BLASTN 2.6.0+ Reference: Stephen F. Altschul, Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer, Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997), "Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402. Database: /mnt/ydrive- ccfa/ExperimentalData/Cloning/Sequencing/UofC.BLAST.ByCloneID/input/ allseq 68 sequences; 87,140 total letters Query= APC113179.120 Length=1128 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value 62_08G_G3_APC113179.120T7term.seq 1182 0.0 22_03G_G3_APC113179.120T7sh.seq 1182 0.0 3_01C_C1_APC114118.102AT7sh.seq 369 7e-104 43_06D_D1_APC114118.102BT7term.seq 360 4e-101 42_06C_C1_APC114118.102AT7term.seq 352 5e-99 34_05C_C5_Milosz-7T7sh.seq 259 9e-71 35_05D_D5_Milosz-8T7sh.seq 248 2e-67 2_01B_B1_APC114117.102BT7sh.seq 248 2e-67 41_06B_B1_APC114117.102BT7term.seq 246 6e-67 29_04F_F4_Milosz-2T7sh.seq 242 7e-66 1_01A_A1_APC114117.102AT7sh.seq 232 1e-62 28_04E_E4_Milosz-1T7sh.seq 230 4e-62 23_03H_H3_APC113179.121T7sh.seq 230 4e-62 39_05H_D5_Milosz-8T7term.seq 215 1e-57 63_08H_H3_APC113179.121T7term.seq 210 4e-56 38_05G_C5_Milosz-7T7term.seq 210 4e-56 64_09A_E4_Milosz-1T7term.seq 208 1e-55 65_09B_F4_Milosz-2T7term.seq 203 6e-54 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..N...G......A.......NN....AT....N...N....GN.GN.N...N....... 748 21 202 ..-...-......-.............--....-...-.......--.....-....... 251 Query_1 308 TATT-TCGATA-CG-AGCA-GTTGTATACAGGGG-CCGTAAA-CGATGTGATGCGTGAAT 361 61 747 ....A.....NN..N...NN.....N........N.......A.....N........... 688 21 252 N...-......-..-....-..............-.......-............N.... 305 Query_1 362 TTTGCCTTTTGGAGCAAGCCTTACCCGGTAGGATTAAACCTTTACGCGAATATCATTC-T 420 61 687 .N.............N...NN.....N.A............N.N..............C. 628 21 306 ........N.................................................-. 364 Query_1 421 GTTGCCGGTTTTGCCTTTACTGTCAAAAGTGCACCAAACGTAAAGATAAAGGGTGAGA-T 479 61 627 ........N..A.....NCN......................................A. 568 21 365 .....................................................N....-. 423 Query_1 480 GGAATATCGAACCCAGATGCTGGATGAGATGCAGGAAGACCATTTTGTTGTCTGGGATAC 539 61 567 .....N....N...N.N..N..............N......................... 508 21 424 .............................................N...........N.. 483 53 1177 ............... 1191 Query_1 540 AAGTCGGGATGATAAAGCTACTTTGTGGGGAGGTGTAATGACGGCAACTGCTAAAGGGAA 599 61 507 ............................................................ 448 21 484 .........................C.................................. 543 2 877 ....... 871 Query_1 600 GAAACTGAAAGCCGCTTGTATAGATGGGGGAATACGGGATACACATCAGATTTTGAATGC 659 61 447 ............................................................ 388 21 544 ..................N..........................C.N............ 603 2 870 ....GC..... 860 Query_1 660 TGATTT-TCCTGTGTTTTACGAATAT-CGTATATCGAATGGTAGCTT-GGGGCGCTGTTT 716 61 387 ......-...................-....................-............ 331 21 604 ......C.......N...........C....................G.........N.. 663 Query_1 717 GATTACTCACTATCAG-ATTCCAATTAAAATCGGAGATGTAACGATTAAG-CCGGGTGAT 774 61 330 ................-.................................-......... 273 21 664 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T...NT..TN.....TN....N..NN.-N......N..A.....NNNN.-.TN.TG.... 662 Query_3 1073 GAAAGGAAGCTG-AGTTGGCTGCTGCCACCGCTGA-GCAATAA-CTAGCATAACCCCTTG 1129 40 16 .... 13 39 10 .N.. 7 4 925 TT..TT..C.-----.A..................-.......-................ 977 3 928 -TT.AT..C..--..--..................-.......-.......-........ 979 2 644 ............-......................-.......-................ 700 42 9 C.... 5 62 14 ....A..... 5 38 14 ........ 7 63 14 ......N.. 6 37 13 ..... 9 64 15 ...NN... 8 61 11 N..N..... 3 6 561 ..................-.......-................ 601 5 564 ..................-.......-................ 604 67 663 ....A....N..A.................NN...NN......NN...........NN.. 722 Query_3 1130 GGG-CCTCTAAACGGGTCTTGAGGGGTTTTTTGCTGAAA 1167 4 978 ...-.....-............-............... 1012 3 980 ...-T.................................. 1017 2 701 ...-................................... 738 6 602 ...-................................... 639 5 605 ...-................................... 642 67 723 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32 2 ... 4 30 7 . 7 29 3 .-.T. 6 31 4 .. 5 Query_4 59 TCCCCT-C-TA-GAAATAATTTTG-TTTAAC-TTT-AAGAAGGAG-A-TATAC-AT--A- 106 2 6 ......-.-..-...-........-......-...-.........-.-.....-..--.- 52 41 654 ..N...-.-..-............-......-...-.........-.-.....-..--.- 607 41 674 ......-A-..-. 683 42 649 ......-.-..-............-......-...-.........-.-.....-..--.- 602 42 669 ......-A-..-. 678 6 12 .....-.....-......-...-.........-.-.....-..--.- 48 5 6 ......-G-..---..........-......-...-.........-.-.....-..--.- 51 46 560 ......-G-..-............-......-...-.........-.-.....-..--.- 513 46 580 ......-A-..-. 589 45 559 ......-G-..-............-......-...-.........-.-.....-..--.- 512 45 579 ......-A-..-. 588 67 5 .NN.AN-.-..-.N.N..-.....-...T..G.N.-C.N......-.A.....-.NNA.- 55 1 8 ......-.-.N-...-........-......-...-.........-.-.....-..--.- 54 40 1037 ......-.-NNN............-......-...-.........-.-.....-..--.- 989 33 5 ......-.-..-...-........-......-...-.........-.-.....-..--.- 51 28 7 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AATGAGGTGG-ATCCGGT-G-CGTATT--AATGCGCTACA--GCGCGTGGC--AATGGAA 378 22 319 ..........-.......-A-......--......T.G..--A.....A..--G.....G 369 53 688 ..........-.......-AA......--......T.G..--A.....AN.--G.....G 637 50 703 ..........N.......N.-NN..N.TA........N.CNG.N.N...N.CA.....N. 645 10 290 .....N....-.......-.-......--.....N.....--........N--....... 340 13 339 ..........-.......-A-......--......T.G..--A.....A..--G.....G 389 Query_8 379 GAATCCCGTTTGGGTATTCCTTTATTGATAGCGCGTGCTGTCATTCACGGGTTT-AAAAC 437 22 370 ..G.....G.....A..C.....G........T..C.A...T............-..... 428 53 636 ..G.....G...A.A..C.....G........T..C.A...T............-..... 578 50 644 ................N........N.......N.GN.......N.N.N.N...-...N. 586 10 341 ........................N..........N..................-...N. 399 13 390 ..G.....G...A.A..C.....G........T..C.A...T............-..... 448 49 644 .....T.....T....A.G..... 621 Query_8 438 AATTTTCCCTATTCCCTTGGGACAAGCGGCTT-CGTTCAATCCGCAGG-TAGCGA-AAGA 494 22 429 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T-GTTGTGA-CGGACTGGGCTTCTGCCAGCGAAATGATAAGCCATG-GTTTTGCCGCCGG 989 51 512 .-.......-..................................C.-....N........ 456 22 925 .G..A....-.A.....................W.......T....-.......T....A 982 53 82 G-..A....-.A.............................T....-.......T....A 26 50 86 .-.N.....C...T....N...N.......N...N...G.N...C.AA...NN..C..T. 28 54 687 G-..A....-.A.............................T....-.......T....A 631 49 116 .-..C..T.-.... 105 9 74 .-..C..T.-......ATA.CGG.AT..TG......G...AT....-..A..---.GA.A 127 9 546 .. 547 Query_9 990 TT-CAAAAGAAG----TGGCAATGAAATCTGTGAATGCAGGAGTAGATATGGAAATGGTG 1044 51 455 ..-.........----............................................ 401 22 983 ..C.T.....G.----.A..C........N........T..G..-..............A 1037 53 25 ..-.T.....G.----A.C..--...... 4 50 27 ..-. 25 54 630 ..-.T.....G.----.A..C........A........T..G..G..............A 576 9 128 .A-TGCG.....TCTC..C.CG..----..T...G.........G........T...... 182 9 548 ..-TG.......----..... 563 20 181 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.T....-.-..-...-........-......-...-.........-.-.....-..--.- 53 0 17 ......-......-...-.........-.-.....-..--.- 49 27 7 ......TN-..-...T--......-......-...-.........-.-.....-..--.- 53 39 1021 ....-.-.-.N--.........-.-......-...-......A..-.-.....N..--.- 976 21 4 ......-.--.-...-........-N.....-...-.........-.-.....-..--.- 49 46 560 ......-G-..-............-......-...-.........-.-.....-..--.- 513 46 580 ......-A-..-. 589 45 559 ......-G-..-............-......-...-.........-.-.....-..--.- 512 45 579 ......-A-..-. 588 44 935 ......-G-..-............-......-...-.........-.-.....-..--.- 888 44 955 ......-A-..-. 964 43 933 ......-G-..-............-......-...-.........-.-.....-..--.- 886 43 953 ......-A-..-. 962 6 12 .....-.....-......-...-.........-.-.....-..--.- 48 5 6 ......-G-..---..........-......-...-.........-.-.....-..--.- 51 67 5 .NN.AN-.-..-.N.N..-.....-...T..G.N.-C.N......-.A.....-.NNA.- 55 3 7 ....-.-G-..-...-........-......-...-.........-.-.....-..--.- 52 4 14 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AATGTCAAACTTTCATCAGCG-TCATTGAAGAAAGATGATGTATTGACTGTGACATTTGA 2117 62 459 .....................-...................................... 401 14 794 ... 796 11 771 ..CA....... 781 15 279 NN................T..N.................N..........N......... 338 Query_13 2118 TCTGGAAAATACAGGTAAATATAAGGGGACGGAAGTTGCTCAATTGTATATACAAGATAA 2177 62 400 ............................................................ 341 15 339 ...........T.N..N.....NNT.N...N......N.N.N.....N..CN.N..N... 398 Query_13 2178 GGTTGGTTCTGTAACTCGTCCGG-TGAAAGAACTGAAACG--TTTTACTCGGG--TAACC 2232 62 340 .......................-................--...........--..... 286 15 399 .........N..CC....N....NN....N.NNNN.....CT...C.......TT..C.. 458 Query_13 2233 TTGAAACCGGGCGAGAAAAAGAATGTTTCGTTTGAACTACCCGTTAGTGAACTTGCATTT 2292 62 285 ............................................................ 226 15 459 .C...N..N..N.... 474 Query_13 2293 TGGAACATCGATATGGTGAAAGTTGTGGAACCCGGAGACTTTGGACTTTGGGTGGCAACA 2352 62 225 ............................................................ 166 Query_13 2353 GACAGCCAATCGGGAGAAGAAGTTTTCTTTAAGGTGGTAGATTAACATTGGAAGTGGATA 2412 62 165 ............................................................ 106 2 534 ................... 552 42 120 ................... 102 41 125 ................... 107 1 909 ..................... 929 40 128 ..................... 108 38 123 .................. 106 63 123 .................. 106 37 122 .................. 105 64 124 .................. 107 39 122 ..................... 102 61 122 .................. 105 46 97 ................... 79 45 96 ................... 78 44 99 ..................... 79 43 97 ..................... 77 6 464 ................... 482 5 467 ................... 485 67 546 ..G.................N. 567 3 842 ..................... 862 4 838 ..................... 858 66 94 .................. 77 65 94 .................. 77 36 93 .................. 76 35 95 .................. 78 Query_13 2413 A-CGGA-TCCGAATTCGAGCTCCGTCGACAAGCTTGCGGCCGCACTC-GAGcac-cacca 2468 62 105 .-....-........................................-......-..... 50 2 553 .-....-........................................-......-..... 608 42 101 .-....-........................................-......-..... 46 41 106 .-....-........................................-......-..... 51 1 930 .-....A................N......... 961 40 107 .-....-........................................-......-..... 52 38 105 .-....-........................................-......-..... 50 63 105 .-....-...........................N............-......-..... 50 37 104 .-....-........................................-......-..... 49 64 106 .-....-...........................N............-......-..... 51 39 101 .-....-..........G.............................-......-..... 46 61 104 .T....-........................................-....N.-..... 48 46 78 .-. 77 45 77 .-. 76 44 78 .-. 77 43 76 .-. 75 6 483 .-. 484 5 486 .-. 487 67 568 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GCTGCCACCGCTGA-GCAATAA-CTAGCATAACCCCTTGGGG-CCTCTAAACGGGTCTTG 2580 2 664 ..............-.......-...................-................. 720 6 565 ..............-.......-...................-................. 621 5 568 ..............-.......-...................-................. 624 67 684 .........NN...NN......NN...........NN...NNC........ 734 3 944 ..............-.......-........-..........-T................ 999 4 941 ..............-.......-...................-.....-........... 996 Query_13 2581 AGGGGTTTTTTGCTGAAA 2598 2 721 .................. 738 6 622 .................. 639 5 625 .................. 642 3 1000 .................. 1017 4 997 .-............... 1012 Lambda K H 0.634 0.408 0.912 Gapped Lambda K H 0.625 0.410 0.780 Effective search space used: 220879824 Query= CMR200122.115 Length=2598 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value 23_03H_H3_APC113179.121T7sh.seq 1932 0.0 63_08H_H3_APC113179.121T7term.seq 1914 0.0 54_07G_G2_CMR200122.105_G08.seq 1445 0.0 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..-..-...-......-...-.N..-.-..-..-...-..-.-.....-..-...-..-. 96 53 937 .-. 936 13 63 ..-..-...-......-...C....-.-..-..A...-..-N-.....C..C...N..A. 112 10 56 ..-NN-...G......N.N.-N...A.-.NN..A...A..C.-.....N..A...C..-. 109 2 53 ..-..-...-......-...-....-.-..-..-...-..-.-.....-..-...-..-. 96 42 601 ..-..-...-......-...-....-.-..-..-...-..-.-....N-..-...-..-. 558 41 606 ..-..-...-......-...-....-.-..-..-...-..-.-.....-..-...-..-. 563 33 52 ..-..-...-......-...-....-.-..-..-...-..-.-.....-..-...-..-. 95 1 55 ..-..-...-......-...-....-.-..-..-...-..-.-.....-..-...-..-. 98 40 988 ..-..-...-......-...-....-.-..-..-...-KC-N-.....-..-N.N-..-. 945 34 53 ..-..-...-......-...-....-.-..-..-...-..-.-.....-..-...-..-. 96 28 54 ..-..-...-......-...-..N.-.-..-..-...-..-.-.....-..-...-..-. 97 0 50 ..-..-...-......-...-....-.-..-..-...-..-.-.....-..-...-..-. 93 27 54 ..-..-...-......-...-.N..-.-..-..-...-..-.-.....-..-...-..-. 97 39 975 ..-..N.N.-......-...-....-.-.--.N-N..-N.-.-.N...-..--N.-..-. 933 21 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AAGCTTGCGGCCGCACTC-GAGcac-caccaccacca-ccacTGAGATCCGGCTGCTAA- 2762 2 580 ..................-......-...........-.....................- 635 42 74 ..................-......-...........-.....................T 18 41 79 ..................-......-...........-.....................- 24 1 958 .... 961 40 80 ..................-......-...........-.....................- 25 38 78 ..................-......-...........-.....................- 23 37 77 ..................-......-...........-.....................- 22 62 78 ..................-......-...........-.....................- 23 63 78 .....N............-......-...........-.....................- 23 64 79 .....N............-......-...........-.....................- 24 39 74 ..................-......-...........-.....................- 19 61 76 ..................-....N.-..........NC............N.......T- 20 67 595 ........NNT...NT..TN.....TN....N..NN.-N......N..A.....NNNN.- 652 Query_15 2763 CAAA--GCCCGAAAGGAAGCTG-AGTTGGCTGCTGCCACCGCTGA-GCAATAA-CTAGCA 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6 31 4 .. 5 Query_16 59 TCCCCT-C-TA-GAAATAATTTTG-TTTAAC-TTT-AAGAAGGAG-A-TATAC-AT--A- 106 2 6 ......-.-..-...-........-......-...-.........-.-.....-..--.- 52 42 649 ......-.-..-............-......-...-.........-.-.....-..--.- 602 42 669 ......-A-..-. 678 41 654 ..N...-.-..-............-......-...-.........-.-.....-..--.- 607 41 674 ......-A-..-. 683 33 5 ......-.-..-...-........-......-...-.........-.-.....-..--.- 51 1 8 ......-.-.N-...-........-......-...-.........-.-.....-..--.- 54 40 1037 ......-.-NNN............-......-...-.........-.-.....-..--.- 989 34 7 ....T.-.-..-...T--......-......-...-.........-.-.....-..--.- 52 28 7 .T....-.-..-...-........-......-...-.........-.-.....-..--.- 53 0 17 ......-......-...-.........-.-.....-..--.- 49 27 7 ......TN-..-...T--......-......-...-.........-.-.....-..--.- 53 22 6 .T....-T-CN-....N.-.....-......-...-.........-.-.....-..--.- 52 39 1021 ....-.-.-.N--.........-.-......-...-......A..-.-.....N..--.- 976 21 4 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.....NN.NN--..........GNNNN..-.......--...NNN.......N....... 1104 58 779 ............................................................ 720 62 758 ............. 770 55 241 ............. 253 14 485 ............. 473 Query_16 797 TAGTGTATAAAGATAATAAAGGCAATATCGCAGCCTTTGAGGTCTTCAGTATAAAACTGA 856 57 1103 ..NNN-......................N........-.......-.........-.... 1048 58 719 ............................................................ 660 Query_16 857 ATGCTGGTGAGGAGAAAATTATCGACATCGTATCGGAGATAAAACAGCCGGATTTGTGGA 916 57 1047 N......N...........................................RA...N.-. 989 58 659 ............................................................ 600 Query_16 917 GCGTCGAGATACCAGTCCTCTATACAGCCGAGACCCGTATTAAGAATGGCGATGAAGTCA 976 57 988 ............................................................ 929 58 599 ............................................................ 540 Query_16 977 TTTCTGAAAACACTGTCAGGTTCGGTATACGAACATTCCACTTTGATGCAGACAAA-GGT 1035 57 928 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TGAGGCAACAGGTTTCTTTGGAGCCGATTCCAACGGTAATTACTTCTGGAACCAGCCTCC 1514 57 450 ............................................................ 391 58 61 .......................................-..... 18 18 112 ............................................................ 171 Query_16 1515 ATACTCTAAAGAAAAAATCAGAGAAATGTGGAAAATCCAGCCTAAACAAGCATACGACAT 1574 57 390 ............................................................ 331 18 172 ............................................................ 231 Query_16 1575 TGGTCGTACAGCGCAAAAATTAGCAGCATGG-ACACGCCAGATGGATACTACACGAGTGG 1633 57 330 ...............................-............................ 272 18 232 ...............................-............................ 290 17 5 ........-............G............................ 53 Query_16 1634 TTACCGCCAACTGCATCCTGCCTTCCATAAGTTTTGAGACAGGATATATCGATGCACTTG 1693 57 271 ............................................................ 212 18 291 ..............................N........................N.... 350 17 54 ...............C...NAAG..................................... 113 Query_16 1694 -ATGTGGCTGGTTTCAGCTACAGACGCGTGATGTATGATTATGCTAAGAAGAATTATCCT 1752 57 211 -........................................................... 153 18 351 -........................................................... 409 17 114 C........................................................... 173 Query_16 1753 GACAAACCTATAATGGGTACAGAAAATCTTGGTCAGTGGCACGAATGGAAGGCGGTGATT 1812 57 152 ......................CT.................................... 93 18 410 ............................................................ 469 17 174 ......................CT..............................N..... 233 Query_16 1813 GAAAGAGATTTCGTTCCGGGTATGTTTATATGGACAGGAGTCGATTATCTGGGAGAAAGT 1872 57 92 ............................................................ 33 18 470 ............................................................ 529 17 234 .............................................N.............. 293 46 828 ....A..... 837 45 827 ....A..... 836 19 275 ....G.C........TT.T...........T... 308 Query_16 1873 GGAAGCCGCCTTTCAAGATGGCCTCAAAAGTCAATAGGATGTGGTCTCCTGGATAT-GTG 1931 57 32 ..........-.......-N......... 6 18 530 ........................................................-... 588 17 294 ...TC.N.....GA.......N...TNCN.G.....N..N....N.A..A....N.C... 353 46 838 ......G.. 846 45 837 ......G.. 845 Query_16 1932 CGGCTATGTGAAGCCTTCGTACGACATGATGAAATCATTGTGGACTGACAAGCCTTTTAT 1991 18 589 ..............................N............................. 648 17 354 NN...T...N.N... 368 32 800 ......... 808 31 800 ......... 808 36 778 ......... 770 35 780 ......... 772 Query_16 1992 TGCTATATATTCACAGACTCCAGACAAATCTTCGTATCTCCAGGTAAAAGATGGC-TTTA 2050 18 649 .......................................................T.... 708 32 809 ..... 813 31 809 ..... 813 36 769 ..... 765 35 771 ..... 767 Query_16 2051 CTGATAAGAAAGGACATGAATGGGATAGAAGATTATGGGTTTGGGATGATGTAAACTCTC 2110 18 709 ............................................................ 768 Query_16 2111 ACTGGAATTATCAGAAAGGTGACTCGGTAATAGTAGAAATATATTCCAATTGTGATGAAG 2170 18 769 ............................................................ 828 Query_16 2171 TGGAACTTTTCGTTAACGGCAAGTCGATGGGAAAGAAGTATATAGACGATTTTGAGGATC 2230 18 829 .-.........--.T.................................T........... 885 Query_16 2231 ATATCTATAAATGGGCAGTTCAGTACAAGCCTGGCACTA-TTACCGCAAAAGGAAAAAAT 2289 18 886 ..N................NN.-N......N........T..........--.G...... 942 Query_16 2290 AAGTTAGGTAATACCACTACAGCTA-TAAGGACTTCAGGCAAAGAACATTCGATATTGCT 2348 18 943 ...-........N............T..C...........-.....Y.....W.-N.... 999 Query_16 2349 AGCGGTTGACAAACAAAGTATCGCAGCAAATGGAAAGGATGTTCTGCATGTCACAGCCCA 2408 18 1000 ...N......--.TC.....-N.......W.-.......N..N........-N....N.. 1054 Query_16 2409 GCTTACAGACAAAAAAGGTAATCCTGTAAAGACAACAGAACAGATGCTTAAGTTCAACAT 2468 18 1055 ..........-T...N....T........----NNN.NN..C..ANNN.T.N......T. 1109 Query_16 2469 CGATGGAGAGTACCGTCTGTTGGGTATAGACAATGGAAATGTAAAGAACGTATCTCCATA 2528 18 1110 ...N...-...N.....NN.... 1131 Query_16 2529 TCAAAGCAAGGAGATTATGACATATCAGGGAAGATGTATGCTGATGCTTCAGTCAACAGA 2588 Query_16 2589 AAAAACATCGGTACTGAATATCAGTGCAGAAACAAGTGAATTACAGTCGAATAAACTAAC 2648 Query_16 2649 AATTAATATAAAATAACATTGGAAGTGGATAA-CGGA-TCCGAATTCGAGCTCCGTCGAC 2706 2 535 ...................-....-...................... 579 42 119 ...................-....-...................... 75 41 124 ...................-....-...................... 80 1 912 ...................-....A................N..... 957 40 125 ...................-....-...................... 81 38 129 ...T.....................-....-...................... 79 37 128 ...T.....................-....-...................... 78 62 123 ...................-....-...................... 79 63 124 ....................-....-...................... 79 64 125 ....................-....-...................... 80 39 119 ...................-....-..........G........... 75 61 126 .......................T....-...................... 77 46 96 ...................-. 77 45 95 ...................-. 76 44 96 ...................-. 77 43 94 ...................-. 75 6 465 ...................-. 484 5 468 ...................-. 487 67 550 ................N..-....-NN....N..A..N........N 594 3 845 ...................-. 864 4 841 ...................-. 860 66 96 .....................-. 75 65 96 .....................-. 75 36 93 ...................-. 74 35 95 ...................-. 76 Query_16 2707 AAGCTTGCGGCCGCACTC-GAGcac-caccaccacca-ccacTGAGATCCGGCTGCTAA- 2762 2 580 ..................-......-...........-.....................- 635 42 74 ..................-......-...........-.....................T 18 41 79 ..................-......-...........-.....................- 24 1 958 .... 961 40 80 ..................-......-...........-.....................- 25 38 78 ..................-......-...........-.....................- 23 37 77 ..................-......-...........-.....................- 22 62 78 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..................-.......-...... 970 4 937 ..................-.......-...... 967 Query_16 2818 TAACCCCTTGGGG-CCTCTAAACGGGTCTTGAGGGGTTTTTTGCTGAAA 2865 2 691 .............-................................... 738 6 592 .............-................................... 639 5 595 .............-................................... 642 67 713 ......NN...NNC........ 734 3 971 ..-..........-T.................................. 1017 4 968 .............-.....-............-............... 1012 Lambda K H 0.634 0.408 0.912 Gapped Lambda K H 0.625 0.410 0.780 Effective search space used: 243764928 Query= CMR200135.107 Length=2778 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value 20_03E_E3_CMR200135.107_E07.seq 1009 0.0 60_08E_E3_CMR200135.107_E09.seq 966 0.0 3_01C_C1_APC114118.102AT7sh.seq 369 2e-103 43_06D_D1_APC114118.102BT7term.seq 360 9e-101 42_06C_C1_APC114118.102AT7term.seq 352 1e-98 34_05C_C5_Milosz-7T7sh.seq 255 3e-69 2_01B_B1_APC114117.102BT7sh.seq 248 4e-67 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......-.-.N-...-........-......-...-.........-.-.....-..--.- 54 40 1037 ......-.-NNN............-......-...-.........-.-.....-..--.- 989 34 7 ....T.-.-..-...T--......-......-...-.........-.-.....-..--.- 52 28 7 .T....-.-..-...-........-......-...-.........-.-.....-..--.- 53 0 17 ......-......-...-.........-.-.....-..--.- 49 27 7 ......TN-..-...T--......-......-...-.........-.-.....-..--.- 53 22 6 .T....-T-CN-....N.-.....-......-...-.........-.-.....-..--.- 52 39 1021 ....-.-.-.N--.........-.-......-...-......A..-.-.....N..--.- 976 21 4 ......-.--.-...-........-N.....-...-.........-.-.....-..--.- 49 46 560 ......-G-..-............-......-...-.........-.-.....-..--.- 513 46 580 ......-A-..-. 589 45 559 ......-G-..-............-......-...-.........-.-.....-..--.- 512 45 579 ......-A-..-. 588 44 935 ......-G-..-............-......-...-.........-.-.....-..--.- 888 44 955 ......-A-..-. 964 43 933 ......-G-..-............-......-...-.........-.-.....-..--.- 886 43 953 ......-A-..-. 962 13 11 .....C-.N.N-C...N.T..N..N......-...T.........C.-.....-N.--N- 62 6 12 .....-.....-......-...-.........-.-.....-..--.- 48 5 6 ......-G-..---..........-......-...-.........-.-.....-..--.- 51 67 5 .NN.AN-.-..-.N.N..-.....-...T..G.N.-C.N......-.A.....-.NNA.- 55 3 7 ....-.-G-..-...-........-......-...-.........-.-.....-..--.- 52 4 14 ..........-....-.-...-.........-.-.....-..--.- 49 32 5 ......-G-..-...-........-......-...-.........-.-.....-..--.- 51 30 8 ....N.-G-..-A...........-......-...-.........-.-.....-..--.- 55 10 42 ....-.-.....-..--NC 55 29 7 ......-G-..-N..-........-......-...-.........-.-.....-..--.- 53 31 6 ......-G-..-...-........-....-.-...-.........-.-.....-..--.- 51 Query_17 107 TG-CA-CCA-TCATCA-TCA-TCAT-T-CT-TC-TGG-TG-T-AGATC-TG-TGG-TC-T 150 2 53 ..-..-...-......-...-....-.-..-..-...-..-.-.....-..-...-..-. 96 42 601 ..-..-...-......-...-....-.-..-..-...-..-.-....N-..-...-..-. 558 41 606 ..-..-...-......-...-....-.-..-..-...-..-.-.....-..-...-..-. 563 33 52 ..-..-...-......-...-....-.-..-..-...-..-.-.....-..-...-..-. 95 1 55 ..-..-...-......-...-....-.-..-..-...-..-.-.....-..-...-..-. 98 40 988 ..-..-...-......-...-....-.-..-..-...-KC-N-.....-..-N.N-..-. 945 34 53 ..-..-...-......-...-....-.-..-..-...-..-.-.....-..-...-..-. 96 28 54 ..-..-...-......-...-..N.-.-..-..-...-..-.-.....-..-...-..-. 97 0 50 ..-..-...-......-...-....-.-..-..-...-..-.-.....-..-...-..-. 93 27 54 ..-..-...-......-...-.N..-.-..-..-...-..-.-.....-..-...-..-. 97 22 53 ..-..-...-......-...-.N..-.-..-..-...-..-.-.....-..-...-..-. 96 39 975 ..-..N.N.-......-...-....-.-.--.N-N..-N.-.-.N...-..--N.-..-. 933 21 50 ..-..-...-......-C.C-.TT.-.N.N-N.-...-..-.-.....-..-N..-..-. 94 46 512 .. 511 45 511 .. 510 44 887 .. 886 43 885 .. 884 13 63 ..-..-...-......-...C....-.-..-..A...-..-N-.....C..C...N..A. 112 6 49 .. 50 5 52 .. 53 67 56 ..G..-...C......G...-....N.-..-N.-...-AN-.T.....-..-...-N.-. 104 3 53 .. 54 4 50 .. 51 32 52 .. 53 30 56 .. 57 10 56 ..-NN-...G......N.N.-N...A.-.NN..A...A..C.-.....N..A...C..-. 109 29 54 .. 55 31 52 .. 53 Query_17 151 C-A-TCCGCAG-TTCG-AAAAGGGTACCG-AG-AA-CC-TG-TACTTCC-AATCCAATGC 200 2 97 .-.-.......-....-............-..-..-..-..-.......-.......... 146 42 557 .-.-.......-....-............-..-..-..-..-.......-.......... 508 41 562 .-.-.......-....-............-..-..-..-..-.......-.......... 513 33 96 .-.-.......-....-............-..-..-..-..-.......-.......... 145 1 99 .-.-.......-....-............-..-..-..-..-.......-.......... 148 40 944 .-N-.......-..N.A............-..-..N..-..-.......N.......... 892 34 97 .-.-.......-....-............-..-..-..-..-.......-.......... 146 28 98 .-.-.......-....-.......A....-..-..-..-..-.......-.......... 147 0 94 .-.-.......-....-............-..-..-..-..-.......-.......... 143 27 98 .-.-.......-....-............-..-..-..-..-.......-.......... 147 22 97 .-.-.......-....-............-..-..-..-..-.......-.......... 146 39 932 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ACTTTACCGGAATGTCCATCTGATTACTGCAGAAAAAATACATGTACCTGTATGGGGAAC 740 52 498 ..........T..C... 482 12 329 ..........T..C... 345 Query_17 741 ACAGGTTACCACCCCACACGTAGCTAATGACTATGCTTCTGTTTGCCTTCGTACCTCTTT 800 Query_17 801 ACAGAATGTGGGAAAAGAAGAAATTACCATAGAAACAGAAATACTGGACCCGAACGGGAA 860 59 650 ..N........NN...N. 633 Query_17 861 AA-AAGTTTCTTTCAAGAAGAACAGCGGACGCATCAATC-ACGGGCAACCGTTTACACAA 918 59 632 ..G...........C...N..........T........NN.........N.......... 573 Query_17 919 AATTTCATT-GTGGAAAACCCGCAATTGTGGTCACCTGAAACACCGTTCTTATATCAGGC 977 59 572 .........T....N....N.............N.......................... 513 Query_17 978 CGTATCTAAAATCTATGCCAACGGAAAACTTACAGAT-ACTTATACCACCCGCTTTGGTA 1036 59 512 N...........N.N....N.N...............T..............N....... 453 Query_17 1037 TCCGTTCCATCGAATTTGTAGCCGACAAGGGCTTTTTCCTGAACGGCCAGCACCGTAAAT 1096 59 452 ....G....................................N.................. 393 Query_17 1097 TCCAGGGGGTATGCAACCACCACGACTTAGGTCCTTTAGGAGCTGCCATCAACGTATCGG 1156 59 392 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A.......AC.CT.T..CA..G-.C...T.....T.....T....A.TG.T.....T... 608 Query_18 493 CCGTTGGCCCTGTCTTGTAGCTGGGATACGGCGGCGGTGACACGTATGGCACGTATTTCT 552 49 607 ..T....GTA..G..GCC.CA.......T.AA...TA.AGA..AATCT..T.....AG.G 548 Query_18 553 GCCACGGAAGCCAGTGCCGATGGAATCAGCTGGACCTTCAGTCCGATGGTAGACATCTGT 612 22 523 ..T...C.T.....T..TGCA......A.C.....TGCC 561 49 547 ..G.TA.................C...T.......A..T...........T..T...A.C 488 53 483 ..T...C.T.....T..TGCA......A.C.....TGCC 445 Query_18 613 CGGGATGCCCGCTGGGGACGTATTGCAGAAGGAAGTGGAGAGGACCCGTACCTCGGGGCG 672 22 562 ..T...C.T........G..C.....C......T....T..A...A.T.....GACTT.T 621 49 487 ..T...C.A..T.........G.AT.C.....T..C.....A..T..T.TTT.A..T.GT 428 53 444 ..T...C.T........G..C.....C......T....T..A...A.T.....GACTT.T 385 Query_18 673 TTGATGGCTGGAGCCTAT-GTGCGCGGTTATCAGGGTGACGGCATGA-AGC--------- 721 22 622 G.A....GA.CT...ATG-..AGAA....T......A..TTCTT...-.TA--------- 670 49 427 GAA..T...-A..G.G..G..ATAT..C.........A.A..--...T...GCATATCGT 371 12 59 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25 49 250 ......C.G.C...T.....T..G..T.CC..CAGT..C...TCT..T.....CGAGG.. 191 12 184 ..C..CC...CT..C..A..T..A..T..A..CAGC..A...GCG..T.....CGAA..A 243 52 643 ..C..CC...CT..C..A..T..A..T..A..CAGC..A...GCG..T.....CGAA..A 584 Query_18 901 AACGGGGTACCT-GCT-ACAGC-TGA--CAAATGGCTG-C-TGA-CGGA--TTTGCT-CC 949 60 889 .........N.N.N.....C...NN..NN......G.-.NNN....AT..N...T.. 834 20 26 ............-...-.....-...--..........-.N...-....--......-.. 75 49 190 G.T..AA.T...-..A-.....-CA.--.......T..-A-.A.-.T..--.G.C..-G. 142 12 244 G....CA....A-..C-..G..-CA.--T.........-A-...-.C..--CG.A..-G. 292 52 583 G....CA....A-..C-..G..-CA.--T.........-A-...-.C..--CG.A..-G. 535 9 10 ...-..--.....-CA.--.......T..-A-.A.-.T..--.G.C..-G. 48 Query_18 950 GCAATGAGTGGGG-GTTCACGGGG--TTTGTGGTGACC-G--CTTAC--AATTCGATTGG 1001 60 833 N...NN..NN...N..........NN..N.........C.--N..N.CA.N.C....... 776 20 76 .............-..........--............-.--.....--........... 127 49 141 .T..AC.......-A...GGT..T--.....C..T.. 108 12 293 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