BLASTN 2.6.0+


Reference: Stephen F. Altschul, Thomas L. Madden, Alejandro A.
Schaffer, Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J.
Lipman (1997), "Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of
protein database search programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.



Database: /mnt/ydrive-
ccfa/ExperimentalData/Cloning/Sequencing/UofC.BLAST.ByCloneID/input/
allseq
           139 sequences; 156,315 total letters



Query= APC113179.130

Length=1089
                                                                      Score     E
Sequences producing significant alignments:                          (Bits)  Value

  111_09D_C9_APC113179.130_T7S.seq                                    1790    0.0  
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Query_1  53    AAC-AA-TT-CCCC--T-C-TAGAAA-TAA-TTTT-GTTTAAC--TTTAAGAA-GGA-GA  98
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9        11         .-..-....--.-.-......-...-....-.......--........-...-..  52
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17       4       .-..-..-...---.-.-......-...-....-.......--........-...-..  46
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109      13         .-..-....--.-.-.....--...-....-.......--........-...-..  53
107      10                ..--.-.-.....--...-....-.....-.--........-...-..  44

Query_1  99    TATAC-ATATG--CACCAT-CATCATCAT-CATTCTT-CT-GG-TGTAGAT-CTGTGGTC  149
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Query_1  150   TCAT-CC-G--CAGTTCG-AAAA-GGGTACC-GAGAACC-TGTACTT-CC-AAT-CC-AA  197
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74       95    ....-..-.--.......-....-.......-.......-.......-..-...-..-..  142
76       99    ....-..-.--.......-....-.......-......G-.......-..-...-..-..  146
61       87    ....-..-.--.......-....-.......-.......-.......-..-...-..-..  134
78       97    ....-..-.--.......-....-.......-.......-.......-..-...-..-..  144
99       93    ....-..-.--.......-....-.......-.......-.......-..-...-..-..  140
91       94    ....-..-.--.......-....-.......-.......-.......-..-...-..-..  141
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114      117   ....-..-.--......T-N...-.......-.......-.......-..-...-..-..  164
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122      957   ....-..-.N-.......A....-.......-.......-.......--.-N..-..-..  909
101      106   ..C.-G.T.--.T..-..-.TG.-.......-.......-.......-..-...-..-..  153
137      969   ..N.T..-.--.....N.-....-..N....-.......-N......N..-...N..-..  919

Query_1  198   TGCCGAAAAATTGATTCAGGATCGTGAAGGAATATCTTCGAAAAA-GTTTCCTATAGAGG  256
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9        152   .....T.G...                                                   162
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96       157   ....                                                          160
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103      159   ....                                                          162
98       161   ....C..                                                       167
86       149   ....C..                                                       155
89       150   ....C..                                                       156
17       146   ....                                                          149
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82       147   ....C..                                                       153
102      157   ....                                                          160
100      148   ....C..                                                       154
59       141   ....                                                          144
80       149   ....                                                          152
29       145   ....                                                          148
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104      160   ....                                                          163
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61       135   ....                                                          138
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101      154   ....                                                          157
137      918   .N..C..                                                       912

Query_1  257   ATAAA-GAATTATTATTTCGATACGAGCAGTTGTATACAGGGGCCGTAAACGATGTGATG  315
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Query_1  316   CGTGAATTTTGCCTTTTGGAGCAAGCCTTACCCGGTAGGATTAAACCTTTACGCGAATAT  375
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Query_1  376   CATTCTGTTGCCGGTTTTGCCTTTACTGTCAAAAGTGCACCAAACGTAAAGATAAAGGGT  435
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Query_1  436   GAGATGGAATATCGAACCCAGATGCTGGATGAGATGCAGGAAGACCATTTTGTTGTCTGG  495
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23       16                       ..............                             29
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120      190                      ..............                             177
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Query_1  496   GATACAAGTCGGGATGATAAAGCTACTTTGTGGGGAGGTGTAATGACGGCAACTGCTAAA  555
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124      798                                                            ...  796
1        748                                             .............       736

Query_1  556   GGGAAGAAACTGAAAGCCGCTTGTATAGATGGGGGAATACGGGATACACATCAGATTTTG  615
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124      795   ............                                                  784

Query_1  616   AATGCTGATTTTCCTGTGTTTTACGAATATCGTATATCGAATGGTAGCTTGGGGCGCTGT  675
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111      564   ............................................................  623
87       388   ............................................................  329

Query_1  676   TTGATTACTCACTATCAGATTCCAATTAAAATCGGAGATGTAACGATT-AAGCCGGGTGA  734
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Query_1  735   TATAATACTTGGAGATATCGA-TGGAG-TTTTAG-TTGTACCAA-GGGAAATAGCTTATG  790
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Query_1  791   AAGTGC-TTTTACGCTCGGAGGAGATACGTG-AAAATGAGAAGAAGA-TTTTCT-CTT-G  845
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87       213   ......-........................-...............-......-...-.  159

Query_1  846   GGTACAAAACGGAGACAGTGTTCAGG-AAATTACAGCAAAATAACATTGGAAGTGGATAA  904
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23       842                                            ...................  860
49       136                                        .......................  114
26       136                                         ......................  115
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44       136                                        .......................  114
115      135                                            ...................  117
14       137                                        .......................  115
42       133                                          .....................  113
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Query_1  905   CGGATCCGAATTCGAGCTCCGTCG-ACAAGCTT-GCGGCCG-CAC-TCGAGcaccaccac  960
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Query_1  961   caccacca-c-TG-AGA-T-CCGGCTGCTAACAAAG-CCC--G--AAAGGAAGC-TGAGT  1009
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Query_1  1062  ACGGGTCTT--GAGG-GG--TTTTTTGCTGAAA  1089
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Query= APC113179.131

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Query_2  99    TATAC-ATATG--CACCAT-CATCATCAT-CATTCTT-CT-GG-TGTAGAT-CTGTGGTC  149
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Query_2  150   TCAT-CC-G--CAGTTCG-AAAA-GGGTACC-GAGAACC-TGTACTT-CC-AAT-CC-AA  197
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Query_2  198   TGCC---AAATTGATTCAGGATCGTGAAGGAATATCTTCGAAAAA-GTTTCCTATAGAGG  253
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103      159   ....---.                                                      163
96       157   ....                                                          160
93       159   ....---C..                                                    165
9        152   ....                                                          155
98       161   ....---C..                                                    167
86       149   ....---C..                                                    155
17       146   ....---..                                                     151
89       150   ....---C..                                                    156
84       146   ....---C..                                                    152
90       146   ....---C..                                                    152
70       149   ....                                                          152
102      157   ....---.                                                      161
95       158   ....                                                          161
94       160   ....                                                          163
82       147   ....---C..                                                    153
29       145   ....---..                                                     150
100      148   ....---C..                                                    154
59       141   ....                                                          144
80       149   ....                                                          152
97       159   ....                                                          162
104      160   ....---.                                                      164
72       148   ....                                                          151
74       143   ....                                                          146
76       147   ....                                                          150
61       135   ....                                                          138
78       145   ....                                                          148
99       141   ....---C..                                                    147
91       142   ....---C..                                                    148
114      165   ....                                                          168
122      908   ....---..                                                     903
101      154   ....                                                          157
137      918   .N..---C..                                                    912

Query_2  254   ATAAA-GAATTATTATTTCGATACGAGCAGTTGTATACAGGGGCCGTAAACGATGTGATG  312
110      210   .....-......................................................  268
85       759   .....-......................................................  701
83       756   .....-......................................................  698
112      206   .....-..................N...................................  264
111      205   .....-......................................................  263
87       748   .....A....................................C.................  689

Query_2  313   CGTGAATTTTGCCTTTTGGAGCAAGCCTTACCCGGTAGGATTAAACCTTTACGCGAATAT  372
110      269   ............................................................  328
85       700   ............................................................  641
83       697   ............................................................  638
112      265   ............................................................  324
111      264   ............................................................  323
87       688   ............................................................  629

Query_2  373   CATTCTGTTGCCGGTTTTGCCTTTACTGTCAAAAGTGCACCAAACGTAAAGATAAAGGGT  432
110      329   ............................................................  388
85       640   ............................................................  581
83       637   ............................................................  578
112      325   ............................................................  384
111      324   ............................................................  383
87       628   ............................................................  569

Query_2  433   GAGATGGAATATCGAACCCAGATGCTGGATGAGATGCAGGAAGACCATTTTGTTGTCTGG  492
110      389   ............................................................  448
85       580   ............................................................  521
83       577   ............................................................  518
112      385   ............................................................  444
111      384   ............................................................  443
87       568   ............................................................  509
27       15                       ..............                             28
23       16                       ..............                             29
134      192                      ..............                             179
126      188                      ..............                             175
123      190                      ..............                             177
120      190                      ..............                             177
25       315                      ..............                             328
21       964                      ..............                             977

Query_2  493   GATACAAGTCGGGATGATAAAGCTACTTTGTGGGGAGGTGTAATGACGGCAACTGCTAAA  552
110      449   ............................................................  508
85       520   ............................................................  461
83       517   ............................................................  458
112      445   ............................................................  504
111      444   ............................................................  503
87       508   ............................................................  449
127      800                                                           ....  797
124      798                                                            ...  796
1        748                                             .............       736

Query_2  553   GGGAAGAAACTGAAAGCCGCTTGTATAGATGGGGGAATACGGGATACACATCAGATTTTG  612
110      509   ............................................................  568
85       460   ............................................................  401
83       457   ............................................................  398
112      505   ............................................................  564
111      504   ............................................................  563
87       448   ............................................................  389
127      796   ............                                                  785
124      795   ............                                                  784

Query_2  613   AATGCTGATTTTCCTGTGTTTTACGAATATCGTATATCGAATGGTAGCTTGGGGCGCTGT  672
110      569   ............................................................  628
85       400   ............................................................  341
83       397   ............................................................  338
112      565   ............................................................  624
111      564   ............................................................  623
87       388   ............................................................  329

Query_2  673   TTGATTACTCACTATCAGATTCCAATTAAAATCGGAGATGTAACGATT-AAGCCGGGTGA  731
110      629   ................................................-...T.......  687
85       340   ................................................-...T.......  282
83       337   ................................................-...T.......  279
112      625   ................................................-...T.......  683
111      624   ................................................A...T.......  683
87       328   ................................................-...T.......  270

Query_2  732   TATAATACTTGGAGATATCGA-TGGAG-TTTTAG-TTGTACCAA-GGGAAATAGCTTATG  787
110      688   .....................-.....-......-.........-...............  743
85       281   .....................-.....-......-.........-...............  226
83       278   .....................-.....-......-.........-...............  223
112      684   .....................-.....T......-.........-...............  740
111      684   .....................T.....-......T.........G...............  742
87       269   .....................-.....-......-.........-...............  214

Query_2  788   AAGTGC-TTTTACGCTCGGAGGAGATACGTG-AAAATGAGAAGAAGA-TTTTCT-CTT-G  842
110      744   ......-........................-...............-......-...G.  799
85       225   ......-........................-...............-......-...-.  171
83       222   ......-........................-...............-......-...-.  168
112      741   ......T........................A...............-......-...--  796
111      743   ......-........................-...............N......C...-.  799
87       213   ......-........................-...............-......-...-.  159

Query_2  843   GGTACAAAACGGAGACAGTGTTCAGG-AAATTACAGCAAAATAACATTGGAAGTGGATAA  901
110      800   ..........................-.................................  858
85       170   ..........................-.................................  112
83       167   ..........................-.................................  109
112      797   .....N....................-.................................  855
111      800   ..................N.....N.A.................................  859
87       158   ..........................-.................................  100
39       814                                          .....................  834
27       841                                            ...................  859
23       842                                            ...................  860
49       136                                        .......................  114
26       136                                         ......................  115
40       133                                          .....................  113
44       136                                        .......................  114
115      135                                            ...................  117
14       137                                        .......................  115
42       133                                          .....................  113
38       133                                          .....................  113
35       130                                          .....................  110
0        136                                        .......................  114
60       134                                            ...................  116
56       134                                           ....................  115
46       138                                        .......................  116
12       140                                        .......................  118
116      128                                            ...................  110
64       132                                            ...................  114
28       136                                         ......................  115
3        137                                        .......................  115
88       122                                        .......................  100
30       131                                            ...................  113
5        137                                        .......................  115
24       136                                         ......................  115
31       134                                            ...................  116
34       135                                            ...................  117
62       136                                            ...................  118
22       135                                         ......................  114
8        136                                          .....................  116
47       141                                        .......................  119
73       130                                            ...................  112
68       129                                            ...................  111
51       119                                           ....................  100
58       116                                           ....................  97
71       127                                            ...................  109
54       121                                           ....................  102
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Query_2  902   CGGATCCGAATTCGAGCTCCGTCG-ACAAGCTT-GCGGCCG-CAC-TCGAGcaccaccac  957
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Query_2  958   caccacca-c-TG-AGA-T-CCGGCTGCTAACAAAG-CCC--G--AAAGGAAGC-TGAGT  1006
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Query_2  1007  TGGC-TG-CTGCCACCGCTGAGCAATAAC-TAG-CA-TAAC-C-CCTT-GGGGCCTCTAA  1058
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Query_2  1059  ACGGGTCTT--GAGG-GG--TTTTTTGCTGAAA  1086
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Effective search space used: 163366740


Query= APC113179.132

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Query_3  1     TCTCG-ATCCCGCGAAATTAATAC-GACTC-ACTATAGGGG--AATT-GTGAG-CGGA-T  52
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Query_3  99    TATAC-ATATG--CACCAT-CATCATCAT-CATTCTT-CT-GG-TGTAGAT-CTGTGGTC  149
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Query_3  150   TCAT-CC-G--CAGTTCG-AAAA-GGGTACC-GAGAACC-TGTACTT-CC-AAT-CC-AA  197
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Query_3  198   TGCC------TTGATTCAGGATCGTGAAGGAATATCTTCGAAAAA-GTTTCCTATAGAGG  250
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104      160   ....                                                          163
72       148   ....                                                          151
74       143   ....                                                          146
76       147   ....                                                          150
61       135   ....                                                          138
78       145   ....                                                          148
99       141   ....                                                          144
91       142   ....                                                          145
114      165   ....                                                          168
122      908   ....                                                          905
101      154   ....                                                          157
137      918   .N..                                                          915

Query_3  251   ATAAA-GAATTATTATTTCGATACGAGCAGTTGTATACAGGGGCCGTAAACGATGTGATG  309
110      210   .....-......................................................  268
85       759   .....-......................................................  701
83       756   .....-......................................................  698
112      206   .....-..................N...................................  264
111      205   .....-......................................................  263
87       748   .....A....................................C.................  689

Query_3  310   CGTGAATTTTGCCTTTTGGAGCAAGCCTTACCCGGTAGGATTAAACCTTTACGCGAATAT  369
110      269   ............................................................  328
85       700   ............................................................  641
83       697   ............................................................  638
112      265   ............................................................  324
111      264   ............................................................  323
87       688   ............................................................  629

Query_3  370   CATTCTGTTGCCGGTTTTGCCTTTACTGTCAAAAGTGCACCAAACGTAAAGATAAAGGGT  429
110      329   ............................................................  388
85       640   ............................................................  581
83       637   ............................................................  578
112      325   ............................................................  384
111      324   ............................................................  383
87       628   ............................................................  569

Query_3  430   GAGATGGAATATCGAACCCAGATGCTGGATGAGATGCAGGAAGACCATTTTGTTGTCTGG  489
110      389   ............................................................  448
85       580   ............................................................  521
83       577   ............................................................  518
112      385   ............................................................  444
111      384   ............................................................  443
87       568   ............................................................  509
27       15                       ..............                             28
23       16                       ..............                             29
134      192                      ..............                             179
126      188                      ..............                             175
123      190                      ..............                             177
120      190                      ..............                             177
25       315                      ..............                             328
21       964                      ..............                             977

Query_3  490   GATACAAGTCGGGATGATAAAGCTACTTTGTGGGGAGGTGTAATGACGGCAACTGCTAAA  549
110      449   ............................................................  508
85       520   ............................................................  461
83       517   ............................................................  458
112      445   ............................................................  504
111      444   ............................................................  503
87       508   ............................................................  449
127      800                                                           ....  797
124      798                                                            ...  796
1        748                                             .............       736

Query_3  550   GGGAAGAAACTGAAAGCCGCTTGTATAGATGGGGGAATACGGGATACACATCAGATTTTG  609
110      509   ............................................................  568
85       460   ............................................................  401
83       457   ............................................................  398
112      505   ............................................................  564
111      504   ............................................................  563
87       448   ............................................................  389
127      796   ............                                                  785
124      795   ............                                                  784

Query_3  610   AATGCTGATTTTCCTGTGTTTTACGAATATCGTATATCGAATGGTAGCTTGGGGCGCTGT  669
110      569   ............................................................  628
85       400   ............................................................  341
83       397   ............................................................  338
112      565   ............................................................  624
111      564   ............................................................  623
87       388   ............................................................  329

Query_3  670   TTGATTACTCACTATCAGATTCCAATTAAAATCGGAGATGTAACGATT-AAGCCGGGTGA  728
110      629   ................................................-...T.......  687
85       340   ................................................-...T.......  282
83       337   ................................................-...T.......  279
112      625   ................................................-...T.......  683
111      624   ................................................A...T.......  683
87       328   ................................................-...T.......  270

Query_3  729   TATAATACTTGGAGATATCGA-TGGAG-TTTTAG-TTGTACCAA-GGGAAATAGCTTATG  784
110      688   .....................-.....-......-.........-...............  743
85       281   .....................-.....-......-.........-...............  226
83       278   .....................-.....-......-.........-...............  223
112      684   .....................-.....T......-.........-...............  740
111      684   .....................T.....-......T.........G...............  742
87       269   .....................-.....-......-.........-...............  214

Query_3  785   AAGTGC-TTTTACGCTCGGAGGAGATACGTG-AAAATGAGAAGAAGA-TTTTCT-CTT-G  839
110      744   ......-........................-...............-......-...G.  799
85       225   ......-........................-...............-......-...-.  171
83       222   ......-........................-...............-......-...-.  168
112      741   ......T........................A...............-......-...--  796
111      743   ......-........................-...............N......C...-.  799
87       213   ......-........................-...............-......-...-.  159

Query_3  840   GGTACAAAACGGAGACAGTGTTCAGG-AAATTACAGCAAAATAACATTGGAAGTGGATAA  898
110      800   ..........................-.................................  858
85       170   ..........................-.................................  112
83       167   ..........................-.................................  109
112      797   .....N....................-.................................  855
111      800   ..................N.....N.A.................................  859
87       158   ..........................-.................................  100
39       814                                          .....................  834
27       841                                            ...................  859
23       842                                            ...................  860
49       136                                        .......................  114
26       136                                         ......................  115
40       133                                          .....................  113
44       136                                        .......................  114
115      135                                            ...................  117
14       137                                        .......................  115
42       133                                          .....................  113
38       133                                          .....................  113
35       130                                          .....................  110
0        136                                        .......................  114
60       134                                            ...................  116
56       134                                           ....................  115
46       138                                        .......................  116
12       140                                        .......................  118
116      128                                            ...................  110
64       132                                            ...................  114
28       136                                         ......................  115
3        137                                        .......................  115
88       122                                        .......................  100
30       131                                            ...................  113
5        137                                        .......................  115
24       136                                         ......................  115
31       134                                            ...................  116
34       135                                            ...................  117
62       136                                            ...................  118
22       135                                         ......................  114
8        136                                          .....................  116
47       141                                        .......................  119
73       130                                            ...................  112
68       129                                            ...................  111
51       119                                           ....................  100
58       116                                           ....................  97
71       127                                            ...................  109
54       121                                           ....................  102
69       128                                            ...................  110
66       127                                            ...................  109
79       65                                           .....................  45
75       67                                           .....................  47
81       65                                           .....................  45
77       65                                           .....................  45
15       61                                             ...................  43
20       65                                             ...................  47
18       65                                             ...................  47

Query_3  899   CGGATCCGAATTCGAGCTCCGTCG-ACAAGCTT-GCGGCCG-CAC-TCGAGcaccaccac  954
110      859   ........................A........-.......-...-..............  915
85       111   ........................-........-.......-...-..............  56
83       108   ........................-........-.......-...-.....---......  56
112      856   ........-.N.............-........-....T..-...T..............  911
111      860   .............N..........-..N.....-.......C..N-..............  916
87       99    ........................-........-A......-...-..............  44
39       835   ........................-........-.......-...-.....---......  887
27       860   ........................-........T.......-...-..............  916
23       861   .......N.....C..........-........-.......-...-....N........-  915
49       113   ........................-........-.......-...-..............  58
26       114   ........................-........-.......-...-..............  59
40       112   ........................-........-.......-...-..............  57
44       113   ........................-........-.......-...-..............  58
115      116   ........................-........-.......-...-..............  61
14       114   ........................-........-.......-...-..............  59
42       112   ........................-........-.......-...-..............  57
38       112   ........................-........-.......-...-..............  57
35       109   ........................-........-.......-...-..............  54
0        113   ........................-........-..N....-...-..............  58
60       115   ........................-........-.......-...-..............  60
56       114   ........................-........-.......-...-..............  59
46       115   ........................-........-.......-...-..............  60
12       117   ........................-........-.......-...-..............  62
116      109   ........................-........-.......-...-..............  54
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28       114   ........................-........-.......-...-..............  59
3        114   ........................-........-NN.....-...-..............  59
88       99    ........................-........-N......-...-..............  44
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5        114   ........................-.......N-.......-...-..............  59
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Query_3  955   caccacca-c-TG-AGA-T-CCGGCTGCTAACAAAG-CCC--G--AAAGGAAGC-TGAGT  1003
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Query_3  1056  ACGGGTCTT--GAGG-GG--TTTTTTGCTGAAA  1083
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Query= APC115027.105

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Query_4  1     TCTCG-ATCCCGCGAAATTAATAC-GACTC-ACTATAGGGG--AATT-GTGAG-CGGA-T  52
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Query_4  53    AAC-AA-TT-CCCC--T-C-TAGAAA-TAA-TTTT-GTTTAAC--TTTAAGAA-GGA-GA  98
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Query_4  99    TATAC-ATATG--CACCAT-CATCATCAT-CATTCTT-CT-GG-TGTAGAT-CTGTGGTC  149
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Query_4  150   TCAT-CC--G-CAGTTCG-AAAAGGGTA-CCGAGAA-CCTGTACTT-CCAAT-CCAATGC  200
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Query_4  201   CCATGAGAGCAAAACGATCAACGACAGTTGGAAATTCTATCAGGGAGAATGCAAAGCTGC  260
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137      915   ...                                                           913

Query_4  261   CGCTTCAGCAACCTATGATGACAGTGCGTGGAACAGCATACATCTCCCGCATACATGGAA  320

Query_4  321   TACGGATGCATATACAGaaaaaaaGTATTACCAGGGAACAGGCTGGTATCGCCGTACGCT  380

Query_4  381   GACATTACCGCAAAATTGGCAAACCAAACAGGTATTCCTGAAACTGGATGCAGCCAGTAA  440

Query_4  441   GGCCGCTGCCATCTACATGAATGGACGGAAAATAGGTGAGCATAACGGTGGATATACTGC  500

Query_4  501   CTGCACATTCGATATCACCCCATTCTGTTCATTTGACGCTCCTAATTCTCTCGCTATCCA  560

Query_4  561   TGTAGATAATGCCCGACAGGATATTCCCCCTATCTCTGCCGACTTTACATTCTTCGGCGG  620
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100      580                                                            ...  582
99       573                                                            ...  575

Query_4  621   TATCTACCGGGATGTATGGCTTACAGCCGTACCAAAACAACATTTCCATTTGACGAACTA  680
98       596   A..T...........G...                                           614
100      583   A..T...........G...                                           601
99       576   A..T...........G...                                           594

Query_4  681   TGGTTCAGAAGGAATATTTATCAGTACCCCGCAAGTATCCGAAGAAAAAGGCACAATACT  740

Query_4  741   TATTCGCGGAGAGATAAAGAACGATGCAGAACAGAAAGCATCTCTTGAACTGGAACATAT  800
80       752                                            ..............A..    768
76       749                                            ..............A..    765
78       750                                            ..............A..    766

Query_4  801   CGTATACAATCCCGATGGAAGTATTGCCCAGACCCAGAAACAGTCTATCCAGATAAAAGG  860

Query_4  861   TGGAGAATTATACTCTTTCCGCACCGAAACCTCCCCTATTCTGTCCCCCCGATTATGGAC  920

Query_4  921   ACCCGAGGCCCCTCATCTCTACAGAATAGAAAGCATTCTGCGCGATaaaaaaaCAAAAGC  980

Query_4  981   CATCCTAGACCACAGTAATCACCATACAGGCTTCCGCTGGTTTAGCTTCGATGGTAAGAC  1040

Query_4  1041  CGGCTTCTCCCTCAACGGAAAACCTTATAAATTACGCGGTATTTGCCGCCATCAGGACCA  1100

Query_4  1101  AAAACCCATCGGAGTTGCCCTGACAGACGAAATGCACCGTCGTGACATGAAGTTAATGAA  1160

Query_4  1161  AGAGATGGGTGCCAACTTCATCCGCATCTCCCATTATCCGCAAGATGACGCTCTGTTGGA  1220

Query_4  1221  AATGTGCGACAAACTCGGTATGCTAGCTTGGGAAGAAATACCCATTATTGATATTGTGCC  1280

Query_4  1281  CGACACTCCCGGCTATGCAGAAAACTGCGAAAACAATCTGCGAGAAATGATACGCCAGCA  1340

Query_4  1341  CTATAACCATCCCTCCATCATCACCTGGGGATACATGAATGCTATATTACTCGTCACCCA  1400

Query_4  1401  GCGCCGCTATAAAAAAGAAGAAGAACTGAAACCCGTGCTGGAACGGACATTGTCACTGGC  1460

Query_4  1461  CAATCGTTTGGAGAAAGTTCTGAAAGAAGAAGATTCCACTCGTGTCAGCACTATGGCTTT  1520

Query_4  1521  TCATGGCAGTAACAGCTACAATGAGGTAGGACTGGGCAACATCACCGATATTGTCGGTTG  1580

Query_4  1581  GAATCTTTACCAAGGCTGGTATGGAGGAGACCTCACAGGCTTCGAACGTTTCCTGACAGA  1640

Query_4  1641  GCAACACAAAAAACACCCTTCCCATCCGATGATTGTCAGCGAATACGGTGCCGGATCTGA  1700

Query_4  1701  CAAGCGTCTACATTCGCTGCAACCGCACGCTTTTGATTTCAGTATCGAGTACCAGCAGAA  1760

Query_4  1761  ATACCTGGAACACTACTTACCGGTATTGGAAGAAACGCCGTATATTTGTGGTGGAACTCA  1820
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Query_4  1821  CTGGAACTTTATCGATTTCTCTTCTGCATTGCGTGATGAATCTATGCCGCGCATCAACAA  1880

Query_4  1881  TAAAGGACTGGTATACTCAGACCGCAGTCCAAAAGACGTGTACTATTACTATAAAGCCGC  1940

Query_4  1941  CTGGCGTCAAGACATTCCCGTGTTACACATTGCCAGCCGTGACTGGACGCACCGTAGCGG  2000

Query_4  2001  TGTACAACATGGAAAGGCTCCGGTTCCGCTACCCGTCAAGGTATATACCAATCTTCCGGA  2060

Query_4  2061  AGTGGAACTCTTCATTGACGGAAAATCCTTAGGTAAACAGAAAACAGAGAATTATACAGT  2120

Query_4  2121  TACATTTCAGGTACCATTCAGCCGGAAAGAGCACTTTATCTCCGCCCAAGCTGAAAACAA  2180
119      648              ...........T.....                                  664

Query_4  2181  AGAGTCAGATCAAAGCATCTCCATGATAGAAGATGCCCTCCACATCAACTTCACCCCTAT  2240

Query_4  2241  CCCTGCAAATCTGAATGAAACAAACTTACGGAATCTGGAACTTGCCGTAAATGTAGGCAG  2300

Query_4  2301  CAACTGTTTCTATACTTCCGATGAAAGCCAGCTCACGTGGCTACCCGATCAGCCCTACAC  2360
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Query_4  2361  TGAAAGCAGTTGGGGATATATCGGCGGAGAAAGCAAAAATAGCCAGACACAGGTTGAGAA  2420
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Query_4  2421  TACCCATGACGGGCCATTGTTTCAAACTCTTCGCAACGAAATTGAAGGGTATTGTTTCGA  2480

Query_4  2481  TGTTCCCAACGGAGTCTACAAGGTAGAATTTCTTTTTACAGATATCTTCCGCGAAAATGC  2540

Query_4  2541  AGCAGCTGTTTACCAGTTGGACCGGGAATCCGGTGTAGAGAGCCGTGAAAATATCTTCGA  2600

Query_4  2601  TATAGTTATCAATGGTGAGAGCGTTGAAGAGAACTTTTCTCCTTGCCGCGAAAGCGGTTA  2660

Query_4  2661  TTTCCATGCTCTACGGAAAAGATACAATATTACAAACTTTCGGAATAAAATTGAAATACG  2720

Query_4  2721  CTTCTAACATTGGAAGTGGATAACGGATCCGAATTCGAGCTCCGTCGA-CAAGCTT-GCG  2778
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Query_4  2779  GCCG-CACT-CGAGcaccaccaccaccacca-cT-G-AGA-T-CCGGCTGCTAACAAAG-  2830
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Query_4  2831  CCC--G--AAAGGAAGC-TGAGTTGGC-TG-CTGCCACCGCTGAGCAATAAC-TAG-CA-  2880
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116      22    ...--.--....A.N..                                             10
60       28    ...--.--.....                                                 20
64       26    ...--.--...A...                                               16
56       27    ...--.--...A...                                               17
44       26    ...--.--....                                                  19
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Query= APC115027.107

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Query_5  150   TCAT-CC--G-CAGTTCG-AAAAGGGTA-CCGAGAA-CCTGTACTT-CCAAT-CCAATGC  200
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Query_5  201   CCATGAGAGCAAAACGATCAACGACAGTTGGAAATTCTATCAGGGAGAATGCAAAGCTGC  260
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96       160   .                                                             160
9        155   .                                                             155
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80       152   ..G....                                                       158
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78       148   ..G....                                                       154
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87       799   .                                                             799
122      905   .                                                             905
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137      915   ...                                                           913

Query_5  261   CGCTTCAGCAACCTATGATGACAGTGCGTGGAACAGCATACATCTCCCGCATACATGGAA  320

Query_5  321   TACGGATGCATATACAGaaaaaaaGTATTACCAGGGAACAGGCTGGTATCGCCGTACGCT  380

Query_5  381   GACATTACCGCAAAATTGGCAAACCAAACAGGTATTCCTGAAACTGGATGCAGCCAGTAA  440

Query_5  441   GGCCGCTGCCATCTACATGAATGGACGGAAAATAGGTGAGCATAACGGTGGATATACTGC  500

Query_5  501   CTGCACATTCGATATCACCCCATTCTGTTCATTTGACGCTCCTAATTCTCTCGCTATCCA  560

Query_5  561   TGTAGATAATGCCCGACAGGATATTCCCCCTATCTCTGCCGACTTTACATTCTTCGGCGG  620
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100      580                                                            ...  582
99       573                                                            ...  575

Query_5  621   TATCTACCGGGATGTATGGCTTACAGCCGTACCAAAACAACATTTCCATTTGACGAACTA  680
98       596   A..T...........G...                                           614
100      583   A..T...........G...                                           601
99       576   A..T...........G...                                           594

Query_5  681   TGGTTCAGAAGGAATATTTATCAGTACCCCGCAAGTATCCGAAGAAAAAGGCACAATACT  740

Query_5  741   TATTCGCGGAGAGATAAAGAACGATGCAGAACAGAAAGCATCTCTTGAACTGGAACATAT  800
80       752                                            ..............A..    768
76       749                                            ..............A..    765
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Query_5  801   CGTATACAATCCCGATGGAAGTATTGCCCAGACCCAGAAACAGTCTATCCAGATAAAAGG  860

Query_5  861   TGGAGAATTATACTCTTTCCGCACCGAAACCTCCCCTATTCTGTCCCCCCGATTATGGAC  920

Query_5  921   ACCCGAGGCCCCTCATCTCTACAGAATAGAAAGCATTCTGCGCGATaaaaaaaCAAAAGC  980

Query_5  981   CATCCTAGACCACAGTAATCACCATACAGGCTTCCGCTGGTTTAGCTTCGATGGTAAGAC  1040

Query_5  1041  CGGCTTCTCCCTCAACGGAAAACCTTATAAATTACGCGGTATTTGCCGCCATCAGGACCA  1100

Query_5  1101  AAAACCCATCGGAGTTGCCCTGACAGACGAAATGCACCGTCGTGACATGAAGTTAATGAA  1160

Query_5  1161  AGAGATGGGTGCCAACTTCATCCGCATCTCCCATTATCCGCAAGATGACGCTCTGTTGGA  1220

Query_5  1221  AATGTGCGACAAACTCGGTATGCTAGCTTGGGAAGAAATACCCATTATTGATATTGTGCC  1280

Query_5  1281  CGACACTCCCGGCTATGCAGAAAACTGCGAAAACAATCTGCGAGAAATGATACGCCAGCA  1340

Query_5  1341  CTATAACCATCCCTCCATCATCACCTGGGGATACATGAATCAGATATTACTCGTCACCCA  1400

Query_5  1401  GCGCCGCTATAAAAAAGAAGAAGAACTGAAACCCGTGCTGGAACGGACATTGTCACTGGC  1460

Query_5  1461  CAATCGTTTGGAGAAAGTTCTGAAAGAAGAAGATTCCACTCGTGTCAGCACTATGGCTTT  1520

Query_5  1521  TCATGGCAGTAACAGCTACAATGAGGTAGGACTGGGCAACATCACCGATATTGTCGGTTG  1580

Query_5  1581  GAATCTTTACCAAGGCTGGTATGGAGGAGACCTCACAGGCTTCGAACGTTTCCTGACAGA  1640

Query_5  1641  GCAACACAAAAAACACCCTTCCCATCCGATGATTGTCAGCGAATACGGTGCCGGATCTGA  1700

Query_5  1701  CAAGCGTCTACATTCGCTGCAACCGCACGCTTTTGATTTCAGTATCGAGTACCAGCAGAA  1760

Query_5  1761  ATACCTGGAACACTACTTACCGGTATTGGAAGAAACGCCGTATATTTGTGGTGGAACTCA  1820
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Query_5  1821  CTGGAACTTTATCGATTTCTCTTCTGCATTGCGTGATGAATCTATGCCGCGCATCAACAA  1880

Query_5  1881  TAAAGGACTGGTATACTCAGACCGCAGTCCAAAAGACGTGTACTATTACTATAAAGCCGC  1940

Query_5  1941  CTGGCGTCAAGACATTCCCGTGTTACACATTGCCAGCCGTGACTGGACGCACCGTAGCGG  2000

Query_5  2001  TGTACAACATGGAAAGGCTCCGGTTCCGCTACCCGTCAAGGTATATACCAATCTTCCGGA  2060

Query_5  2061  AGTGGAACTCTTCATTGACGGAAAATCCTTAGGTAAACAGAAAACAGAGAATTATACAGT  2120

Query_5  2121  TACATTTCAGGTACCATTCAGCCGGAAAGAGCACTTTATCTCCGCCCAAGCTGAAAACAA  2180
119      648              ...........T.....                                  664

Query_5  2181  AGAGTCAGATCAAAGCATCTCCATGATAGAAGATGCCCTCCACATCAACTTCACCCCTAT  2240

Query_5  2241  CCCTGCAAATCTGAATGAAACAAACTTACGGAATCTGGAACTTGCCGTAAATGTAGGCAG  2300

Query_5  2301  CAACTGTTTCTATACTTCCGATGAAAGCCAGCTCACGTGGCTACCCGATCAGCCCTACAC  2360
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Query_5  2361  TGAAAGCAGTTGGGGATATATCGGCGGAGAAAGCAAAAATAGCCAGACACAGGTTGAGAA  2420
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Query_5  2421  TACCCATGACGGGCCATTGTTTCAAACTCTTCGCAACGAAATTGAAGGGTATTGTTTCGA  2480

Query_5  2481  TGTTCCCAACGGAGTCTACAAGGTAGAATTTCTTTTTACAGATATCTTCCGCGAAAATGC  2540

Query_5  2541  AGCAGCTGTTTACCAGTTGGACCGGGAATCCGGTGTAGAGAGCCGTGAAAATATCTTCGA  2600

Query_5  2601  TATAGTTATCAATGGTGAGAGCGTTGAAGAGAACTTTTCTCCTTGCCGCGAAAGCGGTTA  2660

Query_5  2661  TTTCCATGCTCTACGGAAAAGATACAATATTACAAACTTTCGGAATAAAATTGAAATACG  2720

Query_5  2721  CTTCTAACATTGGAAGTGGATAACGGATCCGAATTCGAGCTCCGTCGA-CAAGCTT-GCG  2778
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Query_5  2779  GCCG-CACT-CGAGcaccaccaccaccacca-cT-G-AGA-T-CCGGCTGCTAACAAAG-  2830
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Query_5  2831  CCC--G--AAAGGAAGC-TGAGTTGGC-TG-CTGCCACCGCTGAGCAATAAC-TAG-CA-  2880
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35       22    ...--.--...-.....                                             11
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3        27    ...--.--...A...                                               17
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24       27    ...--.--.....                                                 19
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65       51    .....-.....--A..                                              63
109      54    .....-.....--A..                                              66
137      1004                       .....NNA-....A..-G.A..-G..GA..-TN.....T  970
107      45    .....-.....--A..                                              57

Query_6  150   TCAT-CC--G-CAGTTCG-AAAAGGGTA-CCGAGAA-CCTGTACTT-CCAAT-CCAATGC  200
117      697   ....-..--.-.......-.........-.......-.........-.....-.......  647
83       864   ....-..--.-.......-.........-.......C.........-.....-.......  813
85       863   ....-..--.-.......-.........-.......-.........-.....-.......  813
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87       856   ....-..CGC-.......A.........C.......-.........C.....C.......  800
122      957   ....-..--.N.......A.........-.......-.........--.N..-.......  906
101      106   ..C.-G.T-.-.T..-..-.TG......-.......-.........-.....-.......  156
137      969   ..N.T..--.-.....N.-......N..-.......-..N......N.....N.....N.  916

Query_6  201   CCATGAGAGCAAAACGATCAACGACAGTTGGAAATTCTATCAGGGAGAATGCAAAGCTGC  260
117      646   .                                                             646
83       812   .                                                             812
85       812   .                                                             812
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98       164   ...                                                           166
96       160   .                                                             160
9        155   .                                                             155
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17       149   .                                                             149
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80       152   ..G....                                                       158
59       144   ...                                                           146
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95       161   .                                                             161
94       163   .                                                             163
111      152   .                                                             152
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29       148   .                                                             148
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78       148   ..G....                                                       154
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87       799   .                                                             799
122      905   .                                                             905
101      157   ...                                                           159
137      915   ...                                                           913

Query_6  261   CGCTTCAGCAACCTATGATGACAGTGCGTGGAACAGCATACATCTCCCGCATACATGGAA  320

Query_6  321   TACGGATGCATATACAGaaaaaaaGTATTACCAGGGAACAGGCTGGTATCGCCGTACGCT  380

Query_6  381   GACATTACCGCAAAATTGGCAAACCAAACAGGTATTCCTGAAACTGGATGCAGCCAGTAA  440

Query_6  441   GGCCGCTGCCATCTACATGAATGGACGGAAAATAGGTGAGCATAACGGTGGATATACTGC  500

Query_6  501   CTGCACATTCGATATCACCCCATTCTGTTCATTTGACGCTCCTAATTCTCTCGCTATCCA  560

Query_6  561   TGTAGATAATGCCCGACAGGATATTCCCCCTATCTCTGCCGACTTTACATTCTTCGGCGG  620
98       593                                                            ...  595
100      580                                                            ...  582
99       573                                                            ...  575

Query_6  621   TATCTACCGGGATGTATGGCTTACAGCCGTACCAAAACAACATTTCCATTTGACGAACTA  680
98       596   A..T...........G...                                           614
100      583   A..T...........G...                                           601
99       576   A..T...........G...                                           594

Query_6  681   TGGTTCAGAAGGAATATTTATCAGTACCCCGCAAGTATCCGAAGAAAAAGGCACAATACT  740

Query_6  741   TATTCGCGGAGAGATAAAGAACGATGCAGAACAGAAAGCATCTCTTGAACTGGAACATAT  800
80       752                                            ..............A..    768
76       749                                            ..............A..    765
78       750                                            ..............A..    766

Query_6  801   CGTATACAATCCCGATGGAAGTATTGCCCAGACCCAGAAACAGTCTATCCAGATAAAAGG  860

Query_6  861   TGGAGAATTATACTCTTTCCGCACCGAAACCTCCCCTATTCTGTCCCCCCGATTATGGAC  920

Query_6  921   ACCCGAGGCCCCTCATCTCTACAGAATAGAAAGCATTCTGCGCGATaaaaaaaCAAAAGC  980

Query_6  981   CATCCTAGACCACAGTAATCACCATACAGGCTTCCGCTGGTTTAGCTTCGATGGTAAGAC  1040

Query_6  1041  CGGCTTCTCCCTCAACGGAAAACCTTATAAATTACGCGGTATTTGCCGCCATCAGGACCA  1100

Query_6  1101  AAAACCCATCGGAGTTGCCCTGACAGACGAAATGCACCGTCGTGACATGAAGTTAATGAA  1160

Query_6  1161  AGAGATGGGTGCCAACTTCATCCGCATCTCCCATTATCCGCAAGATGACGCTCTGTTGGA  1220

Query_6  1221  AATGTGCGACAAACTCGGTATGCTAGCTTGGGAAGAAATACCCATTATTGATATTGTGCC  1280

Query_6  1281  CGACACTCCCGGCTATGCAGAAAACTGCGAAAACAATCTGCGAGAAATGATACGCCAGCA  1340

Query_6  1341  CTATAACCATCCCTCCATCATCACCTGGGGATACATGAATGAGATATTACTCGTCACCCA  1400

Query_6  1401  GCGCCGCTATAAAAAAGAAGAAGAACTGAAACCCGTGCTGGAACGGACATTGTCACTGGC  1460

Query_6  1461  CAATCGTTTGGAGAAAGTTCTGAAAGAAGAAGATTCCACTCGTGTCAGCACTATGGCTTT  1520

Query_6  1521  TCATGGCAGTAACAGCTACAATGAGGTAGGACTGGGCAACATCACCGATATTGTCGGTTG  1580

Query_6  1581  GAATCTTTACCAAGGCTGGTATGGAGGAGACCTCACAGGCTTCGAACGTTTCCTGACAGA  1640

Query_6  1641  GCAACACAAAAAACACCCTTCCCATCCGATGATTGTCAGCCAGTACGGTGCCGGATCTGA  1700

Query_6  1701  CAAGCGTCTACATTCGCTGCAACCGCACGCTTTTGATTTCAGTATCGAGTACCAGCAGAA  1760

Query_6  1761  ATACCTGGAACACTACTTACCGGTATTGGAAGAAACGCCGTATATTTGTGGTGGAACTCA  1820
27       591                ................                                 576
23       593                ................                                 578
116      379                ................                                 394
25       892                ................                                 877

Query_6  1821  CTGGAACTTTATCGATTTCTCTTCTGCATTGCGTGATGAATCTATGCCGCGCATCAACAA  1880

Query_6  1881  TAAAGGACTGGTATACTCAGACCGCAGTCCAAAAGACGTGTACTATTACTATAAAGCCGC  1940

Query_6  1941  CTGGCGTCAAGACATTCCCGTGTTACACATTGCCAGCCGTGACTGGACGCACCGTAGCGG  2000

Query_6  2001  TGTACAACATGGAAAGGCTCCGGTTCCGCTACCCGTCAAGGTATATACCAATCTTCCGGA  2060

Query_6  2061  AGTGGAACTCTTCATTGACGGAAAATCCTTAGGTAAACAGAAAACAGAGAATTATACAGT  2120

Query_6  2121  TACATTTCAGGTACCATTCAGCCGGAAAGAGCACTTTATCTCCGCCCAAGCTGAAAACAA  2180
119      648              ...........T.....                                  664

Query_6  2181  AGAGTCAGATCAAAGCATCTCCATGATAGAAGATGCCCTCCACATCAACTTCACCCCTAT  2240

Query_6  2241  CCCTGCAAATCTGAATGAAACAAACTTACGGAATCTGGAACTTGCCGTAAATGTAGGCAG  2300

Query_6  2301  CAACTGTTTCTATACTTCCGATGAAAGCCAGCTCACGTGGCTACCCGATCAGCCCTACAC  2360
56       610                                        ...A........A.A..T..T..  588
51       595                                        ...A........A.A..T..T..  573
58       593                                        ...A........A.A..T..T..  571
54       597                                        ...A........A.A..T..T..  575

Query_6  2361  TGAAAGCAGTTGGGGATATATCGGCGGAGAAAGCAAAAATAGCCAGACACAGGTTGAGAA  2420
115      286                        ..C..............                        270
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54       574   AA.GG.A..............                                         554

Query_6  2421  TACCCATGACGGGCCATTGTTTCAAACTCTTCGCAACGAAATTGAAGGGTATTGTTTCGA  2480

Query_6  2481  TGTTCCCAACGGAGTCTACAAGGTAGAATTTCTTTTTACAGATATCTTCCGCGAAAATGC  2540

Query_6  2541  AGCAGCTGTTTACCAGTTGGACCGGGAATCCGGTGTAGAGAGCCGTGAAAATATCTTCGA  2600

Query_6  2601  TATAGTTATCAATGGTGAGAGCGTTGAAGAGAACTTTTCTCCTTGCCGCGAAAGCGGTTA  2660

Query_6  2661  TTTCCATGCTCTACGGAAAAGATACAATATTACAAACTTTCGGAATAAAATTGAAATACG  2720

Query_6  2721  CTTCTAACATTGGAAGTGGATAACGGATCCGAATTCGAGCTCCGTCGA-CAAGCTT-GCG  2778
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18       65        ....................--.....                               41

Query_6  2779  GCCG-CACT-CGAGcaccaccaccaccacca-cT-G-AGA-T-CCGGCTGCTAACAAAG-  2830
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18       45                                           .-.-................C  27

Query_6  2831  CCC--G--AAAGGAAGC-TGAGTTGGC-TG-CTGCCACCGCTGAGCAATAAC-TAG-CA-  2880
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24       27    ...--.--.....                                                 19
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Query= APC115038.151

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Query_7  150   TCAT-CC--G-CAGTTCG-AAAA-GGGTA-CCGAGAA-CCTGTACTT-CCAAT-CCAATG  199
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101      106   ..C.-G.T-.-.T..-..-.TG.-.....-.......-.........-.....-......  155

Query_7  200   -CC-AAGTCACCGCAAGAC---ATGGATCGCTTCATCGACGCACTGATGAAGAAGATGAC  254
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83       813   -..                                                           812
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9        174                                                       ........  181
98       163   C..-....                                                      169
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70       151   -..-C..                                                       155
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111      151   -..-..                                                        154
100      150   C..-....                                                      156
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99       143   C..-....                                                      149
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Query_7  255   CGTGGAAGAGAAA--ATCGGACAATTGAACCTACCCGTCACGGGAGACATCACCACGGGA  312
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9        182   .C.T..G......--.....T..GA......                               210

Query_7  313   CAGGCCAAAAGTAGCGACGTGGCACAAAA-GATTGAAAAAGGATTGGTGGGCGGACTC-T  370
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Query_7  371   TCAACCTAAAAGGTGTAGACCGTATTCTTGAAGTGCAAAAGCTGGCAGTAGAGAAATCAC  430
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Query_7  431   GCCTCGGTATTCCCCTGCTGTTCGGCATGGATGTGATACATGGCTACGAAACCATCTTCC  490
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Query_7  491   CCATTCCATTGGGATTGTCCTGCACCTGGGATATGGCGGCTATCGAGAAATCCGCCCGTA  550
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122      611   .T.....T.....TA..G.TGC...A.........AA......A..AC....T..T....  552

Query_7  551   TTGCAGCCATCGAAGCAAGTGCCGATGGCATTTCCTGGACATTCAGTCCGATGGTAGACA  610
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122      551   .A..G..G..A.....C..............C.G.........T...........T..T.  492

Query_7  611   TCAGTCGCGACCCACGTTGGGGACGTGTCAGCGAGGGCTCGGGAGAAGATCCGTTTCT-G  669
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131      894   ....C..T..T..G..C........C...........TAAC..C.....C..A..CT.-.  836
122      491   ....C..T..T.................ATC...A..TAGC...........T...T.-A  433

Query_7  670   GGTGGAGCTATCGCACAGGCAATGGTATACGGATACCAGGGTGCCAATCTGCAAGACCA-  728
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Query_7  729   ATTGCACCGCAAC-GA-TGAAATCATGGCTTGC-GTAAAAGCT---TTT-GC-ATTGTAT  780
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Query_7  781   GGAGCCGGAG-AAGCCGGA--CGCGACT-ATAATACAGTA-GATAT-GAGCCGC-AACCG  833
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121      1003  ..G..ATC..-........--.......-..........G-.....-...T.AT-C.A..  951

Query_7  834   -GATGTTCAATGAATTCATGTA-CCCGTATGAGGCTGCC-GTAGAGGCCGGAGTGGGTAG  890
1        154   -.....................-................-....................  210
117      12    -.GAN.....                                                    4
17       782   -T........C....A......-T..C..CC.A......-.....T..A..T..A..C..  838
29       781   -T........C....A......-T..C..CC.A......-.....T..A..T..A..C..  837
126      969   -T........C....A......-T..-..CC.A......-.....T..A..T..A..C..  914
21       182   -T........C...NA......-T..C..CC.A......-.....T..A..T..A..C..  238
120      973   -T........C....A......T...T..CC.A......-.....T..A..T..A..C..  916
137      278   -T........C....A......-T..C..CC.A......-.....T..A..T..A..C..  222
19       185   -T........C....A......-T..C..CC.A......-.....T..A..T..A..C..  241
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121      950   -T........C....AT....T-A..T...C........-..G..A.AA..T........  894

Query_7  891   TGTGATGGCGTC-ATTCAATGAAATAGACGGTATTCCCGCCACCG-GAAACAAATGGC-T  947
1        211   ............-................................-............-.  267
17       839   C..A...T....TT.....C...........C..A..A.....G.-CC..T.......T.  897
29       838   C..A........-T.....C......N....C..A..AN....G.CCC.TT..T....-.  895
126      913   C..A........-T.....C...........C..A..A.....G.-CC..T.......-.  857
21       239   C..A........-T.....C...........C..A..A.....G.-CC..T.......-.  295
120      915   C..A........-T.....C...........C..A..A.....G.-CC..T.......-.  859
137      221   C..A........-T.....C...........C..A..A.....G.-CC..T.......-.  165
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123      914   C..A...N-..N-T....N-...........C..A..A.....-.-.C..T......N-.  861
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121      893   .........T..-..........G.G..T...G.A..G..T....-....T..G....-.  837
4        30                              ..T..A.....T..A..A.-CC.........T-.  61

Query_7  948   GCTGAGCGATTTGCTGCGTG-GCCAGTGGGGCTTCGAAGGGTTTGTGGTAACGGACTTCA  1006
1        268   ....................-.......................................  326
17       898   .A...C...CG.A.....CA-AG..A...........C..C........G..A.....T.  956
29       896   .A...C...NN.A....                                             912
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4        62    .A.A.CT...G.C......A-AA....AT..A...NGT..T.....C..T.......AT.  120

Query_7  1007  CAGGCATTTCAGAGA-T-GATAGAGCATGGTGTCGGCGAC-TTGCAAACCGTCAGTGCAC  1063
1        327   ...............-.-......................-...................  383
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126      797   .C..T..C..C..A.-.-.....C...C..CA....T...-.....G..T..TTCC....  741
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122      98    .C..T..CATG..A.-.-.G..A.T......A.T..A..T-A...G.GAA...TC...C.  42
121      777   .C..T..CA.T..A.-.-..CC..T......A.G..T..T-ACA.....A..TGCA..C.  721
4        121   .C..T..CATG..A.-.-.G..A.T......A.T..A..T-A...G.GAA...TC...C.  177

Query_7  1064  TCGCTCTTAATGCAGGGGTGGACATGGATATGGTAAGTGAGGGCTTCGTCGGTACACTGA  1123
1        384   ............................................................  443
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120      742   GT..A..C........C.....T.....C...........A......ACG......A.C.  683
137      48    GT..A..C........C.....                                        27
19       415   GT..A..C........C.....T.....C...........A......ACG......A.C.  474
131      441   GT..A..C........C.....T.....C...........A......ACG......A.C.  382
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123      742   GT..A..C........C.....T.....C...........A......ACG......A.C.  683
122      41    GT...T.G.G......A.....T..........                             9
121      720   .G.....G........T..C..T...........G..C..T.CT..TACAA.C.....T.  661
4        178   GT...T.G.G......A.....T...........G..C..A..T.ATC.TTC......TC  237

Query_7  1124  TGAAATCAATTAAAGAAGGAAAAG--TAAGAATGGGCACGTTGAATACAGCCTGCCGCCG  1181
1        444   ........................--..................................  501
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19       475   A......C..AG.C.....C..GA--.C..T....AA..CC..G.C.A......T.....  532
131      381   A......C..AG.C.....C..GA--.C..T....AA..CC..G.C.A......T.....  324
134      684   A......C..AG.C.....C..GA--.C..T....AA..CC..G.C.A......T.....  627
123      682   A......C..AG.C.....C..GA--.C..T....AA..CC..G.C.A......T.....  625
121      660   AA.....TC.GG............TT.C..T.AA...-T....-..G.T..T..T.....  603
4        238   AAC.....T.G..G..G..T..GA--...C.GA.AAAGA.A.AG..CA...T.....T..  295

Query_7  1182  GATATTGGAAGCGAAATACAAGCTGGGACTGTTTGACAATCCTTATAAATACTGCGA-CG  1240
1        502   .........................................................-..  560
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21       530   C..CC.T.....C........A......T.A..C..............G........-.C  588
120      624   C..CC.T.....C........A......T.A..C..............G........-.C  566
19       533   C..CC.T.....C........A......T.A..C..............G........-.C  591
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134      626   C..CC.T.....C........A......T.A..C..............G........-.C  568
123      624   C..CC.T.....C........A......T.A..C..............G........-.C  566
121      602   T..TC.......T..G..T........G..T.....T.....C........T..T..-TA  544
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55       578     ..N.......C..G..T...T.A...N....CACA...........G..           530

Query_7  1241  TGAACCGTCCGAAGCGGGATATCTTCACAAAAGAGCATCGTGACGCCGCCCGCAAGATTG  1300
1        561   ............................................................  620
126      563   ....A..C........T..C........C..G..A.....C.....T..T..T.......  504
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19       592   ....A..C........T..C........C..G..A.....C.....T..T..T.......  651
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123      565   ....A..C........T..C........C..G..A.....C.....T..T..T.......  506
121      543   .A.C......T..AAAAC.A.....T........A..C..C.CTATA.....T....CA.  484
4        356   ....-...G.C..AAC........A...TG.T..A.....GAGTATT..A...CG...CT  414

Query_7  1301  CCGGCGAAAGTTTTGTTCTTCTGAAGAATGCCCCCGCCACCGCACAGCCACTCGCAGCTC  1360
1        621   ............................................................  680
126      503   .G..A..G..C.....A..C.....A..------..A..------..T..-----G.T..  461
21       649   .G..A..G..C.....A..C.....A..------..A..------..T..-----G.T..  691
120      505   .G..A..G..C.....A..C.....A..C.-------------...---------..-..  469
19       652   .G..A..G..C.....A..C.....A..------..A..------..T..-----G.T..  694
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121      483   .TTCG.....C........CT.........---------------..------------A  451
4        415   .T.CT.....C.........T.A.......                                444

Query_7  1361  ATAGCTCGTCACCCGTAACTGCTTCCCCCGTGCTTCCGTTGAAGAAACAA-GGTACAGTT  1419
1        681   ..................................................N.........  740
2        21         .....N....G..................................-.........  74
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126      460   C.----------------....AAA...AACA.....T.....A...G..-.....G..G  418
21       692   C.----------------....AAA...AACA.....T.....A...G..-.....G..G  734
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33       24                                                    ..-.....CA..  34
121      450   ....---------T...----..C..--------..T.GCA......----.....CA..  416

Query_7  1420  GCCGTCATCGGCCCTCTCGGAAATACCCGCAGCAACATGCCGGGCACCTGGAGCGTAGCC  1479
1        741   ............................................................  800
2        75    ...........N.............................................N..  134
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121      415   ..T..AG.A..T...T.G.CCG...G...T.....T...........GGCT..T..G...  356

Query_7  1480  GCACGCCTCAACGATTATCCTTCTTTATACGAAGGCTT-GA-AAGAAATGATGGCAGGCA  1537
1        801   ......................................-..-..................  858
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121      355   ..TGTGA.G...A.A...........GATT........-..-.....G.AG...G.....  298

Query_7  1538  A-GGTGAACATCACCTA-TG-CCAAAGGTAGTAACCTCATCGGCGATGCAGCTTACGAAG  1594
1        859   .-...............-..-..............................N.......-  914
115      1082  .N.......N..-....-..G.NN.........C.T........................  1025
2        193   .-...............-..-....................N.......GN........N  249
25       204   .-...A........T..-..-....................A.T........C.......  260
126      299   .-...A........T..-..-....................A.T........C.......  243
21       853   .-...A........T..-..-....................A.T........C.......  909
120      301   .-...A........T..-..-....................A.T........C.......  245
19       857   .-...A........T..-..-...........-.......NA.T........C.......  912
134      303   .-...A........T..-..-....................A.T........C.......  247
123      301   .-...A........T..-..-....................A.T........C.......  245
33       153   .-..CT..A..-T.T..CG.-.T.....A.....T..G..GA.T.....C.AA.......  209
121      297   .-..CT..A..-T.T..CG.-.T.....A.....T..G..GA.T.....C.AA.......  241
4        615                  ..-..-.T..G.....CC.T..G..GA.T.....G.....T..G.  657

Query_7  1595  AA-CGTGCCACC-ATGTTCGGCCGTTCA-TTGAACCGCGATAAT------CGCACGGA-C  1644
1        915   N.-.........-........-N.....-............-..------........-.  962
115      1024  ..A.........C..N.A..T.......A....N........N.------........G.  971
2        250   ..-.........-........N.....N-...............------........-.  299
23       9                                                             ..-.  11
25       261   ..-........A-...............-..A..T..T......------..T..A..-.  310
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19       913   ..-........A-...............-..A..T.NT......------..T..A..-.  962
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123      244   ..-........A-...............-..A..T..T......------..T..A..-.  195
33       210   ..-.....T..T-.....T......A.T-C..C.T..T..C...------..T..A..-T  259
121      240   ..-.....T..T-.....T......A.T-C..C.T..T..C...------..T..A..-T  191
4        658   ..-.....A..A-C.C..T..A...A..-..AT....G.....GGAAAAA..TT.C..-T  713

Query_7  1645  CAGGAGTTACTGGACGAA-GCACTGAAAA-TTG-CAGCCGGCGCCGATGTT-ATCGT-A-  1698
1        963   ..-.N.............-..........-...-......N..........-....N-.-  1015
115      970   ..................N..........AN..-...........N.....T.....-.-  914
2        300   ..NN..............-..........-...-.N.....N.........-...N.-.-  353
27       11    ..A...A.G.....T..G-..G......G-.G.-.C..TAAT..A.....A-..AA.-.-  64
23       12    A.A...A.G.....T..G-..G......G-.G.-.C..TAAT..A.....A-..AA.-.C  66
25       311   A.A...A.G.....T..G-..G......G-.G.-.C..TAAT..A.....A-..AA.-.-  364
126      192   A.A...A.G.....T..G-..G......G-.G.-.C..TAAT..A.....A-..AA.-.-  139
21       960   A.A...A.G.....T..G-..G......G-.G.-NC..TAAT..A....-.-.NAA.-.-  1012
116      952            .....T..N-N.G.......-G..N.C.NTAAT..A.....A-..AA.-.-  907
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4        714   ATCC..A.G...A.T...-...T.A..TG-...-.TCAT..T.........-G.T..-T-  767

Query_7  1699  GCTGCCCTGGGAGAATCTTCTGAAATG-AGCGGTGAA---A-GTTCAAGCCGCACCGAAC  1753
1        1016  -.....TG.................N.A...T.AN..---.-..................  1070
115      913   ...........................-.........---.-..................  859
2        354   C..........................-.........---.-..................  408
27       65    ..C..AT..........A.........-..T...C.G---.-............-.T...  118
23       67    ..C..AT..........A.........-..T......---.-............-.T...  120
25       365   ..C..AT..........A.........-..T......---.-............-.T...  418
126      138   ..C..AT..........A.........-..T......---.-............-.T...  85
21       1013  ..C..AT.....N....A.........-..T....-.---.-.............       1061
116      906   ..C..AN...N......A.........-..T......---.-..A..........TATC.  852
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19       1019  ..-CN.T........N.A.........A..T......---.G..C..N.....CA.T...  1074
134      142   ..C..AT..........A.........-..T...C.G---.-.............TA.C.  88
123      140   ..C..AT..........A.........-..T......---.-.............TA.C.  86
33       314   .....TT....T..G.....C..G...-.........---.-..AGTT....T..A..C.  368
121      136   .....TT....T..G.....C..G...-.........---.-..AGTT....T..A..C.  82
4        768   ..G..AT.A..T...............-..T......TCG.-..---..T..A..A..TT  822

Query_7  1754  TC-GGCT-TGCCCGATGTACAACATACCCTGTTGG-AAGCCTTACTGAAAACGGGTAAAC  1810
1        1071  ..NN...-.-N.....N...-.N..NN.T..GN..T............N.CG......N.  1127
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19       1075  ..                                                            1076
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4        823   .G-AATA-.T..T.....T...-.A..NT.A....-...AA...G.......A..-N...  877
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Query_7  1811  CCGTAGT-ACTAAC-CCT-CTTTACCGG-TCGGCCGTTGACGC-TGAACTGGGAACAGGA  1865
1        1128  .                                                             1128
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126      26    .T..T..-...G..-G..-...                                        8
116      794   .T..T..-...G..-G..-...N..A..-...C..AC.A...T-...CT...........  740
120      28    .T..T..-...G..-G..-...                                        10
134      30    .T..TN.-...G..G.T.-...N..                                     8
123      28    .T..-..-...G..-G..N...A..A..-..                               2
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121      24    .G..G..-.                                                     17
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4        878   .T..C..-T..GGT-AT.-A..C..T..-G..T........C.T...CN......G.-C.  932
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13       398   .T.....G....                                                  409
7        397   .T.....G....                                                  408
6        408   .T.....G....                                                  419
133      292   .T.....G....                                                  281
11       400   .T.....G....                                                  411

Query_7  1866  GCATGTA-CCTGCCATCTTGAA-TGTATGGTTCGGAGGCAGTGAAGCGGCTTATGCCATT  1923
115      745   .......-..............-.....................................  688
2        521   .......-..............-.....................................  578
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8        747   ......T-..G..T...C....-C..G.....T.CC.............G.G........  690
4        933   AA.....T.T...T..TC....-...T.....T.....T.NC...A.C........TN.A  991

Query_7  1924  GGCGATGTTCTGTTCGGTGACGTCAATCCGAGTGGAAAACTAACCATGACTTTCCCGAAG  1983
115      687   ............................................................  628
2        579   ............................................................  638
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8        689   .C......GA....T..A..A..ATC...TTCG..T..G..G..T.C..G......ACGT  630
4        992   .NA....-...N.....                                             1007
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11       540                              ...........GGCGC.GG.C..........G.  572

Query_7  1984  AATGTAGGCCAGATACCTTTGTTCTACAATCATAAGAATACCGGTCGGCC---ACTGGCG  2040
115      627   ..................................................---.......  571
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33       599   .G......A.....T...........T..C...........T.....T..---TT..C.T  655
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6        581   .TG..G..A..A..T...G...A....GC......T........A..T..            630
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11       573   .TG..G..A..A..T...G...A....GC......T........                  616

Query_7  2041  GCAGGCAAATGGTTCGAAAA-GTTCCGTTCA--AACTATCTGGATGTGGATAACGAACCG  2097
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2        696   ....................G.C..GT....--....................N......  753
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8        572   .-.T.AC.C.AC..TC..TC-...AT.-G..GC..T..CA.C..CCA.AG...T......  516

Query_7  2098  CTGTATCCCTTCGGTTATGGATTGTCGTATACCAC-TTTCCAGTACAGTGACATTGCA-T  2155
115      513   ...................................-......................-.  456
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Query_7  2156  TGAGCACACCGACATTGGG-AAAAGATGGTTCCGTTACAGCCGTAGTCACCGTCA-CC-A  2212
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8        457   ....                                                          454

Query_7  2213  ATACTGGTAAACATGACGGTGCGGAAGTAGTTCAAC-TCTATATCCGCGAC-CTCGTAGG  2270
115      398   ....................................-..............-........  341
2        872   .................-......N....N......-...........N.N-....N...  928
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33       829   ....A.....GT........T..........G..G.-.A............T..TA....  887

Query_7  2271  AAGTATCA-CCCGCCCTGT-ACGCG-AGTTGAAAGGTTTCAATAAAATCTTCCTTC---G  2324
115      340   ........-..........-.....-..............................---.  287
2        929   ..NGN...-....N.....-N.T..-........T.G....--T....T..T....---.  980
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33       888   C...G.A.-.A..T..G..G.AAGA-.NC....G.C...G..-.........          936

Query_7  2325  CGCCGGAGAAAGCAAAACGGTATCATTCA-CTATCACG-CGTGATCTGCTTCGCTT-CTA  2381
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Query_7  2382  TGATTACGACCTGAACTACGTAGCC-GAACCGGGTGACTTTG-ACATCATGATCGGTGGA  2439
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Query_7  2440  AACAGCCAGGCTGTGAAGACGGCGAAGTT---GACACTTTAACATTGGAAGTGGATAACG  2496
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Query_7  2497  GATCCGAATTCGAGCTCCGTCGA-CAAGC-TTGCGGCCG-CACT-CGAGcaccaccacca  2552
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Query_7  2553  ccacca-cT-G-AGA-T-CCGGCTGCTAACAAAG-CCC--G--AAAGGAAGC-TGAGTTG  2601
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Query= APC115038.152

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Query_8  200   -CC-AAGTCACCGCAAGAC---ATGGATCGCTTCATCGACGCACTGATGAAGAAGATGAC  254
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99       143   C..-....                                                      149
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Query_8  255   CGTGGAAGAGAAA--ATCGGACAATTGAACCTACCCGTCACGGGAGACATCACCACGGGA  312
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Query_8  313   CAGGCCAAAAGTAGCGACGTGGCACAAAA-GATTGAAAAAGGATTGGTGGGCGGACTC-T  370
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Query_8  371   TCAACCTAAAAGGTGTAGACCGTATTCTTGAAGTGCAAAAGCTGGCAGTAGAGAAATCAC  430
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Query_8  431   GCCTCGGTATTCCCCTGCTGTTCGGCATGGATGTGATACATGGCTACGAAACCATCTTCC  490
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122      671   ....GAAA.....TT.A..C..T...........T..T.....G..T.....TG.T....  612

Query_8  491   CCATTCCATTGGGATTGTCCTGCACCTGGGATATGGCGGCTATCGAGAAATCCGCCCGTA  550
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122      611   .T.....T.....TA..G.TGC...A.........AA......A..AC....T..T....  552

Query_8  551   TTGCAGCCATCGAAGCAAGTGCCGATGGCATTTCCTGGACATTCAGTCCGATGGTAGACA  610
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122      551   .A..G..G..A.....C..............C.G.........T...........T..T.  492

Query_8  611   TCAGTCGCGACCCACGTTGGGGACGTGTCAGCGAGGGCTCGGGAGAAGATCCGTTTCT-G  669
117      236   ..........................................................-.  178
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131      894   ....C..T..T..G..C........C...........TAAC..C.....C..A..CT.-.  836
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Query_8  670   GGTGGAGCTATCGCACAGGCAATGGTATACGGATACCAGGGTGCCAATCTGCAAGACCA-  728
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Query_8  729   ATTGCACCGCAAC-GA-TGAAATCATGGCTTGCGTAAAA-CACTTTG--CATTGTATGGA  783
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Query_8  784   GCCGGAG-AAGCCGGA--CGCGACT-ATAATACAGTA-GATAT-GAGCCGC-AACCG-GA  835
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21       132   .......-........--..T..T.-.C.....C...-.....-...T..T-.....-T.  183
137      328   .......-........--..T..T.-.C.....C...-.....-...T..T-.....-T.  277
19       135   .......-........--..T..T.-.C.....C...-.....-...T..T-.....-T.  186
131      721   .......-........--..T..T.-.C.....C...-.....-...T..T-.....-T.  670
134      1017  ..T.-..-......-.--..T..T.-NC.....C...A.....-...T..T-.....-T.  967
123      1028  .......G.....C..NA..T..T.T.C.G...N...-.....T...T..T-.....TN.  971
122      321   ..A.C..-.......T--TTG....-........ACT-..C..-......T-.TT..-T.  270
121      1000  ..ATC..-........--.......-..........G-.....-...T.AT-C.A..-T.  949

Query_8  836   TGTTCAATGAATTCATGTA-CCCGTATGAGGCTGCC-GTAGAGGCCGGAGTGGGTAGTGT  893
1        156   ...................-................-.......................  213
117      10    AN.....                                                       4
17       784   .......C....A......-T..C..CC.A......-.....T..A..T..A..C..C..  841
29       783   .......C....A......-T..C..CC.A......-.....T..A..T..A..C..C..  840
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21       184   .......C...NA......-T..C..CC.A......-.....T..A..T..A..C..C..  241
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121      948   .......C....AT....T-A..T...C........-..G..A.AA..T...........  891

Query_8  894   GATGGCGTC-ATTCAATGAAATAGACGGTATTCCCGCCACCG-GAAACAAATGGC-TGCT  950
1        214   .........-................................-............-....  270
17       842   A...T....TT.....C...........C..A..A.....G.-CC..T.......T..A.  900
29       841   A........-T.....C......N....C..A..AN....G.CCC.TT..T....-..A.  898
126      910   A........-T.....C...........C..A..A.....G.-CC..T.......-..A.  854
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21       242   A........-T.....C...........C..A..A.....G.-CC..T.......-..A.  298
137      218   A........-T.....C...........C..A..A.....G.-CC..T.......-..A.  162
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134      912   A........--.....C...........C..A..A.....G.-CC..T.......-..A.  857
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4        30                           ..T..A.....T..A..A.-CC.........T-..A.  64

Query_8  951   GAGCGATTTGCTGCGTG-GCCAGTGGGGCTTCGAAGGGTTTGTGGTAACGGACTTCACAG  1009
1        271   .................-..........................................  329
17       901   ..C...CG.A.....CA-AG..A...........C..C........G..A.....T..C.  959
29       899   ..C...NN.A....                                                912
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121      833   ..C....G.A..T...A-AG......AAT..T..T.....C..T..G.......AT..C.  775
4        65    A.CT...G.C......A-AA....AT..A...NGT..T.....C..T.......AT..C.  123

Query_8  1010  GCATTTCAGAGA-T-GATAGAGCATGGTGTCGGCGAC-TTGCAAACCGTCAGTGCACTCG  1066
1        330   ............-.-......................-......................  386
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126      794   .T..C..C..A.-.-.....C...C..CA....T...-.....G..T..TTCC....GT.  738
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121      774   .T..CA.T..A.-.-..CC..T......A.G..T..T-ACA.....A..TGCA..C..G.  718
4        124   .T..CATG..A.-.-.G..A.T......A.T..A..T-A...G.GAA...TC...C.GT.  180

Query_8  1067  CTCTTAATGCAGGGGTGGACATGGATATGGTAAGTGAGGGCTTCGTCGGTACACTGATGA  1126
1        387   ............................................................  446
126      737   .A..C........C.....T.....C...........A......ACG......A.C.A..  678
120      739   .A..C........C.....T.....C...........A......ACG......A.C.A..  680
21       415   .A..C........C.....T.....C...........A......ACG......A.C.A..  474
137      45    .A..C........C.....                                           27
19       418   .A..C........C.....T.....C...........A......ACG......A.C.A..  477
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134      741   .A..C........C.....T.....C...........A......ACG......A.C.A..  682
123      739   .A..C........C.....T.....C...........A......ACG......A.C.A..  680
122      38    ..T.G.G......A.....T..........                                9
121      717   ....G........T..C..T...........G..C..T.CT..TACAA.C.....T.AA.  658
4        181   ..T.G.G......A.....T...........G..C..A..T.ATC.TTC......TCAAC  240

Query_8  1127  AATCAATTAAAGAAGGAAAAG--TAAGAATGGGCACGTTGAATACAGCCTGCCGCCGGAT  1184
1        447   .....................--.....................................  504
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19       478   ....C..AG.C.....C..GA--.C..T....AA..CC..G.C.A......T.....C..  535
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123      679   ....C..AG.C.....C..GA--.C..T....AA..CC..G.C.A......T.....C..  622
121      657   ....TC.GG............TT.C..T.AA...-T....-..G.T..T..T.....T..  600
4        241   .....T.G..G..G..T..GA--...C.GA.AAAGA.A.AG..CA...T.....T..T..  298
55       578                                                              .  578

Query_8  1185  ATTGGAAGCGAAATACAAGCTGGGACTGTTTGACAATCCTTATAAATACTGCGA-CGTGA  1243
1        505   ......................................................-.....  563
126      619   CC.T.....C........A......T.A..C..............G........-.C...  561
120      621   CC.T.....C........A......T.A..C..............G........-.C...  563
21       533   CC.T.....C........A......T.A..C..............G........-.C...  591
19       536   CC.T.....C........A......T.A..C..............G........-.C...  594
131      320   CC.T.....C........A......T.A..C..............G........-.C...  262
134      623   CC.T.....C........A......T.A..C..............G........-.C...  565
123      621   CC.T.....C........A......T.A..C..............G........-.C...  563
121      599   TC.......T..G..T........G..T.....T.....C........T..T..-TA.A.  541
4        299   T.....G..A.....T.........T.A.....T...........G..T..T..TAC...  358
55       577   .N.......C..G..T...T.A...N....CACA...........G..              530

Query_8  1244  ACCGTCCGAAGCGGGATATCTTCACAAAAGAGCATCGTGACGCCGCCCGCAAGATTGCCG  1303
1        564   ............................................................  623
126      560   .A..C........T..C........C..G..A.....C.....T..T..T........G.  501
120      562   .A..C........T..C........C..G..A.....C.....T..T..T........G.  503
21       592   .A..C........T..C........C..G..A.....C.....T..T..T........G.  651
19       595   .A..C........T..C........C..G..A.....C.....T..T..T........G.  654
131      261   .A..C........T..C........C..G..A.....C.....T..T..T........G.  202
134      564   .A..C........T..C........C..G..A.....C.....T..T..T........G.  505
123      562   .A..C........T..C........C..G..A.....C.....T..T..T........G.  503
121      540   C......T..AAAAC.A.....T........A..C..C.CTATA.....T....CA..TT  481
4        359   .-...G.C..AAC........A...TG.T..A.....GAGTATT..A...CG...CT.T.  417

Query_8  1304  GCGAAAGTTTTGTTCTTCTGAAGAATGCCCCCGCCACCGCACAGCCACTCGCAGCTCATA  1363
1        624   ............................................................  683
126      500   .A..G..C.....A..C.....A..------..A..------..T..-----G.T..C.-  459
120      502   .A..G..C.....A..C.....A..C.-------------...---------..-...G-  467
21       652   .A..G..C.....A..C.....A..------..A..------..T..-----G.T..C.-  693
19       655   .A..G..C.....A..C.....A..------..A..------..T..-----G.T..C.-  696
131      201   .A..G..C.....A..C.....A..------..A..------..T..-----G.T..C.-  160
134      504   .A..G..C.....A..C.....A..C.-------------...---------..-...G-  469
123      502   .A..G..C.....A..C.....A..C.-------------...---------..-...G-  467
121      480   CG.....C........CT.........---------------..------------A...  448
4        418   CT.....C.........T.A.......                                   444

Query_8  1364  GCTCGTCACCCGTAACTGCTTCCCCCGTGCTTCCGTTGAAGAAACAA-GGTACAGTTGCC  1422
1        684   ...............................................N............  743
2        21      .....N....G..................................-............  77
25       59                                 .....T.....A...G..-.....G..G..T  88
126      458   ---------------....AAA...AACA.....T.....A...G..-.....G..G..T  415
120      466   .T..C..---------...AAA...AACA.....T.....A...G..-.....G..G..T  417
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134      468   .T..C..---------...AAA...AACA.....T.....A...G..-.....G..G..T  419
123      466   .T..C..---------...AAA...AACA.....T.....A...G..-.....G..G..T  417
33       24                                                 ..-.....CA....T  37
121      447   .---------T...----..C..--------..T.GCA......----.....CA....T  413

Query_8  1423  GTCATCGGCCCTCTCGGAAATACCCGCAGCAACATGCCGGGCACCTGGAGCGTAGCCGCA  1482
1        744   ............................................................  803
2        78    ........N.............................................N..N..  137
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121      412   ..AG.A..T...T.G.CCG...G...T.....T...........GGCT..T..G.....T  353

Query_8  1483  CGCCTCAACGATTATCCTTCTTTATACGAAGGCTT-GA-AAGAAATGATGGCAGGCAA-G  1539
1        804   ...................................-..-...................-.  860
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2        138   .......N...................N.......-..-...................-.  194
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131      55    ...........C.........G.G........-A.-..-....G....              11
134      358   ...........C.........G.G........A..-..-....G......AA......-.  302
123      356   ...........C.........G.G........A..-..-....G......AA......-.  300
33       98    GTGA.G...A.A...........GATT........-..-.....G.AG...G......-.  154
121      352   GTGA.G...A.A...........GATT........-..-.....G.AG...G......-.  296

Query_8  1540  GTGAACATCACCTA-TG-CCAAAGGTAGTAACCTCATCGGCGATGCAGCTTACGAAGAA-  1596
1        861   ..............-..-..............................N.......-N.-  916
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2        195   ..............-..-....................N.......GN........N..-  251
25       206   ..A........T..-..-....................A.T........C.........-  262
126      297   ..A........T..-..-....................A.T........C.........-  241
120      299   ..A........T..-..-....................A.T........C.........-  243
21       855   ..A........T..-..-....................A.T........C.........-  911
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134      301   ..A........T..-..-....................A.T........C.........-  245
123      299   ..A........T..-..-....................A.T........C.........-  243
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121      295   .CT..A..-T.T..CG.-.T.....A.....T..G..GA.T.....C.AA.........-  239
4        615               ..-..-.T..G.....CC.T..G..GA.T.....G.....T..G...-  659

Query_8  1597  CGTGCCACC-ATGTTCGGCCGTTCA-TTGAACCGCGATAAT------CGCACGGA-CCAG  1647
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2        252   .........-........N.....N-...............------........-...N  302
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23       9                                                          ..-.A.A  14
25       263   ........A-...............-..A..T..T......------..T..A..-.A.A  313
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4        660   .....A..A-C.C..T..A...A..-..AT....G.....GGAAAAA..TT.C..-TATC  716

Query_8  1648  GAGTTACTGGACGAA-GCACTGAAAA-TTG-CAGCCGGCGCCGATGTT-ATCGT-A-GCT  1701
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4        717   C..A.G...A.T...-...T.A..TG-...-.TCAT..T.........-G.T..-T-..G  770

Query_8  1702  GCCCTGGGAGAATCTTCTGAAATG-AGCGGTGAA---A-GTTCAAGCCGCACCGAACTC-  1755
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Query_8  1756  GGCT-TGCCCGATGTACAACATACCCTGTTGG-AAGCCTTACTGAAAACGGGTAAACCCG  1813
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Query_8  1814  TAGT-ACTAAC-CCT-CTTTACCGG-TCGGCCGTTGACGC-TGAACTGGGAACAGGAGCA  1868
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Query_8  1869  TGTA-CCTGCCATCTTGAA-TGTATGGTTCGGAGGCAGTGAAGCGGCTTATGCCATTGGC  1926
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Query_8  1927  GATGTTCTGTTCGGTGACGTCAATCCGAGTGGAAAACTAACCATGACTTTCCCGAAGAAT  1986
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Query_8  1987  GTAGGCCAGATACCTTTGTTCTACAATCATAAGAATACCGGTCGGCC---ACTGGCGGCA  2043
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Query_8  2044  GGCAAATGGTTCGAAAAGGCTCG-TTCAAACTATCTGGATGTGGATAACGAACCGCTGTA  2102
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Query_8  2103  TCCCTTCGGTTATGGATTGTCGTATACCAC-TTTCCAGTACAGTGACATTGCA-TTGAGC  2160
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Query_8  2161  ACACCGACATTGGG-AAAAGATGGTTCCGTTACAGCCGTAGTCACCGTCA-CC-AATACT  2217
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Query_8  2218  GGTAAACATGACGGTGCGGAAGTAGTTCAAC-TCTATATCCGCGAC-CTCGTAGGAAGTA  2275
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Query_8  2276  TCA-CCCGCCCTGT-ACGCG-AGTTGAAAGGTTTCAATAAAATCTTCCTTC---GCGCCG  2329
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Query_8  2330  GAGAAAGCAAAACGGTATCATTCA-CTATCACG-CGTGATCTGCTTCGCTT-CTATGATT  2386
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Query_8  2387  ACGACCTGAACTACGTAGCC-GAACCGGGTGACTTTG-ACATCATGATCGGTGGAAACAG  2444
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Query_8  2445  CCAGGCTGTGAAGACGGCGAAGTT---GACACTTTAACATTGGAAGTGGATAACGGATCC  2501
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Query_8  2502  GAATTCGAGCTCCGTCGA-CAAGC-TTGCGGCCG-CACT-CGAGcaccaccaccaccacc  2557
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Query_8  2558  a-cT-G-AGA-T-CCGGCTGCTAACAAAG-CCC--G--AAAGGAAGC-TGAGTTGGC-TG  2605
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Query= APC115043.128

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Query_9  99    TATAC-ATATG--CACCAT-CATCATCAT-CATTCTT-CT-GG-TGTAGATC-TGTGGTC  149
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120      1056                                 ......-.A..-N..-.......TC..N-  1032
21       96                                   ........A..-...A...GCT.TC..A-  122
19       99                                   ........A..-...AGCT....TC..A-  125
1        68                                   ..C........-C..A..AGCT.T...A-  94

Query_9  775   TTGTATGGGGCAGCAGAAGCCGGTTTGGACTATAATACAACTGACATGAGCCGTATTCGT  834
122      330   ............................................................  271
117      72    ........A..C.G.........ACGC............GTA..T........         20
17       723   C.......T..C.G.........ACGT..T..C.....CGTA..T.....T....AC...  782
29       722   C.......T..C.G.........ACGT..T..C.....CGTA..T.....T....AC...  781
121      1009  ..A.........T..........ACGC............GTG..T.....T.A.CAA...  950
137      337   C.......T..C.G.........ACGT..T..C.....CGTA..T.....T....AC...  278
131      730   C.......T..C.G.........ACGT..T..C.....CGTA..T.....T....AC...  671
126      1027  N......NT..C.G........NACGT..T..C.....CGTA..T.....T....C-...  969
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21       123   C.......T..C.G.........ACGT..T..C.....CGTA..T.....T....AC...  182
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1        95    ........A..C.G.........ACGC............GTA..T........C.AC..G  154
123      986                                                 ....T....AC...  973

Query_9  835   -ATGTTTAATGAATATATGTATCC-TTATCAGGC--GGCTGTGGATGCGGGTGCCGGCAG  890
122      270   -.......................-.........--........................  215
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29       782   -.....C..C.....C........-C..C..A..--T..C..A.....A....TA.....  837
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123      972   N.....NG.C.....C.N......-C..-..A..TN.C.N..A.....A....TA.....  915

Query_9  891   TGTCATGTCTTC-TTTCAACGAGGTCGATGGAATTCCTGCAACAG-CCAACAAATGG-TT  947
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123      914   C..A...NG.N--.....N-..AA.A..C..C..A..A..C..G.-.-..T......-N.  861

Query_9  948   GATAACTGATGTCCTGCGTAAACAG-TATGGA--TTCGGTGGTTTTGTCGTTACGGACTA  1004
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123      860   ...GN.C..C..AN....C..G..AA.GG..C--..G.AC..GC..N.G..G..A....T  803

Query_9  1005  TACCGGTATCATGGAAA-TGGTAAATCATGGTATTGGAGATATGCGAGA-A-GTCTCTGC  1061
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4        119   .................-...............................-.-........  175
17       955   ..........TCC....-.                                           972
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137      107   G.........TCC....-..A..GCG..C..C..C..T..CT...-...CT-..T..C..  51
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1        325   C..A..C..TTCA..G.-..A..G.G......G.C..C..CT...A.AC-C-...AG...  381
123      802   ..........TCN....A..A..GCG..C..C..C..T..CT...-...-CT..T..C..  745

Query_9  1062  CCGTGCTTTGAGTGCAGGAGTGGATATGGATATGGTGAGCGAAGGTTATCTTTCTACACT  1121
122      43    ...................................-N......                   2
4        176   ............................................................  235
121      722   ..TG...C...A......T..C....................T.C..T.ACAAGC.....  663
137      50    A.....AC.C.A......C.......                                    25
131      443   A.....AC.C.A......C...........C.....A..T.....C.TCACGGG....A.  384
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1        382   A.TC...C.T.A......G.....C...........A..T..G..C.TCG.CGG......  441
123      744   A.....AC.C.A......C...........C.....A..T.....C.TCACGGG....A.  685

Query_9  1122  TCAACAATCATTGAAGGAGGGTAAGATAACAGAGAAAGAGATAGATCAAGCTTGCCGTCG  1181
4        236   ............................................................  295
121      662   .A..A....TC..G.A..A..A..AG.TT...TA..G.CTG.T...GCT.....T..C..  603
131      383   CA.GA....CA.AG.C..A..C.....C.GTAT.G..ACCC.G..CA....C..T..C..  324
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21       470   CA.GA....CA.AG.C..A..C.....C.GTAT.G..ACCC.G..CA....C..T..C..  529
19       473   CA.GA....CA.AG.C..A..C.....C.GTAT.G..ACCC.G..CA....C..T..C..  532
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1        442   GATGA.....A.T..A..A..A..AG...G.AT.GGCAC.T.GA..AC...C.....C..  501
123      684   CA.GA....CA.AG.C..A..C.....C.GTAT.G..ACCC.G..CA....C..T..C..  625

Query_9  1182  TATTTTGGAGGCAAAATATAAGCTGGGATTATTTGATAATCCTTATAAGTATTGTGATAC  1241
4        296   ............................................................  355
121      602   ....C....A..T..G...........GC.T...........C.....A..........T  543
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19       533   C..CC.T..A..C.....C..A...........C..C..............C..C..-C.  591
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1        502   G..A.....A..G.....C.........C.G.....C...........A..C..C..-CG  560
123      624   C..CC.T..A..C.....C..A...........C..C..............C..C..C-.  566
55       575        ....A..C..G......T.A...N.G..CACA..............           530

Query_9  1242  TGAA-CGTGCCAAAACG-GATATCTACACTGATGAACATCGGAGTATTGCACGCCGGATC  1299
4        356   ....-............-..........................................  413
121      542   AACC-...C.T....AA-C.A....TT..AA.A.....C..CGC...A..C..TAA..CA  485
131      264   ....-ACGC..G..G..T..C....T...CA.G........                     225
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19       592   ....-ACGC..G..G..T..C....T...CA.G........CGACGC...T..TAA...T  650
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1        561   ....C...C.G..GCG.-.......T...AA.A..G.....TGACGCC..C...AA...T  619
123      565   ....-ACGC..G..G..T..C....T...CA.G........CGACGC...T..TAA...T  507

Query_9  1300  TCTGCTGAAAGCTTTGTTCTTTTAAAGAATGATAA-A-CAG-----------------AC  1340
4        414   ...................................-.-...-----------------..  454
121      484   G..T.G..............C..G........G..-T-AGT-----------------GT  444
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Query_9  1341  ACTGCCTATAAAGAAAAAAGGTAAGATTGCTGTAGTTGGGCCGTTGGCGAATACGAGTTC  1400
4        455   ............................................................  514
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123      447   ...T...T.G..A...G......C.G.G.....CA.C..C..AC....A.....CC.CAG  388

Query_9  1401  TAATATGCCCGGAACGTGGAGTGT---AGCGGTCAATATGGA---AGCTCCAGCTACGCT  1454
4        515   ........................---...............---...............  568
121      383   C........G..C...GCT.....GGCC..T..G.TG.ACA.---.TA...TT..TT.A.  327
33       67    C........G..C...GCT.....---G..C.CTGTG...A.CAA.TA...TT..TT.A.  123
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123      387   ...C.....G..T..C........---...C.-..CGCCTC.---.----.GA...TC..  339

Query_9  1455  TGTG-----GAGGGTTTGAAAGAAGTGGCAGGTGATA---AAGTTGAA-ATTGTGTATGC  1505
4        569   ....-----............................---........-...........  619
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Query_9  1506  TAAGGGTAGCCATCTGATGAGTGATGCGGCTTATGAGGAACGTGCAACACTCTTTGGACG  1565
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Query_9  1566  TACATTATACCGGGATAAGGAAAAACGTTCCGATATCCAGATGCTGAATGAAGCATTAAA  1625
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Query_9  1626  TGTTGCT-CATGGTGCCGATGTTGTT-GTT-GCGGCATTAGGTGAATCTTCTGAAATGAG  1682
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Query_9  1683  TGGTGAAT-CGAGT---AGTCGAACAGATTTGAATATTCCTGATGTTCAAAAAACATTAT  1738
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Query_9  1739  TGGAAGAATTAGTGAAAACAGGTAAACCTGTCGTTCTGGTATTATTCACTGGG-CGTCCG  1797
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Query_9  1798  TTGACCC-TGACATGGGAAGACAAAAATGTATC-TGCTATTCTGAA-TGTTTGGTTTGGA  1854
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Query_9  1855  GGTACCGAAGCCGCTTATGCTATAGGAGATGTCCTATTCGGAAATGTAAATCCTGGAGGT  1914
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Query_9  1915  AAGCTGCCTGTAACA-TTTCCTCAGAA-TGTAGGGCAGATTCC--TTT--ATTCT-ATAA  1967
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Query_9  1968  CCATAAAAATACTGGACGT-CCGC-TGGCT-G-A-GGGCGGTTGGTTT-GAGAA-G-TTC  2019
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Query_9  2020  CGGGCA--AATTATCT-GGATGTAACGAATGAAC---CTCTTTATCCA--TTTGGCT--A  2069
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Query_9  2070  TGGACTAAGTTATGCACAATTTG-A-TTATAGCGATGTGAGATTAAGTACGGATCAA-AT  2126
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Query_9  2127  A---GACC-------GGAATGGCATGTTA----ACCGCAAGTGTGACTGTAA-CCAATAA  2171
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Query_9  2172  CAGTGAGTGTGATGGAGATGAAATTGTTCAGTTGTATATTCGCGA-TTTGGTCGGTAGTG  2230
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Query_9  2231  TTA-CTCGTCCGGTGAAAGAATTGAAAGGATTTGAAAAAGTAACAATTAGAGCAGGGGAG  2289
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Query_9  2290  T-CAA--AA-GA-TATTTCTTTTAAGATCACTCCGGAAATGCTT--AAGTTCTACAATTC  2342
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Query_9  2343  GGATATCCAGTTTGTGAATGAAGTTGGTGAATTCGAAGTAATGATCGGAACGAACAGCAG  2402
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Query_9  2403  GGATGTGAAAAAAGCAACGTTT-A--GCTTG-TAACATTGGAAGTGGATAACGGATCCGA  2458
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Query_9  2459  ATTCGAGCTCCGTCGA-CAAGCTT-GCGGCCG-CACT-CGAGcaccaccaccaccacca-  2513
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Query_9  2514  cT-G-AGA-T-CCGGCTGCTAACAAAG-CCC--G--AAAGGAAGC-TGAGTTGGC-TG-C  2561
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Query= APC115044.154

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Query_10  201   CGTAGAATCTCTCCTGTCTAAGATGACCCTTGAGGAGAAAATCGGT-CAG-ATGAACCAG  258
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Query_10  547   TTTGCGCC-AATGATTGATATTGCCCGCGATCCTCGCTGGGGACGTATTGCCGAA-GGGT  604
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19        129                ..T.....C.GA....CC...........C...A..             164

Query_10  768   CGAACGTCGTCTGCGCAATG-TTTATTTGCCACC---TTTTGAAGCT-GCCAC-CAAAG-  820
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130       678   ....................-.............---..........-.....-.....-  626
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16        146   ....................-.............---..........-.....-.....-  198
136       711   ....................-.............---..........-N....-.....-  659

Query_10  821   CGGG-TGCAGCCACG-TTTATG-ACTTCATTTAATG-ATAATG--ATGGAAT-CCC-TTC  872
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133       1128  ..A.-N.....AT..N......G......N..T...G....A.--.......-...C...  1073
125       1131  ....GN..GAN....-N..NG.-CT.....NNNN-.-......GA.......A...-G..  1077
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121       889                      ...-G.......C....-.AGTG.--....TG.-A..-GG.  855

Query_10  873   TA-CCGGGAA-T-GCTTTTATTTTGA-A-GAATGTA-CT-CCGTGACGAG-TGGGGA---  921
9         828   ..-.......-.-.............-.-.......-..-..........-......---  876
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Query_10  922   -TTCG-A-TGGTTTTGTTGTGACGGACT-GGGCTTCTG-CCAGCGAAA-TGATAAGCC--  973
9         877   -....-.-....................-.........-.........-.........--  928
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121       805   -..T.-.-...G..C.............-ATA.CGG.A-T..CT....-...CCGAT.--  754

Query_10  974   ATGGTTTTGCCGCCGGTTC--AAAAGAAGTGGCAATG-AAATCTGTGAATGCAGGAG-TA  1029
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41        217   ..............                                                230

Query_10  1030  GATATGGAAATGG-TGAGTTACA-CTTTTGTGAAGGAA-CTGCCGGAA-TTAGTGAAAGA  1085
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136       449   N..N........N-.........-..............-.NN.....N-...........  394
121       700   ........T....-....                                            684

Query_10  1086  GGGAAAGGTGAAGGAAAGCACTATCGATGAGGCTGTTCGTAATATTTTGCGTATAAAGTA  1145
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125       847   ...............................................-............  789
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136       393   ...............T.....NNN....................................  334

Query_10  1146  TCGTTTAGGATTGTTTGATACACCTTATGTAGATGAACAACAAACATCTGTCATGTATG-  1204
9         1098  .........GA..........................AC.NC.............NN..C  1157
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133       789   ...................N.C.....................................-  731
125       788   ...........................................................-  730
16        524   ...........................................................-  582
136       333   .........N...........................................N.....-  275

Query_10  1205  CTCCTTCTCATTTGGAAGCAGCTAAGCAAGCCGCTG-TTGAATCGGCTATTCTGTTGAAG  1263
9         1158  ....N..N.....NN....-NN.T...T........T.........N.......N...    1214
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6         14                                                ...NN.......TG..  29
11        8                                                 ....-.........G-  21
7         9                                                      .........G-  18
133       730   ....................................-.......................  672
125       729   ....................................-.......................  671
13        5                                                 ...CN.........G-  19
16        583   ....................................-.......................  641
136       274   ....................................-N................N.....  216
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4         430                                                    ....T..A...  440

Query_10  1264  AATGATAAGGAAGTGTTGCCGTTACAGCCATCTGTGAAAA-CTGTTGCAGTGGTAGGA-C  1321
118       186   ........................................-.................-.  129
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6         30    .-......................................-.................-.  86
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4         441   ........                                                      448

Query_10  1322  CTATGGCTAATGCACCTTATGAACAGTTAGGTACTTGGATATTTGATGGTGAGAAAGCTC  1381
118       128   ............................................................  69
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136       155   ..........N..G...N....N..                                     131

Query_10  1382  GTACTCAGACTCCGTTGAACGCTATTAAAGAAATGGTTGGCGATAAAGTACAGGTGATTT  1441
118       68    ...........................................................   10
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16        760   .......                                                       766
73        427                                            ..............       440
68        426                                            ..............       439
71        424                                            ..............       437
69        425                                            ..............       438

Query_10  1442  ATGAACCGGGACTAGCATATAGTCGTGAGAAAAATCCGGCAAGTGTGGCTAAAGCAGCTG  1501
128       13    .NA....C.....                                                 1
6         207   ............................................................  266
11        199   ............................................................  258
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125       492   ............................................................  433
13        197   ............................................................  256

Query_10  1502  CCGCCGCTGCACGTGCAGATGTCATTCTTGCTTTTGTGGGTGAAGAATCTATTCTTTCGG  1561
6         267   ............................................................  326
11        259   ............................................................  318
7         256   ............................................................  315
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125       432   ............................................................  373
13        257   ............................................................  316

Query_10  1562  GTGCTGCTCACTGTTTGGCTGATCTGGATTTGCAGGGTGATCAGGGAGCTTTGATTACAG  1621
6         327   ............................................................  386
11        319   ...AA.......................................................  378
7         316   ...AA.......................................................  375
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13        317   ...AA.......................................................  376

Query_10  1622  CTTTGGCTAAGACGGGTAAACCTGTAGTGACTATTGTGATGGCGGGTCGTCCGTTGACTA  1681
6         387   ............................................................  446
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7         376   ............................................................  435
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115       814           ..A...........C.....-....                             791
2         453           ..A...........C.....-....                             476

Query_10  1682  TCGGTAAAGAAGTCGAAGAGTCGACTGCTGTTCTCTATTCATTCCATCCGGGCACAATGG  1741
6         447   ............................................................  506
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7         436   ............................................................  495
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125       252   ............................................................  193
13        437   ............................................................  496

Query_10  1742  GCGGTCCTGCATTGGCTGATTTGCTTTGGGGGAAGGCTGTGCCGAGTGGAAAGGCGCCGG  1801
6         507   ............................................................  566
11        499   ............................................................  558
7         496   ............................................................  555
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2         606                                            ...........ACTAA.CA  624

Query_10  1802  TCACTTTCCCGAGGATGGTGGGACAAATTCCTGTGTACTACGCTCATAATAATACCGGAC  1861
6         567   ............................................................  626
11        559   ...........................................................G  618
7         556   ............................................................  615
133       133   ...........................................................G  74
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13        557   ............................................................  616
115       641   .G..........A..AT..A..C..G..A...T...T....AA......G........T.  582
2         625   .G..........A..AT..A..C..G..A...T...T....AA......G........T.  684

Query_10  1862  GTCCGGCTACACGGAATGAAGTGTTGCTGAATGATATTGCTGTTGAGGCAGG-ACAGACT  1920
6         627   ....................................................-.......  685
11        619   C...................................................-.......  677
7         616   ....................................................-.......  674
133       73    C...................................................-.......  15
125       72    ....................................................A.......  13
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Query_10  1921  TCA-CTGGGCTGTACTTCCTTCTATATGGATGCGGGTTTTGATCCC-TTGTTTCCGTTTG  1978
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Query_10  2035  GTACTGAAAAAAGATGATGTGCTGACAGTGACATTCGATCTGGAA--AATACCGGGAAAT  2092
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Query_10  2093  ATGAAGGAACGGAAGTAGCTCAATTGTATATACAAGA-TAAGATTGGTTCCGT-GAC-TC  2149
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Query_10  2150  GTCCGGTGAAAGAA-CTGAAACGCTTCACTCGTGTGACATTGAAGCCGGG-TGAGaaaaa  2207
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Query_10  2208  aaGCGTTTCGTTTGAACT-CCCTGTTAGTGAACTTGCATTTTGGAACATAGATATGGCTA  2266
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Query_10  2267  AAGTTGTGG-AA--CCCGGAGACTTTGGGCTTTGGG-TGGCAACGGAT-AG-TCAGTCCG  2320
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Query_10  2321  GAG-AAGAAGTTTT--C-TTCTAACATT-GGAAGTGGATAACGGATCCGAATTCGAGCTC  2375
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Query_10  2376  CGTCGA-CAAGCTT-GCGGCCG-CACT-CGAGcaccaccaccaccacca-cT-G-AGA-T  2427
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Query_10  2428  -CCGGCTGCTAACAAAG-CCC--G--AAAGGAAGC-TGAGTTGGC-TG-CTGCCACCGCT  2478
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Query_10  2479  GAGCAATAAC-TAG-CA-TAAC-C-CCTT-GGGGCCTCTAAACGGGTCTT--GAGG-GG-  2528
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Query_10  2529  -TTTTTTGCTGAAA  2541
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111       1037  T...........    1048


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Gapped
Lambda      K        H
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Effective search space used: 386054383


Query= APC115044.155

Length=2541
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Query_11  1     TCTCG-ATCCCGCGAAATTAATAC-GACTC-ACTATAGGGG--AATT-GTGAG-CGGA-T  52
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Query_11  53    AAC-AA-TT-CCCC--T-C-TAGAAA-TAA-TTTT-GTTTAAC--TTTAAGAA-GGA-GA  98
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Query_11  99    TATAC-ATATG--CACCAT-CATCATCAT-CATTCTT-CT-GG-TGTAGAT-CTGTGGTC  149
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Query_11  150   TCAT-CC--G-CAGTTCG-AAAAGGGTA-CCGAGAA-CCTGTACTT-CCAAT-CCAATGC  200
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Query_11  201   CGTAGAATCTCTCCTGTCTAAGATGACCCTTGAGGAGAAAATCGGT-CAG-ATGAACCAG  258
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Query_11  259   ATTTCCTCTTACGGTAATATCGAGGATATGAGTGCTTTGATTAAGAAA-GGTGAAATCGG  317
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Query_11  373   ATGGAAGAATCCCGTTTGGGTATTCCTTTATTGATAGCGCGTG-ATGTCATTCACGGG-T  430
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Query_11  431   TTAAAACAATTTTCCCTATTCCCTTGGGACAAG-CGGCTTCGTTCAATCC-GCAGG-TAG  487
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29        426      ....C..............A..A..                                  450
122       626   A.G....TG.............T.....TATG.-.T..CA.A.GGG..AT-.A...C..T  569
137       633      ....C..............A..A..                                  609

Query_11  488   CGAAAGACGGTGCACGGA-TAGCAGCTATTGAAGCTTCGTCTGTAGGTATCCGGTGGACT  546
9         442   ..................-.........................................  500
128       971   ........N.N.......A.........................................  912
118       962   N.................-.........................................  904
130       957   ........C.........-.....N...................................  899
122       568   A.-..C.ATC...T..T.-....G..G..A.....CAGTG.C.AT..C...T.C.....A  511

Query_11  547   TTTGCGCC-AATGATTGATATTGCCCGCGATCCTCGCTGGGGACGTATTGCCGAA-GGGT  604
9         501   .....A..-..............................................-....  558
128       911   .....A..C..............................................A....  852
118       903   .....A..-..............................................-....  846
130       898   .....A..-................-.............................-....  842
136       894                                                           ....  891
17        563                           ...T.....G...........                 583
29        562                           ...T.....G...........                 582
122       510   ...AGT..-G...G.......CAG...T.....A..T.........G.AT.....-..TA  453
137       497                           ...T.....G...........                 477
131       908        ...-G...G.A..C..CAG...T.....G...........                 870

Query_11  605   GTGGTGAAGATAC-GTACCTT-ACTT--CCGTAATGGG-AGCAG-CTAT-GGTA-GAAGG  656
9         559   .............-.......-....--..........-.....-....-....-.....  610
128       851   .............-.......-....--..........-.....-....-....-.....  800
118       845   .............-.......-....--..........-.....-....-....-.....  794
130       841   .............-.......-....--..........-.....-....-....-.....  790
16        11                                     ...N.-.....-....-....-.....  33
136       890   ....GA.......C..T....TN...TC..........G...NNA....N....A.....  831
122       452   .C..A......                                                   442

Query_11  657   TTTT-CAGGGA-GATT-CGC-TGAA-TAGTCCTAC-TTCAATTGCAGCTTGCCCTAAA-C  709
9         611   ....-......-....-...-....-.........-......................-.  663
128       799   ....-......-....-...-....A.........-......................-.  746
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130       789   ....-......-....-...-....-.........-......................-.  737
16        34    ....-.N....-....-...G....-N........-......................-.  87
136       830   ....T......A....T...-....A.........C......N...............N.  772

Query_11  710   ATTTT-GTAGG-TTACGGTGCAGCCGAAGGAGGACGTGATTATAATTCCACGTTCATTCC  767
9         664   .....-.....-................................................  721
128       745   .....-.....-................................................  688
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136       771   .....T.....G....N...........................................  712
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29        725                ..T.....C.GA....CC...........C...A..             760
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21        126                ..T.....C.GA....CC...........C...A..             161
19        129                ..T.....C.GA....CC...........C...A..             164

Query_11  768   CGAACGTCGTCTGCGCAATG-TTTATTTGCCACC---TTTTGAAGCT-GCCAC-CAAAG-  820
9         722   ....................T.............---..........-.....-.....-  775
128       687   ....................-.............---..........-.....-.....-  635
118       682   ....................-.............---..........-.....-.....-  630
130       678   ....................-.............---..........-.....-.....-  626
133       1165                         ......T....CTA...G.....NN...N.A.....N  1129
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16        146   ....................-.............---..........-.....-.....-  198
136       711   ....................-.............---..........-N....-.....-  659

Query_11  821   CGGG-TGCAGCCACG-TTTATG-ACTTCATTTAATG-ATAATG--ATGGAAT-CCC-TTC  872
9         776   ....-..........-......-.............-......--.......-...-...  827
128       634   ....-..........-......-.............-......--.......-...-...  583
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130       625   ....-..........-......-.............-......--.......-...-...  574
133       1128  ..A.-N.....AT..N......G......N..T...G....A.--.......-...C...  1073
125       1131  ....GN..GAN....-N..NG.-CT.....NNNN-.-......GA.......A...-G..  1077
16        199   ....-..........-......-.............-......--.......-...-...  250
136       658   ...N-..........-......-.............-......--.......-...-...  607
121       889                      ...-G.......C....-.AGTG.--....TG.-A..-GG.  855

Query_11  873   TA-CCGGGAA-T-GCTTTTATTTTGA-A-GAATGTA-CT-CCGTGACGAG-TGGGGA---  921
9         828   ..-.......-.-.............-.-.......-..-..........-......---  876
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130       573   ..-.......-.-.............-.-.......-..-..........-......---  525
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125       1076  .NN.......A.-.N..NN.G....GG.-.G.....-..A........-.-A..N..GGN  1022
16        251   ..-.......-.-.............-.-.......-..-..........-......---  299
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121       854   ..-....A..-.-AAG.GGC.GA...-C-CG.....-..-T...A.GC..-...AAT---  806

Query_11  922   -TTCG-A-TGGTTTTGTTGTGACGGACT-GGGCTTCTG-CCAGCGAAA-TGATAAGCC--  973
9         877   -....-.-....................-.........-.........-.........--  928
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121       805   -..T.-.-...G..C.............-ATA.CGG.A-T..CT....-...CCGAT.--  754

Query_11  974   ATGGTTTTGCCGCCGGTTC--AAAAGAAGTGGCAATG-AAATCTGTGAATGCAGGAG-TA  1029
9         929   ...................---...............--..................-..  982
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133       964   ..........N....-...--...GA...........N...................-..  909
125       962   .NN...NN......A.A..CA................-...............N...G..  904
16        352   ...................--................-...................-..  407
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121       753   .....A.---G.GT.A.A.--.C..AC...T...GCC-CTGG..C..........T.-.C  701
138       185   ..............                                                172
135       189   ..............                                                176
132       185   ..............                                                172
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41        217   ..............                                                230

Query_11  1030  GATATGGAAATGG-TGAGTTACA-CTTTTGTGAAGGAA-CTGCCGGAA-TTAGTGAAAGA  1085
9         983   .............-.........-..............C.........-...........  1039
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118       420   .............-.........-..............-.........-...........  365
130       416   .............-.........-..............-.........-...........  361
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16        408   .............-.........-..............-.........-...........  463
136       449   N..N........N-.........-..............-.NN.....N-...........  394
121       700   ........T....-....                                            684

Query_11  1086  GGGAAAGGTGAAGGAAAGCACTATCGATGAGGCTGTTCGTAATATTTTGCGTATAAAGTA  1145
9         1040  -.......................................-.N.................  1097
128       369   ............................................................  310
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125       847   ...............................................-............  789
16        464   ............................................................  523
136       393   ...............T.....NNN....................................  334

Query_11  1146  TCGTTTAGGATTGTTTGATACACCTTATGTAGATGAACAACAAACATCTGTCATGTATG-  1204
9         1098  .........GA..........................AC.NC.............NN..C  1157
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118       304   ...........................................................-  246
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125       788   ...........................................................-  730
16        524   ...........................................................-  582
136       333   .........N...........................................N.....-  275

Query_11  1205  CTCCTTCTCATTTGGAAGCAGCTAAGCAAGCCGCTG-TTGAATCGGCTATTCTGTTGAAG  1263
9         1158  ....N..N.....NN....-NN.T...T........T.........N.......N...    1214
128       250   ....................................-.......................  192
118       245   ....................................-.......................  187
130       241   ....................................-.......................  183
7         9                                                      .........G-  18
6         14                                                ...NN.......TG..  29
11        8                                                 ....-.........G-  21
133       730   ....................................-.......................  672
13        5                                                 ...CN.........G-  19
125       729   ....................................-.......................  671
16        583   ....................................-.......................  641
136       274   ....................................-N................N.....  216
121       468                                                    ....C......  458
4         430                                                    ....T..A...  440

Query_11  1264  AATGATAAGGAAGTGTTGCCGTTACAGCCATCTGTGAAAA-CTGTTGCAGTGGTAGGA-C  1321
128       191   ........................................-.................-.  134
118       186   ........................................-.................-.  129
130       182   ........................................-.................-.  125
7         19    -.......................................-...........N.....-.  75
6         30    .-......................................-.................-.  86
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121       457   .....G..                                                      450
4         441   ........                                                      448

Query_11  1322  CTATGGCTAATGCACCTTATGAACAGTTAGGTACTGCTATATTTGATGGTGAGAAAGCTC  1381
128       133   ............................................................  74
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Query_11  1382  GTACTCAGACTCCGTTGAACGCTATTAAAGAAATGGTTGGCGATAAAGTACAGGTGATTT  1441
128       73    ............................................................  14
118       68    ...........................................................   10
130       64    ......................................................-....   7
7         136   ............................................................  195
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16        760   .......                                                       766
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68        426                                            ..............       439
71        424                                            ..............       437
69        425                                            ..............       438

Query_11  1442  ATGAACCGGGACTAGCATATAGTCGTGAGAAAAATCCGGCAAGTGTGGCTAAAGCAGCTG  1501
128       13    .NA....C.....                                                 1
7         196   ............................................................  255
6         207   ............................................................  266
11        199   ............................................................  258
133       493   ............................................................  434
13        197   ............................................................  256
125       492   ............................................................  433

Query_11  1502  CCGCCGCTGCACGTGCAGATGTCATTCTTGCTTTTGTGGGTGAAGAATCTATTCTTTCGG  1561
7         256   ............................................................  315
6         267   ............................................................  326
11        259   ............................................................  318
133       433   ............................................................  374
13        257   ............................................................  316
125       432   ............................................................  373

Query_11  1562  GTGAAGCTCACTGTTTGGCTGATCTGGATTTGCAGGGTGATCAGGGAGCTTTGATTACAG  1621
7         316   ............................................................  375
6         327   ...CT.......................................................  386
11        319   ............................................................  378
133       373   ............................................................  314
13        317   ............................................................  376
125       372   ...CT.......................................................  313

Query_11  1622  CTTTGGCTAAGACGGGTAAACCTGTAGTGACTATTGTGATGGCGGGTCGTCCGTTGACTA  1681
7         376   ............................................................  435
6         387   ............................................................  446
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133       313   ............................................................  254
13        377   ............................................................  436
125       312   ............................................................  253
115       814           ..A...........C.....-....                             791
2         453           ..A...........C.....-....                             476

Query_11  1682  TCGGTAAAGAAGTCGAAGAGTCGACTGCTGTTCTCTATTCATTCCATCCGGGCACAATGG  1741
7         436   ............................................................  495
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11        439   ............................................................  498
133       253   ............................................................  194
13        437   ............................................................  496
125       252   ............................................................  193

Query_11  1742  GCGGTCCTGCATTGGCTGATTTGCTTTGGGGGAAGGCTGTGCCGAGTGGAAAGGCGCCGG  1801
7         496   ............................................................  555
6         507   ............................................................  566
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125       192   ............................................................  133
115       660                                            ...........ACTAA.CA  642
2         606                                            ...........ACTAA.CA  624

Query_11  1802  TCACTTTCCCGAGGATGGTGGGACAAATTCCTGTGTACTACGCTCATAATAATACCGGAC  1861
7         556   ............................................................  615
6         567   ............................................................  626
11        559   ...........................................................G  618
133       133   ...........................................................G  74
13        557   ............................................................  616
125       132   ............................................................  73
115       641   .G..........A..AT..A..C..G..A...T...T....AA......G........T.  582
2         625   .G..........A..AT..A..C..G..A...T...T....AA......G........T.  684

Query_11  1862  GTCCGGCTACACGGAATGAAGTGTTGCTGAATGATATTGCTGTTGAGGCAGG-ACAGACT  1920
7         616   ....................................................-.......  674
6         627   ....................................................-.......  685
11        619   C...................................................-.......  677
133       73    C...................................................-.......  15
13        617   ....................................................-.......  675
125       72    ....................................................A.......  13
115       581   .G..                                                          578
2         685   .G..                                                          688

Query_11  1921  TCA-CTGGGCTGTACTTCCTTCTATATGGATGCGGGTTTTGATCCC-TTGTTTCCGTTTG  1978
7         675   ...-..........................................-.............  732
6         686   ...-..........................................-.............  743
11        678   ...-..........................................-.............  735
133       14    ...N..N...                                                    5
13        676   ...-..........................................T.............  734
125       12    ..                                                            11
27        458                                           .....A-....A...A..C.  476
23        460                                           .....A-....A...A..C.  478
116       512                                           .....A-....A...A..C.  494

Query_11  1979  GTT-ATGGCTTG-TCGTACACCACA-TTTAAGTATAGCAACATCAAACTG-GCGTCTGAT  2034
7         733   ...-........-............-........................-.........  788
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116       493   .C.-....T...-.....T....AC-...C.A..C...G....                   454

Query_11  2035  GTACTGAAAAAAGATGATGTGCTGACAGTGACATTCGATCTGGAA--AATACCGGGAAAT  2092
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27        534   C..-..GG.C.G....--..T...TT.C..CT..GGTCA.G.T..CC........T..G.  590
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Query_11  2093  ATGAAGGAACGGAAGTAGCTCAATTGTATATACAAGA-TAAGATTGGTTCCGT-GAC-TC  2149
7         847   ......................T..............-.........N.....-...-..  903
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27        591   .C..T..TG.A.......TG...C.T.....C.GT..-CCTTG.A..AAG.A.-C..-C.  647
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66        155      ...............                                            141
33        841   ....C..TT.........TG..GC.A.....C.GC..C.CTT..A..CAGT..-A..-A.  898

Query_11  2150  GTCCGGTGAAAGAA-CTGAAACGCTTCACTCGTGTGACATTGAAGCCGGG-TGAGaaaaa  2207
7         904   ........-.....-................N.............N.C..-.........  960
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33        899   ..............N.....                                          918

Query_11  2208  aaGCGTTTCGTTTGAACT-CCCTGTTAGTGAACTTGCATTTTGGAACATAGATATGGCTA  2266
7         961   ..............-...-...................-................-...-  1015
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13        959   .....-...T..G..N..-.....N........-...N...--.G.NN..N..N..C...  1013

Query_11  2267  AAGTTGTGG-AA--CCCGGAGACTTTGGGCTTTGGG-TGGCAACGGAT-AG-TCAGTCCG  2320
7         1016  .......-.-..--............-..N......-N.--CN.C...-..-......T.  1065
6         1031  .........A..--.T.........C..........T...........N..-..--NT.N  1085
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Query_11  2321  GAG-AAGAAGTTTT--C-TTCTAACATT-GGAAGTGGATAACGGATCCGAATTCGAGCTC  2375
7         1066  -----...GAG...--.-....-....---.GN......-.......--G....N.....  1110
6         1086  N.A-...-......--.T..........G.........N.NG.AT.....            1131
11        1083  ..NT....T.....TCT-.....NNT..-....NN.......                    1122
13        1067  A.A-N..-......--.-.......N..-..C..                            1094
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23        839                     ..G.......-...................N.....C.....  879
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20        65                         .......-.............--.....             41
18        65                         .......-.............--.....             41

Query_11  2376  CGTCGA-CAAGCTT-GCGGCCG-CACT-CGAGcaccaccaccaccacca-cT-G-AGA-T  2427
7         1111  GT....-.-.....-..-....-...                                    1131
83        89    ......-.......-.......-....-....---..............-..-.-...-.  41
85        92    ......-.......-.......-....-.....................-..-.-...-.  41
110       878   ......A.......-.......-....-...............--....-..T.-...-.  929
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111       879   ......-.N.....-.......C..N.-..................N..-..-.A...-.  932
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116       90    ......-.......-.......-....-.....................-..-.-...-.  39
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Query= APC115044.156

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Query_12  1     TCTCG-ATCCCGCGAAATTAATAC-GACTC-ACTATAGGGG--AATT-GTGAG-CGGA-T  52
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Query_12  150   TCAT-CC--G-CAGTTCG-AAAAGGGTA-CCGAGAA-CCTGTACTT-CCAAT-CCAATGC  200
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Query_12  201   CGTAGAATCTCTCCTGTCTAAGATGACCCTTGAGGAGAAAATCGGT-CAG-ATGAACCAG  258
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61        138   .                                                             138
78        148   .                                                             148
99        144   .CA..T....                                                    153
91        145   .                                                             145
114       168   .                                                             168
87        799   .                                                             799
122       905   .                                                             905
101       157   .                                                             157
137       915   .                                                             915

Query_12  259   ATTTCCTCTTACGGTAATATCGAGGATATGAGTGCTTTGATTAAGAAA-GGTGAAATCGG  317
9         213   ................................................-...........  271
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128       1201  N.N..-...AC....N.N........NNNNG.....GA-......G..CN.N...T...A  1144
130       1154                                 ......-..C......G-..N-..N....  1129

Query_12  318   TTCCA-T-CTTGAATGAGGTGGATCCGGTGCGTATTAAT-GCG-CTACAGCG-CGTGGCA  372
9         272   .....-.-...............................-...-........-.......  326
118       1125  -....-.-..-................NN-.......-.-..N-N.......-.......  1075
128       1143  .....-.N.....-...A....N..........NA....-...G........-N......  1088
130       1128  .....A.-..G..N.NG.......T..NNN-........N...-.......NN....C..  1072

Query_12  373   ATGGAAGAATCCCGTTTGGGTATTCCTTTATTGATAGCGCGTGCTGTCATTCACGGG-TT  431
9         327   .........................................................-..  385
118       1074  ...A......T..NG........N.-.................A........N....-..  1017
128       1087  N......G......ANG.............A............NN-.......AC..-G.  1030
130       1071  ..........N...G......NN........G........N........N....N..A..  1012
122       640                                               ...T.....T...-.A  626

Query_12  432   TAAAACAATTTTCCCTATTCCCTTGGGACAAG-CGGCTTCGTTCAATCC-GCAGG-TAGC  488
9         386   ................................-................-.....-....  442
118       1016  .................NNN.T.--.......-................-N....-...N  962
128       1029  .G...........N.........G..A.....G................N.....-..N.  971
130       1011  ..............NN.......-........-.......N.N-...T.-.....-....  957
17        427     ....C..............A..A..                                   451
29        426     ....C..............A..A..                                   450
122       625   .G....TG.............T.....TATG.-.T..CA.A.GGG..AT-.A...C..TA  568
137       633     ....C..............A..A..                                   609

Query_12  489   GAAAGACGGTGCACGGA-TAGCAGCTATTGAAGCTTCGTCTGTAGGTATCCGGTGGACTT  547
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128       970   .......N.N.......A..........................................  911
130       956   .......C.........-.....N....................................  898
122       567   .-..C.ATC...T..T.-....G..G..A.....CAGTG.C.AT..C...T.C.....A.  510

Query_12  548   TTGCGCC-AATGATTGATATTGCCCGCGATCCTCGCTGGGGACGTATTGCCGAA-GGGTG  605
9         502   ....A..-..............................................-.....  559
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130       897   ....A..-................-.............................-.....  841
136       894                                                          .....  890
17        563                          ...T.....G...........                  583
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122       509   ..AGT..-G...G.......CAG...T.....A..T.........G.AT.....-..TA.  452
137       497                          ...T.....G...........                  477
131       908       ...-G...G.A..C..CAG...T.....G...........                  870

Query_12  606   TGGTGAAGATAC-GTACCTT-ACTT--CCGTAATGGG-AGCAG-CTAT-GGTA-GAAGGT  657
9         560   ............-.......-....--..........-.....-....-....-......  611
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136       889   ...GA.......C..T....TN...TC..........G...NNA....N....A......  830
122       451   C..A......                                                    442

Query_12  658   TTT-CAGGGA-GATT-CGC-TGAA-TAGTCCTAC-TTCAATTGCAGCTTGCCCTAAA-CA  710
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136       829   ...T......A....T...-....A.........C......N...............N..  771

Query_12  711   TTTT-GTAGG-TTACGGTGCAGCCGAAGGAGGACGTGATTATAATTCCACGTTCATTCCC  768
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136       770   ....T.....G....N............................................  711
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19        129               ..T.....C.GA....CC...........C...A..              164

Query_12  769   GAACGTCGTCTGCGCAATG-TTTATTTGCCACC---TTTTGAAGCT-GCCAC-CAAAG-C  821
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133       1165                        ......T....CTA...G.....NN...N.A.....N.  1128
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16        147   ...................-.............---..........-.....-.....-.  199
136       710   ...................-.............---..........-N....-.....-.  658

Query_12  822   GGG-TGCAGCCACG-TTTATG-ACTTCATTTAATG-ATAATG--ATGGAAT-CCC-TTCT  873
9         777   ...-..........-......-.............-......--.......-...-....  828
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133       1127  .A.-N.....AT..N......G......N..T...G....A.--.......-...C....  1072
125       1130  ...GN..GAN....-N..NG.-CT.....NNNN-.-......GA.......A...-G...  1076
16        200   ...-..........-......-.............-......--.......-...-....  251
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121       889                     ...-G.......C....-.AGTG.--....TG.-A..-GG..  854

Query_12  874   A-CCGGGAA-T-GCTTTTATTTTGA-A-GAATGTA-CT-CCGTGACGAG-TGGGGA----  921
9         829   .-.......-.-.............-.-.......-..-..........-......----  876
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16        252   .-.......-.-.............-.-.......-..-..........-......----  299
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121       853   .-....A..-.-AAG.GGC.GA...-C-CG.....-..-T...A.GC..-...AAT----  806

Query_12  922   TTCG-A-TGGTTTTGTTGTGACGGACT-GGGCTTCTG-CCAGCGAAA-TGATAAGCC--A  974
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135       189                                                              .  189
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Query_12  975   TGGTTTTGCCGCCGGTTC--AAAAGAAGTGGCAATG-AAATCTGTGAATGCAGGAG-TAG  1030
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132       184   .............                                                 172
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41        218   .............                                                 230

Query_12  1031  ATATGGAAATGG-TGAGTTACA-CTTTTGTGAAGGAA-CTGCCGGAA-TTAGTGAAAGAG  1086
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Query_12  1087  GGAAAGGTGAAGGAAAGCACTATCGATGAGGCTGTTCGTAATATTTTGCGTATAAAGTAT  1146
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136       392   ..............T.....NNN.....................................  333

Query_12  1147  CGTTTAGGATTGTTTGATACACCTTATGTAGATGAACAACAAACATCTGTCATGTATG-C  1205
9         1099  ........GA..........................AC.NC.............NN..C.  1158
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136       332   ........N...........................................N.....-.  274

Query_12  1206  TCCTTCTCATTTGGAAGCAGCTAAGCAAGCCGCTG-TTGAATCGGCTATTCTGTTGAAGA  1264
9         1159  ...N..N.....NN....-NN.T...T........T.........N.......N...     1214
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128       249   ...................................-........................  191
130       240   ...................................-........................  182
6         14                                               ...NN.......TG...  30
11        8                                                ....-.........G--  21
7         9                                                     .........G--  18
133       729   ...................................-........................  671
125       728   ...................................-........................  670
13        5                                                ...CN.........G--  19
16        584   ...................................-........................  642
136       273   ...................................-N................N......  215
121       468                                                   ....C.......  457
4         430                                                   ....T..A....  441

Query_12  1265  ATGATAAGGAAGTGTTGCCGTTACAGCCATCTGTGAAAA-CTGTTGCAGTGGTAGGA-CC  1322
118       185   .......................................-.................-..  128
128       190   .......................................-.................-..  133
130       181   .......................................-.................-..  124
6         31    -......................................-.................-..  87
11        22    .......................................-.................-..  79
7         19    .......................................-...........N.....-..  76
133       670   .......................................-.................-..  613
125       669   .......................................-.................-..  612
13        20    .......................................-............A....-..  77
16        643   ............................N..........-...........T..N..-..  700
136       214   NN.....N.......................N.......G...........A.....G..  155
121       456   ....G..                                                       450
4         442   .......                                                       448

Query_12  1323  TATGGCTAATGCACCTTATGAACAGTTAGGTACTTGGATATTTGATGGTGAGAAAGCTCG  1382
118       127   ............................................................  68
128       132   ..................................GCT.......................  73
130       123   ............................................................  64
6         88    ............................................................  147
11        80    ............................................................  139
7         77    ..................................GCT.......................  136
133       612   ............................................................  553
125       611   ............................................................  552
13        78    ...................................TT.......................  137
16        701   ...........................N................................  760
136       154   .........N..G...N....N..                                      131

Query_12  1383  TACTCAGACTCCGTTGAACGCTATTAAAGAAATGGTTGGCGATAAAGTACAGGTGATTTA  1442
118       67    ..........................................................    10
128       72    ............................................................  13
130       63    .....................................................-....    7
6         148   ............................................................  207
11        140   ............................................................  199
7         137   ............................................................  196
133       552   ............................................................  493
125       551   ............................................................  492
13        138   ............................................................  197
16        761   ......                                                        766
73        427                                           ..............        440
68        426                                           ..............        439
71        424                                           ..............        437
69        425                                           ..............        438

Query_12  1443  TGAACCGGGACTAGCATATAGTCGTGAGAAAAATCCGGCAAGTGTGGCTAAAGCAGCTGC  1502
128       12    NA....C.....                                                  1
6         208   ............................................................  267
11        200   ............................................................  259
7         197   ............................................................  256
133       492   ............................................................  433
125       491   ............................................................  432
13        198   ............................................................  257

Query_12  1503  CGCCGCTGCACGTGCAGATGTCATTCTTGCTTTTGTGGGTGAAGAATCTATTCTTTCGGG  1562
6         268   ............................................................  327
11        260   ............................................................  319
7         257   ............................................................  316
133       432   ............................................................  373
125       431   ............................................................  372
13        258   ............................................................  317

Query_12  1563  TGAAGCTCACTGTTTGGCTGATCTGGATTTGCAGGGTGATCAGGGAGCTTTGATTACAGC  1622
6         328   ..CT........................................................  387
11        320   ............................................................  379
7         317   ............................................................  376
133       372   ............................................................  313
125       371   ..CT........................................................  312
13        318   ............................................................  377

Query_12  1623  TTTGGCTAAGACGGGTAAACCTGTAGTGACTATTGTGATGGCGGGTCGTCCGTTGACTAT  1682
6         388   ............................................................  447
11        380   ............................................................  439
7         377   ............................................................  436
133       312   ............................................................  253
125       311   ............................................................  252
13        378   ............................................................  437
115       814          ..A...........C.....-....                              791
2         453          ..A...........C.....-....                              476

Query_12  1683  CGGTAAAGAAGTCGAAGAGTCGACTGCTGTTCTCTATTCATTCCATCCGGGCACAATGGG  1742
6         448   ............................................................  507
11        440   ............................................................  499
7         437   ............................................................  496
133       252   ............................................................  193
125       251   ............................................................  192
13        438   ............................................................  497

Query_12  1743  CGGTCCTGCATTGGCTGATTTGCTTTGGGGGAAGGCTGTGCCGAGTGGAAAGGCGCCGGT  1802
6         508   ............................................................  567
11        500   ............................................................  559
7         497   ............................................................  556
133       192   ............................................................  133
125       191   ............................................................  132
13        498   ............................................................  557
115       660                                           ...........ACTAA.CA.  641
2         606                                           ...........ACTAA.CA.  625

Query_12  1803  CACTTTCCCGAGGATGGTGGGACAAATTCCTGTGTACTACGCTCATAATAATACCGGACG  1862
6         568   ............................................................  627
11        560   ..........................................................GC  619
7         557   ............................................................  616
133       132   ..........................................................GC  73
125       131   ............................................................  72
13        558   ............................................................  617
115       640   G..........A..AT..A..C..G..A...T...T....AA......G........T..  581
2         626   G..........A..AT..A..C..G..A...T...T....AA......G........T..  685

Query_12  1863  TCCGGCTACACGGAATGAAGTGTTGCTGAATGATATTGCTGTTGAGGCAGG-ACAGACTT  1921
6         628   ...................................................-........  686
11        620   ...................................................-........  678
7         617   ...................................................-........  675
133       72    ...................................................-........  14
125       71    ...................................................A........  12
13        618   ...................................................-........  676
115       580   G..                                                           578
2         686   G..                                                           688

Query_12  1922  CA-CTGGGCTGTACTTCCTTCTATATGGATGCGGGTTTTGATCCC-TTGTTTCCGTTTGG  1979
6         687   ..-..........................................-..............  744
11        679   ..-..........................................-..............  736
7         676   ..-..........................................-..............  733
133       13    ..N..N...                                                     5
125       11    .                                                             11
13        677   ..-..........................................T..............  735
27        458                                          .....A-....A...A..C..  477
23        460                                          .....A-....A...A..C..  479
116       512                                          .....A-....A...A..C..  493

Query_12  1980  TT-ATGGCTTG-TCGTACACCACA-TTTAAGTATAGCAACATCAAACTG-GCGTCTGATG  2035
6         745   ..A........-............-........................-..........  801
11        737   ..-........-............T........................-..........  793
7         734   ..-........-............-........................-..........  789
13        736   ..-........T............-..................N.....-..........  792
27        478   C.-....T...-.....T....AC-...C.A..C...G....A.CT...A...C.CCGAC  534
23        480   C.-....T...-.....T....AC-...C.A..C...G....                    518
116       492   C.-....T...-.....T....AC-...C.A..C...G....                    454

Query_12  2036  TACTGAAAAAAGATGATGTGCTGACAGTGACATTCGATCTGGAA--AATACCGGGAAATA  2093
6         802   ................................-...........--..............  858
11        794   ............................................--..............  851
7         790   ............................................--..............  847
13        793   .....-......................................--.........-....  848
27        535   ..-..GG.C.G....--..T...TT.C..CT..GGTCA.G.T..CC........T..G..  591
33        828                                                 .....A..T..G..  841

Query_12  2094  TGAAGGAACGGAAGTAGCTCAATTGTATATACAAGA-TAAGATTGGTTCCGT-GAC-TCG  2150
6         859   ..........................TN........-...............-...-...  915
11        852   ....................................-...............N...T...  910
7         848   .....................T..............-.........N.....-...-...  904
13        849   ...N.........-.N....-...............-...............-...-...  903
27        592   C..T..TG.A.......TG...C.T.....C.GT..-CCTTG.A..AAG.A.-C..-C..  648
8         332                                                             ..  331
66        155     ...............                                             141
33        842   ...C..TT.........TG..GC.A.....C.GC..C.CTT..A..CAGT..-A..-A..  899

Query_12  2151  TCCGGTGAAAGAA-CTGAAACGCTTCACTCGTGTGACATTGAAGCCGGG-TGAGaaaaaa  2208
6         916   .............-.............................N.....-..GAG.....  973
11        911   .-...........-.....N.............................T..........  968
7         905   .......-.....-................N.............N.C..-..........  961
13        904   ...N.........-...........NN..............-.....T.-....-.....  959
27        649   ......A......-......                                          667
8         330   .........G..G-......GCT...CGC......                           297
33        900   .............N.....                                           918

Query_12  2209  aGCGTTTCGTTTGAACT-CCCTGTTAGTGAACTTGCATTTTGGAACATAGATATGGCTAA  2267
6         974   .............-...-..........................................  1031
11        969   .................N...N.................C......N.............  1028
7         962   .............-...-...................-................-...-.  1016
13        960   ....-...T..G..N..-.....N........-...N...--.G.NN..N..N..C....  1014

Query_12  2268  AGTTGTGG-AA--CCCGGAGACTTTGGGCTTTGGG-TGGCAACGGAT-AG-TCAGTCCGG  2321
6         1032  ........A..--.T.........C..........T...........N..-..--NT.NN  1086
11        1029  ........-..AC.N.........--.N....N..-NN..C......A..-.....TNN.  1083
7         1017  ......-.-..--............-..N......-N.--CN.C...-..-......T.-  1065
13        1015  ..-...-.-..--......N.AC...NCT..G...-....C......-..T..N..NN.A  1067

Query_12  2322  AG-AAGAAGTTTT--C-TTCTAACATT-GGAAGTGGATAACGGATCCGAATTCGAGCTCC  2376
6         1087  .A-...-......--.T..........G.........N.NG.AT.....             1131
11        1084  .NT....T.....TCT-.....NNT..-....NN.......                     1122
7         1066  ----...GAG...--.-....-....---.GN......-.......--G....N.....G  1111
13        1068  .A-N..-......--.-.......N..-..C..                             1094
83        127                       .......-................................  89
85        130                       .......-................................  92
110       840                       .......-................................  878
39        816                       .......-................................  854
27        838                    ..G.......-................................  879
23        839                    ..G.......-...................N.....C......  880
112       837                       .......-.....................N.-........  874
111       841                       .......-.........................N......  879
40        131                       .......-................................  93
26        133                       .......-................................  95
115       135                       .......-................................  97
49        132                       .......-................................  94
116       131                    ..G.......-................................  90
60        134                       .......-................................  96
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56        133                       .......-................................  95
44        132                       .......-................................  94
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Query_12  2428  CCGGCTGCTAACAAAG-CCC--G--AAAGGAAGC-TGAGTTGGC-TG-CTGCCACCGCTG  2479
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Query_12  2480  AGCAATAAC-TAG-CA-TAAC-C-CCTT-GGGGCCTCTAAACGGGTCTT--GAGG-GG--  2528
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Query_12  2529  TTTTTTGCTGAAA  2541
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Effective search space used: 386054383


Query= APC115044.157

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Query_13  201   CGTAGAATCTCTCCTGTCTAAGATGACCCTTGAGGAGAAAATCGGT-CAG-ATGAACCAG  258
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117       600                      .........G.G..A...........A-..A-T......    564
83        812   ..A.A...                                                      805
85        812   .                                                             812
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105       160   .                                                             160
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96        160   .                                                             160
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Query_13  259   ATTTCCTCTTACGGTAATATCGAGGATATGAGTGCTTTGATTAAGAAA-GGTGAAATCGG  317
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Query_13  318   TTCCA-T-CTTGAATGAGGTGGATCCGGTGCGTATTAAT-GCG-CTACAGCG-CGTGGCA  372
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Query_13  373   ATGGAAGAATCCCGTTTGGGTATTCCTTTATTGATAGCGCGTG-ATGTCATTCACGGG-T  430
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Query_13  431   TTAAAACAATTTTCCCTATTCCCTTGGGACAAG-CGGCTTCGTTCAATCC-GCAGG-TAG  487
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122       626   A.G....TG.............T.....TATG.-.T..CA.A.GGG..AT-.A...C..T  569
137       633      ....C..............A..A..                                  609

Query_13  488   CGAAAGACGGTGCACGGA-TAGCAGCTATTGAAGCTTCGTCTGTAGGTATCCGGTGGACT  546
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Query_13  547   TTTGCGCC-AATGATTGATATTGCCCGCGATCCTCGCTGGGGACGTATTGCCGAA-GGGT  604
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Query_13  605   GTGGTGAAGATAC-GTACCTT-ACTT--CCGTAATGGG-AGCAG-CTAT-GGTA-GAAGG  656
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Query_13  657   TTTT-CAGGGA-GATT-CGC-TGAA-TAGTCCTAC-TTCAATTGCAGCTTGCCCTAAA-C  709
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Query_13  710   ATTTT-GTAGG-TTACGGTGCAGCCGAAGGAGGACGTGATTATAATTCCACGTTCATTCC  767
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Query_13  768   CGAACGTCGTCTGCGCAATG-TTTATTTGCCACC---TTTTGAAGCT-GCCAC-CAAAG-  820
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Query_13  821   CGGG-TGCAGCCACG-TTTATG-ACTTCATTTAATG-ATAATG--ATGGAAT-CCC-TTC  872
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Query_13  873   TA-CCGGGAA-T-GCTTTTATTTTGA-A-GAATGTA-CT-CCGTGACGAG-TGGGGA---  921
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Query_13  922   -TTCG-A-TGGTTTTGTTGTGACGGACT-GGGCTTCTG-CCAGCGAAA-TGATAAGCC--  973
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121       805   -..T.-.-...G..C.............-ATA.CGG.A-T..CT....-...CCGAT.--  754

Query_13  974   ATGGTTTTGCCGCCGGTTC--AAAAGAAGTGGCAATG-AAATCTGTGAATGCAGGAG-TA  1029
9         929   ...................---...............--..................-..  982
118       476   ...................--................-...................-..  421
128       481   ...................--................-...................-..  426
130       472   ...................--................-...................-..  417
133       964   ..........N....-...--...GA...........N...................-..  909
125       962   .NN...NN......A.A..CA................-...............N...G..  904
16        352   ...................--................-...................-..  407
136       505   ........N..N.......--.G..............-...................-..  450
121       753   .....A.---G.GT.A.A.--.C..AC...T...GCC-CTGG..C..........T.-.C  701
138       185   ..............                                                172
135       189   ..............                                                176
132       185   ..............                                                172
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43        217   ..............                                                230
41        217   ..............                                                230

Query_13  1030  GATATGGAAATGG-TGAGTTACA-CTTTTGTGAAGGAA-CTGCCGGAA-TTAGTGAAAGA  1085
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125       903   .............-.........-..............-.........-...........  848
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136       449   N..N........N-.........-..............-.NN.....N-...........  394
121       700   ........T....-....                                            684

Query_13  1086  GGGAAAGGTGAAGGAAAGCACTATCGATGAGGCTGTTCGTAATATTTTGCGTATAAAGTA  1145
9         1040  -.......................................-.N.................  1097
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130       360   ............................................................  301
133       849   ......A...............................N.....................  790
125       847   ...............................................-............  789
16        464   ............................................................  523
136       393   ...............T.....NNN....................................  334

Query_13  1146  TCGTTTAGGATTGTTTGATACACCTTATGTAGATGAACAACAAACATCTGTCATGTATG-  1204
9         1098  .........GA..........................AC.NC.............NN..C  1157
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130       300   ...........................................................-  242
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125       788   ...........................................................-  730
16        524   ...........................................................-  582
136       333   .........N...........................................N.....-  275

Query_13  1205  CTCCTTCTCATTTGGAAGCAGCTAAGCAAGCCGCTG-TTGAATCGGCTATTCTGTTGAAG  1263
9         1158  ....N..N.....NN....-NN.T...T........T.........N.......N...    1214
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6         14                                                ...NN.......TG..  29
11        8                                                 ....-.........G-  21
133       730   ....................................-.......................  672
7         9                                                      .........G-  18
125       729   ....................................-.......................  671
13        5                                                 ...CN.........G-  19
16        583   ....................................-.......................  641
136       274   ....................................-N................N.....  216
121       468                                                    ....C......  458
4         430                                                    ....T..A...  440

Query_13  1264  AATGATAAGGAAGTGTTGCCGTTACAGCCATCTGTGAAAA-CTGTTGCAGTGGTAGGA-C  1321
118       186   ........................................-.................-.  129
128       191   ........................................-.................-.  134
130       182   ........................................-.................-.  125
6         30    .-......................................-.................-.  86
11        22    -.......................................-.................-.  78
133       671   ........................................-.................-.  614
7         19    -.......................................-...........N.....-.  75
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13        20    -.......................................-............A....-.  76
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136       215   .NN.....N.......................N.......G...........A.....G.  156
121       457   .....G..                                                      450
4         441   ........                                                      448

Query_13  1322  CTATGGCTAATGCACCTTATGAACAGTTAGGTACTTGGATATTTGATGGTGAGAAAGCTC  1381
118       128   ............................................................  69
128       133   ...................................GCT......................  74
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6         87    ............................................................  146
11        79    ............................................................  138
133       613   ............................................................  554
7         76    ...................................GCT......................  135
125       612   ............................................................  553
13        77    ....................................TT......................  136
16        700   ............................N...............................  759
136       155   ..........N..G...N....N..                                     131

Query_13  1382  GTACTCAGACTCCGTTGAACGCTATTAAAGAAATGGTTGGCGATAAAGTACAGGTGATTT  1441
118       68    ...........................................................   10
128       73    ............................................................  14
130       64    ......................................................-....   7
6         147   ............................................................  206
11        139   ............................................................  198
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7         136   ............................................................  195
125       552   ............................................................  493
13        137   ............................................................  196
16        760   .......                                                       766
73        427                                            ..............       440
68        426                                            ..............       439
71        424                                            ..............       437
69        425                                            ..............       438

Query_13  1442  ATGAACCGGGACTAGCATATAGTCGTGAGAAAAATCCGGCAAGTGTGGCTAAAGCAGCTG  1501
128       13    .NA....C.....                                                 1
6         207   ............................................................  266
11        199   ............................................................  258
133       493   ............................................................  434
7         196   ............................................................  255
125       492   ............................................................  433
13        197   ............................................................  256

Query_13  1502  CCGCCGCTGCACGTGCAGATGTCATTCTTGCTTTTGTGGGTGAAGAATCTATTCTTTCGG  1561
6         267   ............................................................  326
11        259   ............................................................  318
133       433   ............................................................  374
7         256   ............................................................  315
125       432   ............................................................  373
13        257   ............................................................  316

Query_13  1562  GTGAAGCTCACTGTTTGGCTGATCTGGATTTGCAGGGTGATCAGGGAGCTTTGATTACAG  1621
6         327   ...CT.......................................................  386
11        319   ............................................................  378
133       373   ............................................................  314
7         316   ............................................................  375
125       372   ...CT.......................................................  313
13        317   ............................................................  376

Query_13  1622  CTTTGGCTAAGACGGGTAAACCTGTAGTGACTATTGTGATGGCGGGTCGTCCGTTGACTA  1681
6         387   ............................................................  446
11        379   ............................................................  438
133       313   ............................................................  254
7         376   ............................................................  435
125       312   ............................................................  253
13        377   ............................................................  436
115       814           ..A...........C.....-....                             791
2         453           ..A...........C.....-....                             476

Query_13  1682  TCGGTAAAGAAGTCGAAGAGTCGACTGCTGTTCTCTATTCATTCCATCCGGGCACAATGG  1741
6         447   ............................................................  506
11        439   ............................................................  498
133       253   ............................................................  194
7         436   ............................................................  495
125       252   ............................................................  193
13        437   ............................................................  496

Query_13  1742  GCGGTCCTGCATTGGCTGATTTGCTTTGGGGGAAGGCTGTGCCGAGTGGAAAGGCGCCGG  1801
6         507   ............................................................  566
11        499   ............................................................  558
133       193   ............................................................  134
7         496   ............................................................  555
125       192   ............................................................  133
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115       660                                            ...........ACTAA.CA  642
2         606                                            ...........ACTAA.CA  624

Query_13  1802  TCACTTTCCCGAGGATGGTGGGACAAATTCCTGTGTACTACGCTCATAATAATACCGGAG  1861
6         567   ...........................................................C  626
11        559   ............................................................  618
133       133   ............................................................  74
7         556   ...........................................................C  615
125       132   ...........................................................C  73
13        557   ...........................................................C  616
115       641   .G..........A..AT..A..C..G..A...T...T....AA......G........    584
2         625   .G..........A..AT..A..C..G..A...T...T....AA......G........    682

Query_13  1862  CTCCGGCTACACGGAATGAAGTGTTGCTGAATGATATTGCTGTTGAGGCAGG-ACAGACT  1920
6         627   G...................................................-.......  685
11        619   ....................................................-.......  677
133       73    ....................................................-.......  15
7         616   G...................................................-.......  674
125       72    G...................................................A.......  13
13        617   G...................................................-.......  675

Query_13  1921  TCA-CTGGGCTGTACTTCCTTCTATATGGATGCGGGTTTTGATCCC-TTGTTTCCGTTTG  1978
6         686   ...-..........................................-.............  743
11        678   ...-..........................................-.............  735
133       14    ...N..N...                                                    5
7         675   ...-..........................................-.............  732
125       12    ..                                                            11
13        676   ...-..........................................T.............  734
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23        460                                           .....A-....A...A..C.  478
116       512                                           .....A-....A...A..C.  494

Query_13  1979  GTT-ATGGCTTG-TCGTACACCACA-TTTAAGTATAGCAACATCAAACTG-GCGTCTGAT  2034
6         744   ...A........-............-........................-.........  800
11        736   ...-........-............T........................-.........  792
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13        735   ...-........T............-..................N.....-.........  791
27        477   .C.-....T...-.....T....AC-...C.A..C...G....A.CT...A...C.CCGA  533
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116       493   .C.-....T...-.....T....AC-...C.A..C...G....                   454

Query_13  2035  GTACTGAAAAAAGATGATGTGCTGACAGTGACATTCGATCTGGAA--AATACCGGGAAAT  2092
6         801   .................................-...........--.............  857
11        793   .............................................--.............  850
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13        792   ......-......................................--.........-...  847
27        534   C..-..GG.C.G....--..T...TT.C..CT..GGTCA.G.T..CC........T..G.  590
33        828                                                  .....A..T..G.  840

Query_13  2093  ATGAAGGAACGGAAGTAGCTCAATTGTATATACAAGA-TAAGATTGGTTCCGT-GAC-TC  2149
6         858   ...........................TN........-...............-...-..  914
11        851   .....................................-...............N...T..  909
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13        848   ....N.........-.N....-...............-...............-...-..  902
27        591   .C..T..TG.A.......TG...C.T.....C.GT..-CCTTG.A..AAG.A.-C..-C.  647
8         332                                                              .  332
66        155      ...............                                            141
33        841   ....C..TT.........TG..GC.A.....C.GC..C.CTT..A..CAGT..-A..-A.  898

Query_13  2150  GTCCGGTGAAAGAA-CTGAAACGCTTCACTCGTGTGACATTGAAGCCGGG-TGAGaaaaa  2207
6         915   ..............-.............................N.....-..GAG....  972
11        910   ..-...........-.....N.............................T.........  967
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13        903   ....N.........-...........NN..............-.....T.-....-....  958
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Query_13  2321  GAG-AAGAAGTTTT--C-TTCTAACATT-GGAAGTGGATAACGGATCCGAATTCGAGCTC  2375
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Query_13  2428  -CCGGCTGCTAACAAAG-CCC--G--AAAGGAAGC-TGAGTTGGC-TG-CTGCCACCGCT  2478
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51        28    C................-...--.--....                                4
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Query_13  2479  GAGCAATAAC-TAG-CA-TAAC-C-CCTT-GGGGCCTCTAAACGGGTCTT--GAGG-GG-  2528
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Effective search space used: 386054383


Query= APC115044.158

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Query_14  1     TCTCG-ATCCCGCGAAATTAATAC-GACTC-ACTATAGGGG--AATT-GTGAG-CGGA-T  52
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Query_14  53    AAC-AA-TT-CCCC--T-C-TAGAAA-TAA-TTTT-GTTTAAC--TTTAAGAA-GGA-GA  98
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Query_14  99    TATAC-ATATG--CACCAT-CATCATCAT-CATTCTT-CT-GG-TGTAGAT-CTGTGGTC  149
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Query_14  201   CGTAGAATCTCTCCTGTCTAAGATGACCCTTGAGGAGAAAATCGGT-CAG-ATGAACCAG  258
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Query_14  373   ATGGAAGAATCCCGTTTGGGTATTCCTTTATTGATAGCGCGTG-ATGTCATTCACGGG-T  430
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Query_14  431   TTAAAACAATTTTCCCTATTCCCTTGGGACAAG-CGGCTTCGTTCAATCC-GCAGG-TAG  487
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Query_14  547   TTTGCGCC-AATGATTGATATTGCCCGCGATCCTCGCTGGGGACGTATTGCCGAA-GGGT  604
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29        725                ..T.....C.GA....CC...........C...A..             760
137       334                ..T.....C.GA....CC...........C...A..             299
131       727                ..T.....C.GA....CC...........C...A..             692
21        126                ..T.....C.GA....CC...........C...A..             161
19        129                ..T.....C.GA....CC...........C...A..             164

Query_14  768   CGAACGTCGTCTGCGCAATG-TTTATTTGCCACC---TTTTGAAGCT-GCCAC-CAAAG-  820
9         722   ....................T.............---..........-.....-.....-  775
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130       678   ....................-.............---..........-.....-.....-  626
133       1165                         ......T....CTA...G.....NN...N.A.....N  1129
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16        146   ....................-.............---..........-.....-.....-  198
136       711   ....................-.............---..........-N....-.....-  659

Query_14  821   CGGG-TGCAGCCACG-TTTATG-ACTTCATTTAATG-ATAATG--ATGGAAT-CCC-TTC  872
9         776   ....-..........-......-.............-......--.......-...-...  827
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133       1128  ..A.-N.....AT..N......G......N..T...G....A.--.......-...C...  1073
125       1131  ....GN..GAN....-N..NG.-CT.....NNNN-.-......GA.......A...-G..  1077
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121       889                      ...-G.......C....-.AGTG.--....TG.-A..-GG.  855

Query_14  873   TA-CCGGGAA-T-GCTTTTATTTTGA-A-GAATGTA-CT-CCGTGACGAG-TGGGGA---  921
9         828   ..-.......-.-.............-.-.......-..-..........-......---  876
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Query_14  922   -TTCG-A-TGGTTTTGTTGTGACGGACT-GGGCTTCTG-CCAGCGAAA-TGATAAGCC--  973
9         877   -....-.-....................-.........-.........-.........--  928
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121       805   -..T.-.-...G..C.............-ATA.CGG.A-T..CT....-...CCGAT.--  754

Query_14  974   ATGGTTTTGCCGCCGGTTC--AAAAGAAGTGGCAATG-AAATCTGTGAATGCAGGAG-TA  1029
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125       962   .NN...NN......A.A..CA................-...............N...G..  904
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138       185   ..............                                                172
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41        217   ..............                                                230

Query_14  1030  GATATGGAAATGG-TGAGTTACA-CTTTTGTGAAGGAA-CTGCCGGAA-TTAGTGAAAGA  1085
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136       449   N..N........N-.........-..............-.NN.....N-...........  394
121       700   ........T....-....                                            684

Query_14  1086  GGGAAAGGTGAAGGAAAGCACTATCGATGAGGCTGTTCGTAATATTTTGCGTATAAAGTA  1145
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125       847   ...............................................-............  789
16        464   ............................................................  523
136       393   ...............T.....NNN....................................  334

Query_14  1146  TCGTTTAGGATTGTTTGATACACCTTATGTAGATGAACAACAAACATCTGTCATGTATG-  1204
9         1098  .........GA..........................AC.NC.............NN..C  1157
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133       789   ...................N.C.....................................-  731
125       788   ...........................................................-  730
16        524   ...........................................................-  582
136       333   .........N...........................................N.....-  275

Query_14  1205  CTCCTTCTCATTTGGAAGCAGCTAAGCAAGCCGCTG-TTGAATCGGCTATTCTGTTGAAG  1263
9         1158  ....N..N.....NN....-NN.T...T........T.........N.......N...    1214
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6         14                                                ...NN.......TG..  29
7         9                                                      .........G-  18
11        8                                                 ....-.........G-  21
133       730   ....................................-.......................  672
13        5                                                 ...CN.........G-  19
125       729   ....................................-.......................  671
16        583   ....................................-.......................  641
136       274   ....................................-N................N.....  216
121       468                                                    ....C......  458
4         430                                                    ....T..A...  440

Query_14  1264  AATGATAAGGAAGTGTTGCCGTTACAGCCATCTGTGAAAA-CTGTTGCAGTGGTAGGA-C  1321
118       186   ........................................-.................-.  129
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6         30    .-......................................-.................-.  86
7         19    -.......................................-...........N.....-.  75
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13        20    -.......................................-............A....-.  76
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136       215   .NN.....N.......................N.......G...........A.....G.  156
121       457   .....G..                                                      450
4         441   ........                                                      448

Query_14  1322  CTATGGCTAATGCACCTTATGAACAGTTAGGTACTTTTATATTTGATGGTGAGAAAGCTC  1381
118       128   ....................................GG......................  69
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7         76    ...................................GC.......................  135
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136       155   ..........N..G...N....N..                                     131

Query_14  1382  GTACTCAGACTCCGTTGAACGCTATTAAAGAAATGGTTGGCGATAAAGTACAGGTGATTT  1441
118       68    ...........................................................   10
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73        427                                            ..............       440
68        426                                            ..............       439
71        424                                            ..............       437
69        425                                            ..............       438

Query_14  1442  ATGAACCGGGACTAGCATATAGTCGTGAGAAAAATCCGGCAAGTGTGGCTAAAGCAGCTG  1501
128       13    .NA....C.....                                                 1
6         207   ............................................................  266
7         196   ............................................................  255
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13        197   ............................................................  256
125       492   ............................................................  433

Query_14  1502  CCGCCGCTGCACGTGCAGATGTCATTCTTGCTTTTGTGGGTGAAGAATCTATTCTTTCGG  1561
6         267   ............................................................  326
7         256   ............................................................  315
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13        257   ............................................................  316
125       432   ............................................................  373

Query_14  1562  GTGAAGCTCACTGTTTGGCTGATCTGGATTTGCAGGGTGATCAGGGAGCTTTGATTACAG  1621
6         327   ...CT.......................................................  386
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13        317   ............................................................  376
125       372   ...CT.......................................................  313

Query_14  1622  CTTTGGCTAAGACGGGTAAACCTGTAGTGACTATTGTGATGGCGGGTCGTCCGTTGACTA  1681
6         387   ............................................................  446
7         376   ............................................................  435
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115       814           ..A...........C.....-....                             791
2         453           ..A...........C.....-....                             476

Query_14  1682  TCGGTAAAGAAGTCGAAGAGTCGACTGCTGTTCTCTATTCATTCCATCCGGGCACAATGG  1741
6         447   ............................................................  506
7         436   ............................................................  495
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13        437   ............................................................  496
125       252   ............................................................  193

Query_14  1742  GCGGTCCTGCATTGGCTGATTTGCTTTGGGGGAAGGCTGTGCCGAGTGGAAAGGCGCCGG  1801
6         507   ............................................................  566
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13        497   ............................................................  556
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115       660                                            ...........ACTAA.CA  642
2         606                                            ...........ACTAA.CA  624

Query_14  1802  TCACTTTCCCGAGGATGGTGGGACAAATTCCTGTGTACTACGCTCATAATAATACCGGAC  1861
6         567   ............................................................  626
7         556   ............................................................  615
11        559   ...........................................................G  618
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13        557   ............................................................  616
125       132   ............................................................  73
115       641   .G..........A..AT..A..C..G..A...T...T....AA......G........T.  582
2         625   .G..........A..AT..A..C..G..A...T...T....AA......G........T.  684

Query_14  1862  GTCCGGCTACACGGAATGAAGTGTTGCTGAATGATATTGCTGTTGAGGCAGG-ACAGACT  1920
6         627   ....................................................-.......  685
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11        619   C...................................................-.......  677
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Query_14  1921  TCA-CTGGGCTGTACTTCCTTCTATATGGATGCGGGTTTTGATCCC-TTGTTTCCGTTTG  1978
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Query_14  2035  GTACTGAAAAAAGATGATGTGCTGACAGTGACATTCGATCTGGAA--AATACCGGGAAAT  2092
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Query_14  2150  GTCCGGTGAAAGAA-CTGAAACGCTTCACTCGTGTGACATTGAAGCCGGG-TGAGaaaaa  2207
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Query_14  2208  aaGCGTTTCGTTTGAACT-CCCTGTTAGTGAACTTGCATTTTGGAACATAGATATGGCTA  2266
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Query_14  2267  AAGTTGTGG-AA--CCCGGAGACTTTGGGCTTTGGG-TGGCAACGGAT-AG-TCAGTCCG  2320
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Query_14  2321  GAG-AAGAAGTTTT--C-TTCTAACATT-GGAAGTGGATAACGGATCCGAATTCGAGCTC  2375
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Query_14  2376  CGTCGA-CAAGCTT-GCGGCCG-CACT-CGAGcaccaccaccaccacca-cT-G-AGA-T  2427
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Query_14  2428  -CCGGCTGCTAACAAAG-CCC--G--AAAGGAAGC-TGAGTTGGC-TG-CTGCCACCGCT  2478
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Query_14  2479  GAGCAATAAC-TAG-CA-TAAC-C-CCTT-GGGGCCTCTAAACGGGTCTT--GAGG-GG-  2528
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Query_14  2529  -TTTTTTGCTGAAA  2541
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111       1037  T...........    1048


Lambda      K        H
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Gapped
Lambda      K        H
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Effective search space used: 386054383


Query= APC115044.159

Length=2541
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Query_15  1     TCTCG-ATCCCGCGAAATTAATAC-GACTC-ACTATAGGGG--AATT-GTGAG-CGGA-T  52
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Query_15  53    AAC-AA-TT-CCCC--T-C-TAGAAA-TAA-TTTT-GTTTAAC--TTTAAGAA-GGA-GA  98
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Query_15  99    TATAC-ATATG--CACCAT-CATCATCAT-CATTCTT-CT-GG-TGTAGAT-CTGTGGTC  149
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Query_15  150   TCAT-CC--G-CAGTTCG-AAAAGGGTA-CCGAGAA-CCTGTACTT-CCAAT-CCAATGC  200
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Query_15  201   CGTAGAATCTCTCCTGTCTAAGATGACCCTTGAGGAGAAAATCGGT-CAG-ATGAACCAG  258
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Query_15  259   ATTTCCTCTTACGGTAATATCGAGGATATGAGTGCTTTGATTAAGAAA-GGTGAAATCGG  317
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Query_15  318   TTCCA-T-CTTGAATGAGGTGGATCCGGTGCGTATTAAT-GCG-CTACAGCG-CGTGGCA  372
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Query_15  373   ATGGAAGAATCCCGTTTGGGTATTCCTTTATTGATAGCGCGTG-ATGTCATTCACGGG-T  430
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Query_15  431   TTAAAACAATTTTCCCTATTCCCTTGGGACAAG-CGGCTTCGTTCAATCC-GCAGG-TAG  487
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17        427      ....C..............A..A..                                  451
29        426      ....C..............A..A..                                  450
122       626   A.G....TG.............T.....TATG.-.T..CA.A.GGG..AT-.A...C..T  569
137       633      ....C..............A..A..                                  609

Query_15  488   CGAAAGACGGTGCACGGA-TAGCAGCTATTGAAGCTTCGTCTGTAGGTATCCGGTGGACT  546
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118       962   N.................-.........................................  904
128       971   ........N.N.......A.........................................  912
130       957   ........C.........-.....N...................................  899
122       568   A.-..C.ATC...T..T.-....G..G..A.....CAGTG.C.AT..C...T.C.....A  511

Query_15  547   TTTGCGCC-AATGATTGATATTGCCCGCGATCCTCGCTGGGGACGTATTGCCGAA-GGGT  604
9         501   .....A..-..............................................-....  558
118       903   .....A..-..............................................-....  846
128       911   .....A..C..............................................A....  852
130       898   .....A..-................-.............................-....  842
136       894                                                           ....  891
17        563                           ...T.....G...........                 583
29        562                           ...T.....G...........                 582
122       510   ...AGT..-G...G.......CAG...T.....A..T.........G.AT.....-..TA  453
137       497                           ...T.....G...........                 477
131       908        ...-G...G.A..C..CAG...T.....G...........                 870

Query_15  605   GTGGTGAAGATAC-GTACCTT-ACTT--CCGTAATGGG-AGCAG-CTAT-GGTA-GAAGG  656
9         559   .............-.......-....--..........-.....-....-....-.....  610
118       845   .............-.......-....--..........-.....-....-....-.....  794
128       851   .............-.......-....--..........-.....-....-....-.....  800
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16        11                                     ...N.-.....-....-....-.....  33
136       890   ....GA.......C..T....TN...TC..........G...NNA....N....A.....  831
122       452   .C..A......                                                   442

Query_15  657   TTTT-CAGGGA-GATT-CGC-TGAA-TAGTCCTAC-TTCAATTGCAGCTTGCCCTAAA-C  709
9         611   ....-......-....-...-....-.........-......................-.  663
118       793   ....-......-....-...-....-.........-......................-.  741
128       799   ....-......-....-...-....A.........-......................-.  746
130       789   ....-......-....-...-....-.........-......................-.  737
16        34    ....-.N....-....-...G....-N........-......................-.  87
136       830   ....T......A....T...-....A.........C......N...............N.  772

Query_15  710   ATTTT-GTAGG-TTACGGTGCAGCCGAAGGAGGACGTGATTATAATTCCACGTTCATTCC  767
9         664   .....-.....-................................................  721
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19        129                ..T.....C.GA....CC...........C...A..             164

Query_15  768   CGAACGTCGTCTGCGCAATG-TTTATTTGCCACC---TTTTGAAGCT-GCCAC-CAAAG-  820
9         722   ....................T.............---..........-.....-.....-  775
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128       687   ....................-.............---..........-.....-.....-  635
130       678   ....................-.............---..........-.....-.....-  626
133       1165                         ......T....CTA...G.....NN...N.A.....N  1129
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16        146   ....................-.............---..........-.....-.....-  198
136       711   ....................-.............---..........-N....-.....-  659

Query_15  821   CGGG-TGCAGCCACG-TTTATG-ACTTCATTTAATG-ATAATG--ATGGAAT-CCC-TTC  872
9         776   ....-..........-......-.............-......--.......-...-...  827
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130       625   ....-..........-......-.............-......--.......-...-...  574
133       1128  ..A.-N.....AT..N......G......N..T...G....A.--.......-...C...  1073
125       1131  ....GN..GAN....-N..NG.-CT.....NNNN-.-......GA.......A...-G..  1077
16        199   ....-..........-......-.............-......--.......-...-...  250
136       658   ...N-..........-......-.............-......--.......-...-...  607
121       889                      ...-G.......C....-.AGTG.--....TG.-A..-GG.  855

Query_15  873   TA-CCGGGAA-T-GCTTTTATTTTGA-A-GAATGTA-CT-CCGTGACGAG-TGGGGA---  921
9         828   ..-.......-.-.............-.-.......-..-..........-......---  876
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16        251   ..-.......-.-.............-.-.......-..-..........-......---  299
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121       854   ..-....A..-.-AAG.GGC.GA...-C-CG.....-..-T...A.GC..-...AAT---  806

Query_15  922   -TTCG-A-TGGTTTTGTTGTGACGGACTTTG-CTTCTG-CCAGCGAAA-TGATAAGCC--  973
9         877   -....-.-....................GG.-......-.........-.........--  928
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121       805   -..T.-.-...G..C.............A.A-.CGG.A-T..CT....-...CCGAT.--  754

Query_15  974   ATGGTTTTGCCGCCGGTTC--AAAAGAAGTGGCAATG-AAATCTGTGAATGCAGGAG-TA  1029
9         929   ...................---...............--..................-..  982
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125       962   .NN...NN......A.A..CA................-...............N...G..  904
16        352   ...................--................-...................-..  407
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121       753   .....A.---G.GT.A.A.--.C..AC...T...GCC-CTGG..C..........T.-.C  701
138       185   ..............                                                172
135       189   ..............                                                176
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41        217   ..............                                                230

Query_15  1030  GATATGGAAATGG-TGAGTTACA-CTTTTGTGAAGGAA-CTGCCGGAA-TTAGTGAAAGA  1085
9         983   .............-.........-..............C.........-...........  1039
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121       700   ........T....-....                                            684

Query_15  1086  GGGAAAGGTGAAGGAAAGCACTATCGATGAGGCTGTTCGTAATATTTTGCGTATAAAGTA  1145
9         1040  -.......................................-.N.................  1097
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125       847   ...............................................-............  789
16        464   ............................................................  523
136       393   ...............T.....NNN....................................  334

Query_15  1146  TCGTTTAGGATTGTTTGATACACCTTATGTAGATGAACAACAAACATCTGTCATGTATG-  1204
9         1098  .........GA..........................AC.NC.............NN..C  1157
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125       788   ...........................................................-  730
16        524   ...........................................................-  582
136       333   .........N...........................................N.....-  275

Query_15  1205  CTCCTTCTCATTTGGAAGCAGCTAAGCAAGCCGCTG-TTGAATCGGCTATTCTGTTGAAG  1263
9         1158  ....N..N.....NN....-NN.T...T........T.........N.......N...    1214
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130       241   ....................................-.......................  183
6         14                                                ...NN.......TG..  29
11        8                                                 ....-.........G-  21
7         9                                                      .........G-  18
133       730   ....................................-.......................  672
13        5                                                 ...CN.........G-  19
125       729   ....................................-.......................  671
16        583   ....................................-.......................  641
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4         430                                                    ....T..A...  440

Query_15  1264  AATGATAAGGAAGTGTTGCCGTTACAGCCATCTGTGAAAA-CTGTTGCAGTGGTAGGA-C  1321
118       186   ........................................-.................-.  129
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6         30    .-......................................-.................-.  86
11        22    -.......................................-.................-.  78
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136       215   .NN.....N.......................N.......G...........A.....G.  156
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Query_15  1322  CTATGGCTAATGCACCTTATGAACAGTTAGGTACTTGGATATTTGATGGTGAGAAAGCTC  1381
118       128   ............................................................  69
128       133   ...................................GCT......................  74
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136       155   ..........N..G...N....N..                                     131

Query_15  1382  GTACTCAGACTCCGTTGAACGCTATTAAAGAAATGGTTGGCGATAAAGTACAGGTGATTT  1441
118       68    ...........................................................   10
128       73    ............................................................  14
130       64    ......................................................-....   7
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16        760   .......                                                       766
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68        426                                            ..............       439
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69        425                                            ..............       438

Query_15  1442  ATGAACCGGGACTAGCATATAGTCGTGAGAAAAATCCGGCAAGTGTGGCTAAAGCAGCTG  1501
128       13    .NA....C.....                                                 1
6         207   ............................................................  266
11        199   ............................................................  258
7         196   ............................................................  255
133       493   ............................................................  434
13        197   ............................................................  256
125       492   ............................................................  433

Query_15  1502  CCGCCGCTGCACGTGCAGATGTCATTCTTGCTTTTGTGGGTGAAGAATCTATTCTTTCGG  1561
6         267   ............................................................  326
11        259   ............................................................  318
7         256   ............................................................  315
133       433   ............................................................  374
13        257   ............................................................  316
125       432   ............................................................  373

Query_15  1562  GTGAAGCTCACTGTTTGGCTGATCTGGATTTGCAGGGTGATCAGGGAGCTTTGATTACAG  1621
6         327   ...CT.......................................................  386
11        319   ............................................................  378
7         316   ............................................................  375
133       373   ............................................................  314
13        317   ............................................................  376
125       372   ...CT.......................................................  313

Query_15  1622  CTTTGGCTAAGACGGGTAAACCTGTAGTGACTATTGTGATGGCGGGTCGTCCGTTGACTA  1681
6         387   ............................................................  446
11        379   ............................................................  438
7         376   ............................................................  435
133       313   ............................................................  254
13        377   ............................................................  436
125       312   ............................................................  253
115       814           ..A...........C.....-....                             791
2         453           ..A...........C.....-....                             476

Query_15  1682  TCGGTAAAGAAGTCGAAGAGTCGACTGCTGTTCTCTATTCATTCCATCCGGGCACAATGG  1741
6         447   ............................................................  506
11        439   ............................................................  498
7         436   ............................................................  495
133       253   ............................................................  194
13        437   ............................................................  496
125       252   ............................................................  193

Query_15  1742  GCGGTCCTGCATTGGCTGATTTGCTTTGGGGGAAGGCTGTGCCGAGTGGAAAGGCGCCGG  1801
6         507   ............................................................  566
11        499   ............................................................  558
7         496   ............................................................  555
133       193   ............................................................  134
13        497   ............................................................  556
125       192   ............................................................  133
115       660                                            ...........ACTAA.CA  642
2         606                                            ...........ACTAA.CA  624

Query_15  1802  TCACTTTCCCGAGGATGGTGGGACAAATTCCTGTGTACTACGCTCATAATAATACCGGAC  1861
6         567   ............................................................  626
11        559   ...........................................................G  618
7         556   ............................................................  615
133       133   ...........................................................G  74
13        557   ............................................................  616
125       132   ............................................................  73
115       641   .G..........A..AT..A..C..G..A...T...T....AA......G........T.  582
2         625   .G..........A..AT..A..C..G..A...T...T....AA......G........T.  684

Query_15  1862  GTCCGGCTACACGGAATGAAGTGTTGCTGAATGATATTGCTGTTGAGGCAGG-ACAGACT  1920
6         627   ....................................................-.......  685
11        619   C...................................................-.......  677
7         616   ....................................................-.......  674
133       73    C...................................................-.......  15
13        617   ....................................................-.......  675
125       72    ....................................................A.......  13
115       581   .G..                                                          578
2         685   .G..                                                          688

Query_15  1921  TCA-CTGGGCTGTACTTCCTTCTATATGGATGCGGGTTTTGATCCC-TTGTTTCCGTTTG  1978
6         686   ...-..........................................-.............  743
11        678   ...-..........................................-.............  735
7         675   ...-..........................................-.............  732
133       14    ...N..N...                                                    5
13        676   ...-..........................................T.............  734
125       12    ..                                                            11
27        458                                           .....A-....A...A..C.  476
23        460                                           .....A-....A...A..C.  478
116       512                                           .....A-....A...A..C.  494

Query_15  1979  GTT-ATGGCTTG-TCGTACACCACA-TTTAAGTATAGCAACATCAAACTG-GCGTCTGAT  2034
6         744   ...A........-............-........................-.........  800
11        736   ...-........-............T........................-.........  792
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13        735   ...-........T............-..................N.....-.........  791
27        477   .C.-....T...-.....T....AC-...C.A..C...G....A.CT...A...C.CCGA  533
23        479   .C.-....T...-.....T....AC-...C.A..C...G....                   518
116       493   .C.-....T...-.....T....AC-...C.A..C...G....                   454

Query_15  2035  GTACTGAAAAAAGATGATGTGCTGACAGTGACATTCGATCTGGAA--AATACCGGGAAAT  2092
6         801   .................................-...........--.............  857
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13        792   ......-......................................--.........-...  847
27        534   C..-..GG.C.G....--..T...TT.C..CT..GGTCA.G.T..CC........T..G.  590
33        828                                                  .....A..T..G.  840

Query_15  2093  ATGAAGGAACGGAAGTAGCTCAATTGTATATACAAGA-TAAGATTGGTTCCGT-GAC-TC  2149
6         858   ...........................TN........-...............-...-..  914
11        851   .....................................-...............N...T..  909
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13        848   ....N.........-.N....-...............-...............-...-..  902
27        591   .C..T..TG.A.......TG...C.T.....C.GT..-CCTTG.A..AAG.A.-C..-C.  647
8         332                                                              .  332
66        155      ...............                                            141
33        841   ....C..TT.........TG..GC.A.....C.GC..C.CTT..A..CAGT..-A..-A.  898

Query_15  2150  GTCCGGTGAAAGAA-CTGAAACGCTTCACTCGTGTGACATTGAAGCCGGG-TGAGaaaaa  2207
6         915   ..............-.............................N.....-..GAG....  972
11        910   ..-...........-.....N.............................T.........  967
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13        903   ....N.........-...........NN..............-.....T.-....-....  958
27        648   .......A......-......                                         667
8         331   ..........G..G-......GCT...CGC......                          297
33        899   ..............N.....                                          918

Query_15  2208  aaGCGTTTCGTTTGAACT-CCCTGTTAGTGAACTTGCATTTTGGAACATAGATATGGCTA  2266
6         973   ..............-...-.........................................  1030
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13        959   .....-...T..G..N..-.....N........-...N...--.G.NN..N..N..C...  1013

Query_15  2267  AAGTTGTGG-AA--CCCGGAGACTTTGGGCTTTGGG-TGGCAACGGAT-AG-TCAGTCCG  2320
6         1031  .........A..--.T.........C..........T...........N..-..--NT.N  1085
11        1028  .........-..AC.N.........--.N....N..-NN..C......A..-.....TNN  1082
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13        1014  ...-...-.-..--......N.AC...NCT..G...-....C......-..T..N..NN.  1066

Query_15  2321  GAG-AAGAAGTTTT--C-TTCTAACATT-GGAAGTGGATAACGGATCCGAATTCGAGCTC  2375
6         1086  N.A-...-......--.T..........G.........N.NG.AT.....            1131
11        1083  ..NT....T.....TCT-.....NNT..-....NN.......                    1122
7         1066  -----...GAG...--.-....-....---.GN......-.......--G....N.....  1110
13        1067  A.A-N..-......--.-.......N..-..C..                            1094
83        127                        .......-...............................  90
85        130                        .......-...............................  93
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23        839                     ..G.......-...................N.....C.....  879
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3         133                        .......-...............................  96
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15        61                         .......-.............--.....             37
20        65                         .......-.............--.....             41
18        65                         .......-.............--.....             41

Query_15  2376  CGTCGA-CAAGCTT-GCGGCCG-CACT-CGAGcaccaccaccaccacca-cT-G-AGA-T  2427
7         1111  GT....-.-.....-..-....-...                                    1131
83        89    ......-.......-.......-....-....---..............-..-.-...-.  41
85        92    ......-.......-.......-....-.....................-..-.-...-.  41
110       878   ......A.......-.......-....-...............--....-..T.-...-.  929
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27        879   ......-.......T.......-....-.....................-..-.-.N.-.  931
23        880   ......-.......-.......-....-...N........-........-..-.-...-.  930
112       874   ......-.......-....T..-....T.................N...N..-.-...-.  927
111       879   ......-.N.....-.......C..N.-..................N..-..-.A...-.  932
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115       97    ......-.......-.......-....-.....................-..-.-...-.  46
49        94    ......-.......-.......-....-.....................-..-.-...-.  43
116       90    ......-.......-.......-....-.....................-..-.-...-.  39
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Query_15  2428  -CCGGCTGCTAACAAAG-CCC--G--AAAGGAAGC-TGAGTTGGC-TG-CTGCCACCGCT  2478
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Query_15  2529  -TTTTTTGCTGAAA  2541
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Query= APC115045.148

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Query_16  1     TCTCG-ATCCCGCGAAATTAATAC-GACTC-ACTATAGGGG--AATT-GTGAG-CGGA-T  52
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Query_16  53    AAC-AA-TT-CCCC--T-C-TAGAAA-TAA-TTTT-GTTTAAC--TTTAAGAA-GGA-GA  98
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76        149   -..                                                           150
61        137   -..-C..A..                                                    144
78        147   -..                                                           148
99        143   C..-....A..                                                   152
91        144   -..                                                           145
114       167   -..-C..A..                                                    174
87        800   -..                                                           799
101       156   -..                                                           157

Query_16  255   TGTAGAGGAAAAG--ATCGGTCAGCTGAACCTACCCGTTTCCGGCGAGATCGTCACCGGG  312
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122       848   CT.G..A..G...--..T........T..T..T...AGC..G..A..T..AAC......A  791

Query_16  313   CAGGCACAAAACAGCGATGTGGCAAAAAA-GATT-GAACAAGGGCTCGTGGGCGGACTCC  370
17        261   .............................-....-.........................  318
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Query_16  371   T-CAACCTGAAAGGGGTGGAGAAGATACGCGATGTACAAAAACTGGCCATAGAGAAGTCA  429
131       1117        .....--............NN........N-.......................  1067
17        319   .-..........................................................  377
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122       732   .T...TA.A.....A..T..........AG..A......CGTA.T..TG.....G..AGT  673

Query_16  430   CGCCTGGGCATCCCCCTGATATTCGGCATGGCTGTAGTGCATGGTTACGAAACCATTTTC  489
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Query_16  490   CCTATTCCATTAGGCCTCTCCTGTTCCTGGGATATGGAAGCCATCAGGA-AATCTGCCCG  548
131       1010  ...N.N.-.....-...N........N...-.....AG...........-..........  955
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128       1016  N.......                                                      1009

Query_16  549   CGTTGCAGCCATCGAGGCCAGTGCTGATGGTATTTCC-TGGACATTCAGCCCGATGGTAG  607
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128       905                                                    ...A...A.T.  895

Query_16  608   ACATCAGCCGTGATCCGCGCTGGGGACGCGTCA--GCGAGGGTAACGGCGAAGACCCATT  665
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Query_16  666   CTTGGG-TGGAGCCAT-CGCTAAAGCAATGGTATCGGGTTATCAGGGTATCGA-CCTCAA  722
21        14    ......-.........-....................................-......  70
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Query_16  723   CAACCAAC-TGAAGCGCAAC-GA-TGAAATTATGGC-ATG-TGTAAA-GC-ACTTCG-C-  773
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Query_16  774   ACTGT-AT-GGTGCCGGAG-AAGCCGGA--CGTGATT-ACAATACCGTA-GATAT-GAGT  825
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130       725       .-.C-.....A.CC.-...GA...--.......-.T...T..                690
128       734       .-.C-.....A.CC.-...GA...--.......-.T...T..                699
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16        99        .-.C-.....A.CC.-...GA...--.......-.T...T..                134
136       754             ....A.CC.-...GA...--.......-.T...T..                723

Query_16  826   CGTAACCGT-ATGTTCAACGAATACATGTATCCCT-ACCAAGCT-GCC-GTAGATGCAGG  881
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117       21    ..C..                                                         17
1         146   ..C.....G-........T....T......C..G.-.TG.G...-...-.....G..C..  201
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121       958   .A.C.A...-..............T....TA..T.-.T..G...-...-..G..A.A...  903

Query_16  882   TGTAGGCAGCGTAATGGCGTC-TTTCAACGAAATAGACGGCATACCAGCCACGG-CCAAT  939
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Query_16  940   AAATGGC-TGATGACCGACGTACTGCGCAAGCAA-TGGGGCTTCGACGGCTTTGTGGTGA  997
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5         693    ...T..-...........                                           677

Query_16  998   CAGACTTTACCGGTATCTCCGAAA-T-GATAGCGCACGGCATCGGTGAC-TTGC-AGACT  1053
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4         112   .G....A..........ATG....-.-.G..AAT..T..T..T..A..T-A...G...A-  167

Query_16  1054  --GTTTCCGCACGTGCACT-CAATGCAGGCGTGGATATGGACATGGTAAGTGAAGGCTTC  1110
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17        1007  TGT.......N........N.......T..                                1036
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Query_16  1111  ACGGGTACAATCAAGAAATCCATAGACGAAGGCAAGATCAGTAT--GGAAACCCTG--GA  1166
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4         225   CTTTC....C.TC.AC....AT.GA.G..G..T.....A.CAGA--.A..GAGA.A--..  280

Query_16  1167  CAAAGCCTGTCGCCGCATCCTTGAAGCCAAATACAAACTGGGATTATTCGACAATCCTTA  1226
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Query_16  1227  TAAGTACTGCGAC-CTGAAACGCCCGAAGCGTGACATCTTCACCAAGGAACATCGCGACG  1285
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Query_16  1286  CTGCTCGTAAGATTGCGGGAGAGAGCTTTGTACTCCTGAAAAA------CGACA------  1333
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4         400   T...A..CCG...CT.T.CT..A........T..TT.A..G..------T..T.------  447

Query_16  1334  AGTCA-----GGTTCCT----------------CTGCAAACCCAACACTTCCTTTGAAAA  1372
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Query_16  1373  AAGAA-GGTACGGTGGCTGTCATCGGCCCACTGGCAAATACCCGCAGTAACATGCCGGGT  1431
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Query_16  1432  ACCTGGAGTGTAGCCG-CACGCCTCAA----CGACTATCCTTCTGTGTACGAAGGATT-G  1485
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Query_16  1486  A-AAGAGATGA----TGAAAGGCAA-GGTAAACATCACTTA-TGCC-AAAGGTAGTAACC  1537
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4         582   .-....AG..GCAGG...T.---..-.T.G..-..TGTG..-...T-..G.....CC.T.  633

Query_16  1538  TCATCAGTGATGCAGCCTACGAAGAA-CGTGCCACA-ATGTTCGGCCGTTCA-TTAAATC  1594
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Query_16  1595  GTGATAAT------CGTACAGA-CAAAGAGATGCTGGATG-A-GGCGCTGAAA-GTG-GC  1643
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Query_16  1644  CGCTAATGCAGATGTA-ATAAT-A-GCCGCATTGGGAGAATCATCTGAAATG-AGTGGTG  1699
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Query_16  1700  AA---A-GTTCAAGCCG-CA-CTAAC-CT-GGCTCTTCCCGAT-GTACAGCGCACTCTAT  1750
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Query_16  1751  TGGAAGCTTTGCTGAAAACTGGAAAGCCTGTTGTACTGACGC-T-CTTTACAGG-T--CG  1805
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Query_16  1806  CCCACT-AACGTTGACTTGGGAACAGGAGCATGT-GCCCGCCATCCTGAA-TGTATGGTT  1862
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Query_16  1863  CGGTGGAAGTGAGGCAGCATACGCCATTGGCGATGTATTGTTCGGCGATGTAAATCCCAG  1922
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8         717   T.CC..C.....A..G.GTG.T.......C......GA....T..A..A...TC...     661

Query_16  1923  CGGCAAACTAACGATGACATTCCCCAAAAACGTAGGCCAAATACCTTTGTTTTACAATCA  1982
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2         611   T..A........C.....T.....G..G..T........G...........C........  670
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Query_16  1983  TAAAAATACCGGTCGTCCTTTACTTG-AAGGCAAATGGTTCGAAAA-ATTCCGTAGTAAT  2040
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33        631   ...G.....T...........G.C.C-....GGCC......C.G..-G........C...  688

Query_16  2041  TACCTGGATGTAGACAACGATCCATTGTATCCATTCGGCTATGGTTTGTCGTATACCAAC  2100
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Query_16  2101  TTT-C-AATACAGCGACATAACTCTG-----AGCG-CCCCGACTATGGG-ACAGGATGGT  2151
25        801   ...-.-....................-----....-.............-..........  851
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Query_16  2152  TCTGTTACTGCTATGGTCACGGT-AA-CCAATACCGGTAAGTACGATGGTGCAGAAGTAG  2209
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Query_16  2210  TGCAAC-TTTATATCCGTGAC-CTTGTAGGAAGCATCA-CCCGTCCGGTAAAAGAA-CTG  2265
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Query_16  2266  AAAGGGTTTGATAAAATTTTCCT-CAAAGCGGG-TGAAAGTAAGACTGTATCTTTCAAAA  2323
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Query_16  2324  TCAC-TCCGGAATTACTGCGCTT-CTACGACTATGAACTCAACTACGTAGCC-GAACCGG  2380
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Query_16  2381  GAGACTTCG-ACATAATGATCGGGGGGAACAGCC--AAAGTGTAAAAA-CG-ACTCATCT  2435
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Query_16  2436  GAGTTTG--TAACATTGGAAGTGGATAACGG-ATCCGAATTCGAGCTCCGTCGA-CAAGC  2491
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18        71     ....G.--....................---.....                         41

Query_16  2492  -TTGCGGCCG-CACT-CGAGcaccaccaccaccacca-cT-G-AGA-T-CCGGCTGCTAA  2543
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Query_16  2544  CAAAG-CCC--G--AAAGGAAGC-TGAGTTGGC-TG-CTGCCACCGCTGAGCAATAAC-T  2594
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Query_16  2595  AG-CA-TAAC-C-CCTT-GGGGCCTCTAAACGGGTCTT--GAGG-GG--TTTTTTGCTGA  2644
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Query_16  2645  AA  2646
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Lambda      K        H
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Gapped
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Effective search space used: 402146368


Query= APC115045.149

Length=2646
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  22_02D_APC115045.150Seq171D02.seq                                   1941    0.0   
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Query_17  1     TCTCG-ATCCCGCGAAATTAATAC-GACTC-ACTATAGGGG--AATT-GTGAG-CGGA-T  52
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82        149   -..                                                           150
59        143   -..-C..A..                                                    150
111       151   -..-..                                                        154
100       150   C..-....A..                                                   159
80        151   -..                                                           152
97        161   -..                                                           162
104       162   -..-.                                                         164
72        150   -..-C..A..                                                    157
74        145   -..-C..A..                                                    152
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61        137   -..-C..A..                                                    144
78        147   -..                                                           148
99        143   C..-....A..                                                   152
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Query_17  255   TGTAGAGGAAAAG--ATCGGTCAGCTGAACCTACCCGTTTCCGGCGAGATCGTCACCGGG  312
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122       848   CT.G..A..G...--..T........T..T..T...AGC..G..A..T..AAC......A  791

Query_17  313   CAGGCACAAAACAGCGATGTGGCAAAAAA-GATT-GAACAAGGGCTCGTGGGCGGACTCC  370
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Query_17  371   T-CAACCTGAAAGGGGTGGAGAAGATACGCGATGTACAAAAACTGGCCATAGAGAAGTCA  429
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Query_17  430   CGCCTGGGCATCCCCCTGATATTCGGCATGGACGTAGTGCATGGTTACGAAACCATTTTC  489
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Query_17  490   CCTATTCCATTAGGCCTCTCCTGTTCCTGGGATATGGAAGCCATCAGGA-AATCTGCCCG  548
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128       1016  N.......                                                      1009

Query_17  549   CGTTGCAGCCATCGAGGCCAGTGCTGATGGTATTTCC-TGGACATTCAGCCCGATGGTAG  607
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122       553   TA.A..G..G..A..A........C.....C..C.G.-........T..T........T.  495
128       905                                                    ...A...A.T.  895

Query_17  608   ACATCAGCCGTGATCCGCGCTGGGGACGCGTCA--GCGAGGGTAACGGCGAAGACCCATT  665
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126       1192  ..T...NNAN....N.CNCN....NNN.....N--NNC......................  1135
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Query_17  666   CTTGGG-TGGAGCCAT-CGCTAAAGCAATGGTATCGGGTTATCAGGGTATCGA-CCTCAA  722
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Query_17  723   CAACCAAC-TGAAGCGCAAC-GA-TGAAATTATGGC-ATG-TGT---A---GCT-C-ACT  769
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Query_17  770   TCG-C-ACTGT-AT-GGTGCCGGAG-AAGCCGGA--CGTGATT-ACAATACCGTA-GATA  820
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Query_17  821   T-GAGTCGTAACCGT-ATGTTCAACGAATACATGTATCCCT-ACCAAGCT-GCC-GTAGA  875
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Query_17  876   TGCAGGTGTAGGCAGCGTAATGGCGTC-TTTCAACGAAATAGACGGCATACCAGCCACGG  934
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Query_17  935   -CCAATAAATGGC-TGATGACCGACGTACTGCGCAAGCAA-TGGGGCTTCGACGGCTTTG  991
21        283   -............-..........................-...................  339
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Query_17  992   TGGTGACAGACTTTACCGGTATCTCCGAAA-T-GATAGCGCACGGCATCGGTGAC-TTGC  1048
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Query_17  1049  -AGACT--GTTTCCGCACGTGCACT-CAATGCAGGCGTGGATATGGACATGGTAAGTGAA  1104
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Query_17  1105  GGCTTCACGGGTACAATCAAGAAATCCATAGACGAAGGCAAGATCAGTAT--GGAAACCC  1162
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Query_17  1163  TG--GACAAAGCCTGTCGCCGCATCCTTGAAGCCAAATACAAACTGGGATTATTCGACAA  1220
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Query_17  1221  TCCTTATAAGTACTGCGAC-CTGAAACGCCCGAAGCGTGACATCTTCACCAAGGAACATC  1279
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Query_17  1280  GCGACGCTGCTCGTAAGATTGCGGGAGAGAGCTTTGTACTCCTGAAAAA------CGACA  1333
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Query_17  1334  ------AGTCA-----GGTTCCT----------------CTGCAAACCCAACACTTCCTT  1366
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Query_17  1367  TGAAAAAAGAA-GGTACGGTGGCTGTCATCGGCCCACTGGCAAATACCCGCAGTAACATG  1425
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Query_17  1426  CCGGGTACCTGGAGTGTAGCCG-CACGCCTCAA----CGACTATCCTTCTGTGTACGAAG  1480
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Query_17  1481  GATT-GA-AAGAGATGA----TGAAAGGCAA-GGTAAACATCACTTA-TGCC-AAAGGTA  1531
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Query_17  1532  GTAACCTCATCAGTGATGCAGCCTACGAAGAA-CGTGCCACA-ATGTTCGGCCGTTCA-T  1588
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Query_17  1589  TAAATCGTGATAAT------CGTACAGA-CAAAGAGATGCTGGATG-A-GGCGCTGAAA-  1638
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Query_17  1639  GTG-GCCGCTAATGCAGATGTA-ATAAT-A-GCCGCATTGGGAGAATCATCTGAAATG-A  1693
21        987   ...-.N...............--.N...-.-............N..............-.  1040
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123       167   ...-..................-.....-.-...........................-.  113
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2         327   A.T-..N..CGGN..C.....T-..CN.-.-C.T..CC..........T.........-.  381
1         989   A.T-..A..CGNC..C.....T-..CGN-.--.T..C.G.........T.......N.A.  1043
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4         741   ..T-..TCA.GG...C.....T-G.TG.-T-..G.....A..T.....T.........-.  795

Query_17  1694  GTGGTGAA---A-GTTCAAGCCG-CA-CTAAC-CT-GGCTCTTCCCGAT-GTACAGCGCA  1744
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4         796   ........TCG.-..---..T..-A.-.AG.T-T.-.AA.A....T...-..T..-AAA.  845

Query_17  1745  CTCTATTGGAAGCTTTGCTGAAAACTGGAAAGCCTGTTGTACTGACGC-T-CTTTACAGG  1802
21        1091  N.....--.G.N................N......N.--NN.......-.-.-..NN...  1143
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Query_17  1803  -T--CGCCCACT-AACGTTGACTTGGGAACAGGAGCATGT-GCCCGCCATCCTGAA-TGT  1856
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8         777   -.--..T..G..-GGAT..ATGC.....GTCT........-T..G..T........-C..  724

Query_17  1857  ATGGTTCGGTGGAAGTGAGGCAGCATACGCCATTGGCGATGTATTGTTCGGCGATGTAAA  1916
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8         723   G.....T.CC..C.....A..G.GTG.T.......C......GA....T..A..A...TC  664

Query_17  1917  TCCCAGCGGCAAACTAACGATGACATTCCCCAAAAACGTAGGCCAAATACCTTTGTTTTA  1976
25        616   ............................................................  675
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4         1017  ...                                                           1019
8         663   ...                                                           661

Query_17  1977  CAATCATAAAAATACCGGTCGTCCTTTACTTG-AAGGCAAATGGTTCGAAAA-ATTCCGT  2034
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33        625   T..C.....G.....T...........G.C.C-....GGCC......C.G..-G......  682

Query_17  2035  AGTAATTACCTGGATGTAGACAACGATCCATTGTATCCATTCGGCTATGGTTTGTCGTAT  2094
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Query_17  2095  ACCAACTTT-C-AATACAGCGACATAACTCTG-----AGCG-CCCCGACTATGGG-ACAG  2145
25        795   .........-.-....................-----....-.............-....  845
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33        743   .-.T.....-.TCT..T..T..T..T..AT..GATAA.T..T..AT..A...-----..-  794

Query_17  2146  GATGGTTCTGTTACTGCTATGGTCACGGT-AA-CCAATACCGGTAAGTACGATGGTGCAG  2203
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33        795   -....AGAGA...TG..A.CT..A.....-..C.......A........T..C...T.G.  852

Query_17  2204  AAGTAGTGCAAC-TTTATATCCGTGAC-CTTGTAGGAAGCATCA-CCCGTCCGGTAAAAG  2260
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6         911                                              .-.T........G....  926
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Query_17  2261  AA-CTGAAAGGGTTTGATAAAATTTTCCT-CAAAGCGGG-TGAAAGTAAGACTGTATCTT  2317
25        963   ..-.CTG.NN.......AT..........N.........NN....N..............  1021
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2         952   .G-T.....T..-..C.....T.....T.-.                               979
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13        915   ..-......                                                     922

Query_17  2318  TCAAAATCAC-TCCGGAATTACTGCGCTT-CTACGACTATGAACTCAACTACGTAGCC-G  2374
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8         206                                                              .  206

Query_17  2375  AACCGGGAGACTTCG-ACATAATGATCGGGGGGAACAGCC--AAAGTGTAAAAA-CG-AC  2429
25        1081  .N......N......A.NT...........----.N..T.--..--N.......-..A..  1131
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8         205   ..........G..T.-.AG.G...G.G..TCC.G......GG..T...C.GC.CG..-..  148

Query_17  2430  TCATCTGAGTTTG--TAACATTGGAAGTGGATAACGG-ATCCGAATTCGAGCTCCGTCGA  2486
25        1132  ........-NN..--........C..N..A..C....A....N.....              1176
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Query_17  2487  -CAAGC-TTGCGGCCG-CACT-CGAGcaccaccaccaccacca-cT-G-AGA-T-CCGGC  2537
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Query_17  2538  TGCTAACAAAG-CCC--G--AAAGGAAGC-TGAGTTGGC-TG-CTGCCACCGCTGAGCAA  2589
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Query_17  2590  TAAC-TAG-CA-TAAC-C-CCTT-GGGGCCTCTAAACGGGTCTT--GAGG-GG--TTTTT  2638
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Query_17  2639  TGCTGAAA  2646
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Lambda      K        H
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Gapped
Lambda      K        H
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Effective search space used: 402146368


Query= APC115045.150

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Query_18  200   -CC-AAGTCTCCGCAGGAC---ATGGATCGCTTCATCGATGCATTGATGAAGAAGATGAC  254
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9         154   -..                                                           155
98        163   C..-....A..                                                   172
93        161   -..                                                           162
86        151   -..                                                           152
89        152   -..                                                           153
84        148   -..                                                           149
70        151   -..-C..A..                                                    158
90        148   -..                                                           149
112       155   -..                                                           156
102       159   -..-.                                                         161
95        160   -..                                                           161
94        162   -..                                                           163
82        149   -..                                                           150
59        143   -..-C..A..                                                    150
111       151   -..-..                                                        154
100       150   C..-....A..                                                   159
80        151   -..                                                           152
97        161   -..                                                           162
104       162   -..-.                                                         164
72        150   -..-C..A..                                                    157
74        145   -..-C..A..                                                    152
76        149   -..                                                           150
61        137   -..-C..A..                                                    144
78        147   -..                                                           148
99        143   C..-....A..                                                   152
91        144   -..                                                           145
114       167   -..-C..A..                                                    174
87        800   -..                                                           799
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Query_18  255   TGTAGAGGAAAAG--ATCGGTCAGCTGAACCTACCCGTTTCCGGCGAGATCGTCACCGGG  312
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122       848   CT.G..A..G...--..T........T..T..T...AGC..G..A..T..AAC......A  791

Query_18  313   CAGGCACAAAACAGCGATGTGGCAAAAAA-GATT-GAACAAGGGCTCGTGGGCGGACTCC  370
17        261   .............................-....-.........................  318
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Query_18  371   T-CAACCTGAAAGGGGTGGAGAAGATACGCGATGTACAAAAACTGGCCATAGAGAAGTCA  429
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122       732   .T...TA.A.....A..T..........AG..A......CGTA.T..TG.....G..AGT  673

Query_18  430   CGCCTGGGCATCCCCCTGATATTCGGCATGGACGTAGTGCATGGTTACGAAACCATTTTC  489
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Query_18  490   CCTATTCCATTAGGCCTCTCCTGTTCCTGGGATATGGAAGCCATCAGGA-AATCTGCCCG  548
131       1010  ...N.N.-.....-...N........N...-.....AG...........-..........  955
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128       1016  N.......                                                      1009

Query_18  549   CGTTGCAGCCATCGAGGCCAGTGCTGATGGTATTTCC-TGGACATTCAGCCCGATGGTAG  607
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Query_18  608   ACATCAGCCGTGATCCGCGCTGGGGACGCGTCA--GCGAGGGTAACGGCGAAGACCCATT  665
21        12                                                              ..  13
126       1192  ..T...NNAN....N.CNCN....NNN.....N--NNC......................  1135
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Query_18  666   CTTGGG-TGGAGCCAT-CGCTAAAGCAATGGTATCGGGTTATCAGGGTATCGA-CCTCAA  722
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Query_18  723   CAACCAAC-TGAAGCGCAAC-GA-TGAAATTATGGC-ATG-TGTAAAGGC--T---TTCG  772
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17        671   ........-...........-..-............-...-.......CA--C---....  720
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1         43    AG.....T-..C.C......-..-......C.....-T..-C.....A..--.---..T.  92
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121       1044                   ..T-..-............-T..-C..G...CA--C---N.-.  1012

Query_18  773   C-ACTGT-AT-GGTGCCGGAG-AAGCCGGA--CGTGATT-ACAATACCGTA-GATAT-GA  823
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16        99          .-.C-.....A.CC.-...GA...--.......-.T...T..              134
136       754               ....A.CC.-...GA...--.......-.T...T..              723

Query_18  824   GTCGTAACCGT-ATGTTCAACGAATACATGTATCCCT-ACCAAGCT-GCC-GTAGATGCA  879
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Query_18  880   GGTGTAGGCAGCGTAATGGCGTC-TTTCAACGAAATAGACGGCATACCAGCCACGG-CCA  937
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Query_18  938   ATAAATGGC-TGATGACCGACGTACTGCGCAAGCAA-TGGGGCTTCGACGGCTTTGTGGT  995
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Query_18  996   GACAGACTTTACCGGTATCTCCGAAA-T-GATAGCGCACGGCATCGGTGAC-TTGC-AGA  1051
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Query_18  1052  CT--GTTTCCGCACGTGCACT-CAATGCAGGCGTGGATATGGACATGGTAAGTGAAGGCT  1108
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Query_18  1109  TCACGGGTACAATCAAGAAATCCATAGACGAAGGCAAGATCAGTAT--GGAAACCCTG--  1164
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Query_18  1165  GACAAAGCCTGTCGCCGCATCCTTGAAGCCAAATACAAACTGGGATTATTCGACAATCCT  1224
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Query_18  1225  TATAAGTACTGCGAC-CTGAAACGCCCGAAGCGTGACATCTTCACCAAGGAACATCGCGA  1283
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Query_18  1284  CGCTGCTCGTAAGATTGCGGGAGAGAGCTTTGTACTCCTGAAAAA------CGACA----  1333
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Query_18  1334  --AGTCA-----GGTTCCT----------------CTGCAAACCCAACACTTCCTTTGAA  1370
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Query_18  1371  AAAAGAA-GGTACGGTGGCTGTCATCGGCCCACTGGCAAATACCCGCAGTAACATGCCGG  1429
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Query_18  1430  GTACCTGGAGTGTAGCCG-CACGCCTCAA----CGACTATCCTTCTGTGTACGAAGGATT  1484
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Query_18  1485  -GA-AAGAGATGA----TGAAAGGCAA-GGTAAACATCACTTA-TGCC-AAAGGTAGTAA  1535
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Query_18  1536  CCTCATCAGTGATGCAGCCTACGAAGAA-CGTGCCACA-ATGTTCGGCCGTTCA-TTAAA  1592
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Query_18  1593  TCGTGATAAT------CGTACAGA-CAAAGAGATGCTGGATG-A-GGCGCTGAAA-GTG-  1641
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Query_18  1642  GCCGCTAATGCAGATGTA-ATAAT-A-GCCGCATTGGGAGAATCATCTGAAATG-AGTGG  1697
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Query_18  1698  TGAA---A-GTTCAAGCCG-CA-CTAAC-CT-GGCTCTTCCCGAT-GTACAGCGCACTCT  1748
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Query_18  1749  ATTGGAAGCTTTGCTGAAAACTGGAAAGCCTGTTGTACTGACGC-T-CTTTACAGG-T--  1803
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Query_18  1804  CGCCCACT-AACGTTGACTTGGGAACAGGAGCATGT-GCCCGCCATCCTGAA-TGTATGG  1860
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Query_18  1861  TTCGGTGGAAGTGAGGCAGCATACGCCATTGGCGATGTATTGTTCGGCGATGTAAATCCC  1920
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Query_18  1921  AGCGGCAAACTAACGATGACATTCCCCAAAAACGTAGGCCAAATACCTTTGTTTTACAAT  1980
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Query_18  1981  CATAAAAATACCGGTCGTCCTTTACTTG-AAGGCAAATGGTTCGAAAA-ATTCCGTAGTA  2038
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Query_18  2039  ATTACCTGGATGTAGACAACGATCCATTGTATCCATTCGGCTATGGTTTGTCGTATACCA  2098
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Query_18  2099  ACTTT-C-AATACAGCGACATAACTCTG-----AGCG-CCCCGACTATGGG-ACAGGATG  2149
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Query_18  2150  GTTCTGTTACTGCTATGGTCACGGT-AA-CCAATACCGGTAAGTACGATGGTGCAGAAGT  2207
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Query_18  2208  AGTGCAAC-TTTATATCCGTGAC-CTTGTAGGAAGCATCA-CCCGTCCGGTAAAAGAA-C  2263
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Query_18  2264  TGAAAGGGTTTGATAAAATTTTCCT-CAAAGCGGG-TGAAAGTAAGACTGTATCTTTCAA  2321
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Query_18  2322  AATCAC-TCCGGAATTACTGCGCTT-CTACGACTATGAACTCAACTACGTAGCC-GAACC  2378
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Query_18  2379  GGGAGACTTCG-ACATAATGATCGGGGGGAACAGCC--AAAGTGTAAAAA-CG-ACTCAT  2433
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Query_18  2434  CTGAGTTTG--TAACATTGGAAGTGGATAACGG-ATCCGAATTCGAGCTCCGTCGA-CAA  2489
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Query_18  2490  GC-TTGCGGCCG-CACT-CGAGcaccaccaccaccacca-cT-G-AGA-T-CCGGCTGCT  2541
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Query_18  2542  AACAAAG-CCC--G--AAAGGAAGC-TGAGTTGGC-TG-CTGCCACCGCTGAGCAATAAC  2593
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Query_18  2594  -TAG-CA-TAAC-C-CCTT-GGGGCCTCTAAACGGGTCTT--GAGG-GG--TTTTTTGCT  2642
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Query_18  2643  GAAA  2646
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Lambda      K        H
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Gapped
Lambda      K        H
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Effective search space used: 402146368


Query= APC115045.151

Length=2646
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Query_19  200   -CC-AAGTCTCCGCAGGAC---ATGGATCGCTTCATCGATGCATTGATGAAGAAGATGAC  254
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Query_19  371   T-CAACCTGAAAGGGGTGGAGAAGATACGCGATGTACAAAAACTGGCCATAGAGAAGTCA  429
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Query_19  490   CCTATTCCATTAGGCCTCTCCTGTTCCTGGGATATGGAAGCCATCAGGA-AATCTGCCCG  548
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Query_19  549   CGTTGCAGCCATCGAGGCCAGTGCTGATGGTATTTCC-TGGACATTCAGCCCGATGGTAG  607
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Query_19  608   ACATCAGCCGTGATCCGCGCTGGGGACGCGTCA--GCGAGGGTAACGGCGAAGACCCATT  665
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Query_19  666   CTTGGG-TGGAGCCAT-CGCTAAAGCAATGGTATCGGGTTATCAGGGTATCGA-CCTCAA  722
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Query_19  723   CAACCAAC-TGAAGCGCAAC-GA-TGAAATTATGGC-ATG-TGTAAA-GC-ACTTCG-C-  773
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Query_19  774   ACTGT-AT-GGTGCCGGAG-AAGCCGGA--CGTGATT-ACAATACCGTA-GATAT-GAGT  825
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118       729       .-.C-.....A.CC.-...GA...--.......-.T...T..                694
16        99        .-.C-.....A.CC.-...GA...--.......-.T...T..                134
136       754             ....A.CC.-...GA...--.......-.T...T..                723

Query_19  826   CGTAACCGT-ATGTTCAACGAATACATGTATCCCT-ACCAAGCT-GCC-GTAGATGCAGG  881
21        174   .........-............N............-........-...-...........  229
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120       981   .........-.........................T........-...-...........  925
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134       976   .........-.......-...-.............-....-...-..--...........  925
19        177   .........-.........................-........-...-...........  232
17        774   .........-.........................-........-...-...........  829
123       981   .........N.....NG.........N........-..-.....N...N...........  924
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29        773   .........-.........................-........-...-...........  828
117       21    ..C..                                                         17
1         146   ..C.....G-........T....T......C..G.-.TG.G...-...-.....G..C..  201
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121       958   .A.C.A...-..............T....TA..T.-.T..G...-...-..G..A.A...  903

Query_19  882   TGTAGGCAGCGTAATGGCGTC-TTTCAACGAAATAGACGGCATACCAGCCACGG-CCAAT  939
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137       230   .....................-................................-.....  173
29        829   .....................-.............N...........N......C...T.  887
1         202   A..G..T..T..G........-A.....T...........T..T..C.....C.-GA..C  259
122       223   ..CC.....T..C...T.T..-.........GG.C..T..A..T..T..A..A.-....C  166
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4         30                                       ..T..A..T..T..A..A.-....C  53

Query_19  940   AAATGGC-TGATGACCGACGTACTGCGCAAGCAA-TGGGGCTTCGACGGCTTTGTGGTGA  997
21        288   .......-..........................-.........................  345
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1         260   .......-..C...G...TT.G.....TGGC..G-...........A..G........A.  317
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12        696    ...T..-...........                                           680
4         54    ......T-....A..T..T..C.....T..A..G-.AT..A...NGT..T.....C..T.  111
3         693    ...T..-...........                                           677
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5         693    ...T..-...........                                           677

Query_19  998   CAGACTTTACCGGTATCTCCGAAA-T-GATAGCGCACGGCATCGGTGAC-TTGC-AGACT  1053
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137       114   ......GG................-.-......................-....-.....  59
1         318   .G.....C..A..C..T..A..G.-.-.....A...T..TG....C...-....-.A..C  373
122       107   .G....A..........ATG....-.-.G..AAT..T..T..T..A..T-A...G...-A  52
121       786   .G....A..........A.T....-.-..CC.AT..T..T..G.....T-ACA.-.A..A  731
4         112   .G....A..........ATG....-.-.G..AAT..T..T..T..A..T-A...G...A-  167

Query_19  1054  --GTTTCCGCACGTGCACT-CAATGCAGGCGTGGATATGGACATGGTAAGTGAAGGCTTC  1110
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17        1007  TGT.......N........N.......T..                                1036
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1         374   --..CAGT....TC..T..-T........G.....C.....T...........G......  430
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Query_19  1111  ACGGGTACAATCAAGAAATCCATAGACGAAGGCAAGATCAGTAT--GGAAACCCTG--GA  1166
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1         431   GTC......C.G.T......A..TA.A.....A..AG.A..A..--..GC..GT..--A.  486
121       673   ..AA.C...C.T..A.....TC.G..A.....A..----...T.CA.T...GG...TT..  618
4         225   CTTTC....C.TC.AC....AT.GA.G..G..T.....A.CAGA--.A..GAGA.A--..  280

Query_19  1167  CAAAGCCTGTCGCCGCATCCTTGAAGCCAAATACAAACTGGGATTATTCGACAATCCTTA  1226
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Query_19  1227  TAAGTACTGCGAC-CTGAAACGCCCGAAGCGTGACATCTTCACCAAGGAACATCGCGACG  1285
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Query_19  1286  CTGCTCGTAAGATTGCGGGAGAGAGCTTTGTACTCCTGAAAAA------CGACA------  1333
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4         400   T...A..CCG...CT.T.CT..A........T..TT.A..G..------T..T.------  447

Query_19  1334  AGTCA-----GGTTCCT----------------CTGCAAACCCAACACTTCCTTTGAAAA  1372
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2         48                                                   .....G.....G.  60
1         666   ..C..CTCGCA.C..A.AGCTCGTCACCCGTAA....TTC...CGTG.....G.....G.  725
121       450   .--T.-----.-----------------------..---------T...C...C..GC..  430
4         448   .A-..-----.---------------------------------.....G...A.A..G.  468

Query_19  1373  AAGAA-GGTACGGTGGCTGTCATCGGCCCACTGGCAAATACCCGCAGTAACATGCCGGGT  1431
21        721   .....-......................................................  779
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4         469   ..A..-....A.A.T.....AG.T..G..GT....G.....GA.TTC...T.....C..A  527

Query_19  1432  ACCTGGAGTGTAGCCG-CACGCCTCAA----CGACTATCCTTCTGTGTACGAAGGATT-G  1485
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123       374   ................-..........----...........................-.  321
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2         120   ........C...N..N-.........N----...T.........T.A...N....C..-.  173
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Query_19  1486  A-AAGAGATGA----TGAAAGGCAA-GGTAAACATCACTTA-TGCC-AAAGGTAGTAACC  1537
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4         582   .-....AG..GCAGG...T.---..-.T.G..-..TGTG..-...T-..G.....CC.T.  633

Query_19  1538  TCATCAGTGATGCAGCCTACGAAGAA-CGTGCCACA-ATGTTCGGCCGTTCA-TTAAATC  1594
21        886   ..........................-.........-...............-.......  942
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1         892   .....G.C.......NT......-N.-........C-........-N.....-..G..C.  946
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4         634   .G..G........G..T..T..G...-.....A...-C.C..T..A...A..-...T.C.  690

Query_19  1595  GTGATAAT------CGTACAGA-CAAAGAGATGCTGGATG-A-GGCGCTGAAA-GTG-GC  1643
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2         283   .C......------..C..G..-.C.NN..T.A.....C.-.-A..A......-A.T-..  331
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Query_19  1644  CGCTAATGCAGATGTA-ATAAT-A-GCCGCATTGGGAGAATCATCTGAAATG-AGTGGTG  1699
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Query_19  1700  AA---A-GTTCAAGCCG-CA-CTAAC-CT-GGCTCTTCCCGAT-GTACAGCGCACTCTAT  1750
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Query_19  1751  TGGAAGCTTTGCTGAAAACTGGAAAGCCTGTTGTACTGACGC-T-CTTTACAGG-T--CG  1805
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Query_19  1806  CCCACT-AACGTTGACTTGGGAACAGGAGCATGT-GCCCGCCATCCTGAA-TGTATGGTT  1862
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Query_19  1863  CGGTGGAAGTGAGGCAGCATACGCCATTGGCGATGTATTGTTCGGCGATGTAAATCCCAG  1922
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Query_19  1923  CGGCAAACTAACGATGACATTCCCCAAAAACGTAGGCCAAATACCTTTGTTTTACAATCA  1982
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Query_19  1983  TAAAAATACCGGTCGTCCTTTACTTG-AAGGCAAATGGTTCGAAAAAGCTCG-TAGTAAT  2040
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33        631   ...G.....T...........G.C.C-....GGCC......C.G..GTTC..-...C...  688

Query_19  2041  TACCTGGATGTAGACAACGATCCATTGTATCCATTCGGCTATGGTTTGTCGTATACCAAC  2100
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Query_19  2101  TTT-C-AATACAGCGACATAACTCTG-----AGCG-CCCCGACTATGGG-ACAGGATGGT  2151
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Query_19  2152  TCTGTTACTGCTATGGTCACGGT-AA-CCAATACCGGTAAGTACGATGGTGCAGAAGTAG  2209
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Query_19  2210  TGCAAC-TTTATATCCGTGAC-CTTGTAGGAAGCATCA-CCCGTCCGGTAAAAGAA-CTG  2265
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Query_19  2266  AAAGGGTTTGATAAAATTTTCCT-CAAAGCGGG-TGAAAGTAAGACTGTATCTTTCAAAA  2323
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Query_19  2324  TCAC-TCCGGAATTACTGCGCTT-CTACGACTATGAACTCAACTACGTAGCC-GAACCGG  2380
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Query_19  2381  GAGACTTCG-ACATAATGATCGGGGGGAACAGCC--AAAGTGTAAAAA-CG-ACTCATCT  2435
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Query_19  2436  GAGTTTG--TAACATTGGAAGTGGATAACGG-ATCCGAATTCGAGCTCCGTCGA-CAAGC  2491
25        1138  ..-NN..--........C..N..A..C....A....N.....                    1176
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Query_19  2492  -TTGCGGCCG-CACT-CGAGcaccaccaccaccacca-cT-G-AGA-T-CCGGCTGCTAA  2543
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Query_19  2544  CAAAG-CCC--G--AAAGGAAGC-TGAGTTGGC-TG-CTGCCACCGCTGAGCAATAAC-T  2594
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Query_19  2645  AA  2646
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Query= APC115045.152

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Query_20  150   TCAT-CC--G-CAGTTCG-AAAA-GGGTA-CCGAGAA-CCTGTACTT-CCAAT-CCAATG  199
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Query_20  200   -CC-AAGTCTCCGCAGGAC---ATGGATCGCTTCATCGATGCATTGATGAAGAAGATGAC  254
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Query_20  371   T-CAACCTGAAAGGGGTGGAGAAGATACGCGATGTACAAAAACTGGCCATAGAGAAGTCA  429
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Query_20  430   CGCCTGGGCATCCCCCTGATATTCGGCATGGACGTAGTGCATGGTTACGAAACCATTTTC  489
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Query_20  490   CCTATTCCATTAGGCCTCTCCTGTTCCTGGGATATGGAAGCCATCAGGA-AATCTGCCCG  548
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Query_20  549   CGTTGCAGCCATCGAGGCCAGTGCTGATGGTATTTCC-TGGACATTCAGCCCGATGGTAG  607
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Query_20  608   ACATCAGCCGTGATCCGCGCTGGGGACGCGTCA--GCGAGGGTAACGGCGAAGACCCATT  665
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Query_20  666   CTTGGG-TGGAGCCAT-CGCTAAAGCAATGGTATCGGGTTATCAGGGTATCGA-CCTCAA  722
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Query_20  723   CAACCAAC-TGAAGCGCAAC-GA-TGAAATTATGGC-ATG-TGTAAA-GC-ACTTCG-C-  773
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Query_20  774   ACTGT-AT-GGTGCCGGAG-AAGCCGGA--CGTGATT-ACAATACCGTA-GATAT-GAGT  825
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117       73    .T...-..-..A.......-........--..C..C.-.T.....A...-.....-...C  22
1         94    .T...-..-..A.......-........--..C..C.-.T.....A...-.....-...C  145
122       331   CT...-..-..G..A.C..-.......T--TTG..C.-.T.....AACT-..C..-...C  280
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130       725       .-.C-.....A.CC.-...GA...--.......-.T...T..                690
128       734       .-.C-.....A.CC.-...GA...--.......-.T...T..                699
118       729       .-.C-.....A.CC.-...GA...--.......-.T...T..                694
16        99        .-.C-.....A.CC.-...GA...--.......-.T...T..                134
136       754             ....A.CC.-...GA...--.......-.T...T..                723

Query_20  826   CGTAACCGT-ATGTTCAACGAATACATGTATCCCT-ACCAAGCT-GCC-GTAGATGCAGG  881
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Query_20  882   TGTAGGCAGCGTAATGGCGTC-TTTCAACGAAATAGACGGCATACCAGCCACGG-CCAAT  939
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Query_20  940   AAATGGC-TGATGACCGACGTACTGCGCAAGCAA-TGGGGCTTCGACGGCTTTGTGGTGA  997
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4         54    ......T-....A..T..T..C.....T..A..G-.AT..A...NGT..T.....C..T.  111

Query_20  998   CAGACTTTACCGGTATCTCCGAAA-T-GATAGCGCACGGCATCGGTGAC-TTGC-AGACT  1053
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4         112   .G....A..........ATG....-.-.G..AAT..T..T..T..A..T-A...G...A-  167

Query_20  1054  --GTTTCCGCACGTGCACT-CAATGCAGGCGTGGATATGGACATGGTAAGTGAAGGCTTC  1110
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17        1007  TGT.......N........N.......T..                                1036
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Query_20  1111  ACGGGTACAATCAAGAAATCCATAGACGAAGGCAAGATCAGTAT--GGAAACCCTG--GA  1166
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Query_20  1167  CAAAGCCTGTCGCCGCATCCTTGAAGCCAAATACAAACTGGGATTATTCGACAATCCTTA  1226
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Query_20  1227  TAAGTACTGCGAC-CTGAAACGCCCGAAGCGTGACATCTTCACCAAGGAACATCGCGACG  1285
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Query_20  1286  CTGCTCGTAAGATTGCGGGAGAGAGCTTTGTACTCCTGAAAAA------CGACA------  1333
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Query_20  1334  AGTCA-----GGTTCCT----------------CTGCAAACCCAACACTTCCTTTGAAAA  1372
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Query_20  1373  AAGAA-GGTACGGTGGCTGTCATCGGCCCACTGGCAAATACCCGCAGTAACATGCCGGGT  1431
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Query_20  1432  ACCTTTAGTGTAGCCG-CACGCCTCAA----CGACTATCCTTCTGTGTACGAAGGATT-G  1485
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Query_20  1486  A-AAGAGATGA----TGAAAGGCAA-GGTAAACATCACTTA-TGCC-AAAGGTAGTAACC  1537
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Query_20  1538  TCATCAGTGATGCAGCCTACGAAGAA-CGTGCCACA-ATGTTCGGCCGTTCA-TTAAATC  1594
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Query_20  1595  GTGATAAT------CGTACAGA-CAAAGAGATGCTGGATG-A-GGCGCTGAAA-GTG-GC  1643
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Query_20  1644  CGCTAATGCAGATGTA-ATAAT-A-GCCGCATTGGGAGAATCATCTGAAATG-AGTGGTG  1699
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Query_20  1700  AA---A-GTTCAAGCCG-CA-CTAAC-CT-GGCTCTTCCCGAT-GTACAGCGCACTCTAT  1750
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Query_20  1751  TGGAAGCTTTGCTGAAAACTGGAAAGCCTGTTGTACTGACGC-T-CTTTACAGG-T--CG  1805
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Query_20  1806  CCCACT-AACGTTGACTTGGGAACAGGAGCATGT-GCCCGCCATCCTGAA-TGTATGGTT  1862
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Query_20  1863  CGGTGGAAGTGAGGCAGCATACGCCATTGGCGATGTATTGTTCGGCGATGTAAATCCCAG  1922
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Query_20  1923  CGGCAAACTAACGATGACATTCCCCAAAAACGTAGGCCAAATACCTTTGTTTTACAATCA  1982
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Query_20  1983  TAAAAATACCGGTCGTCCTTTACTTG-AAGGCAAATGGTTCGAAAA-ATTCCGTAGTAAT  2040
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Query_20  2041  TACCTGGATGTAGACAACGATCCATTGTATCCATTCGGCTATGGTTTGTCGTATACCAAC  2100
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Query_20  2101  TTT-C-AATACAGCGACATAACTCTG-----AGCG-CCCCGACTATGGG-ACAGGATGGT  2151
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Query_20  2152  TCTGTTACTGCTATGGTCACGGT-AA-CCAATACCGGTAAGTACGATGGTGCAGAAGTAG  2209
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Query_20  2210  TGCAAC-TTTATATCCGTGAC-CTTGTAGGAAGCATCA-CCCGTCCGGTAAAAGAA-CTG  2265
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Query_20  2266  AAAGGGTTTGATAAAATTTTCCT-CAAAGCGGG-TGAAAGTAAGACTGTATCTTTCAAAA  2323
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Query_20  2324  TCAC-TCCGGAATTACTGCGCTT-CTACGACTATGAACTCAACTACGTAGCC-GAACCGG  2380
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Query_20  2381  GAGACTTCG-ACATAATGATCGGGGGGAACAGCC--AAAGTGTAAAAA-CG-ACTCATCT  2435
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Query_20  2544  CAAAG-CCC--G--AAAGGAAGC-TGAGTTGGC-TG-CTGCCACCGCTGAGCAATAAC-T  2594
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Query= APC115045.153

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Query_21  200   -CC-AAGTCTCCGCAGGAC---ATGGATCGCTTCATCGATGCATTGATGAAGAAGATGAC  254
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98        163   C..-....A..                                                   172
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Query_21  255   TGTAGAGGAAAAG--ATCGGTCAGCTGAACCTACCCGTTTCCGGCGAGATCGTCACCGGG  312
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Query_21  313   CAGGCACAAAACAGCGATGTGGCAAAAAA-GATT-GAACAAGGGCTCGTGGGCGGACTCC  370
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Query_21  371   T-CAACCTGAAAGGGGTGGAGAAGATACGCGATGTACAAAAACTGGCCATAGAGAAGTCA  429
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Query_21  430   CGCCTGGGCATCCCCCTGATATTCGGCATGGACGTAGTGCATGGTTACGAAACCATTTTC  489
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Query_21  490   CCTATTCCATTAGGCCTCTCCTGTTCCTGGGATATGGAAGCCATCAGGA-AATCTGCCCG  548
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128       1016  N.......                                                      1009

Query_21  549   CGTTGCAGCCATCGAGGCCAGTGCTGATGGTATTTCC-TGGACATTCAGCCCGATGGTAG  607
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Query_21  608   ACATCAGCCGTGATCCGCGCTGGGGACGCGTCA--GCGAGGGTAACGGCGAAGACCCATT  665
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Query_21  666   CTTGGG-TGGAGCCAT-CGCTAAAGCAATGGTATCGGGTTATCAGGGTATCGA-CCTCAA  722
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Query_21  723   CAACCAAC-TGAAGCGCAAC-GA-TGAAATTATGGC-ATG-TGTAAA-GC-ACTTCG-C-  773
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121       1044                   ..T-..-............-T..-C..G..-..-..N.-.-.-  1011

Query_21  774   ACTGT-AT-GGTGCCGGAG-AAGCCGGA--CGTGATT-ACAATACCGTA-GATAT-GAGT  825
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16        99        .-.C-.....A.CC.-...GA...--.......-.T...T..                134
136       754             ....A.CC.-...GA...--.......-.T...T..                723

Query_21  826   CGTAACCGT-ATGTTCAACGAATACATGTATCCCT-ACCAAGCT-GCC-GTAGATGCAGG  881
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Query_21  882   TGTAGGCAGCGTAATGGCGTC-TTTCAACGAAATAGACGGCATACCAGCCACGG-CCAAT  939
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Query_21  940   AAATGGC-TGATGACCGACGTACTGCGCAAGCAA-TGGGGCTTCGACGGCTTTGTGGTGA  997
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4         54    ......T-....A..T..T..C.....T..A..G-.AT..A...NGT..T.....C..T.  111

Query_21  998   CAGACTTTACCGGTATCTCCGAAA-T-GATAGCGCACGGCATCGGTGAC-TTGC-AGACT  1053
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Query_21  1054  --GTTTCCGCACGTGCACT-CAATGCAGGCGTGGATATGGACATGGTAAGTGAAGGCTTC  1110
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Query_21  1111  ACGGGTACAATCAAGAAATCCATAGACGAAGGCAAGATCAGTAT--GGAAACCCTG--GA  1166
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Query_21  1167  CAAAGCCTGTCGCCGCATCCTTGAAGCCAAATACAAACTGGGATTATTCGACAATCCTTA  1226
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Query_21  1227  TAAGTACTGCGAC-CTGAAACGCCCGAAGCGTGACATCTTCACCAAGGAACATCGCGACG  1285
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Query_21  1286  CTGCTCGTAAGATTGCGGGAGAGAGCTTTGTACTCCTGAAAAA------CGACA------  1333
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Query_21  1334  AGTCA-----GGTTCCT----------------CTGCAAACCCAACACTTCCTTTGAAAA  1372
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Query_21  1373  AAGAA-GGTACGGTGGCTGTCATCGGCCCACTGGCAAATACCCGCAGTAACATGCCGGGT  1431
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4         469   ..A..-....A.A.T.....AG.T..G..GT....G.....GA.TTC...T.....C..A  527

Query_21  1432  ACCTGGAGTGTAGCCG-CACGCCTCAA----CGACTATCCTTCTGTGTACGAAGGATT-G  1485
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4         528   ..G...........G.T..ATATGG..GCTC.AG...CG...G..-----..G..T..-.  581

Query_21  1486  A-AAGAGATGA----TGAAAGGCAA-GGTAAACATCACTTA-TGCC-AAAGGTAGTAACC  1537
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4         582   .-....AG..GCAGG...T.---..-.T.G..-..TGTG..-...T-..G.....CC.T.  633

Query_21  1538  TCATCAGTGATGCAGCCTACGAAGAA-CGTGCCACA-ATGTTCGGCCGTTCA-TTAAATC  1594
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Query_21  1595  GTGATAAT------CGTACAGA-CAAAGAGATGCTGGATG-A-GGCGCTGAAA-GTG-GC  1643
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Query_21  1644  CGCTAATGCAGATGTA-ATAAT-A-GCCGCATTGGGAGAATCATCTGAAATG-AGTGGTC  1699
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1         994   A..CGNC..C.....T-..CGN-.--.T..C.G.........T.......N.A..CT.AN  1049
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4         746   TCA.GG...C.....T-G.TG.-T-..G.....A..T.....T.........-......G  801

Query_21  1700  A---GA-GTTCAAGCCG-CA-CTAAC-CT-GGCTCTTCCCGAT-GTACAGCGCACTCTAT  1750
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Query_21  1751  TGGAAGCTTTGCTGAAAACTGGAAAGCCTGTTGTACTGACGC-T-CTTTACAGG-T--CG  1805
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Query_21  1806  CCCACT-AACGTTGACTTGGGAACAGGAGCATGT-GCCCGCCATCCTGAA-TGTATGGTT  1862
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Query_21  1863  CGGTGGAAGTGAGGCAGCATACGCCATTGGCGATGTATTGTTCGGCGATGTAAATCCCAG  1922
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Query_21  1923  CGGCAAACTAACGATGACATTCCCCAAAAACGTAGGCCAAATACCTTTGTTTTACAATCA  1982
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Query_21  1983  TAAAAATACCGGTCGTCCTTTACTTG-AAGGCAAATGGTTCGAAAA-ATTCCGTAGTAAT  2040
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Query_21  2041  TACCTGGATGTAGACAACGATCCATTGTATCCATTCGGCTATGGTTTGTCGTATACCAAC  2100
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Query_21  2101  TTT-C-AATACAGCGACATAACTCTG-----AGCG-CCCCGACTATGGG-ACAGGATGGT  2151
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Query_21  2152  TCTGTTACTGCTATGGTCACGGT-AA-CCAATACCGGTAAGTACGATGGTGCAGAAGTAG  2209
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Query_21  2210  TGCAAC-TTTATATCCGTGAC-CTTGTAGGAAGCATCA-CCCGTCCGGTAAAAGAA-CTG  2265
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Query_21  2266  AAAGGGTTTGATAAAATTTTCCT-CAAAGCGGG-TGAAAGTAAGACTGTATCTTTCAAAA  2323
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13        920   ...                                                           922

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Query_21  2381  GAGACTTCG-ACATAATGATCGGGGGGAACAGCC--AAAGTGTAAAAA-CG-ACTCATCT  2435
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Query_21  2492  -TTGCGGCCG-CACT-CGAGcaccaccaccaccacca-cT-G-AGA-T-CCGGCTGCTAA  2543
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Query_21  2544  CAAAG-CCC--G--AAAGGAAGC-TGAGTTGGC-TG-CTGCCACCGCTGAGCAATAAC-T  2594
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30        30    .....-...--.--...                                             19
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87        17    .-...-...--A--..                                              8
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Query_22  200   -CC-AAGTCTCCGCAGGAC---ATGGATCGCTTCATCGATGCATTGATGAAGAAGATGAC  254
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83        813   -..                                                           812
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103       161   -..-.                                                         163
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9         154   -..                                                           155
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Query_22  255   TGTAGAGGAAAAG--ATCGGTCAGCTGAACCTACCCGTTTCCGGCGAGATCGTCACCGGG  312
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Query_22  313   CAGGCACAAAACAGCGATGTGGCAAAAAA-GATT-GAACAAGGGCTCGTGGGCGGACTCC  370
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Query_22  371   T-CAACCTGAAAGGGGTGGAGAAGATACGCGATGTACAAAAACTGGCCATAGAGAAGTCA  429
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122       732   .T...TA.A.....A..T..........AG..A......CGTA.T..TG.....G..AGT  673

Query_22  430   CGCCTGGGCATCCCCCTGATATTCGGCATGGACGTAGTGCATGGTTACGAAACCATTTTC  489
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Query_22  490   CCTATTCCATTAGGCCTCTCCTGTTCCTGGGATATGGAAGCCATCAGGA-AATCTGCCCG  548
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128       1016  N.......                                                      1009

Query_22  549   CGTTGCAGCCATCGAGGCCAGTGCTGATGGTATTTCC-TGGACATTCAGCCCGATGGTAG  607
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Query_22  608   ACATCAGCCGTGATCCGCGCTGGGGACGCGTCA--GCGAGGGTAACGGCGAAGACCCATT  665
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Query_22  666   CTTGGG-TGGAGCCAT-CGCTAAAGCAATGGTATCGGGTTATCAGGGTATCGA-CCTCAA  722
21        14    ......-.........-....................................-......  70
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122       436   T..A..-...T.AA..-T.....G..G.......AT..C..........AA.G-TGAT.G  380

Query_22  723   CAACCAAC-TGAAGCGCAAC-GA-TGAAATTATGGC-ATG-TGTAAA-GC-ACTTCG-C-  773
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1         43    AG.....T-..C.C......-..-......C.....-T..-C.....-AG-CT..T.-.-  93
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Query_22  774   ACTGT-AT-GGTGCCGGAG-AAGCCGGA--CGTGATT-ACAATACCGTA-GATAT-GAGT  825
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16        99        .-.C-.....A.CC.-...GA...--.......-.T...T..                134
136       754             ....A.CC.-...GA...--.......-.T...T..                723

Query_22  826   CGTAACCGT-ATGTTCAACGAATACATGTATCCCT-ACCAAGCT-GCC-GTAGATGCAGG  881
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121       958   .A.C.A...-..............T....TA..T.-.T..G...-...-..G..A.A...  903

Query_22  882   TGTAGGCAGCGTAATGGCGTC-TTTCAACGAAATAGACGGCATACCAGCCACGG-CCAAT  939
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Query_22  940   AAATGGC-TGATGACCGACGTACTGCGCAAGCAA-TGGGGCTTCGACGGCTTTGTGGTGA  997
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4         54    ......T-....A..T..T..C.....T..A..G-.AT..A...NGT..T.....C..T.  111

Query_22  998   CAGACTGGACCGGTATCTCCGAAA-T-GATAGCGCACGGCATCGGTGAC-TTGC-AGACT  1053
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4         112   .G....AT.........ATG....-.-.G..AAT..T..T..T..A..T-A...G...A-  167

Query_22  1054  --GTTTCCGCACGTGCACT-CAATGCAGGCGTGGATATGGACATGGTAAGTGAAGGCTTC  1110
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Query_22  1111  ACGGGTACAATCAAGAAATCCATAGACGAAGGCAAGATCAGTAT--GGAAACCCTG--GA  1166
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Query_22  1167  CAAAGCCTGTCGCCGCATCCTTGAAGCCAAATACAAACTGGGATTATTCGACAATCCTTA  1226
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Query_22  1227  TAAGTACTGCGAC-CTGAAACGCCCGAAGCGTGACATCTTCACCAAGGAACATCGCGACG  1285
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Query_22  1286  CTGCTCGTAAGATTGCGGGAGAGAGCTTTGTACTCCTGAAAAA------CGACA------  1333
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4         400   T...A..CCG...CT.T.CT..A........T..TT.A..G..------T..T.------  447

Query_22  1334  AGTCA-----GGTTCCT----------------CTGCAAACCCAACACTTCCTTTGAAAA  1372
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1         666   ..C..CTCGCA.C..A.AGCTCGTCACCCGTAA....TTC...CGTG.....G.....G.  725
121       450   .--T.-----.-----------------------..---------T...C...C..GC..  430
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Query_22  1373  AAGAA-GGTACGGTGGCTGTCATCGGCCCACTGGCAAATACCCGCAGTAACATGCCGGGT  1431
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4         469   ..A..-....A.A.T.....AG.T..G..GT....G.....GA.TTC...T.....C..A  527

Query_22  1432  ACCTGGAGTGTAGCCG-CACGCCTCAA----CGACTATCCTTCTGTGTACGAAGGATT-G  1485
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25        131   ....TT..........-..........----...........................-.  184
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131       73    ....TT..........-..........----.........................-.-.  21
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2         120   ........C...N..N-.........N----...T.........T.A...N....C..-.  173
1         786   ........C.......-..........----...T.........T.A........C..-.  839
33        80    ..GGCT.....G....-.TGTGA.G..----.A.A.........T..ATT.....C..-.  133
121       370   ..GGCT.....G....-.TGTGA.G..----.A.A.........T..ATT.....C..-.  317
4         528   ..G...........G.T..ATATGG..GCTC.AG...CG...G..-----..G..T..-.  581

Query_22  1486  A-AAGAGATGA----TGAAAGGCAA-GGTAAACATCACTTA-TGCC-AAAGGTAGTAACC  1537
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2         174   .-....A....----..GC......-...G........C..-....-.............  225
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4         582   .-....AG..GCAGG...T.---..-.T.G..-..TGTG..-...T-..G.....CC.T.  633

Query_22  1538  TCATCAGTGATGCAGCCTACGAAGAA-CGTGCCACA-ATGTTCGGCCGTTCA-TTAAATC  1594
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4         634   .G..G........G..T..T..G...-.....A...-C.C..T..A...A..-...T.C.  690

Query_22  1595  GTGATAAT------CGTACAGA-CAAAGAGATGCTGGATG-A-GGCGCTGAAA-GTG-GC  1643
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Query_22  1644  CGCTAATGCAGATGTA-ATAAT-A-GCCGCATTGGGAGAATCATCTGAAATG-AGTGGTG  1699
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4         746   TCA.GG...C.....T-G.TG.-T-..G.....A..T.....T.........-.......  801

Query_22  1700  AA---A-GTTCAAGCCG-CA-CTAAC-CT-GGCTCTTCCCGAT-GTACAGCGCACTCTAT  1750
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4         802   ..TCG.-..---..T..-A.-.AG.T-T.-.AA.A....T...-..T..-AAA..NT...  851

Query_22  1751  TGGAAGCTTTGCTGAAAACTGGAAAGCCTGTTGTACTGACGC-T-CTTTACAGG-T--CG  1805
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8         812                    ..C........G..G......G.TT-.-G.....C..-.--..  775

Query_22  1806  CCCACT-AACGTTGACTTGGGAACAGGAGCATGT-GCCCGCCATCCTGAA-TGTATGGTT  1862
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8         774   T..G..-GGAT..ATGC.....GTCT........-T..G..T........-C..G.....  718

Query_22  1863  CGGTGGAAGTGAGGCAGCATACGCCATTGGCGATGTATTGTTCGGCGATGTAAATCCCAG  1922
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8         717   T.CC..C.....A..G.GTG.T.......C......GA....T..A..A...TC...     661

Query_22  1923  CGGCAAACTAACGATGACATTCCCCAAAAACGTAGGCCAAATACCTTTGTTTTACAATCA  1982
25        622   ............................................................  681
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Query_22  1983  TAAAAATACCGGTCGTCCTTTACTTG-AAGGCAAATGGTTCGAAAA-ATTCCGTAGTAAT  2040
25        682   ..........................A...................-.............  740
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33        631   ...G.....T...........G.C.C-....GGCC......C.G..-G........C...  688

Query_22  2041  TACCTGGATGTAGACAACGATCCATTGTATCCATTCGGCTATGGTTTGTCGTATACCAAC  2100
25        741   ............................................................  800
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33        689   ..T...........T.....A..GC.T.....G..T..A.....C...AGC....-.T..  747

Query_22  2101  TTT-C-AATACAGCGACATAACTCTG-----AGCG-CCCCGACTATGGG-ACAGGATGGT  2151
25        801   ...-.-....................-----....-.............-..........  851
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33        748   ...-.TCT..T..T..T..T..AT..GATAA.T..T..AT..A...-----..--....A  799

Query_22  2152  TCTGTTACTGCTATGGTCACGGT-AA-CCAATACCGGTAAGTACGATGGTGCAGAAGTAG  2209
25        852   .......................-..-.................................  909
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33        800   GAGA...TG..A.CT..A.....-..C.......A........T..C...T.G.......  858

Query_22  2210  TGCAAC-TTTATATCCGTGAC-CTTGTAGGAAGCATCA-CCCGTCCGGTAAAAGAA-CTG  2265
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115       368   .T....-.C........C...-..C........T....-....C..T...CGC..G-T..  313
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33        859   ....G.-.A........C...T...A....C..TG.A.-.A........G......N...  916
6         911                                        .-.T........G......-...  931
13        899                                        .-.T.....N..G......-...  919

Query_22  2266  AAAGGGTTTGATAAAATTTTCCT-CAAAGCGGG-TGAAAGTAAGACTGTATCTTTCAAAA  2323
25        968   G.NN.......AT..........N.........NN....N................-...  1026
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23        667   .......................-.........-..........................  724
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Query_22  2324  TCAC-TCCGGAATTACTGCGCTT-CTACGACTATGAACTCAACTACGTAGCC-GAACCGG  2380
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Query_22  2381  GAGACTTCG-ACATAATGATCGGGGGGAACAGCC--AAAGTGTAAAAA-CG-ACTCATCT  2435
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Query_22  2436  GAGTTTG--TAACATTGGAAGTGGATAACGG-ATCCGAATTCGAGCTCCGTCGA-CAAGC  2491
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18        71     ....G.--....................---.....                         41

Query_22  2492  -TTGCGGCCG-CACT-CGAGcaccaccaccaccacca-cT-G-AGA-T-CCGGCTGCTAA  2543
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18        45                                                 .-.-...........  33

Query_22  2544  CAAAG-CCC--G--AAAGGAAGC-TGAGTTGGC-TG-CTGCCACCGCTGAGCAATAAC-T  2594
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44        31    .....-...--.--....                                            19
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30        30    .....-...--.--...                                             19
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31        33    .....-...--.N-.....                                           19
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46        33    .....-...--N--...                                             22
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62        35    .....-...                                                     28
3         32    .....-...--.--...A...                                         17
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24        32    .....-...--.--.....                                           19
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22        31    ....N-...--N--...A.N..                                        15
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47        36    ....N-..N--.--...AN...                                        20
87        17    .-...-...--A--..                                              8
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Query_22  2645  AA  2646
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Query= APC115077.128

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108       59    .....-.....--A..                                              71
65        51    .....-.....--A..                                              63
109       54    .....-.....--A..                                              66
107       45    .....-.....--A..                                              57
137       1004                       .....NNA-....A..-G.A..-G..GA..-TN.....T  970

Query_23  150   TCAT-CC--G-CAGTTCG-AAAAGGGTA-CCGAGAA-CCTGTACTT-CCAAT-CCAATGC  200
117       697   ....-..--.-.......-.........-.......-.........-.....-.......  647
83        864   ....-..--.-.......-.........-.......C.........-.....-.......  813
85        863   ....-..--.-.......-.........-.......-.........-.....-.......  813
110       103   ....-..--.-.......-.........-.......-.........-.....-.......  153
105       109   ....-..--.-.......-.........-.......-.........-.....-.......  159
93        111   ....-..--.-.......-.........-.......-.........-.....-.......  161
96        109   ....-..--.-.......-.........-.......-.........-.....-.......  159
86        101   ....-..--.-.......-.........-.......-.........-.....-.......  151
9         104   ....-..--.-.......-.........-.......-.........-.....-.......  154
103       111   ....-..--.-.......-.........-.......-.........-.....-.......  161
98        113   ....-..--.-.......-.........-.......-.........-.....-.......  163
89        102   ....-..--.-.......-.........-.......-.........-.....-.......  152
17        98    ....-..--.-.......-.........-.......-.........-.....-.......  148
90        98    ....-..--.-.......-.........-.......-.........-.....-.......  148
84        98    ....-..--.-.......-.........-.......-.........-.....-.......  148
70        101   ....-..--.-.......-.........-.......-.........-.....-.......  151
82        99    ....-..--.-.......-.........-.......-.........-.....-.......  149
80        101   ....-..--.-.......-.........-.......-.........-.....-.......  151
112       105   ....-..--.-.......-.........-.......-.........-.....-.......  155
95        110   ....-..--.-.......-.........-.......-.........-.....-.......  160
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59        93    ....-..--.-.......-.........-.......-.........-.....-.......  143
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61        87    ....-..--.-.......-.........-.......-.........-.....-.......  137
99        93    ....-..--.-.......-.........-.......-.........-.....-.......  143
91        94    ....-..--.-.......-.........-.......-.........-.....-.......  144
114       117   ....-..--.-......T-N........-.......-.........-.....-.......  167
87        856   ....-..CGC-.......A.........C.......-.........C.....C.......  800
122       957   ....-..--.N.......A.........-.......-.........--.N..-.......  906
101       106   ..C.-G.T-.-.T..-..-.TG......-.......-.........-.....-.......  156
137       969   ..N.T..--.-.....N.-......N..-.......-..N......N.....N.....N.  916

Query_23  201   CCGGGAACAATCTTTCGATGAGGCATGGTTATTTCATCGTGGAGATATTGCCGAAGGAGA  260
117       646   .                                                             646
83        812   .                                                             812
85        812   .                                                             812
110       154   .                                                             154
105       160   .                                                             160
93        162   ..AAC.....                                                    171
96        160   .                                                             160
86        152   ..                                                            153
9         155   .                                                             155
103       162   .                                                             162
98        164   ..                                                            165
89        153   ..                                                            154
17        149   .                                                             149
90        149   ..AAC.....                                                    158
84        149   ..                                                            150
70        152   ..                                                            153
82        150   ..                                                            151
80        152   ...T..                                                        157
112       156   .                                                             156
95        161   .                                                             161
94        163   .                                                             163
59        144   ..                                                            145
111       152   .                                                             152
102       160   .                                                             160
100       151   ..                                                            152
29        148   .                                                             148
97        162   .                                                             162
104       163   .                                                             163
72        151   ..                                                            152
76        150   ...T..                                                        155
74        146   ..                                                            147
78        148   ...T..                                                        153
61        138   ..                                                            139
99        144   ..                                                            145
91        145   ..AAC.....                                                    154
114       168   ..                                                            169
87        799   .                                                             799
122       905   .                                                             905
101       157   ..                                                            158
137       915   ..                                                            914

Query_23  261   AAAGCAATCTTTAGATGACTCACAATGGCGTCAGATAAATCTTCCTCATGATTGGAGTAT  320

Query_23  321   TGAAGATATTCCTGGAACCAATTCTCCTTTTACAGCGGATGCTGCAACGGAAGTTGCAGG  380

Query_23  381   TGGTTTTACTGTAGGTGGTACGGGATGGTATAGAAAGCACTTCTACATAGATGCGGCTGA  440

Query_23  441   AAAAGGTAAATGTATTGCTGTCTCTTTCGATGGAATTTATATGAATGCAGATATCTGGGT  500

Query_23  501   GAATGATCGCCATGTAGCCAATCATGTTTATGGATATACTGCATTTGAACTGGATATAAC  560

Query_23  561   CGATTATGTACGTTTCGGAGCTGAAAATCTGA-TAGCTGTCCGTGTGAAGAATGAAGGTA  619
119       1128                        ......T...GN...NT.....NN-...........NN  1092

Query_23  620   TGAATTGCCGTTGGTATACAGG-TTCGGGTATTTACAGGCA-TACTTTCTTGAAGATAAC  677
119       1091  G--.N....N.A.TA.N.....G.......N..........N.N..............N.  1034

Query_23  678   CAATCCGCTTCATTTTGAAACTTGGGGAACGTTTGTCACGACTCCCG-TTGCAACGGCGG  736
119       1033  -......N.......-......A...........N........G...G............  976

Query_23  737   ATAAAGCAGAGGTACATGTACAGAGTGTTCTGGCAAATACTGAAAAAGTAACCGGAAAAG  796
119       975   ...........................G.T........T........NN....A......  916

Query_23  797   TGATTCTGGAAACGCGGATTGTAGATAAGAATAACC-ATACTGTAGCTCGGAAAGAGCAA  855
119       915   ....................................C.......................  856

Query_23  856   CTGGTAACATTGGATAACAAAGAAAAAACAGAGGTTGGCCATGCGTTGGAAGTGCTTGCT  915
119       855   ............................................................  796
30        135   ..............                                                122
31        138   ..............                                                125
34        139   ..............                                                126

Query_23  916   CCGCAATTATGGTCTATAGACAATCCTTACTTATATCAGGTTGTAAACCGTCTTCTGCAA  975
119       795   ............................................................  736

Query_23  976   GATGATAAAGTTATAGATGAGGAATATATTTCAATAGGTATACGCAATATTGCATTTAGT  1035
119       735   ............................................................  676

Query_23  1036  GCGGAGAATGGTTTCCAGCTGAATGGTAAA-TCCATGAAACTAAAAGGCGGATGTATCCA  1094
119       675   ..............................A.............................  616

Query_23  1095  TCATGACAATGGTCTTTTGGGTGCAAAGGCTTTTGACCGGGCAGAGGAAAGGAAAATAGA  1154
119       615   ............................................................  556

Query_23  1155  ACTACTGAAAGCGGCTGGTTTCAATGCGCTGCGCTTGTCTCATAATCCTCCCTCAATCGC  1214
119       555   ............................................................  496

Query_23  1215  TTTACTCAATGCCTGCGACCGCTTAGGTATGCTGGTCATAGATGAGGCTTTTGATATGTG  1274
119       495   ............................................................  436

Query_23  1275  GCGCTATGGTCATTATCAGTATGATTATGCACAATACTTTGATAAATTGTGGAAAGAAGA  1334
119       435   ............................................................  376
32        5                                       ...N......................  30

Query_23  1335  TTTGCATAGTATGGTTGCACGGGATAGGAATCATCCTAGTGTTATCATGTGGAGTATTGG  1394
119       375   ............................................................  316
32        31    ............................................................  90
138       344                                   .....T....CG.A...........C..  317
135       348                                   .....T....CG.A...........C..  321
132       344                                   .....T....CG.A...........C..  317
45        59                                    .....T....CG.A...........C..  86
43        58                                    .....T....CG.A...........C..  85
41        58                                    .....T....CG.A...........C..  85
127       311             ...A.A.A...T...GT...C.....GTCCA.....TG......C.A...  262
124       312             ...A.A.A...T...GT...C.....GTCCA.....TG......C.A...  263

Query_23  1395  TAATGAAATCAAGAACAAAGAAACTGCTGAAATTGTGGATATATGCAGGGAGTTGACAGG  1454
119       315   ............................................................  256
32        91    ............................................................  150
138       316   .......                                                       310
135       320   .......                                                       314
132       316   .......                                                       310
45        87    .......                                                       93
43        86    .......                                                       92
41        86    .......                                                       92
127       261   ........                                                      254
124       262   ........                                                      255

Query_23  1455  TTTTGTGAAGACGCTTGATACAACGCGGCCTGTTACGGCGGGAGTTAATTCTATTGTTGA  1514
119       255   ............................................................  196
32        151   ............................................................  210

Query_23  1515  TGCAACGGATGATTTTCTGGCTCCTCTGGATGTTTGTGGTTATAATGCTTGTTTAAACCG  1574
119       195   ............................................................  136
32        211   ............................................................  270
61        780                                                          .....  784

Query_23  1575  TTATGAATCGGATGCCAAACGTCATCCGGACCGTATTATCTATGCTTCGGAGTCCTACGC  1634
119       135   ............................................................  76
32        271   ............................................................  330
61        785   .......AAA.......                                             801

Query_23  1635  ATCC-CAGGCTTATGATTATTGGAAAGGAGTAGAAGATCATTCATGGGTGATCGGTGATT  1693
119       75    ....A.........A.............................................  16
32        331   ....-.........A.............................................  389

Query_23  1694  TTATCTGGACTGCTTTTGACTATATTGGTGAGGCAAGTATCGGCTGGTGTGGGTATCCGC  1753
119       15    ..........                                                    6
32        390   ............................................................  449

Query_23  1754  TTGATAAACGTATTTTCCCTTGGAATCATGCCAATTGTGGTGATTTGAATCTTTCGGGCG  1813
32        450   ............................................................  509

Query_23  1814  AACGTCGTCCCCAGTCCTATTTGCGTGAAACGTTATGGAGTGATGCACCGGTATCCCATA  1873
32        510   ............................................................  569

Query_23  1874  TTGTTGTGACGCCTCCTGTTCCTTCTTTTCCTCTGAATCCGGATAAGGCGGATTGGAGTG  1933
32        570   ............................................................  629

Query_23  1934  TATGGGATTTTCCGGATGTTGTGGATCATTGGAATTTCCCGGGATATGAGGGGAAAAAGA  1993
32        630   ............................................................  689

Query_23  1994  TGACAGTATCTGTATACTCCAATTGTGAACAGGTTGAACTGTTCTTGAATGGGGAATCTT  2053
32        690   ............................................................  749

Query_23  2054  TAGGAAAACAAGAAAATACTGCCGATAAGAAAAATACGCTTGTCTGGGAAGTACCTTATG  2113
32        750   .NN.........-...............................................  808

Query_23  2114  CTCATGGAATATTGAAAGCCGTAAGTTATAATAAAGGCGGTGAAGTGGGCACTGCAACGT  2173
32        809   ........................................N...................  868

Query_23  2174  TGGAAAGTGCTGGTAAGGTTGAAAAGATCAG-ATTATCTGCGGACAGAACGGAAA-TCGT  2231
32        869   .............N.......-......N..A..N....................T....  927

Query_23  2232  AGCTGATGGTAATGATCTAAGCTATATCACATTAGAATTGGTAGATAGTAAAGGCATTAG  2291
32        928   ..........-...................-....-........N.N..-..........  983

Query_23  2292  AAATCAGTTGGCTGAAGAATTGGTAGCATTTTCTATAGAAGGAGATGCTACG-TAACATT  2350
32        984   -.....-...N.NN..-..........-C.....-.N.N..N.T.....NNC-.T.....  1037
83        127                                                        .......  121
85        130                                                        .......  124
110       840                                                        .......  846
39        816                                                        .......  822
27        840                                                      .-.......  847
23        841                                                      .-.......  848
112       837                                                        .......  843
111       841                                                        .......  847
40        131                                                        .......  125
26        133                                                        .......  127
115       135                                                        .......  129
49        132                                                        .......  126
60        135                                                      .-.......  128
116       129                                                      .-.......  122
64        133                                                      .-.......  126
56        138                                                   ....A.......  127
44        132                                                        .......  126
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38        131                                                        .......  125
35        128                                                        .......  122
30        132                                                      .-.......  125
14        133                                                        .......  127
31        135                                                      .-.......  128
0         132                                                        .......  126
46        134                                                        .......  128
34        136                                                      .-.......  129
28        133                                                        .......  127
12        136                                                        .......  130
62        137                                                      .-.......  130
3         133                                                        .......  127
88        118                                                        .......  112
24        133                                                        .......  127
5         133                                                        .......  127
73        131                                                      .-.......  124
8         134                                                        .......  128
22        132                                                        .......  126
68        130                                                      .-.......  123
47        137                                                        .......  131
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71        128                                                      .-.......  121
58        120                                                   ....A.......  109
51        123                                                   ....A.......  112
69        129                                                      .-.......  122
54        125                                                   ....A.......  114
66        128                                                      .-.......  121
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75        65                                                         .......  59
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15        62                                                       .-.......  55
20        66                                                       .-.......  59
18        66                                                       .-.......  59

Query_23  2351  GGAAGTGGATAACGGA-TCCGAA-TTCGAGC-TCCGTCGA-CAAGCTT-GCGGCCG-CAC  2404
32        1038  ..C.N...NAN.N...T..T...T.......T..T...T.-AC..N..-.N....       1090
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18        58    .............--.-....                                         41

Query_23  2405  T-CGAGcaccaccaccaccacca-cT-G-AGA-T-CCGGCTGCTAACAAAG-CCC--G--  2453
83        66    .-....---..............-..-.-...-.-................-...--.--  21
85        69    .-.....................-..-.-...-.-................-...--.--  21
110       902   .-...............--....-..T.-...-.-................-..N--A--  949
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Query_23  2454  AAAGGAAGC-TGAGTTGGC-TG-CTGCCACCGCTGAGCAATAAC-TAG-CA-TAAC-C-C  2505
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Query_23  2506  CTT-GGGGCCTCTAAACGGGTCTT--GAGG-GG--TTTTTTGCTGAAA  2547
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Effective search space used: 386973925


Query= APC115086.149

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Query_24  1     TCTCG-ATCCCGCGAAATTAATAC-GACTC-ACTATAGGGG--AATT-GTGAG-CGGA-T  52
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95        160   ..                                                            161
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Query_24  254   CTCTGGAAGAGAAA--ATCGGCCAGTTGAA-C----TTGCCTGTTACGGGTGAAATAACC  306
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Query_24  307   ACCGGACAAGCCAAGAGTAGTAATGTGGCTAAGCGTATCCGTGCCGGTGAA-GTGGGCGG  365
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Query_24  366   ACTCTTTAACT-TGAAAGGCGTGGAGCGTATTCGTGACGTTCAGAAACAGGCAGTAGAAG  424
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Query_24  425   AAAGT--C--GTCTGGGTATTCCTCTTTTATTTGGTATGGATGTAATTCATGGATACGAA  480
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Query_24  481   ACGGTATTTCCTATTCCTCTGGGATTATC-CTGT-ACCTGGAACATGACAGCTATTGAA-  537
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Query_24  538   GAATCTGCACGTATTGCTGCTATCGAAGCCAGTGCTGATGGTATTTGCTGGACATT--CA  595
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Query_24  596   GTCCGATGGTGGATGTTTCCCGTGAT-CCCCGTTGGGGACGAGTTTCCGAA-GGGAATGG  653
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Query_24  654   TGAAGATCCCTTCTTGGGAGCGGAGATTGCGCGTGCTATGGTACGTGGTTATCAAGG---  710
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Query_24  711   ---------GAAAG---ATA---TG----AG------TA------------GT--AATGA  731
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126       1065                                                         ..C..  1061
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Query_24  732   TGAA-ATTATGGCTTGC-GTGAAGCACTTTGCG-TTATATGGGGCATCAGA-AGCCGGAC  787
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Query_24  788   GCGACTATAATACAGTG-GATAT-GAGTCATCAACGT-ATGTTCAACGAATATATGT-TA  843
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Query_24  844   CCTTATCAGGCT-GCC-GTGGAAGAAGGTGTGGGTAGTGTGATGGCTTC-ATTCAATGAA  900
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Query_24  901   GTGGATGGTGTACCGGCTACCG-GAAATAAGTGGC-TGATGACCGATGTACTTCGTAAGC  958
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Query_24  959   AG-T--G-GAATTTTGATGGGTTCGTTGTGACGGACTATACCGGTATCACTGAAA-TGAC  1013
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Query_24  1014  CGATCATGGTAT---GGGTGATACACAAACAGTTGCAGCCCTGGCTCTGAATGCAGGTGT  1070
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Query_24  1071  CGATATGGATATGGTGAGCGATGCTTTTACAAGCACACTTAAAAAATCTCTGGAAGAAGG  1130
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Query_24  1131  AAA----AGTTTCAGTA----AAGGC-TGTTG-ATGCTGCTTGTCGCCGTATTCTGGAAG  1180
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123       663   C..----GA.--.....TGGA..CC.-..--.-.CAAA..C........C..C..T....  614

Query_24  1181  CTAAGTATAAGCTGGGGCTTTTTGATAATCCCTATAAATATTGTGATATAACCCGTCCTA  1240
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Query_24  1241  AAAAACAAATCTTTACAAAAGAACACCGCGCTATAGCCCGTAAGACAGCTTCGGAAAGCT  1300
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Query_24  1301  TTGTTCTCTTGAAGAATGAGAA--T--AG-------TG---------TACTC--------  1332
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Query_24  1333  --------CCTCTGGCAAAGAAAGGTACCATTGCTGTAGTAGGTCCTTTGGCCGATAGCC  1384
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Query_24  1385  GTAGCAATATGCCGGGCACGGCTAGTGTGGCCGCTGTGATGAACAAATATCCTTCTTTGA  1444
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2         103   .C.....C...........CTGG..C..AN..N.ACGCC.C.N.G.T...........AT  162
4         511   ..TCT........C..A...TGG.....---A..G..C.AT.TGG..GC...AG..AC.C  567
134       393   .C..T..C........T..CTGG.....A.....ACGCC.C...G.C.........G..T  334
1         769   .C.....C...........CTGG..C..A.....ACGCC.C...G.T...........AT  828
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124       323                                                            ...  321

Query_24  1445  TT---GAAGGCTTGA-AAGAAGTAGTGGGAGGCAAGGCTAAAAT-T-CTTACGGCTAAAG  1498
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124       320   ..---......A...-T....                                         304

Query_24  1499  GAAGTAATCTGATGAGTGATGCCGAATACGAAGAACGTGCTACTATGTTTGGCCGTAC--  1556
121       273   ..........................................................--  216
33        177   ..........................................................--  234
25        228   .T.....C..C..C........A.CC..............C..A.....C......T.--  285
120       277   .T.....C..C..C........A.CC..............C..A.....C......T.--  220
126       275   .T.....C..C..C........A.CC..............C..A.....C......T.--  218
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2         217   .T.....C..C..CN.C.....GNCT......N.......C..C.....C..N...T.--  274
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1         883   .T.....C..C..CG.C.....A.NT......-N......C..C.....C..          933
123       277   .T.....C..C..C........A.CC..............C..A.....C......T.--  220

Query_24  1557  ----TCTGCATCGTGACAATCGTACAGATAAGGAACTGCTGGATG-AGGCGCTTGCTGTA  1611
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23        2                       ......N-..C..A..GA.........-.......GAAA..G  41
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2         275   ----NT..A.C..C..T.....C..G..CC.NN.GT.A.....C.-.A..A..GAAAA.T  329
4         685   TATAC.G.G..AAG..A..A...T.C....TCC.GA.....A...-.A..AT.AAA...T  743
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123       219   ----AT.AA.......T...........C..A..GA.........-.......GAAA..G  165

Query_24  1612  GCTGCCAAGT-CTGACGTGATTGTT-GCTGCTTTGGGTGAGTCTTCCGAGATGAGCGGTG  1669
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Query_24  1670  AAAG-TAGTTGCCGTACAGACCTCGAAATGCCGGATACGCAACGTGTACTT--TTGCAGG  1726
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123       106   ....-.TCAA....C..TA....G.CTC.T..C...GTA..G..CACT..A--...G.A.  50

Query_24  1727  AATTGTTGAAAACCGGCAAACCGGTGGTATTGGTGTTGTTTACCGG-TCGTCCGTT-AGT  1784
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123       49    CT...C.......T..A..G..T...                                    24

Query_24  1785  ATTGAATTGGGAGCAGGAAAATGTA-CCTGCTATTCTGAA-TGTGTGGTTTGGTGGTAGT  1842
33        463   .........................-..............-...................  520
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8         765   T..ATGC......TCT..GC....T-..G.....C.....-C..........CC..C...  708

Query_24  1843  GAAGCTGCTCTTGCCATTGGTGATGTACTGTTTGGAAATGTAAATCCGAGTGGCAAACTT  1902
33        521   ............................................................  580
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Query_24  1903  ACTACT-AC-TTTTCCGAAG-AGTG-TAGGACAGATTCCTTT--GTTCT-ATAACCATAA  1955
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8         647   .....G-.G-...C..-.C.-T.C.G.G......T.G..GC.--T.AT.-....T..CCT  595

Query_24  1956  GAATACTGGTCGTCCTTTGCCT-CAAGG--GGC-CTGGTTCCAGAAGTTCCGT-AGC-AA  2009
33        634   ......................-.....--...-...................-...-..  687
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4         1091  AN.......A...                                                 1103
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Query_24  2010  TTATCTGGATGTAGA-TAACGAACCGCTTTATCCGTTTGGATATGGCTTGAGCTATA-CT  2067
33        688   ...............-.........................................-..  745
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115       538   C...........G..-...Y........G.....C..C..T.....A...TCG....-.C  481
116       531   ...C...........-C.....T..AT.G.....A..C..C.....T...TCG....-.C  474
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8         540   ...CA.C..CC-...G...T..............T.....C.....T.....T....-.C  483

Query_24  2068  A-C-TTTCTCTTATAGTGATATTACATTGGATAA---ATCGTCCATGAATAT----CA--  2116
33        746   .-.-..............................---...............----..--  794
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8         482   .-.-....CG...CG..A..-..G..G.T..GTGCGG.G...--...GCC.A----GG--  434

Query_24  2117  ATGGAGAGATTATGGCAACTGTAACGGTAA-CCAATACAGGTAAGTATGACGGTTCGGAA  2175
33        795   ..............................C.............................  854
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Query_24  2344  GAACCGGGTGACTTTGAAGTAATGATAGGTGGTG--ATAGCCGTGATGTG-AATAAGGC-  2399
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Query_24  2400  -CTTATTTTC--GCTTCAATAACATTGGAAGTGGATAACGGATCCGAATTCGAGCTCCGT  2456
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Query_24  2508  GGCTGCTAACAAAG-CCC--G--AAAGGAAGC-TGAGTTGGC-TG-CTGCCACCGCTGAG  2559
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Effective search space used: 398008429


Query= CMR200018.120

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Query_25  99    TATAC-ATATG--CACCAT-CATCATCAT-CATTCTT-CT-GG-TGTAGAT-CTGTGGTC  149
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Query_25  150   TCAT-CC--G-CAGTTCG-AAAAGGGTA-CCGAGAA-CCTGTACTT-CCAAT-CCAATGC  200
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Query_25  201   CCAGACACTTCCGCAGACAGAGCGGCAATACCTCTCCGGCCACGGATGCGACGACACAGT  260
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17        149   .A..T.---.......                                              161
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101       157   ...                                                           159
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Query_25  261   AGAATGGGACTTTTTCTGTACCGACGGACGTAACTCCGGTCGATGGACGAAAATAGGCGT  320

Query_25  321   CCCCTCTTGCTGGGAGTTGCAGGGTTTTGGTACCTATCAGTATGGAATTAGTTTTTATGG  380

Query_25  381   TAAAGCCTTTCCCGAAGGCATTGCCGGTGAGAAAGGAATGTATAAATATGAGTTTGAAGT  440

Query_25  441   TCCCGAGGAATTTCGTGGCAAGCAGGTCAGCCTTGTGTT--CGAAG-CATCCATGACCGA  497
124       1178                             ......N.....TCN....N..N...NN-....  1147
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Query_25  498   TACGGAAGTTAAGGTTAACGGACGTAAGG--CAGGAT-CGAAACACCA-GGGAGCCTTCT  553
124       1146  .NNC.G..N......--...N-.......GC......TN.....C...A...........  1090
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Query_25  554   ATTGCTTTTCATATAATGTCACGGATTTACTG-AAATATGGCAAGAA-GAAT-CAGCTGG  610
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Query_25  611   AAGTAACAGTTTCCAAGGAG-AGTGAGAATGCCA-GTGTGAATCTTGCCGAACGGCGCGC  668
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Query_25  669   CGATTATTGGAACTTTGGCGGTATCTTCCGCCCGGTATTTCTGGAAGTAAAACCTGCCGT  728
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Query_25  729   CAATCTCCGTCATATTGCTATTGATGCACAAA-TGG-ACGGATCATTCCGTGCCAATTGC  786
124       913   ....N...........................A...N..A....................  854
127       910   N...................G....AN.....-...-..............N.....-..  854

Query_25  787   TACACGAATATCTCCGGTGACGGAATGAGTATCCGTGCACAGATTTTGGACGGTAAA-GG  845
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110       505                                                        ....-..  510
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87        452                                                        ....-..  447

Query_25  846   GAAGAAACTGGCAGATACCACCGTACCCCTAAAAGCCGGAAGCGACTGGACTACTTTACA  905
124       793   ............................................................  734
127       794   ............................................................  735
83        455   ..........                                                    446
85        458   ..........                                                    449
110       511   ..........                                                    520
111       506   ..........                                                    515
112       507   ..........                                                    516
87        446   ..........                                                    437

Query_25  906   A-TTGAACGTTTCTGCCCCTGCCTTATGGACGGCAGAAACTCCGAATCTTTATAAA-GCT  963
124       733   .-......................................................-...  676
127       734   .N......................................................A...  675
93        1075                                          ..............        1088

Query_25  964   CAATTTTCACTGTTGGATAAAGGAGGTAAAGTCCTGCATCATGAGACCGAGACATTCGGT  1023
124       675   ............................................................  616
127       674   ............................................................  615

Query_25  1024  TTCCGTACTATCGAAGTTCGTGAAAGTGACGGATTGTACGTGAACGGGGTGCGTATCAAC  1083
124       615   ............................................................  556
127       614   ............................................................  555

Query_25  1084  GTGCGTGGTGTCAACCGTCATAGTTTCCGTCCCGAAAGCGGTCGTACCCTAAGTAAAGCG  1143
124       555   ............................................................  496
127       554   ............................................................  495

Query_25  1144  AAGAATATTGAAGATGTACTTCTGATGAAGGGCATGAATATGAATTCTGTCCGTCTGAGC  1203
124       495   ...........G................................................  436
127       494   ...........G................................................  435

Query_25  1204  CACTATCCGGCGGACCCGGAATTTCTGGAAGCATGCGACTCTCTTGGACTCTATGTTATG  1263
124       435   ............................................................  376
124       943                 .....T...........                               927
129       1160                    ......TC.A....N-..NCN.................-...  1121
127       434   ............................................................  375

Query_25  1264  GATGAACTGGGTGGCTGGCATGGCAAGTACGACACCCCTACGGGAGTACGTCTGATTGAA  1323
124       375   ............................................................  316
129       1120  -.N.NNT--........C..........T.NNN--..N.N--.....-...N....-...  1070
127       374   ............................................................  315
121       330                                                       ........  323
33        120                                                       ........  127
55        43                                                           .....  39

Query_25  1324  GGCATGATAGAACGTGATGTGAACCATCCGTCCATTATCTGGTGGAGC-AATGGTAATCA  1382
124       315   ................................................-.........G.  257
129       1069  .C......-..........................-......N.-...N.........G.  1013
127       314   ................................................-.........G.  256
121       322   ...T...A....                                                  311
33        128   ...T...A....                                                  139
55        38    .........                                                     30

Query_25  1383  GAAAGGCTGGAACATTGAACTGGACGGAGAATTCCATAAATACGATCTGCAGAAACGCCC  1442
36        13    ...........-................................................  71
124       256   A...........................................................  197
129       1012  A.................-.......-..N...........N..................  955
127       255   A...........................................................  196
37        1            .....................................................  53

Query_25  1443  GGTCATCCATCCGCAAGGTAACTTCTCCGGTTTCGAAA-CCATGCACTATCGTTCGTATG  1501
36        72    ......................................-.....................  130
124       196   ......................................-.....................  138
129       954   ...........................N.A........A.....................  895
127       195   ......................................-.....................  137
37        54    ......................................-.....................  112
17        431                               .......T..-..........             412
29        430                               .......T..-..........             411
137       629                               .......T..-..........             648

Query_25  1502  GAGAAAGCCAGAACTACATGCGCCTGCCGGAAATCTTTATGCCTACTGAATTCCTGCATG  1561
36        131   ...............................................C.G..........  190
124       137   ...............................................C.G..........  78
129       894   ..................................................N.........  835
127       136   ...............................................C.G..........  77
37        113   ...............................................C.G..........  172

Query_25  1562  GTTTGT-ACGACGGAGGTCATGGTGCCGGCCTGTATGATTACTGGGAAATGATGCGTAAA  1620
36        191   ......-.....................................................  249
124       77    ......-.....................................................  19
129       834   ......-.....................................................  776
127       76    ......A.N...................................................  17
37        173   ......-.....................................................  231

Query_25  1621  CATCCGCGTTGTATCGGTGGTTTCCTGTGGGTATTGGCGGATGAAGGCGTGAAGCGCGTG  1680
36        250   ............................................................  309
124       18    ........-.....                                                6
129       775   ............................................................  716
127       16    .........                                                     8
37        232   ............................................................  291
134       729                                                          .....  725
131       426                                                          .....  422
126       725                                                          .....  721
123       727                                                          .....  723
120       727                                                          .....  723
21        427                                                          .....  431
19        430                                                          .....  434

Query_25  1681  GATATGGACGGGTTCATAGACAATCAGGGAAATTTCGGAGCTGACGGAATTGTAGGCCCT  1740
36        310   ............................................................  369
129       715   ............................................................  656
37        292   ............................................................  351
134       724   .........                                                     716
131       421   .........                                                     413
126       720   .........                                                     712
123       722   .........                                                     714
120       722   .........                                                     714
21        432   .........                                                     440
19        435   .........                                                     443

Query_25  1741  CACCATGAAAAGGAAGGCAGCTATTACACTATCAA-GCAGCTATGGAGCCCGGTGCAGGT  1799
36        370   ...................................-........................  428
129       655   ...................................A........................  596
37        352   ...................................-........................  410

Query_25  1800  TATGAATACCGCTATCGACCGGAATTTCGACGGTAAACTCTCTGTGGAGAACCGTTATGA  1859
36        429   ............................................................  488
129       595   ............................................................  536
37        411   ............................................................  470

Query_25  1860  TTATCTGAACCTGAACACCTGTCGTTTTATCTGGCAGCAAGTGAAGTTCCCGTCGGTAAC  1919
36        489   ............................................................  548
129       535   ............................................................  476
37        471   ............................................................  530

Query_25  1920  GGATGCTTCCAATACAACTACACGGATTC-TGAAACAAGGTGAAGTGCAAGGAAGCGATG  1978
36        549   .............................-..............................  607
129       475   .............................-..............................  417
37        531   .............................T........................N.....  590

Query_25  1979  TAGCAGCCCATGGAGTGGGAGTGGTGGATATCAAGACTTCTATTCTTCCCGAAGCGGATG  2038
36        608   ............................................................  667
129       416   ............................................................  357
37        591   ............................................................  650

Query_25  2039  CTCTTTTCCTGACAGTTATAGATAAATATGGGTATGAACTTTGGCGCTGGACTTTCCCCG  2098
36        668   ............................................................  727
129       356   ............................................................  297
37        651   ..................N............A............N...............  710

Query_25  2099  TA-GATAAACTGAATCGGG-AAACAG-AACAGTTTT-CTGCAT-CA-TCCGGCC-GTGTA  2151
36        728   ..-................-......-.........-......-..-.......-.....  780
129       296   ..-................-......-.........-......-..-.......-.....  244
37        711   ..TN..T.........N..A......A...N.....N......N..T.......TT....  770

Query_25  2152  TCCTATAC-GGAAA--CAGAAAAAGG--TATTACGGT--AAAAGCAAACGGGCGTAC---  2201
36        781   ........-.....--..........--.........--..................---  830
129       243   ........-.....--..........--.........--..................---  194
39        22                                                        .....---  26
37        771   ......N.N.....ACN.T.......NTNT..N.T.NTA......N.N....GNNC.ACT  830

Query_25  2202  TTTTGTCTTTT--CAAAGAAAGACGGGCAGCTGAAAGATGTATCCGTCAATAACCGTAAG  2259
36        831   ...........--...............................................  888
129       193   ...........--...............................................  136
39        27    ...........--...............................................  84
37        831   ...........TCA.......                                         851

Query_25  2260  ATTAGTTTTGCTAACGGTCCCCGTTTTATCGGTGCACGTCGTGCAGACCGTTCCCTAGAT  2319
36        889   ............................................................  948
129       135   ....................................AC......................  76
39        85    ....................................AC......................  144

Query_25  2320  CAGTTCTATAATCATGATGACGAAAAAGCCAAGGCAAAGGACCGTACTTACAGTGAATTT  2379
36        949   ......................................................TG....  1008
129       75    .........................................................-..  17
39        145   ............................................................  204

Query_25  2380  ACCGATGCGGCAGTCTTCACGAAACTGGATGTGAAAGAAGAgggggggAATCTGATCCTC  2439
36        1009  .........................................-......N...........  1067
129       16    ......N.N.GN...                                               2
39        205   ............................................................  264

Query_25  2440  ACCGCTAATTATAAACTGGGTAATTTAG-ATAAAGCTCAGTGGACAA-TTCATCCGGACG  2497
36        1068  ......T..--NT....-..N.T..A..A..................T..........NC  1124
39        265   ............................-..................-............  322

Query_25  2498  GCATGGCTACTCTTGATTATACCTACAACTTCTCCGGTGTGGTAGACCTGATGGGTATTT  2557
36        1125  ............-....--NNN.......C.NCT.......                     1162
39        323   ............................................................  382

Query_25  2558  GCTTTGATTACCCTGAAGAACAAGTGCTCAGCAAGCGTTGGTTGGGAGCAGGTCCGTATC  2617
39        383   ............................................................  442

Query_25  2618  GTGTATGGCAGAATCGTATTCATGGCACGCAGTATGATATCTGGGAGAATGATTATAACG  2677
39        443   ............................................................  502

Query_25  2678  ATCCTATTCCGGGTGAGACATTCACCTATCCTGAATTCAAGGGATATTTTGGCAGTGTCT  2737
39        503   ............................................................  562

Query_25  2738  CTTGGATGAGTATTCGCACGAAAGAGGGAACCATCAGCCTGACGAATGAAACACCTGATT  2797
39        563   ............................................................  622

Query_25  2798  CCTATATCGGAGTATATCAACCCCGTGATGGTCGTGACCGGTTACTGTATACACTTCCCG  2857
39        623   ............................................................  682

Query_25  2858  AAAGCGGAATTTCTGTTTTGAATGTAATTCCTCCGGTGCGTAATAAAGTAAATTCCACGG  2917
39        683   ............................................................  742

Query_25  2918  ACTTGTGCGGTCCTTCTTCACAACCAAAATGGGTGGATGGCTCGCAAACGGGACGCCTTG  2977
39        743   .............................................-..............  801

Query_25  2978  TTATCCGGTTTGAA-TAACATTGGAAGTGGATAACGGATCCGAATTCGAGCTCCGTCGA-  3035
39        802   ..............-............................................-  859
83        129               ..-............................................-  84
85        132               ..-............................................-  87
110       838               ..-............................................A  884
27        836          .....---............................................-  884
23        837          .....---..........................N.....C...........-  885
111       839               ..-................................N...........-  884
112       835               ..-............................N.-.............-  879
40        133               ..-............................................-  88
26        140           ......A............................................-  90
49        134               ..-............................................-  89
115       135                  ............................................-  92
64        136             ...G-............................................-  89
60        138             ...G-............................................-  91
44        134               ..-............................................-  89
42        133               ..-............................................-  88
38        133               ..-............................................-  88
35        130               ..-............................................-  85
116       133          .....---............................................-  85
56        134                .-............................................-  90
14        135               ..-............................................-  90
28        140           ......A............................................-  90
0         134               ..-............................................-  89
46        136               ..-............................................-  91
30        131                  ............................................-  88
12        138               ..-............................................-  93
3         135               ..-............................................-  90
88        120               ..-............................................-  75
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Query_25  3088  GCTAACAAAG-CCC--G--AAAGGAAGC-TGAGTTGGC-TG-CTGCCACCGCTGAGCAAT  3139
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Query= CMR200018.121

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Query_26  201   CCAGACACTTCCGCAGACAGAGCGGCAATACCTCTCCGGCCACGGATGCGACGACACAGT  260
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110       154   .                                                             154
105       160   .                                                             160
93        162   ...                                                           164
86        152   ...                                                           154
98        164   ...                                                           166
96        160   .                                                             160
9         155   .                                                             155
103       162   .                                                             162
89        153   ...                                                           155
70        152   ......                                                        157
17        149   .A..T.---.......                                              161
84        149   ...                                                           151
59        144   ......                                                        149
90        149   ...                                                           151
82        150   ...                                                           152
111       152   .                                                             152
112       156   .                                                             156
100       151   ...                                                           153
95        161   .                                                             161
94        163   .                                                             163
29        148   .A..T.---.......                                              160
102       160   .                                                             160
80        152   ..                                                            153
97        162   .                                                             162
72        151   ......                                                        156
104       163   .                                                             163
74        146   ......                                                        151
61        138   ......                                                        143
76        150   ..                                                            151
78        148   ..                                                            149
99        144   ...                                                           146
91        145   ...                                                           147
114       168   ......                                                        173
87        799   .                                                             799
122       905   .A...                                                         901
101       157   ...                                                           159
137       915   ...                                                           913

Query_26  261   AGAATGGGACTTTTTCTGTACCGACGGACGTAACTCCGGTCGATGGACGAAAATAGGCGT  320

Query_26  321   CCCCTCTTGCTGGGAGTTGCAGGGTTTTGGTACCTATCAGTATGGAATTAGTTTTTATGG  380

Query_26  381   TAAAGCCTTTCCCGAAGGCATTGCCGGTGAGAAAGGAATGTATAAATATGAGTTTGAAGT  440

Query_26  441   TCCCGAGGAATTTCGTGGCAAGCAGGTCAGCCTTGTGTT--CGAAG-CATCCATGACCGA  497
124       1178                             ......N.....TCN....N..N...NN-....  1147
127       1135                                                           ...  1133

Query_26  498   TACGGAAGTTAAGGTTAACGGACGTAAGG--CAGGAT-CGAAACACCA-GGGAGCCTTCT  553
124       1146  .NNC.G..N......--...N-.......GC......TN.....C...A...........  1090
127       1132  .T..........N-......NCGT.....--.G.AG.-....G.-...-..N.NNN.NNG  1079

Query_26  554   ATTGCTTTTCATATAATGTCACGGATTTACTG-AAATATGGCAAGAA-GAAT-CAGCTGG  610
124       1089  .....................N..........N...NNN........A....-......N  1031
127       1078  --..N.N..N-..GN.NN..NN..NA..NAN.-G...TNN.......-.C..T...N...  1024

Query_26  611   AAGTAACAGTTTCCAAGGAG-AGTGAGAATGCCA-GTGTGAATCTTGCCGAACGGCGCGC  668
124       1030  ...GT...............N.............A..N.......-..............  972
127       1023  .GN..N-.N...N....N..-..NN.N...A...-...N..T....A.-.....A....A  968

Query_26  669   CGATTATTGGAACTTTGGCGGTATCTTCCGCCCGGTATTTCTGGAAGTAAAACCTGCCGT  728
124       971   -...A..-....................................................  914
124       421                                 .....A...........               405
127       967   ....-...A..........N....N......G....NN..N..-.......-........  911
127       420                                 .....A...........               404

Query_26  729   CAATCTCCGTCATATTGCTATTGATGCACAAA-TGG-ACGGATCATTCCGTGCCAATTGC  786
124       913   ....N...........................A...N..A....................  854
127       910   N...................G....AN.....-...-..............N.....-..  854

Query_26  787   TACACGAATATCTCCGGTGACGGAATGAGTATCCGTGCACAGATTTTGGACGGTAAA-GG  845
124       853   .........................................................A..  794
127       853   ....N....................................................-..  795
83        461                                                        ....-..  456
85        464                                                        ....-..  459
110       505                                                        ....-..  510
111       500                                                        ....-..  505
112       501                                                        ....-..  506
87        452                                                        ....-..  447

Query_26  846   GAAGAAACTGGCAGATACCACCGTACCCCTAAAAGCCGGAAGCGACTGGACTACTTTACA  905
124       793   ............................................................  734
127       794   ............................................................  735
83        455   ..........                                                    446
85        458   ..........                                                    449
110       511   ..........                                                    520
111       506   ..........                                                    515
112       507   ..........                                                    516
87        446   ..........                                                    437

Query_26  906   A-TTGAACGTTTCTGCCCCTGCCTTATGGACGGCAGAAACTCCGAATCTTTATAAA-GCT  963
124       733   .-......................................................-...  676
127       734   .N......................................................A...  675
93        1075                                          ..............        1088

Query_26  964   CAATTTTCACTGTTGGATAAAGGAGGTAAAGTCCTGCATCATGAGACCGAGACATTCGGT  1023
124       675   ............................................................  616
127       674   ............................................................  615

Query_26  1024  TTCCGTACTATCGAAGTTCGTGAAAGTGACGGATTGTACGTGAACGGGGTGCGTATCAAC  1083
124       615   ............................................................  556
127       614   ............................................................  555

Query_26  1084  GTGCGTGGTGTCAACCGTCATAGTTTCCGTCCCGAAAGCGGTCGTACCCTAAGTAAAGCG  1143
124       555   ............................................................  496
127       554   ............................................................  495

Query_26  1144  AAGAATATTGAAGATGTACTTCTGATGAAGGGCATGAATATGAATTCTGTCCGTCTGAGC  1203
124       495   ...........G................................................  436
127       494   ...........G................................................  435

Query_26  1204  CACTATCCGGCGGACCCGGAATTTCTGGAAGCATGCGACTCTCTTGGACTCTATGTTATG  1263
124       435   ............................................................  376
124       943                 .....T...........                               927
129       1160                    ......TC.A....N-..NCN.................-...  1121
127       434   ............................................................  375

Query_26  1264  GATGAACTGGGTGGCTGGCATGGCAAGTACGACACCCCTACGGGAGTACGTCTGATTGAA  1323
124       375   ............................................................  316
129       1120  -.N.NNT--........C..........T.NNN--..N.N--.....-...N....-...  1070
127       374   ............................................................  315
121       330                                                       ........  323
33        120                                                       ........  127
55        43                                                           .....  39

Query_26  1324  GGCATGATAGAACGTGATGTGAACCATCCGTCCATTATCTGGTGGAGC-AATGGTAATGA  1382
124       315   ................................................-...........  257
129       1069  .C......-..........................-......N.-...N...........  1013
127       314   ................................................-...........  256
119       365      ...G.T.C...G...AG...T.....TAGTG.....AT......T-.T.........  310
32        41       ...G.T.C...G...AG...T.....TAGTG.....AT......T-.T.........  96
121       322   ...T...A....                                                  311
33        128   ...T...A....                                                  139
55        38    .........                                                     30

Query_26  1383  AAAAGGCTGGAACATTGAACTGGACGGAGAATTCCATAAATACGATCTGCAGAAACGCCC  1442
36        14     ..........-................................................  71
124       256   ............................................................  197
129       1012  ..................-.......-..N...........N..................  955
127       255   ............................................................  196
37        1            .....................................................  53
119       309   ..                                                            308
32        97    ..                                                            98

Query_26  1443  GGTCATCCATCCGCAAGGTAACTTCTCCGGTTTCGAAA-CCATGCACTATCGTTCGTATG  1501
36        72    ......................................-.....................  130
124       196   ......................................-.....................  138
129       954   ...........................N.A........A.....................  895
127       195   ......................................-.....................  137
37        54    ......................................-.....................  112
17        431                               .......T..-..........             412
29        430                               .......T..-..........             411
137       629                               .......T..-..........             648

Query_26  1502  GAGAAAGCCAGAACTACATGCGCCTGCCGGAAATCTTTATGCCTACTCAGTTCCTGCATG  1561
36        131   ............................................................  190
124       137   ............................................................  78
129       894   ...............................................G.AN.........  835
127       136   ............................................................  77
37        113   ............................................................  172

Query_26  1562  GTTTGT-ACGACGGAGGTCATGGTGCCGGCCTGTATGATTACTGGGAAATGATGCGTAAA  1620
36        191   ......-.....................................................  249
124       77    ......-.....................................................  19
129       834   ......-.....................................................  776
127       76    ......A.N...................................................  17
37        173   ......-.....................................................  231

Query_26  1621  CATCCGCGTTGTATCGGTGGTTTCCTGTGGGTATTGGCGGATGAAGGCGTGAAGCGCGTG  1680
36        250   ............................................................  309
124       18    ........-.....                                                6
129       775   ............................................................  716
127       16    .........                                                     8
37        232   ............................................................  291
134       729                                                          .....  725
131       426                                                          .....  422
126       725                                                          .....  721
123       727                                                          .....  723
120       727                                                          .....  723
21        427                                                          .....  431
19        430                                                          .....  434

Query_26  1681  GATATGGACGGGTTCATAGACAATCAGGGAAATTTCGGAGCTGACGGAATTGTAGGCCCT  1740
36        310   ............................................................  369
129       715   ............................................................  656
37        292   ............................................................  351
134       724   .........                                                     716
131       421   .........                                                     413
126       720   .........                                                     712
123       722   .........                                                     714
120       722   .........                                                     714
21        432   .........                                                     440
19        435   .........                                                     443

Query_26  1741  CACCATGAAAAGGAAGGCAGCTATTACACTATCAA-GCAGCTATGGAGCCCGGTGCAGGT  1799
36        370   ...................................-........................  428
129       655   ...................................A........................  596
37        352   ...................................-........................  410

Query_26  1800  TATGAATACCGCTATCGACCGGAATTTCGACGGTAAACTCTCTGTGGAGAACCGTTATGA  1859
36        429   ............................................................  488
129       595   ............................................................  536
37        411   ............................................................  470

Query_26  1860  TTATCTGAACCTGAACACCTGTCGTTTTATCTGGCAGCAAGTGAAGTTCCCGTCGGTAAC  1919
36        489   ............................................................  548
129       535   ............................................................  476
37        471   ............................................................  530

Query_26  1920  GGATGCTTCCAATACAACTACACGGATTC-TGAAACAAGGTGAAGTGCAAGGAAGCGATG  1978
36        549   .............................-..............................  607
129       475   .............................-..............................  417
37        531   .............................T........................N.....  590

Query_26  1979  TAGCAGCCCATGGAGTGGGAGTGGTGGATATCAAGACTTCTATTCTTCCCGAAGCGGATG  2038
36        608   ............................................................  667
129       416   ............................................................  357
37        591   ............................................................  650

Query_26  2039  CTCTTTTCCTGACAGTTATAGATAAATATGGGTATGAACTTTGGCGCTGGACTTTCCCCG  2098
36        668   ............................................................  727
129       356   ............................................................  297
37        651   ..................N............A............N...............  710

Query_26  2099  TA-GATAAACTGAATCGGG-AAACAG-AACAGTTTT-CTGCAT-CA-TCCGGCC-GTGTA  2151
36        728   ..-................-......-.........-......-..-.......-.....  780
129       296   ..-................-......-.........-......-..-.......-.....  244
37        711   ..TN..T.........N..A......A...N.....N......N..T.......TT....  770

Query_26  2152  TCCTATAC-GGAAA--CAGAAAAAGG--TATTACGGT--AAAAGCAAACGGGCGTAC---  2201
36        781   ........-.....--..........--.........--..................---  830
129       243   ........-.....--..........--.........--..................---  194
39        22                                                        .....---  26
37        771   ......N.N.....ACN.T.......NTNT..N.T.NTA......N.N....GNNC.ACT  830

Query_26  2202  TTTTGTCTTTT--CAAAGAAAGACGGGCAGCTGAAAGATGTATCCGTCAATAACCGTAAG  2259
36        831   ...........--...............................................  888
129       193   ...........--...............................................  136
39        27    ...........--...............................................  84
37        831   ...........TCA.......                                         851

Query_26  2260  ATTAGTTTTGCTAACGGTCCCCGTTTTATCGGTGCACGTCGTGCAGACCGTTCCCTAGAT  2319
36        889   ............................................................  948
129       135   ....................................AC......................  76
39        85    ....................................AC......................  144

Query_26  2320  CAGTTCTATAATCATGATGACGAAAAAGCCAAGGCAAAGGACCGTACTTACAGTGAATTT  2379
36        949   ......................................................TG....  1008
129       75    .........................................................-..  17
39        145   ............................................................  204

Query_26  2380  ACCGATGCGGCAGTCTTCACGAAACTGGATGTGAAAGAAGAgggggggAATCTGATCCTC  2439
36        1009  .........................................-......N...........  1067
129       16    ......N.N.GN...                                               2
39        205   ............................................................  264

Query_26  2440  ACCGCTAATTATAAACTGGGTAATTTAG-ATAAAGCTCAGTGGACAA-TTCATCCGGACG  2497
36        1068  ......T..--NT....-..N.T..A..A..................T..........NC  1124
39        265   ............................-..................-............  322

Query_26  2498  GCATGGCTACTCTTGATTATACCTACAACTTCTCCGGTGTGGTAGACCTGATGGGTATTT  2557
36        1125  ............-....--NNN.......C.NCT.......                     1162
39        323   ............................................................  382

Query_26  2558  GCTTTGATTACCCTGAAGAACAAGTGCTCAGCAAGCGTTGGTTGGGAGCAGGTCCGTATC  2617
39        383   ............................................................  442

Query_26  2618  GTGTATGGCAGAATCGTATTCATGGCACGCAGTATGATATCTGGGAGAATGATTATAACG  2677
39        443   ............................................................  502

Query_26  2678  ATCCTATTCCGGGTGAGACATTCACCTATCCTGAATTCAAGGGATATTTTGGCAGTGTCT  2737
39        503   ............................................................  562

Query_26  2738  CTTGGATGAGTATTCGCACGAAAGAGGGAACCATCAGCCTGACGAATGAAACACCTGATT  2797
39        563   ............................................................  622

Query_26  2798  CCTATATCGGAGTATATCAACCCCGTGATGGTCGTGACCGGTTACTGTATACACTTCCCG  2857
39        623   ............................................................  682

Query_26  2858  AAAGCGGAATTTCTGTTTTGAATGTAATTCCTCCGGTGCGTAATAAAGTAAATTCCACGG  2917
39        683   ............................................................  742

Query_26  2918  ACTTGTGCGGTCCTTCTTCACAACCAAAATGGGTGGATGGCTCGCAAACGGGACGCCTTG  2977
39        743   .............................................-..............  801

Query_26  2978  TTATCCGGTTTGAA-TAACATTGGAAGTGGATAACGGATCCGAATTCGAGCTCCGTCGA-  3035
39        802   ..............-............................................-  859
83        129               ..-............................................-  84
85        132               ..-............................................-  87
110       838               ..-............................................A  884
27        836          .....---............................................-  884
23        837          .....---..........................N.....C...........-  885
111       839               ..-................................N...........-  884
112       835               ..-............................N.-.............-  879
40        133               ..-............................................-  88
26        140           ......A............................................-  90
49        134               ..-............................................-  89
115       135                  ............................................-  92
64        136             ...G-............................................-  89
60        138             ...G-............................................-  91
44        134               ..-............................................-  89
42        133               ..-............................................-  88
38        133               ..-............................................-  88
35        130               ..-............................................-  85
116       133          .....---............................................-  85
56        134                .-............................................-  90
14        135               ..-............................................-  90
28        140           ......A............................................-  90
0         134               ..-............................................-  89
46        136               ..-............................................-  91
30        131                  ............................................-  88
12        138               ..-............................................-  93
3         135               ..-............................................-  90
88        120               ..-............................................-  75
31        134                  ............................................-  91
24        140           ......A............................................-  90
5         135               ..-............................................-  90
62        140             ...G-............................................-  93
34        135                  ............................................-  92
8         138             ....-............................................-  91
22        139           ......A............................................-  89
73        130                  ............................................-  87
47        139               ..-............................................-  94
87        120               ..-............................................-  75
68        129                  ............................................-  86
51        119                .-............................................-  75
58        116                .-............................................-  72
71        127                  ............................................-  84
54        121                .-............................................-  77
69        128                  ............................................-  85
66        130              ..G-...................T.....N....A....TC.T..G.N-  84
79        66               ...-....................--.....                    39
75        68               ...-....................--.....                    41
81        66               ...-....................--.....                    39
77        66               ...-....................--.....                    39
15        61                   ....................--.....                    37
20        65                   ....................--.....                    41
18        65                   ....................--.....                    41

Query_26  3036  CAAGCTT-GCGGCCG-CACT-CGAGcaccaccaccaccacca-cT-G-AGA-T-CCGGCT  3087
39        860   .......-.......-....-....---..............-..-.-...-.N......  909
83        83    .......-.......-....-....---..............-..-.-...-.-......  35
85        86    .......-.......-....-.....................-..-.-...-.-......  35
110       885   .......-.......-....-...............--....-..T.-...-.-......  935
27        885   .......T.......-....-.....................-..-.-.N.-.C......  938
23        886   .......-.......-....-...N........-........-..-.-...-.-......  936
111       885   .N.....-.......C..N.-..................N..-..-.A...-.-..N...  938
112       880   .......-....T..-....T.................N...N..-.-...-.-......  933
40        87    .......-.......-....-.....................-..-.-...-.-......  36
26        89    .......-.......-....-.....................-..-.-...-.-......  38
49        88    .......-.......-....-.....................-..-.-...-.-......  37
115       91    .......-.......-....-.....................-..-.-...-.-......  40
64        88    .......-.......-....-.....................-..-.-...-.-......  37
60        90    .......-.......-....-.....................-..-.-...-.-......  39
44        88    .......-.......-....-.....................-..-.-...-.-......  37
42        87    .......-.......-....-.....................-..-.-...-.-......  36
38        87    .......-.......-....-.....................-..-.-...-.-......  36
35        84    .......-.......-....-.....................-..-.-...-.-......  33
116       84    .......-.......-....-.....................-..-.-...-.-......  33
56        89    .......-.......-....-.....................-..-.-...-.-......  38
14        89    .......-.......-....-.....................-..-.-...-.-......  38
28        89    .......-.......-....-.....................-..-.-...-.-......  38
0         88    .......-..N....-....-.....................-..-.-...-.-......  37
46        90    .......-.......-....-.....................-..-.-...-.-......  39
30        87    .......-.......-....-.....................-..-.-...-.-......  36
12        92    .......-.......-....-.....................-..-.-...-.-......  41
3         89    .......-NN.....-....-.....................-..-.-...-.-......  38
88        74    .......-N......-....-.....................-..-.-...-.-......  23
31        90    .......-.......-....-.....................-..-.-...-.-......  39
24        89    ......N-N......-....-.....................-..-.-...-.-......  38
5         89    ......N-.......-....-.....................-..-.-...-.-......  38
62        92    .......-.......-....-.....................-..-.-...-.-......  41
34        91    .......-.......-....-.....................-..-.-...T.-......  39
8         90    ......N-.N.....-....-.....................-..-.-...-.-......  39
22        88    ......N-N......-....-.....................-..-.-...-.-......  37
73        86    .......-.......-....-....---..............-..-.-...-.-......  38
47        93    ......N-NN.....-....-.....................-..-.-...-.-......  42
87        74    .......-A......-....-.....................-..-.-...-.-......  23
68        85    .......-.......-....-....---..............-..-.-...-.-......  37
51        74    ..N.N..-NA.....-....-.....................-..-.-...-.C......  22
58        71    ...N...-.......-....-....---..............-..-.-...-.-......  23
71        83    ......N-.......-....-....---..............-..-.-...-.-......  35
54        76    ......A-A...N..-....-.....................T..-.-...-.C......  23
69        84    ....NN.-.......-....-....---..............-..-.-...-.-......  36
66        83    .C.A.CG-A..CAA.-....-.........T.....N.....-N.-N-...-.-......  32
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75        45                                                      .-.-......  38
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Query_26  3088  GCTAACAAAG-CCC--G--AAAGGAAGC-TGAGTTGGC-TG-CTGCCACCGCTGAGCAAT  3139
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Query_26  3189  GCTGAAA  3195
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Gapped
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Query= CMR200018.122

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Query_27  1     TCTCG-ATCCCGCGAAATTAATAC-GACTC-ACTATAGGGG--AATT-GTGAG-CGGA-T  52
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Query_27  201   CCAGACACTTCCGCAGACAGAGCGGCAATACCTCTCCGGCCACGGATGCGACGACACAGT  260
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Query_27  261   AGAATGGGACTTTTTCTGTACCGACGGACGTAACTCCGGTCGATGGACGAAAATAGGCGT  320

Query_27  321   CCCCTCTTGCTGGGAGTTGCAGGGTTTTGGTACCTATCAGTATGGAATTAGTTTTTATGG  380

Query_27  381   TAAAGCCTTTCCCGAAGGCATTGCCGGTGAGAAAGGAATGTATAAATATGAGTTTGAAGT  440

Query_27  441   TCCCGAGGAATTTCGTGGCAAGCAGGTCAGCCTTGTGTT--CGAAG-CATCCATGACCGA  497
124       1178                             ......N.....TCN....N..N...NN-....  1147
127       1135                                                           ...  1133

Query_27  498   TACGGAAGTTAAGGTTAACGGACGTAAGG--CAGGAT-CGAAACACCA-GGGAGCCTTCT  553
124       1146  .NNC.G..N......--...N-.......GC......TN.....C...A...........  1090
127       1132  .T..........N-......NCGT.....--.G.AG.-....G.-...-..N.NNN.NNG  1079

Query_27  554   ATTGCTTTTCATATAATGTCACGGATTTACTG-AAATATGGCAAGAA-GAAT-CAGCTGG  610
124       1089  .....................N..........N...NNN........A....-......N  1031
127       1078  --..N.N..N-..GN.NN..NN..NA..NAN.-G...TNN.......-.C..T...N...  1024

Query_27  611   AAGTAACAGTTTCCAAGGAG-AGTGAGAATGCCA-GTGTGAATCTTGCCGAACGGCGCGC  668
124       1030  ...GT...............N.............A..N.......-..............  972
127       1023  .GN..N-.N...N....N..-..NN.N...A...-...N..T....A.-.....A....A  968

Query_27  669   CGATTATTGGAACTTTGGCGGTATCTTCCGCCCGGTATTTCTGGAAGTAAAACCTGCCGT  728
124       971   -...A..-....................................................  914
124       421                                 .....A...........               405
127       967   ....-...A..........N....N......G....NN..N..-.......-........  911
127       420                                 .....A...........               404

Query_27  729   CAATCTCCGTCATATTGCTATTGATGCACAAA-TGG-ACGGATCATTCCGTGCCAATTGC  786
124       913   ....N...........................A...N..A....................  854
127       910   N...................G....AN.....-...-..............N.....-..  854

Query_27  787   TACACGAATATCTCCGGTGACGGAATGAGTATCCGTGCACAGATTTTGGACGGTAAA-GG  845
124       853   .........................................................A..  794
127       853   ....N....................................................-..  795
83        461                                                        ....-..  456
85        464                                                        ....-..  459
110       505                                                        ....-..  510
111       500                                                        ....-..  505
112       501                                                        ....-..  506
87        452                                                        ....-..  447

Query_27  846   GAAGAAACTGGCAGATACCACCGTACCCCTAAAAGCCGGAAGCGACTGGACTACTTTACA  905
124       793   ............................................................  734
127       794   ............................................................  735
83        455   ..........                                                    446
85        458   ..........                                                    449
110       511   ..........                                                    520
111       506   ..........                                                    515
112       507   ..........                                                    516
87        446   ..........                                                    437

Query_27  906   A-TTGAACGTTTCTGCCCCTGCCTTATGGACGGCAGAAACTCCGAATCTTTATAAA-GCT  963
124       733   .-......................................................-...  676
127       734   .N......................................................A...  675
93        1075                                          ..............        1088

Query_27  964   CAATTTTCACTGTTGGATAAAGGAGGTAAAGTCCTGCATCATGAGACCGAGACATTCGGT  1023
124       675   ............................................................  616
127       674   ............................................................  615

Query_27  1024  TTCCGTACTATCGAAGTTCGTGAAAGTGACGGATTGTACGTGAACGGGGTGCGTATCAAC  1083
124       615   ............................................................  556
127       614   ............................................................  555

Query_27  1084  GTGCGTGGTGTCAACCGTCATAGTTTCCGTCCCGAAAGCGGTCGTACCCTAAGTAAAGCG  1143
124       555   ............................................................  496
127       554   ............................................................  495

Query_27  1144  AAGAATATTGAAGATGTACTTCTGATGAAGGGCATGAATATGAATTCTGTCCGTCTGAGC  1203
124       495   ...........G................................................  436
127       494   ...........G................................................  435

Query_27  1204  CACTATCCGGCGGACCCGGAATTTCTGGAAGCATGCGACTCTCTTGGACTCTATGTTATG  1263
124       435   ............................................................  376
124       943                 .....T...........                               927
129       1160                    ......TC.A....N-..NCN.................-...  1121
127       434   ............................................................  375

Query_27  1264  GATGAACTGGGTGGCTGGCATGGCAAGTACGACACCCCTACGGGAGTACGTCTGATTGAA  1323
124       375   ............................................................  316
129       1120  -.N.NNT--........C..........T.NNN--..N.N--.....-...N....-...  1070
127       374   ............................................................  315
121       330                                                       ........  323
33        120                                                       ........  127
55        43                                                           .....  39

Query_27  1324  GGCATGATAGAACGTGATGTGAACCATCCGTCCATTATCTGGTGGAGC-AATGGTAATGA  1382
124       315   ................................................-...........  257
129       1069  .C......-..........................-......N.-...N...........  1013
127       314   ................................................-...........  256
119       365      ...G.T.C...G...AG...T.....TAGTG.....AT......T-.T.........  310
32        41       ...G.T.C...G...AG...T.....TAGTG.....AT......T-.T.........  96
121       322   ...T...A....                                                  311
33        128   ...T...A....                                                  139
55        38    .........                                                     30

Query_27  1383  AAAAGGCTGGAACATTGAACTGGACGGAGAATTCCATAAATACGATCTGCAGAAACGCCC  1442
36        14     ..........-................................................  71
124       256   ............................................................  197
129       1012  ..................-.......-..N...........N..................  955
127       255   ............................................................  196
37        1            .....................................................  53
119       309   ..                                                            308
32        97    ..                                                            98

Query_27  1443  GGTCATCCATCCGCAAGGTAACTTCTCCGGTTTCGAAA-CCATGCACTATCGTTCGTATG  1501
36        72    ......................................-.....................  130
124       196   ......................................-.....................  138
129       954   ...........................N.A........A.....................  895
127       195   ......................................-.....................  137
37        54    ......................................-.....................  112
17        431                               .......T..-..........             412
29        430                               .......T..-..........             411
137       629                               .......T..-..........             648

Query_27  1502  GAGAAAGCCAGAACTACATGCGCCTGCCGGAAATCTTTATGCCTACTGAATTCCTGCATG  1561
36        131   ...............................................C.G..........  190
124       137   ...............................................C.G..........  78
129       894   ..................................................N.........  835
127       136   ...............................................C.G..........  77
37        113   ...............................................C.G..........  172

Query_27  1562  GTTTGT-ACGACGGAGGTCATGGTGCCGGCCTGTATGATTACTGGGAAATGATGCGTAAA  1620
36        191   ......-.....................................................  249
124       77    ......-.....................................................  19
129       834   ......-.....................................................  776
127       76    ......A.N...................................................  17
37        173   ......-.....................................................  231

Query_27  1621  CATCCGCGTTGTATCGGTGGTTTCCTGTGGGTATTGGCGGATGAAGGCGTGAAGCGCGTG  1680
36        250   ............................................................  309
124       18    ........-.....                                                6
129       775   ............................................................  716
127       16    .........                                                     8
37        232   ............................................................  291
134       729                                                          .....  725
131       426                                                          .....  422
126       725                                                          .....  721
123       727                                                          .....  723
120       727                                                          .....  723
21        427                                                          .....  431
19        430                                                          .....  434

Query_27  1681  GATATGGACGGGTTCATAGACAATCAGGGAAATTTCGGAGCTGACGGAATTGTAGGCCCT  1740
36        310   ............................................................  369
129       715   ............................................................  656
37        292   ............................................................  351
134       724   .........                                                     716
131       421   .........                                                     413
126       720   .........                                                     712
123       722   .........                                                     714
120       722   .........                                                     714
21        432   .........                                                     440
19        435   .........                                                     443

Query_27  1741  CACCATGAAAAGGAAGGCAGCTATTACACTATCAA-GCAGCTATGGAGCCCGGTGCAGGT  1799
36        370   ...................................-........................  428
129       655   ...................................A........................  596
37        352   ...................................-........................  410

Query_27  1800  TATGAATACCGCTATCGACCGGAATTTCGACGGTAAACTCTCTGTGGAGAACCGTTATGA  1859
36        429   ............................................................  488
129       595   ............................................................  536
37        411   ............................................................  470

Query_27  1860  TTATCTGAACCTGAACACCTGTCGTTTTATCTGGCAGCAAGTGAAGTTCCCGTCGGTAAC  1919
36        489   ............................................................  548
129       535   ............................................................  476
37        471   ............................................................  530

Query_27  1920  GGATGCTTCCAATACAACTACACGGATTC-TGAAACAAGGTGAAGTGCAAGGAAGCGATG  1978
36        549   .............................-..............................  607
129       475   .............................-..............................  417
37        531   .............................T........................N.....  590

Query_27  1979  TAGCAGCCCATGGAGTGGGAGTGGTGGATATCAAGACTTCTATTCTTCCCGAAGCGGATG  2038
36        608   ............................................................  667
129       416   ............................................................  357
37        591   ............................................................  650

Query_27  2039  CTCTTTTCCTGACAGTTATAGATAAATATGGGTATGAACTTTGGCGCTGGACTTTCCCCG  2098
36        668   ............................................................  727
129       356   ............................................................  297
37        651   ..................N............A............N...............  710

Query_27  2099  TA-GATAAACTGAATCGGG-AAACAG-AACAGTTTT-CTGCAT-CA-TCCGGCC-GTGTA  2151
36        728   ..-................-......-.........-......-..-.......-.....  780
129       296   ..-................-......-.........-......-..-.......-.....  244
37        711   ..TN..T.........N..A......A...N.....N......N..T.......TT....  770

Query_27  2152  TCCTATAC-GGAAA--CAGAAAAAGG--TATTACGGT--AAAAGCAAACGGGCGTAC---  2201
36        781   ........-.....--..........--.........--..................---  830
129       243   ........-.....--..........--.........--..................---  194
39        22                                                        .....---  26
37        771   ......N.N.....ACN.T.......NTNT..N.T.NTA......N.N....GNNC.ACT  830

Query_27  2202  TTTTGTCTTTT--CAAAGAAAGACGGGCAGCTGAAAGATGTATCCGTCAATAACCGTAAG  2259
36        831   ...........--...............................................  888
129       193   ...........--...............................................  136
39        27    ...........--...............................................  84
37        831   ...........TCA.......                                         851

Query_27  2260  ATTAGTTTTGCTAACGGTCCCCGTTTTATCGGTGCAACTCGTGCAGACCGTTCCCTAGAT  2319
36        889   ....................................CG......................  948
129       135   ............................................................  76
39        85    ............................................................  144

Query_27  2320  CAGTTCTATAATCATGATGACGAAAAAGCCAAGGCAAAGGACCGTACTTACAGTGAATTT  2379
36        949   ......................................................TG....  1008
129       75    .........................................................-..  17
39        145   ............................................................  204

Query_27  2380  ACCGATGCGGCAGTCTTCACGAAACTGGATGTGAAAGAAGAgggggggAATCTGATCCTC  2439
36        1009  .........................................-......N...........  1067
129       16    ......N.N.GN...                                               2
39        205   ............................................................  264

Query_27  2440  ACCGCTAATTATAAACTGGGTAATTTAG-ATAAAGCTCAGTGGACAA-TTCATCCGGACG  2497
36        1068  ......T..--NT....-..N.T..A..A..................T..........NC  1124
39        265   ............................-..................-............  322

Query_27  2498  GCATGGCTACTCTTGATTATACCTACAACTTCTCCGGTGTGGTAGACCTGATGGGTATTT  2557
36        1125  ............-....--NNN.......C.NCT.......                     1162
39        323   ............................................................  382

Query_27  2558  GCTTTGATTACCCTGAAGAACAAGTGCTCAGCAAGCGTTGGTTGGGAGCAGGTCCGTATC  2617
39        383   ............................................................  442

Query_27  2618  GTGTATGGCAGAATCGTATTCATGGCACGCAGTATGATATCTGGGAGAATGATTATAACG  2677
39        443   ............................................................  502

Query_27  2678  ATCCTATTCCGGGTGAGACATTCACCTATCCTGAATTCAAGGGATATTTTGGCAGTGTCT  2737
39        503   ............................................................  562

Query_27  2738  CTTGGATGAGTATTCGCACGAAAGAGGGAACCATCAGCCTGACGAATGAAACACCTGATT  2797
39        563   ............................................................  622

Query_27  2798  CCTATATCGGAGTATATCAACCCCGTGATGGTCGTGACCGGTTACTGTATACACTTCCCG  2857
39        623   ............................................................  682

Query_27  2858  AAAGCGGAATTTCTGTTTTGAATGTAATTCCTCCGGTGCGTAATAAAGTAAATTCCACGG  2917
39        683   ............................................................  742

Query_27  2918  ACTTGTGCGGTCCTTCTTCACAACCAAAATGGGTGGATGGCTCGCAAACGGGACGCCTTG  2977
39        743   .............................................-..............  801

Query_27  2978  TTATCCGGTTTGAA-TAACATTGGAAGTGGATAACGGATCCGAATTCGAGCTCCGTCGA-  3035
39        802   ..............-............................................-  859
83        129               ..-............................................-  84
85        132               ..-............................................-  87
110       838               ..-............................................A  884
27        836          .....---............................................-  884
23        837          .....---..........................N.....C...........-  885
111       839               ..-................................N...........-  884
112       835               ..-............................N.-.............-  879
40        133               ..-............................................-  88
26        140           ......A............................................-  90
49        134               ..-............................................-  89
115       135                  ............................................-  92
64        136             ...G-............................................-  89
60        138             ...G-............................................-  91
44        134               ..-............................................-  89
42        133               ..-............................................-  88
38        133               ..-............................................-  88
35        130               ..-............................................-  85
116       133          .....---............................................-  85
56        134                .-............................................-  90
14        135               ..-............................................-  90
28        140           ......A............................................-  90
0         134               ..-............................................-  89
46        136               ..-............................................-  91
30        131                  ............................................-  88
12        138               ..-............................................-  93
3         135               ..-............................................-  90
88        120               ..-............................................-  75
31        134                  ............................................-  91
24        140           ......A............................................-  90
5         135               ..-............................................-  90
62        140             ...G-............................................-  93
34        135                  ............................................-  92
8         138             ....-............................................-  91
22        139           ......A............................................-  89
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47        139               ..-............................................-  94
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58        116                .-............................................-  72
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54        121                .-............................................-  77
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66        130              ..G-...................T.....N....A....TC.T..G.N-  84
79        66               ...-....................--.....                    39
75        68               ...-....................--.....                    41
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77        66               ...-....................--.....                    39
15        61                   ....................--.....                    37
20        65                   ....................--.....                    41
18        65                   ....................--.....                    41

Query_27  3036  CAAGCTT-GCGGCCG-CACT-CGAGcaccaccaccaccacca-cT-G-AGA-T-CCGGCT  3087
39        860   .......-.......-....-....---..............-..-.-...-.N......  909
83        83    .......-.......-....-....---..............-..-.-...-.-......  35
85        86    .......-.......-....-.....................-..-.-...-.-......  35
110       885   .......-.......-....-...............--....-..T.-...-.-......  935
27        885   .......T.......-....-.....................-..-.-.N.-.C......  938
23        886   .......-.......-....-...N........-........-..-.-...-.-......  936
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112       880   .......-....T..-....T.................N...N..-.-...-.-......  933
40        87    .......-.......-....-.....................-..-.-...-.-......  36
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0         88    .......-..N....-....-.....................-..-.-...-.-......  37
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54        76    ......A-A...N..-....-.....................T..-.-...-.C......  23
69        84    ....NN.-.......-....-....---..............-..-.-...-.-......  36
66        83    .C.A.CG-A..CAA.-....-.........T.....N.....-N.-N-...-.-......  32
79        43                                                      .-.-......  36
75        45                                                      .-.-......  38
81        43                                                      .-.-......  36
77        43                                                      .-.-......  36
15        41                                                      .-.-......  34
20        45                                                      .-.-......  38
18        45                                                      .-.-......  38

Query_27  3088  GCTAACAAAG-CCC--G--AAAGGAAGC-TGAGTTGGC-TG-CTGCCACCGCTGAGCAAT  3139
39        910   ..........-...--.--.........T.........N..-.....N............  963
83        34    ..........-...--.--.......                                    14
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42        35    ..........-...--.--....N.G..                                  13
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28        37    ..........-...G-.--...N...                                    16
0         36    ..........-...--.--...A...                                    16
46        38    ..........-...--N--...                                        22
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3         37    ..........-...--.--...A...                                    17
88        22    ....T.....-...--.--....                                       5
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24        37    ..N.......-...--.--.....                                      19
5         37    ..........C...--.--...A...                                    16
62        40    ..........-...                                                28
34        38    ..........-...--.A-.......                                    17
8         38    ..........-...CGA--.......                                    16
22        36    .........N-...--N--...A.N..                                   15
73        37    ..........-...--.AA........                                   14
47        41    .........N-..N--.--...AN...                                   20
87        22    ......-...-...--A--..                                         8
68        36    ..........C...--.--...A....                                   14
51        21    ..........-...--.--....                                       4
58        22    ..........-...--.--..                                         7
71        34    ..........C...--.--....A...                                   12
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Query_28  201   CCGTGAGGTAGCATC--CTTCAACGACGGTTGGGAATTCAAGAAAGGTCCGTTTTCCAA-  257
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Query_28  258   AGAAGCATTGCAG---GCTGTACAGAAATGGAATTCAGACTGGCAGGAGGTATCCATCCC  314
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Query_28  315   ACATACTTGGAATGCGGACGACATGCAAAAGCAAGCC-TCCGCTTTCTATGAAGGTGTAG  373
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Query_28  374   GCTACTACCGCAAAAAGTTCACTTTCCCCGAAAATATGGAAGGCAAGCGCATCTTTCTAC  433
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Query_28  434   GCTTCGAGGGTGTAGGTTCTTATGCCGAAGTATATATCAATGGCTATCTGGCAGGAACAC  493
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Query_28  494   ACAAAGGAGCTTACTCTGCTTTTGCATGCGAGATCAGCTCGCAAGTGAAGTTCGGCAAGG  553
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Query_28  554   AAAACGAAATTATAGTAAAGGCAGACAACTCCTCACGTCCCGATGTTATCCCCACGAACC  613
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Query_28  786   CTTAGCTCCCGTC-CCACTGGAACTAGAGAATGCAA---TATACGACAGGAACGGCAAAT  841
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Query_28  896   ATTC--CTCACAC-TTCCGACTGAACA-ATCCCCA-TT-TATGGCAAGGACGTGAAGA-C  948
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Query_28  1005  AGTTATTCAGCC-CCTGGG-GATT-CGCAAGTA-TGAAATC-GTGG-CAGGCAAAGG-AT  1057
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Query_28  1058  T-C-TTCCTCAATGGAAAGAAGTA-CCCCATG-CTGGGGGTAAC-CC--GCCAT--CAAG  1108
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Query_28  1109  --AC-TGGTGGGG-AC-TGGGTAGCGCCCTCACCAATAAAGAGCACGACTTCGACTTGGC  1163
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Query_28  1164  ACA-AATTATGGATATCGGTGCAACCACCG-TCCGCTTTGCACATTACCAACAGT-CT--  1218
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Query_28  1219  GACTAC--ATCTA-TT-CACGCTGCGACACGCTGGGATTGGTAATCTGGGCAGAG-ATCC  1273
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Query_28  1274  CCTTCGTGAACCGA-GTC--AGCGGCCAAGAGT--GGGACAATGCCCACCAACAGA-TGC  1327
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Query_28  1328  G-CGAACTTATCCGTCAAAGCTTTAATCATCCCT-CC-ATCTA-TGTA-TGGGG-AA---  1378
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Query_28  1379  TCCATAA-TGCTG-TGTAT-CAT-CCGCA-TGGTTA-TACC-GCCGCACTT-ACCCAATC  1430
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Query_28  1431  CA-TT-CAC-GACCTCTGCAAA-CTGG-A-GGATCCAGA-CCGCTA-CACGGTTGCGGT-  1481
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Query_28  1482  AAATG-GTTACGGTC-A-TGCCGATCACCCCG-TCAA-CCAA-AATGCGGATATACA-GG  1534
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Query_28  1535  GCATGAACCGTTACTTC-GGTTGGTACGA-AC-GGAAGATACAAGACATCAAGCCATGGA  1591
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Query_28  1592  TAGAGAAAA-T-GG-AAAAAGAAT-AT---CCTTGGCAACGCCTGATGCTGACAGAATAT  1644
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Query_28  1645  GGTGCAGACGCC-AATATAGAACATCAGACGGAAATAT-TGGGCGATGCACTGAATT--G  1700
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Query_28  1701  GACAAGCCCTTTCTATCCGGAAACATTTCAAACTAAAACC-CACGAATACCAATGGAGCA  1759
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Query_28  1760  TCATTGCCCAACATCCTTACATCATCGCTTCTTACCTGTGGAATATGTTCGACTTTGCAG  1819
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20        550   ............................................................  491
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34        620   .A...T.T..G........T..TC.T........TT.A...........T..........  561
68        614   .G.....TG....C........T..T.........T.............T..T.....T.  555
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69        613   .G.....TG....C........T..T.........T.............T..T.....T.  554

Query_28  1820  TGCCAACATCAAAAAGAGGCAGTGTAGACGCCCGCAACATGAAAGGCATGATGACTTTCG  1879
15        486   ............................................................  427
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Query_28  1880  ATCGTAGAATCAAGAAAGATTCTTATTTCTGGTATAAGGCGAACTGGAGCAAGGAACCGT  1939
15        426   ...........................................................   368
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20        66                                                              ..  65
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26        133                                                              .  133
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60        135                                                             ..  134
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56        133                                                              .  133
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38        131                                                              .  131
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12        136                                                              .  136
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3         133                                                              .  133
88        118                                                              .  118
24        133                                                              .  133
5         133                                                              .  133
8         134                                                              .  134
22        132                                                              .  132
47        137                                                              .  137
87        118                                                              .  118
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66        137                                                    ......GGA..  127
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77        63                                                               .  63

Query_28  1940  AACATTGGAAGTGGATAACGGATCCGAATTCGAGCTCCGTCGA-CAAGCTT-GCGGCCG-  1996
15        60    ...................--.....                                    37
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77        62    ...................--.....                                    39

Query_28  1997  CACT-CGAGcaccaccaccaccacca-cT-G-AGA-T-CCGGCTGCTAACAAAG-CCC--  2047
15        41                                      .-.-................-...--  21
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20        45                                      .-.-................-...--  25
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110       899   ....-...............--....-..T.-...-.-................-..N--  948
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Query_28  2048  G--AAAGGAAGC-TGAGTTGGC-TG-CTGCCACCGCTGAGCAATAAC-TAG-CA-TAAC-  2098
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Query_28  2099  C-CCTT-GGGGCCTCTAAACGGGTCTT--GAGG-GG--TTTTTTGCTGAAA  2142
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Query= CMR200019.106

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Query_29  1     TCTCG-ATCCCGCGAAATTAATAC-GACTC-ACTATAGGGG--AATT-GTGAG-CGGA-T  52
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Query_29  201   CCGTGAGGTAGCATC--CTTCAACGACGGTTGGGAATTCAAGAAAGGTCCGTTTTCCAA-  257
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Query_29  258   AGAAGCATTGCAG---GCTGTACAGAAATGGAATTCAGACTGGCAGGAGGTATCCATCCC  314
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Query_29  315   ACATACTTGGAATGCGGACGACATGCAAAAGCAAGCC-TCCGCTTTCTATGAAGGTGTAG  373
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Query_29  374   GCTACTACCGCAAAAAGTTCACTTTCCCCGAAAATATGGAAGGCAAGCGCATCTTTCTAC  433
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Query_29  434   GCTTCGAGGGTGTAGGTTCTTATGCCGAAGTATATATCAATGGCTATCTGGCAGGAACAC  493
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Query_29  494   ACAAAGGAGCTTACTCTGCTTTTGCATGCGAGATCAGCTCGCAAGTGAAGTTCGGCAAGG  553
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Query_29  554   AAAACGAAATTATAGTAAAGGCAGACAACTCCTCACGTCCCGATGTTATCCCCACGAACC  613
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Query_29  614   ACATTTTGTTCGGTGTTTATGGAGGTATTTACCGCCCCGTATGGCTGGTTGTTACGGAAA  673
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Query_29  674   CTTGCAGCATCATTGC---AAACGACTGTGCCTCTCCGGGAGTGTATATTACCCAGAAAA  730
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Query_29  731   ATGTTTCAAAGAAGT-CAGCCGA--AG-TGACTGTAAAAGTAAAGGTGGACAATGC-AAC  785
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Query_29  786   CTTAGCTCCCGTC-CCACTGGAACTAGAGAATGCAA---TATACGACAGGAACGGCAAAT  841
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Query_29  842   TGGTAAAGAAACA--TAGTCAGAATTTCGAACTTACT-CCACAA-GG-AGTGCAG-AACT  895
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Query_29  896   ATTC--CTCACAC-TTCCGACTGAACA-ATCCCCA-TT-TATGGCAAGGACGTGAAGA-C  948
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Query_29  949   CCAT--A-TCTGTATAAAGTCGT-TTCACGTCTCATGCAGAATGGACGCGTGATAGACGA  1004
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Query_29  1005  AGTTATTCAGCC-CCTGGG-GATT-CGCAAGTA-TGAAATC-GTGG-CAGGCAAAGG-AT  1057
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Query_29  1058  T-C-TTCCTCAATGGAAAGAAGTA-CCCCATG-CTGGGGGTAAC-CC--GCCAT--CAAG  1108
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Query_29  1109  --AC-TGGTGGGG-AC-TGGGTAGCGCCCTCACCAATAAAGAGCACGACTTCGACTTGGC  1163
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Query_29  1164  ACA-AATTATGGATATCGGTGCAACCACCG-TCCGCTTTGCACATTACCAACAGT-CT--  1218
15        1149  ...N.......A......NNNNNN..N.-.-.N................N.....-..TG  1093
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Query_29  1219  GACTAC--ATCTA-TT-CACGCTGCGACACGCTGGGATTGGTAATCTGGGCAGAG-ATCC  1273
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Query_29  1274  CCTTCGTGAACCGA-GTC--AGCGGCCAAGAGT--GGGACAATGCCCACCAACAGA-TGC  1327
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Query_29  1328  G-CGAACTTATCCGTCAAAGCTTTAATCATCCCT-CC-ATCTA-TGTA-TGGGG-AA---  1378
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Query_29  1379  TCCATAAT--CAGGTGTAT-CAT-CCGCA-TGGTTA-TACC-GCCGCACTT-ACCCAATC  1430
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Query_29  1431  CA-TT-CAC-GACCTCTGCAAA-CTGG-A-GGATCCAGA-CCGCTA-CACGGTTGCGGT-  1481
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Query_29  1482  AAATG-GTTACGGTC-A-TGCCGATCACCCCG-TCAA-CCAA-AATGCGGATATACA-GG  1534
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Query_29  1535  GCATGAACCGTTACTTC-GGTTGGTACGA-AC-GGAAGATACAAGACATCAAGCCATGGA  1591
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Query_29  1592  TAGAGAAAA-T-GG-AAAAAGAAT-AT---CCTTGGCAACGCCTGATGCTGACAGAATAT  1644
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Query_29  1645  GGTGCAGACGCC-AATATAGAACATCAGACGGAAATAT-TGGGCGATGCACTGAATT--G  1700
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Query_29  1701  GACAAGCCCTTTCTATCCGGAAACATTTCAAACTAAAACC-CACGAATACCAATGGAGCA  1759
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69        673   .GA..AA.....T.....T..G..T..C..G..A....GTA..T..G..T..G......G  614

Query_29  1760  TCATTGCCCAACATCCTTACATCATCGCTTCTTACCTGTGGAATATGTTCGACTTTGCAG  1819
15        546   ............................................................  487
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Query_29  1820  TGCCAACATCAAAAAGAGGCAGTGTAGACGCCCGCAACATGAAAGGCATGATGACTTTCG  1879
15        486   ............................................................  427
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69        553   ....T.TG.GGG.GC.T..AG.A..TCCT..A..T...T....G..A...G.A.......  494

Query_29  1880  ATCGTAGAATCAAGAAAGATTCTTATTTCTGGTATAAGGCGAACTGGAGCAAGGAACCGT  1939
15        426   ...........................................................   368
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18        66                                                              ..  65
20        430   ...........................................................   372
20        66                                                              ..  65
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26        133                                                              .  133
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60        135                                                             ..  134
116       129                                                             ..  128
64        133                                                             ..  132
56        133                                                              .  133
44        132                                                              .  132
42        131                                                              .  131
38        131                                                              .  131
35        128                                                              .  128
14        133                                                              .  133
0         132                                                              .  132
46        134                                                              .  134
28        133                                                              .  133
12        136                                                              .  136
62        137                                                             ..  136
3         133                                                              .  133
88        118                                                              .  118
24        133                                                              .  133
5         133                                                              .  133
8         134                                                              .  134
22        132                                                              .  132
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77        63                                                               .  63

Query_29  1940  AACATTGGAAGTGGATAACGGATCCGAATTCGAGCTCCGTCGA-CAAGCTT-GCGGCCG-  1996
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Query_29  1997  CACT-CGAGcaccaccaccaccacca-cT-G-AGA-T-CCGGCTGCTAACAAAG-CCC--  2047
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Query_29  2048  G--AAAGGAAGC-TGAGTTGGC-TG-CTGCCACCGCTGAGCAATAAC-TAG-CA-TAAC-  2098
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20        24    N--...A...                                                    17
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Query= CMR200019.107

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Query_30  315   ACATACTTGGAATGCGGACGACATGCAAAAGCAAGCC-TCCGCTTTCTATGAAGGTGTAG  373
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Query_30  434   GCTTCGAGGGTGTAGGTTCTTATGCCGAAGTATATATCAATGGCTATCTGGCAGGAACAC  493
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Query_30  731   ATGTTTCAAAGAAGT-CAGCCGA--AG-TGACTGTAAAAGTAAAGGTGGACAATGC-AAC  785
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Query_30  786   CTTAGCTCCCGTC-CCACTGGAACTAGAGAATGCAA---TATACGACAGGAACGGCAAAT  841
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Query_30  842   TGGTAAAGAAACA--TAGTCAGAATTTCGAACTTACT-CCACAA-GG-AGTGCAG-AACT  895
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Query_30  949   CCAT--A-TCTGTATAAAGTCGT-TTCACGTCTCATGCAGAATGGACGCGTGATAGACGA  1004
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Query_30  1005  AGTTATTCAGCC-CCTGGG-GATT-CGCAAGTA-TGAAATC-GTGG-CAGGCAAAGG-AT  1057
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Query_30  1058  T-C-TTCCTCAATGGAAAGAAGTA-CCCCATG-CTGGGGGTAAC-CC--GCCAT--CAAG  1108
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Query_30  1109  --AC-TGGTGGGG-AC-TGGGTAGCGCCCTCACCAATAAAGAGCACGACTTCGACTTGGC  1163
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Query_30  1164  ACA-AATTATGGATATCGGTGCAACCACCG-TCCGCTTTGCACATTACCAACAGT-CT--  1218
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Query_30  1274  CCTTCGTGAACCGA-GTC--AGCGGCCAAGAGT--GGGACAATGCCCACCAACAGA-TGC  1327
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Query_30  1328  G-CGAACTTATCCGTCAAAGCTTTAATCATCCCT-CC-ATCTA-TGTA-TGGGG-AA---  1378
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Query_30  1379  TCCATAA-TGAAG-TGTAT-CAT-CCGCA-TGGTTA-TACC-GCCGCACTT-ACCCAATC  1430
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Query_30  1431  CA-TT-CAC-GACCTCTGCAAA-CTGG-A-GGATCCAGA-CCGCTA-CACGGTTGCGGT-  1481
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Query_30  1482  AAATG-GTTACGGTC-A-TGCCGATCACCCCG-TCAA-CCAA-AATGCGGATATACA-GG  1534
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Query_30  1535  GCATGAACCGTTACTTC-GGTTGGTACGA-AC-GGAAGATACAAGACATCAAGCCATGGA  1591
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Query_30  1592  TAGAGAAAA-T-GG-AAAAAGAAT-AT---CCTTGGCAACGCCTGATGCTGACACAGTAT  1644
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73        784   .G..AGGTT-N-..-.....A.T.-.C---..C.....GAAA......T...........  732
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Query_30  1645  GGTGCAGACGCC-AATATAGAACATCAGACGGAAATAT-TGGGCGATGCACTGAATT--G  1700
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20        665   ............-.........................-..................--.  610
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Query_30  1701  GACAAGCCCTTTCTATCCGGAAACATTTCAAACTAAAACC-CACGAATACCAATGGAGCA  1759
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20        609   ........................................-...................  551
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Query_30  1760  TCATTGCCCAACATCCTTACATCATCGCTTCTTACCTGTGGAATATGTTCGACTTTGCAG  1819
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Query_30  1820  TGCCAACATCAAAAAGAGGCAGTGTAGACGCCCGCAACATGAAAGGCATGATGACTTTCG  1879
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Query_30  1880  ATCGTAGAATCAAGAAAGATTCTTATTTCTGGTATAAGGCGAACTGGAGCAAGGAACCGT  1939
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18        66                                                              ..  65
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20        66                                                              ..  65
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30        132                                                             ..  131
34        500   ......A...ACGC..G...G...TC.AT...........A........T.....G...   442
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23        841                                                             ..  842
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111       841                                                              .  841
40        131                                                              .  131
26        133                                                              .  133
115       135                                                              .  135
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60        135                                                             ..  134
116       129                                                             ..  128
64        133                                                             ..  132
56        133                                                              .  133
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42        131                                                              .  131
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35        128                                                              .  128
14        133                                                              .  133
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28        133                                                              .  133
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3         133                                                              .  133
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24        133                                                              .  133
5         133                                                              .  133
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58        115                                                              .  115
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66        137                                                    ......GGA..  127
79        63                                                               .  63
75        65                                                               .  65
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77        63                                                               .  63

Query_30  1940  AACATTGGAAGTGGATAACGGATCCGAATTCGAGCTCCGTCGA-CAAGCTT-GCGGCCG-  1996
15        60    ...................--.....                                    37
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20        64    ...................--.....                                    41
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Query_30  1997  CACT-CGAGcaccaccaccaccacca-cT-G-AGA-T-CCGGCTGCTAACAAAG-CCC--  2047
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Query_30  2048  G--AAAGGAAGC-TGAGTTGGC-TG-CTGCCACCGCTGAGCAATAAC-TAG-CA-TAAC-  2098
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Query_30  2099  C-CCTT-GGGGCCTCTAAACGGGTCTT--GAGG-GG--TTTTTTGCTGAAA  2142
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Gapped
Lambda      K        H
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Effective search space used: 325352916


Query= CMR200020.106

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Query_31  150   TCAT-CC--G-CAGTTCG-AAAAGGGTA-CCGAGAA-CCTGTACTT-CCAAT-CCAATGC  200
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Query_31  201   CCAGACTGTACAGCCGGAATGGCAGAGCCAGTATGCTATCGGAAAAAACAAACTGGCACC  260
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110       154   .                                                             154
105       160   .                                                             160
86        152   ...                                                           154
98        164   ...                                                           166
96        160   .                                                             160
9         155   .                                                             155
103       162   .                                                             162
89        153   ...                                                           155
59        144   ........                                                      151
17        149   .A..T..                                                       155
84        149   ...                                                           151
111       152   .                                                             152
82        150   ...                                                           152
112       156   .                                                             156
100       151   ...                                                           153
95        161   .                                                             161
94        163   .                                                             163
102       160   .                                                             160
80        152   ..                                                            153
29        148   .A..T..                                                       154
97        162   .                                                             162
104       163   .                                                             163
61        138   ........                                                      145
76        150   ..                                                            151
78        148   ..                                                            149
99        144   ...                                                           146
87        799   .                                                             799
122       905   .A...G..                                                      898
101       157   ...                                                           159
137       915   ...                                                           913

Query_31  261   ACATACTTATATATGGCCTTATGCGA--ATG-CTGATGCTGCGGGTGAAGGGAATTATGA  317
70        212   ..........................--...-............................  268
114       228   ..........................--...-............................  284
74        206   ..........................--...-............................  262
72        211   ..........................--...-............................  267
93        219   T.........G.G.........CAA.CC..AT.....A-.C..--.A.C..AG.......  275
90        206   T.........G.G.........CAA.CC..AT.....A-.C..--.A.C..AG.......  262
91        202   T.........G.G.........CAA.CC..AT.....A-.C..--.A.C..AG.......  258

Query_31  318   GCAATCACCTTATTATATGAGTCTGAACGGTAAGTGGAAATTCCACTGGGTGAAGAATCC  377
70        269   ............................................................  328
114       285   ............................................................  344
74        263   ............................................................  322
72        268   ............................................................  327
93        276   ATCT..T.........................GT...........T.....A........  335
90        263   ATCT..T.........................GT...........T.....A........  322
91        259   ATCT..T.........................GT...........T.....A........  318

Query_31  378   CGATCATCGTCCGAAAGACTTTTATAAACCTTCGTTCTATACGGGCGGATGGGCAGATAT  437
70        329   ........................................................G...  388
114       345   ........................................................G...  404
74        323   ........................................................G...  382
72        328   ........................................................G...  387
93        336   ....A.C........G..T...........GGG...T.....A..A........G.....  395
90        323   ....A.C........G..T...........GGG...T.....A..A........G.....  382
91        319   ....A.C........G..T...........GGG...T.....A..A........G.....  378

Query_31  438   CGATGTACCCGGTAACTGGGAGCGTCAGGGATATGGTACGGCTATTTATGTGAACGAAAC  497
70        389   ............................................................  448
114       405   ..........................N.................................  464
74        383   ............................................................  442
72        388   ............................................................  447
93        396   TC.G..T.....C..T.....A..C..A........A..A...........A........  455
90        383   TC.G..T.....C..T.....A..C..A........A..A...........A........  442
91        379   TC.G..T.....CN.T.....A..C..A........A..A..........NA........  438

Query_31  498   TTATGAATTTGATGATCCTTTGTTCAACTTCAAAAAGAATCCTCCGCTGGTACCTTATGC  557
70        449   ............................................................  508
114       465   ............................................................  524
74        443   ............................................................  502
72        448   ............................................................  507
93        456   C.....G..C.....CAAAC.....C.T..T...........G..TT.A..T..A...AA  515
90        443   C.....G..C.....CAAAC.....C.T..T...........G..TT.A..T..A...AA  502
91        439   C.....G..C.....CAAAC.....CNT..T...........G..TT.A..T..A...AA  498

Query_31  558   AGAGAACGAAGTAGGTTCTTATCGCCGTACGTTCACGGTTCCTGCTGACTGGAAAGACCG  617
70        509   ............................................................  568
114       525   .N..........................................................  584
74        503   N.........N.................................................  562
72        508   ............................................................  567
93        516   ......T.....C.....C..CA.A.....C..T..AA.......C..T...G.......  575
90        503   ......T.....C.....C..CA.A.....C..T..AA.......C..T...G.......  562
91        499   ......N.....C.....C..                                         519

Query_31  618   TCGCATCGTGATTTGCTGTGAAGGTGTGATCTCTTTCTATTATATCTGGGTGAACGGACA  677
70        569   ............................................................  628
114       585   N.N....NN..................................................N  644
74        563   ............................................................  622
72        568   ............................................................  627
93        576   C..TG.G..T..C..T........A.....T.....T..C.....T..............  635
90        563   C..TG.G..T..C..T........A.....T.....T..C.....T..............  622

Query_31  678   TATGCTGGGTTATAACCAGGGTTCAAAGACT-CCTGCCGAATGGGATATCACGGACTATG  736
70        629   ...............................-............................  687
114       645   ...............................-............................  703
74        623   ...............................N............................  682
72        628   .........N.....................-..................N.....      682
93        636   .C..T....C.....T..A...........A-..G.................T..TA.AT  694
90        623   .C..T....C.....T..A...........A-..G.................T..TA.AT  681

Query_31  737   TACAGGCAGGAGAAAATATCGTGGCACTTGAAG-TATATCGCTGGAGTGCAGGTTCCTAT  795
70        688   .................................-..........................  746
114       704   ...........N.....................-.................T........  762
74        683   .................................-..........................  741
93        695   .GA..AA...T..G....CG......T.G..G.-.T..C..T.....C..C..A..G...  753
90        682   .GA..AA...T..G....CG......T.G..G.T.T..C..T.....C..C..A..G...  741

Query_31  796   CTGGAGTGTCAGGATATGTGGCGGTTGAGTGGCATTGAACGGGATGTCTATC-TTTACAG  854
70        747   ....................................................-.......  805
114       763   .....................N........................CNN...-.....N.  821
74        742   ........-NN.........................................-..NN...  799
93        754   T.......C.......................T........T.....G....T.......  813
90        742   T.......C.......................T........T.....G....-.......  800

Query_31  855   TACTCCACGCCAGTTTATAGCTGATTATAAAGT-GACTT-CTTCTTTGGA-TAAGAAAGA  911
70        806   .................................-.....-.......N..T.........  863
114       822   -............-...................-.....N......NN..-.........  877
74        800   N...                                                          803
93        814   C.....TAAA....A......C...........-A..C.-.......A..-C..AC..C.  870
90        801   C.....TAAA....A......C...........AA..C.-.......A..-C..AC..C.  858

Query_31  912   GTAT-AAGGAAGGATTTTTCGGCCTTGATGTAACAGTTGAAGGAAGTGCGACTGGTGTGT  970
70        864   ....-.........-................-....................CT......  920
114       878   NATN-.C.T..NN.......N...........C...N....N....A........C....  936
93        871   A...A...A....TA.......                                        892
90        859   A...-...A.N..TA.......TT.G..A.CT..CN.......GCC.T.T...TCCA..A  917

Query_31  971   CTA-CTTTGGCATATAGTCTGGAAGATACTGCCGGAAAGACAATATTACAAAATGAAATA  1029
70        921   ...-.....A.N................................NC.........G..N.  979
114       937   ...-...N...N...N...........................C.-.N....TGN..T..  994
90        918   ...C.....CTT..CC.A..........                                  945

Query_31  1030  CCGATCAAGAACC-GTGG-TTTG-AGTAATTCTATTATCTTTGACGAACAGTCTCTTCCA  1086
70        980   ......N......G.N.C-....-..N.N.C......NN............NT...NT..  1037
114       995   TGN....TN....-....C....N.CNN........                          1029

Query_31  1087  GGTGTAAAACGTTGGAGTGCAGAACATCCGAATCTTTATACGTTAATATTGACGTTG-AA  1145
70        1038  -...GT.......-..NNCANN....NT.CN.NNN...-N....CN.........NNA..  1094
93        1061              ..N.....T..N.................                     1089
127       708               ....CG......AC..............                      681
124       708               ....CG......AC..............                      681

Query_31  1146  AGATGATGCAGGACATA-TAACACACCTGACCGGT-TGCAAAGTTGGTTTC-CGTACTTC  1202
70        1095  .........N.N..TN.T.T............C..C...-.......A...T..N..N..  1153

Query_31  1203  TGAAATCAAGGATGGCCGTTTTTGTATCAACGGGGTACCTATATTGATAAAAGGTGCTAA  1262
70        1154  ..G..N....A....NNNNN......A.N..                               1184

Query_31  1263  CCGGCATGAACATTCACAGTTGGGACGTACTGTCAGCAAAGAACTGATGGAAGAAGACAT  1322

Query_31  1323  TCGCTTGATGAAGCAACATAACCTGAATACTGTGCGCAACTCGCATTATCCGACACATCC  1382

Query_31  1383  GTACTGGTATCAACTCTGCGACCGTTACGGCCTTTATGTGATAGATGAAGCAAACATCGA  1442

Query_31  1443  ATCGCATGGTATGGGGTATGGCCCGGCTTCATTGGCAAAGGATAGCACTTGGCTGCCTGC  1502

Query_31  1503  ACACATGGACCGTACGCAACGTATGTACGAACGTGCCAAGAACCATCCGGGGATCGTGAT  1562

Query_31  1563  CTGGTCGTTGGGCAACGCTGCGGGTAACGGAATCAATTTTGAACGGACATATGATTGGAT  1622
70        619                                          ..............         632
74        613                                          ..............         626
72        618                                          ..............         631

Query_31  1623  GAAGTCCGTTGAAACCACCCGCCCTATACAATACGAGCGTGCCGAACAGAATTATAATAC  1682

Query_31  1683  GGATATCTACTGCCGTATGTACCGCAGTGTGGAAGAATTGCTGGCCTATGCCCGCCAGAC  1742

Query_31  1743  AGAACCGAAAGTGTATCGCCCTTTCATCATGACTGAATATCTGCATGCTATGGGCAATAG  1802

Query_31  1803  CGGAGGCGGATTGAAAGAATACATGGATGTTTTCGAAACAGAACCTATAGTGCAGGGCGG  1862

Query_31  1863  TTGTATCTGGGATTGGGTAGATCAGTCTTTCCGTGAAATAGATGCCGATGGTCGTTGGTA  1922

Query_31  1923  TTGGACTTACGGTGGTGATTATGGTCCGAAGAATGTACCCAGTTTCGGGAACTTTTGCTG  1982
60        249           ..............                                        262
64        247           ..............                                        260
62        251           ..............                                        264

Query_31  1983  CAATGGTCTGGTGAATGCTGTCCGCGAACCTCATCCGCATTTGCTGGAAGTGAAGAAAGC  2042
55        209                           ..............                        196

Query_31  2043  ATATCAATATATAAAGACTACATTGATTGATAAGAGCAACTTGACTTTAAGTATAAAGAA  2102

Query_31  2103  TTGGTATGATTTTACGAATCTCAATGCTTATACCTTACACTGGCAGGTGGTAGGTGATCA  2162

Query_31  2163  TGGGAAAGTGATTACTGATGGTACTCGTCGGGTAGATGCCGCTCCGCACGCCACC-GTTG  2221
24        1145                                                   ......-..N.  1136
26        1148                                                   ......C....  1138

Query_31  2222  AA---GTTACGCTGG-G-T-GCT-GT-ACG-TTTA--CCTT-CT--G-A-TGTT-CGTGA  2264
24        1135  ..A--..........A.-.N..NN..N...G....AC.N..-..--.-.A....T...N.  1083
26        1137  G.AAG......NN..-.G.-...-..T...-...N--....T..--.N.-....-..N..  1088
49        1106              ...-N-.-...-..-.AA-G..G--....-..AC.-.-.T.C-G....  1071
44        1076                                                          ....  1073

Query_31  2265  AGCTTA--TCTGAACTTAAGTTGG--ACGT-CT-GT-GGATGCTGC-TCCG-TTTA-TTA  2314
24        1082  ......N-...........N....NA....-.N-..N.........-....-....-...  1029
26        1087  ...C.NAT........N....G.N--..NNN..N..-.N.......-....-G...A...  1033
22        1047                                        ..N.....N...NN....-...  1027
49        1070  G.....--.-....TC.NTC....--...C-..-.A-TA.G..AAN-N..C-....-.GN  1022
44        1072  G.....--.T....T.NNTTC...--...C-..-.A-TA.G..AA.-...C-....-..G  1023
46        1057                       ...--...C-..-.A-TA.G..AA.-N..C-....-..G  1027

Query_31  2315  A-TACGG-A-TTACG-A-GGTA-GCC-T-ATGACCAATTTGTTCTTT-C--GGGTAA-TA  2362
24        1028  .-.....-.-.....-.-....A...-.T..................T.--......-..  978
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49        1021  .--..TC-.-.G...-.-A..G-...N.-...N...G.....A..G.-.--TNCC..-..  974
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47        1017                          ..-.-.......G..-..A..G.-.--TNCC..-.T  989

Query_31  2363  A-GAAC--TACC-GGGCT-CCGGAAAC-TAAACTTTCGGGTAA-GGTGGA-AATGAATAT  2414
24        977   .-....--....N.....-........-...............-......-.........  925
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Query_31  2415  AGA-TCCGGCAACAGGGGCGCTT-CAC--TCTTATATT-TATAATGGG-AAA-GAATTA-  2466
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Query_31  2467  CTGG-TTTCCCCCGTTACATTGAGCCTCTATCGTCCGGTGACGGATAA-TGATAACCGTG  2524
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Query_31  2525  AAAAAGTAGGAGGAGCCAAAGCTTGGAAGAAA-GCTGGGTTGGATCAG----TTAACACA  2579
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Query_31  2580  GCGTGCCCTTACCGTGAAGACTTCT--ACCCGCAGTGGACGTGCCGAAGTGGAATTATTA  2637
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Query_31  2638  AATG-TCCGTGGTGAAAAAGT-GGGAA-CCGCTTCTTTCATCTATACACTAAAGAAAAAT  2694
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Query_31  2695  GGCGAATTGGATATACAGACACACTTTGT-GCCGGATACTACCGTTATCACTTCACTGGC  2753
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Query_31  2754  GCGTGTAGGGCTTACTTTTGAAATGCCCGATGCTTACAATCAGGTGTCTTATCTGGGGCG  2813
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Query_31  2814  TGGAGAGCATGAAACTTATATGGATCGTAATCAATCCGGTAAAATAGGTATTTATCACAC  2873
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Query_31  2874  CGATGTGGAGAGTATGTTCCACTATTATGTTCGTCCGCAGGCAACGGGTAACCGTACGGA  2933
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Query_31  2934  TGTCCGTTGGATGCAACTTGCTGATGAGGCAGGTGAGGGGCTGGCATTCCGTTCCGATGC  2993
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Query_31  2994  CTCGTTTCAGTTTAGTGTGATTCCTTTTACGGATGAGAATCTGGATGCGGCAACGCATAT  3053
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Query_31  3054  CAATCAATTACGGCGCGATGGAGTGGTAACTGTTCATCTGGATGCCGCACAGGCAGGAGT  3113
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44        283   T...A..C.TGA.A.AACA..GA.TA...A......CT.A.....G.A....T.G..G..  224
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47        288   T...A..C.TGA.A.AACA..GA.TA...A......CT.A.....G.A....T.G..G..  229

Query_31  3114  CGGTACGGCTACCTGTGGTCCTGGAGTATTGCCGCAGTATCGTGTACCTGTGCAGGATTA  3173
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44        223   A.....T..G..T........G..G..........CA........T..G...G..A.GC.  164
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47        228   A.....T..G..T........G..G..........CA........T..G...G..A.GC.  169

Query_31  3174  CATATTCCGGTTTACAATCCGTCCTTTGAAATAACATTGGAAGTGGATAACGGATCCGAA  3233
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Query_31  3234  TTCGAGCTCCGTCGA-CAAGCTT-GCGGCCG-CACT-CGAGcaccaccaccaccacca-c  3288
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Query_31  3289  T-G-AGA-T-CCGGCTGCTAACAAAG-CCC--G--AAAGGAAGC-TGAGTTGGC-TG-CT  3336
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Query_31  3337  GCCACCGCTGAGCAATAAC-TAG-CA-TAAC-C-CCTT-GGGGCCTCTAAACGGGTCTT-  3389
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Query= CMR200020.107

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Query_32  1     TCTCG-ATCCCGCGAAATTAATAC-GACTC-ACTATAGGGG--AATT-GTGAG-CGGA-T  52
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95        161   .                                                             161
94        163   .                                                             163
102       160   .                                                             160
80        152   ..                                                            153
29        148   .A..T..                                                       154
97        162   .                                                             162
104       163   .                                                             163
61        138   ........                                                      145
76        150   ..                                                            151
78        148   ..                                                            149
99        144   ...                                                           146
87        799   .                                                             799
122       905   .A...G..                                                      898
101       157   ...                                                           159
137       915   ...                                                           913

Query_32  261   ACATACTTATATATGGCCTTATGCGA--ATG-CTGATGCTGCGGGTGAAGGGAATTATGA  317
70        212   ..........................--...-............................  268
114       228   ..........................--...-............................  284
74        206   ..........................--...-............................  262
72        211   ..........................--...-............................  267
93        219   T.........G.G.........CAA.CC..AT.....A-.C..--.A.C..AG.......  275
90        206   T.........G.G.........CAA.CC..AT.....A-.C..--.A.C..AG.......  262
91        202   T.........G.G.........CAA.CC..AT.....A-.C..--.A.C..AG.......  258

Query_32  318   GCAATCACCTTATTATATGAGTCTGAACGGTAAGTGGAAATTCCACTGGGTGAAGAATCC  377
70        269   ............................................................  328
114       285   ............................................................  344
74        263   ............................................................  322
72        268   ............................................................  327
93        276   ATCT..T.........................GT...........T.....A........  335
90        263   ATCT..T.........................GT...........T.....A........  322
91        259   ATCT..T.........................GT...........T.....A........  318

Query_32  378   CGATCATCGTCCGAAAGACTTTTATAAACCTTCGTTCTATACGGGCGGATGGGCAGATAT  437
70        329   ........................................................G...  388
114       345   ........................................................G...  404
74        323   ........................................................G...  382
72        328   ........................................................G...  387
93        336   ....A.C........G..T...........GGG...T.....A..A........G.....  395
90        323   ....A.C........G..T...........GGG...T.....A..A........G.....  382
91        319   ....A.C........G..T...........GGG...T.....A..A........G.....  378

Query_32  438   CGATGTACCCGGTAACTGGGAGCGTCAGGGATATGGTACGGCTATTTATGTGAACGAAAC  497
70        389   ............................................................  448
114       405   ..........................N.................................  464
74        383   ............................................................  442
72        388   ............................................................  447
93        396   TC.G..T.....C..T.....A..C..A........A..A...........A........  455
90        383   TC.G..T.....C..T.....A..C..A........A..A...........A........  442
91        379   TC.G..T.....CN.T.....A..C..A........A..A..........NA........  438

Query_32  498   TTATGAATTTGATGATCCTTTGTTCAACTTCAAAAAGAATCCTCCGCTGGTACCTTATGC  557
70        449   ............................................................  508
114       465   ............................................................  524
74        443   ............................................................  502
72        448   ............................................................  507
93        456   C.....G..C.....CAAAC.....C.T..T...........G..TT.A..T..A...AA  515
90        443   C.....G..C.....CAAAC.....C.T..T...........G..TT.A..T..A...AA  502
91        439   C.....G..C.....CAAAC.....CNT..T...........G..TT.A..T..A...AA  498

Query_32  558   AGAGAACGAAGTAGGTTCTTATCGCCGTACGTTCACGGTTCCTGCTGACTGGAAAGACCG  617
70        509   ............................................................  568
114       525   .N..........................................................  584
74        503   N.........N.................................................  562
72        508   ............................................................  567
93        516   ......T.....C.....C..CA.A.....C..T..AA.......C..T...G.......  575
90        503   ......T.....C.....C..CA.A.....C..T..AA.......C..T...G.......  562
91        499   ......N.....C.....C..                                         519

Query_32  618   TCGCATCGTGATTTGCTGTGAAGGTGTGATCTCTTTCTATTATATCTGGGTGAACGGACA  677
70        569   ............................................................  628
114       585   N.N....NN..................................................N  644
74        563   ............................................................  622
72        568   ............................................................  627
93        576   C..TG.G..T..C..T........A.....T.....T..C.....T..............  635
90        563   C..TG.G..T..C..T........A.....T.....T..C.....T..............  622

Query_32  678   TATGCTGGGTTATAACCAGGGTTCAAAGACT-CCTGCCGAATGGGATATCACGGACTATG  736
70        629   ...............................-............................  687
114       645   ...............................-............................  703
74        623   ...............................N............................  682
72        628   .........N.....................-..................N.....      682
93        636   .C..T....C.....T..A...........A-..G.................T..TA.AT  694
90        623   .C..T....C.....T..A...........A-..G.................T..TA.AT  681

Query_32  737   TACAGGCAGGAGAAAATATCGTGGCACTTGAAG-TATATCGCTGGAGTGCAGGTTCCTAT  795
70        688   .................................-..........................  746
114       704   ...........N.....................-.................T........  762
74        683   .................................-..........................  741
93        695   .GA..AA...T..G....CG......T.G..G.-.T..C..T.....C..C..A..G...  753
90        682   .GA..AA...T..G....CG......T.G..G.T.T..C..T.....C..C..A..G...  741

Query_32  796   CTGGAGTGTCAGGATATGTGGCGGTTGAGTGGCATTGAACGGGATGTCTATC-TTTACAG  854
70        747   ....................................................-.......  805
114       763   .....................N........................CNN...-.....N.  821
74        742   ........-NN.........................................-..NN...  799
93        754   T.......C.......................T........T.....G....T.......  813
90        742   T.......C.......................T........T.....G....-.......  800

Query_32  855   TACTCCACGCCAGTTTATAGCTGATTATAAAGT-GACTT-CTTCTTTGGA-TAAGAAAGA  911
70        806   .................................-.....-.......N..T.........  863
114       822   -............-...................-.....N......NN..-.........  877
74        800   N...                                                          803
93        814   C.....TAAA....A......C...........-A..C.-.......A..-C..AC..C.  870
90        801   C.....TAAA....A......C...........AA..C.-.......A..-C..AC..C.  858

Query_32  912   GTAT-AAGGAAGGATTTTTCGGCCTTGATGTAACAGTTGAAGGAAGTGCGACTGGTGTGT  970
70        864   ....-.........-................-....................CT......  920
114       878   NATN-.C.T..NN.......N...........C...N....N....A........C....  936
93        871   A...A...A....TA.......                                        892
90        859   A...-...A.N..TA.......TT.G..A.CT..CN.......GCC.T.T...TCCA..A  917

Query_32  971   CTA-CTTTGGCATATAGTCTGGAAGATACTGCCGGAAAGACAATATTACAAAATGAAATA  1029
70        921   ...-.....A.N................................NC.........G..N.  979
114       937   ...-...N...N...N...........................C.-.N....TGN..T..  994
90        918   ...C.....CTT..CC.A..........                                  945

Query_32  1030  CCGATCAAGAACC-GTGG-TTTG-AGTAATTCTATTATCTTTGACGAACAGTCTCTTCCA  1086
70        980   ......N......G.N.C-....-..N.N.C......NN............NT...NT..  1037
114       995   TGN....TN....-....C....N.CNN........                          1029

Query_32  1087  GGTGTAAAACGTTGGAGTGCAGAACATCCGAATCTTTATACGTTAATATTGACGTTG-AA  1145
70        1038  -...GT.......-..NNCANN....NT.CN.NNN...-N....CN.........NNA..  1094
93        1061              ..N.....T..N.................                     1089
127       708               ....CG......AC..............                      681
124       708               ....CG......AC..............                      681

Query_32  1146  AGATGATGCAGGACATA-TAACACACCTGACCGGT-TGCAAAGTTGGTTTC-CGTACTTC  1202
70        1095  .........N.N..TN.T.T............C..C...-.......A...T..N..N..  1153

Query_32  1203  TGAAATCAAGGATGGCCGTTTTTGTATCAACGGGGTACCTATATTGATAAAAGGTGCTAA  1262
70        1154  ..G..N....A....NNNNN......A.N..                               1184

Query_32  1263  CCGGCATGAACATTCACAGTTGGGACGTACTGTCAGCAAAGAACTGATGGAAGAAGACAT  1322

Query_32  1323  TCGCTTGATGAAGCAACATAACCTGAATACTGTGCGCAACTCGCATTATCCGACACATCC  1382

Query_32  1383  GTACTGGTATCAACTCTGCGACCGTTACGGCCTTTATGTGATAGATGAAGCAAACATCGA  1442

Query_32  1443  ATCGCATGGTATGGGGTATGGCCCGGCTTCATTGGCAAAGGATAGCACTTGGCTGCCTGC  1502

Query_32  1503  ACACATGGACCGTACGCAACGTATGTACGAACGTGCCAAGAACCATCCGGGGATCGTGAT  1562

Query_32  1563  CTGGTCGTTGGGCAACGAAGCGGGTAACGGAATCAATTTTGAACGGACATATGATTGGAT  1622
70        619                                          ..............         632
74        613                                          ..............         626
72        618                                          ..............         631

Query_32  1623  GAAGTCCGTTGAAACCACCCGCCCTATACAATACGAGCGTGCCGAACAGAATTATAATAC  1682

Query_32  1683  GGATATCTACTGCCGTATGTACCGCAGTGTGGAAGAATTGCTGGCCTATGCCCGCCAGAC  1742

Query_32  1743  AGAACCGAAAGTGTATCGCCCTTTCATCATGACTGCTTATCTGCATGCTATGGGCAATAG  1802

Query_32  1803  CGGAGGCGGATTGAAAGAATACATGGATGTTTTCGAAACAGAACCTATAGTGCAGGGCGG  1862

Query_32  1863  TTGTATCTGGGATTGGGTAGATCAGTCTTTCCGTGAAATAGATGCCGATGGTCGTTGGTA  1922

Query_32  1923  TTGGACTTACGGTGGTGATTATGGTCCGAAGAATGTACCCAGTTTCGGGAACTTTTGCTG  1982
60        249           ..............                                        262
64        247           ..............                                        260
62        251           ..............                                        264

Query_32  1983  CAATGGTCTGGTGAATGCTGTCCGCGAACCTCATCCGCATTTGCTGGAAGTGAAGAAAGC  2042
55        209                           ..............                        196

Query_32  2043  ATATCAATATATAAAGACTACATTGATTGATAAGAGCAACTTGACTTTAAGTATAAAGAA  2102

Query_32  2103  TTGGTATGATTTTACGAATCTCAATGCTTATACCTTACACTGGCAGGTGGTAGGTGATCA  2162

Query_32  2163  TGGGAAAGTGATTACTGATGGTACTCGTCGGGTAGATGCCGCTCCGCACGCCACC-GTTG  2221
24        1145                                                   ......-..N.  1136
26        1148                                                   ......C....  1138

Query_32  2222  AA---GTTACGCTGG-G-T-GCT-GT-ACG-TTTA--CCTT-CT--G-A-TGTT-CGTGA  2264
24        1135  ..A--..........A.-.N..NN..N...G....AC.N..-..--.-.A....T...N.  1083
26        1137  G.AAG......NN..-.G.-...-..T...-...N--....T..--.N.-....-..N..  1088
49        1106              ...-N-.-...-..-.AA-G..G--....-..AC.-.-.T.C-G....  1071
44        1076                                                          ....  1073

Query_32  2265  AGCTTA--TCTGAACTTAAGTTGG--ACGT-CT-GT-GGATGCTGC-TCCG-TTTA-TTA  2314
24        1082  ......N-...........N....NA....-.N-..N.........-....-....-...  1029
26        1087  ...C.NAT........N....G.N--..NNN..N..-.N.......-....-G...A...  1033
22        1047                                        ..N.....N...NN....-...  1027
49        1070  G.....--.-....TC.NTC....--...C-..-.A-TA.G..AAN-N..C-....-.GN  1022
44        1072  G.....--.T....T.NNTTC...--...C-..-.A-TA.G..AA.-...C-....-..G  1023
46        1057                       ...--...C-..-.A-TA.G..AA.-N..C-....-..G  1027

Query_32  2315  A-TACGG-A-TTACG-A-GGTA-GCC-T-ATGACCAATTTGTTCTTT-C--GGGTAA-TA  2362
24        1028  .-.....-.-.....-.-....A...-.T..................T.--......-..  978
26        1032  .-.....-NN.....N.-....-...-.T..................-.CG......-..  980
22        1026  .A.....-.-.....-.A....-...-.-..........-.......-.--......A..  977
28        977                                                         ...-..  973
49        1021  .--..TC-.-.G...-.-A..G-...N.-...N...G.....A..G.-.--TNCC..-..  974
44        1022  G-A..TNC.-.G..N-.-.TGN-C.T-.-...N...G.....A..G.-.--TNC-..-..  975
46        1026  G-A..NC-.-.G.N.-.-A..G-...-.-N..G...G.....A...--.--T.CC..-..  980
47        1017                          ..-.-.......G..-..A..G.-.--TNCC..-.T  989

Query_32  2363  A-GAAC--TACC-GGGCT-CCGGAAAC-TAAACTTTCGGGTAA-GGTGGA-AATGAATAT  2414
24        977   .-....--....N.....-........-...............-......-.........  925
26        979   .A...NN-....-.A.N.T........-...............-......-.........  925
22        976   .-....N-....-.....-......-.-.......-.......A......-.........  925
28        972   .-....--....-.....-....N...N............N.--....A.-.........  921
49        973   .A.GNG--..T.-.T..G-.......T-C...T.GG.T.A...-....A.-G..AG....  921
44        974   .-A.GGG-..T.-.T..G-...N...T-C...-.GG.T.A...-....A.-G..AG....  923
46        979   .-AGGG--..T.-.T..G-.......T-C...T.GG.T.A...-..NNA.-G..AG....  928
47        988   .-A..GGG..T.-.T..G-.......T-C...T.GG.T.A...A....A.GN..AG....  933

Query_32  2415  AGA-TCCGGCAACAGGGGCGCTT-CAC--TCTTATATT-TATAATGGG-AAA-GAATTA-  2466
24        924   ...-...................-...--.........-.........N...-......-  872
26        924   ...-...................-...--.........-.........-...-......-  873
22        924   ...-...................-...--.........-.........-...A......A  871
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49        920   T..-...T.....C..C..TT.A-.G.--........A-.....A..T-...-..GA.G-  869
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47        932   T..A...T.....CN..-.....-T..GC.........A.....A.A.T...-..GA.G-  877

Query_32  2467  CTGG-TTTCCCCCGTTACATTGAGCCTCTATCGTCCGGTGACGGATAA-TGATAACCGTG  2524
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Query_32  2525  AAAAAGTAGGAGGAGCCAAAGCTTGGAAGAAA-GCTGGGTTGGATCAG----TTAACACA  2579
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Query_32  2580  GCGTGCCCTTACCGTGAAGACTTCT--ACCCGCAGTGGACGTGCCGAAGTGGAATTATTA  2637
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Query_32  2638  AATG-TCCGTGGTGAAAAAGT-GGGAA-CCGCTTCTTTCATCTATACACTAAAGAAAAAT  2694
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Query_32  2695  GGCGAATTGGATATACAGACACACTTTGT-GCCGGATACTACCGTTATCACTTCACTGGC  2753
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Query_32  2754  GCGTGTAGGGCTTACTTTTGAAATGCCCGATGCTTACAATCAGGTGTCTTATCTGGGGCG  2813
24        584   ............................................................  525
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44        583   TA.A..G..C..GG.A...........GT....C..T..CA....T......T....A..  524
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47        588   TA.A..G..C..GG.A...........GT....C..T..CA....T......T....A..  529

Query_32  2814  TGGAGAGCATGAAACTTATATGGATCGTAATCAATCCGGTAAAATAGGTATTTATCACAC  2873
24        524   ............................................................  465
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44        523   ...T..A..............A..C........G..T..ATGT..C..A.....C..T..  464
46        525   ...T..A..............A..C........G..T..ATGT..C..A.....C..T..  466
47        528   ...T..A..............A..C........G..T..ATGT..C..A.....C..T..  469

Query_32  2874  CGATGTGGAGAGTATGTTCCACTATTATGTTCGTCCGCAGGCAACGGGTAACCGTACGGA  2933
24        464   ............................................................  405
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47        468   A....CA..AC..........T........GAAG..C.....T..A..A..T........  409

Query_32  2934  TGTCCGTTGGATGCAACTTGCTGATGAGGCAGGTGAGGGGCTGGCATTCCGTTCCGATGC  2993
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47        408   ...G.........G..T.G..G...........A..A..TT..T.T........G...AA  349

Query_32  2994  CTCGTTTCAGTTTAGTGTGATTCCTTTTACGGATGAGAATCTGGATGCGGCAACGCATAT  3053
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47        348   AGT.........CT....T.....A.........TCT...G.A...AAA..T..T.....  289

Query_32  3054  CAATCAATTACGGCGCGATGGAGTGGTAACTGTTCATCTGGATGCCGCACAGGCAGGAGT  3113
24        284   ............................................................  225
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44        283   T...A..C.TGA.A.AACA..GA.TA...A......CT.A.....G.A....T.G..G..  224
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47        288   T...A..C.TGA.A.AACA..GA.TA...A......CT.A.....G.A....T.G..G..  229

Query_32  3114  CGGTACGGCTACCTGTGGTCCTGGAGTATTGCCGCAGTATCGTGTACCTGTGCAGGATTA  3173
24        224   ............................................................  165
26        224   ............................................................  165
22        223   ............................................................  164
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44        223   A.....T..G..T........G..G..........CA........T..G...G..A.GC.  164
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47        228   A.....T..G..T........G..G..........CA........T..G...G..A.GC.  169

Query_32  3174  CATATTCCGGTTTACAATCCGTCCTTTGAAATAACATTGGAAGTGGATAACGGATCCGAA  3233
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26        164   ............................................................  105
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28        164   ............................................................  105
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44        163   T.CG..TGA.....TG..TT....A..A................................  104
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47        168   T.CG..TGA.....TG..TT....A..A................................  109
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85        133                               ................................  102
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111       838                               ................................  869
112       834                               ...............................N  865
40        136                             ..C...............................  103
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38        136                             ..C...............................  103
35        133                             ..C...............................  100
14        136                               ................................  105
60        134                                  .............................  106
56        134                                 ..............................  105
0         135                               ................................  104
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30        131                                  .............................  103
3         136                               ................................  105
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5         136                               ................................  105
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8         136                                ...............................  106
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18        65                                   ....................--.....    41

Query_32  3234  TTCGAGCTCCGTCGA-CAAGCTT-GCGGCCG-CACT-CGAGcaccaccaccaccacca-c  3288
24        104   ...............-......N-N......-....-.....................-.  50
26        104   ...............-.......-.......-....-.....................-.  50
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49        103   ...............-.......-.......-....-.....................-.  49
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Query_32  3289  T-G-AGA-T-CCGGCTGCTAACAAAG-CCC--G--AAAGGAAGC-TGAGTTGGC-TG-CT  3336
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Query_33  99    TATAC-ATATG--CACCAT-CATCATCAT-CATTCTT-CT-GG-TGTAGAT-CTGTGGTC  149
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Query_33  150   TCAT-CC--G-CAGTTCG-AAAAGGGTA-CCGAGAA-CCTGTACTT-CCAAT-CCAATGC  200
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Query_33  201   CCAGACTGTACAGCCGGAATGGCAGAGCCAGTATGCTATCGGAAAAAACAAACTGGCACC  260
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137       915   ...                                                           913

Query_33  261   ACATACTTATATATGGCCTTATGCGA--ATG-CTGATGCTGCGGGTGAAGGGAATTATGA  317
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93        219   T.........G.G.........CAA.CC..AT.....A-.C..--.A.C..AG.......  275
90        206   T.........G.G.........CAA.CC..AT.....A-.C..--.A.C..AG.......  262
91        202   T.........G.G.........CAA.CC..AT.....A-.C..--.A.C..AG.......  258

Query_33  318   GCAATCACCTTATTATATGAGTCTGAACGGTAAGTGGAAATTCCACTGGGTGAAGAATCC  377
70        269   ............................................................  328
114       285   ............................................................  344
74        263   ............................................................  322
72        268   ............................................................  327
93        276   ATCT..T.........................GT...........T.....A........  335
90        263   ATCT..T.........................GT...........T.....A........  322
91        259   ATCT..T.........................GT...........T.....A........  318

Query_33  378   CGATCATCGTCCGAAAGACTTTTATAAACCTTCGTTCTATACGGGCGGATGGGCAGATAT  437
70        329   ........................................................G...  388
114       345   ........................................................G...  404
74        323   ........................................................G...  382
72        328   ........................................................G...  387
93        336   ....A.C........G..T...........GGG...T.....A..A........G.....  395
90        323   ....A.C........G..T...........GGG...T.....A..A........G.....  382
91        319   ....A.C........G..T...........GGG...T.....A..A........G.....  378

Query_33  438   CGATGTACCCGGTAACTGGGAGCGTCAGGGATATGGTACGGCTATTTATGTGAACGAAAC  497
70        389   ............................................................  448
114       405   ..........................N.................................  464
74        383   ............................................................  442
72        388   ............................................................  447
93        396   TC.G..T.....C..T.....A..C..A........A..A...........A........  455
90        383   TC.G..T.....C..T.....A..C..A........A..A...........A........  442
91        379   TC.G..T.....CN.T.....A..C..A........A..A..........NA........  438

Query_33  498   TTATGAATTTGATGATCCTTTGTTCAACTTCAAAAAGAATCCTCCGCTGGTACCTTATGC  557
70        449   ............................................................  508
114       465   ............................................................  524
74        443   ............................................................  502
72        448   ............................................................  507
93        456   C.....G..C.....CAAAC.....C.T..T...........G..TT.A..T..A...AA  515
90        443   C.....G..C.....CAAAC.....C.T..T...........G..TT.A..T..A...AA  502
91        439   C.....G..C.....CAAAC.....CNT..T...........G..TT.A..T..A...AA  498

Query_33  558   AGAGAACGAAGTAGGTTCTTATCGCCGTACGTTCACGGTTCCTGCTGACTGGAAAGACCG  617
70        509   ............................................................  568
114       525   .N..........................................................  584
74        503   N.........N.................................................  562
72        508   ............................................................  567
93        516   ......T.....C.....C..CA.A.....C..T..AA.......C..T...G.......  575
90        503   ......T.....C.....C..CA.A.....C..T..AA.......C..T...G.......  562
91        499   ......N.....C.....C..                                         519

Query_33  618   TCGCATCGTGATTTGCTGTGAAGGTGTGATCTCTTTCTATTATATCTGGGTGAACGGACA  677
70        569   ............................................................  628
114       585   N.N....NN..................................................N  644
74        563   ............................................................  622
72        568   ............................................................  627
93        576   C..TG.G..T..C..T........A.....T.....T..C.....T..............  635
90        563   C..TG.G..T..C..T........A.....T.....T..C.....T..............  622

Query_33  678   TATGCTGGGTTATAACCAGGGTTCAAAGACT-CCTGCCGAATGGGATATCACGGACTATG  736
70        629   ...............................-............................  687
114       645   ...............................-............................  703
74        623   ...............................N............................  682
72        628   .........N.....................-..................N.....      682
93        636   .C..T....C.....T..A...........A-..G.................T..TA.AT  694
90        623   .C..T....C.....T..A...........A-..G.................T..TA.AT  681

Query_33  737   TACAGGCAGGAGAAAATATCGTGGCACTTGAAG-TATATCGCTGGAGTGCAGGTTCCTAT  795
70        688   .................................-..........................  746
114       704   ...........N.....................-.................T........  762
74        683   .................................-..........................  741
93        695   .GA..AA...T..G....CG......T.G..G.-.T..C..T.....C..C..A..G...  753
90        682   .GA..AA...T..G....CG......T.G..G.T.T..C..T.....C..C..A..G...  741

Query_33  796   CTGGAGTGTCAGGATATGTGGCGGTTGAGTGGCATTGAACGGGATGTCTATC-TTTACAG  854
70        747   ....................................................-.......  805
114       763   .....................N........................CNN...-.....N.  821
74        742   ........-NN.........................................-..NN...  799
93        754   T.......C.......................T........T.....G....T.......  813
90        742   T.......C.......................T........T.....G....-.......  800

Query_33  855   TACTCCACGCCAGTTTATAGCTGATTATAAAGT-GACTT-CTTCTTTGGA-TAAGAAAGA  911
70        806   .................................-.....-.......N..T.........  863
114       822   -............-...................-.....N......NN..-.........  877
74        800   N...                                                          803
93        814   C.....TAAA....A......C...........-A..C.-.......A..-C..AC..C.  870
90        801   C.....TAAA....A......C...........AA..C.-.......A..-C..AC..C.  858

Query_33  912   GTAT-AAGGAAGGATTTTTCGGCCTTGATGTAACAGTTGAAGGAAGTGCGACTGGTGTGT  970
70        864   ....-.........-................-....................CT......  920
114       878   NATN-.C.T..NN.......N...........C...N....N....A........C....  936
93        871   A...A...A....TA.......                                        892
90        859   A...-...A.N..TA.......TT.G..A.CT..CN.......GCC.T.T...TCCA..A  917

Query_33  971   CTA-CTTTGGCATATAGTCTGGAAGATACTGCCGGAAAGACAATATTACAAAATGAAATA  1029
70        921   ...-.....A.N................................NC.........G..N.  979
114       937   ...-...N...N...N...........................C.-.N....TGN..T..  994
90        918   ...C.....CTT..CC.A..........                                  945

Query_33  1030  CCGATCAAGAACC-GTGG-TTTG-AGTAATTCTATTATCTTTGACGAACAGTCTCTTCCA  1086
70        980   ......N......G.N.C-....-..N.N.C......NN............NT...NT..  1037
114       995   TGN....TN....-....C....N.CNN........                          1029

Query_33  1087  GGTGTAAAACGTTGGAGTGCAGAACATCCGAATCTTTATACGTTAATATTGACGTTG-AA  1145
70        1038  -...GT.......-..NNCANN....NT.CN.NNN...-N....CN.........NNA..  1094
93        1061              ..N.....T..N.................                     1089
127       708               ....CG......AC..............                      681
124       708               ....CG......AC..............                      681

Query_33  1146  AGATGATGCAGGACATA-TAACACACCTGACCGGT-TGCAAAGTTGGTTTC-CGTACTTC  1202
70        1095  .........N.N..TN.T.T............C..C...-.......A...T..N..N..  1153

Query_33  1203  TGAAATCAAGGATGGCCGTTTTTGTATCAACGGGGTACCTATATTGATAAAAGGTGCTAA  1262
70        1154  ..G..N....A....NNNNN......A.N..                               1184

Query_33  1263  CCGGCATGAACATTCACAGTTGGGACGTACTGTCAGCAAAGAACTGATGGAAGAAGACAT  1322

Query_33  1323  TCGCTTGATGAAGCAACATAACCTGAATACTGTGCGCAACTCGCATTATCCGACACATCC  1382

Query_33  1383  GTACTGGTATCAACTCTGCGACCGTTACGGCCTTTATGTGATAGATGAAGCAAACATCGA  1442

Query_33  1443  ATCGCATGGTATGGGGTATGGCCCGGCTTCATTGGCAAAGGATAGCACTTGGCTGCCTGC  1502

Query_33  1503  ACACATGGACCGTACGCAACGTATGTACGAACGTGCCAAGAACCATCCGGGGATCGTGAT  1562

Query_33  1563  CTGGTCGTTGGGCAACCAGGCGGGTAACGGAATCAATTTTGAACGGACATATGATTGGAT  1622
70        619                                          ..............         632
74        613                                          ..............         626
72        618                                          ..............         631

Query_33  1623  GAAGTCCGTTGAAACCACCCGCCCTATACAATACGAGCGTGCCGAACAGAATTATAATAC  1682

Query_33  1683  GGATATCTACTGCCGTATGTACCGCAGTGTGGAAGAATTGCTGGCCTATGCCCGCCAGAC  1742

Query_33  1743  AGAACCGAAAGTGTATCGCCCTTTCATCATGACTGAATATCTGCATGCTATGGGCAATAG  1802

Query_33  1803  CGGAGGCGGATTGAAAGAATACATGGATGTTTTCGAAACAGAACCTATAGTGCAGGGCGG  1862

Query_33  1863  TTGTATCTGGGATTGGGTAGATCAGTCTTTCCGTGAAATAGATGCCGATGGTCGTTGGTA  1922

Query_33  1923  TTGGACTTACGGTGGTGATTATGGTCCGAAGAATGTACCCAGTTTCGGGAACTTTTGCTG  1982
60        249           ..............                                        262
64        247           ..............                                        260
62        251           ..............                                        264

Query_33  1983  CAATGGTCTGGTGAATGCTGTCCGCGAACCTCATCCGCATTTGCTGGAAGTGAAGAAAGC  2042
55        209                           ..............                        196

Query_33  2043  ATATCAATATATAAAGACTACATTGATTGATAAGAGCAACTTGACTTTAAGTATAAAGAA  2102

Query_33  2103  TTGGTATGATTTTACGAATCTCAATGCTTATACCTTACACTGGCAGGTGGTAGGTGATCA  2162

Query_33  2163  TGGGAAAGTGATTACTGATGGTACTCGTCGGGTAGATGCCGCTCCGCACGCCACC-GTTG  2221
24        1145                                                   ......-..N.  1136
26        1148                                                   ......C....  1138

Query_33  2222  AA---GTTACGCTGG-G-T-GCT-GT-ACG-TTTA--CCTT-CT--G-A-TGTT-CGTGA  2264
24        1135  ..A--..........A.-.N..NN..N...G....AC.N..-..--.-.A....T...N.  1083
26        1137  G.AAG......NN..-.G.-...-..T...-...N--....T..--.N.-....-..N..  1088
49        1106              ...-N-.-...-..-.AA-G..G--....-..AC.-.-.T.C-G....  1071
44        1076                                                          ....  1073

Query_33  2265  AGCTTA--TCTGAACTTAAGTTGG--ACGT-CT-GT-GGATGCTGC-TCCG-TTTA-TTA  2314
24        1082  ......N-...........N....NA....-.N-..N.........-....-....-...  1029
26        1087  ...C.NAT........N....G.N--..NNN..N..-.N.......-....-G...A...  1033
22        1047                                        ..N.....N...NN....-...  1027
49        1070  G.....--.-....TC.NTC....--...C-..-.A-TA.G..AAN-N..C-....-.GN  1022
44        1072  G.....--.T....T.NNTTC...--...C-..-.A-TA.G..AA.-...C-....-..G  1023
46        1057                       ...--...C-..-.A-TA.G..AA.-N..C-....-..G  1027

Query_33  2315  A-TACGG-A-TTACG-A-GGTA-GCC-T-ATGACCAATTTGTTCTTT-C--GGGTAA-TA  2362
24        1028  .-.....-.-.....-.-....A...-.T..................T.--......-..  978
26        1032  .-.....-NN.....N.-....-...-.T..................-.CG......-..  980
22        1026  .A.....-.-.....-.A....-...-.-..........-.......-.--......A..  977
28        977                                                         ...-..  973
49        1021  .--..TC-.-.G...-.-A..G-...N.-...N...G.....A..G.-.--TNCC..-..  974
44        1022  G-A..TNC.-.G..N-.-.TGN-C.T-.-...N...G.....A..G.-.--TNC-..-..  975
46        1026  G-A..NC-.-.G.N.-.-A..G-...-.-N..G...G.....A...--.--T.CC..-..  980
47        1017                          ..-.-.......G..-..A..G.-.--TNCC..-.T  989

Query_33  2363  A-GAAC--TACC-GGGCT-CCGGAAAC-TAAACTTTCGGGTAA-GGTGGA-AATGAATAT  2414
24        977   .-....--....N.....-........-...............-......-.........  925
26        979   .A...NN-....-.A.N.T........-...............-......-.........  925
22        976   .-....N-....-.....-......-.-.......-.......A......-.........  925
28        972   .-....--....-.....-....N...N............N.--....A.-.........  921
49        973   .A.GNG--..T.-.T..G-.......T-C...T.GG.T.A...-....A.-G..AG....  921
44        974   .-A.GGG-..T.-.T..G-...N...T-C...-.GG.T.A...-....A.-G..AG....  923
46        979   .-AGGG--..T.-.T..G-.......T-C...T.GG.T.A...-..NNA.-G..AG....  928
47        988   .-A..GGG..T.-.T..G-.......T-C...T.GG.T.A...A....A.GN..AG....  933

Query_33  2415  AGA-TCCGGCAACAGGGGCGCTT-CAC--TCTTATATT-TATAATGGG-AAA-GAATTA-  2466
24        924   ...-...................-...--.........-.........N...-......-  872
26        924   ...-...................-...--.........-.........-...-......-  873
22        924   ...-...................-...--.........-.........-...A......A  871
28        920   ...-....-........-.....-...--.........-.........-..G-N...-.-  872
49        920   T..-...T.....C..C..TT.A-.G.--........A-.....A..T-...-..GA.G-  869
44        922   T..-...T.....C..C..TT.A-.G.--........A-.....A..T-...-..GA.G-  871
46        927   T..-..NT.....N..C..TT..A.G.--.......A.A.....A..T-...-..GANG-  874
47        932   T..A...T.....CN..-.....-T..GC.........A.....A.A.T...-..GA.G-  877

Query_33  2467  CTGG-TTTCCCCCGTTACATTGAGCCTCTATCGTCCGGTGACGGATAA-TGATAACCGTG  2524
24        871   ....-...........................................-...........  814
26        872   ....-...........................................A...........  814
22        870   ....-...........................................-.....N.....  813
28        871   ....G..........-....-...........................-...........  815
49        868   ..TC-A.-.T..T..AGTTC.C.....T........T..T.....C..-...C.G.A.G.  812
44        870   ..TT-CA..T..T..AGTTC.C.....T........T..T.....C..-...C.G.A.G.  813
46        873   ..TT-CA..T..T..AGTTC.C.....T........T..TC....C..-...C.G.A.G.  816
47        876   ..TT-CA..T..T..AGTTC.C.....-........T..T.....C..-...C.G.A.G.  820

Query_33  2525  AAAAAGTAGGAGGAGCCAAAGCTTGGAAGAAA-GCTGGGTTGGATCAG----TTAACACA  2579
24        813   ................................-...............----........  759
26        813   ................................-...............----........  759
22        812   ................................-...............----........  758
28        814   ................................-...............----........  760
49        811   .....AC..............-.....G....-.AA..T......A.TATGA..C.A.A.  754
44        812   .....AC..............T.N...G....-.AA..T......A.TATGA..C.A.A.  754
46        815   .....AC..............T.....G....A.AA..T......A.TATGA..C.A.A.  756
47        819   .....C-..............T.....G....-.AA..T......A.TATGA..C.A.A.  762

Query_33  2580  GCGTGCCCTTACCGTGAAGACTTCT--ACCCGCAGTGGACGTGCCGAAGTGGAATTATTA  2637
24        758   .........................--.................................  701
26        758   .........................--.................................  701
22        757   ..........N..............--.................................  700
28        759   .........................--.................................  702
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44        753   ..-.A.TT..---..C..AG.A...GA.A.A.--....TAAA..G.....A..G....GG  700
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Query_33  2638  AATG-TCCGTGGTGAAAAAGT-GGGAA-CCGCTTCTTTCATCTATACACTAAAGAAAAAT  2694
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Query_33  2695  GGCGAATTGGATATACAGACACACTTTGT-GCCGGATACTACCGTTATCACTTCACTGGC  2753
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Query_33  2754  GCGTGTAGGGCTTACTTTTGAAATGCCCGATGCTTACAATCAGGTGTCTTATCTGGGGCG  2813
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Query_33  2814  TGGAGAGCATGAAACTTATATGGATCGTAATCAATCCGGTAAAATAGGTATTTATCACAC  2873
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47        528   ...T..A..............A..C........G..T..ATGT..C..A.....C..T..  469

Query_33  2874  CGATGTGGAGAGTATGTTCCACTATTATGTTCGTCCGCAGGCAACGGGTAACCGTACGGA  2933
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Query_33  2934  TGTCCGTTGGATGCAACTTGCTGATGAGGCAGGTGAGGGGCTGGCATTCCGTTCCGATGC  2993
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Query_33  2994  CTCGTTTCAGTTTAGTGTGATTCCTTTTACGGATGAGAATCTGGATGCGGCAACGCATAT  3053
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Query_33  3054  CAATCAATTACGGCGCGATGGAGTGGTAACTGTTCATCTGGATGCCGCACAGGCAGGAGT  3113
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Query_33  3114  CGGTACGGCTACCTGTGGTCCTGGAGTATTGCCGCAGTATCGTGTACCTGTGCAGGATTA  3173
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44        223   A.....T..G..T........G..G..........CA........T..G...G..A.GC.  164
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47        228   A.....T..G..T........G..G..........CA........T..G...G..A.GC.  169

Query_33  3174  CATATTCCGGTTTACAATCCGTCCTTTGAAATAACATTGGAAGTGGATAACGGATCCGAA  3233
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3         136                               ................................  105
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18        65                                   ....................--.....    41

Query_33  3234  TTCGAGCTCCGTCGA-CAAGCTT-GCGGCCG-CACT-CGAGcaccaccaccaccacca-c  3288
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28        104   ...............-.......-.......-....-.....................-.  50
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66        98    .A....TC.T..G.N-.C.A.CG-A..CAA.-....-.........T.....N.....-N  44

Query_33  3289  T-G-AGA-T-CCGGCTGCTAACAAAG-CCC--G--AAAGGAAGC-TGAGTTGGC-TG-CT  3336
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22        48    .-.-...-.-...............N-...--N--...A.N..                   15
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Effective search space used: 518928202


Query= CMR200020.109

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Query_34  150   TCAT-CC--G-CAGTTCG-AAAAGGGTA-CCGAGAA-CCTGTACTT-CCAAT-CCAATGC  200
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Query_34  201   CCAGACTGTACAGCCGGAATGGCAGAGCCAGTATGCTATCGGAAAAAACAAACTGGCACC  260
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96        160   .                                                             160
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111       152   .                                                             152
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Query_34  261   ACATACTTATATATGGCCTTATGCGA--ATG-CTGATGCTGCGGGTGAAGGGAATTATGA  317
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Query_34  318   GCAATCACCTTATTATATGAGTCTGAACGGTAAGTGGAAATTCCACTGGGTGAAGAATCC  377
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Query_34  498   TTATGAATTTGATGATCCTTTGTTCAACTTCAAAAAGAATCCTCCGCTGGTACCTTATGC  557
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Query_34  558   AGAGAACGAAGTAGGTTCTTATCGCCGTACGTTCACGGTTCCTGCTGACTGGAAAGACCG  617
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90        503   ......T.....C.....C..CA.A.....C..T..AA.......C..T...G.......  562
91        499   ......N.....C.....C..                                         519

Query_34  618   TCGCATCGTGATTTGCTGTGAAGGTGTGATCTCTTTCTATTATATCTGGGTGAACGGACA  677
70        569   ............................................................  628
114       585   N.N....NN..................................................N  644
74        563   ............................................................  622
72        568   ............................................................  627
93        576   C..TG.G..T..C..T........A.....T.....T..C.....T..............  635
90        563   C..TG.G..T..C..T........A.....T.....T..C.....T..............  622

Query_34  678   TATGCTGGGTTATAACCAGGGTTCAAAGACT-CCTGCCGAATGGGATATCACGGACTATG  736
70        629   ...............................-............................  687
114       645   ...............................-............................  703
74        623   ...............................N............................  682
72        628   .........N.....................-..................N.....      682
93        636   .C..T....C.....T..A...........A-..G.................T..TA.AT  694
90        623   .C..T....C.....T..A...........A-..G.................T..TA.AT  681

Query_34  737   TACAGGCAGGAGAAAATATCGTGGCACTTGAAG-TATATCGCTGGAGTGCAGGTTCCTAT  795
70        688   .................................-..........................  746
114       704   ...........N.....................-.................T........  762
74        683   .................................-..........................  741
93        695   .GA..AA...T..G....CG......T.G..G.-.T..C..T.....C..C..A..G...  753
90        682   .GA..AA...T..G....CG......T.G..G.T.T..C..T.....C..C..A..G...  741

Query_34  796   CTGGAGTGTCAGGATATGTGGCGGTTGAGTGGCATTGAACGGGATGTCTATC-TTTACAG  854
70        747   ....................................................-.......  805
114       763   .....................N........................CNN...-.....N.  821
74        742   ........-NN.........................................-..NN...  799
93        754   T.......C.......................T........T.....G....T.......  813
90        742   T.......C.......................T........T.....G....-.......  800

Query_34  855   TACTCCACGCCAGTTTATAGCTGATTATAAAGT-GACTT-CTTCTTTGGA-TAAGAAAGA  911
70        806   .................................-.....-.......N..T.........  863
114       822   -............-...................-.....N......NN..-.........  877
74        800   N...                                                          803
93        814   C.....TAAA....A......C...........-A..C.-.......A..-C..AC..C.  870
90        801   C.....TAAA....A......C...........AA..C.-.......A..-C..AC..C.  858

Query_34  912   GTAT-AAGGAAGGATTTTTCGGCCTTGATGTAACAGTTGAAGGAAGTGCGACTGGTGTGT  970
70        864   ....-.........-................-....................CT......  920
114       878   NATN-.C.T..NN.......N...........C...N....N....A........C....  936
93        871   A...A...A....TA.......                                        892
90        859   A...-...A.N..TA.......TT.G..A.CT..CN.......GCC.T.T...TCCA..A  917

Query_34  971   CTA-CTTTGGCATATAGTCTGGAAGATACTGCCGGAAAGACAATATTACAAAATGAAATA  1029
70        921   ...-.....A.N................................NC.........G..N.  979
114       937   ...-...N...N...N...........................C.-.N....TGN..T..  994
90        918   ...C.....CTT..CC.A..........                                  945

Query_34  1030  CCGATCAAGAACC-GTGG-TTTG-AGTAATTCTATTATCTTTGACGAACAGTCTCTTCCA  1086
70        980   ......N......G.N.C-....-..N.N.C......NN............NT...NT..  1037
114       995   TGN....TN....-....C....N.CNN........                          1029

Query_34  1087  GGTGTAAAACGTTGGAGTGCAGAACATCCGAATCTTTATACGTTAATATTGACGTTG-AA  1145
70        1038  -...GT.......-..NNCANN....NT.CN.NNN...-N....CN.........NNA..  1094
93        1061              ..N.....T..N.................                     1089
127       708               ....CG......AC..............                      681
124       708               ....CG......AC..............                      681

Query_34  1146  AGATGATGCAGGACATA-TAACACACCTGACCGGT-TGCAAAGTTGGTTTC-CGTACTTC  1202
70        1095  .........N.N..TN.T.T............C..C...-.......A...T..N..N..  1153

Query_34  1203  TGAAATCAAGGATGGCCGTTTTTGTATCAACGGGGTACCTATATTGATAAAAGGTGCTAA  1262
70        1154  ..G..N....A....NNNNN......A.N..                               1184

Query_34  1263  CCGGCATGAACATTCACAGTTGGGACGTACTGTCAGCAAAGAACTGATGGAAGAAGACAT  1322

Query_34  1323  TCGCTTGATGAAGCAACATAACCTGAATACTGTGCGCAACTCGCATTATCCGACACATCC  1382

Query_34  1383  GTACTGGTATCAACTCTGCGACCGTTACGGCCTTTATGTGATAGATGAAGCAAACATCGA  1442

Query_34  1443  ATCGCATGGTATGGGGTATGGCCCGGCTTCATTGGCAAAGGATAGCACTTGGCTGCCTGC  1502

Query_34  1503  ACACATGGACCGTACGCAACGTATGTACGAACGTGCCAAGAACCATCCGGGGATCGTGAT  1562

Query_34  1563  CTGGTCGTTGGGCAACGAAGCGGGTAACGGAATCAATTTTGAACGGACATATGATTGGAT  1622
70        619                                          ..............         632
74        613                                          ..............         626
72        618                                          ..............         631

Query_34  1623  GAAGTCCGTTGAAACCACCCGCCCTATACAATACGAGCGTGCCGAACAGAATTATAATAC  1682

Query_34  1683  GGATATCTACTGCCGTATGTACCGCAGTGTGGAAGAATTGCTGGCCTATGCCCGCCAGAC  1742

Query_34  1743  AGAACCGAAAGTGTATCGCCCTTTCATCATGACTCAGTATCTGCATGCTATGGGCAATAG  1802

Query_34  1803  CGGAGGCGGATTGAAAGAATACATGGATGTTTTCGAAACAGAACCTATAGTGCAGGGCGG  1862

Query_34  1863  TTGTATCTGGGATTGGGTAGATCAGTCTTTCCGTGAAATAGATGCCGATGGTCGTTGGTA  1922

Query_34  1923  TTGGACTTACGGTGGTGATTATGGTCCGAAGAATGTACCCAGTTTCGGGAACTTTTGCTG  1982
60        249           ..............                                        262
64        247           ..............                                        260
62        251           ..............                                        264

Query_34  1983  CAATGGTCTGGTGAATGCTGTCCGCGAACCTCATCCGCATTTGCTGGAAGTGAAGAAAGC  2042
55        209                           ..............                        196

Query_34  2043  ATATCAATATATAAAGACTACATTGATTGATAAGAGCAACTTGACTTTAAGTATAAAGAA  2102

Query_34  2103  TTGGTATGATTTTACGAATCTCAATGCTTATACCTTACACTGGCAGGTGGTAGGTGATCA  2162

Query_34  2163  TGGGAAAGTGATTACTGATGGTACTCGTCGGGTAGATGCCGCTCCGCACGCCACC-GTTG  2221
24        1145                                                   ......-..N.  1136
26        1148                                                   ......C....  1138

Query_34  2222  AA---GTTACGCTGG-G-T-GCT-GT-ACG-TTTA--CCTT-CT--G-A-TGTT-CGTGA  2264
24        1135  ..A--..........A.-.N..NN..N...G....AC.N..-..--.-.A....T...N.  1083
26        1137  G.AAG......NN..-.G.-...-..T...-...N--....T..--.N.-....-..N..  1088
49        1106              ...-N-.-...-..-.AA-G..G--....-..AC.-.-.T.C-G....  1071
44        1076                                                          ....  1073

Query_34  2265  AGCTTA--TCTGAACTTAAGTTGG--ACGT-CT-GT-GGATGCTGC-TCCG-TTTA-TTA  2314
24        1082  ......N-...........N....NA....-.N-..N.........-....-....-...  1029
26        1087  ...C.NAT........N....G.N--..NNN..N..-.N.......-....-G...A...  1033
22        1047                                        ..N.....N...NN....-...  1027
49        1070  G.....--.-....TC.NTC....--...C-..-.A-TA.G..AAN-N..C-....-.GN  1022
44        1072  G.....--.T....T.NNTTC...--...C-..-.A-TA.G..AA.-...C-....-..G  1023
46        1057                       ...--...C-..-.A-TA.G..AA.-N..C-....-..G  1027

Query_34  2315  A-TACGG-A-TTACG-A-GGTA-GCC-T-ATGACCAATTTGTTCTTT-C--GGGTAA-TA  2362
24        1028  .-.....-.-.....-.-....A...-.T..................T.--......-..  978
26        1032  .-.....-NN.....N.-....-...-.T..................-.CG......-..  980
22        1026  .A.....-.-.....-.A....-...-.-..........-.......-.--......A..  977
28        977                                                         ...-..  973
49        1021  .--..TC-.-.G...-.-A..G-...N.-...N...G.....A..G.-.--TNCC..-..  974
44        1022  G-A..TNC.-.G..N-.-.TGN-C.T-.-...N...G.....A..G.-.--TNC-..-..  975
46        1026  G-A..NC-.-.G.N.-.-A..G-...-.-N..G...G.....A...--.--T.CC..-..  980
47        1017                          ..-.-.......G..-..A..G.-.--TNCC..-.T  989

Query_34  2363  A-GAAC--TACC-GGGCT-CCGGAAAC-TAAACTTTCGGGTAA-GGTGGA-AATGAATAT  2414
24        977   .-....--....N.....-........-...............-......-.........  925
26        979   .A...NN-....-.A.N.T........-...............-......-.........  925
22        976   .-....N-....-.....-......-.-.......-.......A......-.........  925
28        972   .-....--....-.....-....N...N............N.--....A.-.........  921
49        973   .A.GNG--..T.-.T..G-.......T-C...T.GG.T.A...-....A.-G..AG....  921
44        974   .-A.GGG-..T.-.T..G-...N...T-C...-.GG.T.A...-....A.-G..AG....  923
46        979   .-AGGG--..T.-.T..G-.......T-C...T.GG.T.A...-..NNA.-G..AG....  928
47        988   .-A..GGG..T.-.T..G-.......T-C...T.GG.T.A...A....A.GN..AG....  933

Query_34  2415  AGA-TCCGGCAACAGGGGCGCTT-CAC--TCTTATATT-TATAATGGG-AAA-GAATTA-  2466
24        924   ...-...................-...--.........-.........N...-......-  872
26        924   ...-...................-...--.........-.........-...-......-  873
22        924   ...-...................-...--.........-.........-...A......A  871
28        920   ...-....-........-.....-...--.........-.........-..G-N...-.-  872
49        920   T..-...T.....C..C..TT.A-.G.--........A-.....A..T-...-..GA.G-  869
44        922   T..-...T.....C..C..TT.A-.G.--........A-.....A..T-...-..GA.G-  871
46        927   T..-..NT.....N..C..TT..A.G.--.......A.A.....A..T-...-..GANG-  874
47        932   T..A...T.....CN..-.....-T..GC.........A.....A.A.T...-..GA.G-  877

Query_34  2467  CTGG-TTTCCCCCGTTACATTGAGCCTCTATCGTCCGGTGACGGATAA-TGATAACCGTG  2524
24        871   ....-...........................................-...........  814
26        872   ....-...........................................A...........  814
22        870   ....-...........................................-.....N.....  813
28        871   ....G..........-....-...........................-...........  815
49        868   ..TC-A.-.T..T..AGTTC.C.....T........T..T.....C..-...C.G.A.G.  812
44        870   ..TT-CA..T..T..AGTTC.C.....T........T..T.....C..-...C.G.A.G.  813
46        873   ..TT-CA..T..T..AGTTC.C.....T........T..TC....C..-...C.G.A.G.  816
47        876   ..TT-CA..T..T..AGTTC.C.....-........T..T.....C..-...C.G.A.G.  820

Query_34  2525  AAAAAGTAGGAGGAGCCAAAGCTTGGAAGAAA-GCTGGGTTGGATCAG----TTAACACA  2579
24        813   ................................-...............----........  759
26        813   ................................-...............----........  759
22        812   ................................-...............----........  758
28        814   ................................-...............----........  760
49        811   .....AC..............-.....G....-.AA..T......A.TATGA..C.A.A.  754
44        812   .....AC..............T.N...G....-.AA..T......A.TATGA..C.A.A.  754
46        815   .....AC..............T.....G....A.AA..T......A.TATGA..C.A.A.  756
47        819   .....C-..............T.....G....-.AA..T......A.TATGA..C.A.A.  762

Query_34  2580  GCGTGCCCTTACCGTGAAGACTTCT--ACCCGCAGTGGACGTGCCGAAGTGGAATTATTA  2637
24        758   .........................--.................................  701
26        758   .........................--.................................  701
22        757   ..........N..............--.................................  700
28        759   .........................--.................................  702
49        753   ..-.A.TT..---..C..AG.A...GA.A.A.--....TAAA..G.....A..G....GG  700
44        753   ..-.A.TT..---..C..AG.A...GA.A.A.--....TAAA..G.....A..G....GG  700
46        755   ..-.A.TT..---..C..AG.A...GA.A.A.--....TAAA..G.....A..G....GG  702
47        761   ..TAA.TT..---..C..AG.A...GA.A.A.--....TAAA..G.....A..G....GG  707

Query_34  2638  AATG-TCCGTGGTGAAAAAGT-GGGAA-CCGCTTCTTTCATCTATACACTAAAGAAAAAT  2694
24        700   ....-................-.....-................................  644
26        700   ....-................-.....-................................  644
22        699   ....-................-.....-................................  643
28        701   ....-................-.....A................................  644
49        699   ....-CTAAA..C.T...GT.-.....-TG...A.C..TG.A.....CT.GC...GC...  643
44        699   ....-CTAAA..C.T...GT.-.....-TG...A.C..TG.A.....CT.GC...GC...  643
46        701   ....-CTAAA..C.T...GT.-.....-TG...A.C..TG.A.....CT.GC...GC...  645
47        706   ....C.AAAA..C.T...GT.T.....-TG...A.C..TG.A.....CT.GC...GC...  648

Query_34  2695  GGCGAATTGGATATACAGACACACTTTGT-GCCGGATACTACCGTTATCACTTCACTGGC  2753
24        643   .............................-..............................  585
26        643   .............................-..............................  585
22        642   .............................-..............................  584
28        643   .............................-..............................  585
49        642   ..T.C...AA.AG..A.....-.....C.T..........T.T.C.G.T......T....  584
44        642   ..T.C...AA.AG..A.....-.....C.T..........T.T.C.G.T......T....  584
46        644   ..T.C...AA.AG..A.....-.....C.T..........T.T.C.G.T......T....  586
47        647   ..T.C...AA.AG..A.....-.....C.T..........T.T.C.G.T......T....  589

Query_34  2754  GCGTGTAGGGCTTACTTTTGAAATGCCCGATGCTTACAATCAGGTGTCTTATCTGGGGCG  2813
24        584   ............................................................  525
26        584   ............................................................  525
22        583   ............................................................  524
28        584   ....................................................N.......  525
49        583   TA.A..G..C..GG.A...........GT....C..T..CA....T......T....A..  524
44        583   TA.A..G..C..GG.A...........GT....C..T..CA....T......T....A..  524
46        585   TA.A..G..C..GG.A...........GT....C..T..CA....T......T....A..  526
47        588   TA.A..G..C..GG.A...........GT....C..T..CA....T......T....A..  529

Query_34  2814  TGGAGAGCATGAAACTTATATGGATCGTAATCAATCCGGTAAAATAGGTATTTATCACAC  2873
24        524   ............................................................  465
26        524   ............................................................  465
22        523   ............................................................  464
28        524   ............................................................  465
49        523   ...T..A..............A..C........G..T..ATGT..C..A.....C..T..  464
44        523   ...T..A..............A..C........G..T..ATGT..C..A.....C..T..  464
46        525   ...T..A..............A..C........G..T..ATGT..C..A.....C..T..  466
47        528   ...T..A..............A..C........G..T..ATGT..C..A.....C..T..  469

Query_34  2874  CGATGTGGAGAGTATGTTCCACTATTATGTTCGTCCGCAGGCAACGGGTAACCGTACGGA  2933
24        464   ............................................................  405
26        464   ............................................................  405
22        463   ............................................................  404
28        464   ............................................................  405
49        463   A....CA..AC..........T........GAAG..C.....T..A..A..T........  404
44        463   A....CA..AC..........T........GAAG..C.....T..A..A..T........  404
46        465   A....CA..AC..........T........GAAG..C.....T..A..A..T........  406
47        468   A....CA..AC..........T........GAAG..C.....T..A..A..T........  409

Query_34  2934  TGTCCGTTGGATGCAACTTGCTGATGAGGCAGGTGAGGGGCTGGCATTCCGTTCCGATGC  2993
24        404   ............................................................  345
26        404   ............................................................  345
22        403   ............................................................  344
28        404   ............................................................  345
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44        403   ...G.........G..T.G..G...........A..A..TT..T.T........G...AA  344
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47        408   ...G.........G..T.G..G...........A..A..TT..T.T........G...AA  349

Query_34  2994  CTCGTTTCAGTTTAGTGTGATTCCTTTTACGGATGAGAATCTGGATGCGGCAACGCATAT  3053
24        344   ............................................................  285
26        344   ............................................................  285
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47        348   AGT.........CT....T.....A.........TCT...G.A...AAA..T..T.....  289

Query_34  3054  CAATCAATTACGGCGCGATGGAGTGGTAACTGTTCATCTGGATGCCGCACAGGCAGGAGT  3113
24        284   ............................................................  225
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22        283   ............................................................  224
28        284   ............................................................  225
49        283   T...A..C.TGA.A.AACA..GA.TA...A......CT.A.....G.A....T.G..G..  224
44        283   T...A..C.TGA.A.AACA..GA.TA...A......CT.A.....G.A....T.G..G..  224
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47        288   T...A..C.TGA.A.AACA..GA.TA...A......CT.A.....G.A....T.G..G..  229

Query_34  3114  CGGTACGGCTACCTGTGGTCCTGGAGTATTGCCGCAGTATCGTGTACCTGTGCAGGATTA  3173
24        224   ............................................................  165
26        224   ............................................................  165
22        223   ............................................................  164
28        224   ............................................................  165
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44        223   A.....T..G..T........G..G..........CA........T..G...G..A.GC.  164
46        225   A.....T..G..T........G..G..........CA........T..G...G..A.GC.  166
47        228   A.....T..G..T........G..G..........CA........T..G...G..A.GC.  169

Query_34  3174  CATATTCCGGTTTACAATCCGTCCTTTGAAATAACATTGGAAGTGGATAACGGATCCGAA  3233
24        164   ............................................................  105
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22        163   ............................................................  104
28        164   ............................................................  105
49        163   T.CG..TGA.....TG..TT....A..A................................  104
44        163   T.CG..TGA.....TG..TT....A..A................................  104
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47        168   T.CG..TGA.....TG..TT....A..A................................  109
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85        133                               ................................  102
110       837                               ................................  868
39        810                           ......-.............................  844
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111       838                               ................................  869
112       834                               ...............................N  865
40        136                             ..C...............................  103
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42        136                             ..C...............................  103
38        136                             ..C...............................  103
35        133                             ..C...............................  100
14        136                               ................................  105
60        134                                  .............................  106
56        134                                 ..............................  105
0         135                               ................................  104
116       128                                  .............................  100
64        132                                  .............................  104
12        139                               ................................  108
30        131                                  .............................  103
3         136                               ................................  105
88        121                               ................................  90
5         136                               ................................  105
31        134                                  .............................  106
34        135                                  .............................  107
62        136                                  .............................  108
8         136                                ...............................  106
87        121                               ................................  90
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51        119                                 ..............................  90
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79        65                                 ......................--.....    39
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81        65                                 ......................--.....    39
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20        65                                   ....................--.....    41
18        65                                   ....................--.....    41

Query_34  3234  TTCGAGCTCCGTCGA-CAAGCTT-GCGGCCG-CACT-CGAGcaccaccaccaccacca-c  3288
24        104   ...............-......N-N......-....-.....................-.  50
26        104   ...............-.......-.......-....-.....................-.  50
22        103   ...............-......N-N......-....-.....................-.  49
28        104   ...............-.......-.......-....-.....................-.  50
49        103   ...............-.......-.......-....-.....................-.  49
44        103   ...............-.......-.......-....-.....................-.  49
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85        101   ...............-.......-.......-....-.....................-.  47
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112       866   .-.............-.......-....T..-....T.................N...N.  921
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66        98    .A....TC.T..G.N-.C.A.CG-A..CAA.-....-.........T.....N.....-N  44

Query_34  3289  T-G-AGA-T-CCGGCTGCTAACAAAG-CCC--G--AAAGGAAGC-TGAGTTGGC-TG-CT  3336
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26        49    .-.-...-.-................-...--.--........                   16
22        48    .-.-...-.-...............N-...--N--...A.N..                   15
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3         49    .-.-...-.-................-...--.--...A...                    17
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5         49    .-.-...-.-................C...--.--...A...                    16
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Query= CMR200027.123

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Query_35  150   TCAT-CC--G-CAGTTCG-AAAAGGGTA-CCGAGAA-CCTGTACTT-CCAAT-CCAATGC  200
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Query_35  201   CCAGCGCAGTGAGTATCTACTTGAAAAGAACTGGAAGTTCATGAAGGGGGAAGCTCCGGA  260
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29        148   .A..                                                          151
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Query_35  261   AGCCATGAAGCCGGAATTTGACGACCGGAAGTGGGAAACCGTAACCGTGCCTCACGACTG  320

Query_35  321   GGCCATTTTTGGTCCCTTCGATCGCAGCAACGATTTGCAGGAAGTGGCGGTAACGCAGAA  380

Query_35  381   CTTCGAGAAGAAAGCTTCCGTCAAGACCGGACGTACCGGTGGACTTCCTTATGTTGGCAT  440

Query_35  441   CGGATGGTATCGTACTAGGTTCGATGCCCCCGTCAATCAACAGACGACACTTGTCTTTGA  500

Query_35  501   TGGTGCCATGAGCGAAGCCCGTGTATATGTCAATGGACAAGAAGCATGCTTCTGGCCATT  560

Query_35  561   TGGTTATAATTCTTTCCATTGTGATGTCACCGGACTTTTGAATAAAG--ACGGTAAAAAC  618
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Query_35  619   AATACGCTTG-CCGTGC-GTTTGGAAAATAAACCA-CAAT-CTTCCCGTTGGTAT-CCTG  673
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Query_35  674   G-CG-CAGGA-CTTT--ATCGC-AATG-TGC-GTGT-AGTG-AG-TAC-CG-AT--AAAG  718
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Query_35  719   T-ACATGTT-CCTGTA-TGGGG-TACT-CA-G-CTGACTACTCCTCATGTTT-CTGATG-  769
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Query_35  770   A-GTA-TGC-TTCAGTACGTCTGTTGACCACTATTGCC-AATGATGAAGAAA-GAGATAT  824
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Query_35  825   CCGTATCGTGACAGAGAT-AATCT-CTCCCGATGGGAAA-GTCGTTGCAACGAA-GGATA  880
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132       907   .-................-.....-..............A..............-..N..  852

Query_35  881   ATACCCGTAA-GATT-AATCATGGTCAGCCTTTTGAACAAAACTTCCTGGTGAATGCTCC  938
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Query_35  939   TTGCTT-GTGGTCGCC--GGAGACACCTTATTT-ATATAAAGCTGTTTCTAAAATCTATG  994
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Query_35  995   CCGATGGCAA-GCAAACGGATGAATACACTACTCGTTTCGGCATCCGCAGCATAGAAATC  1053
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Query_35  1054  ATTGCCGACAAAGGATTTTTCCTGAACGGTAAGCATCGCAAGTTCCAGGGGGTGTGCAAT  1113
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Query_35  1114  CACCACGATCTTGGTCCGTTAGGCGCTGCCATCAATGTTGCTGCATTGCGCCGTCAACTT  1173
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Query_35  1174  ACGATGCTGAAAGATATGGGTTGTGATGCCATCCGCACCGCTCACAATATGCCGGCACCG  1233
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135       562   ............................................................  503
132       558   ............................................................  499

Query_35  1234  GAGTTAGTGCAACTTTGTGATGAAATGGGTTTTATGATGATGCTGGAACCTTTCGACGAA  1293
138       498   ............................................................  439
135       502   ............................................................  443
132       498   ............................................................  439

Query_35  1294  TGGGACATTGCCAAATGTGAGAATGGCTATCACCGTTATTTCAACGAGTGGGCAGAACGT  1353
138       438   ............................................................  379
135       442   ............................................................  383
132       438   ............................................................  379
45        1                                        ........-................  24
41        2                                          ......-................  23
43        7                                                .................  23

Query_35  1354  GATATGATAAATATGTTGCATCAGTTCCGCAACAATCCTTGTGTCGTAATGTGGAGTATC  1413
138       378   ............................................................  319
135       382   ............................................................  323
132       378   ............................................................  319
45        25    ............................................................  84
41        24    ............................................................  83
43        24    ............................................................  83
119       343                                     .....A....TA.C...........T  318
32        63                                      .....A....TA.C...........T  88

Query_35  1414  GGTAATGAAGTTCCTACCCAATGTAGTCCCGTAGGCTATAAAGTCGCTTCTTTCTTGCAG  1473
138       318   ............................................................  259
135       322   ............................................................  263
132       318   ............................................................  259
45        85    ............................................................  144
41        84    ............................................................  143
43        84    ............................................................  143
119       317   .........                                                     309
32        89    .........                                                     97

Query_35  1474  GATATCTGTCATCGTGAAGATCCGACACGTCCTGTTACTTGCGGCATGGATCAGGTGACT  1533
138       258   ............................................................  199
135       262   ............................................................  203
132       258   ............................................................  199
45        145   ............................................................  204
41        144   ............................................................  203
43        144   ............................................................  203

Query_35  1534  TGTGTTCTTGCTAATGGTTTTGCCGCCATGATTGATGTGCCCGGTTTTAATTATCGCGCA  1593
138       198   ....................................................T.......  139
135       202   ...................................................GC.......  143
132       198   ............................................................  139
45        205   ....................................................T.......  264
41        204   ............................................................  263
43        204   ...................................................GC.......  263
9         929                ..............                                   942
130       472                ..............                                   459
128       481                ..............                                   468
118       476                ..............                                   463
16        352                ..............                                   365

Query_35  1594  CACCGTTATCTGGAAGCTTATGAACTGTTGCCGCAGAATATAGTACTTGGTTCTCAGACA  1653
138       138   ......................................................G.A...  79
135       142   ......................................................G.A...  83
132       138   ............................................................  79
45        265   ......................................................G.A...  324
41        264   ............................................................  323
43        264   ......................................................G.A...  323

Query_35  1654  TCCTCTACCGTTAGTTCTCGTGGCGTATATAAATTTCCTGTAGAGAAACGCGGGGATGCG  1713
138       78    ............................................................  19
135       82    ............................................................  23
132       78    ............................................................  19
45        325   ............................................................  384
41        324   ............................................................  383
43        324   ............................................................  383

Query_35  1714  -AAGTACGATGATCACCAGTCTTCCGGATATGACTTGGAGCATTGTGCCTGGTCTAATGT  1772
138       18    -........-N........                                           2
135       22    A................                                             6
132       18    -........-N......                                             4
45        385   -...........................................................  443
41        384   -...........................................................  442
43        384   -...........................................................  442

Query_35  1773  TCCAGATGAAGATTTTGCTTTAGCGGATGATTATGACTGGACTATCGGTCAATTCGTTTG  1832
45        444   ............................................................  503
41        443   ............................................................  502
43        443   ............................................................  502

Query_35  1833  GACAGGATTCGATTATCTGGGTGAGCCTTCTCCTTATGATACGGATGCATGGCCAAGTCA  1892
45        504   ............................................................  563
41        503   ............................................................  562
43        503   ............................................................  562

Query_35  1893  TAGCTCTTTGTTTGGTATCATTGACCTTGCCAG-TTTGCCAAAAGACCGCTACTATCTGT  1951
45        564   .................................-..........................  622
41        563   .................................T..........................  622
43        563   .................................-..........................  621

Query_35  1952  ACCGTAGTC-TTTGGAATAAGAATGTGAATACACTCCATATACTTCCTCACTGGACATGG  2010
45        623   ......N..T..................................................  682
41        623   .........-..................................................  681
43        622   .........-..................................................  680

Query_35  2011  CCGGGTAGGGAAGGAGAGAATACTCCTGTCTTTGTTTACACAAACTATCCTGCTGCCGAA  2070
45        683   ............................................................  742
41        682   .......N....................................................  741
43        681   ..-.................................                          715

Query_35  2071  CTTTTCGTTAATGGAAAAAGCTATGGTAAACAGCATAAACTGACAG-CCGAAGAGAGTAA  2129
45        743   ..............................................C.............  802
41        742   .....TCN.T........                                            759

Query_35  2130  AGCTATTCAGGAC-AAAGATACACTTGCCCTCCAGCGTCGTTACCGCCTGATGTGGATGG  2188
45        803   .............A..............................................  862

Query_35  2189  ACGTTCCTTATGAGCCGGGTGAAGTGAAAGTGGTGGCTTACGATGCTTCCGGCAAACCTG  2248
45        863   ......T................N.............C......................  922

Query_35  2249  CTGAAGAAAAAGTAGTTCGTAC-TTCCGGCAAACCTCATCATCTGGAAGTCATTGCTGAC  2307
45        923   N..-.T.....A..........T......T..C.T..N.NT...                  965

Query_35  2308  CGTGACCAACTCACTGCCGATGGTAAAGATTTGGCATACATCACTGTTCGTGTGGTTGAT  2367

Query_35  2368  AAAGACGGAAACCTTTGTCCTGCTGATAATCGTCTTGTAAACTTTACGGTGAAAGGCGCG  2427

Query_35  2428  GGGCGTTATCGTGCTGCCGCTAATGGAGATGCAACTTCACTTGATTTATTCCACTTGCCG  2487

Query_35  2488  AAGATGCCCGCTTTCAGTGGTCAGCTGACAGCCATTGTTCAAATGACCGAACAGCCCGGT  2547

Query_35  2548  GAAATTATTTTCGAGGCTAAGGCTAAAGGGGTGAAATCTGGTAAGCTTGTGCTGAGGTCT  2607

Query_35  2608  GTTAGAGAGTAACATTGGAAGTGGATAACGGATCCGAATTCGAGCTCCGTCGA-CAAGCT  2666
83        127            ............................................-......  78
85        130            ............................................-......  81
110       840            ............................................A......  890
39        813         ..A............................................-......  865
27        840           .............................................-......  890
23        841           ...........................N.....C...........-......  891
112       837            ............................N.-.............-......  885
111       841            ................................N...........-.N....  890
60        137         ...............................................-......  85
40        131            ............................................-......  82
26        133            ............................................-......  84
115       135            ............................................-......  86
64        135         ...............................................-......  83
49        132            ............................................-......  83
116       129           .............................................-......  79
56        133            ............................................-......  84
44        132            ............................................-......  83
42        131            ............................................-......  82
38        131            ............................................-......  82
35        128            ............................................-......  79
30        132           .............................................-......  82
14        133            ............................................-......  84
62        139         ...............................................-......  87
31        135           .............................................-......  85
0         132            ............................................-......  83
46        134            ............................................-......  85
34        136           .............................................-......  86
28        133            ............................................-......  84
12        136            ............................................-......  87
3         133            ............................................-......  84
88        118            ............................................-......  69
24        133            ............................................-......  84
5         133            ............................................-......  84
73        131           .............................................-......  81
8         137         ..A............................................-......  85
22        132            ............................................-......  83
68        130           .............................................-......  80
47        137            ............................................-......  88
87        118            ............................................-......  69
71        128           .............................................-......  78
51        118            ............................................-..N.N.  69
69        129           .............................................-....NN  79
58        115            ............................................-...N..  66
54        120            ............................................-......  71
66        130         ......................T.....N....A....TC.T..G.N-.C.A.C  78
79        66          ..A....................--.....                          39
75        68          ..A....................--.....                          41
81        66          ..A....................--.....                          39
77        66          ..A....................--.....                          39
15        62            .....................--.....                          37
20        66            .....................--.....                          41
18        66            .....................--.....                          41

Query_35  2667  T-GCGGCCG-CACT-CGAGcaccaccaccaccacca-cT-G-AGA-T-CCGGCTGCTAAC  2718
83        77    .-.......-....-....---..............-..-.-...-.-............  29
85        80    .-.......-....-.....................-..-.-...-.-............  29
110       891   .-.......-....-...............--....-..T.-...-.-............  941
39        866   .-.......-....-....---..............-..-.-...-.N............  915
27        891   .T.......-....-.....................-..-.-.N.-.C.........-.N  943
23        892   .-.......-....-...N........-........-..-.-...-.-..........T.  942
112       886   .-....T..-....T.................N...N..-.-...-.-..........N.  939
111       891   .-.......C..N.-..................N..-..-.A...-.-..N.......N.  944
60        84    .-.......-....-.....................-..-.-...-.-............  33
40        81    .-.......-....-.....................-..-.-...-.-............  30
26        83    .-.......-....-.....................-..-.-...-.-............  32
115       85    .-.......-....-.....................-..-.-...-.-............  34
64        82    .-.......-....-.....................-..-.-...-.-............  31
49        82    .-.......-....-.....................-..-.-...-.-............  31
116       78    .-.......-....-.....................-..-.-...-.-............  27
56        83    .-.......-....-.....................-..-.-...-.-............  32
44        82    .-.......-....-.....................-..-.-...-.-............  31
42        81    .-.......-....-.....................-..-.-...-.-............  30
38        81    .-.......-....-.....................-..-.-...-.-............  30
35        78    .-.......-....-.....................-..-.-...-.-............  27
30        81    .-.......-....-.....................-..-.-...-.-............  30
14        83    .-.......-....-.....................-..-.-...-.-............  32
62        86    .-.......-....-.....................-..-.-...-.-............  35
31        84    .-.......-....-.....................-..-.-...-.-............  33
0         82    .-..N....-....-.....................-..-.-...-.-............  31
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34        85    .-.......-....-.....................-..-.-...T.-............  33
28        83    .-.......-....-.....................-..-.-...-.-............  32
12        86    .-.......-....-.....................-..-.-...-.-............  35
3         83    .-NN.....-....-.....................-..-.-...-.-............  32
88        68    .-N......-....-.....................-..-.-...-.-..........T.  17
24        83    N-N......-....-.....................-..-.-...-.-........N...  32
5         83    N-.......-....-.....................-..-.-...-.-............  32
73        80    .-.......-....-....---..............-..-.-...-.-............  32
8         84    N-.N.....-....-.....................-..-.-...-.-............  33
22        82    N-N......-....-.....................-..-.-...-.-............  31
68        79    .-.......-....-....---..............-..-.-...-.-............  31
47        87    N-NN.....-....-.....................-..-.-...-.-............  36
87        68    .-A......-....-.....................-..-.-...-.-............  17
71        77    N-.......-....-....---..............-..-.-...-.-............  29
51        68    .-NA.....-....-.....................-..-.-...-.C............  16
69        78    .-.......-....-....---..............-..-.-...-.-............  30
58        65    .-.......-....-....---..............-..-.-...-.-............  17
54        70    A-A...N..-....-.....................T..-.-...-.C............  17
66        77    G-A..CAA.-....-.........T.....N.....-N.-N-...-.-............  26
79        43                                                .-.-............  30
75        45                                                .-.-............  32
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Query_35  2719  AAAG-CCC--G--AAAGGAAGC-TGAGTTGGC-TG-CTGCCACCGCTGAGCAATAAC-TA  2769
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Query= CMR200027.124

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Query_36  1     TCTCG-ATCCCGCGAAATTAATAC-GACTC-ACTATAGGGG--AATT-GTGAG-CGGA-T  52
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Query_36  99    TATAC-ATATG--CACCAT-CATCATCAT-CATTCTT-CT-GG-TGTAGAT-CTGTGGTC  149
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Query_36  150   TCAT-CC--G-CAGTTCG-AAAAGGGTA-CCGAGAA-CCTGTACTT-CCAAT-CCAATGC  200
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Query_36  201   CCAGCGCAGTGAGTATCTACTTGAAAAGAACTGGAAGTTCATGAAGGGGGAAGCTCCGGA  260
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Query_36  261   AGCCATGAAGCCGGAATTTGACGACCGGAAGTGGGAAACCGTAACCGTGCCTCACGACTG  320

Query_36  321   GGCCATTTTTGGTCCCTTCGATCGCAGCAACGATTTGCAGGAAGTGGCGGTAACGCAGAA  380

Query_36  381   CTTCGAGAAGAAAGCTTCCGTCAAGACCGGACGTACCGGTGGACTTCCTTATGTTGGCAT  440

Query_36  441   CGGATGGTATCGTACTAGGTTCGATGCCCCCGTCAATCAACAGACGACACTTGTCTTTGA  500

Query_36  501   TGGTGCCATGAGCGAAGCCCGTGTATATGTCAATGGACAAGAAGCATGCTTCTGGCCATT  560

Query_36  561   TGGTTATAATTCTTTCCATTGTGATGTCACCGGACTTTTGAATAAAG--ACGGTAAAAAC  618
135       1157                                          .......GA.........C.  1138

Query_36  619   AATACGCTTG-CCGTGC-GTTTGGAAAATAAACCA-CAAT-CTTCCCGTTGGTAT-CCTG  673
138       1109                     ..G.......T....NN....-..............T....  1070
135       1137  .-....N..NN......A.................-.C..T...G......NNT.-..N.  1081

Query_36  674   G-CG-CAGGA-CTTT--ATCGC-AATG-TGC-GTGT-AGTG-AG-TAC-CG-AT--AAAG  718
138       1069  .AN.-....N-...N---....-.NN.-...N.N..-....G..-GNT-..N..N-....  1021
135       1080  .-A.N.....-AN..TA.....C....G...-...--..N.-..G..T-..-.NTA....  1029
132       1063     .-.....AN..N--N....-....-...-N...N....-..-..AT..-..--....  1018
73        427                                                     .-..--....  433
68        426                                                     .-..--....  432
71        424                                                     .-..--....  430
69        425                                                     .-..--....  431

Query_36  719   T-ACATGTT-CCTGTA-TGGGG-TACT-CA-G-CTGACTACTCCTCATGTTT-CTGATG-  769
138       1020  N-.......T..N...-.....G....T..-.G...................T......G  964
135       1028  .G......N-......-...N.-....-..-.-N.........-...A....-......N  977
132       1017  .-.....G.-..C...G.A...-..N.-..A.-.N........TC.......-.C..N.-  965
73        434   .-...G...-...                                                 444
68        433   .-...G...-...                                                 443
71        431   .-...G...-...                                                 441
69        432   .-...G...-...                                                 442

Query_36  770   A-GTA-TGC-TTCAGTACGTCTGTTGACCACTATTGCC-AATGATGAAGAAA-GAGATAT  824
138       963   .-...-..NN............................-.............A.......  907
135       976   .-...A...-............................C.............A.......  919
132       964   .N...-N..-.........................N..C......N.N....-.......  908

Query_36  825   CCGTATCGTGACAGAGAT-AATCT-CTCCCGATGGGAAA-GTCGTTGCAACGAA-GGATA  880
138       906   ..................-.....-..............-..............-.....  851
135       918   ..................N.....T..............-..............N.....  860
132       907   .-................-.....-..............A..............-..N..  852

Query_36  881   ATACCCGTAA-GATT-AATCATGGTCAGCCTTTTGAACAAAACTTCCTGGTGAATGCTCC  938
138       850   ..........-....-..............................-.............  794
135       859   ..........A....N.....N......................................  800
132       851   .....-....-....W.........................CT.C...............  794

Query_36  939   TTGCTT-GTGGTCGCC--GGAGACACCTTATTT-ATATAAAGCTGTTTCTAAAATCTATG  994
138       793   ......-.........--...............-..........................  738
135       799   ......T.........--........N......T..........................  742
132       793   ......-.........--..............--..........................  739
96        886       ..-......T..--T..ATT.........-.....                       916
97        892       ..-......T..CT...ATN.........-.....                       924

Query_36  995   CCGATGGCAA-GCAAACGGATGAATACACTACTCGTTTCGGCATCCGCAGCATAGAAATC  1053
138       737   ..........-.................................................  679
135       741   ..........-.................................................  683
132       738   ..........A.................N...............................  679

Query_36  1054  ATTGCCGACAAAGGATTTTTCCTGAACGGTAAGCATCGCAAGTTCCAGGGGGTGTGCAAT  1113
138       678   ............................................................  619
135       682   ............................................................  623
132       678   ............................................................  619

Query_36  1114  CACCACGATCTTGGTCCGTTAGGCGCTGCCATCAATGTTGCTGCATTGCGCCGTCAACTT  1173
138       618   ............................................................  559
135       622   ............................................................  563
132       618   ............................................................  559

Query_36  1174  ACGATGCTGAAAGATATGGGTTGTGATGCCATCCGCACCGCTCACAATATGCCGGCACCG  1233
138       558   ............................................................  499
135       562   ............................................................  503
132       558   ............................................................  499

Query_36  1234  GAGTTAGTGCAACTTTGTGATGAAATGGGTTTTATGATGATGCTGGAACCTTTCGACGAA  1293
138       498   ............................................................  439
135       502   ............................................................  443
132       498   ............................................................  439

Query_36  1294  TGGGACATTGCCAAATGTGAGAATGGCTATCACCGTTATTTCAACGAGTGGGCAGAACGT  1353
138       438   ............................................................  379
135       442   ............................................................  383
132       438   ............................................................  379
45        1                                        ........-................  24
41        2                                          ......-................  23
43        7                                                .................  23

Query_36  1354  GATATGATAAATATGTTGCATCAGTTCCGCAACAATCCTTGTGTCGTAATGTGGAGTATC  1413
138       378   ............................................................  319
135       382   ............................................................  323
132       378   ............................................................  319
45        25    ............................................................  84
41        24    ............................................................  83
43        24    ............................................................  83
119       343                                     .....A....TA.C...........T  318
32        63                                      .....A....TA.C...........T  88

Query_36  1414  GGTAATGAAGTTCCTACCCAATGTAGTCCCGTAGGCTATAAAGTCGCTTCTTTCTTGCAG  1473
138       318   ............................................................  259
135       322   ............................................................  263
132       318   ............................................................  259
45        85    ............................................................  144
41        84    ............................................................  143
43        84    ............................................................  143
119       317   .........                                                     309
32        89    .........                                                     97

Query_36  1474  GATATCTGTCATCGTGAAGATCCGACACGTCCTGTTACTTGCGGCATGGATCAGGTGACT  1533
138       258   ............................................................  199
135       262   ............................................................  203
132       258   ............................................................  199
45        145   ............................................................  204
41        144   ............................................................  203
43        144   ............................................................  203

Query_36  1534  TGTGTTCTTGCTAATGGTTTTGCCGCCATGATTGATGTGCCCGGTTTTAATGCTCGCGCA  1593
138       198   ...................................................TT.......  139
135       202   ............................................................  143
132       198   ...................................................TA.......  139
45        205   ...................................................TT.......  264
41        204   ...................................................TA.......  263
43        204   ............................................................  263
9         929                ..............                                   942
130       472                ..............                                   459
128       481                ..............                                   468
118       476                ..............                                   463
16        352                ..............                                   365

Query_36  1594  CACCGTTATCTGGAAGCTTATGAACTGTTGCCGCAGAATATAGTACTTGGTTCTGAAACA  1653
138       138   ............................................................  79
135       142   ............................................................  83
132       138   ......................................................C.G...  79
45        265   ............................................................  324
41        264   ......................................................C.G...  323
43        264   ............................................................  323

Query_36  1654  TCCTCTACCGTTAGTTCTCGTGGCGTATATAAATTTCCTGTAGAGAAACGCGGGGATGCG  1713
138       78    ............................................................  19
135       82    ............................................................  23
132       78    ............................................................  19
45        325   ............................................................  384
41        324   ............................................................  383
43        324   ............................................................  383

Query_36  1714  -AAGTACGATGATCACCAGTCTTCCGGATATGACTTGGAGCATTGTGCCTGGTCTAATGT  1772
138       18    -........-N........                                           2
135       22    A................                                             6
132       18    -........-N......                                             4
45        385   -...........................................................  443
41        384   -...........................................................  442
43        384   -...........................................................  442

Query_36  1773  TCCAGATGAAGATTTTGCTTTAGCGGATGATTATGACTGGACTATCGGTCAATTCGTTTG  1832
45        444   ............................................................  503
41        443   ............................................................  502
43        443   ............................................................  502

Query_36  1833  GACAGGATTCGATTATCTGGGTGAGCCTTCTCCTTATGATACGGATGCATGGCCAAGTCA  1892
45        504   ............................................................  563
41        503   ............................................................  562
43        503   ............................................................  562

Query_36  1893  TAGCTCTTTGTTTGGTATCATTGACCTTGCCAG-TTTGCCAAAAGACCGCTACTATCTGT  1951
45        564   .................................-..........................  622
41        563   .................................T..........................  622
43        563   .................................-..........................  621

Query_36  1952  ACCGTAGTC-TTTGGAATAAGAATGTGAATACACTCCATATACTTCCTCACTGGACATGG  2010
45        623   ......N..T..................................................  682
41        623   .........-..................................................  681
43        622   .........-..................................................  680

Query_36  2011  CCGGGTAGGGAAGGAGAGAATACTCCTGTCTTTGTTTACACAAACTATCCTGCTGCCGAA  2070
45        683   ............................................................  742
41        682   .......N....................................................  741
43        681   ..-.................................                          715

Query_36  2071  CTTTTCGTTAATGGAAAAAGCTATGGTAAACAGCATAAACTGACAG-CCGAAGAGAGTAA  2129
45        743   ..............................................C.............  802
41        742   .....TCN.T........                                            759

Query_36  2130  AGCTATTCAGGAC-AAAGATACACTTGCCCTCCAGCGTCGTTACCGCCTGATGTGGATGG  2188
45        803   .............A..............................................  862

Query_36  2189  ACGTTCCTTATGAGCCGGGTGAAGTGAAAGTGGTGGCTTACGATGCTTCCGGCAAACCTG  2248
45        863   ......T................N.............C......................  922

Query_36  2249  CTGAAGAAAAAGTAGTTCGTAC-TTCCGGCAAACCTCATCATCTGGAAGTCATTGCTGAC  2307
45        923   N..-.T.....A..........T......T..C.T..N.NT...                  965

Query_36  2308  CGTGACCAACTCACTGCCGATGGTAAAGATTTGGCATACATCACTGTTCGTGTGGTTGAT  2367

Query_36  2368  AAAGACGGAAACCTTTGTCCTGCTGATAATCGTCTTGTAAACTTTACGGTGAAAGGCGCG  2427

Query_36  2428  GGGCGTTATCGTGCTGCCGCTAATGGAGATGCAACTTCACTTGATTTATTCCACTTGCCG  2487

Query_36  2488  AAGATGCCCGCTTTCAGTGGTCAGCTGACAGCCATTGTTCAAATGACCGAACAGCCCGGT  2547

Query_36  2548  GAAATTATTTTCGAGGCTAAGGCTAAAGGGGTGAAATCTGGTAAGCTTGTGCTGAGGTCT  2607

Query_36  2608  GTTAGAGAGTAACATTGGAAGTGGATAACGGATCCGAATTCGAGCTCCGTCGA-CAAGCT  2666
83        127            ............................................-......  78
85        130            ............................................-......  81
110       840            ............................................A......  890
39        813         ..A............................................-......  865
27        840           .............................................-......  890
23        841           ...........................N.....C...........-......  891
112       837            ............................N.-.............-......  885
111       841            ................................N...........-.N....  890
60        137         ...............................................-......  85
40        131            ............................................-......  82
26        133            ............................................-......  84
115       135            ............................................-......  86
64        135         ...............................................-......  83
49        132            ............................................-......  83
116       129           .............................................-......  79
56        133            ............................................-......  84
44        132            ............................................-......  83
42        131            ............................................-......  82
38        131            ............................................-......  82
35        128            ............................................-......  79
30        132           .............................................-......  82
14        133            ............................................-......  84
62        139         ...............................................-......  87
31        135           .............................................-......  85
0         132            ............................................-......  83
46        134            ............................................-......  85
34        136           .............................................-......  86
28        133            ............................................-......  84
12        136            ............................................-......  87
3         133            ............................................-......  84
88        118            ............................................-......  69
24        133            ............................................-......  84
5         133            ............................................-......  84
73        131           .............................................-......  81
8         137         ..A............................................-......  85
22        132            ............................................-......  83
68        130           .............................................-......  80
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87        118            ............................................-......  69
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Query_36  2667  T-GCGGCCG-CACT-CGAGcaccaccaccaccacca-cT-G-AGA-T-CCGGCTGCTAAC  2718
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Query_36  2719  AAAG-CCC--G--AAAGGAAGC-TGAGTTGGC-TG-CTGCCACCGCTGAGCAATAAC-TA  2769
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Query_36  2770  G-CA-TAAC-C-CCTT-GGGGCCTCTAAACGGGTCTT--GAGG-GG--TTTTTTGCTGAA  2819
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Query_36  2820  A  2820
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Gapped
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Effective search space used: 428813086


Query= CMR200027.125

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Query_37  201   CCAGCGCAGTGAGTATCTACTTGAAAAGAACTGGAAGTTCATGAAGGGGGAAGCTCCGGA  260
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86        152   ...A..                                                        157
98        164   ...                                                           166
96        160   .                                                             160
9         155   .                                                             155
103       162   .                                                             162
89        153   ...A..                                                        158
84        149   ...A..                                                        154
17        149   .A..                                                          152
70        152   ....                                                          155
90        149   ...                                                           151
82        150   ...A..                                                        155
59        144   ....                                                          147
112       156   .                                                             156
100       151   ...                                                           153
95        161   .                                                             161
94        163   .                                                             163
111       152   .                                                             152
102       160   .                                                             160
80        152   ..                                                            153
29        148   .A..                                                          151
97        162   .                                                             162
104       163   .                                                             163
72        151   ....                                                          154
74        146   ....                                                          149
61        138   ....                                                          141
76        150   ..                                                            151
78        148   ..                                                            149
99        144   ...                                                           146
91        145   ...                                                           147
114       168   ....                                                          171
87        799   .                                                             799
122       905   .A..                                                          902
101       157   ...                                                           159
137       915   ...                                                           913

Query_37  261   AGCCATGAAGCCGGAATTTGACGACCGGAAGTGGGAAACCGTAACCGTGCCTCACGACTG  320

Query_37  321   GGCCATTTTTGGTCCCTTCGATCGCAGCAACGATTTGCAGGAAGTGGCGGTAACGCAGAA  380

Query_37  381   CTTCGAGAAGAAAGCTTCCGTCAAGACCGGACGTACCGGTGGACTTCCTTATGTTGGCAT  440

Query_37  441   CGGATGGTATCGTACTAGGTTCGATGCCCCCGTCAATCAACAGACGACACTTGTCTTTGA  500

Query_37  501   TGGTGCCATGAGCGAAGCCCGTGTATATGTCAATGGACAAGAAGCATGCTTCTGGCCATT  560

Query_37  561   TGGTTATAATTCTTTCCATTGTGATGTCACCGGACTTTTGAATAAAG--ACGGTAAAAAC  618
135       1157                                          .......GA.........C.  1138

Query_37  619   AATACGCTTG-CCGTGC-GTTTGGAAAATAAACCA-CAAT-CTTCCCGTTGGTAT-CCTG  673
138       1109                     ..G.......T....NN....-..............T....  1070
135       1137  .-....N..NN......A.................-.C..T...G......NNT.-..N.  1081

Query_37  674   G-CG-CAGGA-CTTT--ATCGC-AATG-TGC-GTGT-AGTG-AG-TAC-CG-AT--AAAG  718
138       1069  .AN.-....N-...N---....-.NN.-...N.N..-....G..-GNT-..N..N-....  1021
135       1080  .-A.N.....-AN..TA.....C....G...-...--..N.-..G..T-..-.NTA....  1029
132       1063     .-.....AN..N--N....-....-...-N...N....-..-..AT..-..--....  1018
73        427                                                     .-..--....  433
68        426                                                     .-..--....  432
71        424                                                     .-..--....  430
69        425                                                     .-..--....  431

Query_37  719   T-ACATGTT-CCTGTA-TGGGG-TACT-CA-G-CTGACTACTCCTCATGTTT-CTGATG-  769
138       1020  N-.......T..N...-.....G....T..-.G...................T......G  964
135       1028  .G......N-......-...N.-....-..-.-N.........-...A....-......N  977
132       1017  .-.....G.-..C...G.A...-..N.-..A.-.N........TC.......-.C..N.-  965
73        434   .-...G...-...                                                 444
68        433   .-...G...-...                                                 443
71        431   .-...G...-...                                                 441
69        432   .-...G...-...                                                 442

Query_37  770   A-GTA-TGC-TTCAGTACGTCTGTTGACCACTATTGCC-AATGATGAAGAAA-GAGATAT  824
138       963   .-...-..NN............................-.............A.......  907
135       976   .-...A...-............................C.............A.......  919
132       964   .N...-N..-.........................N..C......N.N....-.......  908

Query_37  825   CCGTATCGTGACAGAGAT-AATCT-CTCCCGATGGGAAA-GTCGTTGCAACGAA-GGATA  880
138       906   ..................-.....-..............-..............-.....  851
135       918   ..................N.....T..............-..............N.....  860
132       907   .-................-.....-..............A..............-..N..  852

Query_37  881   ATACCCGTAA-GATT-AATCATGGTCAGCCTTTTGAACAAAACTTCCTGGTGAATGCTCC  938
138       850   ..........-....-..............................-.............  794
135       859   ..........A....N.....N......................................  800
132       851   .....-....-....W.........................CT.C...............  794

Query_37  939   TTGCTT-GTGGTCGCC--GGAGACACCTTATTT-ATATAAAGCTGTTTCTAAAATCTATG  994
138       793   ......-.........--...............-..........................  738
135       799   ......T.........--........N......T..........................  742
132       793   ......-.........--..............--..........................  739
96        886       ..-......T..--T..ATT.........-.....                       916
97        892       ..-......T..CT...ATN.........-.....                       924

Query_37  995   CCGATGGCAA-GCAAACGGATGAATACACTACTCGTTTCGGCATCCGCAGCATAGAAATC  1053
138       737   ..........-.................................................  679
135       741   ..........-.................................................  683
132       738   ..........A.................N...............................  679

Query_37  1054  ATTGCCGACAAAGGATTTTTCCTGAACGGTAAGCATCGCAAGTTCCAGGGGGTGTGCAAT  1113
138       678   ............................................................  619
135       682   ............................................................  623
132       678   ............................................................  619

Query_37  1114  CACCACGATCTTGGTCCGTTAGGCGCTGCCATCAATGTTGCTGCATTGCGCCGTCAACTT  1173
138       618   ............................................................  559
135       622   ............................................................  563
132       618   ............................................................  559

Query_37  1174  ACGATGCTGAAAGATATGGGTTGTGATGCCATCCGCACCGCTCACAATATGCCGGCACCG  1233
138       558   ............................................................  499
135       562   ............................................................  503
132       558   ............................................................  499

Query_37  1234  GAGTTAGTGCAACTTTGTGATGAAATGGGTTTTATGATGATGCTGGAACCTTTCGACGAA  1293
138       498   ............................................................  439
135       502   ............................................................  443
132       498   ............................................................  439

Query_37  1294  TGGGACATTGCCAAATGTGAGAATGGCTATCACCGTTATTTCAACGAGTGGGCAGAACGT  1353
138       438   ............................................................  379
135       442   ............................................................  383
132       438   ............................................................  379
45        1                                        ........-................  24
41        2                                          ......-................  23
43        7                                                .................  23

Query_37  1354  GATATGATAAATATGTTGCATCAGTTCCGCAACAATCCTTGTGTCGTAATGTGGAGTATC  1413
138       378   ............................................................  319
135       382   ............................................................  323
132       378   ............................................................  319
45        25    ............................................................  84
41        24    ............................................................  83
43        24    ............................................................  83
119       343                                     .....A....TA.C...........T  318
32        63                                      .....A....TA.C...........T  88

Query_37  1414  GGTAATGAAGTTCCTACCCAATGTAGTCCCGTAGGCTATAAAGTCGCTTCTTTCTTGCAG  1473
138       318   ............................................................  259
135       322   ............................................................  263
132       318   ............................................................  259
45        85    ............................................................  144
41        84    ............................................................  143
43        84    ............................................................  143
119       317   .........                                                     309
32        89    .........                                                     97

Query_37  1474  GATATCTGTCATCGTGAAGATCCGACACGTCCTGTTACTTGCGGCATGGATCAGGTGACT  1533
138       258   ............................................................  199
135       262   ............................................................  203
132       258   ............................................................  199
45        145   ............................................................  204
41        144   ............................................................  203
43        144   ............................................................  203

Query_37  1534  TGTGTTCTTGCTAATGGTTTTGCCGCCATGATTGATGTGCCCGGTTTTAATTTTCGCGCA  1593
138       198   ............................................................  139
135       202   ...................................................GC.......  143
132       198   ....................................................A.......  139
45        205   ............................................................  264
41        204   ....................................................A.......  263
43        204   ...................................................GC.......  263
9         929                ..............                                   942
130       472                ..............                                   459
128       481                ..............                                   468
118       476                ..............                                   463
16        352                ..............                                   365

Query_37  1594  CACCGTTATCTGGAAGCTTATGAACTGTTGCCGCAGAATATAGTACTTGGTTCTGAAACA  1653
138       138   ............................................................  79
135       142   ............................................................  83
132       138   ......................................................C.G...  79
45        265   ............................................................  324
41        264   ......................................................C.G...  323
43        264   ............................................................  323

Query_37  1654  TCCTCTACCGTTAGTTCTCGTGGCGTATATAAATTTCCTGTAGAGAAACGCGGGGATGCG  1713
138       78    ............................................................  19
135       82    ............................................................  23
132       78    ............................................................  19
45        325   ............................................................  384
41        324   ............................................................  383
43        324   ............................................................  383

Query_37  1714  -AAGTACGATGATCACCAGTCTTCCGGATATGACTTGGAGCATTGTGCCTGGTCTAATGT  1772
138       18    -........-N........                                           2
135       22    A................                                             6
132       18    -........-N......                                             4
45        385   -...........................................................  443
41        384   -...........................................................  442
43        384   -...........................................................  442

Query_37  1773  TCCAGATGAAGATTTTGCTTTAGCGGATGATTATGACTGGACTATCGGTCAATTCGTTTG  1832
45        444   ............................................................  503
41        443   ............................................................  502
43        443   ............................................................  502

Query_37  1833  GACAGGATTCGATTATCTGGGTGAGCCTTCTCCTTATGATACGGATGCATGGCCAAGTCA  1892
45        504   ............................................................  563
41        503   ............................................................  562
43        503   ............................................................  562

Query_37  1893  TAGCTCTTTGTTTGGTATCATTGACCTTGCCAG-TTTGCCAAAAGACCGCTACTATCTGT  1951
45        564   .................................-..........................  622
41        563   .................................T..........................  622
43        563   .................................-..........................  621

Query_37  1952  ACCGTAGTC-TTTGGAATAAGAATGTGAATACACTCCATATACTTCCTCACTGGACATGG  2010
45        623   ......N..T..................................................  682
41        623   .........-..................................................  681
43        622   .........-..................................................  680

Query_37  2011  CCGGGTAGGGAAGGAGAGAATACTCCTGTCTTTGTTTACACAAACTATCCTGCTGCCGAA  2070
45        683   ............................................................  742
41        682   .......N....................................................  741
43        681   ..-.................................                          715

Query_37  2071  CTTTTCGTTAATGGAAAAAGCTATGGTAAACAGCATAAACTGACAG-CCGAAGAGAGTAA  2129
45        743   ..............................................C.............  802
41        742   .....TCN.T........                                            759

Query_37  2130  AGCTATTCAGGAC-AAAGATACACTTGCCCTCCAGCGTCGTTACCGCCTGATGTGGATGG  2188
45        803   .............A..............................................  862

Query_37  2189  ACGTTCCTTATGAGCCGGGTGAAGTGAAAGTGGTGGCTTACGATGCTTCCGGCAAACCTG  2248
45        863   ......T................N.............C......................  922

Query_37  2249  CTGAAGAAAAAGTAGTTCGTAC-TTCCGGCAAACCTCATCATCTGGAAGTCATTGCTGAC  2307
45        923   N..-.T.....A..........T......T..C.T..N.NT...                  965

Query_37  2308  CGTGACCAACTCACTGCCGATGGTAAAGATTTGGCATACATCACTGTTCGTGTGGTTGAT  2367

Query_37  2368  AAAGACGGAAACCTTTGTCCTGCTGATAATCGTCTTGTAAACTTTACGGTGAAAGGCGCG  2427

Query_37  2428  GGGCGTTATCGTGCTGCCGCTAATGGAGATGCAACTTCACTTGATTTATTCCACTTGCCG  2487

Query_37  2488  AAGATGCCCGCTTTCAGTGGTCAGCTGACAGCCATTGTTCAAATGACCGAACAGCCCGGT  2547

Query_37  2548  GAAATTATTTTCGAGGCTAAGGCTAAAGGGGTGAAATCTGGTAAGCTTGTGCTGAGGTCT  2607

Query_37  2608  GTTAGAGAGTAACATTGGAAGTGGATAACGGATCCGAATTCGAGCTCCGTCGA-CAAGCT  2666
83        127            ............................................-......  78
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23        841           ...........................N.....C...........-......  891
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30        132           .............................................-......  82
14        133            ............................................-......  84
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0         132            ............................................-......  83
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5         133            ............................................-......  84
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87        118            ............................................-......  69
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51        118            ............................................-..N.N.  69
69        129           .............................................-....NN  79
58        115            ............................................-...N..  66
54        120            ............................................-......  71
66        130         ......................T.....N....A....TC.T..G.N-.C.A.C  78
79        66          ..A....................--.....                          39
75        68          ..A....................--.....                          41
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15        62            .....................--.....                          37
20        66            .....................--.....                          41
18        66            .....................--.....                          41

Query_37  2667  T-GCGGCCG-CACT-CGAGcaccaccaccaccacca-cT-G-AGA-T-CCGGCTGCTAAC  2718
83        77    .-.......-....-....---..............-..-.-...-.-............  29
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110       891   .-.......-....-...............--....-..T.-...-.-............  941
39        866   .-.......-....-....---..............-..-.-...-.N............  915
27        891   .T.......-....-.....................-..-.-.N.-.C.........-.N  943
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58        65    .-.......-....-....---..............-..-.-...-.-............  17
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75        45                                                .-.-............  32
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20        45                                                .-.-............  32
18        45                                                .-.-............  32

Query_37  2719  AAAG-CCC--G--AAAGGAAGC-TGAGTTGGC-TG-CTGCCACCGCTGAGCAATAAC-TA  2769
83        28    ....-...--.--.......                                          14
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111       945   .N..-...--.--.......N.-.T.A.....-..T..T.T..............NN-N.  996
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40        29    ....-...--.--........                                         14
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42        29    ....-...--.--....N.G..                                        13
38        29    ....C...--.--........                                         13
35        26    ....-...--.--...-.....                                        11
30        29    ....-...--.--...                                              19
14        31    ....-...--.--...                                              21
62        34    ....-...                                                      28
31        32    ....-...--.N-.....                                            19
0         30    ....-...--.--...A...                                          16
46        32    ....-...--N--...                                              22
34        32    ....-...--.A-.......                                          17
28        31    ....-...G-.--...N...                                          16
12        34    ....C...--.--...N...                                          19
3         31    ....-...--.--...A...                                          17
88        16    ....-...--.--....                                             5
24        31    ....-...--.--.....                                            19
5         31    ....C...--.--...A...                                          16
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8         32    ....-...CGA--.......                                          16
22        30    ...N-...--N--...A.N..                                         15
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47        35    ...N-..N--.--...AN...                                         20
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Query_38  150   TCAT-CC--G-CAGTTCG-AAAAGGGTA-CCGAGAA-CCTGTACTT-CCAAT-CCAATGC  200
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Query_38  201   CCGTGAGGTAACTCCATTCAATAACGGATGGGAGTTTAAGAAAGGGCCTTTTCCAACCGA  260
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Query_38  559   GAAATTGTTGTCAAGTCCGATAATGTAGCACGTCCGGATGTGATTCCGGTCAACCATGCT  618
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Query_38  619   CTTTTTGGCGTCTATGGTGGAATTTACCGTCCCGTATGGCTGATAGTGACTGAACCCTGC  678
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Query_38  679   AATATTGTAGTGAATGACTGTGCCTCTCCGGGTGTATATATAACTCAGAAGAACGTATCG  738
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Query_38  1412  CG-GC-TGCTC--TTACTCA--GTCT-GTT-CAC-GATCTCTGCAAA-CTGGAAG-ATCC  1460
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15        739   -..-......A..C.....G..A.....A..G....-...A....-....--....T...  686
18        743   -..-......A..C.....G..A.....A..G....-...A....-....--....T...  690
20        692                                                            ...  690

Query_38  1621  -CAACGGCTGATGCTGACAGAATATGGGGCTGATGCG-AACATTGAGCATCAGACAGAAT  1678
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20        689   -.....C............C.G.....T..A..C..C-..T..A..A........G...A  632

Query_38  1679  TGCTGGGAGATGCCTTGAACTGGGGCAGTGA--TTTTTATCCGGAAACTTTCCAGACAAA  1736
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Query_38  1737  GAC-ACATGAGTATCAGTGGGGAGTAATTTCTCAGCATCCTTATATTCTTGCTTCTTATT  1795
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Query_38  1796  TATGGAATATGTTTGACTTTGCAGTTCCTCAATGGAAGCGTGGAGGTGTAGATGCGCGGA  1855
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Query_38  1856  ACATGAAAGGGTTGATAACTTTTGATCGTAAAATACGCAAGGATGCTTTCTATTGGTATA  1915
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20        454   ..........CA....G.....C.......G...CAAG..A...T...AT.TC.......  395

Query_38  1916  AGGCAAACTGGAGTAAGGAGCCGGTGCTTTATCTGACGCAACGCCGTAATACGGAACGTG  1975
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20        394   ....G........C.....A.....T.....C.....A..G.....G...G.A.TG..C.  335

Query_38  1976  AACGCCGGGAAACTTCTGTCACTGTCTATTCCAATCTTGGGACACCCCGCGTTTTCCTGA  2035
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20        334   .GAAAAAA........CA.T..A..G.........A.C..T..C...AAG..G.AT....  275

Query_38  2036  ATGGCCGGGAAC---TGGATGGCGTTCGTAAGGGATATACCGATGTGCATTACATTTTTG  2092
30        340   ............---.............................................  284
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20        274   .C..GAAA...T---..ACC..A..G..G..A..T....NT.....A.....T..A..C.  218

Query_38  2093  ATCAGGTAACGCTTGCCGAAGAACGAAATGTACTTAGAGCTGTTATCGTGTC--TGATGG  2150
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20        217   .CA.....GT...G.A...T.GCAAG.....T..G.A...--A.CC.T.C..CA.C.A..  160

Query_38  2151  TAAGGAATATACCGATGAAATTGTGTGGAACTACAACGGTG---AGCATGTCCGGCAGGC  2207
30        225   .........................................---................  169
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20        159   A..A........A..C.....A.AA.....T..T.....A.---..TGCAA....G.A..  103

Query_38  2208  CGATGCTTAC--GAACATAAGAAAGAACATGCCGGCTG-GTAACATTGGAAGTGGATAAC  2264
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56        133                                           ....................  114
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42        131                                           ....................  112
38        131                                           ....................  112
35        128                                           ....................  109
14        133                                           ....................  114
0         132                                           ....................  113
62        143                                    .....A.....................  117
46        134                                           ....................  115
28        133                                           ....................  114
12        136                                           ....................  117
3         133                                           ....................  114
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24        133                                           ....................  114
5         133                                           ....................  114
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111       152   .                                                             152
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Query_39  261   TGCGATGCAGACTGCTG-CCAGATGGAATGCAGATTGGGAACAGGTGAATGTGCCTCATA  319
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Query_39  320   CCTGGAATGCGGATGATATGCAGAAGAAAACCAACAGCTTTTATGCTGGGGTAGCTTATT  379
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Query_39  380   ATCGGAAGCACTATGTTTTTCCTGAATCACTGGAAGGCAAGCGTCTTTTTCTACGCTTTG  439
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Query_39  440   AGGGTGTAGGAGCATGTGCCGAAGTTTATGTCAACGGTTATTTGGTTGGAACACATAAAG  499
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Query_39  500   GAGCTTATTCTGCATTTGTCTGCGAAATTGGTTCGCAAGTCAGGCTGGGAGAAGAG-AAT  558
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Query_39  559   GAAATTGTTGTCAAGTCCGATAATGTAGCACGTCCGGATGTGATTCCGGTCAACCATGCT  618
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Query_39  619   CTTTTTGGCGTCTATGGTGGAATTTACCGTCCCGTATGGCTGATAGTGACTGAACCCTGC  678
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Query_39  679   AATATTGTAGTGAATGACTGTGCCTCTCCGGGTGTATATATAACTCAGAAGAACGTATCG  738
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104       641   C......CG...G.A..T.A...T.....A..G..C.....T..C.....A..T..G...  700

Query_39  739   AAACAGT-CTGCTGAT--G-TTTCTGTCAGGGTGAAACTTGATAATGC-AACATTGGCT-  792
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Query_39  793   CCGGCTGCTCTTGAACTGGAAAATGCGA-TTTAT-ACCCGTGAGGGCAAGTTGGTTA--A  848
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Query_39  849   AGTTCA--TCGGCAGTTTTTTGAGCTGACT-CCTC-AGGGA-------GTACA-AAACTA  896
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Query_39  897   -T----GTTTCT---GATTTTAAAATCAGTCATCCTCA-TCTT-TGGCAGGGGCGCGAAG  946
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Query_39  947   AT-CC-TT--A-TTTATATAAGGTCGT-CT-CTCGTCTGAAACAGGACGGACAGGTAA-T  998
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Query_39  999   TGATGAAGTGATACAGCCA-CTC-GG-C-T--TGCGTAAGTA-TG-AGGCTGTGG-CTGG  1049
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Query_39  1050  AAAAGG-TTT-C-TTCCTGAATGG-TA-AAAAATA-T-CCGAT-GT-A-T--GGAGTTA-  1096
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Query_39  1097  C-C-CGTCA-T-CAGG-A-C-TGGTGGGG-G-----ATGGG-TAGCGC-ACTGACTAAC-  1140
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Query_39  1141  -AGGGAA-CATGATTTTGAT-CTGGAGCAGATT--ATGG-AA--GTTGGG-GCAACGACC  1191
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Query_39  1192  GTGCGTTTTGCTCATTACCAGCAGT-C--GGATTAT--ATTTA--TTCAC-GTTGTG-AT  1242
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Query_39  1243  ACGTTGGGACTTATTAT-CTGGGCTGAG---ATTCCTTTT--GTGAACC-GTGT--GACA  1293
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Query_39  1294  GGG-CA--GG--AG-T--GGG--A-T--AA-TG--TT-CAT-CAGC--AA-AT-GCGC-G  1330
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Query_39  1331  -AG-C-TG--A-TACGT-CAG-A-GTTT-CAA-TCAT-CCT---T-CT-ATTTA-TG-TG  1371
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Query_39  1372  -T--GGGG-AA--TT-CA-TAAC--GAGGT-GTAT-C-AT-CCGC-A-TGGTT--A-TAC  1412
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Query_39  1413  G-GC-TGCTC--TTACTCA--GTCT-GTT-CAC-GATCTCTGCAAA-CTGGAAG-ATCCT  1461
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Query_39  1462  GATC-GTTAT-ACGGTGGCTGTCAA-T-G-GTTATGGCC-A-TGCAGAACATCC-GGTT-  1512
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Query_39  1513  AA-CGG-G-AATACCGATATACA-GGGAATGAACCGTTA-TTTCGGATGGTATGAGAAA-  1566
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Query_39  1567  AA-GATACAGGATATCAAACCCTGGATTGAAAAAA-TGGCAAAA-GAAT--ATCCCTGG-  1620
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Query_39  1621  CAACGGCTGATGCTGACAGCTTATGGGGCTGATGCG-AACATTGAGCATCAGACAGAATT  1679
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20        689   .....C............CAG.....T..A..C..C-..T..A..A........G...A.  631

Query_39  1680  GCTGGGAGATGCCTTGAACTGGGGCAGTGA--TTTTTATCCGGAAACTTTCCAGACAAAG  1737
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Query_39  1738  AC-ACATGAGTATCAGTGGGGAGTAATTTCTCAGCATCCTTATATTCTTGCTTCTTATTT  1796
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Query_39  1797  ATGGAATATGTTTGACTTTGCAGTTCCTCAATGGAAGCGTGGAGGTGTAGATGCGCGGAA  1856
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Query_39  1857  CATGAAAGGGTTGATAACTTTTGATCGTAAAATACGCAAGGATGCTTTCTATTGGTATAA  1916
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Query_39  1917  GGCAAACTGGAGTAAGGAGCCGGTGCTTTATCTGACGCAACGCCGTAATACGGAACGTGA  1976
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Query_39  1977  ACGCCGGGAAACTTCTGTCACTGTCTATTCCAATCTTGGGACACCCCGCGTTTTCCTGAA  2036
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Query_39  2037  TGGCCGGGAAC---TGGATGGCGTTCGTAAGGGATATACCGATGTGCATTACATTTTTGA  2093
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Query_39  2094  TCAGGTAACGCTTGCCGAAGAACGAAATGTACTTAGAGCTGTTATCGTGTC--TGATGGT  2151
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Query_39  2152  AAGGAATATACCGATGAAATTGTGTGGAACTACAACGGTG---AGCATGTCCGGCAGGCC  2208
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Query_39  2209  GATGCTTAC--GAACATAAGAAAGAACATGCCGGCTG-GTAACATTGGAAGTGGATAACG  2265
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Query_39  2266  GATCCGAATTCGAGCTCCGTCGA-CAAGCTT-GCGGCCG-CACT-CGAGcaccaccacca  2321
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Query_39  2322  ccacca-cT-G-AGA-T-CCGGCTGCTAACAAAG-CCC--G--AAAGGAAGC-TGAGTTG  2370
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Query= CMR200052.106

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Query_40  150   TCAT-CC--G-CAGTTCG-AAAAGGGTA-CCGAGAA-CCTGTACTT-CCAAT-CCAATGC  200
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Query_40  559   GAAATTGTTGTCAAGTCCGATAATGTAGCACGTCCGGATGTGATTCCGGTCAACCATGCT  618
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Query_40  619   CTTTTTGGCGTCTATGGTGGAATTTACCGTCCCGTATGGCTGATAGTGACTGAACCCTGC  678
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Query_40  1567  -AA-GATACAGGATATCAAACCCTGGATTGAAAAAA-TGGCAAAA-GAAT--ATCCCTGG  1620
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Query_40  1621  -CAACGGCTGATGCTGACAGAATATGGGGCTGATGCG-AACATTGAGCATCAGACAGAAT  1678
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Query_40  1679  TGCTGGGAGATGCCTTGAACTGGGGCAGTGA--TTTTTATCCGGAAACTTTCCAGACAAA  1736
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Query_40  1737  GAC-ACATGAGTATCAGTGGGGAGTAATTTCTCAGCATCCTTATATTCTTGCTTCTTATT  1795
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Query_40  1796  TATGGAATATGTTTGACTTTGCAGTTCCTCAATGGAAGCGTGGAGGTGTAGATGCGCGGA  1855
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Query_40  1856  ACATGAAAGGGTTGATAACTTTTGATCGTAAAATACGCAAGGATGCTTTCTATTGGTATA  1915
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Query_40  1916  AGGCAAACTGGAGTAAGGAGCCGGTGCTTTATCTGACGCAACGCCGTAATACGGAACGTG  1975
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20        394   ....G........C.....A.....T.....C.....A..G.....G...G.A.TG..C.  335

Query_40  1976  AACGCCGGGAAACTTCTGTCACTGTCTATTCCAATCTTGGGACACCCCGCGTTTTCCTGA  2035
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Query_40  2036  ATGGCCGGGAAC---TGGATGGCGTTCGTAAGGGATATACCGATGTGCATTACATTTTTG  2092
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20        274   .C..GAAA...T---..ACC..A..G..G..A..T....NT.....A.....T..A..C.  218

Query_40  2093  ATCAGGTAACGCTTGCCGAAGAACGAAATGTACTTAGAGCTGTTATCGTGTC--TGATGG  2150
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20        217   .CA.....GT...G.A...T.GCAAG.....T..G.A...--A.CC.T.C..CA.C.A..  160

Query_40  2151  TAAGGAATATACCGATGAAATTGTGTGGAACTACAACGGTG---AGCATGTCCGGCAGGC  2207
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20        159   A..A........A..C.....A.AA.....T..T.....A.---..TGCAA....G.A..  103

Query_40  2208  CGATGCTTAC--GAACATAAGAAAGAACATGCCGGCTG-GTAACATTGGAAGTGGATAAC  2264
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Query_41  150   TCAT-CC--G-CAGTTCG-AAAAGGGTA-CCGAGAA-CCTGTACTT-CCAAT-CCAATGC  200
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Query_41  201   CCAACGTGAAGTTCCGCAATCGCGCATGGAGCAGATTTATGAGGAAGCCAAGACTCCTTA  260
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9         155   .                                                             155
103       162   .                                                             162
90        149   .....                                                         153
17        149   .                                                             149
70        152   ...                                                           154
111       152   .A..                                                          155
100       151   ....                                                          154
59        144   ...                                                           146
112       156   .                                                             156
95        161   .                                                             161
94        163   .                                                             163
102       160   .                                                             160
80        152   ..                                                            153
29        148   .                                                             148
97        162   .                                                             162
104       163   .                                                             163
72        151   ...                                                           153
74        146   ...                                                           148
76        150   ..                                                            151
61        138   ...                                                           140
78        148   ..                                                            149
91        145   .....                                                         149
99        144   ....                                                          147
114       168   ...                                                           170
87        799   .                                                             799
122       905   .                                                             905
101       157   ...                                                           159
137       915   ....                                                          912

Query_41  261   TAAATATGGGCTGGCTGTAGCTCCGGCCGACAACAAGCATAAAATAGACTGCCCTACCGT  320
89        213   ............................................................  272
82        210   ............................................................  269
86        212   ............................................................  271
84        209   ............................................................  268

Query_41  321   GTTCCGCGAAGGGGATAAGTGGTATATGACCTACGTGGTTTATAATGGTAAGAGCGGACT  380
89        273   ............................................................  332
82        270   ............................................................  329
86        272   ............................................................  331
84        269   ............................................................  328

Query_41  381   GGACGGACGTGGATACGAGACATGGATAGCCGAAAGTGATAATCTGTTGGAATGGCGTAC  440
89        333   ............................................................  392
82        330   ............................................................  389
86        332   ............................................................  391
84        329   ............................................................  388

Query_41  441   ATTGGGACGTGTCTTGTCTTATCGTGACGGATTCTGGGATTGCAACCAGCGTGGTGGTTT  500
89        393   ............................................................  452
82        390   ............................................................  449
86        392   ............................................................  451
84        389   ............................................................  448

Query_41  501   CCCTGCATTGCCGGATATGGAGTGGGGAGGAAGCTATGCCCTGCAGACGTATAAAGGCAA  560
89        453   ............................................................  512
82        450   ............................................................  509
86        452   ............................................................  511
84        449   ............................................................  508

Query_41  561   GCATTGGATGACTTATCTGGGTGGGGAAGGGACCGGATATGAATCGGTGAACAAGCCGCT  620
89        513   ............................................................  572
82        510   ............................................................  569
86        512   ............................................................  571
84        509   ............................................................  568

Query_41  621   GTATATTGGTTTGGCCTGGACAGACCGGCCTTTGGGTTCCGCCCATGAATGGCAGGCACA  680
89        573   ............................................................  632
82        570   ............................................................  629
86        572   ............................................................  631
84        569   ............................................................  628

Query_41  681   GGACCAGCCCGTGATGAGTATCCATGATAAAGACGCGCAATGGTGGGAAAAGCTGACTCA  740
89        633   ............................................................  692
82        630   ............................................................  689
86        632   ............................................................  691
84        629   ............................................................  688

Query_41  741   ATATAAGAGTGTGGTCTATTGGGAT-AAGGAGAAAACATTGGGCGCACC-TTTCGTCATG  798
89        693   .........................-.......................-..........  750
82        690   .........................-.......................-..........  747
86        692   .........................A.......................-..........  750
84        689   .........................-.......................T..........  747

Query_41  799   TTCTATAACGCGGCAGGACGGCATCCGGAAACGGA-TTTGAAAGCGGAACGGG-TGGGTA  856
89        751   ...................................-.................-......  808
82        748   ...................................-.................-......  805
86        751   .............N.....................-.................-......  808
84        748   ...................................T.................N......  807

Query_41  857   TCGCCTTGTCCAAAGATATGAAGAAA-TGG-AAACGATATCCGGGCAAT-CCGGTC-TTT  912
89        809   ..........................-...A..................-......-...  865
82        806   ..........................-...-..................-......-...  861
86        809   .........N................-...-..................-......-...  864
84        808   .........N.C..............T...-..................C......T...  866

Query_41  913   GCACACGAAGCGGACGGAACCATTACGGGGGATGCGCATA-T-CCAGAAAA-TGGGCGAT  969
89        866   ..........................N.............T.-........-........  923
82        862   ..........................-.............-.-........-........  917
86        865   ...................................N....-.C........T.......N  923
84        867   ..N.......................-.....N.......-.-T.......-........  922

Query_41  970   GTGTATGTCATGTTC-TATTTC-TCGGCTTTTGAACCGAGCCGCAAA-TACAAGGCATTT  1026
89        924   ...............-....N.-.....-........N.........N............  980
82        918   ...............-......-....................-N..-............  973
86        924   ............-..-......N.....-...........T...T..-............  979
84        923   ...-N..........T......-..-.......-..........-..-..TN.-......  975

Query_41  1027  AATACA-TTTGC-TGCCAGTTATGACCTAGTACATTGGACGGATTGGAAAGGGGCGGATT  1084
89        981   ....N.T.....-......-..............................N.......-.  1037
82        974   ......-.....-......-..............-............-..N.......-.  1027
86        980   -.....-.....N....N............N............-..............-.  1035
84        976   .....N-.....-......-.........-.N.....NNN.......N..-..N..A...  1030

Query_41  1085  TGATTATCCCTTCTAAAGACTATGATGAATTGTTCGCTCATAAGAG-TTATGTGGTGAAA  1143
89        1038  .N.....-......-.................-..N...-N..N.N-.............  1092
82        1028  .......-......-............-.............-....-.........-NN.  1081
86        1036  .....-.T..............................NC...AN.T......CNNNN..  1094
84        1031  G...A...T..NTN..NA.AN......-.N.....                           1064

Query_41  1144  TACAATGGGGTGGTGTATC-ATT-TCTATT--GTGCCGTGAATGACGCGGAACAACGTGG  1199
89        1093  N......N..-.NNN....N...-......TN.G......N....NC..C.........N  1150
82        1082  ...........-.N..NN.-...-..-...--.N.NNNNA........N.T.AC....NN  1135
86        1095  .NN.T...N....NNG...-...C..AT.G--............NN..-N.......N..  1150

Query_41  1200  TATAG-CCATTGCTACCAGCAAACCGA-TGGGA-CGTTCACAAGTGCATTTCCCGGAACG  1256
89        1151  NNANN-N......N.....GC......T...N.-N....N..........            1198
82        1136  N.-..-..............-....N.-...A.-...                         1167
86        1151  NN...C........-N...GC......-..T..N....                        1186

Query_41  1257  GGAGGTGAAGAATCGCCGGATGGTGATGGAATTGGATAAAGGATGGAAAACATGGCTGAC  1316

Query_41  1317  GGAAGCAACTCATCTGAAAGGGTTGTTTGCTCAAAAGGCAATAGAAGTAAATATTCCTCA  1376

Query_41  1377  TAACTGGGATGATTATTATGGCTACCGCCAACTGACACATGGTAATTTGCACGGTACTGC  1436

Query_41  1437  CATATACGAAAAGACCTTCACATTGGATGATTCTCAGTTTCTAATTTCCAACTCTTCATT  1496

Query_41  1497  CGGAAAACGTTATTTTCTTCGTTTTGAGGGAGTGGGGACGTATGCCACTATAACGTTGAA  1556
96        379                  ............T.......                           398
95        380                  ............T.......                           399
94        382                  ............T.......                           401
97        381                  ............T.......                           400

Query_41  1557  TGGAAAGGATTTCGGCCGTCATCCCGTAGGGCGTACTACGCTGACATTGGATGTGACGGA  1616

Query_41  1617  TGCGTTGAAGCTGGGAGAGAATAAGCTGGTAGTGAAAGCGGAACATCCTGAAATGATAGC  1676

Query_41  1677  CGACATGCCTTGGGTGTGCGGTGGCTGTTCCTCGGAATGGGGATTCAGCGAAGGTTCCCA  1736

Query_41  1737  GCCTTTGGGAATTTTCCGTCCCGTGGTGCTGGAGGCTACGGATGAGATCCGCATTGAGCC  1796

Query_41  1797  TTTCGGAGTGCATATCTGGAATGATGATAAGGCGGGAACTGTCTTTGTGGAAACGGAGGT  1856

Query_41  1857  GAAAAATTACGGAAAGACTGCTGAGACGGTGGAAGTGGTTAATAAATTCAGTAATGCGGA  1916

Query_41  1917  TGGCAAGCAGGTGTTCCGCCTGACGGAGAAGGTGACTTTGCAGCCGGGTGAAAAGAAGGT  1976
45        875                                            ...........NT...A..  893

Query_41  1977  GGTGAAGCAACAATCGCCAGTGCAGAATCCTGTTTTATGGAGTACGGAGAATCCTTATTT  2036
45        894   ....                                                          897

Query_41  2037  GTATAAACTGGCCAGTATGATAAAGCGTGGTAAGAGTACTACGGATGAGATTAGTACACC  2096

Query_41  2097  CTTTGGTATCCGTACCATCAGTTGGCCGGTGAAACGGGAGGATGGTGACGGACGGTTCTA  2156

Query_41  2157  TCTGAACGGACAGCCTGTCTTTATCAATGGAGTGTGTGAATATGAACATCAGTTCGGACA  2216

Query_41  2217  AAGCCATGCTTTCAGCCGTGAGCAGGTGGCAGCCCGTGTGAAACAGATCCGTGCGGCGGG  2276

Query_41  2277  CTTCAACGCTTTCCGTGACGCTCACCAGCCCCATCACCTGGATTATCAGAAATATTGGGA  2336

Query_41  2337  CAAGGAAGGAGTCTTGTGGTGGACTCAGTTTTCGGCCCACGTGTGGTATGATACTCCGGA  2396

Query_41  2397  GTTTCGTGAGAATTTCAAGAAACTGCTCCGCCAGTGGGTGAAAGAGCGTCGTAACTCGCC  2456

Query_41  2457  CAGTGTGGTGATGTGGGGATTGCAGAACGCTAGCACGCTGCCTAAGGAGTTTGCCGAAGA  2516
33        589                                                    ...T.......  599

Query_41  2517  GTGTAGTGAGATTATCCGGGAAATGGATCCTACGGCCCGTACCATGCGTGTGATTACTAC  2576
33        600   ......                                                        605

Query_41  2577  GTGTAACGGTGGTGATGGGACAGATTGGAATGTTATTCAGAACTGGAGTGGAACCTATGG  2636

Query_41  2637  TGGTGATGTGAATAAGTATGGCCGTGAATTGTCACAGAAGAATCAGTTGTTGAACGGTGA  2696

Query_41  2697  ATATGGGGCATGGCGCAGCATCGGATTGCATACGGAACCGGCAGCTTTTGATGTGAATGG  2756

Query_41  2757  TGTATGGAGCGAGGAGCGTATGTGCCAGCTGATGGAAACCAAGATACGACTGGCGGAACA  2816

Query_41  2817  GGCAAAGGACAGTGTGTGCGGACAATTCCAATGGATATTCAGCAGTCATGATAATCCGGG  2876

Query_41  2877  ACGCCGCCAGCCGGATGAAGCGTATCGCCGGATAGATAAGGTGGGACCATTTAATTATAA  2936

Query_41  2937  AGGATTGGTGACTCCGTGGGAGGAGCCGCTGGATGTATATTATATGTATCGCGCGAACTA  2996

Query_41  2997  TGTGCCGGCTTCCGAAGATCCGATGGTTTATCTGGCATCTCATACATGGGAGGACCGTTT  3056

Query_41  3057  TGCGACAGGCCGCAGACGGGCTACCATTGAGGCGTACAGCAATTGTGACAGTGTGTTGCT  3116

Query_41  3117  GTACAATGATGCGGTGGATGCTGAATACTTGGGACGGAAATTGAATCATGGGGTGGGGAC  3176

Query_41  3177  TCATTTCATGTGGGAAAACCGCGATATCCGTTACAATGTGCTTCGTGCTGTGGGGTACTT  3236

Query_41  3237  TAAAGGAAAACCGGCAGCGGAAGATGTGCTGGTGCTGAACGGTCTGGAAAAAGCTCCTCA  3296

Query_41  3297  TTTTGAAGCTCTTTACCGTGGTTCTGCTATAGTGCCTGTTGCTGCCGACCGGTTGAACGG  3356

Query_41  3357  AACTGATTTGTTGAAAGGAGCTGA-GGGATATA-CGTAT-CTTTATCGTTTGAA-TTGCG  3412
38        1155                                                ......NN-N..N.  1143
42        1180         ........-.N......A..NNN...-.....T.N....TCG...N--.....  1132
35        1170                       ...-........A...N.-...-..NN..-..N-N....  1137
40        1169                                          ...AN...N.....A.....  1150

Query_41  3413  G-AGGAG-A---C-GCTT-AT-ACGGA-TA-C-GTA-TGGTC-AGGT-CTGG-GCGCAGG  3457
38        1142  .N.....-N---NN....N..-N....-..A.-...-.....-....-....-.......  1094
42        1131  .-N.-..-.---N-NGN.-..-NN.-.-..-.-...N....T-CA..-TNN.-......A  1088
35        1136  .-N....G.---.-NGC.-..N.....N..-.-..T-AT...-.A..T....-NN.....  1088
40        1149  .-...G.-.GGA.-...A-.N-.....-NN-NN.N.-N....C....-....AN....NN  1099

Query_41  3458  A-TAA--CAGCCGTTATTCTCATTCGTGGG-CGG--AATCG-TTTGTTCATCCGTCGGAT  3510
38        1093  .A...--..........NT..N.-......G...--.....-.....-............  1041
42        1087  .-...--................CG.....-...--.....-..-...............  1036
35        1087  .-...--..................NNN..N...--.....-..-.......-.......  1036
40        1098  .A...AC.......-...N...NNN-...N-N..GA.....G....N.............  1042

Query_41  3511  AGT-GTACAGTTGTTGA-GCCCTTATCAGGC-GAG-CCA-GCGTACCACGAATGATCCCA  3565
38        1040  ...N..........G.N-............N-...-...-....................  985
42        1035  ...-..N..........-N.NT.AT......-...-...-....N...............  981
35        1035  ...-.....NN......-AG..C........-...G...-....................  980
40        1041  ...-NNNA.....G...A.....AN......N...-..NN....................  984

Query_41  3566  TTCATGGCACTAGGGACTGGG-AACTGTTCCAGACTTTCCGCTTCGGACGCCATAAGCTG  3624
38        984   .....................-......................................  926
42        980   ....................--......................................  923
35        979   N....................-...........GAC........................  921
40        983   .....................G...........N..........................  924

Query_41  3625  AACTT-CCGCTTTCCCGTTCCGG-ATGGCGA-GTATCGTGTGGAACTTTATTTTACAGAA  3681
38        925   .....-.................G.......-............................  868
42        922   .....-.................-.......-............-...............  867
35        920   .....-.................-.......-............................  864
40        923   .....Y................--.......A............................  866

Query_41  3682  CCCTGGCATGGTACAGGAGGCGGCGTACAGACGGATTGTGAAGG-CTTGCGTATTTTTGA  3740
38        867   ........................................G...G...............  808
42        866   ............................................-...............  808
35        863   ............................................-...............  805
40        865   ............................................-...............  807

Query_41  3741  TGTAGCGGTAAATGATAAAGTACTTCTGGACGACTTGGATGTATGGGCTGAAGCGGGTCA  3800
38        807   ............................................................  748
42        807   ............................................................  748
35        804   ............................................................  745
40        806   ............................-...............................  748

Query_41  3801  TGACGGCGCTTGCAAAAAGGTGGTGAATGCTATCGTGAAAGGGGGAGTCTTGAAGATTAA  3860
38        747   ............................................................  688
42        747   ............................................................  688
35        744   ............................................................  685
40        747   ............................................................  688

Query_41  3861  TTTTCCGGAGGTGAAAGCGGGGCAAGCTTTGATTTGTGGCATTGCGATAGCTTGTAAAGG  3920
38        687   ............................................................  628
42        687   ............................................................  628
35        684   ............................................................  625
40        687   ............................................................  628

Query_41  3921  CGACTTGGATTCCGTTCGCTCTTTTTCTGCCCATAGCTTCAGCTGGGCTGCACAAGACAA  3980
38        627   ............................................................  568
42        627   ............................................................  568
35        624   ............................................................  565
40        627   ............................................................  568

Query_41  3981  GGAGGTGATGGAAAAGACTCCCAAAGAATTATTGCCTGAAGATAAAAACGCACGTGCCAA  4040
38        567   ............................................................  508
42        567   ............................................................  508
35        564   ............................................................  505
40        567   ............................................................  508

Query_41  4041  TGTGACTTATCAAGCGGAGGATGCTGTGCTGAAAGGTAAGTTCATAAAGAAAGAGGTTAA  4100
38        507   ............................................................  448
42        507   ............................................................  448
35        504   ............................................................  445
40        507   ............................................................  448

Query_41  4101  GAAACAAACCGGGGTTTTCTTTGGTAAAGGTACACAAAGCAGTATTACTTGGAACATTTC  4160
38        447   ............................................................  388
42        447   ............................................................  388
35        444   ............................................................  385
40        447   ............................................................  388

Query_41  4161  TACCGGTCTGGCACAAGTCTATGCTCTTCGTTTTAAATACATGAATGTTACAGGGAAGCC  4220
38        387   ............................................................  328
42        387   ............................................................  328
35        384   ............................................................  325
40        387   ............................................................  328

Query_41  4221  TATGAAGGTGCGTATGCAGTTCATTGATTCCAAAGGGGTGGTACTGAAGGAAGATAATCT  4280
38        327   ............................................................  268
42        327   ............................................................  268
35        324   ............................................................  265
40        327   ............................................................  268

Query_41  4281  GACTTTTGCCGAAACTCCCGGAAAGTGGCGTATGCTGAGTACAACGACGGGTACGTATAT  4340
38        267   ............................................................  208
42        267   ............................................................  208
35        264   ............................................................  205
40        267   ............................................................  208

Query_41  4341  CAATGCAGGCTATTATAAGGTGGTGCTTTCCGCACCGGATATGGAGGGACTGGCATTGGA  4400
38        207   ............................................................  148
42        207   ............................................................  148
35        204   ............................................................  145
40        207   ............................................................  148

Query_41  4401  TGCGCTGGATGTGCAATAACATTGGAAGTGGATAACGGATCCGAATTCGAGCTCCGTCGA  4460
38        147   ............................................................  88
42        147   ............................................................  88
35        144   ............................................................  85
40        147   ............................................................  88
85        132                 ..............................................  87
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111       839                 ..................................N...........  884
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26        138              ..A..............................................  90
49        134                 ..............................................  89
115       135                   ............................................  92
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14        135                 ..............................................  90
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28        138              ..A..............................................  90
0         134                 ..............................................  89
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12        138                 ..............................................  93
3         135                 ..............................................  90
88        120                 ..............................................  75
31        134                   ............................................  91
24        138              ..A..............................................  90
5         135                 ..............................................  90
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22        137              ..A..............................................  89
8         136                 ..............................................  91
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20        65                    ....................--.....                   41
18        65                    ....................--.....                   41

Query_41  4461  -CAAGCTT-GCGGCCG-CACT-CGAGcaccaccaccaccacca-cT-G-AGA-T-CCGGC  4511
38        87    -.......-.......-....-.....................-..-.-...-.-.....  37
42        87    -.......-.......-....-.....................-..-.-...-.-.....  37
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110       884   A.......-.......-....-...............--....-..T.-...-.-.....  934
39        860   -.......-.......-....-....---..............-..-.-...-.N.....  908
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81        43                                                       .-.-.....  37
77        43                                                       .-.-.....  37
15        41                                                       .-.-.....  35
20        45                                                       .-.-.....  39
18        45                                                       .-.-.....  39

Query_41  4512  TGCTAACAAAG-CCC--G--AAAGGAAGC-TGAGTTGGC-TG-CTGCCACCGCTGAGCAA  4563
38        36    ...........C...--.--........                                  13
42        36    ...........-...--.--....N.G..                                 13
35        33    ...........-...--.--...-.....                                 11
40        36    ...........-...--.--........                                  14
85        35    ...........-...--.--....                                      17
83        35    ...........-...--.--.......                                   14
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Effective search space used: 704675686


Query= CMR200062.107

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Query_42  1     TCTCG-ATCCCGCGAAATTAATAC-GACTC-ACTATAGGGG--AATT-GTGAG-CGGA-T  52
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Query_42  99    TATAC-ATATG--CACCAT-CATCATCAT-CATTCTT-CT-GG-TGTAGAT-CTGTGGTC  149
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Query_42  150   TCAT-CC--G-CAGTTCG-AAAAGGGTA-CCGAGAA-CCTGTACTT-CCAAT-CCAATGC  200
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122       957   ....-..--.N.......A.........-.......-.........--.N..-.......  906
101       106   ..C.-G.T-.-.T..-..-.TG......-.......-.........-.....-.......  156
137       969   ..N.T..--.-.....N.-......N..-.......-..N......N.....N.....N.  916

Query_42  201   CCAACGTGAAGTTCCGCAATCGCGCATGGAGCAGATTTATGAGGAAGCCAAGACTCCTTA  260
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83        812   .G..                                                          809
110       154   .G..                                                          157
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105       160   .                                                             160
98        164   ....                                                          167
96        160   .                                                             160
9         155   .                                                             155
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17        149   .                                                             149
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111       152   .A..                                                          155
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112       156   .                                                             156
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94        163   .                                                             163
102       160   .                                                             160
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104       163   .                                                             163
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78        148   ..                                                            149
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87        799   .                                                             799
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137       915   ....                                                          912

Query_42  261   TAAATATGGGCTGGCTGTAGCTCCGGCCGACAACAAGCATAAAATAGACTGCCCTACCGT  320
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Query_42  321   GTTCCGCGAAGGGGATAAGTGGTATATGACCTACGTGGTTTATAATGGTAAGAGCGGACT  380
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Query_42  381   GGACGGACGTGGATACGAGACATGGATAGCCGAAAGTGATAATCTGTTGGAATGGCGTAC  440
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Query_42  441   ATTGGGACGTGTCTTGTCTTATCGTGACGGATTCTGGGATTGCAACCAGCGTGGTGGTTT  500
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Query_42  501   CCCTGCATTGCCGGATATGGAGTGGGGAGGAAGCTATGCCCTGCAGACGTATAAAGGCAA  560
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Query_42  561   GCATTGGATGACTTATCTGGGTGGGGAAGGGACCGGATATGAATCGGTGAACAAGCCGCT  620
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Query_42  621   GTATATTGGTTTGGCCTGGACAGACCGGCCTTTGGGTTCCGCCCATGAATGGCAGGCACA  680
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Query_42  681   GGACCAGCCCGTGATGAGTATCCATGATAAAGACGCGCAATGGTGGGAAAAGCTGACTCA  740
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Query_42  741   ATATAAGAGTGTGGTCTATTGGGAT-AAGGAGAAAACATTGGGCGCACC-TTTCGTCATG  798
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Query_42  799   TTCTATAACGCGGCAGGACGGCATCCGGAAACGGA-TTTGAAAGCGGAACGGG-TGGGTA  856
89        751   ...................................-.................-......  808
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84        748   ...................................T.................N......  807

Query_42  857   TCGCCTTGTCCAAAGATATGAAGAAA-TGG-AAACGATATCCGGGCAAT-CCGGTC-TTT  912
89        809   ..........................-...A..................-......-...  865
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84        808   .........N.C..............T...-..................C......T...  866

Query_42  913   GCACACGAAGCGGACGGAACCATTACGGGGGATGCGCATA-T-CCAGAAAA-TGGGCGAT  969
89        866   ..........................N.............T.-........-........  923
82        862   ..........................-.............-.-........-........  917
86        865   ...................................N....-.C........T.......N  923
84        867   ..N.......................-.....N.......-.-T.......-........  922

Query_42  970   GTGTATGTCATGTTC-TATTTC-TCGGCTTTTGAACCGAGCCGCAAA-TACAAGGCATTT  1026
89        924   ...............-....N.-.....-........N.........N............  980
82        918   ...............-......-....................-N..-............  973
86        924   ............-..-......N.....-...........T...T..-............  979
84        923   ...-N..........T......-..-.......-..........-..-..TN.-......  975

Query_42  1027  AATACA-TTTGC-TGCCAGTTATGACCTAGTACATTGGACGGATTGGAAAGGGGCGGATT  1084
89        981   ....N.T.....-......-..............................N.......-.  1037
82        974   ......-.....-......-..............-............-..N.......-.  1027
86        980   -.....-.....N....N............N............-..............-.  1035
84        976   .....N-.....-......-.........-.N.....NNN.......N..-..N..A...  1030

Query_42  1085  TGATTATCCCTTCTAAAGACTATGATGAATTGTTCGCTCATAAGAG-TTATGTGGTGAAA  1143
89        1038  .N.....-......-.................-..N...-N..N.N-.............  1092
82        1028  .......-......-............-.............-....-.........-NN.  1081
86        1036  .....-.T..............................NC...AN.T......CNNNN..  1094
84        1031  G...A...T..NTN..NA.AN......-.N.....                           1064

Query_42  1144  TACAATGGGGTGGTGTATC-ATT-TCTATT--GTGCCGTGAATGACGCGGAACAACGTGG  1199
89        1093  N......N..-.NNN....N...-......TN.G......N....NC..C.........N  1150
82        1082  ...........-.N..NN.-...-..-...--.N.NNNNA........N.T.AC....NN  1135
86        1095  .NN.T...N....NNG...-...C..AT.G--............NN..-N.......N..  1150

Query_42  1200  TATAG-CCATTGCTACCAGCAAACCGA-TGGGA-CGTTCACAAGTGCATTTCCCGGAACG  1256
89        1151  NNANN-N......N.....GC......T...N.-N....N..........            1198
82        1136  N.-..-..............-....N.-...A.-...                         1167
86        1151  NN...C........-N...GC......-..T..N....                        1186

Query_42  1257  GGAGGTGAAGAATCGCCGGATGGTGATGGAATTGGATAAAGGATGGAAAACATGGCTGAC  1316

Query_42  1317  GGAAGCAACTCATCTGAAAGGGTTGTTTGCTCAAAAGGCAATAGAAGTAAATATTCCTCA  1376

Query_42  1377  TAACTGGGATGATTATTATGGCTACCGCCAACTGACACATGGTAATTTGCACGGTACTGC  1436

Query_42  1437  CATATACGAAAAGACCTTCACATTGGATGATTCTCAGTTTCTAATTTCCAACTCTTCATT  1496

Query_42  1497  CGGAAAACGTTATTTTCTTCGTTTTGAGGGAGTGGGGACGTATGCCACTATAACGTTGAA  1556
96        379                  ............T.......                           398
95        380                  ............T.......                           399
94        382                  ............T.......                           401
97        381                  ............T.......                           400

Query_42  1557  TGGAAAGGATTTCGGCCGTCATCCCGTAGGGCGTACTACGCTGACATTGGATGTGACGGA  1616

Query_42  1617  TGCGTTGAAGCTGGGAGAGAATAAGCTGGTAGTGAAAGCGGAACATCCTGAAATGATAGC  1676

Query_42  1677  CGACATGCCTTGGGTGTGCGGTGGCTGTTCCTCGGAATGGGGATTCAGCGAAGGTTCCCA  1736

Query_42  1737  GCCTTTGGGAATTTTCCGTCCCGTGGTGCTGGAGGCTACGGATGAGATCCGCATTGAGCC  1796

Query_42  1797  TTTCGGAGTGCATATCTGGAATGATGATAAGGCGGGAACTGTCTTTGTGGAAACGGAGGT  1856

Query_42  1857  GAAAAATTACGGAAAGACTGCTGAGACGGTGGAAGTGGTTAATAAATTCAGTAATGCGGA  1916

Query_42  1917  TGGCAAGCAGGTGTTCCGCCTGACGGAGAAGGTGACTTTGCAGCCGGGTGAAAAGAAGGT  1976
45        875                                            ...........NT...A..  893

Query_42  1977  GGTGAAGCAACAATCGCCAGTGCAGAATCCTGTTTTATGGAGTACGGAGAATCCTTATTT  2036
45        894   ....                                                          897

Query_42  2037  GTATAAACTGGCCAGTATGATAAAGCGTGGTAAGAGTACTACGGATGAGATTAGTACACC  2096

Query_42  2097  CTTTGGTATCCGTACCATCAGTTGGCCGGTGAAACGGGAGGATGGTGACGGACGGTTCTA  2156

Query_42  2157  TCTGAACGGACAGCCTGTCTTTATCAATGGAGTGTGTGAATATGAACATCAGTTCGGACA  2216

Query_42  2217  AAGCCATGCTTTCAGCCGTGAGCAGGTGGCAGCCCGTGTGAAACAGATCCGTGCGGCGGG  2276

Query_42  2277  CTTCAACGCTTTCCGTGACGCTCACCAGCCCCATCACCTGGATTATCAGAAATATTGGGA  2336

Query_42  2337  CAAGGAAGGAGTCTTGTGGTGGACTCAGTTTTCGGCCCACGTGTGGTATGATACTCCGGA  2396

Query_42  2397  GTTTCGTGAGAATTTCAAGAAACTGCTCCGCCAGTGGGTGAAAGAGCGTCGTAACTCGCC  2456

Query_42  2457  CAGTGTGGTGATGTGGGGATTGCAGAACGAAAGCACGCTGCCTAAGGAGTTTGCCGAAGA  2516
33        589                                                    ...T.......  599

Query_42  2517  GTGTAGTGAGATTATCCGGGAAATGGATCCTACGGCCCGTACCATGCGTGTGATTACTAC  2576
33        600   ......                                                        605

Query_42  2577  GTGTAACGGTGGTGATGGGACAGATTGGAATGTTATTCAGAACTGGAGTGGAACCTATGG  2636

Query_42  2637  TGGTGATGTGAATAAGTATGGCCGTGAATTGTCACAGAAGAATCAGTTGTTGAACGGTGC  2696

Query_42  2697  TTATGGGGCATGGCGCAGCATCGGATTGCATACGGAACCGGCAGCTTTTGATGTGAATGG  2756

Query_42  2757  TGTATGGAGCGAGGAGCGTATGTGCCAGCTGATGGAAACCAAGATACGACTGGCGGAACA  2816

Query_42  2817  GGCAAAGGACAGTGTGTGCGGACAATTCCAATGGATATTCAGCAGTCATGATAATCCGGG  2876

Query_42  2877  ACGCCGCCAGCCGGATGAAGCGTATCGCCGGATAGATAAGGTGGGACCATTTAATTATAA  2936

Query_42  2937  AGGATTGGTGACTCCGTGGGAGGAGCCGCTGGATGTATATTATATGTATCGCGCGAACTA  2996

Query_42  2997  TGTGCCGGCTTCCGAAGATCCGATGGTTTATCTGGCATCTCATACATGGGAGGACCGTTT  3056

Query_42  3057  TGCGACAGGCCGCAGACGGGCTACCATTGAGGCGTACAGCAATTGTGACAGTGTGTTGCT  3116

Query_42  3117  GTACAATGATGCGGTGGATGCTGAATACTTGGGACGGAAATTGAATCATGGGGTGGGGAC  3176

Query_42  3177  TCATTTCATGTGGGAAAACCGCGATATCCGTTACAATGTGCTTCGTGCTGTGGGGTACTT  3236

Query_42  3237  TAAAGGAAAACCGGCAGCGGAAGATGTGCTGGTGCTGAACGGTCTGGAAAAAGCTCCTCA  3296

Query_42  3297  TTTTGAAGCTCTTTACCGTGGTTCTGCTATAGTGCCTGTTGCTGCCGACCGGTTGAACGG  3356

Query_42  3357  AACTGATTTGTTGAAAGGAGCTGA-GGGATATA-CGTAT-CTTTATCGTTTGAA-TTGCG  3412
38        1155                                                ......NN-N..N.  1143
42        1180         ........-.N......A..NNN...-.....T.N....TCG...N--.....  1132
35        1170                       ...-........A...N.-...-..NN..-..N-N....  1137
40        1169                                          ...AN...N.....A.....  1150

Query_42  3413  G-AGGAG-A---C-GCTT-AT-ACGGA-TA-C-GTA-TGGTC-AGGT-CTGG-GCGCAGG  3457
38        1142  .N.....-N---NN....N..-N....-..A.-...-.....-....-....-.......  1094
42        1131  .-N.-..-.---N-NGN.-..-NN.-.-..-.-...N....T-CA..-TNN.-......A  1088
35        1136  .-N....G.---.-NGC.-..N.....N..-.-..T-AT...-.A..T....-NN.....  1088
40        1149  .-...G.-.GGA.-...A-.N-.....-NN-NN.N.-N....C....-....AN....NN  1099

Query_42  3458  A-TAA--CAGCCGTTATTCTCATTCGTGGG-CGG--AATCG-TTTGTTCATCCGTCGGAT  3510
38        1093  .A...--..........NT..N.-......G...--.....-.....-............  1041
42        1087  .-...--................CG.....-...--.....-..-...............  1036
35        1087  .-...--..................NNN..N...--.....-..-.......-.......  1036
40        1098  .A...AC.......-...N...NNN-...N-N..GA.....G....N.............  1042

Query_42  3511  AGT-GTACAGTTGTTGA-GCCCTTATCAGGC-GAG-CCA-GCGTACCACGAATGATCCCA  3565
38        1040  ...N..........G.N-............N-...-...-....................  985
42        1035  ...-..N..........-N.NT.AT......-...-...-....N...............  981
35        1035  ...-.....NN......-AG..C........-...G...-....................  980
40        1041  ...-NNNA.....G...A.....AN......N...-..NN....................  984

Query_42  3566  TTCATGGCACTAGGGACTGGG-AACTGTTCCAGACTTTCCGCTTCGGACGCCATAAGCTG  3624
38        984   .....................-......................................  926
42        980   ....................--......................................  923
35        979   N....................-...........GAC........................  921
40        983   .....................G...........N..........................  924

Query_42  3625  AACTT-CCGCTTTCCCGTTCCGG-ATGGCGA-GTATCGTGTGGAACTTTATTTTACAGAA  3681
38        925   .....-.................G.......-............................  868
42        922   .....-.................-.......-............-...............  867
35        920   .....-.................-.......-............................  864
40        923   .....Y................--.......A............................  866

Query_42  3682  CCCTGGCATGGTACAGGAGGCGGCGTACAGACGGATTGTGAAGG-CTTGCGTATTTTTGA  3740
38        867   ........................................G...G...............  808
42        866   ............................................-...............  808
35        863   ............................................-...............  805
40        865   ............................................-...............  807

Query_42  3741  TGTAGCGGTAAATGATAAAGTACTTCTGGACGACTTGGATGTATGGGCTGAAGCGGGTCA  3800
38        807   ............................................................  748
42        807   ............................................................  748
35        804   ............................................................  745
40        806   ............................-...............................  748

Query_42  3801  TGACGGCGCTTGCAAAAAGGTGGTGAATGCTATCGTGAAAGGGGGAGTCTTGAAGATTAA  3860
38        747   ............................................................  688
42        747   ............................................................  688
35        744   ............................................................  685
40        747   ............................................................  688

Query_42  3861  TTTTCCGGAGGTGAAAGCGGGGCAAGCTTTGATTTGTGGCATTGCGATAGCTTGTAAAGG  3920
38        687   ............................................................  628
42        687   ............................................................  628
35        684   ............................................................  625
40        687   ............................................................  628

Query_42  3921  CGACTTGGATTCCGTTCGCTCTTTTTCTGCCCATAGCTTCAGCTGGGCTGCACAAGACAA  3980
38        627   ............................................................  568
42        627   ............................................................  568
35        624   ............................................................  565
40        627   ............................................................  568

Query_42  3981  GGAGGTGATGGAAAAGACTCCCAAAGAATTATTGCCTGAAGATAAAAACGCACGTGCCAA  4040
38        567   ............................................................  508
42        567   ............................................................  508
35        564   ............................................................  505
40        567   ............................................................  508

Query_42  4041  TGTGACTTATCAAGCGGAGGATGCTGTGCTGAAAGGTAAGTTCATAAAGAAAGAGGTTAA  4100
38        507   ............................................................  448
42        507   ............................................................  448
35        504   ............................................................  445
40        507   ............................................................  448

Query_42  4101  GAAACAAACCGGGGTTTTCTTTGGTAAAGGTACACAAAGCAGTATTACTTGGAACATTTC  4160
38        447   ............................................................  388
42        447   ............................................................  388
35        444   ............................................................  385
40        447   ............................................................  388

Query_42  4161  TACCGGTCTGGCACAAGTCTATGCTCTTCGTTTTAAATACATGAATGTTACAGGGAAGCC  4220
38        387   ............................................................  328
42        387   ............................................................  328
35        384   ............................................................  325
40        387   ............................................................  328

Query_42  4221  TATGAAGGTGCGTATGCAGTTCATTGATTCCAAAGGGGTGGTACTGAAGGAAGATAATCT  4280
38        327   ............................................................  268
42        327   ............................................................  268
35        324   ............................................................  265
40        327   ............................................................  268

Query_42  4281  GACTTTTGCCGAAACTCCCGGAAAGTGGCGTATGCTGAGTACAACGACGGGTACGTATAT  4340
38        267   ............................................................  208
42        267   ............................................................  208
35        264   ............................................................  205
40        267   ............................................................  208

Query_42  4341  CAATGCAGGCTATTATAAGGTGGTGCTTTCCGCACCGGATATGGAGGGACTGGCATTGGA  4400
38        207   ............................................................  148
42        207   ............................................................  148
35        204   ............................................................  145
40        207   ............................................................  148

Query_42  4401  TGCGCTGGATGTGCAATAACATTGGAAGTGGATAACGGATCCGAATTCGAGCTCCGTCGA  4460
38        147   ............................................................  88
42        147   ............................................................  88
35        144   ............................................................  85
40        147   ............................................................  88
85        132                 ..............................................  87
83        129                 ..............................................  84
110       838                 ..............................................  883
39        814                 ..............................................  859
27        841                   ............................................  884
23        842                   ..........................N.....C...........  885
111       839                 ..................................N...........  884
112       835                 ..............................N.-.............  879
26        138              ..A..............................................  90
49        134                 ..............................................  89
115       135                   ............................................  92
44        134                 ..............................................  89
60        134                   ............................................  91
56        134                  .............................................  90
14        135                 ..............................................  90
116       128                   ............................................  85
64        132                   ............................................  89
28        138              ..A..............................................  90
0         134                 ..............................................  89
46        136                 ..............................................  91
30        131                   ............................................  88
12        138                 ..............................................  93
3         135                 ..............................................  90
88        120                 ..............................................  75
31        134                   ............................................  91
24        138              ..A..............................................  90
5         135                 ..............................................  90
34        135                   ............................................  92
62        136                   ............................................  93
22        137              ..A..............................................  89
8         136                 ..............................................  91
73        130                   ............................................  87
47        139                 ..............................................  94
87        120                 ..............................................  75
68        129                   ............................................  86
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Query_42  4461  -CAAGCTT-GCGGCCG-CACT-CGAGcaccaccaccaccacca-cT-G-AGA-T-CCGGC  4511
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Query_42  4512  TGCTAACAAAG-CCC--G--AAAGGAAGC-TGAGTTGGC-TG-CTGCCACCGCTGAGCAA  4563
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Query_42  4564  TAAC-TAG-CA-TAAC-C-CCTT-GGGGCCTCTAAACGGGTCTT--GAGG-GG--TTTTT  4612
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Query_42  4613  TGCTGAAA  4620
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Lambda      K        H
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Gapped
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Effective search space used: 704675686


Query= CMR200062.108

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Query_43  150   TCAT-CC--G-CAGTTCG-AAAAGGGTA-CCGAGAA-CCTGTACTT-CCAAT-CCAATGC  200
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Query_43  201   CCAACGTGAAGTTCCGCAATCGCGCATGGAGCAGATTTATGAGGAAGCCAAGACTCCTTA  260
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9         155   .                                                             155
103       162   .                                                             162
90        149   .....                                                         153
17        149   .                                                             149
70        152   ...                                                           154
111       152   .A..                                                          155
100       151   ....                                                          154
59        144   ...                                                           146
112       156   .                                                             156
95        161   .                                                             161
94        163   .                                                             163
102       160   .                                                             160
80        152   ..                                                            153
29        148   .                                                             148
97        162   .                                                             162
104       163   .                                                             163
72        151   ...                                                           153
74        146   ...                                                           148
76        150   ..                                                            151
61        138   ...                                                           140
78        148   ..                                                            149
91        145   .....                                                         149
99        144   ....                                                          147
114       168   ...                                                           170
87        799   .                                                             799
122       905   .                                                             905
101       157   ...                                                           159
137       915   ....                                                          912

Query_43  261   TAAATATGGGCTGGCTGTAGCTCCGGCCGACAACAAGCATAAAATAGACTGCCCTACCGT  320
89        213   ............................................................  272
82        210   ............................................................  269
86        212   ............................................................  271
84        209   ............................................................  268

Query_43  321   GTTCCGCGAAGGGGATAAGTGGTATATGACCTACGTGGTTTATAATGGTAAGAGCGGACT  380
89        273   ............................................................  332
82        270   ............................................................  329
86        272   ............................................................  331
84        269   ............................................................  328

Query_43  381   GGACGGACGTGGATACGAGACATGGATAGCCGAAAGTGATAATCTGTTGGAATGGCGTAC  440
89        333   ............................................................  392
82        330   ............................................................  389
86        332   ............................................................  391
84        329   ............................................................  388

Query_43  441   ATTGGGACGTGTCTTGTCTTATCGTGACGGATTCTGGGATTGCAACCAGCGTGGTGGTTT  500
89        393   ............................................................  452
82        390   ............................................................  449
86        392   ............................................................  451
84        389   ............................................................  448

Query_43  501   CCCTGCATTGCCGGATATGGAGTGGGGAGGAAGCTATGCCCTGCAGACGTATAAAGGCAA  560
89        453   ............................................................  512
82        450   ............................................................  509
86        452   ............................................................  511
84        449   ............................................................  508

Query_43  561   GCATTGGATGACTTATCTGGGTGGGGAAGGGACCGGATATGAATCGGTGAACAAGCCGCT  620
89        513   ............................................................  572
82        510   ............................................................  569
86        512   ............................................................  571
84        509   ............................................................  568

Query_43  621   GTATATTGGTTTGGCCTGGACAGACCGGCCTTTGGGTTCCGCCCATGAATGGCAGGCACA  680
89        573   ............................................................  632
82        570   ............................................................  629
86        572   ............................................................  631
84        569   ............................................................  628

Query_43  681   GGACCAGCCCGTGATGAGTATCCATGATAAAGACGCGCAATGGTGGGAAAAGCTGACTCA  740
89        633   ............................................................  692
82        630   ............................................................  689
86        632   ............................................................  691
84        629   ............................................................  688

Query_43  741   ATATAAGAGTGTGGTCTATTGGGAT-AAGGAGAAAACATTGGGCGCACC-TTTCGTCATG  798
89        693   .........................-.......................-..........  750
82        690   .........................-.......................-..........  747
86        692   .........................A.......................-..........  750
84        689   .........................-.......................T..........  747

Query_43  799   TTCTATAACGCGGCAGGACGGCATCCGGAAACGGA-TTTGAAAGCGGAACGGG-TGGGTA  856
89        751   ...................................-.................-......  808
82        748   ...................................-.................-......  805
86        751   .............N.....................-.................-......  808
84        748   ...................................T.................N......  807

Query_43  857   TCGCCTTGTCCAAAGATATGAAGAAA-TGG-AAACGATATCCGGGCAAT-CCGGTC-TTT  912
89        809   ..........................-...A..................-......-...  865
82        806   ..........................-...-..................-......-...  861
86        809   .........N................-...-..................-......-...  864
84        808   .........N.C..............T...-..................C......T...  866

Query_43  913   GCACACGAAGCGGACGGAACCATTACGGGGGATGCGCATA-T-CCAGAAAA-TGGGCGAT  969
89        866   ..........................N.............T.-........-........  923
82        862   ..........................-.............-.-........-........  917
86        865   ...................................N....-.C........T.......N  923
84        867   ..N.......................-.....N.......-.-T.......-........  922

Query_43  970   GTGTATGTCATGTTC-TATTTC-TCGGCTTTTGAACCGAGCCGCAAA-TACAAGGCATTT  1026
89        924   ...............-....N.-.....-........N.........N............  980
82        918   ...............-......-....................-N..-............  973
86        924   ............-..-......N.....-...........T...T..-............  979
84        923   ...-N..........T......-..-.......-..........-..-..TN.-......  975

Query_43  1027  AATACA-TTTGC-TGCCAGTTATGACCTAGTACATTGGACGGATTGGAAAGGGGCGGATT  1084
89        981   ....N.T.....-......-..............................N.......-.  1037
82        974   ......-.....-......-..............-............-..N.......-.  1027
86        980   -.....-.....N....N............N............-..............-.  1035
84        976   .....N-.....-......-.........-.N.....NNN.......N..-..N..A...  1030

Query_43  1085  TGATTATCCCTTCTAAAGACTATGATGAATTGTTCGCTCATAAGAG-TTATGTGGTGAAA  1143
89        1038  .N.....-......-.................-..N...-N..N.N-.............  1092
82        1028  .......-......-............-.............-....-.........-NN.  1081
86        1036  .....-.T..............................NC...AN.T......CNNNN..  1094
84        1031  G...A...T..NTN..NA.AN......-.N.....                           1064

Query_43  1144  TACAATGGGGTGGTGTATC-ATT-TCTATT--GTGCCGTGAATGACGCGGAACAACGTGG  1199
89        1093  N......N..-.NNN....N...-......TN.G......N....NC..C.........N  1150
82        1082  ...........-.N..NN.-...-..-...--.N.NNNNA........N.T.AC....NN  1135
86        1095  .NN.T...N....NNG...-...C..AT.G--............NN..-N.......N..  1150

Query_43  1200  TATAG-CCATTGCTACCAGCAAACCGA-TGGGA-CGTTCACAAGTGCATTTCCCGGAACG  1256
89        1151  NNANN-N......N.....GC......T...N.-N....N..........            1198
82        1136  N.-..-..............-....N.-...A.-...                         1167
86        1151  NN...C........-N...GC......-..T..N....                        1186

Query_43  1257  GGAGGTGAAGAATCGCCGGATGGTGATGGAATTGGATAAAGGATGGAAAACATGGCTGAC  1316

Query_43  1317  GGAAGCAACTCATCTGAAAGGGTTGTTTGCTCAAAAGGCAATAGAAGTAAATATTCCTCA  1376

Query_43  1377  TAACTGGGATGATTATTATGGCTACCGCCAACTGACACATGGTAATTTGCACGGTACTGC  1436

Query_43  1437  CATATACGAAAAGACCTTCACATTGGATGATTCTCAGTTTCTAATTTCCAACTCTTCATT  1496

Query_43  1497  CGGAAAACGTTATTTTCTTCGTTTTGAGGGAGTGGGGACGTATGCCACTATAACGTTGAA  1556
96        379                  ............T.......                           398
95        380                  ............T.......                           399
94        382                  ............T.......                           401
97        381                  ............T.......                           400

Query_43  1557  TGGAAAGGATTTCGGCCGTCATCCCGTAGGGCGTACTACGCTGACATTGGATGTGACGGA  1616

Query_43  1617  TGCGTTGAAGCTGGGAGAGAATAAGCTGGTAGTGAAAGCGGAACATCCTGAAATGATAGC  1676

Query_43  1677  CGACATGCCTTGGGTGTGCGGTGGCTGTTCCTCGGAATGGGGATTCAGCGAAGGTTCCCA  1736

Query_43  1737  GCCTTTGGGAATTTTCCGTCCCGTGGTGCTGGAGGCTACGGATGAGATCCGCATTGAGCC  1796

Query_43  1797  TTTCGGAGTGCATATCTGGAATGATGATAAGGCGGGAACTGTCTTTGTGGAAACGGAGGT  1856

Query_43  1857  GAAAAATTACGGAAAGACTGCTGAGACGGTGGAAGTGGTTAATAAATTCAGTAATGCGGA  1916

Query_43  1917  TGGCAAGCAGGTGTTCCGCCTGACGGAGAAGGTGACTTTGCAGCCGGGTGAAAAGAAGGT  1976
45        875                                            ...........NT...A..  893

Query_43  1977  GGTGAAGCAACAATCGCCAGTGCAGAATCCTGTTTTATGGAGTACGGAGAATCCTTATTT  2036
45        894   ....                                                          897

Query_43  2037  GTATAAACTGGCCAGTATGATAAAGCGTGGTAAGAGTACTACGGATGAGATTAGTACACC  2096

Query_43  2097  CTTTGGTATCCGTACCATCAGTTGGCCGGTGAAACGGGAGGATGGTGACGGACGGTTCTA  2156

Query_43  2157  TCTGAACGGACAGCCTGTCTTTATCAATGGAGTGTGTGAATATGAACATCAGTTCGGACA  2216

Query_43  2217  AAGCCATGCTTTCAGCCGTGAGCAGGTGGCAGCCCGTGTGAAACAGATCCGTGCGGCGGG  2276

Query_43  2277  CTTCAACGCTTTCCGTGACGCTCACCAGCCCCATCACCTGGATTATCAGAAATATTGGGA  2336

Query_43  2337  CAAGGAAGGAGTCTTGTGGTGGACTCAGTTTTCGGCCCACGTGTGGTATGATACTCCGGA  2396

Query_43  2397  GTTTCGTGAGAATTTCAAGAAACTGCTCCGCCAGTGGGTGAAAGAGCGTCGTAACTCGCC  2456

Query_43  2457  CAGTGTGGTGATGTGGGGATTGCAGAACCAGAGCACGCTGCCTAAGGAGTTTGCCGAAGA  2516
33        589                                                    ...T.......  599

Query_43  2517  GTGTAGTGAGATTATCCGGGAAATGGATCCTACGGCCCGTACCATGCGTGTGATTACTAC  2576
33        600   ......                                                        605

Query_43  2577  GTGTAACGGTGGTGATGGGACAGATTGGAATGTTATTCAGAACTGGAGTGGAACCTATGG  2636

Query_43  2637  TGGTGATGTGAATAAGTATGGCCGTGAATTGTCACAGAAGAATCAGTTGTTGAACGGTGA  2696

Query_43  2697  ATATGGGGCATGGCGCAGCATCGGATTGCATACGGAACCGGCAGCTTTTGATGTGAATGG  2756

Query_43  2757  TGTATGGAGCGAGGAGCGTATGTGCCAGCTGATGGAAACCAAGATACGACTGGCGGAACA  2816

Query_43  2817  GGCAAAGGACAGTGTGTGCGGACAATTCCAATGGATATTCAGCAGTCATGATAATCCGGG  2876

Query_43  2877  ACGCCGCCAGCCGGATGAAGCGTATCGCCGGATAGATAAGGTGGGACCATTTAATTATAA  2936

Query_43  2937  AGGATTGGTGACTCCGTGGGAGGAGCCGCTGGATGTATATTATATGTATCGCGCGAACTA  2996

Query_43  2997  TGTGCCGGCTTCCGAAGATCCGATGGTTTATCTGGCATCTCATACATGGGAGGACCGTTT  3056

Query_43  3057  TGCGACAGGCCGCAGACGGGCTACCATTGAGGCGTACAGCAATTGTGACAGTGTGTTGCT  3116

Query_43  3117  GTACAATGATGCGGTGGATGCTGAATACTTGGGACGGAAATTGAATCATGGGGTGGGGAC  3176

Query_43  3177  TCATTTCATGTGGGAAAACCGCGATATCCGTTACAATGTGCTTCGTGCTGTGGGGTACTT  3236

Query_43  3237  TAAAGGAAAACCGGCAGCGGAAGATGTGCTGGTGCTGAACGGTCTGGAAAAAGCTCCTCA  3296

Query_43  3297  TTTTGAAGCTCTTTACCGTGGTTCTGCTATAGTGCCTGTTGCTGCCGACCGGTTGAACGG  3356

Query_43  3357  AACTGATTTGTTGAAAGGAGCTGA-GGGATATA-CGTAT-CTTTATCGTTTGAA-TTGCG  3412
38        1155                                                ......NN-N..N.  1143
42        1180         ........-.N......A..NNN...-.....T.N....TCG...N--.....  1132
35        1170                       ...-........A...N.-...-..NN..-..N-N....  1137
40        1169                                          ...AN...N.....A.....  1150

Query_43  3413  G-AGGAG-A---C-GCTT-AT-ACGGA-TA-C-GTA-TGGTC-AGGT-CTGG-GCGCAGG  3457
38        1142  .N.....-N---NN....N..-N....-..A.-...-.....-....-....-.......  1094
42        1131  .-N.-..-.---N-NGN.-..-NN.-.-..-.-...N....T-CA..-TNN.-......A  1088
35        1136  .-N....G.---.-NGC.-..N.....N..-.-..T-AT...-.A..T....-NN.....  1088
40        1149  .-...G.-.GGA.-...A-.N-.....-NN-NN.N.-N....C....-....AN....NN  1099

Query_43  3458  A-TAA--CAGCCGTTATTCTCATTCGTGGG-CGG--AATCG-TTTGTTCATCCGTCGGAT  3510
38        1093  .A...--..........NT..N.-......G...--.....-.....-............  1041
42        1087  .-...--................CG.....-...--.....-..-...............  1036
35        1087  .-...--..................NNN..N...--.....-..-.......-.......  1036
40        1098  .A...AC.......-...N...NNN-...N-N..GA.....G....N.............  1042

Query_43  3511  AGT-GTACAGTTGTTGA-GCCCTTATCAGGC-GAG-CCA-GCGTACCACGAATGATCCCA  3565
38        1040  ...N..........G.N-............N-...-...-....................  985
42        1035  ...-..N..........-N.NT.AT......-...-...-....N...............  981
35        1035  ...-.....NN......-AG..C........-...G...-....................  980
40        1041  ...-NNNA.....G...A.....AN......N...-..NN....................  984

Query_43  3566  TTCATGGCACTAGGGACTGGG-AACTGTTCCAGACTTTCCGCTTCGGACGCCATAAGCTG  3624
38        984   .....................-......................................  926
42        980   ....................--......................................  923
35        979   N....................-...........GAC........................  921
40        983   .....................G...........N..........................  924

Query_43  3625  AACTT-CCGCTTTCCCGTTCCGG-ATGGCGA-GTATCGTGTGGAACTTTATTTTACAGAA  3681
38        925   .....-.................G.......-............................  868
42        922   .....-.................-.......-............-...............  867
35        920   .....-.................-.......-............................  864
40        923   .....Y................--.......A............................  866

Query_43  3682  CCCTGGCATGGTACAGGAGGCGGCGTACAGACGGATTGTGAAGG-CTTGCGTATTTTTGA  3740
38        867   ........................................G...G...............  808
42        866   ............................................-...............  808
35        863   ............................................-...............  805
40        865   ............................................-...............  807

Query_43  3741  TGTAGCGGTAAATGATAAAGTACTTCTGGACGACTTGGATGTATGGGCTGAAGCGGGTCA  3800
38        807   ............................................................  748
42        807   ............................................................  748
35        804   ............................................................  745
40        806   ............................-...............................  748

Query_43  3801  TGACGGCGCTTGCAAAAAGGTGGTGAATGCTATCGTGAAAGGGGGAGTCTTGAAGATTAA  3860
38        747   ............................................................  688
42        747   ............................................................  688
35        744   ............................................................  685
40        747   ............................................................  688

Query_43  3861  TTTTCCGGAGGTGAAAGCGGGGCAAGCTTTGATTTGTGGCATTGCGATAGCTTGTAAAGG  3920
38        687   ............................................................  628
42        687   ............................................................  628
35        684   ............................................................  625
40        687   ............................................................  628

Query_43  3921  CGACTTGGATTCCGTTCGCTCTTTTTCTGCCCATAGCTTCAGCTGGGCTGCACAAGACAA  3980
38        627   ............................................................  568
42        627   ............................................................  568
35        624   ............................................................  565
40        627   ............................................................  568

Query_43  3981  GGAGGTGATGGAAAAGACTCCCAAAGAATTATTGCCTGAAGATAAAAACGCACGTGCCAA  4040
38        567   ............................................................  508
42        567   ............................................................  508
35        564   ............................................................  505
40        567   ............................................................  508

Query_43  4041  TGTGACTTATCAAGCGGAGGATGCTGTGCTGAAAGGTAAGTTCATAAAGAAAGAGGTTAA  4100
38        507   ............................................................  448
42        507   ............................................................  448
35        504   ............................................................  445
40        507   ............................................................  448

Query_43  4101  GAAACAAACCGGGGTTTTCTTTGGTAAAGGTACACAAAGCAGTATTACTTGGAACATTTC  4160
38        447   ............................................................  388
42        447   ............................................................  388
35        444   ............................................................  385
40        447   ............................................................  388

Query_43  4161  TACCGGTCTGGCACAAGTCTATGCTCTTCGTTTTAAATACATGAATGTTACAGGGAAGCC  4220
38        387   ............................................................  328
42        387   ............................................................  328
35        384   ............................................................  325
40        387   ............................................................  328

Query_43  4221  TATGAAGGTGCGTATGCAGTTCATTGATTCCAAAGGGGTGGTACTGAAGGAAGATAATCT  4280
38        327   ............................................................  268
42        327   ............................................................  268
35        324   ............................................................  265
40        327   ............................................................  268

Query_43  4281  GACTTTTGCCGAAACTCCCGGAAAGTGGCGTATGCTGAGTACAACGACGGGTACGTATAT  4340
38        267   ............................................................  208
42        267   ............................................................  208
35        264   ............................................................  205
40        267   ............................................................  208

Query_43  4341  CAATGCAGGCTATTATAAGGTGGTGCTTTCCGCACCGGATATGGAGGGACTGGCATTGGA  4400
38        207   ............................................................  148
42        207   ............................................................  148
35        204   ............................................................  145
40        207   ............................................................  148

Query_43  4401  TGCGCTGGATGTGCAATAACATTGGAAGTGGATAACGGATCCGAATTCGAGCTCCGTCGA  4460
38        147   ............................................................  88
42        147   ............................................................  88
35        144   ............................................................  85
40        147   ............................................................  88
85        132                 ..............................................  87
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110       838                 ..............................................  883
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23        842                   ..........................N.....C...........  885
111       839                 ..................................N...........  884
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26        138              ..A..............................................  90
49        134                 ..............................................  89
115       135                   ............................................  92
44        134                 ..............................................  89
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14        135                 ..............................................  90
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28        138              ..A..............................................  90
0         134                 ..............................................  89
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30        131                   ............................................  88
12        138                 ..............................................  93
3         135                 ..............................................  90
88        120                 ..............................................  75
31        134                   ............................................  91
24        138              ..A..............................................  90
5         135                 ..............................................  90
34        135                   ............................................  92
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22        137              ..A..............................................  89
8         136                 ..............................................  91
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15        61                    ....................--.....                   37
20        65                    ....................--.....                   41
18        65                    ....................--.....                   41

Query_43  4461  -CAAGCTT-GCGGCCG-CACT-CGAGcaccaccaccaccacca-cT-G-AGA-T-CCGGC  4511
38        87    -.......-.......-....-.....................-..-.-...-.-.....  37
42        87    -.......-.......-....-.....................-..-.-...-.-.....  37
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110       884   A.......-.......-....-...............--....-..T.-...-.-.....  934
39        860   -.......-.......-....-....---..............-..-.-...-.N.....  908
27        885   -.......T.......-....-.....................-..-.-.N.-.C.....  937
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3         89    -.......-NN.....-....-.....................-..-.-...-.-.....  39
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81        43                                                       .-.-.....  37
77        43                                                       .-.-.....  37
15        41                                                       .-.-.....  35
20        45                                                       .-.-.....  39
18        45                                                       .-.-.....  39

Query_43  4512  TGCTAACAAAG-CCC--G--AAAGGAAGC-TGAGTTGGC-TG-CTGCCACCGCTGAGCAA  4563
38        36    ...........C...--.--........                                  13
42        36    ...........-...--.--....N.G..                                 13
35        33    ...........-...--.--...-.....                                 11
40        36    ...........-...--.--........                                  14
85        35    ...........-...--.--....                                      17
83        35    ...........-...--.--.......                                   14
110       935   ...........-..N--A--....T....N.........-..-.................  987
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44        37    ...........-...--.--....                                      19
60        39    ...........-...--.--.....                                     20
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14        38    ...........-...--.--...                                       21
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Query= CMR200062.109

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Query_44  1     TCTCG-ATCCCGCGAAATTAATAC-GACTC-ACTATAGGGG--AATT-GTGAG-CGGA-T  52
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Query_44  99    TATAC-ATATG--CACCAT-CATCATCAT-CATTCTT-CT-GG-TGTAGAT-CTGTGGTC  149
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Query_44  150   TCAT-CC--G-CAGTTCG-AAAAGGGTA-CCGAGAA-CCTGTACTT-CCAAT-CCAATGC  200
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122       957   ....-..--.N.......A.........-.......-.........--.N..-.......  906
101       106   ..C.-G.T-.-.T..-..-.TG......-.......-.........-.....-.......  156
137       969   ..N.T..--.-.....N.-......N..-.......-..N......N.....N.....N.  916

Query_44  201   CCAACGTGAAGTTCCGCAATCGCGCATGGAGCAGATTTATGAGGAAGCCAAGACTCCTTA  260
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83        812   .G..                                                          809
110       154   .G..                                                          157
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105       160   .                                                             160
98        164   ....                                                          167
96        160   .                                                             160
9         155   .                                                             155
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17        149   .                                                             149
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111       152   .A..                                                          155
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112       156   .                                                             156
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94        163   .                                                             163
102       160   .                                                             160
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104       163   .                                                             163
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78        148   ..                                                            149
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87        799   .                                                             799
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101       157   ...                                                           159
137       915   ....                                                          912

Query_44  261   TAAATATGGGCTGGCTGTAGCTCCGGCCGACAACAAGCATAAAATAGACTGCCCTACCGT  320
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Query_44  321   GTTCCGCGAAGGGGATAAGTGGTATATGACCTACGTGGTTTATAATGGTAAGAGCGGACT  380
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Query_44  381   GGACGGACGTGGATACGAGACATGGATAGCCGAAAGTGATAATCTGTTGGAATGGCGTAC  440
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Query_44  441   ATTGGGACGTGTCTTGTCTTATCGTGACGGATTCTGGGATTGCAACCAGCGTGGTGGTTT  500
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Query_44  501   CCCTGCATTGCCGGATATGGAGTGGGGAGGAAGCTATGCCCTGCAGACGTATAAAGGCAA  560
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Query_44  561   GCATTGGATGACTTATCTGGGTGGGGAAGGGACCGGATATGAATCGGTGAACAAGCCGCT  620
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Query_44  621   GTATATTGGTTTGGCCTGGACAGACCGGCCTTTGGGTTCCGCCCATGAATGGCAGGCACA  680
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Query_44  681   GGACCAGCCCGTGATGAGTATCCATGATAAAGACGCGCAATGGTGGGAAAAGCTGACTCA  740
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Query_44  741   ATATAAGAGTGTGGTCTATTGGGAT-AAGGAGAAAACATTGGGCGCACC-TTTCGTCATG  798
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Query_44  799   TTCTATAACGCGGCAGGACGGCATCCGGAAACGGA-TTTGAAAGCGGAACGGG-TGGGTA  856
89        751   ...................................-.................-......  808
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84        748   ...................................T.................N......  807

Query_44  857   TCGCCTTGTCCAAAGATATGAAGAAA-TGG-AAACGATATCCGGGCAAT-CCGGTC-TTT  912
89        809   ..........................-...A..................-......-...  865
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84        808   .........N.C..............T...-..................C......T...  866

Query_44  913   GCACACGAAGCGGACGGAACCATTACGGGGGATGCGCATA-T-CCAGAAAA-TGGGCGAT  969
89        866   ..........................N.............T.-........-........  923
82        862   ..........................-.............-.-........-........  917
86        865   ...................................N....-.C........T.......N  923
84        867   ..N.......................-.....N.......-.-T.......-........  922

Query_44  970   GTGTATGTCATGTTC-TATTTC-TCGGCTTTTGAACCGAGCCGCAAA-TACAAGGCATTT  1026
89        924   ...............-....N.-.....-........N.........N............  980
82        918   ...............-......-....................-N..-............  973
86        924   ............-..-......N.....-...........T...T..-............  979
84        923   ...-N..........T......-..-.......-..........-..-..TN.-......  975

Query_44  1027  AATACA-TTTGC-TGCCAGTTATGACCTAGTACATTGGACGGATTGGAAAGGGGCGGATT  1084
89        981   ....N.T.....-......-..............................N.......-.  1037
82        974   ......-.....-......-..............-............-..N.......-.  1027
86        980   -.....-.....N....N............N............-..............-.  1035
84        976   .....N-.....-......-.........-.N.....NNN.......N..-..N..A...  1030

Query_44  1085  TGATTATCCCTTCTAAAGACTATGATGAATTGTTCGCTCATAAGAG-TTATGTGGTGAAA  1143
89        1038  .N.....-......-.................-..N...-N..N.N-.............  1092
82        1028  .......-......-............-.............-....-.........-NN.  1081
86        1036  .....-.T..............................NC...AN.T......CNNNN..  1094
84        1031  G...A...T..NTN..NA.AN......-.N.....                           1064

Query_44  1144  TACAATGGGGTGGTGTATC-ATT-TCTATT--GTGCCGTGAATGACGCGGAACAACGTGG  1199
89        1093  N......N..-.NNN....N...-......TN.G......N....NC..C.........N  1150
82        1082  ...........-.N..NN.-...-..-...--.N.NNNNA........N.T.AC....NN  1135
86        1095  .NN.T...N....NNG...-...C..AT.G--............NN..-N.......N..  1150

Query_44  1200  TATAG-CCATTGCTACCAGCAAACCGA-TGGGA-CGTTCACAAGTGCATTTCCCGGAACG  1256
89        1151  NNANN-N......N.....GC......T...N.-N....N..........            1198
82        1136  N.-..-..............-....N.-...A.-...                         1167
86        1151  NN...C........-N...GC......-..T..N....                        1186

Query_44  1257  GGAGGTGAAGAATCGCCGGATGGTGATGGAATTGGATAAAGGATGGAAAACATGGCTGAC  1316

Query_44  1317  GGAAGCAACTCATCTGAAAGGGTTGTTTGCTCAAAAGGCAATAGAAGTAAATATTCCTCA  1376

Query_44  1377  TAACTGGGATGATTATTATGGCTACCGCCAACTGACACATGGTAATTTGCACGGTACTGC  1436

Query_44  1437  CATATACGAAAAGACCTTCACATTGGATGATTCTCAGTTTCTAATTTCCAACTCTTCATT  1496

Query_44  1497  CGGAAAACGTTATTTTCTTCGTTTTGAGGGAGTGGGGACGTATGCCACTATAACGTTGAA  1556
96        379                  ............T.......                           398
95        380                  ............T.......                           399
94        382                  ............T.......                           401
97        381                  ............T.......                           400

Query_44  1557  TGGAAAGGATTTCGGCCGTCATCCCGTAGGGCGTACTACGCTGACATTGGATGTGACGGA  1616

Query_44  1617  TGCGTTGAAGCTGGGAGAGAATAAGCTGGTAGTGAAAGCGGAACATCCTGAAATGATAGC  1676

Query_44  1677  CGACATGCCTTGGGTGTGCGGTGGCTGTTCCTCGGAATGGGGATTCAGCGAAGGTTCCCA  1736

Query_44  1737  GCCTTTGGGAATTTTCCGTCCCGTGGTGCTGGAGGCTACGGATGAGATCCGCATTGAGCC  1796

Query_44  1797  TTTCGGAGTGCATATCTGGAATGATGATAAGGCGGGAACTGTCTTTGTGGAAACGGAGGT  1856

Query_44  1857  GAAAAATTACGGAAAGACTGCTGAGACGGTGGAAGTGGTTAATAAATTCAGTAATGCGGA  1916

Query_44  1917  TGGCAAGCAGGTGTTCCGCCTGACGGAGAAGGTGACTTTGCAGCCGGGTGAAAAGAAGGT  1976
45        875                                            ...........NT...A..  893

Query_44  1977  GGTGAAGCAACAATCGCCAGTGCAGAATCCTGTTTTATGGAGTACGGAGAATCCTTATTT  2036
45        894   ....                                                          897

Query_44  2037  GTATAAACTGGCCAGTATGATAAAGCGTGGTAAGAGTACTACGGATGAGATTAGTACACC  2096

Query_44  2097  CTTTGGTATCCGTACCATCAGTTGGCCGGTGAAACGGGAGGATGGTGACGGACGGTTCTA  2156

Query_44  2157  TCTGAACGGACAGCCTGTCTTTATCAATGGAGTGTGTGAATATGAACATCAGTTCGGACA  2216

Query_44  2217  AAGCCATGCTTTCAGCCGTGAGCAGGTGGCAGCCCGTGTGAAACAGATCCGTGCGGCGGG  2276

Query_44  2277  CTTCAACGCTTTCCGTGACGCTCACCAGCCCCATCACCTGGATTATCAGAAATATTGGGA  2336

Query_44  2337  CAAGGAAGGAGTCTTGTGGTGGACTCAGTTTTCGGCCCACGTGTGGTATGATACTCCGGA  2396

Query_44  2397  GTTTCGTGAGAATTTCAAGAAACTGCTCCGCCAGTGGGTGAAAGAGCGTCGTAACTCGCC  2456

Query_44  2457  CAGTGTGGTGATGTGGGGATTGCAGAACGAAAGCACGCTGCCTAAGGAGTTTGCCGAAGA  2516
33        589                                                    ...T.......  599

Query_44  2517  GTGTAGTGAGATTATCCGGGAAATGGATCCTACGGCCCGTACCATGCGTGTGATTACTAC  2576
33        600   ......                                                        605

Query_44  2577  GTGTAACGGTGGTGATGGGACAGATTGGAATGTTATTCAGAACTGGAGTGGAACCTATGG  2636

Query_44  2637  TGGTGATGTGAATAAGTATGGCCGTGAATTGTCACAGAAGAATCAGTTGTTGAACGGTCA  2696

Query_44  2697  GTATGGGGCATGGCGCAGCATCGGATTGCATACGGAACCGGCAGCTTTTGATGTGAATGG  2756

Query_44  2757  TGTATGGAGCGAGGAGCGTATGTGCCAGCTGATGGAAACCAAGATACGACTGGCGGAACA  2816

Query_44  2817  GGCAAAGGACAGTGTGTGCGGACAATTCCAATGGATATTCAGCAGTCATGATAATCCGGG  2876

Query_44  2877  ACGCCGCCAGCCGGATGAAGCGTATCGCCGGATAGATAAGGTGGGACCATTTAATTATAA  2936

Query_44  2937  AGGATTGGTGACTCCGTGGGAGGAGCCGCTGGATGTATATTATATGTATCGCGCGAACTA  2996

Query_44  2997  TGTGCCGGCTTCCGAAGATCCGATGGTTTATCTGGCATCTCATACATGGGAGGACCGTTT  3056

Query_44  3057  TGCGACAGGCCGCAGACGGGCTACCATTGAGGCGTACAGCAATTGTGACAGTGTGTTGCT  3116

Query_44  3117  GTACAATGATGCGGTGGATGCTGAATACTTGGGACGGAAATTGAATCATGGGGTGGGGAC  3176

Query_44  3177  TCATTTCATGTGGGAAAACCGCGATATCCGTTACAATGTGCTTCGTGCTGTGGGGTACTT  3236

Query_44  3237  TAAAGGAAAACCGGCAGCGGAAGATGTGCTGGTGCTGAACGGTCTGGAAAAAGCTCCTCA  3296

Query_44  3297  TTTTGAAGCTCTTTACCGTGGTTCTGCTATAGTGCCTGTTGCTGCCGACCGGTTGAACGG  3356

Query_44  3357  AACTGATTTGTTGAAAGGAGCTGA-GGGATATA-CGTAT-CTTTATCGTTTGAA-TTGCG  3412
38        1155                                                ......NN-N..N.  1143
42        1180         ........-.N......A..NNN...-.....T.N....TCG...N--.....  1132
35        1170                       ...-........A...N.-...-..NN..-..N-N....  1137
40        1169                                          ...AN...N.....A.....  1150

Query_44  3413  G-AGGAG-A---C-GCTT-AT-ACGGA-TA-C-GTA-TGGTC-AGGT-CTGG-GCGCAGG  3457
38        1142  .N.....-N---NN....N..-N....-..A.-...-.....-....-....-.......  1094
42        1131  .-N.-..-.---N-NGN.-..-NN.-.-..-.-...N....T-CA..-TNN.-......A  1088
35        1136  .-N....G.---.-NGC.-..N.....N..-.-..T-AT...-.A..T....-NN.....  1088
40        1149  .-...G.-.GGA.-...A-.N-.....-NN-NN.N.-N....C....-....AN....NN  1099

Query_44  3458  A-TAA--CAGCCGTTATTCTCATTCGTGGG-CGG--AATCG-TTTGTTCATCCGTCGGAT  3510
38        1093  .A...--..........NT..N.-......G...--.....-.....-............  1041
42        1087  .-...--................CG.....-...--.....-..-...............  1036
35        1087  .-...--..................NNN..N...--.....-..-.......-.......  1036
40        1098  .A...AC.......-...N...NNN-...N-N..GA.....G....N.............  1042

Query_44  3511  AGT-GTACAGTTGTTGA-GCCCTTATCAGGC-GAG-CCA-GCGTACCACGAATGATCCCA  3565
38        1040  ...N..........G.N-............N-...-...-....................  985
42        1035  ...-..N..........-N.NT.AT......-...-...-....N...............  981
35        1035  ...-.....NN......-AG..C........-...G...-....................  980
40        1041  ...-NNNA.....G...A.....AN......N...-..NN....................  984

Query_44  3566  TTCATGGCACTAGGGACTGGG-AACTGTTCCAGACTTTCCGCTTCGGACGCCATAAGCTG  3624
38        984   .....................-......................................  926
42        980   ....................--......................................  923
35        979   N....................-...........GAC........................  921
40        983   .....................G...........N..........................  924

Query_44  3625  AACTT-CCGCTTTCCCGTTCCGG-ATGGCGA-GTATCGTGTGGAACTTTATTTTACAGAA  3681
38        925   .....-.................G.......-............................  868
42        922   .....-.................-.......-............-...............  867
35        920   .....-.................-.......-............................  864
40        923   .....Y................--.......A............................  866

Query_44  3682  CCCTGGCATGGTACAGGAGGCGGCGTACAGACGGATTGTGAAGG-CTTGCGTATTTTTGA  3740
38        867   ........................................G...G...............  808
42        866   ............................................-...............  808
35        863   ............................................-...............  805
40        865   ............................................-...............  807

Query_44  3741  TGTAGCGGTAAATGATAAAGTACTTCTGGACGACTTGGATGTATGGGCTGAAGCGGGTCA  3800
38        807   ............................................................  748
42        807   ............................................................  748
35        804   ............................................................  745
40        806   ............................-...............................  748

Query_44  3801  TGACGGCGCTTGCAAAAAGGTGGTGAATGCTATCGTGAAAGGGGGAGTCTTGAAGATTAA  3860
38        747   ............................................................  688
42        747   ............................................................  688
35        744   ............................................................  685
40        747   ............................................................  688

Query_44  3861  TTTTCCGGAGGTGAAAGCGGGGCAAGCTTTGATTTGTGGCATTGCGATAGCTTGTAAAGG  3920
38        687   ............................................................  628
42        687   ............................................................  628
35        684   ............................................................  625
40        687   ............................................................  628

Query_44  3921  CGACTTGGATTCCGTTCGCTCTTTTTCTGCCCATAGCTTCAGCTGGGCTGCACAAGACAA  3980
38        627   ............................................................  568
42        627   ............................................................  568
35        624   ............................................................  565
40        627   ............................................................  568

Query_44  3981  GGAGGTGATGGAAAAGACTCCCAAAGAATTATTGCCTGAAGATAAAAACGCACGTGCCAA  4040
38        567   ............................................................  508
42        567   ............................................................  508
35        564   ............................................................  505
40        567   ............................................................  508

Query_44  4041  TGTGACTTATCAAGCGGAGGATGCTGTGCTGAAAGGTAAGTTCATAAAGAAAGAGGTTAA  4100
38        507   ............................................................  448
42        507   ............................................................  448
35        504   ............................................................  445
40        507   ............................................................  448

Query_44  4101  GAAACAAACCGGGGTTTTCTTTGGTAAAGGTACACAAAGCAGTATTACTTGGAACATTTC  4160
38        447   ............................................................  388
42        447   ............................................................  388
35        444   ............................................................  385
40        447   ............................................................  388

Query_44  4161  TACCGGTCTGGCACAAGTCTATGCTCTTCGTTTTAAATACATGAATGTTACAGGGAAGCC  4220
38        387   ............................................................  328
42        387   ............................................................  328
35        384   ............................................................  325
40        387   ............................................................  328

Query_44  4221  TATGAAGGTGCGTATGCAGTTCATTGATTCCAAAGGGGTGGTACTGAAGGAAGATAATCT  4280
38        327   ............................................................  268
42        327   ............................................................  268
35        324   ............................................................  265
40        327   ............................................................  268

Query_44  4281  GACTTTTGCCGAAACTCCCGGAAAGTGGCGTATGCTGAGTACAACGACGGGTACGTATAT  4340
38        267   ............................................................  208
42        267   ............................................................  208
35        264   ............................................................  205
40        267   ............................................................  208

Query_44  4341  CAATGCAGGCTATTATAAGGTGGTGCTTTCCGCACCGGATATGGAGGGACTGGCATTGGA  4400
38        207   ............................................................  148
42        207   ............................................................  148
35        204   ............................................................  145
40        207   ............................................................  148

Query_44  4401  TGCGCTGGATGTGCAATAACATTGGAAGTGGATAACGGATCCGAATTCGAGCTCCGTCGA  4460
38        147   ............................................................  88
42        147   ............................................................  88
35        144   ............................................................  85
40        147   ............................................................  88
85        132                 ..............................................  87
83        129                 ..............................................  84
110       838                 ..............................................  883
39        814                 ..............................................  859
27        841                   ............................................  884
23        842                   ..........................N.....C...........  885
111       839                 ..................................N...........  884
112       835                 ..............................N.-.............  879
26        138              ..A..............................................  90
49        134                 ..............................................  89
115       135                   ............................................  92
44        134                 ..............................................  89
60        134                   ............................................  91
56        134                  .............................................  90
14        135                 ..............................................  90
116       128                   ............................................  85
64        132                   ............................................  89
28        138              ..A..............................................  90
0         134                 ..............................................  89
46        136                 ..............................................  91
30        131                   ............................................  88
12        138                 ..............................................  93
3         135                 ..............................................  90
88        120                 ..............................................  75
31        134                   ............................................  91
24        138              ..A..............................................  90
5         135                 ..............................................  90
34        135                   ............................................  92
62        136                   ............................................  93
22        137              ..A..............................................  89
8         136                 ..............................................  91
73        130                   ............................................  87
47        139                 ..............................................  94
87        120                 ..............................................  75
68        129                   ............................................  86
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Query_44  4461  -CAAGCTT-GCGGCCG-CACT-CGAGcaccaccaccaccacca-cT-G-AGA-T-CCGGC  4511
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Query_44  4512  TGCTAACAAAG-CCC--G--AAAGGAAGC-TGAGTTGGC-TG-CTGCCACCGCTGAGCAA  4563
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Query_44  4564  TAAC-TAG-CA-TAAC-C-CCTT-GGGGCCTCTAAACGGGTCTT--GAGG-GG--TTTTT  4612
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Query_44  4613  TGCTGAAA  4620
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Lambda      K        H
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Gapped
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Effective search space used: 704675686


Query= CMR200065.109

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Query_45  150   TCAT-CC--G-CAGTTCG-AAAAGGGTA-CCGAGAA-CCTGTACTT-CCAAT-CCAATGC  200
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Query_45  201   CGAAGATAAGCTTATCAATCAGGATTGGAGTTTCCGTTTTTCCCATCAAGTAAATGCTAA  260
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103       162   .                                                             162
86        152   .C..                                                          155
89        153   .C..                                                          156
17        149   .                                                             149
84        149   .C..                                                          152
90        149   .C..                                                          152
111       152   .A..                                                          155
70        152   .                                                             152
112       156   .                                                             156
100       151   .C...                                                         155
95        161   .                                                             161
94        163   .                                                             163
82        150   .C..                                                          153
102       160   .                                                             160
59        144   .                                                             144
80        152   .                                                             152
29        148   .                                                             148
97        162   .                                                             162
104       163   .                                                             163
72        151   .                                                             151
74        146   .                                                             146
76        150   .                                                             150
61        138   .                                                             138
78        148   .                                                             148
99        144   .C...                                                         148
91        145   .C..                                                          148
114       168   .                                                             168
87        799   .                                                             799
122       905   .-....                                                        901
101       157   .                                                             157
137       915   .C...                                                         911

Query_45  261   TGCTGCACGTAGGGTAGACTTGCCTCATACTTGGAATGCACAGGACGCTTTGGGTGGTAA  320
96        254                .....T.....C..............                       279
95        255                .....T.....C..............                       280
94        257                .....T.....C..............                       282
97        256                .....T.....C..............                       281

Query_45  321   GCACGATTACAAGAGGGGAATAGGTAATTATACTaaaaaaaTATTCATCCGTCCCGAGTG  380

Query_45  381   GCAAAGTAAGCGGCtttttttACGTTTTGAGGGAGCGAATTGCGTGAGCAATGTCTTTGT  440

Query_45  441   AAATGGTAAACATATAGGTGAGCATCGGGGCGGTTATGGAGCTTTTGTCTTCGAGATAAC  500

Query_45  501   CGATAAAGTGGAATATGGAAAAGAGAATACATTGCTGGTACGTGTCAATAATGGCGAGCA  560

Query_45  561   GTTGGATGTAATGCCATTGGTCGGTGATTTTAATTTTTATGGTGGCATTTATCGGGATGT  620

Query_45  621   ACATCTGTTGCTGACTGATAACCTGTGTATCTCTCCGTTAGATTATGCATCGTCTGGGTT  680

Query_45  681   TTATCTCATACAGCAACAGATTACGGACAAACAGGCAGCTATTTGTGCACGCATCAATCT  740

Query_45  741   TTCTAATGGAACGGGAGAACTCCGAAAAGCAGTGCTCCGGTTGCAGGTTAATGATGGAAA  800

Query_45  801   AAAGACTGTGTATGAAACGGAGAAGGAAGTAAGTATGATTCCTCATACAGATGTACAGGT  860

Query_45  861   AGAGAATATAGAGTTCATACTGAAGAATCCGCGTCTTTGGAACGGGACGCAGGATCCATT  920

Query_45  921   CATGTATCAGACGGTGGTGACCTTGATTAAAGATGGAAAAGAGTTGGATAAAGTGGAACA  980

Query_45  981   GCCGTTAGGGGTACGTTATTACATCACGGATCCCGATAAAGGTTTTTTCTTGAATGGAAA  1040

Query_45  1041  ACATTTGCCGCTGCATGGTGTATGCCGTCATCAGGAGAGGGCGGAAGTGGGTAATGCTCT  1100

Query_45  1101  TTATCCGGTGCATCACGAGGAAGATACTCGTATCATGCTTGATATGGGGGTGAATGCCGT  1160

Query_45  1161  TCGTCTGGCACATTATCCACAAGCTACCTATATGTATGATTTAATGGATAAATATGGCAT  1220

Query_45  1221  TGTCACTTGGGCTGAGATTCCATTTGTGGGGCCGGGAGGATACGCTGATAAAGGTTTTGT  1280

Query_45  1281  TGATCAGCCTTCTTTCCGCGAAAATGGTAAGGAGCAGTTGAAAGAGATGATCCGCCAGCA  1340
134       325                                        ..............           312
126       321                                        ..............           308
123       323                                        ..............           310
120       323                                        ..............           310
25        182                                        ..............           195
21        831                                        ..............           844

Query_45  1341  TTACAATCATCCTAGTATCTGTTTTTGGGGATTGTTCAATGAATTGAAAGAGCAGGGAGA  1400

Query_45  1401  CAATCCTGTAGAGTATATAAAGGAGTTGAATGCTATGGCACATCGGGAGGATCCTACTCG  1460

Query_45  1461  TCCTACTACTTCTGCAAGTAATCAGGATGGCGCGTTGAATTTCATTACTGATCATATAGC  1520

Query_45  1521  TTGGAATCGCTATGATGGATGGTATGGGGCCACACCGGCTACGCTTGCTACATGGTTGGA  1580

Query_45  1581  TGCTACTCATAAGAACCATCCCGAAATAAAAATTGCCATCAGCCAGTATGGTGCTGGTGC  1640

Query_45  1641  TAGTATCTATCATCAGCAGGACTCATTGGTACAAACTGTTCCCGGAAGTTGGTGGCATCC  1700

Query_45  1701  AGAGAATTGGCAAACAGAATATCATATTCAGAATTGGAAAATAATAAATGAACGTCCGTA  1760

Query_45  1761  TGTGTGGGCTAGTTTTGTGTGGAATATGTTTGATTTCGGTGCAGCTCATC-------GTA  1813
30        578                      ..............C..---.....T..C..AATGGAA.CG  541
31        581                      ..............C..---.....T..C..AATGGAA.CG  544
34        582                      ..............C..---.....T..C..AATGGAA.CG  545
73        579                    ...................T.C..                     556
68        578                    ...................T.C..                     555
71        576                    ...................T.C..                     553
69        577                    ...................T.C..                     554
15        510                    .............C..C..                          492
20        514                    .............C..C..                          496
18        514                    .............C..C..                          496

Query_45  1814  TGGAGGGGGATCGTTCGGGCATCAATGACAAAGGACTGGTAACTCATGATCGTAAGATTA  1873
30        540   ......T.T.-GA.G..C.G.A.-...--.....GT..A.....TT.........A..AC  485
31        543   ......T.T.-GA.G..C.G.A.-...--.....GT..A.....TT.........A..AC  488
34        544   ......T.T.-GA.G..C.G.A.-...--.....GT..A.....TT.........A..AC  489
73        514                                ..G...A........TTC..C..........  484
68        513                                ..G...A........TTC..C..........  483
71        511                                ..G...A........TTC..C..........  481
69        512                                ..G...A........TTC..C..........  482

Query_45  1874  AAAAGGATGCTTATTATTTTTACCGGGCCAATTGGAATCCAGAACCTATGATTTATATCG  1933
30        484   GC..........TC....GG..TAA...A..C....                          449
31        487   GC..........TC....GG..TAA...A..C....                          452
34        488   GC..........TC....GG..TAA...A..C....                          453
73        483   .G......T.C.......GG..TAAA..T..C....G.AAG......G.AC.....C.GA  424
68        482   .G......T.C.......GG..TAAA..T..C....G.AAG......G.AC.....C.GA  423
71        480   .G......T.C.......GG..TAAA..T..C....G.AAG......G.AC.....C.GA  421
69        481   .G......T.C.......GG..TAAA..T..C....G.AAG......G.AC.....C.GA  422

Query_45  1934  CAGGGCGTCGTAATGTGAATCGGGTGAAGCCGCTCGTTGATGTACAGGTCTTTTCGAATG  1993
73        423   ..CA.............                                             407
68        422   ..CA.............                                             406
71        420   ..CA.............                                             404
69        421   ..CA.............                                             405

Query_45  1994  TAGAAGAAGTGATATTGATAGTGAATGACTGTCAGTGTAGAAGGATGAAGCCGGACAGTT  2053
80        631              ......-..............                              650
76        629              ......-..............                              648
78        627              ......-..............                              646

Query_45  2054  TGAAAGTTTGTTTGTTCAAGGAGGTCCCTCTCAGAAAAGGAAGGAATGAAATAGAAGTAC  2113

Query_45  2114  GTGCCAGTGATAGTAAAAAACAATTGATAGATCGATGCACTTGGATATTACAATAACATT  2173
83        129                                                      .........  121
85        132                                                      .........  124
110       838                                                      .........  846
39        814                                                      .........  822
27        841                                                        .......  847
23        842                                                        .......  848
111       839                                                      .........  847
112       835                                                      .........  843
49        139                                                 ....A.........  126
40        149                                    .....G..-....G.G-..........  125
26        135                                                      .........  127
44        139                                                 ....A.........  126
42        149                                    .....G..-....G.G-..........  125
38        149                                    .....G..-....G.G-..........  125
35        146                                    .....G..-....G.G-..........  122
115       135                                                        .......  129
56        138                                                   ...G........  127
60        134                                                        .......  128
46        141                                                 ....A.........  128
14        135                                                      .........  127
116       128                                                        .......  122
64        132                                                        .......  126
0         134                                                      .........  126
30        131                                                        .......  125
28        135                                                      .........  127
12        138                                                      .........  130
3         135                                                      .........  127
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24        135                                                      .........  127
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Query_45  2174  GGAAGTGGATAACGGATCCGAATTCGAGCTCCGTCGA-CAAGCTT-GCGGCCG-CACT-C  2229
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Query_45  2230  GAGcaccaccaccaccacca-cT-G-AGA-T-CCGGCTGCTAACAAAG-CCC--G--AAA  2279
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Query_45  2280  GGAAGC-TGAGTTGGC-TG-CTGCCACCGCTGAGCAATAAC-TAG-CA-TAAC-C-CCTT  2331
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115       22    ....                                                          19
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Effective search space used: 359847436


Query= CMR200069.106

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Query_46  1     TCTCG-ATCCCGCGAAATTAATAC-GACTC-ACTATAGGGG--AATT-GTGAG-CGGA-T  52
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Query_46  150   TCAT-CC--G-CAGTTCG-AAAAGGGTA-CCGAGAA-CCTGTACTT-CCAAT-CCAATGC  200
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Query_46  201   CCA-ACA--ACAACCCGAATGGCAGAGCCAATATGCTGTCGGACTGAACAAACTGGCCCC  257
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85        812   .A.-.                                                         809
110       154   .G.-.A.--.                                                    160
86        152   ...-..                                                        156
105       160   .                                                             160
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9         155   .                                                             155
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59        144   ...                                                           146
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137       915   ...-.                                                         912

Query_46  258   TCATACTTATGTGTGGCCTTATCAAACCATATCTGATA-TCCG--TAACGGAGATTATGA  314
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Query_46  315   ATCTTCTCCTTATTATATGAGTCTGAACGGTAGTTGGAAATTCCATTGGGTAAAGAATCC  374
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Query_46  375   CGATAACCGTCCGAAGGATTTTTATAAACCGGAGTTTTATACAGGAGGATGGGCGGATAT  434
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Query_46  435   TCAGGTTCCCGGCAATTGGGAACGCCAAGGATATGGAACAGCTATTTATGTAAACGAAAC  494
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Query_46  495   CTATGAGTTCGATGACAAACTGTTCCATTTTAAAAAGAATCCGCCTTTAGTTCCATATAA  554
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Query_46  555   AGAGAATGAAGTCGGTTCCTACAGACGTACCTTTACAATTCCTGCCGATTGGGAAGACCG  614
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74        503   N.....C...N.A.....T..TC.C.....G..C..GG.......T..C...A.......  562
114       525   .N....C.....A.....T..TC.C.....G..C..GG.......T..C...A.......  584
72        508   ......C.....A.....T..TC.C.....G..C..GG.......T..C...A.......  567

Query_46  615   CCGTGTGGTTATCTGTTGTGAAGGAGTGATTTCTTTTTACTATATTTGGGTGAACGGACA  674
93        576   ............................................................  635
90        563   ............................................................  622
70        569   T..CA.C..G..T..C........T.....C.....C..T.....C..............  628
74        563   T..CA.C..G..T..C........T.....C.....C..T.....C..............  622
114       585   N.NCA.CNNG..T..C........T.....C.....C..T.....C.............N  644
72        568   T..CA.C..G..T..C........T.....C.....C..T.....C..............  627

Query_46  675   TCTGTTGGGCTATAATCAAGGTTCAAAGAC-ACCGGCCGAATGGGATATCACTGATAAAT  733
93        636   ..............................-.............................  694
90        623   ..............................-.............................  681
70        629   .A..C....T.....C..G...........-T..T.................G..CT.TG  687
74        623   .A..C....T.....C..G...........TN..T.................G..CT.TG  682
114       645   .A..C....T.....C..G...........-T..T.................G..CT.TG  703
72        628   .A..C....N.....C..G...........-T..T...............N.G..       681

Query_46  734   TGAAGAAAGGTGAGAATACGGTGGCATTGGAGG-TTTACCGTTGGAGCGCCGGATCGTAT  792
93        695   .................................-..........................  753
90        682   .................................T..........................  741
70        688   .AC..GC...A..A....TC......C.T..A.-.A..T..C.....T..A..T..C...  746
74        683   .AC..GC...A..A....TC......C.T..A.-.A..T..C.....T..A..T..C...  741
114       704   .AC..GC...AN.A....TC......C.T..A.-.A..T..C.....T..AT.T..C...  762

Query_46  793   TTGGAGTGCCAGGATATGTGGCGGTTGAGTGGTATTGAACGTGATGTGTATC-TTTACAG  851
93        754   ....................................................T.......  813
90        742   ....................................................-.......  800
70        747   C.......T.......................C........G.....C....-.......  805
74        742   C.......-NN.....................C........G.....C....-..NN...  799
114       763   C.......T............N..........C........G....CNN...-.....N.  821

Query_46  852   CACTCCTAAACAGTATATAGCCGATTATAAAGT-AACCT-CTTCTTTAGA-CAAACAACA  908
93        814   .................................-.....-..........-.........  870
90        801   .................................A.....-..........-.........  858
70        806   T.....ACGC....T......T...........-G..T.-.......N..TT..GA..G.  863
74        800   N...                                                          803
114       822   -.....ACGC....-......T...........-G..T.N......NN..-T..        871

Query_46  909   ATATAAAG-AAGGTATTTTCGGTTTGGAAG-CTACCATTGAAGGGCCTT-CTACTTCCAT  965
93        871   ........A.....................C..............T...N..........  930
90        859   ......GA-.N...................-.....N............-..........  915
70        864   G.....G.-....-........CC.T..T.--...AG.......AAG.G-.G..C.GTG.  918

Query_46  966   GACTACC-TTTGC-TTACCGACTGGAAGATAAAACCGGTAAGGCGGTTCTGCAAGGTGAA  1023
93        931   ..N....T.....-..............................T........N......  989
90        916   .......-.....T........................-N.............N......  973
70        919   .T....T-..GA.-N..TA.T..........CTG....A...                    958

Query_46  1024  TAT-CCTATCAAATCGAAGGGATTG-AGCCATTTCTTGAAGTTGGA-TGAACAAAGTTTG  1080
93        990   ...-.....................A.....-.........-....-.....-.......  1044
90        974   ...N..................A..-....N...............N.......N.....  1032

Query_46  1081  CCGGATGTGGAAGT-CTGG-AGTG-CTGAG-CATCCGAA--TCTTTATACAC--T-GAT-  1130
93        1045  .......GT.....C...N-....-....N-........--...........CTG-...-  1097
90        1033  ..............-....N....C.....C.N...N..ATC......N.N.--.N...N  1089
127       694                                    ......--........             681
124       694                                    ......--........             681

Query_46  1131  CTT-GGAATT-GAAAGAT-GTAACA-GGTAAAGT-AACGG-AACTTA--CC-GGAT-GTG  1180
93        1098  ...-.....N-...GN.N-TAT...-...-...N-.....A......CT.G-....-.NN  1149
90        1090  ...G......N..N....N......C...N....A.....A......--..G....G...  1147

Query_46  1181  AAGTA-GGTTTCCGCACTTCGGAAA-TTAAGGAC--GGA-CGTTTTTGCATCAAT-GGTG  1234
93        1150  .....N........N....TC.G..-...N.N..--...N.......TGCN.N.N-...N  1205
90        1148  ...NN-..N...G............T...NN...CG.A.-.N...NNC....T..G....  1205

Query_46  1235  TG-CCGGTTTTGGTAAAGGGAACGAACCGTCATGAACATTCCCAATTAGGACGGACTGTA  1293
93        1206  ..T....A..N...-.N..NNCNN..N.....N....                         1241
90        1206  GN-G.N.N....T....                                             1221

Query_46  1294  AGCAAGGAACTGATGGAAAAAGATATCAAATTGATGAAACAGCATAATATCAATACGGTC  1353

Query_46  1354  CGCAATTCGCACTACCCTACCCATCCTTATTGGTATCAGCTTTGTGATCGTTATGGACTT  1413

Query_46  1414  TATATGATAGATGAAGCTAATATTGAATCGCATGGCATGGGGTATGGACCTGCTTCATTG  1473

Query_46  1474  GCCAAAGATTCCACTTGGTTGCCTGCCCACATGGATCGTACCCAACGTATGTATGAGCGT  1533

Query_46  1534  TCCAAGAATCATCCGGCTATCGTTATCTGGTCATTGGGGAATGCTGCCGGAAACGGTATT  1593

Query_46  1594  AACTTCGAACGTACATATGACTGGATGAAGTCAGTGGAGAAAAGTCGTCCTGTACAATAT  1653

Query_46  1654  GAACGGGCCGAACAGAATTATAATACCGATATCTATTGCCGTATGTATCGCAGCGTGGAA  1713

Query_46  1714  GAACTCATGGCCTATGCCCGCCAGACAGAACCTAAAGTTTATCGTCCTTTCATCATGACA  1773

Query_46  1774  GAGTATCTGCATACTATGGGTAATAGTGGCGGAGGATTAAAGGAATATATGCATGTATTC  1833

Query_46  1834  GAAACCGAACCGATTGTTCAGGGAGGTTGTATCTGGGATTGGGTGGATCAATCTTTCCGC  1893

Query_46  1894  GAGATAGATAAGGATGGTAAAT---GGTATTGGAGTTATGGTGGGGATTATGGTCCGAAG  1950
122       84                 .........CAT..........A....                      58
4         135                .........CAT..........A....                      161

Query_46  1951  GATGTGCCCAGTTTTGGCAATTTCTGTTGTAACGGGTTGGTCAATGCAGTCCGCGAACCG  2010

Query_46  2011  CATCCGCACCTCATTGAAGTGAAGAAGGAGTATCAATATATCAAATCGGTACTGACCGAT  2070

Query_46  2071  CCTAAGAAGCTGACAGTGGAAGTCAAGAACTGGTATGACTTTACCAATTTGAATGCCTAT  2130
49        1217                                             ....A.......A.NNN  1201

Query_46  2131  ACGTTGCACTGGCAGGTCATGGGGGATGATGGGAAA-GTGATAG-CAGAAGGAACTCGAA  2188
49        1200  NNNG...T...N.........NC--.....N.--..-NNN....-....NNN.NNNN...  1147
44        1184                        ........T.....C..N...NN.......NN....G.  1147
46        1189                     ......GA..NT.....-.NNN-.N-.GN.....C.NGA..  1152

Query_46  2189  AAGC-AGA-CTGTGCCCCTCAT-GAGGC--TGT-AACATTCTCTTTGGGTGCTGTAAAGT  2242
49        1146  ....-..NN...NN...T....-..NNT--GT.-..............N...........  1092
44        1146  ....C...-..NN--.......-.....--...T........NC..T.....NN....NG  1093
46        1151  .G..-.N.-..NN-........-.GAN.NG...-..........CN..N...N.......  1097
47        1159                ...T....A.....C-..A-..NN.CT....A...N........AG  1116

Query_46  2243  TG--CCTT-CTACGATTC--GTGAGGC-TTA-TTTG-AA-TCTGT-CTTGGACGCCTGAT  2292
49        1091  ..--....-........TCG.......-...-..-.-..-...N.-..............  1041
44        1092  ..--....T.......CN--.......-...-....-..-.TNN.-TC............  1042
46        1096  .TGC....-NN...NNNN--NN-.N..-.A.-....G..-..NN.-..-...........  1046
47        1115  .T--N...-TNNGN...N--.N...NNN...N....-..AN.N..A.......N.NN...  1062

Query_46  2293  --AAGGCAACTCCCTTTATTGG-AACT-C-ATGACG-AAG-TG-GCC-T-ATGACCAGTT  2342
49        1040  --.......NN........-.N-....-.-......-...-..-...N.-...N......  991
44        1041  --....................-....N.-.....N-.-.-..-N..-.T...N......  991
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47        1061  TA...........NN..N....G..N.-.N....A.N...N..-...C.-..........  1005
26        1009                                                  .-.......A..  999
24        1040           ....G......AA-T..G-G-..T...-.G.-.AA...-.T.......A..  996
22        1019                                ..T...-...G.A-...-.-.......A..  994

Query_46  2343  TGTACTGT-CTGCC--AAT--AAAG--G--GTATC-GTGCG-CCGGAAATCAAATTGGCT  2391
49        990   ........-..N..--...--....--.N-.....-.....-..................  941
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22        993   -..T..T.-.G.GT--..A--T...--AACN..C.-.G..T-......C.A..C..C.GG  944

Query_46  2392  GATAA-GGTGAAG-ATAGATATTGA-TCCTGCAACC-GG-CGCTTT-ACGCTCTTATA-T  2444
49        940   .....-.......-...........-..........-..-......-...........-.  888
44        942   .....-.......-...........-..........-..-......-...........-.  890
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24        944   .G...-....G.A-..GA....A..-...G.....A-..-G..GC.-T.A........-.  892
22        943   T.-..-....G.A-..GA....A..-...G.....A-..-G..GC.-T.A........-.  892
28        936       .-......A-..GA....A..-...-.....A-..G.....C-..--.......-.  890

Query_46  2445  -ATATAAAG-G-TAAAGAGA------TGCT---TTCATCTCCTGTAGTTCTCAGCCTTTA  2492
49        887   -........-.-........------....---.-.........................  841
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28        889   -T.....T.-.-G..GN.-.------.A..GGG..--..C..C...CA.G--.....C..  844

Query_46  2493  TCGTCCTGTTACGGACAA-TGACAGCAGGGAAAAAACAGGAGGAGCCAAAGTTTGGAGGA  2551
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28        843   ......G..G.....T..-...T.A.C.T......GT..............C.....A..  785

Query_46  2552  AA-GAAGGTTTGGATAATATGATTCAAAAAGC-TA-CTTTT---GTCAAAGCATCTGAAA  2605
49        782   ..-.............................-..-.....---................  729
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24        783   ..-.CT..G......C.G----..A.C.C...G.G-.CC..ACC..G..GA.T...--.C  732
22        782   ..-.CT..G......C.GT.A.CA..GCGT..-CC-T.NCC---..G..GA.T...--.C  731
28        784   ..-.CT..G......C.G----..A.C.C...G.G-.CC..ACC..G..GA.T...--.C  733

Query_46  2606  CAG--GTGGTAAAGCGGAAGTAGAGTTATGGAATGCTAAA-GGCGTAAAGTT-GGGAATG  2661
49        728   ...--...................................-...........-.......  673
44        728   ...--...................................-...........-.......  673
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47        735   ...--...................................A...........T.......  678
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24        731   .C.CA....ACGT..C.....G..A....TA....TCCGT-..T.A...AG.-.....CC  674
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28        732   .C.CA....ACGT..C.....G..A....TA....TCCGT-..T.A...AG.-.....AC  675

Query_46  2662  -GCTACCTTTGTATATACCTTGCAGAGCAATGGTGCATTAAAAGTAAAGACA-ACTTTCT  2719
49        672   -...................................................-.......  615
44        672   -...................................................-.......  615
46        674   -...................................................-.......  617
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56        155                                       ..............A.-.        139
51        140                                       ..............A.-.        124
58        137                                       ..............A.-.        121
54        142                                       ..............A.-.        126

Query_46  2720  TGCCGGATACTTCTGCTGTTACTTCATTGGCTAGAGTGGGCCTGGCATTTGAAATGCCGT  2779
49        614   ............................................................  555
44        614   ............................................................  555
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24        614   -..........A.C.T.A.C......C....GC.T..A..G..TA.T...........CG  556
22        613   -..........A.C.T.A.C......C....GC.T..A..G..TA.T...........CG  555
28        614   -..........A.C.T.A.C......C....GC.T..A..G..TA.T...........CG  556

Query_46  2780  ATGCCTATAACAAGGTTTCTTATTTGGGACGTGGTGAACATGAAACTTATATAGACCGTA  2839
49        554   ............................................................  495
44        554   ............................................................  495
46        556   ............................................................  497
47        559   ............................................................  500
26        555   ....T..C..TC....G......C....G.....A..G..............G..T....  496
24        555   ....T..C..TC....G......C....G.....A..G..............G..T....  496
22        554   ....T..C..TC....G......C....G.....A..G..............G..T....  495
28        555   ....T..C..TC....G......N....G.....A..G..............G..T....  496

Query_46  2840  ATCAGTCTGGATGTATCGGAATTTACCATACAGATGCAGAACGTATGTTCCATTATTATG  2899
49        494   ............................................................  435
44        494   ............................................................  435
46        496   ............................................................  437
47        499   ............................................................  440
26        495   ....A..C..TAAA..A..T.....T..C..C....TG..GA..........C.......  436
24        495   ....A..C..TAAA..A..T.....T..C..C....TG..GA..........C.......  436
22        494   ....A..C..TAAA..A..T.....T..C..C....TG..GA..........C.......  435
28        495   ....A..C..TAAA..A..T.....T..C..C....TG..GA..........C.......  436

Query_46  2900  TGAAGCCCCAGGCTACAGGAAATCGTACGGATGTGCGTTGGATGGAATTGGCGGATGAGG  2959
49        434   ............................................................  375
44        434   ............................................................  375
46        436   ............................................................  377
47        439   ............................................................  380
26        435   .TCGT..G.....A..G..T..C...........C.........C..C.T..T.......  376
24        435   .TCGT..G.....A..G..T..C...........C.........C..C.T..T.......  376
22        434   .TCGT..G.....A..G..T..C...........C.........C..C.T..T.......  375
28        435   .TCGT..G.....A..G..T..C...........C.........C..C.T..T.......  376

Query_46  2960  CAGGAGAAGGTTTGTCTTTCCGTTCGGATAAAGTGTTTCAGTTCTGTGTTATTCCATTTA  3019
49        374   ............................................................  315
44        374   ............................................................  315
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26        375   ....T..G..GC..G.A........C...GCCTC.........TA....G.....T....  316
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22        374   ....T..G..GC..G.A........C...GCCTC.........TA....G.....T....  315
28        375   ....T..G..GC..G.A........C...GCCTC.........TA....G.....T....  316

Query_46  3020  CGGATTCTAATGTAGATAAAGCTACTCATATTAATAAACTTGAGAGAACAGGGATTATAA  3079
49        314   ............................................................  255
44        314   ............................................................  255
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26        315   .....GAG...C.G...GCG..A..G.....C...C..T.ACG.C.CGAT..AG.GG...  256
24        315   .....GAG...C.G...GCG..A..G.....C...C..T.ACG.C.CGAT..AG.GG...  256
22        314   .....GAG...C.G...GCG..A..G.....C...C..T.ACG.C.CGAT..AG.GG...  255
28        315   .....GAG...C.G...GCG..A..G.....C...C..T.ACG.C.CGAT..AG.GG...  256

Query_46  3080  ATGTTCACTTAGATGCGGAACAGTCGGGGGTAGGTACTGCGACTTGTGGTCCGGGGGTAT  3139
49        254   ............................................................  195
44        254   ............................................................  195
46        256   ............................................................  197
47        259   ............................................................  200
26        255   C......TC.G.....C.C....G.A..A..C.....G..T..C........T..A....  196
24        255   C......TC.G.....C.C....G.A..A..C.....G..T..C........T..A....  196
22        254   C......TC.G.....C.C....G.A..A..C.....G..T..C........T..A....  195
28        255   C......TC.G.....C.C....G.A..A..C.....G..T..C........T..A....  196

Query_46  3140  TGCCGCCATATCGTGTTCCGGTGGAGAAGCATACGTTTGAGTTTATGATTTGTCCATTAA  3199
49        194   ............................................................  135
44        194   ............................................................  135
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24        195   ......AG........A..T...C..G.TT.C.TA..CCG.....CA..CC....T..G.  136
22        194   ......AG........A..T...C..G.TT.C.TA..CCG.....CA..CC....T..G.  135
28        195   ......AG........A..T...C..G.TT.C.TA..CCG.....CA..CC....T..G.  136
83        131                                                             ..  130
85        134                                                             ..  133
110       836                                                             ..  837
111       837                                                             ..  838
112       833                                                             ..  834
14        137                                                             ..  136
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12        140                                                             ..  139
3         137                                                             ..  136
88        122                                                             ..  121
5         137                                                             ..  136
87        122                                                             ..  121

Query_46  3200  AATAACATTGGAAGTGGATAACGGATCCGAATTCGAGCTCCGTCGA-CAAGCTT-GCGGC  3257
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20        65      ....................--.....                                 41
18        65      ....................--.....                                 41

Query_46  3258  CG-CACT-CGAGcaccaccaccaccacca-cT-G-AGA-T-CCGGCTGCTAACAAAG-CC  3309
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79        43                                         .-.-................-..  24
75        45                                         .-.-................-..  26
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20        45                                         .-.-................-..  26
18        45                                         .-.-................C..  25

Query_46  3310  C--G--AAAGGAAGC-TGAGTTGGC-TG-CTGCCACCGCTGAGCAATAAC-TAG-CA-TA  3359
49        24    .--.--.......                                                 16
44        24    .--.--....                                                    19
46        26    .--N--...                                                     22
47        29    N--.--...AN...                                                20
26        25    .--.--........                                                16
24        25    .--.--.....                                                   19
22        24    .--N--...A.N..                                                15
28        25    .G-.--...N...                                                 16
83        22    .--.--.......                                                 14
85        22    .--.--....                                                    17
110       948   N--A--....T....N.........-..-.....................-...-..-..  998
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27        950   .--.--.........-.........T..-.........N...........-...-..N..  1001
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Query= CMR200069.108

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Query_47  99    TATAC-ATATG--CACCAT-CATCATCAT-CATTCTT-CT-GG-TGTAGAT-CTGTGGTC  149
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Query_47  150   TCAT-CC--G-CAGTTCG-AAAAGGGTA-CCGAGAA-CCTGTACTT-CCAAT-CCAATGC  200
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Query_47  201   CCA-ACA--ACAACCCGAATGGCAGAGCCAATATGCTGTCGGACTGAACAAACTGGCCCC  257
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85        812   .A.-.                                                         809
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105       160   .                                                             160
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17        149   .                                                             149
111       152   .A.-.                                                         155
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Query_47  258   TCATACTTATGTGTGGCCTTATCAAACCATATCTGATA-TCCG--TAACGGAGATTATGA  314
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Query_47  315   ATCTTCTCCTTATTATATGAGTCTGAACGGTAGTTGGAAATTCCATTGGGTAAAGAATCC  374
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Query_47  375   CGATAACCGTCCGAAGGATTTTTATAAACCGGAGTTTTATACAGGAGGATGGGCGGATAT  434
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114       345   ....C.T........A..C...........TTC...C.....G..C........A.G...  404
72        328   ....C.T........A..C...........TTC...C.....G..C........A.G...  387
58        774                     ................                            759

Query_47  435   TCAGGTTCCCGGCAATTGGGAACGCCAAGGATATGGAACAGCTATTTATGTAAACGAAAC  494
93        396   ............................................................  455
90        383   ............................................................  442
91        379   .............N....................................N.........  438
70        389   CG.T..A.....T..C.....G..T..G........T..G...........G........  448
74        383   CG.T..A.....T..C.....G..T..G........T..G...........G........  442
114       405   CG.T..A.....T..C.....G..T.NG........T..G...........G........  464
72        388   CG.T..A.....T..C.....G..T..G........T..G...........G........  447

Query_47  495   CTATGAGTTCGATGACAAACTGTTCCATTTTAAAAAGAATCCGCCTTTAGTTCCATATAA  554
93        456   ............................................................  515
90        443   ............................................................  502
91        439   ..........................N.................................  498
70        449   T.....A..T.....TCCTT.....A.C..C...........T..GC.G..A..T...GC  508
74        443   T.....A..T.....TCCTT.....A.C..C...........T..GC.G..A..T...GC  502
114       465   T.....A..T.....TCCTT.....A.C..C...........T..GC.G..A..T...GC  524
72        448   T.....A..T.....TCCTT.....A.C..C...........T..GC.G..A..T...GC  507

Query_47  555   AGAGAATGAAGTCGGTTCCTACAGACGTACCTTTACAATTCCTGCCGATTGGGAAGACCG  614
93        516   ............................................................  575
90        503   ............................................................  562
91        499   ......N...................                                    524
70        509   ......C.....A.....T..TC.C.....G..C..GG.......T..C...A.......  568
74        503   N.....C...N.A.....T..TC.C.....G..C..GG.......T..C...A.......  562
114       525   .N....C.....A.....T..TC.C.....G..C..GG.......T..C...A.......  584
72        508   ......C.....A.....T..TC.C.....G..C..GG.......T..C...A.......  567

Query_47  615   CCGTGTGGTTATCTGTTGTGAAGGAGTGATTTCTTTTTACTATATTTGGGTGAACGGACA  674
93        576   ............................................................  635
90        563   ............................................................  622
70        569   T..CA.C..G..T..C........T.....C.....C..T.....C..............  628
74        563   T..CA.C..G..T..C........T.....C.....C..T.....C..............  622
114       585   N.NCA.CNNG..T..C........T.....C.....C..T.....C.............N  644
72        568   T..CA.C..G..T..C........T.....C.....C..T.....C..............  627

Query_47  675   TCTGTTGGGCTATAATCAAGGTTCAAAGAC-ACCGGCCGAATGGGATATCACTGATAAAT  733
93        636   ..............................-.............................  694
90        623   ..............................-.............................  681
70        629   .A..C....T.....C..G...........-T..T.................G..CT.TG  687
74        623   .A..C....T.....C..G...........TN..T.................G..CT.TG  682
114       645   .A..C....T.....C..G...........-T..T.................G..CT.TG  703
72        628   .A..C....N.....C..G...........-T..T...............N.G..       681

Query_47  734   TGAAGAAAGGTGAGAATACGGTGGCATTGGAGG-TTTACCGTTGGAGCGCCGGATCGTAT  792
93        695   .................................-..........................  753
90        682   .................................T..........................  741
70        688   .AC..GC...A..A....TC......C.T..A.-.A..T..C.....T..A..T..C...  746
74        683   .AC..GC...A..A....TC......C.T..A.-.A..T..C.....T..A..T..C...  741
114       704   .AC..GC...AN.A....TC......C.T..A.-.A..T..C.....T..AT.T..C...  762

Query_47  793   TTGGAGTGCCAGGATATGTGGCGGTTGAGTGGTATTGAACGTGATGTGTATC-TTTACAG  851
93        754   ....................................................T.......  813
90        742   ....................................................-.......  800
70        747   C.......T.......................C........G.....C....-.......  805
74        742   C.......-NN.....................C........G.....C....-..NN...  799
114       763   C.......T............N..........C........G....CNN...-.....N.  821

Query_47  852   CACTCCTAAACAGTATATAGCCGATTATAAAGT-AACCT-CTTCTTTAGA-CAAACAACA  908
93        814   .................................-.....-..........-.........  870
90        801   .................................A.....-..........-.........  858
70        806   T.....ACGC....T......T...........-G..T.-.......N..TT..GA..G.  863
74        800   N...                                                          803
114       822   -.....ACGC....-......T...........-G..T.N......NN..-T..        871

Query_47  909   ATATAAAG-AAGGTATTTTCGGTTTGGAAG-CTACCATTGAAGGGCCTT-CTACTTCCAT  965
93        871   ........A.....................C..............T...N..........  930
90        859   ......GA-.N...................-.....N............-..........  915
70        864   G.....G.-....-........CC.T..T.--...AG.......AAG.G-.G..C.GTG.  918

Query_47  966   GACTACC-TTTGC-TTACCGACTGGAAGATAAAACCGGTAAGGCGGTTCTGCAAGGTGAA  1023
93        931   ..N....T.....-..............................T........N......  989
90        916   .......-.....T........................-N.............N......  973
70        919   .T....T-..GA.-N..TA.T..........CTG....A...                    958

Query_47  1024  TAT-CCTATCAAATCGAAGGGATTG-AGCCATTTCTTGAAGTTGGA-TGAACAAAGTTTG  1080
93        990   ...-.....................A.....-.........-....-.....-.......  1044
90        974   ...N..................A..-....N...............N.......N.....  1032

Query_47  1081  CCGGATGTGGAAGT-CTGG-AGTG-CTGAG-CATCCGAA--TCTTTATACAC--T-GAT-  1130
93        1045  .......GT.....C...N-....-....N-........--...........CTG-...-  1097
90        1033  ..............-....N....C.....C.N...N..ATC......N.N.--.N...N  1089
127       694                                    ......--........             681
124       694                                    ......--........             681

Query_47  1131  CTT-GGAATT-GAAAGAT-GTAACA-GGTAAAGT-AACGG-AACTTA--CC-GGAT-GTG  1180
93        1098  ...-.....N-...GN.N-TAT...-...-...N-.....A......CT.G-....-.NN  1149
90        1090  ...G......N..N....N......C...N....A.....A......--..G....G...  1147

Query_47  1181  AAGTA-GGTTTCCGCACTTCGGAAA-TTAAGGAC--GGA-CGTTTTTGCATCAAT-GGTG  1234
93        1150  .....N........N....TC.G..-...N.N..--...N.......TGCN.N.N-...N  1205
90        1148  ...NN-..N...G............T...NN...CG.A.-.N...NNC....T..G....  1205

Query_47  1235  TG-CCGGTTTTGGTAAAGGGAACGAACCGTCATGAACATTCCCAATTAGGACGGACTGTA  1293
93        1206  ..T....A..N...-.N..NNCNN..N.....N....                         1241
90        1206  GN-G.N.N....T....                                             1221

Query_47  1294  AGCAAGGAACTGATGGAAAAAGATATCAAATTGATGAAACAGCATAATATCAATACGGTC  1353

Query_47  1354  CGCAATTCGCACTACCCTACCCATCCTTATTGGTATCAGCTTTGTGATCGTTATGGACTT  1413

Query_47  1414  TATATGATAGATGAAGCTAATATTGAATCGCATGGCATGGGGTATGGACCTGCTTCATTG  1473

Query_47  1474  GCCAAAGATTCCACTTGGTTGCCTGCCCACATGGATCGTACCCAACGTATGTATGAGCGT  1533

Query_47  1534  TCCAAGAATCATCCGGCTATCGTTATCTGGTCATTGGGGAATCAGGCCGGAAACGGTATT  1593

Query_47  1594  AACTTCGAACGTACATATGACTGGATGAAGTCAGTGGAGAAAAGTCGTCCTGTACAATAT  1653

Query_47  1654  GAACGGGCCGAACAGAATTATAATACCGATATCTATTGCCGTATGTATCGCAGCGTGGAA  1713

Query_47  1714  GAACTCATGGCCTATGCCCGCCAGACAGAACCTAAAGTTTATCGTCCTTTCATCATGACA  1773

Query_47  1774  GAGTATCTGCATACTATGGGTAATAGTGGCGGAGGATTAAAGGAATATATGCATGTATTC  1833

Query_47  1834  GAAACCGAACCGATTGTTCAGGGAGGTTGTATCTGGGATTGGGTGGATCAATCTTTCCGC  1893

Query_47  1894  GAGATAGATAAGGATGGTAAAT---GGTATTGGAGTTATGGTGGGGATTATGGTCCGAAG  1950
122       84                 .........CAT..........A....                      58
4         135                .........CAT..........A....                      161

Query_47  1951  GATGTGCCCAGTTTTGGCAATTTCTGTTGTAACGGGTTGGTCAATGCAGTCCGCGAACCG  2010

Query_47  2011  CATCCGCACCTCATTGAAGTGAAGAAGGAGTATCAATATATCAAATCGGTACTGACCGAT  2070

Query_47  2071  CCTAAGAAGCTGACAGTGGAAGTCAAGAACTGGTATGACTTTACCAATTTGAATGCCTAT  2130
49        1217                                             ....A.......A.NNN  1201

Query_47  2131  ACGTTGCACTGGCAGGTCATGGGGGATGATGGGAAA-GTGATAG-CAGAAGGAACTCGAA  2188
49        1200  NNNG...T...N.........NC--.....N.--..-NNN....-....NNN.NNNN...  1147
44        1184                        ........T.....C..N...NN.......NN....G.  1147
46        1189                     ......GA..NT.....-.NNN-.N-.GN.....C.NGA..  1152

Query_47  2189  AAGC-AGA-CTGTGCCCCTCAT-GAGGC--TGT-AACATTCTCTTTGGGTGCTGTAAAGT  2242
49        1146  ....-..NN...NN...T....-..NNT--GT.-..............N...........  1092
44        1146  ....C...-..NN--.......-.....--...T........NC..T.....NN....NG  1093
46        1151  .G..-.N.-..NN-........-.GAN.NG...-..........CN..N...N.......  1097
47        1159                ...T....A.....C-..A-..NN.CT....A...N........AG  1116

Query_47  2243  TG--CCTT-CTACGATTC--GTGAGGC-TTA-TTTG-AA-TCTGT-CTTGGACGCCTGAT  2292
49        1091  ..--....-........TCG.......-...-..-.-..-...N.-..............  1041
44        1092  ..--....T.......CN--.......-...-....-..-.TNN.-TC............  1042
46        1096  .TGC....-NN...NNNN--NN-.N..-.A.-....G..-..NN.-..-...........  1046
47        1115  .T--N...-TNNGN...N--.N...NNN...N....-..AN.N..A.......N.NN...  1062

Query_47  2293  --AAGGCAACTCCCTTTATTGG-AACT-C-ATGACG-AAG-TG-GCC-T-ATGACCAGTT  2342
49        1040  --.......NN........-.N-....-.-......-...-..-...N.-...N......  991
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47        1061  TA...........NN..N....G..N.-.N....A.N...N..-...C.-..........  1005
26        1009                                                  .-.......A..  999
24        1040           ....G......AA-T..G-G-..T...-.G.-.AA...-.T.......A..  996
22        1019                                ..T...-...G.A-...-.-.......A..  994

Query_47  2343  TGTACTGT-CTGCC--AAT--AAAG--G--GTATC-GTGCG-CCGGAAATCAAATTGGCT  2391
49        990   ........-..N..--...--....--.N-.....-.....-..................  941
44        990   ........-..N.A--.TA--....--.--.....-.....-...N.........-....  943
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22        993   -..T..T.-.G.GT--..A--T...--AACN..C.-.G..T-......C.A..C..C.GG  944

Query_47  2392  GATAA-GGTGAAG-ATAGATATTGA-TCCTGCAACC-GG-CGCTTT-ACGCTCTTATA-T  2444
49        940   .....-.......-...........-..........-..-......-...........-.  888
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24        944   .G...-....G.A-..GA....A..-...G.....A-..-G..GC.-T.A........-.  892
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28        936       .-......A-..GA....A..-...-.....A-..G.....C-..--.......-.  890

Query_47  2445  -ATATAAAG-G-TAAAGAGA------TGCT---TTCATCTCCTGTAGTTCTCAGCCTTTA  2492
49        887   -........-.-........------....---.-.........................  841
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28        889   -T.....T.-.-G..GN.-.------.A..GGG..--..C..C...CA.G--.....C..  844

Query_47  2493  TCGTCCTGTTACGGACAA-TGACAGCAGGGAAAAAACAGGAGGAGCCAAAGTTTGGAGGA  2551
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28        843   ......G..G.....T..-...T.A.C.T......GT..............C.....A..  785

Query_47  2552  AA-GAAGGTTTGGATAATATGATTCAAAAAGC-TA-CTTTT---GTCAAAGCATCTGAAA  2605
49        782   ..-.............................-..-.....---................  729
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28        784   ..-.CT..G......C.G----..A.C.C...G.G-.CC..ACC..G..GA.T...--.C  733

Query_47  2606  CAG--GTGGTAAAGCGGAAGTAGAGTTATGGAATGCTAAA-GGCGTAAAGTT-GGGAATG  2661
49        728   ...--...................................-...........-.......  673
44        728   ...--...................................-...........-.......  673
46        730   ...--...................................-...........-.......  675
47        735   ...--...................................A...........T.......  678
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24        731   .C.CA....ACGT..C.....G..A....TA....TCCGT-..T.A...AG.-.....CC  674
22        730   .C.CA....ACGT..C.....G..A....TA....TCCGT-..T.A...AG.-.....CC  673
28        732   .C.CA....ACGT..C.....G..A....TA....TCCGT-..T.A...AG.-.....AC  675

Query_47  2662  -GCTACCTTTGTATATACCTTGCAGAGCAATGGTGCATTAAAAGTAAAGACA-ACTTTCT  2719
49        672   -...................................................-.......  615
44        672   -...................................................-.......  615
46        674   -...................................................-.......  617
47        677   -...................................................-.......  620
26        673   -...T.T..CA.C.....AC.AA...AA.....C.A...GG.TA..C.....C.....G.  615
24        673   -...T.T..CA.C.....AC.AA...AA.....C.A...GG.TA..C.....C.....G.  615
22        672   -...T.T..CA.C.....AC.AA...AA.....C.A...GG.TA..C.....C.....G.  614
28        674   C...T.T..CA.C.....AC.AA...AA.....C.A...GG.TA..C.....C.....G.  615
56        155                                       ..............A.-.        139
51        140                                       ..............A.-.        124
58        137                                       ..............A.-.        121
54        142                                       ..............A.-.        126

Query_47  2720  TGCCGGATACTTCTGCTGTTACTTCATTGGCTAGAGTGGGCCTGGCATTTGAAATGCCGT  2779
49        614   ............................................................  555
44        614   ............................................................  555
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26        614   -..........A.C.T.A.C......C....GC.T..A..G..TA.T...........CG  556
24        614   -..........A.C.T.A.C......C....GC.T..A..G..TA.T...........CG  556
22        613   -..........A.C.T.A.C......C....GC.T..A..G..TA.T...........CG  555
28        614   -..........A.C.T.A.C......C....GC.T..A..G..TA.T...........CG  556

Query_47  2780  ATGCCTATAACAAGGTTTCTTATTTGGGACGTGGTGAACATGAAACTTATATAGACCGTA  2839
49        554   ............................................................  495
44        554   ............................................................  495
46        556   ............................................................  497
47        559   ............................................................  500
26        555   ....T..C..TC....G......C....G.....A..G..............G..T....  496
24        555   ....T..C..TC....G......C....G.....A..G..............G..T....  496
22        554   ....T..C..TC....G......C....G.....A..G..............G..T....  495
28        555   ....T..C..TC....G......N....G.....A..G..............G..T....  496

Query_47  2840  ATCAGTCTGGATGTATCGGAATTTACCATACAGATGCAGAACGTATGTTCCATTATTATG  2899
49        494   ............................................................  435
44        494   ............................................................  435
46        496   ............................................................  437
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26        495   ....A..C..TAAA..A..T.....T..C..C....TG..GA..........C.......  436
24        495   ....A..C..TAAA..A..T.....T..C..C....TG..GA..........C.......  436
22        494   ....A..C..TAAA..A..T.....T..C..C....TG..GA..........C.......  435
28        495   ....A..C..TAAA..A..T.....T..C..C....TG..GA..........C.......  436

Query_47  2900  TGAAGCCCCAGGCTACAGGAAATCGTACGGATGTGCGTTGGATGGAATTGGCGGATGAGG  2959
49        434   ............................................................  375
44        434   ............................................................  375
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26        435   .TCGT..G.....A..G..T..C...........C.........C..C.T..T.......  376
24        435   .TCGT..G.....A..G..T..C...........C.........C..C.T..T.......  376
22        434   .TCGT..G.....A..G..T..C...........C.........C..C.T..T.......  375
28        435   .TCGT..G.....A..G..T..C...........C.........C..C.T..T.......  376

Query_47  2960  CAGGAGAAGGTTTGTCTTTCCGTTCGGATAAAGTGTTTCAGTTCTGTGTTATTCCATTTA  3019
49        374   ............................................................  315
44        374   ............................................................  315
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26        375   ....T..G..GC..G.A........C...GCCTC.........TA....G.....T....  316
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Query_47  3020  CGGATTCTAATGTAGATAAAGCTACTCATATTAATAAACTTGAGAGAACAGGGATTATAA  3079
49        314   ............................................................  255
44        314   ............................................................  255
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24        315   .....GAG...C.G...GCG..A..G.....C...C..T.ACG.C.CGAT..AG.GG...  256
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28        315   .....GAG...C.G...GCG..A..G.....C...C..T.ACG.C.CGAT..AG.GG...  256

Query_47  3080  ATGTTCACTTAGATGCGGAACAGTCGGGGGTAGGTACTGCGACTTGTGGTCCGGGGGTAT  3139
49        254   ............................................................  195
44        254   ............................................................  195
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26        255   C......TC.G.....C.C....G.A..A..C.....G..T..C........T..A....  196
24        255   C......TC.G.....C.C....G.A..A..C.....G..T..C........T..A....  196
22        254   C......TC.G.....C.C....G.A..A..C.....G..T..C........T..A....  195
28        255   C......TC.G.....C.C....G.A..A..C.....G..T..C........T..A....  196

Query_47  3140  TGCCGCCATATCGTGTTCCGGTGGAGAAGCATACGTTTGAGTTTATGATTTGTCCATTAA  3199
49        194   ............................................................  135
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24        195   ......AG........A..T...C..G.TT.C.TA..CCG.....CA..CC....T..G.  136
22        194   ......AG........A..T...C..G.TT.C.TA..CCG.....CA..CC....T..G.  135
28        195   ......AG........A..T...C..G.TT.C.TA..CCG.....CA..CC....T..G.  136
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85        134                                                             ..  133
110       836                                                             ..  837
111       837                                                             ..  838
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14        137                                                             ..  136
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12        140                                                             ..  139
3         137                                                             ..  136
88        122                                                             ..  121
5         137                                                             ..  136
87        122                                                             ..  121

Query_47  3200  AATAACATTGGAAGTGGATAACGGATCCGAATTCGAGCTCCGTCGA-CAAGCTT-GCGGC  3257
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69        128     ............................................-....NN.-.....  73
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75        67    ......................--.....                                 41
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20        65      ....................--.....                                 41
18        65      ....................--.....                                 41

Query_47  3258  CG-CACT-CGAGcaccaccaccaccacca-cT-G-AGA-T-CCGGCTGCTAACAAAG-CC  3309
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66        71    A.-....-.........T.....N.....-N.-N-...-.-................-..  20
79        43                                         .-.-................-..  24
75        45                                         .-.-................-..  26
81        43                                         .-.-................-..  24
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Query_47  3310  C--G--AAAGGAAGC-TGAGTTGGC-TG-CTGCCACCGCTGAGCAATAAC-TAG-CA-TA  3359
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Query_47  3360  AC-C-CCTT-GGGGCCTCTAAACGGGTCTT--GAGG-GG--TTTTTTGCTGAAA  3405
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Query= CMR200069.109

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Query_48  1     TCTCG-ATCCCGCGAAATTAATAC-GACTC-ACTATAGGGG--AATT-GTGAG-CGGA-T  52
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Query_48  150   TCAT-CC--G-CAGTTCG-AAAAGGGTA-CCGAGAA-CCTGTACTT-CCAAT-CCAATGC  200
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Query_48  201   CCA-ACA--ACAACCCGAATGGCAGAGCCAATATGCTGTCGGACTGAACAAACTGGCCCC  257
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105       160   .                                                             160
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Query_48  258   TCATACTTATGTGTGGCCTTATCAAACCATATCTGATA-TCCG--TAACGGAGATTATGA  314
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79        122                                                  .............  110
75        124                                                  .............  112
81        122                                                  .............  110
77        122                                                  .............  110

Query_48  315   ATCTTCTCCTTATTATATGAGTCTGAACGGTAGTTGGAAATTCCATTGGGTAAAGAATCC  374
93        276   ............................................................  335
90        263   ............................................................  322
91        259   ............................................................  318
70        269   GCAA..A.........................AG...........C.....G........  328
74        263   GCAA..A.........................AG...........C.....G........  322
114       285   GCAA..A.........................AG...........C.....G........  344
72        268   GCAA..A.........................AG...........C.....G........  327
79        109   ..                                                            108
75        111   ..                                                            110
81        109   ..                                                            108
77        109   ..                                                            108

Query_48  375   CGATAACCGTCCGAAGGATTTTTATAAACCGGAGTTTTATACAGGAGGATGGGCGGATAT  434
93        336   ................................G...........................  395
90        323   ................................G...........................  382
91        319   ................................G...........................  378
70        329   ....C.T........A..C...........TTC...C.....G..C........A.G...  388
74        323   ....C.T........A..C...........TTC...C.....G..C........A.G...  382
114       345   ....C.T........A..C...........TTC...C.....G..C........A.G...  404
72        328   ....C.T........A..C...........TTC...C.....G..C........A.G...  387
58        774                     ................                            759

Query_48  435   TCAGGTTCCCGGCAATTGGGAACGCCAAGGATATGGAACAGCTATTTATGTAAACGAAAC  494
93        396   ............................................................  455
90        383   ............................................................  442
91        379   .............N....................................N.........  438
70        389   CG.T..A.....T..C.....G..T..G........T..G...........G........  448
74        383   CG.T..A.....T..C.....G..T..G........T..G...........G........  442
114       405   CG.T..A.....T..C.....G..T.NG........T..G...........G........  464
72        388   CG.T..A.....T..C.....G..T..G........T..G...........G........  447

Query_48  495   CTATGAGTTCGATGACAAACTGTTCCATTTTAAAAAGAATCCGCCTTTAGTTCCATATAA  554
93        456   ............................................................  515
90        443   ............................................................  502
91        439   ..........................N.................................  498
70        449   T.....A..T.....TCCTT.....A.C..C...........T..GC.G..A..T...GC  508
74        443   T.....A..T.....TCCTT.....A.C..C...........T..GC.G..A..T...GC  502
114       465   T.....A..T.....TCCTT.....A.C..C...........T..GC.G..A..T...GC  524
72        448   T.....A..T.....TCCTT.....A.C..C...........T..GC.G..A..T...GC  507

Query_48  555   AGAGAATGAAGTCGGTTCCTACAGACGTACCTTTACAATTCCTGCCGATTGGGAAGACCG  614
93        516   ............................................................  575
90        503   ............................................................  562
91        499   ......N...................                                    524
70        509   ......C.....A.....T..TC.C.....G..C..GG.......T..C...A.......  568
74        503   N.....C...N.A.....T..TC.C.....G..C..GG.......T..C...A.......  562
114       525   .N....C.....A.....T..TC.C.....G..C..GG.......T..C...A.......  584
72        508   ......C.....A.....T..TC.C.....G..C..GG.......T..C...A.......  567

Query_48  615   CCGTGTGGTTATCTGTTGTGAAGGAGTGATTTCTTTTTACTATATTTGGGTGAACGGACA  674
93        576   ............................................................  635
90        563   ............................................................  622
70        569   T..CA.C..G..T..C........T.....C.....C..T.....C..............  628
74        563   T..CA.C..G..T..C........T.....C.....C..T.....C..............  622
114       585   N.NCA.CNNG..T..C........T.....C.....C..T.....C.............N  644
72        568   T..CA.C..G..T..C........T.....C.....C..T.....C..............  627

Query_48  675   TCTGTTGGGCTATAATCAAGGTTCAAAGAC-ACCGGCCGAATGGGATATCACTGATAAAT  733
93        636   ..............................-.............................  694
90        623   ..............................-.............................  681
70        629   .A..C....T.....C..G...........-T..T.................G..CT.TG  687
74        623   .A..C....T.....C..G...........TN..T.................G..CT.TG  682
114       645   .A..C....T.....C..G...........-T..T.................G..CT.TG  703
72        628   .A..C....N.....C..G...........-T..T...............N.G..       681

Query_48  734   TGAAGAAAGGTGAGAATACGGTGGCATTGGAGG-TTTACCGTTGGAGCGCCGGATCGTAT  792
93        695   .................................-..........................  753
90        682   .................................T..........................  741
70        688   .AC..GC...A..A....TC......C.T..A.-.A..T..C.....T..A..T..C...  746
74        683   .AC..GC...A..A....TC......C.T..A.-.A..T..C.....T..A..T..C...  741
114       704   .AC..GC...AN.A....TC......C.T..A.-.A..T..C.....T..AT.T..C...  762

Query_48  793   TTGGAGTGCCAGGATATGTGGCGGTTGAGTGGTATTGAACGTGATGTGTATC-TTTACAG  851
93        754   ....................................................T.......  813
90        742   ....................................................-.......  800
70        747   C.......T.......................C........G.....C....-.......  805
74        742   C.......-NN.....................C........G.....C....-..NN...  799
114       763   C.......T............N..........C........G....CNN...-.....N.  821

Query_48  852   CACTCCTAAACAGTATATAGCCGATTATAAAGT-AACCT-CTTCTTTAGA-CAAACAACA  908
93        814   .................................-.....-..........-.........  870
90        801   .................................A.....-..........-.........  858
70        806   T.....ACGC....T......T...........-G..T.-.......N..TT..GA..G.  863
74        800   N...                                                          803
114       822   -.....ACGC....-......T...........-G..T.N......NN..-T..        871

Query_48  909   ATATAAAG-AAGGTATTTTCGGTTTGGAAG-CTACCATTGAAGGGCCTT-CTACTTCCAT  965
93        871   ........A.....................C..............T...N..........  930
90        859   ......GA-.N...................-.....N............-..........  915
70        864   G.....G.-....-........CC.T..T.--...AG.......AAG.G-.G..C.GTG.  918

Query_48  966   GACTACC-TTTGC-TTACCGACTGGAAGATAAAACCGGTAAGGCGGTTCTGCAAGGTGAA  1023
93        931   ..N....T.....-..............................T........N......  989
90        916   .......-.....T........................-N.............N......  973
70        919   .T....T-..GA.-N..TA.T..........CTG....A...                    958

Query_48  1024  TAT-CCTATCAAATCGAAGGGATTG-AGCCATTTCTTGAAGTTGGA-TGAACAAAGTTTG  1080
93        990   ...-.....................A.....-.........-....-.....-.......  1044
90        974   ...N..................A..-....N...............N.......N.....  1032

Query_48  1081  CCGGATGTGGAAGT-CTGG-AGTG-CTGAG-CATCCGAA--TCTTTATACAC--T-GAT-  1130
93        1045  .......GT.....C...N-....-....N-........--...........CTG-...-  1097
90        1033  ..............-....N....C.....C.N...N..ATC......N.N.--.N...N  1089
127       694                                    ......--........             681
124       694                                    ......--........             681

Query_48  1131  CTT-GGAATT-GAAAGAT-GTAACA-GGTAAAGT-AACGG-AACTTA--CC-GGAT-GTG  1180
93        1098  ...-.....N-...GN.N-TAT...-...-...N-.....A......CT.G-....-.NN  1149
90        1090  ...G......N..N....N......C...N....A.....A......--..G....G...  1147

Query_48  1181  AAGTA-GGTTTCCGCACTTCGGAAA-TTAAGGAC--GGA-CGTTTTTGCATCAAT-GGTG  1234
93        1150  .....N........N....TC.G..-...N.N..--...N.......TGCN.N.N-...N  1205
90        1148  ...NN-..N...G............T...NN...CG.A.-.N...NNC....T..G....  1205

Query_48  1235  TG-CCGGTTTTGGTAAAGGGAACGAACCGTCATGAACATTCCCAATTAGGACGGACTGTA  1293
93        1206  ..T....A..N...-.N..NNCNN..N.....N....                         1241
90        1206  GN-G.N.N....T....                                             1221

Query_48  1294  AGCAAGGAACTGATGGAAAAAGATATCAAATTGATGAAACAGCATAATATCAATACGGTC  1353

Query_48  1354  CGCAATTCGCACTACCCTACCCATCCTTATTGGTATCAGCTTTGTGATCGTTATGGACTT  1413

Query_48  1414  TATATGATAGATGAAGCTAATATTGAATCGCATGGCATGGGGTATGGACCTGCTTCATTG  1473

Query_48  1474  GCCAAAGATTCCACTTGGTTGCCTGCCCACATGGATCGTACCCAACGTATGTATGAGCGT  1533

Query_48  1534  TCCAAGAATCATCCGGCTATCGTTATCTGGTCATTGGGGAATGAAGCCGGAAACGGTATT  1593

Query_48  1594  AACTTCGAACGTACATATGACTGGATGAAGTCAGTGGAGAAAAGTCGTCCTGTACAATAT  1653

Query_48  1654  GAACGGGCCGAACAGAATTATAATACCGATATCTATTGCCGTATGTATCGCAGCGTGGAA  1713

Query_48  1714  GAACTCATGGCCTATGCCCGCCAGACAGAACCTAAAGTTTATCGTCCTTTCATCATGACA  1773

Query_48  1774  CAGTATCTGCATACTATGGGTAATAGTGGCGGAGGATTAAAGGAATATATGCATGTATTC  1833

Query_48  1834  GAAACCGAACCGATTGTTCAGGGAGGTTGTATCTGGGATTGGGTGGATCAATCTTTCCGC  1893

Query_48  1894  GAGATAGATAAGGATGGTAAAT---GGTATTGGAGTTATGGTGGGGATTATGGTCCGAAG  1950
122       84                 .........CAT..........A....                      58
4         135                .........CAT..........A....                      161

Query_48  1951  GATGTGCCCAGTTTTGGCAATTTCTGTTGTAACGGGTTGGTCAATGCAGTCCGCGAACCG  2010

Query_48  2011  CATCCGCACCTCATTGAAGTGAAGAAGGAGTATCAATATATCAAATCGGTACTGACCGAT  2070

Query_48  2071  CCTAAGAAGCTGACAGTGGAAGTCAAGAACTGGTATGACTTTACCAATTTGAATGCCTAT  2130
49        1217                                             ....A.......A.NNN  1201

Query_48  2131  ACGTTGCACTGGCAGGTCATGGGGGATGATGGGAAA-GTGATAG-CAGAAGGAACTCGAA  2188
49        1200  NNNG...T...N.........NC--.....N.--..-NNN....-....NNN.NNNN...  1147
44        1184                        ........T.....C..N...NN.......NN....G.  1147
46        1189                     ......GA..NT.....-.NNN-.N-.GN.....C.NGA..  1152

Query_48  2189  AAGC-AGA-CTGTGCCCCTCAT-GAGGC--TGT-AACATTCTCTTTGGGTGCTGTAAAGT  2242
49        1146  ....-..NN...NN...T....-..NNT--GT.-..............N...........  1092
44        1146  ....C...-..NN--.......-.....--...T........NC..T.....NN....NG  1093
46        1151  .G..-.N.-..NN-........-.GAN.NG...-..........CN..N...N.......  1097
47        1159                ...T....A.....C-..A-..NN.CT....A...N........AG  1116

Query_48  2243  TG--CCTT-CTACGATTC--GTGAGGC-TTA-TTTG-AA-TCTGT-CTTGGACGCCTGAT  2292
49        1091  ..--....-........TCG.......-...-..-.-..-...N.-..............  1041
44        1092  ..--....T.......CN--.......-...-....-..-.TNN.-TC............  1042
46        1096  .TGC....-NN...NNNN--NN-.N..-.A.-....G..-..NN.-..-...........  1046
47        1115  .T--N...-TNNGN...N--.N...NNN...N....-..AN.N..A.......N.NN...  1062

Query_48  2293  --AAGGCAACTCCCTTTATTGG-AACT-C-ATGACG-AAG-TG-GCC-T-ATGACCAGTT  2342
49        1040  --.......NN........-.N-....-.-......-...-..-...N.-...N......  991
44        1041  --....................-....N.-.....N-.-.-..-N..-.T...N......  991
46        1045  --........N...........-...N-.-....N.-...-..-...-.-N..G......  996
47        1061  TA...........NN..N....G..N.-.N....A.N...N..-...C.-..........  1005
26        1009                                                  .-.......A..  999
24        1040           ....G......AA-T..G-G-..T...-.G.-.AA...-.T.......A..  996
22        1019                                ..T...-...G.A-...-.-.......A..  994

Query_48  2343  TGTACTGT-CTGCC--AAT--AAAG--G--GTATC-GTGCG-CCGGAAATCAAATTGGCT  2391
49        990   ........-..N..--...--....--.N-.....-.....-..................  941
44        990   ........-..N.A--.TA--....--.--.....-.....-...N.........-....  943
46        995   ......-.-.....--...--....--.--.....-.....-..................  948
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24        995   ...T..T.T.G.GT--...--..GA--A--C..C.N.G..T-.......CT...C.TT.G  945
22        993   -..T..T.-.G.GT--..A--T...--AACN..C.-.G..T-......C.A..C..C.GG  944

Query_48  2392  GATAA-GGTGAAG-ATAGATATTGA-TCCTGCAACC-GG-CGCTTT-ACGCTCTTATA-T  2444
49        940   .....-.......-...........-..........-..-......-...........-.  888
44        942   .....-.......-...........-..........-..-......-...........-.  890
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47        954   .....A.......N...........A..........N..-......-...........-.  898
26        944   .G...-....G.A-..GA....A..-...G.....A-..-G..GC.-T.A........-.  892
24        944   .G...-....G.A-..GA....A..-...G.....A-..-G..GC.-T.A........-.  892
22        943   T.-..-....G.A-..GA....A..-...G.....A-..-G..GC.-T.A........-.  892
28        936       .-......A-..GA....A..-...-.....A-..G.....C-..--.......-.  890

Query_48  2445  -ATATAAAG-G-TAAAGAGA------TGCT---TTCATCTCCTGTAGTTCTCAGCCTTTA  2492
49        887   -........-.-........------....---.-.........................  841
44        889   -........-.-........------....---...........................  842
46        892   -........-.-........------N...---...........................  845
47        897   T........A.-........------....---.........................-.  849
26        891   -T.....T.-.-G.....AT------.A..---GGTT..C..C..TACAT.G.....C..  844
24        891   -T.....T.-.GN.....AT------.A..---GGTT..C..C..TACAT.G.....C..  843
22        891   -T.....T.-.-G...-...ATTAAC..G.---...--.C..GT..CA.-.G.....C..  842
28        889   -T.....T.-.-G..GN.-.------.A..GGG..--..C..C...CA.G--.....C..  844

Query_48  2493  TCGTCCTGTTACGGACAA-TGACAGCAGGGAAAAAACAGGAGGAGCCAAAGTTTGGAGGA  2551
49        840   ..................-..................................-......  783
44        841   ..................-..................................N......  783
46        844   ..........C.......-.........................................  786
47        848   ..................-................-........................  791
26        843   ......G..G.....T..A...T.A.C.T......GT..............C.....A..  784
24        842   ......G..G.....T..-...T.A.C.T......GT..............C.....A..  784
22        841   ......G..G.....T..-...T.N.C.T......GT..............C.....A..  783
28        843   ......G..G.....T..-...T.A.C.T......GT..............C.....A..  785

Query_48  2552  AA-GAAGGTTTGGATAATATGATTCAAAAAGC-TA-CTTTT---GTCAAAGCATCTGAAA  2605
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26        783   ..-.CT..G......C.G----..A.C.C...G.G-.CC..ACC..G..GA.T...--.C  732
24        783   ..-.CT..G......C.G----..A.C.C...G.G-.CC..ACC..G..GA.T...--.C  732
22        782   ..-.CT..G......C.GT.A.CA..GCGT..-CC-T.NCC---..G..GA.T...--.C  731
28        784   ..-.CT..G......C.G----..A.C.C...G.G-.CC..ACC..G..GA.T...--.C  733

Query_48  2606  CAG--GTGGTAAAGCGGAAGTAGAGTTATGGAATGCTAAA-GGCGTAAAGTT-GGGAATG  2661
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47        735   ...--...................................A...........T.......  678
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24        731   .C.CA....ACGT..C.....G..A....TA....TCCGT-..T.A...AG.-.....CC  674
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28        732   .C.CA....ACGT..C.....G..A....TA....TCCGT-..T.A...AG.-.....AC  675

Query_48  2662  -GCTACCTTTGTATATACCTTGCAGAGCAATGGTGCATTAAAAGTAAAGACA-ACTTTCT  2719
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Query_48  2720  TGCCGGATACTTCTGCTGTTACTTCATTGGCTAGAGTGGGCCTGGCATTTGAAATGCCGT  2779
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28        614   -..........A.C.T.A.C......C....GC.T..A..G..TA.T...........CG  556

Query_48  2780  ATGCCTATAACAAGGTTTCTTATTTGGGACGTGGTGAACATGAAACTTATATAGACCGTA  2839
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28        555   ....T..C..TC....G......N....G.....A..G..............G..T....  496

Query_48  2840  ATCAGTCTGGATGTATCGGAATTTACCATACAGATGCAGAACGTATGTTCCATTATTATG  2899
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Query_48  2900  TGAAGCCCCAGGCTACAGGAAATCGTACGGATGTGCGTTGGATGGAATTGGCGGATGAGG  2959
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Query_48  2960  CAGGAGAAGGTTTGTCTTTCCGTTCGGATAAAGTGTTTCAGTTCTGTGTTATTCCATTTA  3019
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Query_48  3020  CGGATTCTAATGTAGATAAAGCTACTCATATTAATAAACTTGAGAGAACAGGGATTATAA  3079
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28        315   .....GAG...C.G...GCG..A..G.....C...C..T.ACG.C.CGAT..AG.GG...  256

Query_48  3080  ATGTTCACTTAGATGCGGAACAGTCGGGGGTAGGTACTGCGACTTGTGGTCCGGGGGTAT  3139
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28        255   C......TC.G.....C.C....G.A..A..C.....G..T..C........T..A....  196

Query_48  3140  TGCCGCCATATCGTGTTCCGGTGGAGAAGCATACGTTTGAGTTTATGATTTGTCCATTAA  3199
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28        195   ......AG........A..T...C..G.TT.C.TA..CCG.....CA..CC....T..G.  136
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85        134                                                             ..  133
110       836                                                             ..  837
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12        140                                                             ..  139
3         137                                                             ..  136
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5         137                                                             ..  136
87        122                                                             ..  121

Query_48  3200  AATAACATTGGAAGTGGATAACGGATCCGAATTCGAGCTCCGTCGA-CAAGCTT-GCGGC  3257
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18        65      ....................--.....                                 41

Query_48  3258  CG-CACT-CGAGcaccaccaccaccacca-cT-G-AGA-T-CCGGCTGCTAACAAAG-CC  3309
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Query_48  3310  C--G--AAAGGAAGC-TGAGTTGGC-TG-CTGCCACCGCTGAGCAATAAC-TAG-CA-TA  3359
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Query_48  3360  AC-C-CCTT-GGGGCCTCTAAACGGGTCTT--GAGG-GG--TTTTTTGCTGAAA  3405
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Query= CMR200071.104

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Query_49  1     TCTCG-ATCCCGCGAAATTAATAC-GACTC-ACTATAGGGG--AATT-GTGAG-CGGA-T  52
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Query_49  53    AAC-AA-TT-CCCC--T-C-TAGAAA-TAA-TTTT-GTTTAAC--TTTAAGAA-GGA-GA  98
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Query_49  201   CTCTGAAATTTCTATAACAGATTCATGGAAGTATAAAGCAGAGAATGATGAACGTTTTTC  260
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74        146   .                                                             146
76        150   .                                                             150
61        138   .                                                             138
78        148   .                                                             148
99        144   .                                                             144
91        145   .                                                             145
114       168   .                                                             168
87        799   ..                                                            798
122       905   .                                                             905
101       157   .                                                             157
137       915   .                                                             915

Query_49  261   CAGTATGGATTGGAATGATTCTGATTGGGTAACTGTAGATTTGCCCCATACTTGGAATGC  320
96        220   ............................................................  279
97        222   ............................................................  281
94        223   ............................................................  282
95        221   ............................................................  280

Query_49  321   CGGAGATGTGATTGACGAGCAACGGGGATATAGGCGCGGCATATCTTGGTATAGGAAGAA  380
96        280   ............................................................  339
97        282   ............................................................  341
94        283   ............................................................  342
95        281   ....N...........N...........................................  340

Query_49  381   GTTGTTCATTCCTTCAGAGGCACGGGATAAGAAAATAACTCTTCGTTTTGATGGAGTGGC  440
96        340   ............................................................  399
97        342   ............................................................  401
94        343   ............................................................  402
95        341   ............................................................  400

Query_49  441   CAGCAAGGCAGACGTCTATTTAAATGGGAAATTATTGCAAACTCATTTGGGGGCATATAC  500
96        400   ............................................................  459
97        402   ............................................................  461
94        403   ............................................................  462
95        401   ........NN..................................................  460

Query_49  501   CGCTTTCGGAGTTGATATAACTGATATCTGTGAAGTTGGAAAGGAAAATCTGTTGGCGGT  560
96        460   ............................................................  519
97        462   ............................................................  521
94        463   ............................................................  522
95        461   ............................................................  520

Query_49  561   AAAAGTGGATAATAGTTCTTCTTTGGGGGAAATCCTTCCATCGGTTTCCGGAGATTTTTC  620
96        520   ............................................................  579
97        522   ............................................................  581
94        523   ............................................................  582
95        521   ..........................N.................................  580

Query_49  621   TATTTTTGGGGGTATTTATCGCAGGGTGTTCTTGCAATGGACGGAAAGAGTGCATTTTGT  680
96        580   ............................................................  639
97        582   ............................................................  641
94        583   ............................................................  642
95        581   .......................N....................................  640

Query_49  681   GACAGAACCTTATGCAGCTG-TTCCAGTAAGGATACAAACCCCTGAAGTGTCGGTATCTG  739
96        640   ....................T.......................................  699
97        642   .......T............-.......................................  700
94        643   ....................-.......................................  701
95        641   ................N...-.....................                    681

Query_49  740   AGGCGTCAATGCAAATTGTGGCTTTT--CTTAAAAATGACTTTACCGATACAAAGCACGT  797
96        700   ..........................--................................  757
97        701   ..........................TCT...............................  760
94        702   ..........................--...N............................  759

Query_49  798   GCACGTCAATG-TTTTTC-TTTGCGATGAAATGAATCGGATTGTGAAAGAGAAACAGTTG  855
96        758   ...........-......-.........................................  815
97        761   ...........-......T.........................................  819
94        760   ...........T......-................................-........  817

Query_49  856   AAACTG-AAACTGATTCCAGGCAGGAAATATCC-TATATCCACTTCTGTAGGAA-GGATA  912
96        816   ......A..........................-....................-.....  873
97        820   ......-................N.........T.......N............G.....  878
94        818   ......-...............N..-.......-....................-.....  873
59        338                     ..............                              351
61        332                     ..............                              345

Query_49  913   GAGAATCCT-CATTTGTGGTC-TCC--TGAATTACCTT-ATTTATATACGGTAAAA-GTG  966
96        874   .........-...........-...--...........-.................-...  927
97        879   N.NN.N..NC.N.........-...CTG....N.....-.................N...  936
94        874   .........-...........T..N--...........N.....C...              918
138       789                ........-G..--G..GAC.....-.........              759

Query_49  967   CAGGTATGCGAT-GCCAAGAAT-GGAGAAATGTATCAAGAAGTAATTTC-TCCGGTTGGA  1023
96        928   ............-.........-...N......................T..........  985
97        937   .....N.....NG.........N...N.....                              968

Query_49  1024  TTCAGATGGTTTTCGGTGGACAAGACAGGC-TTTTATCTGAACGGGAAGTATCTTAAATT  1082
96        986   .........-....................T..................NN.........  1044
73        346                                     ..............              333
68        345                                     ..............              332
71        343                                     ..............              330
69        344                                     ..............              331
15        277                                     ..............              264
20        281                                     ..............              268
18        281                                     ..............              268

Query_49  1083  GA-GGGGAGCTGCACGGCATCAGG-ATTATGCAGGTTTGGGAACGGCTATTCCCGTTGAA  1140
96        1045  ..G..........N.......N..A..A............CN......TA.T.N......  1104

Query_49  1141  ATGAATCGTAGGGATATGCGGTTGCTGAAAGAAATGGGAGCTAA-TTTTGTGCG-TATCA  1198
96        1105  ..-NN........--.NNNCNNN...TG.N.-.......N....T.........N.....  1160

Query_49  1199  G-TCATTATCCTCAAGATCCGGAAATATATCGAGCCTGTGACGAATTGGGGTTGATAGTA  1257
96        1161  .T............GA......N.......                                1190

Query_49  1258  TGGTCTGAAATTTGTGTTGTGAATGAAGTGAGAAAAAATACGAAATTCGCTCATAACTGC  1317

Query_49  1318  AAAGAAATGTTGAAAGAGATGATTCTTCAGAACTACAATCATCCATCGGTGGTACTATGG  1377
134       325            ..............                                       312
126       321            ..............                                       308
123       323            ..............                                       310
120       323            ..............                                       310
25        182            ..............                                       195
21        831            ..............                                       844

Query_49  1378  GGGGCTATGAATGCTTTATGGGATTACCATAAGCAAGCTATTGTGTTGGCTAGGGAATTG  1437
33        915                                                             ..  916

Query_49  1438  GAGGCTTTGAAAAAAGAGCTGGATCCTTATCGTCTTTCTTGTGTCGCCTTTCATGCTTTT  1497
33        917   A..............                                               931

Query_49  1498  ACTTGGGAGAAACCCTATACACAGTCTAGTAAGGAGATGTTTAATATTTCGGATGTTAAC  1557

Query_49  1558  GGGGTAAATGTATATGAATCTTGGTATCAGGGAGATTCTGCTACGATTGCACCTATGTTT  1617

Query_49  1618  GATAAATTTTGTAGTTATTCTACTGCAAAACCTCGTTTTTTGTCGGAATTTGGAGCAGGA  1677

Query_49  1678  AGCGATGAACGTATCCATTCTTATACTCCGCGTACATTTGATTTTACTCCGGAATTTCAA  1737
51        1203                                          .....NTN........-..N  1185

Query_49  1738  TTGGATTTTAATCGCAGA--TATATCAATGAAATGG-AG--AAAC-G-TCCGGA-TTATA  1789
56        1146                   .--.......N........N..--....C.-......-.NNNN  1110
51        1184  ....-.....T.NNNC.NNN..N.C.....N..N..-G.--..N.-NN..G...-..NN.  1131
58        1172                          ..C.N....N..-..NG....-N-...C.NG....N  1140

Query_49  1790  TA-GGTTATTCTATTTGGAA-TTTGGTTGATTTTC-A--GGTGG-ACGGTC--G-TGGT-  1839
56        1109  ..-.N.-...NN....N..--..............-.--....--......--.G....-  1062
51        1130  ..N....G.C..C..G.N..AN........N....C.--N..N.N..C..N--.-G..GA  1076
58        1139  ..-N.G.NN.T...N.....-A.N..NNAN....N-CNG..G..-......NG.-...--  1087

Query_49  1840  GATAGC--AAGCCT-AATCTGAATC--AAAAA-GGAAT--GTTGA-C---AGA-GGATCG  1886
56        1061  ......--......T.........N--C....-.....--..-..-.---...-......  1015
51        1075  ....N.--C.A..N-TT.TN.....NA.....-.....--....NN.---...-..N.NN  1026
58        1086  .NN..NCN.G....-.N.NGN.T..--.....N.....--N..T.-NCCA..G-N.N.NT  1034
54        1074             ...-..........--.....-..N.NTNN..AC-.---N..N..T.NN  1034

Query_49  1887  -T-CGGAAG-AAA--GAG--ATTTATT-A--TTAC-TG-TCAGG--C-TCGTTG-GTC-G  1929
56        1014  G.-......-...A-...--.......-.--.-..-..-....---.-......-...-.  972
51        1025  -.T.....N-...AGN..--....N..-.--..C.CN.-..N..--.N......-...C.  977
58        1033  -.-.N...NN...--NNN--.......-TNT....-.T-..N.N--.N......-...-N  987
54        1033  -N-N.N..N-...--N.AGA...N...N.--.N..-N.G.....NN.-C.....N..N-.  984

Query_49  1930  GA-CATTCC-G--ATGATT--CAT--ATT-GCCGGGG--CCGATT-GGACGA-AAA--GG  1974
56        971   ..-.....G-N--......--...--...-......---....N.N......-...--..  927
51        976   ..-......C.--.N.N..TC..N--...-N..C...GC..N...-..G...-...AG..  925
58        986   ..N.N....-.GA..N...T-..NTNN..-C......G-......-......-...AA..  933
54        983   .N-....A.-.--.A.NA.--T..--N.NN.......GC...N.G-......N...--..  935

Query_49  1975  GTGG--AAAT-TT-GTG-AT-G-ATAG-TA-TAAA-TGTG--C-GT-AA-GATC-AGTGT  2018
56        926   ....--...A-..-...-..-.N....-..-.N..-....--.-..-..-....-.....  882
51        924   ....--....-..N.N.-.N-.N....-..-....A....--.-..N..-....C.....  876
58        932   ....GA....N..-...N..-.-....G..N....-.NANGN.-..-..A.N..C.....  879
54        934   .N..G-....-..-..N-NNN.-....N.N-....ANN..--.N.A-..-....CN....  885

Query_49  2019  TTTTT-CT-AAT-C-AGAAAA--CGGTGG--AGTTAA-TT-C-A-TAATGG-AAAGTCTT  2065
56        881   .....-..-...-.-.....---......--......-..-.-.N......-........  835
51        875   .....-N.N...-.C......--......--......N..-.N.-......-........  825
58        878   .....T..-...T.-......AN......G-N.....-..T.-N-......G........  825
54        884   .....-..-N..-.-N.....N-...NN.GN.....T-..-.-.-......N........  834

Query_49  2066  T-GGGA-GTGC-GTGAA-GTGG-TAAA-TGGGG-AA-G-CTG-TTTT-CGTAGTTCCTTT  2114
56        834   .-....-....-.....-....-....-.....-..-.-...-...--............  787
51        824   .-....-....-.....-....-....-.....G..-.-...-....TN...........  774
58        824   .N....-....C.....A..N.-....A.....-..A.-...-....-........T...  771
54        833   .-....A....-.....A....G....N.....-..-.G...N....-............  779

Query_49  2115  TATAAA-C-GGAGAGAATC-TGCT-GGATGCCCGAAGTGGGGCACTTTCAGACAGGCTGA  2170
56        786   ......-.-..........-....-...................................  731
51        773   ......-.-.........N-...N-...................................  718
58        770   ......-.C..........-....-................................N..  714
54        778   ......A.-.........NN.N..T.N.N............................N..  720

Query_49  2171  A-GATACAGA-TGAGATTGTTATCTT-CCCGTCTTACTG-ACAGTGATGTGCTTTTGG-A  2225
56        730   .A........-...............-............-..................-.  675
51        717   .-........-...............T............-..................N.  661
58        713   .-........-...............-............-..................-.  659
54        719   .-........A..N............-............G..................-.  663

Query_49  2226  CGGTCTT-TGTA-TTAATTTGGGACAGGAGCATTGTTA-TTTTATAGACCCGCAGCTTCA  2282
56        674   .......-....-.........................-.....................  618
51        660   .......-....A.........................-.....................  603
58        658   .......-....-.........................N.....................  601
54        662   ..N....N....-...................N.....-.....................  605

Query_49  2283  GGAAATATGGATACCCGATAAACCTTATACAAAGGGAAGTTGGGGATATATGG-ATGGAA  2341
56        617   .....................................................-......  559
51        602   .....................................................-......  544
58        600   .....................................................G......  541
54        604   .....................................................-......  546

Query_49  2342  AACCTTTTAACTCCTGGCCGGGATCATCACATGATGGAGTTAGGTATGGAGTAGGGGCTG  2401
56        558   ............................................................  499
51        543   ............................................................  484
58        540   ............................................................  481
54        545   ............................................................  486

Query_49  2402  ATATAAAAAATACTTTTTTAGAGCCTCTTTTTCAGACCTTTTTAATTGGTACGACTTGTT  2461
56        498   ............................................................  439
51        483   ............................................................  424
58        480   ............................................................  421
54        485   ............................................................  426

Query_49  2462  ACCGGCTGGATGTTCCTGACGGAGTATATGAAATTGGCTTTTATTTCACGGAACCTTTCA  2521
56        438   ............................................................  379
51        423   ............................................................  364
58        420   ............................................................  361
54        425   ............................................................  366

Query_49  2522  GTAAGGATGAACGGAAAAATATTGTGCGTACAGGTGTTTCTGCCGAGGGACAACGTGTAT  2581
56        378   ............................................................  319
51        363   ............................................................  304
58        360   ............................................................  301
54        365   ............................................................  306

Query_49  2582  TTGATGTGTCAGTCAATGGAGAAAAATTGATAGAGTCATTGAATCTGGCTGATTCTTATG  2641
56        318   ............................................................  259
51        303   ............................................................  244
58        300   ............................................................  241
54        305   ............................................................  246

Query_49  2642  GCGAGCAGACAGCTGTTGTAAAGACACTTGTGGTCAATGTGCGGAATCATGAAGGACTGG  2701
56        258   ............................................................  199
51        243   ............................................................  184
58        240   ............................................................  181
54        245   ............................................................  186

Query_49  2702  AGATTCTGCTTTCTCCTCAAAAAGGACAAGGTGTTATTAGCGGATTAAAAGTAAAGAAAA  2761
56        198   ............................................................  139
51        183   ............................................................  124
58        180   ............................................................  121
54        185   ............................................................  126
49        637                                              ..............C..  621
44        637                                              ..............C..  621
46        639                                              ..............C..  623
47        642                                              ..............C..  626

Query_49  2762  TACGATAACATTGGAAGTGGATAACGGATCCGAATTCGAGCTCCGTCGA-CAAGCTT-GC  2819
56        138   .................................................-.......-..  81
51        123   .................................................-..N.N..-NA  66
58        120   .................................................-...N...-..  63
54        125   .................................................-......A-A.  68
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85        131       .............................................-.......-..  78
110       839       .............................................A.......-..  893
39        815       .............................................-.......-..  868
27        841        ............................................-.......T..  894
23        842        ..........................N.....C...........-.......-..  894
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111       840       .................................N...........-.N.....-..  893
40        132       .............................................-.......-..  79
26        134       .............................................-.......-..  81
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115       135        ............................................-.......-..  83
60        134        ............................................-.......-..  82
44        133       .............................................-.......-..  80
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14        134       .............................................-.......-..  81
30        131        ............................................-.......-..  79
0         133       .............................................-.......-..  80
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28        134       .............................................-.......-..  81
12        137       .............................................-.......-..  84
31        134        ............................................-.......-..  82
3         134       .............................................-.......-NN  81
88        119       .............................................-.......-N.  66
34        135        ............................................-.......-..  83
24        134       .............................................-......N-N.  81
5         134       .............................................-......N-..  81
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8         135       .............................................-......N-.N  82
22        133       .............................................-......N-N.  80
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71        127        ............................................-......N-..  75
69        128        ............................................-....NN.-..  76
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79        64        .....................--.....                              39
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15        61         ....................--.....                              37
20        65         ....................--.....                              41
18        65         ....................--.....                              41

Query_49  2820  GGCCG-CACT-CGAGcaccaccaccaccacca-cT-G-AGA-T-CCGGCTGCTAACAAAG  2872
56        80    .....-....-.....................-..-.-...-.-................  28
51        65    .....-....-.....................-..-.-...-.C................  12
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23        895   .....-....-...N........-........-..-.-...-.-..........T.....  946
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111       894   .....C..N.-..................N..-..-.A...-.-..N.......N..N..  948
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116       75    .....-....-.....................-..-.-...-.-................  23
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14        80    .....-....-.....................-..-.-...-.-................  28
30        78    .....-....-.....................-..-.-...-.-................  26
0         79    N....-....-.....................-..-.-...-.-................  27
46        81    .....-....-.....................-..-.-...-.-................  29
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3         80    .....-....-.....................-..-.-...-.-................  28
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24        80    .....-....-.....................-..-.-...-.-........N.......  28
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87        65    .....-....-.....................-..-.-...-.-............-...  14
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66        74    .CAA.-....-.........T.....N.....-N.-N-...-.-................  22
79        43                                            .-.-................  26
75        45                                            .-.-................  28
81        43                                            .-.-................  26
77        43                                            .-.-................  26
15        41                                            .-.-................  24
20        45                                            .-.-................  28
18        45                                            .-.-................  28

Query_49  2873  -CCC--G--AAAGGAAGC-TGAGTTGGC-TG-CTGCCACCGCTGAGCAATAAC-TAG-CA  2922
56        27    -...--.--...A...                                              17
51        11    -...--.--....                                                 4
58        12    -...--.--..                                                   7
54        12    -...--.--....                                                 5
83        24    -...--.--.......                                              14
85        24    -...--.--....                                                 17
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40        25    -...--.--........                                             14
26        27    -...--.--........                                             16
49        26    -...--.--.......                                              16
115       29    -...--.--.......                                              19
60        28    -...--.--.....                                                20
44        26    -...--.--....                                                 19
42        25    -...--.--....N.G..                                            13
38        25    C...--.--........                                             13
35        22    -...--.--...-.....                                            11
116       22    -...--.--....A.N..                                            10
64        26    -...--.--...A...                                              16
14        27    -...--.--...                                                  21
30        25    -...--.--...                                                  19
0         26    -...--.--...A...                                              16
46        28    -...--N--...                                                  22
28        27    -...G-.--...N...                                              16
12        30    C...--.--...N...                                              19
31        28    -...--.N-.....                                                19
3         27    -...--.--...A...                                              17
88        12    -...--.--....                                                 5
34        28    -...--.A-.......                                              17
24        27    -...--.--.....                                                19
5         27    C...--.--...A...                                              16
62        30    -...                                                          28
8         28    -...CGA--.......                                              16
22        26    -...--N--...A.N..                                             15
73        27    -...--.AA........                                             14
47        31    -..N--.--...AN...                                             20
87        13    -...--A--..                                                   8
68        26    C...--.--...A....                                             14
71        24    C...--.--....A...                                             12
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83        864   ....-..--.-.......-.........-.......C.........-.....-.......  813
85        863   ....-..--.-.......-.........-.......-.........-.....-.......  813
110       103   ....-..--.-.......-.........-.......-.........-.....-.......  153
105       109   ....-..--.-.......-.........-.......-.........-.....-.......  159
9         104   ....-..--.-.......-.........-.......-.........-.....-.......  154
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87        856   ....-..CGC-.......A.........C.......-.........C.....C.......  800
122       957   ....-..--.N.......A.........-.......-.........--.N..-.......  906
101       106   ..C.-G.T-.-.T..-..-.TG......-.......-.........-.....-.......  156
137       969   ..N.T..--.-.....N.-......N..-.......-..N......N.....N.....N.  916

Query_50  201   CTCTGAAATTTCTATAACAGATTCATGGAAGTATAAAGCAGAGAATGATGAACGTTTTTC  260
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83        812   .                                                             812
85        812   .                                                             812
110       154   .                                                             154
105       160   .                                                             160
9         155   .                                                             155
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93        162   .                                                             162
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111       152   .                                                             152
82        150   .                                                             150
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137       915   .                                                             915

Query_50  261   CAGTATGGATTGGAATGATTCTGATTGGGTAACTGTAGATTTGCCCCATACTTGGAATGC  320
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Query_50  321   CGGAGATGTGATTGACGAGCAACGGGGATATAGGCGCGGCATATCTTGGTATAGGAAGAA  380
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Query_50  381   GTTGTTCATTCCTTCAGAGGCACGGGATAAGAAAATAACTCTTCGTTTTGATGGAGTGGC  440
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Query_50  441   CAGCAAGGCAGACGTCTATTTAAATGGGAAATTATTGCAAACTCATTTGGGGGCATATAC  500
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Query_50  501   CGCTTTCGGAGTTGATATAACTGATATCTGTGAAGTTGGAAAGGAAAATCTGTTGGCGGT  560
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Query_50  561   AAAAGTGGATAATAGTTCTTCTTTGGGGGAAATCCTTCCATCGGTTTCCGGAGATTTTTC  620
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Query_50  621   TATTTTTGGGGGTATTTATCGCAGGGTGTTCTTGCAATGGACGGAAAGAGTGCATTTTGT  680
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Query_50  681   GACAGAACCTTATGCAGCTG-TTCCAGTAAGGATACAAACCCCTGAAGTGTCGGTATCTG  739
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Query_50  740   AGGCGTCAATGCAAATTGTGGCTTTT--CTTAAAAATGACTTTACCGATACAAAGCACGT  797
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Query_50  798   GCACGTCAATG-TTTTTC-TTTGCGATGAAATGAATCGGATTGTGAAAGAGAAACAGTTG  855
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Query_50  856   AAACTG-AAACTGATTCCAGGCAGGAAATATCC-TATATCCACTTCTGTAGGAA-GGATA  912
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Query_50  913   GAGAATCCT-CATTTGTGGTC-TCC--TGAATTACCTT-ATTTATATACGGTAAAA-GTG  966
96        874   .........-...........-...--...........-.................-...  927
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Query_50  967   CAGGTATGCGAT-GCCAAGAAT-GGAGAAATGTATCAAGAAGTAATTTC-TCCGGTTGGA  1023
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Query_50  1024  TTCAGATGGTTTTCGGTGGACAAGACAGGC-TTTTATCTGAACGGGAAGTATCTTAAATT  1082
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Query_50  1083  GA-GGGGAGCTGCACGGCATCAGG-ATTATGCAGGTTTGGGAACGGCTATTCCCGTTGAA  1140
96        1045  ..G..........N.......N..A..A............CN......TA.T.N......  1104

Query_50  1141  ATGAATCGTAGGGATATGCGGTTGCTGAAAGAAATGGGAGCTAA-TTTTGTGCG-TATCA  1198
96        1105  ..-NN........--.NNNCNNN...TG.N.-.......N....T.........N.....  1160

Query_50  1199  G-TCATTATCCTCAAGATCCGGAAATATATCGAGCCTGTGACGAATTGGGGTTGATAGTA  1257
96        1161  .T............GA......N.......                                1190

Query_50  1258  TGGTCTGAAATTTGTGTTGTGAATGAAGTGAGAAAAAATACGAAATTCGCTCATAACTGC  1317

Query_50  1318  AAAGAAATGTTGAAAGAGATGATTCTTCAGAACTACAATCATCCATCGGTGGTACTATGG  1377
134       325            ..............                                       312
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120       323            ..............                                       310
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21        831            ..............                                       844

Query_50  1378  GGGGCTATGAATGAATTATGGGATTACCATAAGCAAGCTATTGTGTTGGCTAGGGAATTG  1437
33        915                                                             ..  916

Query_50  1438  GAGGCTTTGAAAAAAGAGCTGGATCCTTATCGTCTTTCTTGTGTCGCCTTTCATGCTTTT  1497
33        917   A..............                                               931

Query_50  1498  ACTTGGGAGAAACCCTATACACAGTCTAGTAAGGAGATGTTTAATATTTCGGATGTTAAC  1557

Query_50  1558  GGGGTAAATGTATATGAATCTTGGTATCAGGGAGATTCTGCTACGATTGCACCTATGTTT  1617

Query_50  1618  GATAAATTTTGTAGTTATTCTACTGCAAAACCTCGTTTTTTGTCGGCTTTTGGAGCAGGA  1677

Query_50  1678  AGCGATGAACGTATCCATTCTTATACTCCGCGTACATTTGATTTTACTCCGGAATTTCAA  1737
51        1203                                          .....NTN........-..N  1185

Query_50  1738  TTGGATTTTAATCGCAGA--TATATCAATGAAATGG-AG--AAAC-G-TCCGGA-TTATA  1789
56        1146                   .--.......N........N..--....C.-......-.NNNN  1110
51        1184  ....-.....T.NNNC.NNN..N.C.....N..N..-G.--..N.-NN..G...-..NN.  1131
58        1172                          ..C.N....N..-..NG....-N-...C.NG....N  1140

Query_50  1790  TA-GGTTATTCTATTTGGAA-TTTGGTTGATTTTC-A--GGTGG-ACGGTC--G-TGGT-  1839
56        1109  ..-.N.-...NN....N..--..............-.--....--......--.G....-  1062
51        1130  ..N....G.C..C..G.N..AN........N....C.--N..N.N..C..N--.-G..GA  1076
58        1139  ..-N.G.NN.T...N.....-A.N..NNAN....N-CNG..G..-......NG.-...--  1087

Query_50  1840  GATAGC--AAGCCT-AATCTGAATC--AAAAA-GGAAT--GTTGA-C---AGA-GGATCG  1886
56        1061  ......--......T.........N--C....-.....--..-..-.---...-......  1015
51        1075  ....N.--C.A..N-TT.TN.....NA.....-.....--....NN.---...-..N.NN  1026
58        1086  .NN..NCN.G....-.N.NGN.T..--.....N.....--N..T.-NCCA..G-N.N.NT  1034
54        1074             ...-..........--.....-..N.NTNN..AC-.---N..N..T.NN  1034

Query_50  1887  -T-CGGAAG-AAA--GAG--ATTTATT-A--TTAC-TG-TCAGG--C-TCGTTG-GTC-G  1929
56        1014  G.-......-...A-...--.......-.--.-..-..-....---.-......-...-.  972
51        1025  -.T.....N-...AGN..--....N..-.--..C.CN.-..N..--.N......-...C.  977
58        1033  -.-.N...NN...--NNN--.......-TNT....-.T-..N.N--.N......-...-N  987
54        1033  -N-N.N..N-...--N.AGA...N...N.--.N..-N.G.....NN.-C.....N..N-.  984

Query_50  1930  GA-CATTCC-G--ATGATT--CAT--ATT-GCCGGGG--CCGATT-GGACGA-AAA--GG  1974
56        971   ..-.....G-N--......--...--...-......---....N.N......-...--..  927
51        976   ..-......C.--.N.N..TC..N--...-N..C...GC..N...-..G...-...AG..  925
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54        983   .N-....A.-.--.A.NA.--T..--N.NN.......GC...N.G-......N...--..  935

Query_50  1975  GTGG--AAAT-TT-GTG-AT-G-ATAG-TA-TAAA-TGTG--C-GT-AA-GATC-AGTGT  2018
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54        934   .N..G-....-..-..N-NNN.-....N.N-....ANN..--.N.A-..-....CN....  885

Query_50  2019  TTTTT-CT-AAT-C-AGAAAA--CGGTGG--AGTTAA-TT-C-A-TAATGG-AAAGTCTT  2065
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Query_50  2066  T-GGGA-GTGC-GTGAA-GTGG-TAAA-TGGGG-AA-G-CTG-TTTT-CGTAGTTCCTTT  2114
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Query_50  2115  TATAAA-C-GGAGAGAATC-TGCT-GGATGCCCGAAGTGGGGCACTTTCAGACAGGCTGA  2170
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Query_50  2171  A-GATACAGA-TGAGATTGTTATCTT-CCCGTCTTACTG-ACAGTGATGTGCTTTTGG-A  2225
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54        719   .-........A..N............-............G..................-.  663

Query_50  2226  CGGTCTT-TGTA-TTAATTTGGGACAGGAGCATTGTTA-TTTTATAGACCCGCAGCTTCA  2282
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Query_50  2283  GGAAATATGGATACCCGATAAACCTTATACAAAGGGAAGTTGGGGATATATGG-ATGGAA  2341
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Query_50  2342  AACCTTTTAACTCCTGGCCGGGATCATCACATGATGGAGTTAGGTATGGAGTAGGGGCTG  2401
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Query_50  2402  ATATAAAAAATACTTTTTTAGAGCCTCTTTTTCAGACCTTTTTAATTGGTACGACTTGTT  2461
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Query_50  2462  ACCGGCTGGATGTTCCTGACGGAGTATATGAAATTGGCTTTTATTTCACGGAACCTTTCA  2521
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Query_50  2522  GTAAGGATGAACGGAAAAATATTGTGCGTACAGGTGTTTCTGCCGAGGGACAACGTGTAT  2581
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Query_50  2582  TTGATGTGTCAGTCAATGGAGAAAAATTGATAGAGTCATTGAATCTGGCTGATTCTTATG  2641
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54        305   ............................................................  246

Query_50  2642  GCGAGCAGACAGCTGTTGTAAAGACACTTGTGGTCAATGTGCGGAATCATGAAGGACTGG  2701
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Query_50  2702  AGATTCTGCTTTCTCCTCAAAAAGGACAAGGTGTTATTAGCGGATTAAAAGTAAAGAAAA  2761
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44        637                                              ..............C..  621
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Query_50  2762  TACGATAACATTGGAAGTGGATAACGGATCCGAATTCGAGCTCCGTCGA-CAAGCTT-GC  2819
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18        65         ....................--.....                              41

Query_50  2820  GGCCG-CACT-CGAGcaccaccaccaccacca-cT-G-AGA-T-CCGGCTGCTAACAAAG  2872
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0         79    N....-....-.....................-..-.-...-.-................  27
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Query_50  2873  -CCC--G--AAAGGAAGC-TGAGTTGGC-TG-CTGCCACCGCTGAGCAATAAC-TAG-CA  2922
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Query= CMR200071.106

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Query_51  1     TCTCG-ATCCCGCGAAATTAATAC-GACTC-ACTATAGGGG--AATT-GTGAG-CGGA-T  52
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Query_51  150   TCAT-CC--G-CAGTTCG-AAAAGGGTA-CCGAGAA-CCTGTACTT-CCAAT-CCAATGC  200
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Query_51  201   CTCTGAAATTTCTATAACAGATTCATGGAAGTATAAAGCAGAGAATGATGAACGTTTTTC  260
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137       915   .                                                             915

Query_51  261   CAGTATGGATTGGAATGATTCTGATTGGGTAACTGTAGATTTGCCCCATACTTGGAATGC  320
96        220   ............................................................  279
97        222   ............................................................  281
94        223   ............................................................  282
95        221   ............................................................  280

Query_51  321   CGGAGATGTGATTGACGAGCAACGGGGATATAGGCGCGGCATATCTTGGTATAGGAAGAA  380
96        280   ............................................................  339
97        282   ............................................................  341
94        283   ............................................................  342
95        281   ....N...........N...........................................  340

Query_51  381   GTTGTTCATTCCTTCAGAGGCACGGGATAAGAAAATAACTCTTCGTTTTGATGGAGTGGC  440
96        340   ............................................................  399
97        342   ............................................................  401
94        343   ............................................................  402
95        341   ............................................................  400

Query_51  441   CAGCAAGGCAGACGTCTATTTAAATGGGAAATTATTGCAAACTCATTTGGGGGCATATAC  500
96        400   ............................................................  459
97        402   ............................................................  461
94        403   ............................................................  462
95        401   ........NN..................................................  460

Query_51  501   CGCTTTCGGAGTTGATATAACTGATATCTGTGAAGTTGGAAAGGAAAATCTGTTGGCGGT  560
96        460   ............................................................  519
97        462   ............................................................  521
94        463   ............................................................  522
95        461   ............................................................  520

Query_51  561   AAAAGTGGATAATAGTTCTTCTTTGGGGGAAATCCTTCCATCGGTTTCCGGAGATTTTTC  620
96        520   ............................................................  579
97        522   ............................................................  581
94        523   ............................................................  582
95        521   ..........................N.................................  580

Query_51  621   TATTTTTGGGGGTATTTATCGCAGGGTGTTCTTGCAATGGACGGAAAGAGTGCATTTTGT  680
96        580   ............................................................  639
97        582   ............................................................  641
94        583   ............................................................  642
95        581   .......................N....................................  640

Query_51  681   GACAGAACCTTATGCAGCTG-TTCCAGTAAGGATACAAACCCCTGAAGTGTCGGTATCTG  739
96        640   ....................T.......................................  699
97        642   .......T............-.......................................  700
94        643   ....................-.......................................  701
95        641   ................N...-.....................                    681

Query_51  740   AGGCGTCAATGCAAATTGTGGCTTTT--CTTAAAAATGACTTTACCGATACAAAGCACGT  797
96        700   ..........................--................................  757
97        701   ..........................TCT...............................  760
94        702   ..........................--...N............................  759

Query_51  798   GCACGTCAATG-TTTTTC-TTTGCGATGAAATGAATCGGATTGTGAAAGAGAAACAGTTG  855
96        758   ...........-......-.........................................  815
97        761   ...........-......T.........................................  819
94        760   ...........T......-................................-........  817

Query_51  856   AAACTG-AAACTGATTCCAGGCAGGAAATATCC-TATATCCACTTCTGTAGGAA-GGATA  912
96        816   ......A..........................-....................-.....  873
97        820   ......-................N.........T.......N............G.....  878
94        818   ......-...............N..-.......-....................-.....  873
59        338                     ..............                              351
61        332                     ..............                              345

Query_51  913   GAGAATCCT-CATTTGTGGTC-TCC--TGAATTACCTT-ATTTATATACGGTAAAA-GTG  966
96        874   .........-...........-...--...........-.................-...  927
97        879   N.NN.N..NC.N.........-...CTG....N.....-.................N...  936
94        874   .........-...........T..N--...........N.....C...              918
138       789                ........-G..--G..GAC.....-.........              759

Query_51  967   CAGGTATGCGAT-GCCAAGAAT-GGAGAAATGTATCAAGAAGTAATTTC-TCCGGTTGGA  1023
96        928   ............-.........-...N......................T..........  985
97        937   .....N.....NG.........N...N.....                              968

Query_51  1024  TTCAGATGGTTTTCGGTGGACAAGACAGGC-TTTTATCTGAACGGGAAGTATCTTAAATT  1082
96        986   .........-....................T..................NN.........  1044
73        346                                     ..............              333
68        345                                     ..............              332
71        343                                     ..............              330
69        344                                     ..............              331
15        277                                     ..............              264
20        281                                     ..............              268
18        281                                     ..............              268

Query_51  1083  GA-GGGGAGCTGCACGGCATCAGG-ATTATGCAGGTTTGGGAACGGCTATTCCCGTTGAA  1140
96        1045  ..G..........N.......N..A..A............CN......TA.T.N......  1104

Query_51  1141  ATGAATCGTAGGGATATGCGGTTGCTGAAAGAAATGGGAGCTAA-TTTTGTGCG-TATCA  1198
96        1105  ..-NN........--.NNNCNNN...TG.N.-.......N....T.........N.....  1160

Query_51  1199  G-TCATTATCCTCAAGATCCGGAAATATATCGAGCCTGTGACGAATTGGGGTTGATAGTA  1257
96        1161  .T............GA......N.......                                1190

Query_51  1258  TGGTCTGAAATTTGTGTTGTGAATGAAGTGAGAAAAAATACGAAATTCGCTCATAACTGC  1317

Query_51  1318  AAAGAAATGTTGAAAGAGATGATTCTTCAGAACTACAATCATCCATCGGTGGTACTATGG  1377
134       325            ..............                                       312
126       321            ..............                                       308
123       323            ..............                                       310
120       323            ..............                                       310
25        182            ..............                                       195
21        831            ..............                                       844

Query_51  1378  GGGGCTATGAATCAGTTATGGGATTACCATAAGCAAGCTATTGTGTTGGCTAGGGAATTG  1437
33        915                                                             ..  916

Query_51  1438  GAGGCTTTGAAAAAAGAGCTGGATCCTTATCGTCTTTCTTGTGTCGCCTTTCATGCTTTT  1497
33        917   A..............                                               931

Query_51  1498  ACTTGGGAGAAACCCTATACACAGTCTAGTAAGGAGATGTTTAATATTTCGGATGTTAAC  1557

Query_51  1558  GGGGTAAATGTATATGAATCTTGGTATCAGGGAGATTCTGCTACGATTGCACCTATGTTT  1617

Query_51  1618  GATAAATTTTGTAGTTATTCTACTGCAAAACCTCGTTTTTTGTCGGAATTTGGAGCAGGA  1677

Query_51  1678  AGCGATGAACGTATCCATTCTTATACTCCGCGTACATTTGATTTTACTCCGGAATTTCAA  1737
51        1203                                          .....NTN........-..N  1185

Query_51  1738  TTGGATTTTAATCGCAGA--TATATCAATGAAATGG-AG--AAAC-G-TCCGGA-TTATA  1789
56        1146                   .--.......N........N..--....C.-......-.NNNN  1110
51        1184  ....-.....T.NNNC.NNN..N.C.....N..N..-G.--..N.-NN..G...-..NN.  1131
58        1172                          ..C.N....N..-..NG....-N-...C.NG....N  1140

Query_51  1790  TA-GGTTATTCTATTTGGAA-TTTGGTTGATTTTC-A--GGTGG-ACGGTC--G-TGGT-  1839
56        1109  ..-.N.-...NN....N..--..............-.--....--......--.G....-  1062
51        1130  ..N....G.C..C..G.N..AN........N....C.--N..N.N..C..N--.-G..GA  1076
58        1139  ..-N.G.NN.T...N.....-A.N..NNAN....N-CNG..G..-......NG.-...--  1087

Query_51  1840  GATAGC--AAGCCT-AATCTGAATC--AAAAA-GGAAT--GTTGA-C---AGA-GGATCG  1886
56        1061  ......--......T.........N--C....-.....--..-..-.---...-......  1015
51        1075  ....N.--C.A..N-TT.TN.....NA.....-.....--....NN.---...-..N.NN  1026
58        1086  .NN..NCN.G....-.N.NGN.T..--.....N.....--N..T.-NCCA..G-N.N.NT  1034
54        1074             ...-..........--.....-..N.NTNN..AC-.---N..N..T.NN  1034

Query_51  1887  -T-CGGAAG-AAA--GAG--ATTTATT-A--TTAC-TG-TCAGG--C-TCGTTG-GTC-G  1929
56        1014  G.-......-...A-...--.......-.--.-..-..-....---.-......-...-.  972
51        1025  -.T.....N-...AGN..--....N..-.--..C.CN.-..N..--.N......-...C.  977
58        1033  -.-.N...NN...--NNN--.......-TNT....-.T-..N.N--.N......-...-N  987
54        1033  -N-N.N..N-...--N.AGA...N...N.--.N..-N.G.....NN.-C.....N..N-.  984

Query_51  1930  GA-CATTCC-G--ATGATT--CAT--ATT-GCCGGGG--CCGATT-GGACGA-AAA--GG  1974
56        971   ..-.....G-N--......--...--...-......---....N.N......-...--..  927
51        976   ..-......C.--.N.N..TC..N--...-N..C...GC..N...-..G...-...AG..  925
58        986   ..N.N....-.GA..N...T-..NTNN..-C......G-......-......-...AA..  933
54        983   .N-....A.-.--.A.NA.--T..--N.NN.......GC...N.G-......N...--..  935

Query_51  1975  GTGG--AAAT-TT-GTG-AT-G-ATAG-TA-TAAA-TGTG--C-GT-AA-GATC-AGTGT  2018
56        926   ....--...A-..-...-..-.N....-..-.N..-....--.-..-..-....-.....  882
51        924   ....--....-..N.N.-.N-.N....-..-....A....--.-..N..-....C.....  876
58        932   ....GA....N..-...N..-.-....G..N....-.NANGN.-..-..A.N..C.....  879
54        934   .N..G-....-..-..N-NNN.-....N.N-....ANN..--.N.A-..-....CN....  885

Query_51  2019  TTTTT-CT-AAT-C-AGAAAA--CGGTGG--AGTTAA-TT-C-A-TAATGG-AAAGTCTT  2065
56        881   .....-..-...-.-.....---......--......-..-.-.N......-........  835
51        875   .....-N.N...-.C......--......--......N..-.N.-......-........  825
58        878   .....T..-...T.-......AN......G-N.....-..T.-N-......G........  825
54        884   .....-..-N..-.-N.....N-...NN.GN.....T-..-.-.-......N........  834

Query_51  2066  T-GGGA-GTGC-GTGAA-GTGG-TAAA-TGGGG-AA-G-CTG-TTTT-CGTAGTTCCTTT  2114
56        834   .-....-....-.....-....-....-.....-..-.-...-...--............  787
51        824   .-....-....-.....-....-....-.....G..-.-...-....TN...........  774
58        824   .N....-....C.....A..N.-....A.....-..A.-...-....-........T...  771
54        833   .-....A....-.....A....G....N.....-..-.G...N....-............  779

Query_51  2115  TATAAA-C-GGAGAGAATC-TGCT-GGATGCCCGAAGTGGGGCACTTTCAGACAGGCTGA  2170
56        786   ......-.-..........-....-...................................  731
51        773   ......-.-.........N-...N-...................................  718
58        770   ......-.C..........-....-................................N..  714
54        778   ......A.-.........NN.N..T.N.N............................N..  720

Query_51  2171  A-GATACAGA-TGAGATTGTTATCTT-CCCGTCTTACTG-ACAGTGATGTGCTTTTGG-A  2225
56        730   .A........-...............-............-..................-.  675
51        717   .-........-...............T............-..................N.  661
58        713   .-........-...............-............-..................-.  659
54        719   .-........A..N............-............G..................-.  663

Query_51  2226  CGGTCTT-TGTA-TTAATTTGGGACAGGAGCATTGTTA-TTTTATAGACCCGCAGCTTCA  2282
56        674   .......-....-.........................-.....................  618
51        660   .......-....A.........................-.....................  603
58        658   .......-....-.........................N.....................  601
54        662   ..N....N....-...................N.....-.....................  605

Query_51  2283  GGAAATATGGATACCCGATAAACCTTATACAAAGGGAAGTTGGGGATATATGG-ATGGAA  2341
56        617   .....................................................-......  559
51        602   .....................................................-......  544
58        600   .....................................................G......  541
54        604   .....................................................-......  546

Query_51  2342  AACCTTTTAACTCCTGGCCGGGATCATCACATGATGGAGTTAGGTATGGAGTAGGGGCTG  2401
56        558   ............................................................  499
51        543   ............................................................  484
58        540   ............................................................  481
54        545   ............................................................  486

Query_51  2402  ATATAAAAAATACTTTTTTAGAGCCTCTTTTTCAGACCTTTTTAATTGGTACGACTTGTT  2461
56        498   ............................................................  439
51        483   ............................................................  424
58        480   ............................................................  421
54        485   ............................................................  426

Query_51  2462  ACCGGCTGGATGTTCCTGACGGAGTATATGAAATTGGCTTTTATTTCACGGAACCTTTCA  2521
56        438   ............................................................  379
51        423   ............................................................  364
58        420   ............................................................  361
54        425   ............................................................  366

Query_51  2522  GTAAGGATGAACGGAAAAATATTGTGCGTACAGGTGTTTCTGCCGAGGGACAACGTGTAT  2581
56        378   ............................................................  319
51        363   ............................................................  304
58        360   ............................................................  301
54        365   ............................................................  306

Query_51  2582  TTGATGTGTCAGTCAATGGAGAAAAATTGATAGAGTCATTGAATCTGGCTGATTCTTATG  2641
56        318   ............................................................  259
51        303   ............................................................  244
58        300   ............................................................  241
54        305   ............................................................  246

Query_51  2642  GCGAGCAGACAGCTGTTGTAAAGACACTTGTGGTCAATGTGCGGAATCATGAAGGACTGG  2701
56        258   ............................................................  199
51        243   ............................................................  184
58        240   ............................................................  181
54        245   ............................................................  186

Query_51  2702  AGATTCTGCTTTCTCCTCAAAAAGGACAAGGTGTTATTAGCGGATTAAAAGTAAAGAAAA  2761
56        198   ............................................................  139
51        183   ............................................................  124
58        180   ............................................................  121
54        185   ............................................................  126
49        637                                              ..............C..  621
44        637                                              ..............C..  621
46        639                                              ..............C..  623
47        642                                              ..............C..  626

Query_51  2762  TACGATAACATTGGAAGTGGATAACGGATCCGAATTCGAGCTCCGTCGA-CAAGCTT-GC  2819
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Query_51  2820  GGCCG-CACT-CGAGcaccaccaccaccacca-cT-G-AGA-T-CCGGCTGCTAACAAAG  2872
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Query_51  2873  -CCC--G--AAAGGAAGC-TGAGTTGGC-TG-CTGCCACCGCTGAGCAATAAC-TAG-CA  2922
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Query_51  2923  -TAAC-C-CCTT-GGGGCCTCTAAACGGGTCTT--GAGG-GG--TTTTTTGCTGAAA  2970
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Query= CMR200071.107

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Query_52  150   TCAT-CC--G-CAGTTCG-AAAAGGGTA-CCGAGAA-CCTGTACTT-CCAAT-CCAATGC  200
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99        93    ....-..--.-.......-.........-.......-.........-.....-.......  143
91        94    ....-..--.-.......-.........-.......-.........-.....-.......  144
114       117   ....-..--.-......T-N........-.......-.........-.....-.......  167
87        856   ....-..CGC-.......A.........C.......-.........C.....C.......  800
122       957   ....-..--.N.......A.........-.......-.........--.N..-.......  906
101       106   ..C.-G.T-.-.T..-..-.TG......-.......-.........-.....-.......  156
137       969   ..N.T..--.-.....N.-......N..-.......-..N......N.....N.....N.  916

Query_52  201   CTCTGAAATTTCTATAACAGATTCATGGAAGTATAAAGCAGAGAATGATGAACGTTTTTC  260
96        160   ............................................................  219
97        162   ............................................................  221
94        163   ............................................................  222
95        161   ............................................................  220
117       646   .                                                             646
83        812   .                                                             812
85        812   .                                                             812
110       154   .                                                             154
105       160   .                                                             160
9         155   .                                                             155
103       162   .                                                             162
93        162   .                                                             162
86        152   .                                                             152
98        164   .                                                             164
89        153   .                                                             153
17        149   .                                                             149
84        149   .                                                             149
112       156   ..                                                            157
90        149   .                                                             149
70        152   .                                                             152
111       152   .                                                             152
82        150   .                                                             150
102       160   .                                                             160
59        144   .                                                             144
100       151   .                                                             151
80        152   .                                                             152
29        148   .                                                             148
104       163   .                                                             163
72        151   .                                                             151
74        146   .                                                             146
76        150   .                                                             150
61        138   .                                                             138
78        148   .                                                             148
99        144   .                                                             144
91        145   .                                                             145
114       168   .                                                             168
87        799   ..                                                            798
122       905   .                                                             905
101       157   .                                                             157
137       915   .                                                             915

Query_52  261   CAGTATGGATTGGAATGATTCTGATTGGGTAACTGTAGATTTGCCCCATACTTGGAATGC  320
96        220   ............................................................  279
97        222   ............................................................  281
94        223   ............................................................  282
95        221   ............................................................  280

Query_52  321   CGGAGATGTGATTGACGAGCAACGGGGATATAGGCGCGGCATATCTTGGTATAGGAAGAA  380
96        280   ............................................................  339
97        282   ............................................................  341
94        283   ............................................................  342
95        281   ....N...........N...........................................  340

Query_52  381   GTTGTTCATTCCTTCAGAGGCACGGGATAAGAAAATAACTCTTCGTTTTGATGGAGTGGC  440
96        340   ............................................................  399
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94        343   ............................................................  402
95        341   ............................................................  400

Query_52  441   CAGCAAGGCAGACGTCTATTTAAATGGGAAATTATTGCAAACTCATTTGGGGGCATATAC  500
96        400   ............................................................  459
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94        403   ............................................................  462
95        401   ........NN..................................................  460

Query_52  501   CGCTTTCGGAGTTGATATAACTGATATCTGTGAAGTTGGAAAGGAAAATCTGTTGGCGGT  560
96        460   ............................................................  519
97        462   ............................................................  521
94        463   ............................................................  522
95        461   ............................................................  520

Query_52  561   AAAAGTGGATAATAGTTCTTCTTTGGGGGAAATCCTTCCATCGGTTTCCGGAGATTTTTC  620
96        520   ............................................................  579
97        522   ............................................................  581
94        523   ............................................................  582
95        521   ..........................N.................................  580

Query_52  621   TATTTTTGGGGGTATTTATCGCAGGGTGTTCTTGCAATGGACGGAAAGAGTGCATTTTGT  680
96        580   ............................................................  639
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94        583   ............................................................  642
95        581   .......................N....................................  640

Query_52  681   GACAGAACCTTATGCAGCTG-TTCCAGTAAGGATACAAACCCCTGAAGTGTCGGTATCTG  739
96        640   ....................T.......................................  699
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94        643   ....................-.......................................  701
95        641   ................N...-.....................                    681

Query_52  740   AGGCGTCAATGCAAATTGTGGCTTTT--CTTAAAAATGACTTTACCGATACAAAGCACGT  797
96        700   ..........................--................................  757
97        701   ..........................TCT...............................  760
94        702   ..........................--...N............................  759

Query_52  798   GCACGTCAATG-TTTTTC-TTTGCGATGAAATGAATCGGATTGTGAAAGAGAAACAGTTG  855
96        758   ...........-......-.........................................  815
97        761   ...........-......T.........................................  819
94        760   ...........T......-................................-........  817

Query_52  856   AAACTG-AAACTGATTCCAGGCAGGAAATATCC-TATATCCACTTCTGTAGGAA-GGATA  912
96        816   ......A..........................-....................-.....  873
97        820   ......-................N.........T.......N............G.....  878
94        818   ......-...............N..-.......-....................-.....  873
59        338                     ..............                              351
61        332                     ..............                              345

Query_52  913   GAGAATCCT-CATTTGTGGTC-TCC--TGAATTACCTT-ATTTATATACGGTAAAA-GTG  966
96        874   .........-...........-...--...........-.................-...  927
97        879   N.NN.N..NC.N.........-...CTG....N.....-.................N...  936
94        874   .........-...........T..N--...........N.....C...              918
138       789                ........-G..--G..GAC.....-.........              759

Query_52  967   CAGGTATGCGAT-GCCAAGAAT-GGAGAAATGTATCAAGAAGTAATTTC-TCCGGTTGGA  1023
96        928   ............-.........-...N......................T..........  985
97        937   .....N.....NG.........N...N.....                              968

Query_52  1024  TTCAGATGGTTTTCGGTGGACAAGACAGGC-TTTTATCTGAACGGGAAGTATCTTAAATT  1082
96        986   .........-....................T..................NN.........  1044
73        346                                     ..............              333
68        345                                     ..............              332
71        343                                     ..............              330
69        344                                     ..............              331
15        277                                     ..............              264
20        281                                     ..............              268
18        281                                     ..............              268

Query_52  1083  GA-GGGGAGCTGCACGGCATCAGG-ATTATGCAGGTTTGGGAACGGCTATTCCCGTTGAA  1140
96        1045  ..G..........N.......N..A..A............CN......TA.T.N......  1104

Query_52  1141  ATGAATCGTAGGGATATGCGGTTGCTGAAAGAAATGGGAGCTAA-TTTTGTGCG-TATCA  1198
96        1105  ..-NN........--.NNNCNNN...TG.N.-.......N....T.........N.....  1160

Query_52  1199  G-TCATTATCCTCAAGATCCGGAAATATATCGAGCCTGTGACGAATTGGGGTTGATAGTA  1257
96        1161  .T............GA......N.......                                1190

Query_52  1258  TGGTCTGAAATTTGTGTTGTGAATGAAGTGAGAAAAAATACGAAATTCGCTCATAACTGC  1317

Query_52  1318  AAAGAAATGTTGAAAGAGATGATTCTTCAGAACTACAATCATCCATCGGTGGTACTATGG  1377
134       325            ..............                                       312
126       321            ..............                                       308
123       323            ..............                                       310
120       323            ..............                                       310
25        182            ..............                                       195
21        831            ..............                                       844

Query_52  1378  GGGGCTATGAATGAATTATGGGATTACCATAAGCAAGCTATTGTGTTGGCTAGGGAATTG  1437
33        915                                                             ..  916

Query_52  1438  GAGGCTTTGAAAAAAGAGCTGGATCCTTATCGTCTTTCTTGTGTCGCCTTTCATGCTTTT  1497
33        917   A..............                                               931

Query_52  1498  ACTTGGGAGAAACCCTATACACAGTCTAGTAAGGAGATGTTTAATATTTCGGATGTTAAC  1557

Query_52  1558  GGGGTAAATGTATATGAATCTTGGTATCAGGGAGATTCTGCTACGATTGCACCTATGTTT  1617

Query_52  1618  GATAAATTTTGTAGTTATTCTACTGCAAAACCTCGTTTTTTGTCGCAGTTTGGAGCAGGA  1677

Query_52  1678  AGCGATGAACGTATCCATTCTTATACTCCGCGTACATTTGATTTTACTCCGGAATTTCAA  1737
51        1203                                          .....NTN........-..N  1185

Query_52  1738  TTGGATTTTAATCGCAGA--TATATCAATGAAATGG-AG--AAAC-G-TCCGGA-TTATA  1789
56        1146                   .--.......N........N..--....C.-......-.NNNN  1110
51        1184  ....-.....T.NNNC.NNN..N.C.....N..N..-G.--..N.-NN..G...-..NN.  1131
58        1172                          ..C.N....N..-..NG....-N-...C.NG....N  1140

Query_52  1790  TA-GGTTATTCTATTTGGAA-TTTGGTTGATTTTC-A--GGTGG-ACGGTC--G-TGGT-  1839
56        1109  ..-.N.-...NN....N..--..............-.--....--......--.G....-  1062
51        1130  ..N....G.C..C..G.N..AN........N....C.--N..N.N..C..N--.-G..GA  1076
58        1139  ..-N.G.NN.T...N.....-A.N..NNAN....N-CNG..G..-......NG.-...--  1087

Query_52  1840  GATAGC--AAGCCT-AATCTGAATC--AAAAA-GGAAT--GTTGA-C---AGA-GGATCG  1886
56        1061  ......--......T.........N--C....-.....--..-..-.---...-......  1015
51        1075  ....N.--C.A..N-TT.TN.....NA.....-.....--....NN.---...-..N.NN  1026
58        1086  .NN..NCN.G....-.N.NGN.T..--.....N.....--N..T.-NCCA..G-N.N.NT  1034
54        1074             ...-..........--.....-..N.NTNN..AC-.---N..N..T.NN  1034

Query_52  1887  -T-CGGAAG-AAA--GAG--ATTTATT-A--TTAC-TG-TCAGG--C-TCGTTG-GTC-G  1929
56        1014  G.-......-...A-...--.......-.--.-..-..-....---.-......-...-.  972
51        1025  -.T.....N-...AGN..--....N..-.--..C.CN.-..N..--.N......-...C.  977
58        1033  -.-.N...NN...--NNN--.......-TNT....-.T-..N.N--.N......-...-N  987
54        1033  -N-N.N..N-...--N.AGA...N...N.--.N..-N.G.....NN.-C.....N..N-.  984

Query_52  1930  GA-CATTCC-G--ATGATT--CAT--ATT-GCCGGGG--CCGATT-GGACGA-AAA--GG  1974
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51        976   ..-......C.--.N.N..TC..N--...-N..C...GC..N...-..G...-...AG..  925
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54        983   .N-....A.-.--.A.NA.--T..--N.NN.......GC...N.G-......N...--..  935

Query_52  1975  GTGG--AAAT-TT-GTG-AT-G-ATAG-TA-TAAA-TGTG--C-GT-AA-GATC-AGTGT  2018
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Query_52  2019  TTTTT-CT-AAT-C-AGAAAA--CGGTGG--AGTTAA-TT-C-A-TAATGG-AAAGTCTT  2065
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Query_52  2066  T-GGGA-GTGC-GTGAA-GTGG-TAAA-TGGGG-AA-G-CTG-TTTT-CGTAGTTCCTTT  2114
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Query_52  2115  TATAAA-C-GGAGAGAATC-TGCT-GGATGCCCGAAGTGGGGCACTTTCAGACAGGCTGA  2170
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Query_52  2171  A-GATACAGA-TGAGATTGTTATCTT-CCCGTCTTACTG-ACAGTGATGTGCTTTTGG-A  2225
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Query_52  2226  CGGTCTT-TGTA-TTAATTTGGGACAGGAGCATTGTTA-TTTTATAGACCCGCAGCTTCA  2282
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Query_52  2283  GGAAATATGGATACCCGATAAACCTTATACAAAGGGAAGTTGGGGATATATGG-ATGGAA  2341
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Query_52  2342  AACCTTTTAACTCCTGGCCGGGATCATCACATGATGGAGTTAGGTATGGAGTAGGGGCTG  2401
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Query_52  2402  ATATAAAAAATACTTTTTTAGAGCCTCTTTTTCAGACCTTTTTAATTGGTACGACTTGTT  2461
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Query_52  2462  ACCGGCTGGATGTTCCTGACGGAGTATATGAAATTGGCTTTTATTTCACGGAACCTTTCA  2521
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Query_52  2522  GTAAGGATGAACGGAAAAATATTGTGCGTACAGGTGTTTCTGCCGAGGGACAACGTGTAT  2581
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Query_52  2582  TTGATGTGTCAGTCAATGGAGAAAAATTGATAGAGTCATTGAATCTGGCTGATTCTTATG  2641
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Query_52  2642  GCGAGCAGACAGCTGTTGTAAAGACACTTGTGGTCAATGTGCGGAATCATGAAGGACTGG  2701
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Query_52  2702  AGATTCTGCTTTCTCCTCAAAAAGGACAAGGTGTTATTAGCGGATTAAAAGTAAAGAAAA  2761
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Query_52  2762  TACGATAACATTGGAAGTGGATAACGGATCCGAATTCGAGCTCCGTCGA-CAAGCTT-GC  2819
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18        65         ....................--.....                              41

Query_52  2820  GGCCG-CACT-CGAGcaccaccaccaccacca-cT-G-AGA-T-CCGGCTGCTAACAAAG  2872
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18        45                                            .-.-................  28

Query_52  2873  -CCC--G--AAAGGAAGC-TGAGTTGGC-TG-CTGCCACCGCTGAGCAATAAC-TAG-CA  2922
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Query= CMR200125.105

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Query_53  1     TCTCG-ATCCCGCGAAATTAATAC-GACTC-ACTATAGGGG--AATT-GTGAG-CGGA-T  52
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Query_53  99    TATAC-ATATG--CACCAT-CATCATCAT-CATTCTT-CT-GG-TGTAGAT-CTGTGGTC  149
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Query_53  150   TCAT-CC--G-CAGTTCG-AAAAGGGTA-CCGAGAA-CCTGTACTT-CCAAT-CCAATGC  200
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Query_53  201   CCAAGTATCTTTTGGCGAAGCCAAAAAATTTAATGAGAATTGGTTGTTCAGTTTGTCGGA  260
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105       160   .                                                             160
9         155   .GT..A....                                                    164
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17        148   ......C..                                                     156
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Query_53  261   CGATAGTCTGAGCACTTCCGTATCGTATGACGATAGTAAGTGGCGAAAACTTGATTTGCC  320
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Query_53  321   GCACGACTGGTCGGTAGAAGGACAGCTTTCTCCTTCCCTGGCAAGCTGTACCGGTTATTT  380
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Query_53  381   GCCgggggggATAGGCTGGTATCGGAAACATTTTCAGGTTACCGATAAGGCTGCGCGCCA  440
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Query_53  441   CTACATCTATTTTGAGGGAGCATATAACCGCAGCGAGGTTTATTTGAACGGTCACTTGCT  500
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Query_53  501   CGGTAAACGTCCGAACGGATACATATCTTTTATGTATGACATGACTCCCTACCTGAAGGA  560
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Query_53  561   AGGAAATAACGTGCTGGCAGTCCGTATTGACCATAGCCGTTATGCCGATTCACGCTGGTA  620
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Query_53  621   CACCGGTTCCGGAATTTACCGGGATGTGTGGATGATTTCCGCCCCGGATATTCATTTTGC  680
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Query_53  681   TCAATGGGG-AATAGGCTGGCACGCTAC-TTCGCTGACCGATAAGCAGGCGGTAGTGGCA  738
100       631   .........-..................-...............................  688
98        644   .........A..................T...N...........................  703
99        624   .........-..................T.............................-.  681
101       635   .........-...T......-GT.....-.........TT....N....TNNN.A..AAG  691

Query_53  739   GTTGATATGGAAGTCG-AAAAACATGTGAAGGCTGCTGGTGCA-TTGGAGGTTTCTGCGG  796
100       689   ................-..........................-................  746
98        704   ................A..........................T................  763
99        682   ............N...-..........................-.......-........  738
101       692   A.......C......N-C.........A.N..N......N..C-.....N.CC......N  749

Query_53  797   CAC-TTTATGATGCAGAAGGTGCGTT-GGTAGCACAAGGCCGTAAGAAAGTGGCAGAT-A  853
100       747   ...-......................-...............................-.  803
98        764   ...T...........N..........G....N.........N................A.  823
99        739   ...-...N..............                                        759
101       750   NN.-.G..............G.....-...GNGN...A.G.....N.N.TN..N...C-T  806

Query_53  854   AAGCTGAGGGTATTGCGAAAGAAACAAT-ATCACTGAA-GGTGAAGAAGCCTCGCCGCTG  911
100       804   ............................-.........-.....................  861
98        824   .........................N..N.........N..NN.................  883
101       807   .C.....C..A.C...C.......A...-.........-C.....C...N..........  864

Query_53  912   GAATCT-GGATGCACCTTATC-TGTACACGCTGAAGACAG-AGTTGCTTTGTG---ACGG  965
100       862   ......-..............T..................-............---....  916
98        884   ......G..............-...N.N............A............---....  939
101       865   .N....-C........N....-...N..N......NGANC-.........-..NNN..T.  920

Query_53  966   GAAACGGAT-AGA-TGGC-AG-TTCGACGAATG-TAGGTCT--CCGTACATTG-AAGTTT  1017
100       917   .........-...-....-..-...........-.......--..........-...-..  967
98        940   ....NN.G.G...T....-..NN.....T....T.......C-....CA....A......  997
101       921   A..CT....-...-....T.C-N.....N...N-..A...NTC...NG.N...-C.N...  975

Query_53  1018  GATGCCAAC-AAGGGAT-TTG-CC-TTGAA-CGG-AAAGTGGATGAAGGT--GAAAGGA-  1068
100       968   .........-.......-...-..-.....-...-....-N.N.......--.......-  1017
98        998   .....A...A......N-...C..-.....N...-N..NG...A......C-N......A  1053
101       976   ...N..NC.-.N..T..G...-.NG.....-...C.....-...N..T..NA...C.A.-  1030

Query_53  1069  -GT-ATGT-C-TGCATCATGA-TGC-AGGTGTGCTGGGTGCGGTAG-TTCCTCCTGAAGT  1121
100       1018  -..-....-.-..........T...-..N.-....-..N.......T.....T.......  1070
98        1054  GA.-...NC.-.....N....-...N..NN....C...                        1088
101       1031  -..NN...-.T...N.....                                          1048

Query_53  1122  ATGGGAGCGTCGTCT-GAGAAACCTGAAAG-AGATTGGTGTGAATGCCATCCGTATGAGC  1179
100       1071  ...............G..N..C........A.........NNNT.............-NN  1129

Query_53  1180  CATAATCCGCAGGCACCGGTA-TTGTATGATTTATGTG-ACCGAATGGGCTTCCTGGTGA  1237
100       1130  N..N........CAC.....NT................A.......--.NN....-NNN.  1186

Query_53  1238  TGGATGAAGCTTCGGATGAATGGGAATTCCCGAAACGGAAATGGATAAAGGGATGGAATG  1297
100       1187  ......-......-.N........N.N.-.N..N..C....                     1224

Query_53  1298  TCGGTGAACCAAGCTATGACGGAACATTTGATTTCTTTGAGGAATGGATTGAACGCGATG  1357

Query_53  1358  TGACGGATATGGTGCGTCGTGACCGGAATCACCCTTGTATATTCTTGTGGAGCATCGGTA  1417

Query_53  1418  ATGCTGTAGACTATCCGAACGATCCTTATTCTCACCCTATTTTGGATGGCACAACCATTA  1477

Query_53  1478  ATCAGCCTATGTTCGGTGGATACAAGCCTGAT-GCCCCGGATGCCA-TGCGTAT-CGGT-  1533
64        1159                                                 .......T....T  1147
60        1175                           ...N...T....G....TNN.A.NN.N..-..T.-  1143

Query_53  1534  -AAGATTGCGAA-GCGT-CTGGCTGCCTGTGT-TCGTGCGGTGGA-CACTTCACGTCCTG  1588
64        1146  A...........A.N..-......N.....N.-NGTNNG......A...NN-........  1090
60        1142  -..NN...N...A....T.N.....NN.....A..NNN....N..A.NN.NA......N.  1084
62        1117                                                  ..N...NN..N.  1106

Query_53  1589  TTACC-GGT--GCATTGGCCGGAGT-GG-T-GATGTCGAA--TCAGACAGAGTATCCTGA  1640
64        1089  N....C..N--.............NN..-.-.........--..................  1036
60        1083  .....C...--....G.--...N.N-..-NN...N.....--....N.............  1032
62        1105  ...N.-C.NNN.....N.NG.....-..GN-.......N.AT......N....N......  1049

Query_53  1641  AGCAGT-AGATG-T-AGTAGGATA-TAATT-ATACGGAAAA-CCGTTAT-GACG-A-AGA  1691
64        1035  ......-...N.-.T.........N.....-.........N-.......N....N.-...  981
60        1031  ......-....N-N-.........-..-..-..........-....-..-....-.-...  983
62        1048  ......TN....N.-.....N...-.....T..........A....A..-....-.T...  993
66        976                                                              .  976

Query_53  1692  T-CATGCTACTTATCC-TGAC-CGTGTGATTTAC--GGTAGTGAAACC-GGTGTGG-GAA  1744
64        980   .-.........-....-....-............--............-.......-...  929
60        982   .-..............-....-..N.........--............-.......-...  930
62        992   .T..............N....-...........NCG.......CT...C.......-...  935
66        975   .-.........C....-....G...A....G...--.N....C.G...-.NN.NN.C...  921

Query_53  1745  TTGAGGCTTGGCATGCAGTACGCGACAA-G-GAGTTTATTTTCGGACAGTTCCTCTGGAC  1802
64        928   ............................-.-.............................  871
60        929   ............................-.-.............................  872
62        934   ............................A.-.............................  876
66        920   NN...N..C.N........N..T.....-.T...A........A......AAN....T.N  862

Query_53  1803  GGGTACAGACTATTTGGGTGAATCAGGCAGATGGCCTT-CCAGAGGTTTGTATACTGGTT  1861
64        870   ......................................-.....................  812
60        871   ......................................-.....................  813
62        875   .................-....................T.....................  817
66        861   .A..G.......G..TNNN.......N......T.T..-........N...........N  803

Query_53  1862  TGCTGGACTTTGGCAGCTTCCCTAAACCC-CGTGGATACTTCCGTGCTTCGCTTTGGAGT  1920
64        811   -............................-..............................  754
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66        802   ...........................T.G......N.N...............A.....  743

Query_53  1921  GAAAAACC-TGTGACTTATGTTGGTACGTATCCTAAGCACGA-CTGGGTATCAATGGATG  1978
64        753   ........-.................................-.................  696
60        755   ........-.................................-.................  698
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66        742   .......GG..........A.-..........N......N.NG.GN..............  684

Query_53  1979  CATGGGATTTGTGGAACTACGAACCGGGTCAGTTGATTCGGGTGGTTTGTTATACCAATG  2038
64        695   ............................................................  636
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66        683   ................N.T-......NA....CAN...T.......N......NN.....  625

Query_53  2039  CACCGCAGGCTCGTTTGTTGCTGAACGGAAAAGAAGTGGGTCAGATGAAGCCTTACGATG  2098
64        635   ............................................................  576
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66        624   ..NG...CAN...NN..............................N...N..N..N....  565

Query_53  2099  ATAAGAGTGGTATCATTTATTGGGATATTCCTTATCAGGATGGAGAATTGCGTGCAGAAG  2158
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66        564   .......................C................NC.....N.T...N......  505

Query_53  2159  GTTGTGATGCAACTGGAAAGGTGCTTTCATCTTATGCAATCAAGACCTCAGGACGTCCAT  2218
64        515   ............................................................  456
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66        504   A..N...CA....C................NCC.N..................G....C.  445

Query_53  2219  ACGCCTTGCGGGCTACTGTGGATAAGGAAGTCTTGTCGCCGGATAAGGCTACTGCACATG  2278
64        455   ............................................................  396
60        457   ............................................................  398
62        459   ............................................................  400
66        444   N.A..C.NN...AANNN.A.............CNC.A....N......N.NN.S.N....  385

Query_53  2279  TGACAATCGAAGTGGTGGATGAACAAGGTACTATCGTAAAATTAGGCGATAACGACGTAA  2338
64        395   ............................................................  336
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66        384   NTC....G...CA..N......N......GAA..G..C...C....GA...N....C.TN  325

Query_53  2339  CTTGTCAGATTGAAGGTCCGGCACGCTTGTTGGGACTGGAAGGTTCAAATAACGGAGATA  2398
64        335   ............................................................  276
60        337   ............................................................  278
62        339   ............................................................  280
66        324   ..C....T..N......AA...............CA........................  265

Query_53  2399  TGAGTGATTATACAGATAATCACCACCGTGCTTTTCACGGACGTTTGCTGGCTTATATCC  2458
64        275   ............................................................  216
60        277   ............................................................  218
62        279   ............................................................  220
66        264   N.......................-....-.......A.......NC.............  207

Query_53  2459  AGACTACAGGTGAGAAAGGTGAGATTCGTGTGAAACTGACTTCTCCTCTTTTGAAAGGAA  2518
64        215   ............................................................  156
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62        219   ............................................................  160
66        206   ..-T....................CANC.........-..........-.GA........  150

Query_53  2519  CGGAAGTGGTATTGAAGGCTGAGTAACATTGGAAGTGGATAACGGATCCGAATTCGAGCT  2578
64        155   ............................................................  96
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66        149   .......A...-CC....AG......................T.....N....A....TC  91
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23        841                         ...........................N.....C....  878
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111       841                          ................................N....  877
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26        133                          .....................................  97
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56        133                          .....................................  97
44        132                          .....................................  96
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8         141                   ......A.....................................  98
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15        62                          .....................--.....            37
20        66                          .....................--.....            41
18        66                          .....................--.....            41

Query_53  2579  CCGTCGA-CAAGCTT-GCGGCCG-CACT-CGAGcaccaccaccaccacca-cT-G-AGA-  2630
64        95    .......-.......-.......-....-.....................-..-.-...-  44
60        97    .......-.......-.......-....-.....................-..-.-...-  46
62        99    .......-.......-.......-....-.....................-..-.-...-  48
66        90    .T..G.N-.C.A.CG-A..CAA.-....-.........T.....N.....-N.-N-...-  39
85        93    .......-.......-.......-....-.....................-..-.-...-  42
83        90    .......-.......-.......-....-....---..............-..-.-...-  42
110       877   .......A.......-.......-....-...............--....-..T.-...-  928
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Query_53  2631  T-CCGGCTGCTAACAAAG-CCC--G--AAAGGAAGC-TGAGTTGGC-TG-CTGCCACCGC  2681
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Query_53  2733  --TTTTTTGCTGAAA  2745
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Query= CMR200125.106

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Query_54  1     TCTCG-ATCCCGCGAAATTAATAC-GACTC-ACTATAGGGG--AATT-GTGAG-CGGA-T  52
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Query_54  53    AAC-AA-TT-CCCC--T-C-TAGAAA-TAA-TTTT-GTTTAAC--TTTAAGAA-GGA-GA  98
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Query_54  201   CCAAGTATCTTTTGGCGAAGCCAAAAAATTTAATGAGAATTGGTTGTTCAGTTTGTCGGA  260
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97        162   .                                                             162
104       163   .                                                             163
72        151   ...                                                           153
74        146   ...                                                           148
76        150   ..                                                            151
61        138   ...                                                           140
78        148   ..                                                            149
91        145   ....                                                          148
114       168   ...                                                           170
87        799   .                                                             799
122       905   .                                                             905
137       915   ......N..                                                     907

Query_54  261   CGATAGTCTGAGCACTTCCGTATCGTATGACGATAGTAAGTGGCGAAAACTTGATTTGCC  320
100       211   ............................................................  270
98        224   ............................................................  283
99        204   ............................................................  263
101       216   .TGG..NA.....C...........C........C-.......N................  274

Query_54  321   GCACGACTGGTCGGTAGAAGGACAGCTTTCTCCTTCCCTGGCAAGCTGTACCGGTTATTT  380
100       271   ............................................................  330
98        284   ............................................................  343
99        264   ............................................................  323
101       275   ..........N...N.C..N.....T..........A...NACC......A.........  334

Query_54  381   GCCgggggggATAGGCTGGTATCGGAAACATTTTCAGGTTACCGATAAGGCTGCGCGCCA  440
100       331   ............................................................  390
98        344   ............................................................  403
99        324   ............................................................  383
101       335   .....CC............N...N.....N.....NN.........NT......N....T  394

Query_54  441   CTACATCTATTTTGAGGGAGCATATAACCGCAGCGAGGTTTATTTGAACGGTCACTTGCT  500
100       391   ............................................................  450
98        404   ............................................................  463
99        384   ............................................................  443
101       395   G...N................G...G...T.CTG......A..A......AC.TG.....  454

Query_54  501   CGGTAAACGTCCGAACGGATACATATCTTTTATGTATGACATGACTCCCTACCTGAAGGA  560
100       451   ............................................................  510
98        464   ............................................................  523
99        444   ............................................................  503
101       455   ..TG....T.A...TG......G.................N..........G....N...  514

Query_54  561   AGGAAATAACGTGCTGGCAGTCCGTATTGACCATAGCCGTTATGCCGATTCACGCTGGTA  620
100       511   ............................................................  570
98        524   ............................................................  583
99        504   ............................................................  563
101       515   .A......C.NG.A...NG.N..............C..............AT.A......  574

Query_54  621   CACCGGTTCCGGAATTTACCGGGATGTGTGGATGATTTCCGCCCCGGATATTCATTTTGC  680
100       571   ............................................................  630
98        584   ............................................................  643
99        564   ............................................................  623
101       575   .....N..............T.....A..............A.A................  634

Query_54  681   TCAATGGGG-AATAGGCTGGCACGCTAC-TTCGCTGACCGATAAGCAGGCGGTAGTGGCA  738
100       631   .........-..................-...............................  688
98        644   .........A..................T...N...........................  703
99        624   .........-..................T.............................-.  681
101       635   .........-...T......-GT.....-.........TT....N....TNNN.A..AAG  691

Query_54  739   GTTGATATGGAAGTCG-AAAAACATGTGAAGGCTGCTGGTGCA-TTGGAGGTTTCTGCGG  796
100       689   ................-..........................-................  746
98        704   ................A..........................T................  763
99        682   ............N...-..........................-.......-........  738
101       692   A.......C......N-C.........A.N..N......N..C-.....N.CC......N  749

Query_54  797   CAC-TTTATGATGCAGAAGGTGCGTT-GGTAGCACAAGGCCGTAAGAAAGTGGCAGAT-A  853
100       747   ...-......................-...............................-.  803
98        764   ...T...........N..........G....N.........N................A.  823
99        739   ...-...N..............                                        759
101       750   NN.-.G..............G.....-...GNGN...A.G.....N.N.TN..N...C-T  806

Query_54  854   AAGCTGAGGGTATTGCGAAAGAAACAAT-ATCACTGAA-GGTGAAGAAGCCTCGCCGCTG  911
100       804   ............................-.........-.....................  861
98        824   .........................N..N.........N..NN.................  883
101       807   .C.....C..A.C...C.......A...-.........-C.....C...N..........  864

Query_54  912   GAATCT-GGATGCACCTTATC-TGTACACGCTGAAGACAG-AGTTGCTTTGTG---ACGG  965
100       862   ......-..............T..................-............---....  916
98        884   ......G..............-...N.N............A............---....  939
101       865   .N....-C........N....-...N..N......NGANC-.........-..NNN..T.  920

Query_54  966   GAAACGGAT-AGA-TGGC-AG-TTCGACGAATG-TAGGTCT--CCGTACATTG-AAGTTT  1017
100       917   .........-...-....-..-...........-.......--..........-...-..  967
98        940   ....NN.G.G...T....-..NN.....T....T.......C-....CA....A......  997
101       921   A..CT....-...-....T.C-N.....N...N-..A...NTC...NG.N...-C.N...  975

Query_54  1018  GATGCCAAC-AAGGGAT-TTG-CC-TTGAA-CGG-AAAGTGGATGAAGGT--GAAAGGA-  1068
100       968   .........-.......-...-..-.....-...-....-N.N.......--.......-  1017
98        998   .....A...A......N-...C..-.....N...-N..NG...A......C-N......A  1053
101       976   ...N..NC.-.N..T..G...-.NG.....-...C.....-...N..T..NA...C.A.-  1030

Query_54  1069  -GT-ATGT-C-TGCATCATGA-TGC-AGGTGTGCTGGGTGCGGTAG-TTCCTCCTGAAGT  1121
100       1018  -..-....-.-..........T...-..N.-....-..N.......T.....T.......  1070
98        1054  GA.-...NC.-.....N....-...N..NN....C...                        1088
101       1031  -..NN...-.T...N.....                                          1048

Query_54  1122  ATGGGAGCGTCGTCT-GAGAAACCTGAAAG-AGATTGGTGTGAATGCCATCCGTATGAGC  1179
100       1071  ...............G..N..C........A.........NNNT.............-NN  1129

Query_54  1180  CATAATCCGCAGGCACCGGTA-TTGTATGATTTATGTG-ACCGAATGGGCTTCCTGGTGA  1237
100       1130  N..N........CAC.....NT................A.......--.NN....-NNN.  1186

Query_54  1238  TGGATGAAGCTTCGGATGAATGGGAATTCCCGAAACGGAAATGGATAAAGGGATGGAATG  1297
100       1187  ......-......-.N........N.N.-.N..N..C....                     1224

Query_54  1298  TCGGTGAACCAAGCTATGACGGAACATTTGATTTCTTTGAGGAATGGATTGAACGCGATG  1357
138       384                                                     .....T...A  375
135       388                                                     .....T...A  379
132       384                                                     .....T...A  375
45        1                                     ..A...C.C..G...GCA.....T...A  28
43        3                                        ...N.C..G...GCA.....T...A  27
41        18                                                      .....T...A  27

Query_54  1358  TGACGGATATGGTGCGTCGTGACCGGAATCACCCTTGTATATTCTTGTGGAGCATCGGTA  1417
138       374   ...TAA.....T...A..AGTT...C..CA.T......G.CG.AA.......T.......  315
135       378   ...TAA.....T...A..AGTT...C..CA.T......G.CG.AA.......T.......  319
132       374   ...TAA.....T...A..AGTT...C..CA.T......G.CG.AA.......T.......  315
45        29    ...TAA.....T...A..AGTT...C..CA.T......G.CG.AA.......T.......  88
43        28    ...TAA.....T...A..AGTT...C..CA.T......G.CG.AA.......T.......  87
41        28    ...TAA.....T...A..AGTT...C..CA.T......G.CG.AA.......T.......  87

Query_54  1418  ATGAGGTAGACTATCCGAACGATCCTTATTCTCACCCTATTTTGGATGGCACAACCATTA  1477
138       314   ....A..                                                       308
135       318   ....A..                                                       312
132       314   ....A..                                                       308
45        89    ....A..                                                       95
43        88    ....A..                                                       94
41        88    ....A..                                                       94

Query_54  1478  ATCAGCCTATGTTCGGTGGATACAAGCCTGAT-GCCCCGGATGCCA-TGCGTAT-CGGT-  1533
64        1159                                                 .......T....T  1147
60        1175                           ...N...T....G....TNN.A.NN.N..-..T.-  1143

Query_54  1534  -AAGATTGCGAA-GCGT-CTGGCTGCCTGTGT-TCGTGCGGTGGA-CACTTCACGTCCTG  1588
64        1146  A...........A.N..-......N.....N.-NGTNNG......A...NN-........  1090
60        1142  -..NN...N...A....T.N.....NN.....A..NNN....N..A.NN.NA......N.  1084
62        1117                                                  ..N...NN..N.  1106

Query_54  1589  TTACC-GGT--GCATTGGCCGGAGT-GG-T-GATGTCGAA--TCAGACAGAGTATCCTGA  1640
64        1089  N....C..N--.............NN..-.-.........--..................  1036
60        1083  .....C...--....G.--...N.N-..-NN...N.....--....N.............  1032
62        1105  ...N.-C.NNN.....N.NG.....-..GN-.......N.AT......N....N......  1049

Query_54  1641  AGCAGT-AGATG-T-AGTAGGATA-TAATT-ATACGGAAAA-CCGTTAT-GACG-A-AGA  1691
64        1035  ......-...N.-.T.........N.....-.........N-.......N....N.-...  981
60        1031  ......-....N-N-.........-..-..-..........-....-..-....-.-...  983
62        1048  ......TN....N.-.....N...-.....T..........A....A..-....-.T...  993
66        976                                                              .  976

Query_54  1692  T-CATGCTACTTATCC-TGAC-CGTGTGATTTAC--GGTAGTGCTACC-GGTGTGG-GAA  1744
64        980   .-.........-....-....-............--.......AA...-.......-...  929
60        982   .-..............-....-..N.........--.......AA...-.......-...  930
62        992   .T..............N....-...........NCG............C.......-...  935
66        975   .-.........C....-....G...A....G...--.N....CAG...-.NN.NN.C...  921

Query_54  1745  TTGAGGCTTGGCATGCAGTACGCGACAA-G-GAGTTTATTTTCGGACAGTTCCTCTGGAC  1802
64        928   ............................-.-.............................  871
60        929   ............................-.-.............................  872
62        934   ............................A.-.............................  876
66        920   NN...N..C.N........N..T.....-.T...A........A......AAN....T.N  862

Query_54  1803  GGGTACAGACTATTTGGGTGAATCAGGCAGATGGCCTT-CCAGAGGTTTGTATACTGGTT  1861
64        870   ......................................-.....................  812
60        871   ......................................-.....................  813
62        875   .................-....................T.....................  817
66        861   .A..G.......G..TNNN.......N......T.T..-........N...........N  803

Query_54  1862  TGCTGGACTTTGGCAGCTTCCCTAAACCC-CGTGGATACTTCCGTGCTTCGCTTTGGAGT  1920
64        811   -............................-..............................  754
60        812   ..........-..............-...-..............................  756
62        816   .............................-..............................  758
66        802   ...........................T.G......N.N...............A.....  743

Query_54  1921  GAAAAACC-TGTGACTTATGTTGGTACGTATCCTAAGCACGA-CTGGGTATCAATGGATG  1978
64        753   ........-.................................-.................  696
60        755   ........-.................................-.................  698
62        757   ........-.................................-.................  700
66        742   .......GG..........A.-..........N......N.NG.GN..............  684

Query_54  1979  CATGGGATTTGTGGAACTACGAACCGGGTCAGTTGATTCGGGTGGTTTGTTATACCAATG  2038
64        695   ............................................................  636
60        697   ............................................................  638
62        699   .......................T....................................  640
66        683   ................N.T-......NA....CAN...T.......N......NN.....  625

Query_54  2039  CACCGCAGGCTCGTTTGTTGCTGAACGGAAAAGAAGTGGGTCAGATGAAGCCTTACGATG  2098
64        635   ............................................................  576
60        637   ......G.....................................................  578
62        639   ............................................................  580
66        624   ..NG...CAN...NN..............................N...N..N..N....  565

Query_54  2099  ATAAGAGTGGTATCATTTATTGGGATATTCCTTATCAGGATGGAGAATTGCGTGCAGAAG  2158
64        575   ............................................................  516
60        577   ............................................................  518
62        579   ............................................................  520
66        564   .......................C................NC.....N.T...N......  505

Query_54  2159  GTTGTGATGCAACTGGAAAGGTGCTTTCATCTTATGCAATCAAGACCTCAGGACGTCCAT  2218
64        515   ............................................................  456
60        517   ............................................................  458
62        519   ............................................................  460
66        504   A..N...CA....C................NCC.N..................G....C.  445

Query_54  2219  ACGCCTTGCGGGCTACTGTGGATAAGGAAGTCTTGTCGCCGGATAAGGCTACTGCACATG  2278
64        455   ............................................................  396
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62        459   ............................................................  400
66        444   N.A..C.NN...AANNN.A.............CNC.A....N......N.NN.S.N....  385

Query_54  2279  TGACAATCGAAGTGGTGGATGAACAAGGTACTATCGTAAAATTAGGCGATAACGACGTAA  2338
64        395   ............................................................  336
60        397   ............................................................  338
62        399   ............................................................  340
66        384   NTC....G...CA..N......N......GAA..G..C...C....GA...N....C.TN  325

Query_54  2339  CTTGTCAGATTGAAGGTCCGGCACGCTTGTTGGGACTGGAAGGTTCAAATAACGGAGATA  2398
64        335   ............................................................  276
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Query_54  2399  TGAGTGATTATACAGATAATCACCACCGTGCTTTTCACGGACGTTTGCTGGCTTATATCC  2458
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Query_54  2519  CGGAAGTGGTATTGAAGGCTGAGTAACATTGGAAGTGGATAACGGATCCGAATTCGAGCT  2578
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Query_54  2579  CCGTCGA-CAAGCTT-GCGGCCG-CACT-CGAGcaccaccaccaccacca-cT-G-AGA-  2630
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Query_54  2631  T-CCGGCTGCTAACAAAG-CCC--G--AAAGGAAGC-TGAGTTGGC-TG-CTGCCACCGC  2681
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Query_54  2682  TGAGCAATAAC-TAG-CA-TAAC-C-CCTT-GGGGCCTCTAAACGGGTCTT--GAGG-GG  2732
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Query_55  99    TATAC-ATATG--CACCAT-CATCATCAT-CATTCTT-CT-GG-TGTAGAT-CTGTGGTC  149
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Query_55  150   TCAT-CC--G-CAGTTCG-AAAAGGGTA-CCGAGAA-CCTGTACTT-CCAAT-CCAATGC  200
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84        98    ....-..--.-.......-.........-.......-.........-.....-.......  148
17        98    ....-..--.-.......-.........-.......-.........-.....-......-  147
90        98    ....-..--.-.......-.........-.......-.........-.....-.......  148
82        99    ....-..--.-.......-.........-.......-.........-.....-.......  149
70        101   ....-..--.-.......-.........-.......-.........-.....-.......  151
59        93    ....-..--.-.......-.........-.......-.........-.....-.......  143
112       105   ....-..--.-.......-.........-.......-.........-.....-.......  155
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61        87    ....-..--.-.......-.........-.......-.........-.....-.......  137
78        97    ....-..--.-.......-.........-.......-.........-.....-.......  147
91        94    ....-..--.-.......-.........-.......-.........-.....-.......  144
114       117   ....-..--.-......T-N........-.......-.........-.....-.......  167
87        856   ....-..CGC-.......A.........C.......-.........C.....C.......  800
122       957   ....-..--.N.......A.........-.......-.........--.N..-.......  906
137       969   ..N.T..--.-.....N.-......N..-.......-..N......N.....N.....N.  916

Query_55  201   CCAAGTATCTTTTGGCGAAGCCAAAAAATTTAATGAGAATTGGTTGTTCAGTTTGTCGGA  260
100       151   ............................................................  210
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99        144   ............................................................  203
101       157   ...NA..........AC..-............N..G......N........NA..A....  215
117       647   ......                                                        642
85        812   .A..                                                          809
83        812   .G..                                                          809
110       154   .G..                                                          157
93        162   ....                                                          165
86        152   ....                                                          155
105       160   .                                                             160
9         155   .GT..A....                                                    164
96        160   .                                                             160
89        153   ....                                                          156
103       162   .                                                             162
84        149   ....                                                          152
17        148   ......C..                                                     156
90        149   ....                                                          152
82        150   ....                                                          153
70        152   ...                                                           154
59        144   ...                                                           146
112       156   .                                                             156
95        161   .                                                             161
94        163   .                                                             163
111       152   .A..                                                          155
102       160   .                                                             160
80        152   ..                                                            153
29        147   ......C..                                                     155
97        162   .                                                             162
104       163   .                                                             163
72        151   ...                                                           153
74        146   ...                                                           148
76        150   ..                                                            151
61        138   ...                                                           140
78        148   ..                                                            149
91        145   ....                                                          148
114       168   ...                                                           170
87        799   .                                                             799
122       905   .                                                             905
137       915   ......N..                                                     907

Query_55  261   CGATAGTCTGAGCACTTCCGTATCGTATGACGATAGTAAGTGGCGAAAACTTGATTTGCC  320
100       211   ............................................................  270
98        224   ............................................................  283
99        204   ............................................................  263
101       216   .TGG..NA.....C...........C........C-.......N................  274

Query_55  321   GCACGACTGGTCGGTAGAAGGACAGCTTTCTCCTTCCCTGGCAAGCTGTACCGGTTATTT  380
100       271   ............................................................  330
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99        264   ............................................................  323
101       275   ..........N...N.C..N.....T..........A...NACC......A.........  334

Query_55  381   GCCgggggggATAGGCTGGTATCGGAAACATTTTCAGGTTACCGATAAGGCTGCGCGCCA  440
100       331   ............................................................  390
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101       335   .....CC............N...N.....N.....NN.........NT......N....T  394

Query_55  441   CTACATCTATTTTGAGGGAGCATATAACCGCAGCGAGGTTTATTTGAACGGTCACTTGCT  500
100       391   ............................................................  450
98        404   ............................................................  463
99        384   ............................................................  443
101       395   G...N................G...G...T.CTG......A..A......AC.TG.....  454

Query_55  501   CGGTAAACGTCCGAACGGATACATATCTTTTATGTATGACATGACTCCCTACCTGAAGGA  560
100       451   ............................................................  510
98        464   ............................................................  523
99        444   ............................................................  503
101       455   ..TG....T.A...TG......G.................N..........G....N...  514

Query_55  561   AGGAAATAACGTGCTGGCAGTCCGTATTGACCATAGCCGTTATGCCGATTCACGCTGGTA  620
100       511   ............................................................  570
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99        504   ............................................................  563
101       515   .A......C.NG.A...NG.N..............C..............AT.A......  574

Query_55  621   CACCGGTTCCGGAATTTACCGGGATGTGTGGATGATTTCCGCCCCGGATATTCATTTTGC  680
100       571   ............................................................  630
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99        564   ............................................................  623
101       575   .....N..............T.....A..............A.A................  634

Query_55  681   TCAATGGGG-AATAGGCTGGCACGCTAC-TTCGCTGACCGATAAGCAGGCGGTAGTGGCA  738
100       631   .........-..................-...............................  688
98        644   .........A..................T...N...........................  703
99        624   .........-..................T.............................-.  681
101       635   .........-...T......-GT.....-.........TT....N....TNNN.A..AAG  691

Query_55  739   GTTGATATGGAAGTCG-AAAAACATGTGAAGGCTGCTGGTGCA-TTGGAGGTTTCTGCGG  796
100       689   ................-..........................-................  746
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99        682   ............N...-..........................-.......-........  738
101       692   A.......C......N-C.........A.N..N......N..C-.....N.CC......N  749

Query_55  797   CAC-TTTATGATGCAGAAGGTGCGTT-GGTAGCACAAGGCCGTAAGAAAGTGGCAGAT-A  853
100       747   ...-......................-...............................-.  803
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99        739   ...-...N..............                                        759
101       750   NN.-.G..............G.....-...GNGN...A.G.....N.N.TN..N...C-T  806

Query_55  854   AAGCTGAGGGTATTGCGAAAGAAACAAT-ATCACTGAA-GGTGAAGAAGCCTCGCCGCTG  911
100       804   ............................-.........-.....................  861
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101       807   .C.....C..A.C...C.......A...-.........-C.....C...N..........  864

Query_55  912   GAATCT-GGATGCACCTTATC-TGTACACGCTGAAGACAG-AGTTGCTTTGTG---ACGG  965
100       862   ......-..............T..................-............---....  916
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101       865   .N....-C........N....-...N..N......NGANC-.........-..NNN..T.  920

Query_55  966   GAAACGGAT-AGA-TGGC-AG-TTCGACGAATG-TAGGTCT--CCGTACATTG-AAGTTT  1017
100       917   .........-...-....-..-...........-.......--..........-...-..  967
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101       921   A..CT....-...-....T.C-N.....N...N-..A...NTC...NG.N...-C.N...  975

Query_55  1018  GATGCCAAC-AAGGGAT-TTG-CC-TTGAA-CGG-AAAGTGGATGAAGGT--GAAAGGA-  1068
100       968   .........-.......-...-..-.....-...-....-N.N.......--.......-  1017
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101       976   ...N..NC.-.N..T..G...-.NG.....-...C.....-...N..T..NA...C.A.-  1030

Query_55  1069  -GT-ATGT-C-TGCATCATGA-TGC-AGGTGTGCTGGGTGCGGTAG-TTCCTCCTGAAGT  1121
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Query_55  1122  ATGGGAGCGTCGTCT-GAGAAACCTGAAAG-AGATTGGTGTGAATGCCATCCGTATGAGC  1179
100       1071  ...............G..N..C........A.........NNNT.............-NN  1129

Query_55  1180  CATAATCCGCAGGCACCGGTA-TTGTATGATTTATGTG-ACCGAATGGGCTTCCTGGTGA  1237
100       1130  N..N........CAC.....NT................A.......--.NN....-NNN.  1186

Query_55  1238  TGGATGAAGCTTCGGATGAATGGGAATTCCCGAAACGGAAATGGATAAAGGGATGGAATG  1297
100       1187  ......-......-.N........N.N.-.N..N..C....                     1224

Query_55  1298  TCGGTGAACCAAGCTATGACGGAACATTTGATTTCTTTGAGGAATGGATTGAACGCGATG  1357

Query_55  1358  TGACGGATATGGTGCGTCGTGACCGGAATCACCCTTGTATATTCTTGTGGAGCATCGGTA  1417

Query_55  1418  ATCAGGTAGACTATCCGAACGATCCTTATTCTCACCCTATTTTGGATGGCACAACCATTA  1477

Query_55  1478  ATCAGCCTATGTTCGGTGGATACAAGCCTGAT-GCCCCGGATGCCA-TGCGTAT-CGGT-  1533
64        1159                                                 .......T....T  1147
60        1175                           ...N...T....G....TNN.A.NN.N..-..T.-  1143

Query_55  1534  -AAGATTGCGAA-GCGT-CTGGCTGCCTGTGT-TCGTGCGGTGGA-CACTTCACGTCCTG  1588
64        1146  A...........A.N..-......N.....N.-NGTNNG......A...NN-........  1090
60        1142  -..NN...N...A....T.N.....NN.....A..NNN....N..A.NN.NA......N.  1084
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Query_55  1589  TTACC-GGT--GCATTGGCCGGAGT-GG-T-GATGTCGAA--TCAGACAGAGTATCCTGA  1640
64        1089  N....C..N--.............NN..-.-.........--..................  1036
60        1083  .....C...--....G.--...N.N-..-NN...N.....--....N.............  1032
62        1105  ...N.-C.NNN.....N.NG.....-..GN-.......N.AT......N....N......  1049

Query_55  1641  AGCAGT-AGATG-T-AGTAGGATA-TAATT-ATACGGAAAA-CCGTTAT-GACG-A-AGA  1691
64        1035  ......-...N.-.T.........N.....-.........N-.......N....N.-...  981
60        1031  ......-....N-N-.........-..-..-..........-....-..-....-.-...  983
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66        976                                                              .  976

Query_55  1692  T-CATGCTACTTATCC-TGAC-CGTGTGATTTAC--GGTAGTGAAACC-GGTGTGG-GAA  1744
64        980   .-.........-....-....-............--............-.......-...  929
60        982   .-..............-....-..N.........--............-.......-...  930
62        992   .T..............N....-...........NCG.......CT...C.......-...  935
66        975   .-.........C....-....G...A....G...--.N....C.G...-.NN.NN.C...  921

Query_55  1745  TTGAGGCTTGGCATGCAGTACGCGACAA-G-GAGTTTATTTTCGGACAGTTCCTCTGGAC  1802
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66        920   NN...N..C.N........N..T.....-.T...A........A......AAN....T.N  862

Query_55  1803  GGGTACAGACTATTTGGGTGAATCAGGCAGATGGCCTT-CCAGAGGTTTGTATACTGGTT  1861
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Query_55  1862  TGCTGGACTTTGGCAGCTTCCCTAAACCC-CGTGGATACTTCCGTGCTTCGCTTTGGAGT  1920
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Query_55  1921  GAAAAACC-TGTGACTTATGTTGGTACGTATCCTAAGCACGA-CTGGGTATCAATGGATG  1978
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Query_55  1979  CATGGGATTTGTGGAACTACGAACCGGGTCAGTTGATTCGGGTGGTTTGTTATACCAATG  2038
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Query_55  2039  CACCGCAGGCTCGTTTGTTGCTGAACGGAAAAGAAGTGGGTCAGATGAAGCCTTACGATG  2098
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Query_55  2099  ATAAGAGTGGTATCATTTATTGGGATATTCCTTATCAGGATGGAGAATTGCGTGCAGAAG  2158
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Query_55  2159  GTTGTGATGCAACTGGAAAGGTGCTTTCATCTTATGCAATCAAGACCTCAGGACGTCCAT  2218
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Query_55  2219  ACGCCTTGCGGGCTACTGTGGATAAGGAAGTCTTGTCGCCGGATAAGGCTACTGCACATG  2278
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Query_55  2279  TGACAATCGAAGTGGTGGATGAACAAGGTACTATCGTAAAATTAGGCGATAACGACGTAA  2338
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Query_55  2339  CTTGTCAGATTGAAGGTCCGGCACGCTTGTTGGGACTGGAAGGTTCAAATAACGGAGATA  2398
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Query_55  2399  TGAGTGATTATACAGATAATCACCACCGTGCTTTTCACGGACGTTTGCTGGCTTATATCC  2458
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Query_55  2459  AGACTACAGGTGAGAAAGGTGAGATTCGTGTGAAACTGACTTCTCCTCTTTTGAAAGGAA  2518
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Query_55  2519  CGGAAGTGGTATTGAAGGCTGAGTAACATTGGAAGTGGATAACGGATCCGAATTCGAGCT  2578
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Query_55  2579  CCGTCGA-CAAGCTT-GCGGCCG-CACT-CGAGcaccaccaccaccacca-cT-G-AGA-  2630
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Query_55  2631  T-CCGGCTGCTAACAAAG-CCC--G--AAAGGAAGC-TGAGTTGGC-TG-CTGCCACCGC  2681
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Query_55  2682  TGAGCAATAAC-TAG-CA-TAAC-C-CCTT-GGGGCCTCTAAACGGGTCTT--GAGG-GG  2732
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Query_55  2733  --TTTTTTGCTGAAA  2745
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Effective search space used: 417318811


Query= CMR200125.108

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Query_56  1     TCTCG-ATCCCGCGAAATTAATAC-GACTC-ACTATAGGGG--AATT-GTGAG-CGGA-T  52
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Query_56  99    TATAC-ATATG--CACCAT-CATCATCAT-CATTCTT-CT-GG-TGTAGAT-CTGTGGTC  149
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Query_56  150   TCAT-CC--G-CAGTTCG-AAAAGGGTA-CCGAGAA-CCTGTACTT-CCAAT-CCAATGC  200
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Query_56  201   CCAAGTATCTTTTGGCGAAGCCAAAAAATTTAATGAGAATTGGTTGTTCAGTTTGTCGGA  260
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105       160   .                                                             160
9         155   .GT..A....                                                    164
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17        148   ......C..                                                     156
90        149   ....                                                          152
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95        161   .                                                             161
94        163   .                                                             163
111       152   .A..                                                          155
102       160   .                                                             160
80        152   ..                                                            153
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97        162   .                                                             162
104       163   .                                                             163
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Query_56  261   CGATAGTCTGAGCACTTCCGTATCGTATGACGATAGTAAGTGGCGAAAACTTGATTTGCC  320
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Query_56  321   GCACGACTGGTCGGTAGAAGGACAGCTTTCTCCTTCCCTGGCAAGCTGTACCGGTTATTT  380
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Query_56  381   GCCgggggggATAGGCTGGTATCGGAAACATTTTCAGGTTACCGATAAGGCTGCGCGCCA  440
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Query_56  441   CTACATCTATTTTGAGGGAGCATATAACCGCAGCGAGGTTTATTTGAACGGTCACTTGCT  500
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Query_56  501   CGGTAAACGTCCGAACGGATACATATCTTTTATGTATGACATGACTCCCTACCTGAAGGA  560
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Query_56  561   AGGAAATAACGTGCTGGCAGTCCGTATTGACCATAGCCGTTATGCCGATTCACGCTGGTA  620
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Query_56  621   CACCGGTTCCGGAATTTACCGGGATGTGTGGATGATTTCCGCCCCGGATATTCATTTTGC  680
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Query_56  681   TCAATGGGG-AATAGGCTGGCACGCTAC-TTCGCTGACCGATAAGCAGGCGGTAGTGGCA  738
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Query_56  739   GTTGATATGGAAGTCG-AAAAACATGTGAAGGCTGCTGGTGCA-TTGGAGGTTTCTGCGG  796
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Query_56  797   CAC-TTTATGATGCAGAAGGTGCGTT-GGTAGCACAAGGCCGTAAGAAAGTGGCAGAT-A  853
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Query_56  854   AAGCTGAGGGTATTGCGAAAGAAACAAT-ATCACTGAA-GGTGAAGAAGCCTCGCCGCTG  911
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Query_56  912   GAATCT-GGATGCACCTTATC-TGTACACGCTGAAGACAG-AGTTGCTTTGTG---ACGG  965
100       862   ......-..............T..................-............---....  916
98        884   ......G..............-...N.N............A............---....  939
101       865   .N....-C........N....-...N..N......NGANC-.........-..NNN..T.  920

Query_56  966   GAAACGGAT-AGA-TGGC-AG-TTCGACGAATG-TAGGTCT--CCGTACATTG-AAGTTT  1017
100       917   .........-...-....-..-...........-.......--..........-...-..  967
98        940   ....NN.G.G...T....-..NN.....T....T.......C-....CA....A......  997
101       921   A..CT....-...-....T.C-N.....N...N-..A...NTC...NG.N...-C.N...  975

Query_56  1018  GATGCCAAC-AAGGGAT-TTG-CC-TTGAA-CGG-AAAGTGGATGAAGGT--GAAAGGA-  1068
100       968   .........-.......-...-..-.....-...-....-N.N.......--.......-  1017
98        998   .....A...A......N-...C..-.....N...-N..NG...A......C-N......A  1053
101       976   ...N..NC.-.N..T..G...-.NG.....-...C.....-...N..T..NA...C.A.-  1030

Query_56  1069  -GT-ATGT-C-TGCATCATGA-TGC-AGGTGTGCTGGGTGCGGTAG-TTCCTCCTGAAGT  1121
100       1018  -..-....-.-..........T...-..N.-....-..N.......T.....T.......  1070
98        1054  GA.-...NC.-.....N....-...N..NN....C...                        1088
101       1031  -..NN...-.T...N.....                                          1048

Query_56  1122  ATGGGAGCGTCGTCT-GAGAAACCTGAAAG-AGATTGGTGTGAATGCCATCCGTATGAGC  1179
100       1071  ...............G..N..C........A.........NNNT.............-NN  1129

Query_56  1180  CATAATCCGCAGGCACCGGTA-TTGTATGATTTATGTG-ACCGAATGGGCTTCCTGGTGA  1237
100       1130  N..N........CAC.....NT................A.......--.NN....-NNN.  1186

Query_56  1238  TGGATGAAGCTTCGGATGAATGGGAATTCCCGAAACGGAAATGGATAAAGGGATGGAATG  1297
100       1187  ......-......-.N........N.N.-.N..N..C....                     1224

Query_56  1298  TCGGTGAACCAAGCTATGACGGAACATTTGATTTCTTTGAGGAATGGATTGAACGCGATG  1357
138       384                                                     .....T...A  375
135       388                                                     .....T...A  379
132       384                                                     .....T...A  375
45        1                                     ..A...C.C..G...GCA.....T...A  28
43        3                                        ...N.C..G...GCA.....T...A  27
41        18                                                      .....T...A  27

Query_56  1358  TGACGGATATGGTGCGTCGTGACCGGAATCACCCTTGTATATTCTTGTGGAGCATCGGTA  1417
138       374   ...TAA.....T...A..AGTT...C..CA.T......G.CG.AA.......T.......  315
135       378   ...TAA.....T...A..AGTT...C..CA.T......G.CG.AA.......T.......  319
132       374   ...TAA.....T...A..AGTT...C..CA.T......G.CG.AA.......T.......  315
45        29    ...TAA.....T...A..AGTT...C..CA.T......G.CG.AA.......T.......  88
43        28    ...TAA.....T...A..AGTT...C..CA.T......G.CG.AA.......T.......  87
41        28    ...TAA.....T...A..AGTT...C..CA.T......G.CG.AA.......T.......  87

Query_56  1418  ATGAGGTAGACTATCCGAACGATCCTTATTCTCACCCTATTTTGGATGGCACAACCATTA  1477
138       314   ....A..                                                       308
135       318   ....A..                                                       312
132       314   ....A..                                                       308
45        89    ....A..                                                       95
43        88    ....A..                                                       94
41        88    ....A..                                                       94

Query_56  1478  ATCAGCCTATGTTCGGTGGATACAAGCCTGAT-GCCCCGGATGCCA-TGCGTAT-CGGT-  1533
64        1159                                                 .......T....T  1147
60        1175                           ...N...T....G....TNN.A.NN.N..-..T.-  1143

Query_56  1534  -AAGATTGCGAA-GCGT-CTGGCTGCCTGTGT-TCGTGCGGTGGA-CACTTCACGTCCTG  1588
64        1146  A...........A.N..-......N.....N.-NGTNNG......A...NN-........  1090
60        1142  -..NN...N...A....T.N.....NN.....A..NNN....N..A.NN.NA......N.  1084
62        1117                                                  ..N...NN..N.  1106

Query_56  1589  TTACC-GGT--GCATTGGCCGGAGT-GG-T-GATGTCGAA--TCAGACAGAGTATCCTGA  1640
64        1089  N....C..N--.............NN..-.-.........--..................  1036
60        1083  .....C...--....G.--...N.N-..-NN...N.....--....N.............  1032
62        1105  ...N.-C.NNN.....N.NG.....-..GN-.......N.AT......N....N......  1049

Query_56  1641  AGCAGT-AGATG-T-AGTAGGATA-TAATT-ATACGGAAAA-CCGTTAT-GACG-A-AGA  1691
64        1035  ......-...N.-.T.........N.....-.........N-.......N....N.-...  981
60        1031  ......-....N-N-.........-..-..-..........-....-..-....-.-...  983
62        1048  ......TN....N.-.....N...-.....T..........A....A..-....-.T...  993
66        976                                                              .  976

Query_56  1692  T-CATGCTACTTATCC-TGAC-CGTGTGATTTAC--GGTAGTCAGACC-GGTGTGG-GAA  1744
64        980   .-.........-....-....-............--......G.A...-.......-...  929
60        982   .-..............-....-..N.........--......G.A...-.......-...  930
62        992   .T..............N....-...........NCG......GCT...C.......-...  935
66        975   .-.........C....-....G...A....G...--.N..........-.NN.NN.C...  921

Query_56  1745  TTGAGGCTTGGCATGCAGTACGCGACAA-G-GAGTTTATTTTCGGACAGTTCCTCTGGAC  1802
64        928   ............................-.-.............................  871
60        929   ............................-.-.............................  872
62        934   ............................A.-.............................  876
66        920   NN...N..C.N........N..T.....-.T...A........A......AAN....T.N  862

Query_56  1803  GGGTACAGACTATTTGGGTGAATCAGGCAGATGGCCTT-CCAGAGGTTTGTATACTGGTT  1861
64        870   ......................................-.....................  812
60        871   ......................................-.....................  813
62        875   .................-....................T.....................  817
66        861   .A..G.......G..TNNN.......N......T.T..-........N...........N  803

Query_56  1862  TGCTGGACTTTGGCAGCTTCCCTAAACCC-CGTGGATACTTCCGTGCTTCGCTTTGGAGT  1920
64        811   -............................-..............................  754
60        812   ..........-..............-...-..............................  756
62        816   .............................-..............................  758
66        802   ...........................T.G......N.N...............A.....  743

Query_56  1921  GAAAAACC-TGTGACTTATGTTGGTACGTATCCTAAGCACGA-CTGGGTATCAATGGATG  1978
64        753   ........-.................................-.................  696
60        755   ........-.................................-.................  698
62        757   ........-.................................-.................  700
66        742   .......GG..........A.-..........N......N.NG.GN..............  684

Query_56  1979  CATGGGATTTGTGGAACTACGAACCGGGTCAGTTGATTCGGGTGGTTTGTTATACCAATG  2038
64        695   ............................................................  636
60        697   ............................................................  638
62        699   .......................T....................................  640
66        683   ................N.T-......NA....CAN...T.......N......NN.....  625

Query_56  2039  CACCGCAGGCTCGTTTGTTGCTGAACGGAAAAGAAGTGGGTCAGATGAAGCCTTACGATG  2098
64        635   ............................................................  576
60        637   ......G.....................................................  578
62        639   ............................................................  580
66        624   ..NG...CAN...NN..............................N...N..N..N....  565

Query_56  2099  ATAAGAGTGGTATCATTTATTGGGATATTCCTTATCAGGATGGAGAATTGCGTGCAGAAG  2158
64        575   ............................................................  516
60        577   ............................................................  518
62        579   ............................................................  520
66        564   .......................C................NC.....N.T...N......  505

Query_56  2159  GTTGTGATGCAACTGGAAAGGTGCTTTCATCTTATGCAATCAAGACCTCAGGACGTCCAT  2218
64        515   ............................................................  456
60        517   ............................................................  458
62        519   ............................................................  460
66        504   A..N...CA....C................NCC.N..................G....C.  445

Query_56  2219  ACGCCTTGCGGGCTACTGTGGATAAGGAAGTCTTGTCGCCGGATAAGGCTACTGCACATG  2278
64        455   ............................................................  396
60        457   ............................................................  398
62        459   ............................................................  400
66        444   N.A..C.NN...AANNN.A.............CNC.A....N......N.NN.S.N....  385

Query_56  2279  TGACAATCGAAGTGGTGGATGAACAAGGTACTATCGTAAAATTAGGCGATAACGACGTAA  2338
64        395   ............................................................  336
60        397   ............................................................  338
62        399   ............................................................  340
66        384   NTC....G...CA..N......N......GAA..G..C...C....GA...N....C.TN  325

Query_56  2339  CTTGTCAGATTGAAGGTCCGGCACGCTTGTTGGGACTGGAAGGTTCAAATAACGGAGATA  2398
64        335   ............................................................  276
60        337   ............................................................  278
62        339   ............................................................  280
66        324   ..C....T..N......AA...............CA........................  265

Query_56  2399  TGAGTGATTATACAGATAATCACCACCGTGCTTTTCACGGACGTTTGCTGGCTTATATCC  2458
64        275   ............................................................  216
60        277   ............................................................  218
62        279   ............................................................  220
66        264   N.......................-....-.......A.......NC.............  207

Query_56  2459  AGACTACAGGTGAGAAAGGTGAGATTCGTGTGAAACTGACTTCTCCTCTTTTGAAAGGAA  2518
64        215   ............................................................  156
60        217   ............................................................  158
62        219   ............................................................  160
66        206   ..-T....................CANC.........-..........-.GA........  150

Query_56  2519  CGGAAGTGGTATTGAAGGCTGAGTAACATTGGAAGTGGATAACGGATCCGAATTCGAGCT  2578
64        155   ............................................................  96
60        157   ............................................................  98
62        159   ............................................................  100
66        149   .......A...-CC....AG......................T.....N....A....TC  91
85        130                          .....................................  94
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110       840                          .....................................  876
39        812                      ...A.....................................  852
27        840                         ......................................  877
23        841                         ...........................N.....C....  878
112       837                          ............................N.-......  872
111       841                          ................................N....  877
40        131                          .....................................  95
26        133                          .....................................  97
115       135                          .....................................  99
49        132                          .....................................  96
116       129                         ......................................  92
30        137                   .....-......................................  95
56        133                          .....................................  97
44        132                          .....................................  96
42        131                          .....................................  95
38        131                          .....................................  95
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14        133                          .....................................  97
34        141                   .....-......................................  99
0         132                          .....................................  96
46        134                          .....................................  98
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8         141                   ......A.....................................  98
3         133                          .....................................  97
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24        133                          .....................................  97
5         133                          .....................................  97
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68        139               ..C...A..-......................................  93
22        132                          .....................................  96
71        137               ..C...A..-......................................  91
47        137                          .....................................  101
87        118                          .....................................  82
69        138               ..C...A..-......................................  92
51        118                          .....................................  82
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54        120                          .....................................  84
79        66                        ..A....................--.....            39
75        68                        ..A....................--.....            41
81        66                        ..A....................--.....            39
77        66                        ..A....................--.....            39
15        62                          .....................--.....            37
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Query_56  2631  T-CCGGCTGCTAACAAAG-CCC--G--AAAGGAAGC-TGAGTTGGC-TG-CTGCCACCGC  2681
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Query_56  2682  TGAGCAATAAC-TAG-CA-TAAC-C-CCTT-GGGGCCTCTAAACGGGTCTT--GAGG-GG  2732
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Query_56  2733  --TTTTTTGCTGAAA  2745
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Query_57  1     TCTCG-ATCCCGCGAAATTAATAC-GACTC-ACTATAGGGG--AATT-GTGAG-CGGA-T  52
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82        150   .                                                             150
111       152   ..                                                            153
59        144   .                                                             144
29        148   ..                                                            149
100       151   .                                                             151
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101       157   .                                                             157
137       915   .                                                             915

Query_57  261   CGTGATGAAGGCAGCTGCCCAGTGGGAGAGTA-AATGGACAGAGGTGACCATCCCTCATA  319
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Query_57  320   CCTGGAATGCGCAGGATATGCAGGTGAAGACAAACTCTTTTTATGAGGGAGCGGCTTATT  379
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Query_57  380   ATCGTAAGACTTATGTGATTCCCGAGACCATGAAGGGGAAGCGTTTGTTCTTGCGCTTTG  439
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Query_57  440   AAGGTGTGGGGACTTGTACGGAAGTGTATGTCAACGGTTATCTGGTGGGTACACACAAGG  499
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Query_57  500   GAGGATATTCCGCCTTTGTCTGTGAGATTGGTGAGC-AGGT-AAAATATGGGGAGAGCAA  557
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Query_57  558   TGAGATTGTAGTGAAGGCTGACAATACAGCTCGTCCGGATGTCATTCCGGTGAACCATAG  617
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Query_57  618   CCTTTTTGGAGTATACGGAGGTATCTATCGCCCGGTGTCGTTGGTAGTGACAGAGCCTTG  677
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Query_57  678   TCATATTGCGGTGGAAGATTATGCTTCTCCAGGGGTCTATATTACCCAGAAAAATGTGTC  737
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Query_57  738   GAAA-AGTGCAGCGGA--AG-TAAATGTGAAGGTGAAACTGGACAACGC-TTCCTT-GCA  791
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Query_57  792   ACCGGAAACACTGGAACTGGAGAATGCAATCTATGATGCG-GAAGGCAAACTGGTGAAGA  850
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Query_57  851   AGCATGTACGCAG--TTTGGAACTGACT-CCGCAA-GGAA-TGCAGTCG-TATACGGC-T  903
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Query_57  904   T--CT--TTCCAA-TT--AAAACG---TCCGCA-TT-T-GTGGCAGGGACGGAAAGAT-C  949
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Query_57  950   C-TT--A-TTTATATAAGGTAGT-ATCC-CGTCTGAAGCAGGAGGGACGGGTGA-TTGAT  1002
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Query_57  1003  GAAGTGGTACAGCC-GTTGGGT-A-TC-CGTAAATA-TGAA-ATTGTGGCCGGG-AAAGG  1055
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Query_57  1056  -C-TT-C-TTCCTGAATGG-AGAGAAA-TA-T-CCTAT-GT-A-T-GGAGTAAC-T-CG-  1100
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Query_57  1101  CCA-T-CAGG-A-C-T-G---GTGGGGAAAA-GGTAG-T-GC-GTTGACAAA-TC-AGGA  1145
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Query_57  1146  ACA--T-GACGC-GGATTTAGC-CAT-G-A-TTAT-GGA-TA-TTGG-AGC-TACTACC-  1191
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Query_57  1192  -ATT-CGCCTGGC-AC-ATTATCAGCAGGCAGA--G-TATAT-GTATGCTAAATGCG---  1240
102       1163  -...C.N....NN-N.-...........NNN..NNN-..N..-........           1208
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Query_57  1241  ATAGTCTGGGACTGATA-GTCTGGGCTGAGATTCCTTTTGTAAATCGGGTGAC-GGGG--  1296
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Query_57  1297  CA--GGAA-TGGGA--TAA--T-GCCCATC-AG-C-AG-AT-GA-GA-G-AATTGGTT-C  1339
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Query_57  1340  GACAGAATTTTAA--TCA-C-CCTT-CCATTTA-TATT-TGGGG-AA--TTCA-TAA-TG  1387
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Query_57  1388  CTG-TGTAT-CAT-CCGCA-TGGTTAC-AC-AGCTGCA-TTGA-CCCGTTC--GTTGCA-  1436
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Query_57  1437  TGATGTATGTAAGAC--GGATG-ATCCGGA-CCGTTAT-ACGGCTGCTGT-AAACGGGT-  1489
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Query_57  1490  ATGGAC-A-TGCTGAACATCC-GG-TGAA-CCA-G-AATGCAGACGTTCAAGGG-A-TGA  1540
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Query_57  1541  ACCGCTACTTT-GGCTGGTATGA-AA-GGAAGATACAGGATATCAAACCTTGGGTGGAA-  1596
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Query_57  1597  GGTT-TGGaaaaaa-a-TT-ACCCCTGG-CAGAAACTGATGTTGACAGAGTATGGGGCGG  1651
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Query_57  1652  ATGCG-AACTTGGAGCATCAGACTGAA-TATCTGGGAGATGCCTTGAA-TTGGGGAAAA-  1707
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Query_57  1708  CCTTTTTATCCTGAGACTTTCCAGACAAAA-GTACATGAGTATCAGTGGAGCGTGATTGC  1766
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Query_57  1767  TGAACACCCTTACATTATTGCTTCTTACTTGTGGAATATGTTTGATTTTGCTGTGCCTAT  1826
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Query_57  1827  GTGGGAGCGTGGAGGAGTTCCTGCACGTAACTTGAAGGGAATGGTAACTTTCGACCGTAA  1886
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Query_57  1887  GATTAAGAAGGATTCCTATTATTGGTATAAAGCTAACTGGAGTAAGGAACCTGTACTTTA  1946
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6         201                                                   ............  190

Query_57  1947  TCTGACACAGCGTCGTAATGTGGACAGAGAAAGAAAAGAAACTTCGGTAACCGTGTATTC  2006
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Query_57  2007  TAATATCGGAACTCCGGTGGTATATCTGAA---CGGGAAACCTTTGGAAGGTATCCGTAA  2063
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Query_57  2064  AGGATATACAGAGGTGCACTATGTATTTGATAAAGTGACGCTGGTTCAGGGAAAGAATAT  2123
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Query_57  2124  ATTGAAGGCTGTAGTCAGCTATCAGGGAAAAGAGTACGTAGATGAGATAGAATGGAACTA  2183
68        250   ............................................................  191
73        251   ............................................................  192
71        248   ............................................................  189
69        249   ............................................................  190
30        252   .C.T.GA.....TA..GTG.C.G.T..T..G..A..TACC.....A..T.TG........  193
34        256   .C.T.GA.....TA..GTG.C.G.T..T..G..A..TACC.....A..T.TG........  197
31        255   .C.T.GA.....TA..GTG.C.G.T..T..G..A..TACC.....A..T.TG........  196
15        182   TC....A..ATCCC.TCT.C....A........A..TAC...C..A...........T..  123
18        186   TC....A..ATCCC.TCT.C....A........A..TAC...C..A...........T..  127
20        186   TC....A..ATCCC.TCT.C....A........A..TAC...C..A...........T..  127

Query_57  2184  TACTGGTGAAAAGAATAGGGGGACTGTCG-TGC--ATGAGAATAAGAAGGAGCATGCAGG  2240
68        190   .............................-...--.........................  134
73        191   .............................-...--.........................  135
71        188   .............................-...--.........................  132
69        189   .............................-...--.........................  133
30        192   C.AC....---..C..GTCC..CAG.C..A...TT.C..AC.......A..A.....C..  136
34        196   C.AC....---..C..GTCC..CAG.C..A...TT.C..AC.......A..A...N.C..  140
31        195   C.AC....---..C..GTCC..CAG.C..A...TT.C..AC.......A..A.....C..  139
15        122   ..AC..A..GTGC..CC...AAG...ATT-.C.--TG...C.......A.......GTA.  66
18        126   ..AC..A..GTGC..CC...AAG...ATT-.C.--TG...C.......A.......GTA.  70
20        126   ..AC..A..GTGC..CC...AAG...ATT-.C.--TG...C.......A.......GTA.  70
64        143                                                         ..A...  138
60        145                                                         ..A...  140
62        147                                                         ..A...  142
66        146                                              ...T..T.C..A.G...  130

Query_57  2241  ATG-GTAACATTGGAAGTGGATAACGGATCCGAATTCGAGCTCCGTCGA-CAAGCTT-GC  2297
68        133   ...-.............................................-.......-..  77
73        134   ...-.............................................-.......-..  78
71        131   ...-.............................................-......N-..  75
69        132   ...-.............................................-....NN.-..  76
30        135   C..-.............................................-.......-..  79
34        139   C..-.............................................-.......-..  83
31        138   C..-.............................................-.......-..  82
15        65    T..-.....................--.....                              37
18        69    T..-.....................--.....                              41
20        69    T..-.....................--.....                              41
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23        841       ...........................N.....C...........-.......-..  894
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64        137   C..A.............................................-.......-..  80
60        139   C..A.............................................-.......-..  82
116       129       .............................................-.......-..  76
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0         132        ............................................-.......-..  80
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62        141   C..A.............................................-.......-..  84
3         133        ............................................-.......-NN  81
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8         134        ............................................-......N-.N  82
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87        118        ............................................-.......-A.  66
51        118        ............................................-..N.N..-NA  66
58        115        ............................................-...N...-..  63
54        120        ............................................-......A-A.  68
66        129   .---....................T.....N....A....TC.T..G.N-.C.A.CG-A.  75
79        63         ....................--.....                              39
75        65         ....................--.....                              41
81        63         ....................--.....                              39
77        63         ....................--.....                              39

Query_57  2298  GGCCG-CACT-CGAGcaccaccaccaccacca-cT-G-AGA-T-CCGGCTGCTAACAAAG  2350
68        76    .....-....-....---..............-..-.-...-.-................  27
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18        45                                            .-.-................  28
20        45                                            .-.-................  28
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23        895   .....-....-...N........-........-..-.-...-.-..........T.....  946
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26        80    .....-....-.....................-..-.-...-.-................  28
115       82    .....-....-.....................-..-.-...-.-................  30
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14        80    .....-....-.....................-..-.-...-.-................  28
0         79    N....-....-.....................-..-.-...-.-................  27
46        81    .....-....-.....................-..-.-...-.-................  29
28        80    .....-....-.....................-..-.-...-.-................  28
12        83    .....-....-.....................-..-.-...-.-................  31
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3         80    .....-....-.....................-..-.-...-.-................  28
88        65    .....-....-.....................-..-.-...-.-..........T.....  13
24        80    .....-....-.....................-..-.-...-.-........N.......  28
5         80    .....-....-.....................-..-.-...-.-................  28
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87        65    .....-....-.....................-..-.-...-.-............-...  14
51        65    .....-....-.....................-..-.-...-.C................  12
58        62    .....-....-....---..............-..-.-...-.-................  13
54        67    ..N..-....-.....................T..-.-...-.C................  13
66        74    .CAA.-....-.........T.....N.....-N.-N-...-.-................  22
79        43                                            .-.-................  26
75        45                                            .-.-................  28
81        43                                            .-.-................  26
77        43                                            .-.-................  26

Query_57  2351  -CCC--G--AAAGGAAGC-TGAGTTGGC-TG-CTGCCACCGCTGAGCAATAAC-TAG-CA  2400
68        26    C...--.--...A....                                             14
73        27    -...--.AA........                                             14
71        24    C...--.--....A...                                             12
69        25    -...--.--...                                                  19
30        25    -...--.--...                                                  19
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15        23    -...--.--...-.....                                            12
18        27    C...--.--...                                                  20
20        27    -...--N--...A...                                              17
85        24    -...--.--....                                                 17
83        24    -...--.--.......                                              14
110       946   -..N--A--....T....N.........-..-.....................-...-..  996
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112       943   -...--.--..N......-.........-..-......N.A....N....N..-..N-.N  992
111       949   -...--.--.......N.-.T.A.....-..T..T.T..............NN-N..-..  999
40        25    -...--.--........                                             14
26        27    -...--.--........                                             16
115       29    -...--.--.......                                              19
49        26    -...--.--.......                                              16
64        26    -...--.--...A...                                              16
60        28    -...--.--.....                                                20
116       22    -...--.--....A.N..                                            10
56        27    -...--.--...A...                                              17
44        26    -...--.--....                                                 19
42        25    -...--.--....N.G..                                            13
38        25    C...--.--........                                             13
35        22    -...--.--...-.....                                            11
14        27    -...--.--...                                                  21
0         26    -...--.--...A...                                              16
46        28    -...--N--...                                                  22
28        27    -...G-.--...N...                                              16
12        30    C...--.--...N...                                              19
62        30    -...                                                          28
3         27    -...--.--...A...                                              17
88        12    -...--.--....                                                 5
24        27    -...--.--.....                                                19
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8         28    -...CGA--.......                                              16
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Query_58  150   TCAT-CC--G-CAGTTCG-AAAAGGGTA-CCGAGAA-CCTGTACTT-CCAAT-CCAATGC  200
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Query_58  201   CAGAGAGGTAATCAGCTTTAATGATGGCTGGTTGTTTAAAAAAGGGCCGTTTGCAACAGA  260
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Query_58  320   CCTGGAATGCGCAGGATATGCAGGTGAAGACAAACTCTTTTTATGAGGGAGCGGCTTATT  379
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Query_58  380   ATCGTAAGACTTATGTGATTCCCGAGACCATGAAGGGGAAGCGTTTGTTCTTGCGCTTTG  439
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Query_58  440   AAGGTGTGGGGACTTGTACGGAAGTGTATGTCAACGGTTATCTGGTGGGTACACACAAGG  499
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Query_58  500   GAGGATATTCCGCCTTTGTCTGTGAGATTGGTGAGC-AGGT-AAAATATGGGGAGAGCAA  557
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Query_58  558   TGAGATTGTAGTGAAGGCTGACAATACAGCTCGTCCGGATGTCATTCCGGTGAACCATAG  617
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Query_58  618   CCTTTTTGGAGTATACGGAGGTATCTATCGCCCGGTGTCGTTGGTAGTGACAGAGCCTTG  677
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Query_58  678   TCATATTGCGGTGGAAGATTATGCTTCTCCAGGGGTCTATATTACCCAGAAAAATGTGTC  737
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Query_58  738   GAAA-AGTGCAGCGGA--AG-TAAATGTGAAGGTGAAACTGGACAACGC-TTCCTT-GCA  791
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Query_58  792   ACCGGAAACACTGGAACTGGAGAATGCAATCTATGATGCG-GAAGGCAAACTGGTGAAGA  850
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Query_58  851   AGCATGTACGCAG--TTTGGAACTGACT-CCGCAA-GGAA-TGCAGTCG-TATACGGC-T  903
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Query_58  950   C-TT--A-TTTATATAAGGTAGT-ATCC-CGTCTGAAGCAGGAGGGACGGGTGA-TTGAT  1002
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Query_58  1056  -C-TT-C-TTCCTGAATGG-AGAGAAA-TA-T-CCTAT-GT-A-T-GGAGTAAC-T-CG-  1100
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Query_58  1101  CCA-T-CAGG-A-C-T-G---GTGGGGAAAA-GGTAG-T-GC-GTTGACAAA-TC-AGGA  1145
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Query_58  1146  ACA--T-GACGC-GGATTTAGC-CAT-G-A-TTAT-GGA-TA-TTGG-AGC-TACTACC-  1191
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Query_58  1192  -ATT-CGCCTGGC-AC-ATTATCAGCAGGCAGA--G-TATAT-GTATGCTAAATGCG---  1240
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Query_58  1241  ATAGTCTGGGACTGATA-GTCTGGGCTGAGATTCCTTTTGTAAATCGGGTGAC-GGGG--  1296
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Query_58  1297  CA--GGAA-TGGGA--TAA--T-GCCCATC-AG-C-AG-AT-GA-GA-G-AATTGGTT-C  1339
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Query_58  1340  GACAGAATTTTAA--TCA-C-CCTT-CCATTTA-TATT-TGGGG-AA--TTCA-TAA-TG  1387
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Query_58  1388  A-GGTGTAT-CAT-CCGCA-TGGTTAC-AC-AGCTGCA-TTGA-CCCGTTC--GTTGCA-  1436
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Query_58  1437  TGATGTATGTAAGAC--GGATG-ATCCGGA-CCGTTAT-ACGGCTGCTGT-AAACGGGT-  1489
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Query_58  1490  ATGGAC-A-TGCTGAACATCC-GG-TGAA-CCA-G-AATGCAGACGTTCAAGGG-A-TGA  1540
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Query_58  1541  ACCGCTACTTT-GGCTGGTATGA-AA-GGAAGATACAGGATATCAAACCTTGGGTGGAA-  1596
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Query_58  1597  GGTT-TGGaaaaaa-a-TT-ACCCCTGG-CAGAAACTGATGTTGACAGCTTATGGGGCGG  1651
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Query_58  1652  ATGCG-AACTTGGAGCATCAGACTGAA-TATCTGGGAGATGCCTTGAA-TTGGGGAAAA-  1707
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Query_58  1708  CCTTTTTATCCTGAGACTTTCCAGACAAAA-GTACATGAGTATCAGTGGAGCGTGATTGC  1766
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Query_58  1767  TGAACACCCTTACATTATTGCTTCTTACTTGTGGAATATGTTTGATTTTGCTGTGCCTAT  1826
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Query_58  1827  GTGGGAGCGTGGAGGAGTTCCTGCACGTAACTTGAAGGGAATGGTAACTTTCGACCGTAA  1886
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20        483   A.CAA.AA.A..CA.T..AGAC..C..C...A....A..C...A.G........T....G  424

Query_58  1887  GATTAAGAAGGATTCCTATTATTGGTATAAAGCTAACTGGAGTAAGGAACCTGTACTTTA  1946
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6         201                                                   ............  190

Query_58  1947  TCTGACACAGCGTCGTAATGTGGACAGAGAAAGAAAAGAAACTTCGGTAACCGTGTATTC  2006
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Query_58  2007  TAATATCGGAACTCCGGTGGTATATCTGAA---CGGGAAACCTTTGGAAGGTATCCGTAA  2063
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Query_58  2064  AGGATATACAGAGGTGCACTATGTATTTGATAAAGTGACGCTGGTTCAGGGAAAGAATAT  2123
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Query_58  2124  ATTGAAGGCTGTAGTCAGCTATCAGGGAAAAGAGTACGTAGATGAGATAGAATGGAACTA  2183
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Query_58  2184  TACTGGTGAAAAGAATAGGGGGACTGTCG-TGC--ATGAGAATAAGAAGGAGCATGCAGG  2240
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Query_58  2241  ATG-GTAACATTGGAAGTGGATAACGGATCCGAATTCGAGCTCCGTCGA-CAAGCTT-GC  2297
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Query_58  2298  GGCCG-CACT-CGAGcaccaccaccaccacca-cT-G-AGA-T-CCGGCTGCTAACAAAG  2350
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Query_58  2351  -CCC--G--AAAGGAAGC-TGAGTTGGC-TG-CTGCCACCGCTGAGCAATAAC-TAG-CA  2400
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Query_58  2401  -TAAC-C-CCTT-GGGGCCTCTAAACGGGTCTT--GAGG-GG--TTTTTTGCTGAAA  2448
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Query= CMR200128.106

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Query_59  99    TATAC-ATATG--CACCAT-CATCATCAT-CATTCTT-CT-GG-TGTAGAT-CTGTGGTC  149
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Query_59  150   TCAT-CC--G-CAGTTCG-AAAAGGGTA-CCGAGAA-CCTGTACTT-CCAAT-CCAATGC  200
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Query_59  201   CAGAGAGGTAATCAGCTTTAATGATGGCTGGTTGTTTAAAAAAGGGCCGTTTGCAACAGA  260
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Query_59  261   CGTGATGAAGGCAGCTGCCCAGTGGGAGAGTA-AATGGACAGAGGTGACCATCCCTCATA  319
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104       223   ................................-...........................  281
76        210   T.C....C..A.T....-....AT...AT.C.G.T...GA.C......ATG.G.......  268
80        212   T.C....C..A.T....-....AT...AT.C.G.T...GA.C......ATG.G.......  270
78        208   T.C....C..A.T....-....AT...AT.C.G.T...GA.C......ATG.G.......  266

Query_59  320   CCTGGAATGCGCAGGATATGCAGGTGAAGACAAACTCTTTTTATGAGGGAGCGGCTTATT  379
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105       279   ............................................................  338
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Query_59  380   ATCGTAAGACTTATGTGATTCCCGAGACCATGAAGGGGAAGCGTTTGTTCTTGCGCTTTG  439
102       339   ............................................................  398
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78        327   ....G...CAC.....TT....T..AT.AC..G.A..C......C.T..TC.A.......  386

Query_59  440   AAGGTGTGGGGACTTGTACGGAAGTGTATGTCAACGGTTATCTGGTGGGTACACACAAGG  499
102       399   ............................................................  458
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80        391   .G.....A..AG.A...G.C.....T...............T....T..A.....T..A.  450
78        387   .G.....A..AG.A...G.C.....T...............T....T..A.....T..A.  446

Query_59  500   GAGGATATTCCGCCTTTGTCTGTGAGATTGGTGAGC-AGGT-AAAATATGGGGAGAGCAA  557
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Query_59  558   TGAGATTGTAGTGAAGGCTGACAATACAGCTCGTCCGGATGTCATTCCGGTGAACCATAG  617
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Query_59  618   CCTTTTTGGAGTATACGGAGGTATCTATCGCCCGGTGTCGTTGGTAGTGACAGAGCCTTG  677
102       577   ............................................................  636
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Query_59  678   TCATATTGCGGTGGAAGATTATGCTTCTCCAGGGGTCTATATTACCCAGAAAAATGTGTC  737
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Query_59  738   GAAA-AGTGCAGCGGA--AG-TAAATGTGAAGGTGAAACTGGACAACGC-TTCCTT-GCA  791
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Query_59  792   ACCGGAAACACTGGAACTGGAGAATGCAATCTATGATGCG-GAAGGCAAACTGGTGAAGA  850
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78        742   C....CTG.T..T........A.....G..T.TAT.CC..T..G.....GT....A...-  800

Query_59  851   AGCATGTACGCAG--TTTGGAACTGACT-CCGCAA-GGAA-TGCAGTCG-TATACGGC-T  903
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78        801   TT..--.CG....T-...T..G......C..T..G-...G-.A..------.A..-TA-.  847

Query_59  904   T--CT--TTCCAA-TT--AAAACG---TCCGCA-TT-T-GTGGCAGGGACGGAAAGAT-C  949
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138       771                                                              .  771

Query_59  950   C-TT--A-TTTATATAAGGTAGT-ATCC-CGTCTGAAGCAGGAGGGACGGGTGA-TTGAT  1002
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Query_59  1003  GAAGTGGTACAGCC-GTTGGGT-A-TC-CGTAAATA-TGAA-ATTGTGGCCGGG-AAAGG  1055
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Query_59  1056  -C-TT-C-TTCCTGAATGG-AGAGAAA-TA-T-CCTAT-GT-A-T-GGAGTAAC-T-CG-  1100
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Query_59  1101  CCA-T-CAGG-A-C-T-G---GTGGGGAAAA-GGTAG-T-GC-GTTGACAAA-TC-AGGA  1145
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78        1055  NN.-.-..N.-.-.-.-.---T...                                     1070

Query_59  1146  ACA--T-GACGC-GGATTTAGC-CAT-G-A-TTAT-GGA-TA-TTGG-AGC-TACTACC-  1191
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Query_59  1192  -ATT-CGCCTGGC-AC-ATTATCAGCAGGCAGA--G-TATAT-GTATGCTAAATGCG---  1240
102       1163  -...C.N....NN-N.-...........NNN..NNN-..N..-........           1208
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Query_59  1241  ATAGTCTGGGACTGATA-GTCTGGGCTGAGATTCCTTTTGTAAATCGGGTGAC-GGGG--  1296
68        1140  N....TNT.........A..NNN..N...ANA.N.N.NG...G-.........C....--  1084
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Query_59  1297  CA--GGAA-TGGGA--TAA--T-GCCCATC-AG-C-AG-AT-GA-GA-G-AATTGGTT-C  1339
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Query_59  1340  GACAGAATTTTAA--TCA-C-CCTT-CCATTTA-TATT-TGGGG-AA--TTCA-TAAT--  1386
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Query_59  1387  CAGGTGTAT-CAT-CCGCA-TGGTTAC-AC-AGCTGCA-TTGA-CCCGTTC--GTTGCA-  1436
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Query_59  1437  TGATGTATGTAAGAC--GGATG-ATCCGGA-CCGTTAT-ACGGCTGCTGT-AAACGGGT-  1489
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15        870   C..CC.C..C..-..TG.R.G.-....A..-...C..C-....T...G..-...T..T.-  817

Query_59  1490  ATGGAC-A-TGCTGAACATCC-GG-TGAA-CCA-G-AATGCAGACGTTCAAGGG-A-TGA  1540
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Query_59  1541  ACCGCTACTTT-GGCTGGTATGA-AA-GGAAGATACAGGATATCAAACCTTGGGTGGAA-  1596
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Query_59  1597  GGTT-TGGaaaaaa-a-TT-ACCCCTGG-CAGAAACTGATGTTGACAGAGTATGGGGCGG  1651
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Query_59  1652  ATGCG-AACTTGGAGCATCAGACTGAA-TATCTGGGAGATGCCTTGAA-TTGGGGAAAA-  1707
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Query_59  1708  CCTTTTTATCCTGAGACTTTCCAGACAAAA-GTACATGAGTATCAGTGGAGCGTGATTGC  1766
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Query_59  1767  TGAACACCCTTACATTATTGCTTCTTACTTGTGGAATATGTTTGATTTTGCTGTGCCTAT  1826
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20        543   CC....T........C..C.........C.............C..C.....A.....A.C  484

Query_59  1827  GTGGGAGCGTGGAGGAGTTCCTGCACGTAACTTGAAGGGAATGGTAACTTTCGACCGTAA  1886
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Query_59  1887  GATTAAGAAGGATTCCTATTATTGGTATAAAGCTAACTGGAGTAAGGAACCTGTACTTTA  1946
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6         201                                                   ............  190

Query_59  1947  TCTGACACAGCGTCGTAATGTGGACAGAGAAAGAAAAGAAACTTCGGTAACCGTGTATTC  2006
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Query_59  2007  TAATATCGGAACTCCGGTGGTATATCTGAA---CGGGAAACCTTTGGAAGGTATCCGTAA  2063
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Query_59  2064  AGGATATACAGAGGTGCACTATGTATTTGATAAAGTGACGCTGGTTCAGGGAAAGAATAT  2123
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Query_59  2124  ATTGAAGGCTGTAGTCAGCTATCAGGGAAAAGAGTACGTAGATGAGATAGAATGGAACTA  2183
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Query_59  2184  TACTGGTGAAAAGAATAGGGGGACTGTCG-TGC--ATGAGAATAAGAAGGAGCATGCAGG  2240
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62        147                                                         ..A...  142
66        146                                              ...T..T.C..A.G...  130

Query_59  2241  ATG-GTAACATTGGAAGTGGATAACGGATCCGAATTCGAGCTCCGTCGA-CAAGCTT-GC  2297
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Query_59  2298  GGCCG-CACT-CGAGcaccaccaccaccacca-cT-G-AGA-T-CCGGCTGCTAACAAAG  2350
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Query_59  2351  -CCC--G--AAAGGAAGC-TGAGTTGGC-TG-CTGCCACCGCTGAGCAATAAC-TAG-CA  2400
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Query_59  2401  -TAAC-C-CCTT-GGGGCCTCTAAACGGGTCTT--GAGG-GG--TTTTTTGCTGAAA  2448
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Gapped
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Effective search space used: 371801482


Query= CMR200128.107

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Query_60  201   CAGAGAGGTAATCAGCTTTAATGATGGCTGGTTGTTTAAAAAAGGGCCGTTTGCAACAGA  260
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Query_60  261   CGTGATGAAGGCAGCTGCCCAGTGGGAGAGTA-AATGGACAGAGGTGACCATCCCTCATA  319
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Query_60  320   CCTGGAATGCGCAGGATATGCAGGTGAAGACAAACTCTTTTTATGAGGGAGCGGCTTATT  379
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Query_60  380   ATCGTAAGACTTATGTGATTCCCGAGACCATGAAGGGGAAGCGTTTGTTCTTGCGCTTTG  439
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Query_60  440   AAGGTGTGGGGACTTGTACGGAAGTGTATGTCAACGGTTATCTGGTGGGTACACACAAGG  499
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Query_60  500   GAGGATATTCCGCCTTTGTCTGTGAGATTGGTGAGC-AGGT-AAAATATGGGGAGAGCAA  557
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Query_60  558   TGAGATTGTAGTGAAGGCTGACAATACAGCTCGTCCGGATGTCATTCCGGTGAACCATAG  617
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Query_60  618   CCTTTTTGGAGTATACGGAGGTATCTATCGCCCGGTGTCGTTGGTAGTGACAGAGCCTTG  677
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Query_60  678   TCATATTGCGGTGGAAGATTATGCTTCTCCAGGGGTCTATATTACCCAGAAAAATGTGTC  737
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Query_60  738   GAAA-AGTGCAGCGGA--AG-TAAATGTGAAGGTGAAACTGGACAACGC-TTCCTT-GCA  791
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Query_60  792   ACCGGAAACACTGGAACTGGAGAATGCAATCTATGATGCG-GAAGGCAAACTGGTGAAGA  850
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Query_60  851   AGCATGTACGCAG--TTTGGAACTGACT-CCGCAA-GGAA-TGCAGTCG-TATACGGC-T  903
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Query_60  904   T--CT--TTCCAA-TT--AAAACG---TCCGCA-TT-T-GTGGCAGGGACGGAAAGAT-C  949
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Query_60  950   C-TT--A-TTTATATAAGGTAGT-ATCC-CGTCTGAAGCAGGAGGGACGGGTGA-TTGAT  1002
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Query_60  1003  GAAGTGGTACAGCC-GTTGGGT-A-TC-CGTAAATA-TGAA-ATTGTGGCCGGG-AAAGG  1055
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Query_60  1056  -C-TT-C-TTCCTGAATGG-AGAGAAA-TA-T-CCTAT-GT-A-T-GGAGTAAC-T-CG-  1100
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Query_60  1192  -ATT-CGCCTGGC-AC-ATTATCAGCAGGCAGA--G-TATAT-GTATGCTAAATGCG---  1240
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Query_60  1241  ATAGTCTGGGACTGATA-GTCTGGGCTGAGATTCCTTTTGTAAATCGGGTGAC-GGGG--  1296
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Query_60  1297  CA--GGAA-TGGGA--TAA--T-GCCCATC-AG-C-AG-AT-GA-GA-G-AATTGGTT-C  1339
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Query_60  1340  GACAGAATTTTAA--TCA-C-CCTT-CCATTTA-TATT-TGGGG-AA--TTCA-TAA-TG  1387
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Query_60  1388  A-GGTGTAT-CAT-CCGCA-TGGTTAC-AC-AGCTGCA-TTGA-CCCGTTC--GTTGCA-  1436
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Query_60  1437  TGATGTATGTAAGAC--GGATG-ATCCGGA-CCGTTAT-ACGGCTGCTGT-AAACGGGT-  1489
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Query_60  1490  ATGGAC-A-TGCTGAACATCC-GG-TGAA-CCA-G-AATGCAGACGTTCAAGGG-A-TGA  1540
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Query_60  1541  ACCGCTACTTT-GGCTGGTATGA-AA-GGAAGATACAGGATATCAAACCTTGGGTGGAA-  1596
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Query_60  1597  GGTT-TGGaaaaaa-a-TT-ACCCCTGG-CAGAAACTGATGTTGACACAGTATGGGGCGG  1651
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Query_60  1652  ATGCG-AACTTGGAGCATCAGACTGAA-TATCTGGGAGATGCCTTGAA-TTGGGGAAAA-  1707
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Query_60  1708  CCTTTTTATCCTGAGACTTTCCAGACAAAA-GTACATGAGTATCAGTGGAGCGTGATTGC  1766
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Query_60  1767  TGAACACCCTTACATTATTGCTTCTTACTTGTGGAATATGTTTGATTTTGCTGTGCCTAT  1826
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Query_60  1827  GTGGGAGCGTGGAGGAGTTCCTGCACGTAACTTGAAGGGAATGGTAACTTTCGACCGTAA  1886
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Query_60  1887  GATTAAGAAGGATTCCTATTATTGGTATAAAGCTAACTGGAGTAAGGAACCTGTACTTTA  1946
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Query_60  1947  TCTGACACAGCGTCGTAATGTGGACAGAGAAAGAAAAGAAACTTCGGTAACCGTGTATTC  2006
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Query_60  2007  TAATATCGGAACTCCGGTGGTATATCTGAA---CGGGAAACCTTTGGAAGGTATCCGTAA  2063
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Query_60  2064  AGGATATACAGAGGTGCACTATGTATTTGATAAAGTGACGCTGGTTCAGGGAAAGAATAT  2123
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Query_60  2124  ATTGAAGGCTGTAGTCAGCTATCAGGGAAAAGAGTACGTAGATGAGATAGAATGGAACTA  2183
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Query_60  2184  TACTGGTGAAAAGAATAGGGGGACTGTCG-TGC--ATGAGAATAAGAAGGAGCATGCAGG  2240
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Query_60  2241  ATG-GTAACATTGGAAGTGGATAACGGATCCGAATTCGAGCTCCGTCGA-CAAGCTT-GC  2297
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Query_60  2298  GGCCG-CACT-CGAGcaccaccaccaccacca-cT-G-AGA-T-CCGGCTGCTAACAAAG  2350
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Query_60  2351  -CCC--G--AAAGGAAGC-TGAGTTGGC-TG-CTGCCACCGCTGAGCAATAAC-TAG-CA  2400
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20        27    -...--N--...A...                                              17
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Effective search space used: 371801482


Query= CMR200133.104

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Query_61  1     TCTCG-ATCCCGCGAAATTAATAC-GACTC-ACTATAGGGG--AATT-GTGAG-CGGA-T  52
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Query_61  53    AAC-AA-TT-CCCC--T-C-TAGAAA-TAA-TTTT-GTTTAAC--TTTAAGAA-GGA-GA  98
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Query_61  99    TATAC-ATATG--CACCAT-CATCATCAT-CATTCTT-CT-GG-TGTAGAT-CTGTGGTC  149
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Query_61  150   TCAT-CC--G-CAGTTCG-AAAAGGGTA-CCGAGAA-CCTGTACTT-CCAAT-CCAATGC  200
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87        856   ....-..CGC-.......A.........C.......-.........C.....C.......  800
122       957   ....-..--.N.......A.........-.......-.........--.N..-.......  906
101       106   ..C.-G.T-.-.T..-..-.TG......-.......-.........-.....-.......  156
137       969   ..N.T..--.-.....N.-......N..-.......-..N......N.....N.....N.  916

Query_61  201   C-CAGACATTTAAAGAATGGCAAGACCCGGAAATAAATGCCATCAACCGGGCACCGATGC  259
117       646   .-A..T..                                                      640
83        812   .-G.A.A...                                                    804
85        812   .                                                             812
110       154   .-G.A.A...                                                    162
105       160   .                                                             160
93        162   .-..                                                          164
86        152   .-..                                                          154
98        164   .-..                                                          166
96        160   .T.T..A....                                                   170
9         155   .                                                             155
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89        153   .-..                                                          155
70        152   .-.....                                                       157
17        149   .-A..                                                         152
84        149   .-..                                                          151
59        144   .-.....                                                       149
90        149   .-..                                                          151
82        150   .-..                                                          152
111       152   .                                                             152
94        163   .T.T..A....                                                   173
112       156   .                                                             156
100       151   .-..                                                          153
95        161   .T.T..A....                                                   171
102       160   .                                                             160
80        152   .-.                                                           153
29        148   .-A..                                                         151
97        162   .T.T..A....                                                   172
72        151   .-.....                                                       156
104       163   .                                                             163
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61        138   .-.....                                                       143
76        150   .-.                                                           151
78        148   .-.                                                           149
99        144   .-..                                                          146
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114       168   .-.....                                                       173
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122       905   .-A...                                                        901
101       157   .-..N.T..                                                     164
137       915   .-..                                                          913

Query_61  260   ACGCAAACTTCTTTGCGTACGAAAATGCAGAAATGGCTGCCAAAGCAGTCAAGGAAGACT  319

Query_61  320   CCAAGAACTTTATGAGCCTGAATGGAACCTGGAAATTCTTCTGGGTGCGGAATGCAGATG  379

Query_61  380   CACGCCCCACGGATTTCTGGAAAACCGGCTTCAACGATAAAGGTTGGGACAACCTTCAGG  439

Query_61  440   TGCCGGGAGTATGGGAAACTCACGGATACGGCGACCCTATCTACATCAACGTAGGCTACG  499

Query_61  500   GATGGCGCAGCCGTTTCGAGAACAATCCTCCTTACGTACCGACTGAAGAAAACCACGTAG  559
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114       493                 ...A.A..G........GCTG.....TTA..C.N.G...G.A....  538

Query_61  560   GTTCTTACCGTCGTGAAATTATGGTTCCGGCCGACTGGAAAGGCAAAGACATCATCGCTC  619
70        523   .......T..C...ACGT.C.C......T..T..........                    564
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114       539   .......T..C...ACGT.C.C......T..T..........                    580

Query_61  620   ATTTTGGTGCAGTCAGCTCAAACATGTACCTGTGGGTAAACGGTAAGTTCGTTGGCTACA  679

Query_61  680   GCGAAGACAGCAAGCTGGAAGCTGAATTCAACCTGACTCCGTACCTGAAACCGGGACAGA  739

Query_61  740   AAAACCTGATTGCTTTCCAGGTGTTCCGCTGGTGTGACGGTTCATACCTGGAAGACCAGG  799

Query_61  800   ACTTCTTCCGCTATACCGGAGTAGCACGCGACTGCTATCTTTATACCCGCAACAAAAAAC  859
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108       785                                                    ....G.T....  795
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Query_61  860   GTATCGATGACATCCGCGTGACTCCCGACCTGGACAGCGAATACAAGAACGGTTCACTGG  919
63        784   ........                                                      791
106       796   ........                                                      803
108       796   ........                                                      803
65        789   ........                                                      796
109       791   ........                                                      798
107       783   ........                                                      790

Query_61  920   CCATCAACCTGAACCTGAAAGGAAGCGGCAATGTCAGCCTGGAACTGCTGGATGCCCAAA  979
121       188                                           ..............        175
33        262                                           ..............        275

Query_61  980   ACCAGACCGTAGCTTCTACCGAAGTAAAAGGTTCAGGCAATGTTTCTACTACACTTCAGG  1039

Query_61  1040  TAGAAAATCCGAAAAAATGGAGCGCAGAAACTCCTTACTTATACACACTGCGTGCTACAC  1099

Query_61  1100  TGAAAGACGGTAGCCAGGCTAGCGAAGTTGTACCTGTGAAAGTAGGTTTCCGCAAGATTG  1159

Query_61  1160  AACTCAAAAACGCACAGATTCTGGTCAACGGCCAGCCTGTACTTTTCAAAGGTGCCGACC  1219

Query_61  1220  GTCATGAACTGGACCCGGACGGTGGATACGTAGTTTCACGCGACCGCATGATTCAGGACA  1279

Query_61  1280  TTCAGATTATGAAGCAGTTCAACATCAACGCCGTAAGAACCTGTCACTATCCGGACGACA  1339

Query_61  1340  ACTTCTGGTACGAACTCTGCGACAAATACGGTATTTATGTAGTGGCTGAAGCCAACATCG  1399

Query_61  1400  AATCTCACGGAATGGGATACGGCGACAAGACACTGGCCAAGGAACCGACTTATAAAAAGG  1459

Query_61  1460  CACACATGGAACGCAACCAGCGCAACGTACAGCGTGGTTTCAACCATCCGAGCATCATCT  1519

Query_61  1520  TCTGGTCATTGGGTAACGCTGCCGGATACGGTCCGAACTTCGAAGCTGCTTACGACTGGA  1579

Query_61  1580  TCAAGGCAGAAGACCCCAGCCGTGCCGTACAATACGAACAGGCCCGCATCGAAGGAAAGA  1639

Query_61  1640  CTGATATCTACTGCCCGATGTATGCCAACTACAAATGGTGCGAAGAATACAGCAAGGACG  1699

Query_61  1700  ATAAATACCAGAAACCGCTGATTCAGTGTGAATATGCACACGCCATGGGTAATTCACAAG  1759

Query_61  1760  GTGGATTCAAGGAATACTGGGACCTGATTCGCAAGTATCCGAAATATCAGGGTGGATTCA  1819

Query_61  1820  TCTGGGACTTCGTAGACCAGTCTATCCGCTGGACAGGAAAGAACGGCAAGATGATTTATG  1879

Query_61  1880  CTTATGCCGGCGACTTCAACCGTATGGATGATTCTGGCGACAAGAACTTCTGTAACAACG  1939

Query_61  1940  GACTTATCAGCCCTGACCGTAAACCGAATCCGCATGCATACGAAGTACAGTACTTCTACC  1999

Query_61  2000  AGAACATCTGGACTACTCCGGGCGATTTGGCAAAGGGAGAAATCAAGGTATACAACGAAA  2059

Query_61  2060  ACTTCTTCCGTGACCTGTCTGCATACGCACTGGAATGGGAAG-TACTGAAAGATGGT-AA  2117
77        1215                                      ..A...-NN......N.....-.N  1194
81        1210                                      ......A....TN.....N..T..  1187

Query_61  2118  GGCTATCCGTAGCGGACGCATTGAAAACCTGAACGT-GGCACCTCATCAGACTGCCAGCC  2176
77        1193  .NNNT--........NGC.N.G....--.....NC.-NNN...NN.......N......T  1139
81        1186  ..............NN.NTN------.N...NNN..T..........TCNNN........  1133

Query_61  2177  TGAAACTTGATCTGGGC-AAGACTTGC-CAG-TGT---GGTGAATGGCTGC-TCAACG-T  2228
77        1138  .NNNC--....N.....C.........-.CA-GNN---N.......-....-......-.  1089
79        1121                       ...G..-...G.AN---......AT.....-...N..-.  1089
81        1132  ..N.N--.....N.N---...N..-..-...-...---..-.TGNN....N-......-.  1087
75        1147                  .-........NN...-N..TNG.......N.....N...N..G.  1106

Query_61  2229  GAAA--TACA-TCCA-GAAGAACCGTGAAGGTTTGAT-CCCGGCCGG--TTTTGTA-GTA  2280
77        1088  ....--....-..AN-.......-.........-..N-.......CN--N......-...  1039
79        1088  ....A-....-.T..-....NN.......N...-..N-..-......--.......-...  1038
81        1086  ....A-N.N.A....-....NN--.........-...-....N...N--...-...-...  1037
75        1105  ....ATNN.N-....N..................N..N....N....NT.......A...  1047

Query_61  2281  GCTAAA--GACCAGCTTGT-GCTGAA--T-CCATACAAA-GCACCGGCTATGGAACTGAA  2333
77        1038  ......A-N..........-......--.-.........-...............N....  985
79        1037  ......--...........-......--.T.........-..N.................  984
81        1036  .....---.N......-..-......--.-...NT.N..-....................  986
75        1046  ......AGN....N...N.T....G.AT.-.........A....................  988

Query_61  2334  GAACGTAGTTGAAACTAA-CCAGCAGGTAGTTGAACCGCAAATCAACCCGAACTATCCGG  2392
77        984   .........-........-............-............................  928
79        983   ..................-............-............................  926
81        985   .................NN.........................................  926
75        987   ..................-.........................................  929

Query_61  2393  ACTACATCACTGTAGAA-GGCGACGGA-TTCTATCTGGAATTCAGCAAACGCAACGGTTA  2450
77        927   .................A.........-................................  869
79        925   .................-.........-................................  868
81        925   .................-.........-................................  868
75        928   .................-........NN....................-...........  871

Query_61  2451  TCTTGACAGATACGATGTAAACGGAGTAAGCATGTTGAAAGAAGGCGAAGCACTGACACC  2510
77        868   ............................................................  809
79        867   ...................................-........................  809
81        867   ...-........................................................  809
75        870   ............................................................  811

Query_61  2511  GAACTTCTGGCGTGCCCCGACCGACAACGACTTCGGTGCTGGTCTGCAGAACAAATATGC  2570
77        808   ............................................................  749
79        808   ............................................................  749
81        808   ............................................................  749
75        810   ............................................................  751

Query_61  2571  TGCATGGAAGAACCCGGGCATCAAACTGACAGACTTCAACTACAAGGTAGAAAACGGACA  2630
77        748   ............................................................  689
79        748   ............................................................  689
81        748   ............................................................  689
75        750   ............................................................  691

Query_61  2631  GGCCATCGTAAACTCTACTTACGACCTCAAGGAAGTATCTGCCAAGTTGTATCTCACTTA  2690
77        688   ............................................................  629
79        688   ............................................................  629
81        688   ............................................................  629
75        690   ............................................................  631

Query_61  2691  CCAGATCAACAACCAGGGAGCAGTGAAAGTGACACAGAAAATGGTAGCCGACAAGAATGC  2750
77        628   ............................................................  569
79        628   ............................................................  569
81        628   ............................................................  569
75        630   ............................................................  571

Query_61  2751  CAAGGTATCACCGATGTTCCGTTTCGGTATGCAGATGGTAATGCCGAAGTCATTTGAAAA  2810
77        568   ............................................................  509
79        568   ............................................................  509
81        568   ............................................................  509
75        570   ............................................................  511

Query_61  2811  GATTTCTTACTACGGACGCGGTCCGATAGAAAACTACAGCGACCGTAACCATTGCACTGA  2870
77        508   ............................................................  449
79        508   ............................................................  449
81        508   ............................................................  449
75        510   ............................................................  451

Query_61  2871  CCTGGGAATCTACAACCAGAATGTAAGCGACCAGTTCTATCCGTACATCCGTCCGCAGGA  2930
77        448   ............................................................  389
79        448   ............................................................  389
81        448   ............................................................  389
75        450   ............................................................  391

Query_61  2931  AAACGGCAACAAGACTGACATCCGCTGGTGGAAACAGGTAAACATGGCTGGAAACGGACT  2990
77        388   ............................................................  329
79        388   ............................................................  329
81        388   ............................................................  329
75        390   ............................................................  331

Query_61  2991  GATGTTCGTAGCTGAAGCACCGTTCTCTGCTTCTGCTCTCCACTACACCATCGCTTCACT  3050
77        328   ............................................................  269
79        328   ............................................................  269
81        328   ............................................................  269
75        330   ............................................................  271

Query_61  3051  GGACGACGGTACTGAAAAGAAACAGAGCCACTCGTTCGAAGTAGAAGAAGCCGACCTGAC  3110
77        268   ............................................................  209
79        268   ............................................................  209
81        268   ............................................................  209
75        270   ............................................................  211

Query_61  3111  CAACCTGTTGATTGACAAGGCACAGATGGGCTTAGGTTGTGTCAACAGCTGGGGTGCCCT  3170
77        208   ............................................................  149
79        208   ............................................................  149
81        208   ............................................................  149
75        210   ............................................................  151

Query_61  3171  GCCGGAAGACAAGTACATGCTTCCTTACGGAGATTATGAATTTACGTTCATCATGACTCC  3230
77        148   ............................................................  89
79        148   ............................................................  89
81        148   ............................................................  89
75        150   ............................................................  91
93        263                             ...............                     277
90        250                             ...............                     264
91        246                             ...............                     260

Query_61  3231  GGTGAAAGGCTATATCGCACACGAATAACATTGGAAGTGGATAACGGATCCGAATTCGAG  3290
77        88    .............................................--.....          39
79        88    .............................................--.....          39
81        88    .............................................--.....          39
75        90    .............................................--.....          41
83        129                          .....................................  93
85        132                          .....................................  96
110       838                          .....................................  874
39        813                         ......................................  850
27        841                            ...................................  875
23        842                            ..........................N.....C..  876
111       839                          ..................................N..  875
112       835                          ..............................N.-....  870
40        133                          .....................................  97
26        135                          .....................................  99
49        134                          .....................................  98
115       135                            ...................................  101
44        134                          .....................................  98
42        133                          .....................................  97
38        133                          .....................................  97
35        130                          .....................................  94
64        135                         ..G...................................  98
60        137                         ..G...................................  100
56        134                           ....................................  99
14        135                          .....................................  99
116       128                            ...................................  94
0         134                          .....................................  98
46        136                          .....................................  100
30        131                            ...................................  97
28        135                          .....................................  99
12        138                          .....................................  102
3         135                          .....................................  99
88        120                          .....................................  84
31        134                            ...................................  100
24        135                          .....................................  99
5         135                          .....................................  99
34        135                            ...................................  101
62        139                         ..G...................................  102
8         137                         ......................................  100
22        134                          .....................................  98
73        130                            ...................................  96
47        139                          .....................................  103
87        120                          .....................................  84
68        129                            ...................................  95
51        119                           ....................................  84
58        116                           ....................................  81
71        127                            ...................................  93
54        121                           ....................................  86
69        128                            ...................................  94
66        130                         ..G...................T.....N....A....  93
15        61                             ....................--.....          37
20        65                             ....................--.....          41
18        65                             ....................--.....          41

Query_61  3291  CTCCGTCGA-CAAGCTT-GCGGCCG-CACT-CGAGcaccaccaccaccacca-cT-G-AG  3343
83        92    .........-.......-.......-....-....---..............-..-.-..  43
85        95    .........-.......-.......-....-.....................-..-.-..  43
110       875   .........A.......-.......-....-...............--....-..T.-..  927
39        851   .........-.......-.......-....-....---..............-..-.-..  900
27        876   .........-.......T.......-....-.....................-..-.-.N  929
23        877   .........-.......-.......-....-...N........-........-..-.-..  928
111       876   .........-.N.....-.......C..N.-..................N..-..-.A..  930
112       871   .........-.......-....T..-....T.................N...N..-.-..  925
40        96    .........-.......-.......-....-.....................-..-.-..  44
26        98    .........-.......-.......-....-.....................-..-.-..  46
49        97    .........-.......-.......-....-.....................-..-.-..  45
115       100   .........-.......-.......-....-.....................-..-.-..  48
44        97    .........-.......-.......-....-.....................-..-.-..  45
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38        96    .........-.......-.......-....-.....................-..-.-..  44
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Query_61  3344  A-T-CCGGCTGCTAACAAAG-CCC--G--AAAGGAAGC-TGAGTTGGC-TG-CTGCCACC  3393
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Query= CMR200133.105

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Query_62  1     TCTCG-ATCCCGCGAAATTAATAC-GACTC-ACTATAGGGG--AATT-GTGAG-CGGA-T  52
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Query_62  53    AAC-AA-TT-CCCC--T-C-TAGAAA-TAA-TTTT-GTTTAAC--TTTAAGAA-GGA-GA  98
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Query_62  99    TATAC-ATATG--CACCAT-CATCATCAT-CATTCTT-CT-GG-TGTAGAT-CTGTGGTC  149
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Query_62  150   TCAT-CC--G-CAGTTCG-AAAAGGGTA-CCGAGAA-CCTGTACTT-CCAAT-CCAATGC  200
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Query_62  201   C-CAGACATTTAAAGAATGGCAAGACCCGGAAATAAATGCCATCAACCGGGCACCGATGC  259
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87        799   .                                                             799
122       905   .-A...                                                        901
101       157   .-..N.T..                                                     164
137       915   .-..                                                          913

Query_62  260   ACGCAAACTTCTTTGCGTACGAAAATGCAGAAATGGCTGCCAAAGCAGTCAAGGAAGACT  319

Query_62  320   CCAAGAACTTTATGAGCCTGAATGGAACCTGGAAATTCTTCTGGGTGCGGAATGCAGATG  379

Query_62  380   CACGCCCCACGGATTTCTGGAAAACCGGCTTCAACGATAAAGGTTGGGACAACCTTCAGG  439

Query_62  440   TGCCGGGAGTATGGGAAACTCACGGATACGGCGACCCTATCTACATCAACGTAGGCTACG  499

Query_62  500   GATGGCGCAGCCGTTTCGAGAACAATCCTCCTTACGTACCGACTGAAGAAAACCACGTAG  559
70        477                 ...A.A..G........GCTG.....TTA..C...G...G.A....  522
72        476                 ...A.A..G........GCTG.....TTA..C...G...G.A....  521
114       493                 ...A.A..G........GCTG.....TTA..C.N.G...G.A....  538

Query_62  560   GTTCTTACCGTCGTGAAATTATGGTTCCGGCCGACTGGAAAGGCAAAGACATCATCGCTC  619
70        523   .......T..C...ACGT.C.C......T..T..........                    564
72        522   .......T..C...ACGT.C.C......T..T..........                    563
114       539   .......T..C...ACGT.C.C......T..T..........                    580

Query_62  620   ATTTTGGTGCAGTCAGCTCAAACATGTACCTGTGGGTAAACGGTAAGTTCGTTGGCTACA  679

Query_62  680   GCGAAGACAGCAAGCTGGAAGCTGAATTCAACCTGACTCCGTACCTGAAACCGGGACAGA  739

Query_62  740   AAAACCTGATTGCTTTCCAGGTGTTCCGCTGGTGTGACGGTTCATACCTGGAAGACCAGG  799

Query_62  800   ACTTCTTCCGCTATACCGGAGTAGCACGCGACTGCTATCTTTATACCCGCAACAAAAAAC  859
63        773                                                    ....G.T....  783
106       785                                                    ....G.T....  795
108       785                                                    ....G.T....  795
65        778                                                    ....G.T....  788
109       780                                                    ....G.T....  790
107       772                                                    ....G.T....  782

Query_62  860   GTATCGATGACATCCGCGTGACTCCCGACCTGGACAGCGAATACAAGAACGGTTCACTGG  919
63        784   ........                                                      791
106       796   ........                                                      803
108       796   ........                                                      803
65        789   ........                                                      796
109       791   ........                                                      798
107       783   ........                                                      790

Query_62  920   CCATCAACCTGAACCTGAAAGGAAGCGGCAATGTCAGCCTGGAACTGCTGGATGCCCAAA  979
121       188                                           ..............        175
33        262                                           ..............        275

Query_62  980   ACCAGACCGTAGCTTCTACCGAAGTAAAAGGTTCAGGCAATGTTTCTACTACACTTCAGG  1039

Query_62  1040  TAGAAAATCCGAAAAAATGGAGCGCAGAAACTCCTTACTTATACACACTGCGTGCTACAC  1099

Query_62  1100  TGAAAGACGGTAGCCAGGCTAGCGAAGTTGTACCTGTGAAAGTAGGTTTCCGCAAGATTG  1159

Query_62  1160  AACTCAAAAACGCACAGATTCTGGTCAACGGCCAGCCTGTACTTTTCAAAGGTGCCGACC  1219

Query_62  1220  GTCATGAACTGGACCCGGACGGTGGATACGTAGTTTCACGCGACCGCATGATTCAGGACA  1279

Query_62  1280  TTCAGATTATGAAGCAGTTCAACATCAACGCCGTAAGAACCTGTCACTATCCGGACGACA  1339

Query_62  1340  ACTTCTGGTACGAACTCTGCGACAAATACGGTATTTATGTAGTGGCTGAAGCCAACATCG  1399

Query_62  1400  AATCTCACGGAATGGGATACGGCGACAAGACACTGGCCAAGGAACCGACTTATAAAAAGG  1459

Query_62  1460  CACACATGGAACGCAACCAGCGCAACGTACAGCGTGGTTTCAACCATCCGAGCATCATCT  1519

Query_62  1520  TCTGGTCATTGGGTAACGAGGCCGGATACGGTCCGAACTTCGAAGCTGCTTACGACTGGA  1579

Query_62  1580  TCAAGGCAGAAGACCCCAGCCGTGCCGTACAATACGAACAGGCCCGCATCGAAGGAAAGA  1639

Query_62  1640  CTGATATCTACTGCCCGATGTATGCCAACTACAAATGGTGCGAAGAATACAGCAAGGACG  1699

Query_62  1700  ATAAATACCAGAAACCGCTGATTCAGTGTGCTTATGCACACGCCATGGGTAATTCACAAG  1759

Query_62  1760  GTGGATTCAAGGAATACTGGGACCTGATTCGCAAGTATCCGAAATATCAGGGTGGATTCA  1819

Query_62  1820  TCTGGGACTTCGTAGACCAGTCTATCCGCTGGACAGGAAAGAACGGCAAGATGATTTATG  1879

Query_62  1880  CTTATGCCGGCGACTTCAACCGTATGGATGATTCTGGCGACAAGAACTTCTGTAACAACG  1939

Query_62  1940  GACTTATCAGCCCTGACCGTAAACCGAATCCGCATGCATACGAAGTACAGTACTTCTACC  1999

Query_62  2000  AGAACATCTGGACTACTCCGGGCGATTTGGCAAAGGGAGAAATCAAGGTATACAACGAAA  2059

Query_62  2060  ACTTCTTCCGTGACCTGTCTGCATACGCACTGGAATGGGAAG-TACTGAAAGATGGT-AA  2117
77        1215                                      ..A...-NN......N.....-.N  1194
81        1210                                      ......A....TN.....N..T..  1187

Query_62  2118  GGCTATCCGTAGCGGACGCATTGAAAACCTGAACGT-GGCACCTCATCAGACTGCCAGCC  2176
77        1193  .NNNT--........NGC.N.G....--.....NC.-NNN...NN.......N......T  1139
81        1186  ..............NN.NTN------.N...NNN..T..........TCNNN........  1133

Query_62  2177  TGAAACTTGATCTGGGC-AAGACTTGC-CAG-TGT---GGTGAATGGCTGC-TCAACG-T  2228
77        1138  .NNNC--....N.....C.........-.CA-GNN---N.......-....-......-.  1089
79        1121                       ...G..-...G.AN---......AT.....-...N..-.  1089
81        1132  ..N.N--.....N.N---...N..-..-...-...---..-.TGNN....N-......-.  1087
75        1147                  .-........NN...-N..TNG.......N.....N...N..G.  1106

Query_62  2229  GAAA--TACA-TCCA-GAAGAACCGTGAAGGTTTGAT-CCCGGCCGG--TTTTGTA-GTA  2280
77        1088  ....--....-..AN-.......-.........-..N-.......CN--N......-...  1039
79        1088  ....A-....-.T..-....NN.......N...-..N-..-......--.......-...  1038
81        1086  ....A-N.N.A....-....NN--.........-...-....N...N--...-...-...  1037
75        1105  ....ATNN.N-....N..................N..N....N....NT.......A...  1047

Query_62  2281  GCTAAA--GACCAGCTTGT-GCTGAA--T-CCATACAAA-GCACCGGCTATGGAACTGAA  2333
77        1038  ......A-N..........-......--.-.........-...............N....  985
79        1037  ......--...........-......--.T.........-..N.................  984
81        1036  .....---.N......-..-......--.-...NT.N..-....................  986
75        1046  ......AGN....N...N.T....G.AT.-.........A....................  988

Query_62  2334  GAACGTAGTTGAAACTAA-CCAGCAGGTAGTTGAACCGCAAATCAACCCGAACTATCCGG  2392
77        984   .........-........-............-............................  928
79        983   ..................-............-............................  926
81        985   .................NN.........................................  926
75        987   ..................-.........................................  929

Query_62  2393  ACTACATCACTGTAGAA-GGCGACGGA-TTCTATCTGGAATTCAGCAAACGCAACGGTTA  2450
77        927   .................A.........-................................  869
79        925   .................-.........-................................  868
81        925   .................-.........-................................  868
75        928   .................-........NN....................-...........  871

Query_62  2451  TCTTGACAGATACGATGTAAACGGAGTAAGCATGTTGAAAGAAGGCGAAGCACTGACACC  2510
77        868   ............................................................  809
79        867   ...................................-........................  809
81        867   ...-........................................................  809
75        870   ............................................................  811

Query_62  2511  GAACTTCTGGCGTGCCCCGACCGACAACGACTTCGGTGCTGGTCTGCAGAACAAATATGC  2570
77        808   ............................................................  749
79        808   ............................................................  749
81        808   ............................................................  749
75        810   ............................................................  751

Query_62  2571  TGCATGGAAGAACCCGGGCATCAAACTGACAGACTTCAACTACAAGGTAGAAAACGGACA  2630
77        748   ............................................................  689
79        748   ............................................................  689
81        748   ............................................................  689
75        750   ............................................................  691

Query_62  2631  GGCCATCGTAAACTCTACTTACGACCTCAAGGAAGTATCTGCCAAGTTGTATCTCACTTA  2690
77        688   ............................................................  629
79        688   ............................................................  629
81        688   ............................................................  629
75        690   ............................................................  631

Query_62  2691  CCAGATCAACAACCAGGGAGCAGTGAAAGTGACACAGAAAATGGTAGCCGACAAGAATGC  2750
77        628   ............................................................  569
79        628   ............................................................  569
81        628   ............................................................  569
75        630   ............................................................  571

Query_62  2751  CAAGGTATCACCGATGTTCCGTTTCGGTATGCAGATGGTAATGCCGAAGTCATTTGAAAA  2810
77        568   ............................................................  509
79        568   ............................................................  509
81        568   ............................................................  509
75        570   ............................................................  511

Query_62  2811  GATTTCTTACTACGGACGCGGTCCGATAGAAAACTACAGCGACCGTAACCATTGCACTGA  2870
77        508   ............................................................  449
79        508   ............................................................  449
81        508   ............................................................  449
75        510   ............................................................  451

Query_62  2871  CCTGGGAATCTACAACCAGAATGTAAGCGACCAGTTCTATCCGTACATCCGTCCGCAGGA  2930
77        448   ............................................................  389
79        448   ............................................................  389
81        448   ............................................................  389
75        450   ............................................................  391

Query_62  2931  AAACGGCAACAAGACTGACATCCGCTGGTGGAAACAGGTAAACATGGCTGGAAACGGACT  2990
77        388   ............................................................  329
79        388   ............................................................  329
81        388   ............................................................  329
75        390   ............................................................  331

Query_62  2991  GATGTTCGTAGCTGAAGCACCGTTCTCTGCTTCTGCTCTCCACTACACCATCGCTTCACT  3050
77        328   ............................................................  269
79        328   ............................................................  269
81        328   ............................................................  269
75        330   ............................................................  271

Query_62  3051  GGACGACGGTACTGAAAAGAAACAGAGCCACTCGTTCGAAGTAGAAGAAGCCGACCTGAC  3110
77        268   ............................................................  209
79        268   ............................................................  209
81        268   ............................................................  209
75        270   ............................................................  211

Query_62  3111  CAACCTGTTGATTGACAAGGCACAGATGGGCTTAGGTTGTGTCAACAGCTGGGGTGCCCT  3170
77        208   ............................................................  149
79        208   ............................................................  149
81        208   ............................................................  149
75        210   ............................................................  151

Query_62  3171  GCCGGAAGACAAGTACATGCTTCCTTACGGAGATTATGAATTTACGTTCATCATGACTCC  3230
77        148   ............................................................  89
79        148   ............................................................  89
81        148   ............................................................  89
75        150   ............................................................  91
93        263                             ...............                     277
90        250                             ...............                     264
91        246                             ...............                     260

Query_62  3231  GGTGAAAGGCTATATCGCACACGAATAACATTGGAAGTGGATAACGGATCCGAATTCGAG  3290
77        88    .............................................--.....          39
79        88    .............................................--.....          39
81        88    .............................................--.....          39
75        90    .............................................--.....          41
83        129                          .....................................  93
85        132                          .....................................  96
110       838                          .....................................  874
39        813                         ......................................  850
27        841                            ...................................  875
23        842                            ..........................N.....C..  876
111       839                          ..................................N..  875
112       835                          ..............................N.-....  870
40        133                          .....................................  97
26        135                          .....................................  99
49        134                          .....................................  98
115       135                            ...................................  101
44        134                          .....................................  98
42        133                          .....................................  97
38        133                          .....................................  97
35        130                          .....................................  94
64        135                         ..G...................................  98
60        137                         ..G...................................  100
56        134                           ....................................  99
14        135                          .....................................  99
116       128                            ...................................  94
0         134                          .....................................  98
46        136                          .....................................  100
30        131                            ...................................  97
28        135                          .....................................  99
12        138                          .....................................  102
3         135                          .....................................  99
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Query_62  3291  CTCCGTCGA-CAAGCTT-GCGGCCG-CACT-CGAGcaccaccaccaccacca-cT-G-AG  3343
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Query_62  3344  A-T-CCGGCTGCTAACAAAG-CCC--G--AAAGGAAGC-TGAGTTGGC-TG-CTGCCACC  3393
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Query_62  3394  GCTGAGCAATAAC-TAG-CA-TAAC-C-CCTT-GGGGCCTCTAAACGGGTCTT--GAGG-  3444
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Query_62  3445  GG--TTTTTTGCTGAAA  3459
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Query= CMR200133.106

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Query_63  1     TCTCG-ATCCCGCGAAATTAATAC-GACTC-ACTATAGGGG--AATT-GTGAG-CGGA-T  52
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Query_63  99    TATAC-ATATG--CACCAT-CATCATCAT-CATTCTT-CT-GG-TGTAGAT-CTGTGGTC  149
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Query_63  150   TCAT-CC--G-CAGTTCG-AAAAGGGTA-CCGAGAA-CCTGTACTT-CCAAT-CCAATGC  200
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Query_63  201   C-CAGACATTTAAAGAATGGCAAGACCCGGAAATAAATGCCATCAACCGGGCACCGATGC  259
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96        160   .T.T..A....                                                   170
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84        149   .-..                                                          151
59        144   .-.....                                                       149
90        149   .-..                                                          151
82        150   .-..                                                          152
111       152   .                                                             152
94        163   .T.T..A....                                                   173
112       156   .                                                             156
100       151   .-..                                                          153
95        161   .T.T..A....                                                   171
102       160   .                                                             160
80        152   .-.                                                           153
29        148   .-A..                                                         151
97        162   .T.T..A....                                                   172
72        151   .-.....                                                       156
104       163   .                                                             163
74        146   .-.....                                                       151
61        138   .-.....                                                       143
76        150   .-.                                                           151
78        148   .-.                                                           149
99        144   .-..                                                          146
91        145   .-..                                                          147
114       168   .-.....                                                       173
87        799   .                                                             799
122       905   .-A...                                                        901
101       157   .-..N.T..                                                     164
137       915   .-..                                                          913

Query_63  260   ACGCAAACTTCTTTGCGTACGAAAATGCAGAAATGGCTGCCAAAGCAGTCAAGGAAGACT  319

Query_63  320   CCAAGAACTTTATGAGCCTGAATGGAACCTGGAAATTCTTCTGGGTGCGGAATGCAGATG  379

Query_63  380   CACGCCCCACGGATTTCTGGAAAACCGGCTTCAACGATAAAGGTTGGGACAACCTTCAGG  439

Query_63  440   TGCCGGGAGTATGGGAAACTCACGGATACGGCGACCCTATCTACATCAACGTAGGCTACG  499

Query_63  500   GATGGCGCAGCCGTTTCGAGAACAATCCTCCTTACGTACCGACTGAAGAAAACCACGTAG  559
70        477                 ...A.A..G........GCTG.....TTA..C...G...G.A....  522
72        476                 ...A.A..G........GCTG.....TTA..C...G...G.A....  521
114       493                 ...A.A..G........GCTG.....TTA..C.N.G...G.A....  538

Query_63  560   GTTCTTACCGTCGTGAAATTATGGTTCCGGCCGACTGGAAAGGCAAAGACATCATCGCTC  619
70        523   .......T..C...ACGT.C.C......T..T..........                    564
72        522   .......T..C...ACGT.C.C......T..T..........                    563
114       539   .......T..C...ACGT.C.C......T..T..........                    580

Query_63  620   ATTTTGGTGCAGTCAGCTCAAACATGTACCTGTGGGTAAACGGTAAGTTCGTTGGCTACA  679

Query_63  680   GCGAAGACAGCAAGCTGGAAGCTGAATTCAACCTGACTCCGTACCTGAAACCGGGACAGA  739

Query_63  740   AAAACCTGATTGCTTTCCAGGTGTTCCGCTGGTGTGACGGTTCATACCTGGAAGACCAGG  799

Query_63  800   ACTTCTTCCGCTATACCGGAGTAGCACGCGACTGCTATCTTTATACCCGCAACAAAAAAC  859
63        773                                                    ....G.T....  783
106       785                                                    ....G.T....  795
108       785                                                    ....G.T....  795
65        778                                                    ....G.T....  788
109       780                                                    ....G.T....  790
107       772                                                    ....G.T....  782

Query_63  860   GTATCGATGACATCCGCGTGACTCCCGACCTGGACAGCGAATACAAGAACGGTTCACTGG  919
63        784   ........                                                      791
106       796   ........                                                      803
108       796   ........                                                      803
65        789   ........                                                      796
109       791   ........                                                      798
107       783   ........                                                      790

Query_63  920   CCATCAACCTGAACCTGAAAGGAAGCGGCAATGTCAGCCTGGAACTGCTGGATGCCCAAA  979
121       188                                           ..............        175
33        262                                           ..............        275

Query_63  980   ACCAGACCGTAGCTTCTACCGAAGTAAAAGGTTCAGGCAATGTTTCTACTACACTTCAGG  1039

Query_63  1040  TAGAAAATCCGAAAAAATGGAGCGCAGAAACTCCTTACTTATACACACTGCGTGCTACAC  1099

Query_63  1100  TGAAAGACGGTAGCCAGGCTAGCGAAGTTGTACCTGTGAAAGTAGGTTTCCGCAAGATTG  1159

Query_63  1160  AACTCAAAAACGCACAGATTCTGGTCAACGGCCAGCCTGTACTTTTCAAAGGTGCCGACC  1219

Query_63  1220  GTCATGAACTGGACCCGGACGGTGGATACGTAGTTTCACGCGACCGCATGATTCAGGACA  1279

Query_63  1280  TTCAGATTATGAAGCAGTTCAACATCAACGCCGTAAGAACCTGTCACTATCCGGACGACA  1339

Query_63  1340  ACTTCTGGTACGAACTCTGCGACAAATACGGTATTTATGTAGTGGCTGAAGCCAACATCG  1399

Query_63  1400  AATCTCACGGAATGGGATACGGCGACAAGACACTGGCCAAGGAACCGACTTATAAAAAGG  1459

Query_63  1460  CACACATGGAACGCAACCAGCGCAACGTACAGCGTGGTTTCAACCATCCGAGCATCATCT  1519

Query_63  1520  TCTGGTCATTGGGTAACCAGGCCGGATACGGTCCGAACTTCGAAGCTGCTTACGACTGGA  1579

Query_63  1580  TCAAGGCAGAAGACCCCAGCCGTGCCGTACAATACGAACAGGCCCGCATCGAAGGAAAGA  1639

Query_63  1640  CTGATATCTACTGCCCGATGTATGCCAACTACAAATGGTGCGAAGAATACAGCAAGGACG  1699

Query_63  1700  ATAAATACCAGAAACCGCTGATTCAGTGTGAATATGCACACGCCATGGGTAATTCACAAG  1759

Query_63  1760  GTGGATTCAAGGAATACTGGGACCTGATTCGCAAGTATCCGAAATATCAGGGTGGATTCA  1819

Query_63  1820  TCTGGGACTTCGTAGACCAGTCTATCCGCTGGACAGGAAAGAACGGCAAGATGATTTATG  1879

Query_63  1880  CTTATGCCGGCGACTTCAACCGTATGGATGATTCTGGCGACAAGAACTTCTGTAACAACG  1939

Query_63  1940  GACTTATCAGCCCTGACCGTAAACCGAATCCGCATGCATACGAAGTACAGTACTTCTACC  1999

Query_63  2000  AGAACATCTGGACTACTCCGGGCGATTTGGCAAAGGGAGAAATCAAGGTATACAACGAAA  2059

Query_63  2060  ACTTCTTCCGTGACCTGTCTGCATACGCACTGGAATGGGAAG-TACTGAAAGATGGT-AA  2117
77        1215                                      ..A...-NN......N.....-.N  1194
81        1210                                      ......A....TN.....N..T..  1187

Query_63  2118  GGCTATCCGTAGCGGACGCATTGAAAACCTGAACGT-GGCACCTCATCAGACTGCCAGCC  2176
77        1193  .NNNT--........NGC.N.G....--.....NC.-NNN...NN.......N......T  1139
81        1186  ..............NN.NTN------.N...NNN..T..........TCNNN........  1133

Query_63  2177  TGAAACTTGATCTGGGC-AAGACTTGC-CAG-TGT---GGTGAATGGCTGC-TCAACG-T  2228
77        1138  .NNNC--....N.....C.........-.CA-GNN---N.......-....-......-.  1089
79        1121                       ...G..-...G.AN---......AT.....-...N..-.  1089
81        1132  ..N.N--.....N.N---...N..-..-...-...---..-.TGNN....N-......-.  1087
75        1147                  .-........NN...-N..TNG.......N.....N...N..G.  1106

Query_63  2229  GAAA--TACA-TCCA-GAAGAACCGTGAAGGTTTGAT-CCCGGCCGG--TTTTGTA-GTA  2280
77        1088  ....--....-..AN-.......-.........-..N-.......CN--N......-...  1039
79        1088  ....A-....-.T..-....NN.......N...-..N-..-......--.......-...  1038
81        1086  ....A-N.N.A....-....NN--.........-...-....N...N--...-...-...  1037
75        1105  ....ATNN.N-....N..................N..N....N....NT.......A...  1047

Query_63  2281  GCTAAA--GACCAGCTTGT-GCTGAA--T-CCATACAAA-GCACCGGCTATGGAACTGAA  2333
77        1038  ......A-N..........-......--.-.........-...............N....  985
79        1037  ......--...........-......--.T.........-..N.................  984
81        1036  .....---.N......-..-......--.-...NT.N..-....................  986
75        1046  ......AGN....N...N.T....G.AT.-.........A....................  988

Query_63  2334  GAACGTAGTTGAAACTAA-CCAGCAGGTAGTTGAACCGCAAATCAACCCGAACTATCCGG  2392
77        984   .........-........-............-............................  928
79        983   ..................-............-............................  926
81        985   .................NN.........................................  926
75        987   ..................-.........................................  929

Query_63  2393  ACTACATCACTGTAGAA-GGCGACGGA-TTCTATCTGGAATTCAGCAAACGCAACGGTTA  2450
77        927   .................A.........-................................  869
79        925   .................-.........-................................  868
81        925   .................-.........-................................  868
75        928   .................-........NN....................-...........  871

Query_63  2451  TCTTGACAGATACGATGTAAACGGAGTAAGCATGTTGAAAGAAGGCGAAGCACTGACACC  2510
77        868   ............................................................  809
79        867   ...................................-........................  809
81        867   ...-........................................................  809
75        870   ............................................................  811

Query_63  2511  GAACTTCTGGCGTGCCCCGACCGACAACGACTTCGGTGCTGGTCTGCAGAACAAATATGC  2570
77        808   ............................................................  749
79        808   ............................................................  749
81        808   ............................................................  749
75        810   ............................................................  751

Query_63  2571  TGCATGGAAGAACCCGGGCATCAAACTGACAGACTTCAACTACAAGGTAGAAAACGGACA  2630
77        748   ............................................................  689
79        748   ............................................................  689
81        748   ............................................................  689
75        750   ............................................................  691

Query_63  2631  GGCCATCGTAAACTCTACTTACGACCTCAAGGAAGTATCTGCCAAGTTGTATCTCACTTA  2690
77        688   ............................................................  629
79        688   ............................................................  629
81        688   ............................................................  629
75        690   ............................................................  631

Query_63  2691  CCAGATCAACAACCAGGGAGCAGTGAAAGTGACACAGAAAATGGTAGCCGACAAGAATGC  2750
77        628   ............................................................  569
79        628   ............................................................  569
81        628   ............................................................  569
75        630   ............................................................  571

Query_63  2751  CAAGGTATCACCGATGTTCCGTTTCGGTATGCAGATGGTAATGCCGAAGTCATTTGAAAA  2810
77        568   ............................................................  509
79        568   ............................................................  509
81        568   ............................................................  509
75        570   ............................................................  511

Query_63  2811  GATTTCTTACTACGGACGCGGTCCGATAGAAAACTACAGCGACCGTAACCATTGCACTGA  2870
77        508   ............................................................  449
79        508   ............................................................  449
81        508   ............................................................  449
75        510   ............................................................  451

Query_63  2871  CCTGGGAATCTACAACCAGAATGTAAGCGACCAGTTCTATCCGTACATCCGTCCGCAGGA  2930
77        448   ............................................................  389
79        448   ............................................................  389
81        448   ............................................................  389
75        450   ............................................................  391

Query_63  2931  AAACGGCAACAAGACTGACATCCGCTGGTGGAAACAGGTAAACATGGCTGGAAACGGACT  2990
77        388   ............................................................  329
79        388   ............................................................  329
81        388   ............................................................  329
75        390   ............................................................  331

Query_63  2991  GATGTTCGTAGCTGAAGCACCGTTCTCTGCTTCTGCTCTCCACTACACCATCGCTTCACT  3050
77        328   ............................................................  269
79        328   ............................................................  269
81        328   ............................................................  269
75        330   ............................................................  271

Query_63  3051  GGACGACGGTACTGAAAAGAAACAGAGCCACTCGTTCGAAGTAGAAGAAGCCGACCTGAC  3110
77        268   ............................................................  209
79        268   ............................................................  209
81        268   ............................................................  209
75        270   ............................................................  211

Query_63  3111  CAACCTGTTGATTGACAAGGCACAGATGGGCTTAGGTTGTGTCAACAGCTGGGGTGCCCT  3170
77        208   ............................................................  149
79        208   ............................................................  149
81        208   ............................................................  149
75        210   ............................................................  151

Query_63  3171  GCCGGAAGACAAGTACATGCTTCCTTACGGAGATTATGAATTTACGTTCATCATGACTCC  3230
77        148   ............................................................  89
79        148   ............................................................  89
81        148   ............................................................  89
75        150   ............................................................  91
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Query_63  3231  GGTGAAAGGCTATATCGCACACGAATAACATTGGAAGTGGATAACGGATCCGAATTCGAG  3290
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Query_63  3291  CTCCGTCGA-CAAGCTT-GCGGCCG-CACT-CGAGcaccaccaccaccacca-cT-G-AG  3343
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Query_63  3344  A-T-CCGGCTGCTAACAAAG-CCC--G--AAAGGAAGC-TGAGTTGGC-TG-CTGCCACC  3393
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Query_63  3394  GCTGAGCAATAAC-TAG-CA-TAAC-C-CCTT-GGGGCCTCTAAACGGGTCTT--GAGG-  3444
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Query_63  3445  GG--TTTTTTGCTGAAA  3459
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Query_64  150   TCAT-CC--G-CAGTTCG-AAAAGGGTA-CCGAGAA-CCTGTACTT-CCAAT-CCAATGC  200
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78        97    ....-..--.-.......-.........-.......-.........-.....-.......  147
99        93    ....-..--.-.......-.........-.......-.........-.....-.......  143
91        94    ....-..--.-.......-.........-.......-.........-.....-.......  144
114       117   ....-..--.-......T-N........-.......-.........-.....-.......  167
87        856   ....-..CGC-.......A.........C.......-.........C.....C.......  800
122       957   ....-..--.N.......A.........-.......-.........--.N..-.......  906
101       106   ..C.-G.T-.-.T..-..-.TG......-.......-.........-.....-.......  156
137       969   ..N.T..--.-.....N.-......N..-.......-..N......N.....N.....N.  916

Query_64  201   C-CAGACATTTAAAGAATGGCAAGACCCGGAAATAAATGCCATCAACCGGGCACCGATGC  259
117       646   .-A..T..                                                      640
83        812   .-G.A.A...                                                    804
85        812   .                                                             812
110       154   .-G.A.A...                                                    162
105       160   .                                                             160
93        162   .-..                                                          164
86        152   .-..                                                          154
98        164   .-..                                                          166
96        160   .T.T..A....                                                   170
9         155   .                                                             155
103       162   .                                                             162
89        153   .-..                                                          155
70        152   .-.....                                                       157
17        149   .-A..                                                         152
84        149   .-..                                                          151
59        144   .-.....                                                       149
90        149   .-..                                                          151
82        150   .-..                                                          152
111       152   .                                                             152
94        163   .T.T..A....                                                   173
112       156   .                                                             156
100       151   .-..                                                          153
95        161   .T.T..A....                                                   171
102       160   .                                                             160
80        152   .-.                                                           153
29        148   .-A..                                                         151
97        162   .T.T..A....                                                   172
72        151   .-.....                                                       156
104       163   .                                                             163
74        146   .-.....                                                       151
61        138   .-.....                                                       143
76        150   .-.                                                           151
78        148   .-.                                                           149
99        144   .-..                                                          146
91        145   .-..                                                          147
114       168   .-.....                                                       173
87        799   .                                                             799
122       905   .-A...                                                        901
101       157   .-..N.T..                                                     164
137       915   .-..                                                          913

Query_64  260   ACGCAAACTTCTTTGCGTACGAAAATGCAGAAATGGCTGCCAAAGCAGTCAAGGAAGACT  319

Query_64  320   CCAAGAACTTTATGAGCCTGAATGGAACCTGGAAATTCTTCTGGGTGCGGAATGCAGATG  379

Query_64  380   CACGCCCCACGGATTTCTGGAAAACCGGCTTCAACGATAAAGGTTGGGACAACCTTCAGG  439

Query_64  440   TGCCGGGAGTATGGGAAACTCACGGATACGGCGACCCTATCTACATCAACGTAGGCTACG  499

Query_64  500   GATGGCGCAGCCGTTTCGAGAACAATCCTCCTTACGTACCGACTGAAGAAAACCACGTAG  559
70        477                 ...A.A..G........GCTG.....TTA..C...G...G.A....  522
72        476                 ...A.A..G........GCTG.....TTA..C...G...G.A....  521
114       493                 ...A.A..G........GCTG.....TTA..C.N.G...G.A....  538

Query_64  560   GTTCTTACCGTCGTGAAATTATGGTTCCGGCCGACTGGAAAGGCAAAGACATCATCGCTC  619
70        523   .......T..C...ACGT.C.C......T..T..........                    564
72        522   .......T..C...ACGT.C.C......T..T..........                    563
114       539   .......T..C...ACGT.C.C......T..T..........                    580

Query_64  620   ATTTTGGTGCAGTCAGCTCAAACATGTACCTGTGGGTAAACGGTAAGTTCGTTGGCTACA  679

Query_64  680   GCGAAGACAGCAAGCTGGAAGCTGAATTCAACCTGACTCCGTACCTGAAACCGGGACAGA  739

Query_64  740   AAAACCTGATTGCTTTCCAGGTGTTCCGCTGGTGTGACGGTTCATACCTGGAAGACCAGG  799

Query_64  800   ACTTCTTCCGCTATACCGGAGTAGCACGCGACTGCTATCTTTATACCCGCAACAAAAAAC  859
63        773                                                    ....G.T....  783
106       785                                                    ....G.T....  795
108       785                                                    ....G.T....  795
65        778                                                    ....G.T....  788
109       780                                                    ....G.T....  790
107       772                                                    ....G.T....  782

Query_64  860   GTATCGATGACATCCGCGTGACTCCCGACCTGGACAGCGAATACAAGAACGGTTCACTGG  919
63        784   ........                                                      791
106       796   ........                                                      803
108       796   ........                                                      803
65        789   ........                                                      796
109       791   ........                                                      798
107       783   ........                                                      790

Query_64  920   CCATCAACCTGAACCTGAAAGGAAGCGGCAATGTCAGCCTGGAACTGCTGGATGCCCAAA  979
121       188                                           ..............        175
33        262                                           ..............        275

Query_64  980   ACCAGACCGTAGCTTCTACCGAAGTAAAAGGTTCAGGCAATGTTTCTACTACACTTCAGG  1039

Query_64  1040  TAGAAAATCCGAAAAAATGGAGCGCAGAAACTCCTTACTTATACACACTGCGTGCTACAC  1099

Query_64  1100  TGAAAGACGGTAGCCAGGCTAGCGAAGTTGTACCTGTGAAAGTAGGTTTCCGCAAGATTG  1159

Query_64  1160  AACTCAAAAACGCACAGATTCTGGTCAACGGCCAGCCTGTACTTTTCAAAGGTGCCGACC  1219

Query_64  1220  GTCATGAACTGGACCCGGACGGTGGATACGTAGTTTCACGCGACCGCATGATTCAGGACA  1279

Query_64  1280  TTCAGATTATGAAGCAGTTCAACATCAACGCCGTAAGAACCTGTCACTATCCGGACGACA  1339

Query_64  1340  ACTTCTGGTACGAACTCTGCGACAAATACGGTATTTATGTAGTGGCTGAAGCCAACATCG  1399

Query_64  1400  AATCTCACGGAATGGGATACGGCGACAAGACACTGGCCAAGGAACCGACTTATAAAAAGG  1459

Query_64  1460  CACACATGGAACGCAACCAGCGCAACGTACAGCGTGGTTTCAACCATCCGAGCATCATCT  1519

Query_64  1520  TCTGGTCATTGGGTAACGAGGCCGGATACGGTCCGAACTTCGAAGCTGCTTACGACTGGA  1579

Query_64  1580  TCAAGGCAGAAGACCCCAGCCGTGCCGTACAATACGAACAGGCCCGCATCGAAGGAAAGA  1639

Query_64  1640  CTGATATCTACTGCCCGATGTATGCCAACTACAAATGGTGCGAAGAATACAGCAAGGACG  1699

Query_64  1700  ATAAATACCAGAAACCGCTGATTCAGTGTCAGTATGCACACGCCATGGGTAATTCACAAG  1759

Query_64  1760  GTGGATTCAAGGAATACTGGGACCTGATTCGCAAGTATCCGAAATATCAGGGTGGATTCA  1819

Query_64  1820  TCTGGGACTTCGTAGACCAGTCTATCCGCTGGACAGGAAAGAACGGCAAGATGATTTATG  1879

Query_64  1880  CTTATGCCGGCGACTTCAACCGTATGGATGATTCTGGCGACAAGAACTTCTGTAACAACG  1939

Query_64  1940  GACTTATCAGCCCTGACCGTAAACCGAATCCGCATGCATACGAAGTACAGTACTTCTACC  1999

Query_64  2000  AGAACATCTGGACTACTCCGGGCGATTTGGCAAAGGGAGAAATCAAGGTATACAACGAAA  2059

Query_64  2060  ACTTCTTCCGTGACCTGTCTGCATACGCACTGGAATGGGAAG-TACTGAAAGATGGT-AA  2117
77        1215                                      ..A...-NN......N.....-.N  1194
81        1210                                      ......A....TN.....N..T..  1187

Query_64  2118  GGCTATCCGTAGCGGACGCATTGAAAACCTGAACGT-GGCACCTCATCAGACTGCCAGCC  2176
77        1193  .NNNT--........NGC.N.G....--.....NC.-NNN...NN.......N......T  1139
81        1186  ..............NN.NTN------.N...NNN..T..........TCNNN........  1133

Query_64  2177  TGAAACTTGATCTGGGC-AAGACTTGC-CAG-TGT---GGTGAATGGCTGC-TCAACG-T  2228
77        1138  .NNNC--....N.....C.........-.CA-GNN---N.......-....-......-.  1089
79        1121                       ...G..-...G.AN---......AT.....-...N..-.  1089
81        1132  ..N.N--.....N.N---...N..-..-...-...---..-.TGNN....N-......-.  1087
75        1147                  .-........NN...-N..TNG.......N.....N...N..G.  1106

Query_64  2229  GAAA--TACA-TCCA-GAAGAACCGTGAAGGTTTGAT-CCCGGCCGG--TTTTGTA-GTA  2280
77        1088  ....--....-..AN-.......-.........-..N-.......CN--N......-...  1039
79        1088  ....A-....-.T..-....NN.......N...-..N-..-......--.......-...  1038
81        1086  ....A-N.N.A....-....NN--.........-...-....N...N--...-...-...  1037
75        1105  ....ATNN.N-....N..................N..N....N....NT.......A...  1047

Query_64  2281  GCTAAA--GACCAGCTTGT-GCTGAA--T-CCATACAAA-GCACCGGCTATGGAACTGAA  2333
77        1038  ......A-N..........-......--.-.........-...............N....  985
79        1037  ......--...........-......--.T.........-..N.................  984
81        1036  .....---.N......-..-......--.-...NT.N..-....................  986
75        1046  ......AGN....N...N.T....G.AT.-.........A....................  988

Query_64  2334  GAACGTAGTTGAAACTAA-CCAGCAGGTAGTTGAACCGCAAATCAACCCGAACTATCCGG  2392
77        984   .........-........-............-............................  928
79        983   ..................-............-............................  926
81        985   .................NN.........................................  926
75        987   ..................-.........................................  929

Query_64  2393  ACTACATCACTGTAGAA-GGCGACGGA-TTCTATCTGGAATTCAGCAAACGCAACGGTTA  2450
77        927   .................A.........-................................  869
79        925   .................-.........-................................  868
81        925   .................-.........-................................  868
75        928   .................-........NN....................-...........  871

Query_64  2451  TCTTGACAGATACGATGTAAACGGAGTAAGCATGTTGAAAGAAGGCGAAGCACTGACACC  2510
77        868   ............................................................  809
79        867   ...................................-........................  809
81        867   ...-........................................................  809
75        870   ............................................................  811

Query_64  2511  GAACTTCTGGCGTGCCCCGACCGACAACGACTTCGGTGCTGGTCTGCAGAACAAATATGC  2570
77        808   ............................................................  749
79        808   ............................................................  749
81        808   ............................................................  749
75        810   ............................................................  751

Query_64  2571  TGCATGGAAGAACCCGGGCATCAAACTGACAGACTTCAACTACAAGGTAGAAAACGGACA  2630
77        748   ............................................................  689
79        748   ............................................................  689
81        748   ............................................................  689
75        750   ............................................................  691

Query_64  2631  GGCCATCGTAAACTCTACTTACGACCTCAAGGAAGTATCTGCCAAGTTGTATCTCACTTA  2690
77        688   ............................................................  629
79        688   ............................................................  629
81        688   ............................................................  629
75        690   ............................................................  631

Query_64  2691  CCAGATCAACAACCAGGGAGCAGTGAAAGTGACACAGAAAATGGTAGCCGACAAGAATGC  2750
77        628   ............................................................  569
79        628   ............................................................  569
81        628   ............................................................  569
75        630   ............................................................  571

Query_64  2751  CAAGGTATCACCGATGTTCCGTTTCGGTATGCAGATGGTAATGCCGAAGTCATTTGAAAA  2810
77        568   ............................................................  509
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81        568   ............................................................  509
75        570   ............................................................  511

Query_64  2811  GATTTCTTACTACGGACGCGGTCCGATAGAAAACTACAGCGACCGTAACCATTGCACTGA  2870
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75        510   ............................................................  451

Query_64  2871  CCTGGGAATCTACAACCAGAATGTAAGCGACCAGTTCTATCCGTACATCCGTCCGCAGGA  2930
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81        448   ............................................................  389
75        450   ............................................................  391

Query_64  2931  AAACGGCAACAAGACTGACATCCGCTGGTGGAAACAGGTAAACATGGCTGGAAACGGACT  2990
77        388   ............................................................  329
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75        390   ............................................................  331

Query_64  2991  GATGTTCGTAGCTGAAGCACCGTTCTCTGCTTCTGCTCTCCACTACACCATCGCTTCACT  3050
77        328   ............................................................  269
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75        330   ............................................................  271

Query_64  3051  GGACGACGGTACTGAAAAGAAACAGAGCCACTCGTTCGAAGTAGAAGAAGCCGACCTGAC  3110
77        268   ............................................................  209
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75        270   ............................................................  211

Query_64  3111  CAACCTGTTGATTGACAAGGCACAGATGGGCTTAGGTTGTGTCAACAGCTGGGGTGCCCT  3170
77        208   ............................................................  149
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81        208   ............................................................  149
75        210   ............................................................  151

Query_64  3171  GCCGGAAGACAAGTACATGCTTCCTTACGGAGATTATGAATTTACGTTCATCATGACTCC  3230
77        148   ............................................................  89
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90        250                             ...............                     264
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Query_64  3231  GGTGAAAGGCTATATCGCACACGAATAACATTGGAAGTGGATAACGGATCCGAATTCGAG  3290
77        88    .............................................--.....          39
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8         137                         ......................................  100
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15        61                             ....................--.....          37
20        65                             ....................--.....          41
18        65                             ....................--.....          41

Query_64  3291  CTCCGTCGA-CAAGCTT-GCGGCCG-CACT-CGAGcaccaccaccaccacca-cT-G-AG  3343
83        92    .........-.......-.......-....-....---..............-..-.-..  43
85        95    .........-.......-.......-....-.....................-..-.-..  43
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40        96    .........-.......-.......-....-.....................-..-.-..  44
26        98    .........-.......-.......-....-.....................-..-.-..  46
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5         98    .........-......N-.......-....-.....................-..-.-..  46
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69        93    .........-....NN.-.......-....-....---..............-..-.-..  44
66        92    TC.T..G.N-.C.A.CG-A..CAA.-....-.........T.....N.....-N.-N-..  40

Query_64  3344  A-T-CCGGCTGCTAACAAAG-CCC--G--AAAGGAAGC-TGAGTTGGC-TG-CTGCCACC  3393
77        43    .-.-................-...--.--...-.....                        14
79        43    .-.-................-...--.--....A....                        13
81        43    .-.-................-...--.--...A...                          15
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23        929   .-.-..........T.....-...--.--.........-...-N....-..-....G...  977
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42        43    .-.-................-...--.--....N.G..                        13
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64        44    .-.-................-...--.--...A...                          16
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56        45    .-.-................-...--.--...A...                          17
14        45    .-.-................-...--.--...                              21
116       40    .-.-................-...--.--....A.N..                        10
0         44    .-.-................-...--.--...A...                          16
46        46    .-.-................-...--N--...                              22
30        43    .-.-................-...--.--...                              19
28        45    .-.-................-...G-.--...N...                          16
12        48    .-.-................C...--.--...N...                          19
3         45    .-.-................-...--.--...A...                          17
88        30    .-.-..........T.....-...--.--....                             5
31        46    .-.-................-...--.N-.....                            19
24        45    .-.-........N.......-...--.--.....                            19
5         45    .-.-................C...--.--...A...                          16
34        47    .T.-................-...--.A-.......                          17
62        48    .-.-................-...                                      28
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Query_64  3394  GCTGAGCAATAAC-TAG-CA-TAAC-C-CCTT-GGGGCCTCTAAACGGGTCTT--GAGG-  3444
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Query_64  3445  GG--TTTTTTGCTGAAA  3459
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Effective search space used: 526744309


Query= CMR200137.120

Length=3144
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Query_65  1     TCTCG-ATCCCGCGAAATTAATAC-GACTC-ACTATAGGGG--AATT-GTGAG-CGGA-T  52
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Query_65  53    AAC-AA-TT-CCCC--T-C-TAGAAA-TAA-TTTT-GTTTAAC--TTTAAGAA-GGA-GA  98
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Query_65  99    TATAC-ATATG--CACCAT-CATCATCAT-CATTCTT-CT-GG-TGTAGAT-CTGTGGTC  149
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Query_65  150   TCAT-CC--G-CAGTTCG-AAAAGGGTA-CCGAGAA-CCTGTACTT-CCAAT-CCAATGC  200
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Query_65  201   CCAGACTGATAAGATTGACCTGGCCGGCTCGTGGACATTTTCTACGGACAGCATGGACTG  260
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96        160   .                                                             160
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17        149   .A..T..                                                       155
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80        152   ..                                                            153
29        148   .A..T..                                                       154
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97        162   .                                                             162
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Query_65  321   CGTGGGTACTGATTGGACGGGCGGTATTGTGGATTCTTCTTATTTCTTTAAACCTTCGTA  380
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Query_65  381   TGCCAAATACCGTGAGGCAGGAAATATCAAGGTACCTTTCTGGCTTCAGCCGGTAAAATA  440
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Query_65  441   TTACAAGGGTAAGGCGTGGTATCAGAAAGAGGTGGTGATTCCGGACAGTTGGGAAGGAAA  500
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Query_65  501   GGACATTTCTCTCTTTTTGGAACGATGCCATTGGGAGAGCCGTTTGTATATAGACGGAAA  560
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Query_65  561   GGAAATCGGCATGCAAAATGCTTTGGGGGCGCCCCATCGTTATGACCTGACAGGCAAGCT  620
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Query_65  621   TTCAG-CAGGGAAACATGTG-TTGATGCTGTGTGTAGACAA-TCGGGTGAAAAACATTGA  677
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Query_65  678   TCCGGGGGAGAACTCACATAGTATTTC-CGACCATACACAAGGAAACTGGAACGGGGTG-  735
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Query_65  736   GTAGGC-GATATGTTCCTGGAAGTAAAGCC-GG-AAGTGAATGTGTC-TTCCGTCAAGAT  791
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Query_65  792   TATGCCGGAGCGTCTGGCTAAG-AAAGTCAGTGTGTCGGC-TT-CCTTGATGAACC-GTT  847
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Query_65  848   ATGAAAAAGA--TGCCAATGTGGTAC-TGGAGATGACGGTAGGTAATGAAAAAGTACAG-  903
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Query_65  904   --CAACAATG-TACGTTGAAGCCGGGC-GAAAATCAAGTGATGATGTCGCTGGCCATGAA  959
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Query_65  960   G--GGAGACA-TTAAGTGCTGGGATG-AGTTTTCTCCATCCTTATA-TGA-TTTGAAGCT  1013
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50        556   .TG..T.G..-....AA..A......-.....GNC..TA.AAC.C.-N.N-CN..C..T.  501

Query_65  1014  GAGTG-TGAAGGATGC-GG-ATAGCGGTGAAACG-GATGTC-TATG-CGGAACGTTTTGG  1067
61        959   N....T..........-..A..............T......T....N.......N.....  1017
59        957   ..T..                                                         961
48        505   .TCC.--....CCA..A..-.AG...TC...CAA-A.....-...N-...TT.TC...CA  452
50        500   .....-G...C...CA-..-.A....TC....A.-..G...-C...-...----....CA  451

Query_65  1068  -TT---TCCGTGAT-GTG-AAGGTGAAAGAC-GGCAAA-CTCACCATCAAC-GACCGCCG  1118
61        1018  T..---....NN..N...A...NN....N..-.                             1046
52        441                    .-..T......ATT-......-.........CC.-.T...TA-  404
48        451   -G.---..TC-..G-.N.-.....C....TT-.....GG.G..T..C.C-.-.T....N-  403
50        450   -.CCAG..NT...G-.A--..T......A.TT......-..G--.....C.C........  398
105       717               ..-...-.........                                  730
103       719               ..-...-.........                                  732
102       717               ..-...-.........                                  730
104       720               ..-...-.........                                  733

Query_65  1119  TTTG---TTCCTG--CGTGGTACGCTGG--AT-TGTGC--CGTATTTCCGAAGACCG-GT  1167
52        403   ....---GC.A.TTC....--.A.T...--GA-.A...ACN.C..........T...-..  353
48        402   -...---NC.A.TTC....--.A.T...GA.A-.NCA.--N.C..........N...T..  352
50        397   .G.CCAT.....-----..--.A.T...G-..A..CN.--N.C..............-..  349

Query_65  1168  TTCCCGCCCACGGATGTAGAATCCTGGAAAAAGATTTATACCACCTGTCGGCAGCACGGA  1227
52        352   ..T.NC..TNG...G..G.....N...G...-.....G.C..                    312
48        351   .....-.ATCG...N..G.....N.....TGTA......C.....ATAG......CG..G  293
50        348   ..T..C.ATNG...G..G.....G.....TGT.......-...GTCA........-...G  291

Query_65  1228  CTGAACCATGT------GCGCTTCCATTCCTGGTGTCCGCCCGAAGCTGCTTTTGCAGCT  1281
48        292   AG.....G...                                                   282
50        290   GA.CN......TGATAAT.AT..T.GCA...--.......----..GC........----  241

Query_65  1282  GCCGA-TGGGATGGGT----ATGTACCTGGAGATAGAATGTTCTTCCT-GGGCTAACCAG  1335
50        240   .AG..T...A...AN.CGAG.A..--.G..........AT.GG.C.A.CN...--.....  185

Query_65  1336  TCGACTACCATTGGCGATGGAGGCGATCTGGACCGCTTTATCTGGGAGGAAAGTGAACGC  1395
52        2                  ....-..........................................  47
48        2                  ....-..........................................  47
50        5                        .........................................  45
50        184   .NC.A...............T..........N...G..                        147

Query_65  1396  ATCGTCCGTGAGTTTGGTAACCATCCTTCTTTCTGCATGATGATGTACGGTAACGCTCCG  1455
52        48    ....................................T.............G....AAG..  107
48        48    ....................G..........G....T.............G......G..  107
50        46    ....................................T......G......G...CAGG..  105

Query_65  1456  GCTGGTGAGGGAAGTAATGCCTATCTGACTAATTTTGTTACTACCTGGAAAGAGCGCGAT  1515
52        108   ............................T.........A..A...G.N.....T.....C  167
48        108   .................A............C..............G..............  167
50        106   .A............A..A..........T.CC......AN.A...G.NCC...T...C.C  165

Query_65  1516  GCCCGCCGTTTATATTGTTCGGGTGCCGGATGGCCCAATTTGCCGGTTAACGACTTCTTG  1575
52        168   .......AA.GG.....NA.T............A.......CTATC....G.........  227
48        168   ........-.GG.....NA.T....................CTATC.CC.G...C..AC.  226
50        166   CAT....AA.GG.....NA.T......N.....A.......-.TATC.CC........C.  224

Query_65  1576  AGCGATTCCAATCCTCGTATTCAGGCGTGGGGACAAGGTGTGAAGAGTATTATCAACGCA  1635
52        228   .NTC.....N....CT.C....NC..C.TC......ACACC...A.TG.........NTG  287
48        227   CAT....T.N....CT.C.AA.GN.....C....G.....C...A.TG.........A.G  286
50        225   .NTC.............C.AAAGC..C..C..........C...A.TG........--..  282

Query_65  1636  CAG-GCTCCGCG--TACCGACTATGACTGGTCAGAATACATCGGACGTTTCCAGCAGCCG  1692
52        288   ...-.....C..--G.TGC........G..A..-...CTT..CC.N.A.....C.TC..N  343
48        287   GTT-C....C..GC.G..--.....GTG..AT.A.T.....TCC.N.A.....CNTC...  343
50        283   TG.N.....C..---G.T.C.G........AT.A.TC....TCC...A.....C.TC..N  339

Query_65  1693  ATGGTGAGCCACGAAATCGGGCAGTGGTGTGTATATCCCAACTTCAAGGAAATGGCCAAA  1752
52        344   .G..N..AAAC..G.C.TC..A.A..CN...C..............C.............  403
48        344   ....G..AA....GNC.TC..A.A..CN...N..T...........C........N...N  403
50        340   ....G..AAAC..GTC.TC..A.A..CN.N.C.......................----.  395

Query_65  1753  TAC-GACG---GGG-TGATGC-GCCCGCGTAATTTTGAGATATTCCAGGAAACACTGGCT  1806
52        404   ...G....---...A..G..A-.TTT..-C......C.C..TC...TC.CT.......N.  458
48        404   GCG-....---...-......-...TTGCC..C.....CC.TCN..TC..G.-....AAA  456
50        396   C..-.G..GTC...-......A.TTT..CA.T....C.C..-....-TC..NG.....A.  451

Query_65  1807  GAAAACGGTATGGCACATTTGGCT-GACAGCTTCCTGCTGGCTTCCGGAAAATTGCAGG-  1864
5         1229                                                     ........G  1221
52        459   ..NNT.C.N....AC.T....TT.-...NNT.........CT.C..A..C.......N.-  516
48        457   ..G...C.N..A.-......T.T.C...GC...................C.......NA-  514
50        452   ......C.C....                                                 464

Query_65  1865  CGTTGTGTTATA-AGGCCGATATCGAAGCTGCTTTGCGTAC---AAAAGACTT-CGGTGG  1919
0         1183                               ...N.N....TA---C........T....T.  1156
5         1220  ........-...TNNNN...AN.N...NN.N.C...N....---...NNNNN.-......  1166
14        1195                   ...AN........N...N......---...N.NN.--......  1158
3         1196                       .............G.....TNCA.........-.....A  1159
52        517   TCN......                                                     525
48        515   TCA......GA.-G..N.A.AC..ATCC.........A.G.---CNC.C.TCN-...C..  569

Query_65  1920  -ATTCCA--GTTACTGGGCTTGTCTGATTTCCCGGGGC-AGGGTACGG-CTTTG-G-TA-  1971
0         1155  -...N..--..N.....-..A........N......-.-.A......--...G.-T-A.-  1107
5         1165  G......--.....NTNN..GN.NN..........A..N..N.....A-N....A.-..A  1110
14        1157  -.N.NA.--..-...NNNNN......N..C.....NNA-...-.....-NC...-.-.T-  1108
12        1147       ..--.......NNTN.-..-.......N.A..N-.A.......-NN...-.-..-  1102
3         1158  -.NNN-.--.N-..NN.-..N..TNN.A.NN...N.NN-N.N--....G.N.G.-.-..-  1111
48        570   -..NA..TCT.C...T.--.........CGG.TT....-.....-T..-.....-NACT-  621

Query_65  1972  GGAG-TGC-TCGAT-GCG-T-TCTGGGAAG--AAAAA-GGCTA-CA-T-CCGTCC-GGAA  2019
0         1106  ....-...-NN...-N..A.-...T....AGA.....-.....-..-.T......C....  1054
5         1109  ....N...C.....-...-.N.........N-.....-.....-..-.T......-.-..  1058
14        1107  A...ANN.-.NNNNN...-G-.........--.....-.....A..N.-.G....-....  1056
12        1101  ....-...-.....-...-.--..T.....--.....A.....-.N-.-T.....-N...  1054
3         1110  A.NA-GN.-.....-...-A-........AGA.....-.....-..-.-......-....  1061
48        622   T..T-..T-.AC..-..C-G-.....T.C.--.....-N.A..                   656

Query_65  2020  GAATA-CCGTCGTTTCTGT-AATAGTACGGTACCATTACTGCGC-TTGCCGAAG-TTGAT  2075
0         1053  .....-.............N..........N.....-.......C.........-.....  997
5         1057  ...NN-......G...NN.-........................-.........-.....  1002
14        1055  .....-..........NN.-.......................G-N........-.-...  1001
12        1053  ...AN-AN......-....-.........-.N............-....NN.-.-....N  1001
3         1060  .....A.....CG......-...........N............-.-.......G.....  1004
48        695                             ..N..G..T.........-...A.NC.C-.....  726

Query_65  2076  TTATACC-AACCAGG-AAACGGTGAAA-GGAAGTCTGGAA-GTGGCACATTTCGGAGCTG  2131
0         996   .......-.......-...........-A...........-...-......CG.A.....  942
5         1001  .......-.......G...........-............-...................  945
14        1000  .......C.......-......NN..G-.A..........A...................  943
12        1000  .-.....-.-....--...........-......N.....-...................  948
3         1003  ....C..-....CA.-G..........A.........N..-.....N....-........  948
48        727   .                                                             727

Query_65  2132  CT-CCGCTGGAGG-TG-ACTTCT-ACTGTCTGGACCC-TG-AAAAC--AAAAG--AA-GG  2180
0         941   ..-..........-..-......-.............-..-.....--.....--..-..  893
5         944   ..T....N.....G..-......-.............-..-.....--.....--..-..  894
14        942   ..-..........-..N......-.............-..-...-.--.....--..A..  893
12        947   ..-....N.....-..-......T.............-..-.....--.....--..-..  898
3         947   ..-..........-..-......-........N....-..-....ACA.....--..A..  896
88        924                                 .......C..N.....--....NGA..-..  898

Query_65  2181  AAAG-ACAATTGCTT-CGGG-CACGCTGGCACA-CCAG-CC-GG-TAGGTAT-CGGCAAT  2232
0         892   ....-....N.....-....-............-....-..-..-.......-.......  841
5         893   ....-..........-...C-............-....-..C..-.......-.......  841
14        892   ....-..........-....-.......-....-....-..-..-.......-.......  842
12        897   ....-..........T....-............-....-..-..-.......-.......  845
3         895   ....-..........-....-............-....-..-..-.......-.......  844
88        897   ....G......NA..T....A..N.........N....A..-..N..N..T.T......N  839

Query_65  2233  TGT-ATTCCGTTGGGGCAGCTGGAGA-TTCC-ATTGGATAAGG-TGGACGTCCC--TTCA  2286
0         840   ...-......................-....-...........-..........--....  787
5         840   ...-......................-....-...........-..........--....  787
14        841   ...-......................-....-...........-..........--....  788
12        844   ...-......................-....-...........-..........--....  791
3         843   ...-......................-....-...........-..........C-....  789
88        838   .N.TN....N.G............NNG....N..G......N.N..........CT....  779

Query_65  2287  -TGTCTGA-CACTGGAAGCTACATT-GGGAGATTACGCCAA-CAGCTGGCACATCTGGGT  2342
0         786   -.......-................-...............-..................  731
5         786   -.......-................-.......-.......-..................  732
14        787   -.......-................-...............-..................  732
12        790   -.......-................-...............-..................  735
3         788   -.......-................-...............A..................  732
88        778   N.N.....N........N.......T...............-..................  720

Query_65  2343  ATATCCTGCTGCGGTACA-GAAAGTAGCTGATGAA-GCACAATTGCTGATGACCGACCGT  2400
0         730   ..................-................-........................  673
5         731   ..................-................-........................  674
14        731   ..................-................-........................  674
12        734   ..................-................-........................  677
3         731   ..................-................-........................  674
88        719   ..N..T............N................A........................  660
137       171                                           ...G.............     155
134       866                                           ...G.............     850
131       564                                           ...G.............     548
126       863                                           ...G.............     847
120       865                                           ...G.............     849
21        289                                           ...G.............     305
19        292                                           ...G.............     308

Query_65  2401  CTGGATGCAAAA-GCTTTGCAACGTCTTCAGGAAGGTGGCAACGTACTGCTTTCTTTACG  2459
0         672   ............-...............................................  614
5         673   ............-...............................................  615
14        673   ............-...............................................  615
12        676   ............-...............................................  618
3         673   ............-...............................................  615
88        659   ............A.......................N.......................  600

Query_65  2460  GAAAGGCTCCTTGCCTGCCGAAGCGGGAGGCGAAGTAGTGATAGGTTTCTCTAGCATCTT  2519
0         613   ............................................................  554
5         614   ............................................................  555
14        614   ............................................................  555
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3         614   ............................................................  555
88        599   ............................................................  540

Query_65  2520  CTGGAACACGGCCTGGACGCTGGGACAAGCACCGCACACACTGGGTATCCTGTGTAACCC  2579
0         553   ............................................................  494
5         554   ............................................................  495
14        554   ............................................................  495
12        557   ............................................................  498
3         554   ............................................................  495
88        539   ............................................................  480

Query_65  2580  CGCTCATCCGGCACTTTCAGAGTTCCCTACAGAGTATTACAGTGATTATCAGTGGTGGGA  2639
0         493   ............................................................  434
5         494   ............................................................  435
14        494   ............................................................  435
12        497   ............................................................  438
3         494   ............................................................  435
88        479   ............................................................  420

Query_65  2640  TGCCATGAGCCATTCCGGTGCCATCGAAGTGGTCAAGATTGATAAAAACTTGCAGCCGAT  2699
0         433   ............................................................  374
5         434   ............................................................  375
14        434   ............................................................  375
12        437   ............................................................  378
3         434   ............................................................  375
88        419   ............................................................  360

Query_65  2700  TGTACGAGTTATCGACGACTGGTTTACGAACCGTCCGCTGGCTTTGTTGTTCGAAGTGAA  2759
0         373   ............................................................  314
5         374   ............................................................  315
14        374   ............................................................  315
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3         374   ............................................................  315
88        359   ............................................................  300

Query_65  2760  GGTGGGTAAGGGTAAATTGCTTGTGTCAGGAATTGATTTCTGGCAGGATATGGACAAGCG  2819
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Query_65  2820  TACGGAAGCCCGTCAGTTACTCTACAGCTTGAAGAAATATATGTGCGGTAATCGCTTCAA  2879
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Query_65  2880  TCCCTCTTCTGAAGTCGATGCGAAAGATTTAAGTATTTTGTTTTCCATTAAAAATCAAAA  2939
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26        136                                                             ..  135
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42        133                                                              .  133
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22        135                                                             ..  134
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Query_65  2940  ATAACATTGGAAGTGGATAACGGATCCGAATTCGAGCTCCGTCGA-CAAGCTT-GCGGCC  2997
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Query_65  2998  G-CACT-CGAGcaccaccaccaccacca-cT-G-AGA-T-CCGGCTGCTAACAAAG-CCC  3049
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Query_65  3050  --G--AAAGGAAGC-TGAGTTGGC-TG-CTGCCACCGCTGAGCAATAAC-TAG-CA-TAA  3099
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56        24    --.--...A...                                                  17
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116       19    --.--....A.N..                                                10
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30        22    --.--...                                                      19
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87        10    --A--..                                                       8
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51        8     --.--....                                                     4
58        9     --.--..                                                       7
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Query_65  3100  C-C-CCTT-GGGGCCTCTAAACGGGTCTT--GAGG-GG--TTTTTTGCTGAAA  3144
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111       1003  .-.-....G....N..TNN..........--.NN.-..GT...........    1048
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Lambda      K        H
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Gapped
Lambda      K        H
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Effective search space used: 478468354


Query= CMR200137.121

Length=3144
                                                                      Score     E
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  1_01A_A4_CMR200137.120_ST7term.seq                                  1903    0.0   
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  94_07B_B7_CMR200069.109_T7S.seq                                     264     1e-71 



Query_66  1     TCTCG-ATCCCGCGAAATTAATAC-GACTC-ACTATAGGGG--AATT-GTGAG-CGGA-T  52
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Query_66  53    AAC-AA-TT-CCCC--T-C-TAGAAA-TAA-TTTT-GTTTAAC--TTTAAGAA-GGA-GA  98
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Query_66  99    TATAC-ATATG--CACCAT-CATCATCAT-CATTCTT-CT-GG-TGTAGAT-CTGTGGTC  149
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Query_66  150   TCAT-CC--G-CAGTTCG-AAAAGGGTA-CCGAGAA-CCTGTACTT-CCAAT-CCAATGC  200
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101       106   ..C.-G.T-.-.T..-..-.TG......-.......-.........-.....-.......  156
137       969   ..N.T..--.-.....N.-......N..-.......-..N......N.....N.....N.  916

Query_66  201   CCAGACTGATAAGATTGACCTGGCCGGCTCGTGGACATTTTCTACGGACAGCATGGACTG  260
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117       646   .A..                                                          643
83        812   .                                                             812
85        812   .                                                             812
110       154   .                                                             154
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86        152   ...                                                           154
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96        160   .                                                             160
9         155   .                                                             155
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17        149   .A..T..                                                       155
84        149   ...                                                           151
111       152   .                                                             152
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112       156   .                                                             156
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95        161   .                                                             161
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102       160   .                                                             160
80        152   ..                                                            153
29        148   .A..T..                                                       154
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137       915   ...                                                           913

Query_66  261   GAGCCGGGTGATTGAACTGCCGGGTTCAATGGCTTCCAATGGTTTTGGGGAAGATATTGC  320
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Query_66  321   CGTGGGTACTGATTGGACGGGCGGTATTGTGGATTCTTCTTATTTCTTTAAACCTTCGTA  380
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Query_66  381   TGCCAAATACCGTGAGGCAGGAAATATCAAGGTACCTTTCTGGCTTCAGCCGGTAAAATA  440
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Query_66  441   TTACAAGGGTAAGGCGTGGTATCAGAAAGAGGTGGTGATTCCGGACAGTTGGGAAGGAAA  500
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Query_66  501   GGACATTTCTCTCTTTTTGGAACGATGCCATTGGGAGAGCCGTTTGTATATAGACGGAAA  560
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Query_66  561   GGAAATCGGCATGCAAAATGCTTTGGGGGCGCCCCATCGTTATGACCTGACAGGCAAGCT  620
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50        899                                                        .......  893

Query_66  621   TTCAG-CAGGGAAACATGTG-TTGATGCTGTGTGTAGACAA-TCGGGTGAAAAACATTGA  677
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Query_66  678   TCCGGGGGAGAACTCACATAGTATTTC-CGACCATACACAAGGAAACTGGAACGGGGTG-  735
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Query_66  736   GTAGGC-GATATGTTCCTGGAAGTAAAGCC-GG-AAGTGAATGTGTC-TTCCGTCAAGAT  791
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Query_66  792   TATGCCGGAGCGTCTGGCTAAG-AAAGTCAGTGTGTCGGC-TT-CCTTGATGAACC-GTT  847
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50        722   ...CNN......G.AA......T.......CN......AT-.C-.GNA....CGGT-...  666
119       140                                                       ....-...  134
32        266                                                       ....-...  272

Query_66  848   ATGAAAAAGA--TGCCAATGTGGTAC-TGGAGATGACGGTAGGTAATGAAAAAGTACAG-  903
61        787   ..........--.....N........T................N...............-  843
59        793   ...-......--..............-................................-  847
52        674   ..TC......GA..T-.NCC..T.T.-..-..CN..N....T....GC..TC.AGC...-  619
48        670   ...C......--....T..CNTT.TT-C.T.CCA.....C.T....CA.TC....N..AA  614
50        665   N.TC.G....--N...T.G.N...TT-.....CA.........G.GC-..........A-  611
119       133   .....TCG..--......                                            118
32        273   .....TCG..--......                                            288

Query_66  904   --CAACAATG-TACGTTGAAGCCGGGC-GAAAATCAAGTGATGATGTCGCTGGCCATGAA  959
61        844   --.....T..T......TG........-....................K...........  900
59        848   --........-................-.............................N..  903
52        618   --........-...........AAAT.A.....A...C...N....GNATCC...GAA.T  562
48        613   GC....CC..-CC.----......AT.-AG.C.A.......A.....NATCC...GN..T  560
50        610   --AGC.....-...........AAAT.-...C.....CA..N.....AATCCN..--...  557

Query_66  960   G--GGAGACA-TTAAGTGCTGGGATG-AGTTTTCTCCATCCTTATA-TGA-TTTGAAGCT  1013
61        901   .--.......T...............N.......N...........T...T.........  958
59        904   ---.......-...............-.....N....T.......N-...-.........  956
52        561   .--....N..-....AA..A......-..A...N......                      526
48        559   .--T.N.G..-.GC.AA..A......-.....GNC..T..AAC.C.-...-.N..C.AT.  506
50        556   .TG..T.G..-....AA..A......-.....GNC..TA.AAC.C.-N.N-CN..C..T.  501

Query_66  1014  GAGTG-TGAAGGATGC-GG-ATAGCGGTGAAACG-GATGTC-TATG-CGGAACGTTTTGG  1067
61        959   N....T..........-..A..............T......T....N.......N.....  1017
59        957   ..T..                                                         961
48        505   .TCC.--....CCA..A..-.AG...TC...CAA-A.....-...N-...TT.TC...CA  452
50        500   .....-G...C...CA-..-.A....TC....A.-..G...-C...-...----....CA  451

Query_66  1068  -TT---TCCGTGAT-GTG-AAGGTGAAAGAC-GGCAAA-CTCACCATCAAC-GACCGCCG  1118
61        1018  T..---....NN..N...A...NN....N..-.                             1046
52        441                    .-..T......ATT-......-.........CC.-.T...TA-  404
48        451   -G.---..TC-..G-.N.-.....C....TT-.....GG.G..T..C.C-.-.T....N-  403
50        450   -.CCAG..NT...G-.A--..T......A.TT......-..G--.....C.C........  398
105       717               ..-...-.........                                  730
103       719               ..-...-.........                                  732
102       717               ..-...-.........                                  730
104       720               ..-...-.........                                  733

Query_66  1119  TTTG---TTCCTG--CGTGGTACGCTGG--AT-TGTGC--CGTATTTCCGAAGACCG-GT  1167
52        403   ....---GC.A.TTC....--.A.T...--GA-.A...ACN.C..........T...-..  353
48        402   -...---NC.A.TTC....--.A.T...GA.A-.NCA.--N.C..........N...T..  352
50        397   .G.CCAT.....-----..--.A.T...G-..A..CN.--N.C..............-..  349

Query_66  1168  TTCCCGCCCACGGATGTAGAATCCTGGAAAAAGATTTATACCACCTGTCGGCAGCACGGA  1227
52        352   ..T.NC..TNG...G..G.....N...G...-.....G.C..                    312
48        351   .....-.ATCG...N..G.....N.....TGTA......C.....ATAG......CG..G  293
50        348   ..T..C.ATNG...G..G.....G.....TGT.......-...GTCA........-...G  291

Query_66  1228  CTGAACCATGT------GCGCTTCCATTCCTGGTGTCCGCCCGAAGCTGCTTTTGCAGCT  1281
48        292   AG.....G...                                                   282
50        290   GA.CN......TGATAAT.AT..T.GCA...--.......----..GC........----  241

Query_66  1282  GCCGA-TGGGATGGGT----ATGTACCTGGAGATAGAATGTTCTTCCT-GGGCTAACCAG  1335
50        240   .AG..T...A...AN.CGAG.A..--.G..........AT.GG.C.A.CN...--.....  185

Query_66  1336  TCGACTACCATTGGCGATGGAGGCGATCTGGACCGCTTTATCTGGGAGGAAAGTGAACGC  1395
52        2                  ....-..........................................  47
48        2                  ....-..........................................  47
50        5                        .........................................  45
50        184   .NC.A...............T..........N...G..                        147

Query_66  1396  ATCGTCCGTGAGTTTGGTAACCATCCTTCTTTCTGCATGATGATGTACGGTAACCAGCCG  1455
52        48    ....................................T.............G...G.AG..  107
48        48    ....................G..........G....T.............G...GCTG..  107
50        46    ....................................T......G......G......G..  105

Query_66  1456  GCTGGTGAGGGAAGTAATGCCTATCTGACTAATTTTGTTACTACCTGGAAAGAGCGCGAT  1515
52        108   ............................T.........A..A...G.N.....T.....C  167
48        108   .................A............C..............G..............  167
50        106   .A............A..A..........T.CC......AN.A...G.NCC...T...C.C  165

Query_66  1516  GCCCGCCGTTTATATTGTTCGGGTGCCGGATGGCCCAATTTGCCGGTTAACGACTTCTTG  1575
52        168   .......AA.GG.....NA.T............A.......CTATC....G.........  227
48        168   ........-.GG.....NA.T....................CTATC.CC.G...C..AC.  226
50        166   CAT....AA.GG.....NA.T......N.....A.......-.TATC.CC........C.  224

Query_66  1576  AGCGATTCCAATCCTCGTATTCAGGCGTGGGGACAAGGTGTGAAGAGTATTATCAACGCA  1635
52        228   .NTC.....N....CT.C....NC..C.TC......ACACC...A.TG.........NTG  287
48        227   CAT....T.N....CT.C.AA.GN.....C....G.....C...A.TG.........A.G  286
50        225   .NTC.............C.AAAGC..C..C..........C...A.TG........--..  282

Query_66  1636  CAG-GCTCCGCG--TACCGACTATGACTGGTCAGAATACATCGGACGTTTCCAGCAGCCG  1692
52        288   ...-.....C..--G.TGC........G..A..-...CTT..CC.N.A.....C.TC..N  343
48        287   GTT-C....C..GC.G..--.....GTG..AT.A.T.....TCC.N.A.....CNTC...  343
50        283   TG.N.....C..---G.T.C.G........AT.A.TC....TCC...A.....C.TC..N  339

Query_66  1693  ATGGTGAGCCACGAAATCGGGCAGTGGTGTGTATATCCCAACTTCAAGGAAATGGCCAAA  1752
52        344   .G..N..AAAC..G.C.TC..A.A..CN...C..............C.............  403
48        344   ....G..AA....GNC.TC..A.A..CN...N..T...........C........N...N  403
50        340   ....G..AAAC..GTC.TC..A.A..CN.N.C.......................----.  395

Query_66  1753  TAC-GACG---GGG-TGATGC-GCCCGCGTAATTTTGAGATATTCCAGGAAACACTGGCT  1806
52        404   ...G....---...A..G..A-.TTT..-C......C.C..TC...TC.CT.......N.  458
48        404   GCG-....---...-......-...TTGCC..C.....CC.TCN..TC..G.-....AAA  456
50        396   C..-.G..GTC...-......A.TTT..CA.T....C.C..-....-TC..NG.....A.  451

Query_66  1807  GAAAACGGTATGGCACATTTGGCT-GACAGCTTCCTGCTGGCTTCCGGAAAATTGCAGG-  1864
5         1229                                                     ........G  1221
52        459   ..NNT.C.N....AC.T....TT.-...NNT.........CT.C..A..C.......N.-  516
48        457   ..G...C.N..A.-......T.T.C...GC...................C.......NA-  514
50        452   ......C.C....                                                 464

Query_66  1865  CGTTGTGTTATA-AGGCCGATATCGAAGCTGCTTTGCGTAC---AAAAGACTT-CGGTGG  1919
0         1183                               ...N.N....TA---C........T....T.  1156
5         1220  ........-...TNNNN...AN.N...NN.N.C...N....---...NNNNN.-......  1166
14        1195                   ...AN........N...N......---...N.NN.--......  1158
3         1196                       .............G.....TNCA.........-.....A  1159
52        517   TCN......                                                     525
48        515   TCA......GA.-G..N.A.AC..ATCC.........A.G.---CNC.C.TCN-...C..  569

Query_66  1920  -ATTCCA--GTTACTGGGCTTGTCTGATTTCCCGGGGC-AGGGTACGG-CTTTG-G-TA-  1971
0         1155  -...N..--..N.....-..A........N......-.-.A......--...G.-T-A.-  1107
5         1165  G......--.....NTNN..GN.NN..........A..N..N.....A-N....A.-..A  1110
14        1157  -.N.NA.--..-...NNNNN......N..C.....NNA-...-.....-NC...-.-.T-  1108
12        1147       ..--.......NNTN.-..-.......N.A..N-.A.......-NN...-.-..-  1102
3         1158  -.NNN-.--.N-..NN.-..N..TNN.A.NN...N.NN-N.N--....G.N.G.-.-..-  1111
48        570   -..NA..TCT.C...T.--.........CGG.TT....-.....-T..-.....-NACT-  621

Query_66  1972  GGAG-TGC-TCGAT-GCG-T-TCTGGGAAG--AAAAA-GGCTA-CA-T-CCGTCC-GGAA  2019
0         1106  ....-...-NN...-N..A.-...T....AGA.....-.....-..-.T......C....  1054
5         1109  ....N...C.....-...-.N.........N-.....-.....-..-.T......-.-..  1058
14        1107  A...ANN.-.NNNNN...-G-.........--.....-.....A..N.-.G....-....  1056
12        1101  ....-...-.....-...-.--..T.....--.....A.....-.N-.-T.....-N...  1054
3         1110  A.NA-GN.-.....-...-A-........AGA.....-.....-..-.-......-....  1061
48        622   T..T-..T-.AC..-..C-G-.....T.C.--.....-N.A..                   656

Query_66  2020  GAATA-CCGTCGTTTCTGT-AATAGTACGGTACCATTACTGCGC-TTGCCGAAG-TTGAT  2075
0         1053  .....-.............N..........N.....-.......C.........-.....  997
5         1057  ...NN-......G...NN.-........................-.........-.....  1002
14        1055  .....-..........NN.-.......................G-N........-.-...  1001
12        1053  ...AN-AN......-....-.........-.N............-....NN.-.-....N  1001
3         1060  .....A.....CG......-...........N............-.-.......G.....  1004
48        695                             ..N..G..T.........-...A.NC.C-.....  726

Query_66  2076  TTATACC-AACCAGG-AAACGGTGAAA-GGAAGTCTGGAA-GTGGCACATTTCGGAGCTG  2131
0         996   .......-.......-...........-A...........-...-......CG.A.....  942
5         1001  .......-.......G...........-............-...................  945
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12        1000  .-.....-.-....--...........-......N.....-...................  948
3         1003  ....C..-....CA.-G..........A.........N..-.....N....-........  948
48        727   .                                                             727

Query_66  2132  CT-CCGCTGGAGG-TG-ACTTCT-ACTGTCTGGACCC-TG-AAAAC--AAAAG--AA-GG  2180
0         941   ..-..........-..-......-.............-..-.....--.....--..-..  893
5         944   ..T....N.....G..-......-.............-..-.....--.....--..-..  894
14        942   ..-..........-..N......-.............-..-...-.--.....--..A..  893
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3         947   ..-..........-..-......-........N....-..-....ACA.....--..A..  896
88        924                                 .......C..N.....--....NGA..-..  898

Query_66  2181  AAAG-ACAATTGCTT-CGGG-CACGCTGGCACA-CCAG-CC-GG-TAGGTAT-CGGCAAT  2232
0         892   ....-....N.....-....-............-....-..-..-.......-.......  841
5         893   ....-..........-...C-............-....-..C..-.......-.......  841
14        892   ....-..........-....-.......-....-....-..-..-.......-.......  842
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3         895   ....-..........-....-............-....-..-..-.......-.......  844
88        897   ....G......NA..T....A..N.........N....A..-..N..N..T.T......N  839

Query_66  2233  TGT-ATTCCGTTGGGGCAGCTGGAGA-TTCC-ATTGGATAAGG-TGGACGTCCC--TTCA  2286
0         840   ...-......................-....-...........-..........--....  787
5         840   ...-......................-....-...........-..........--....  787
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3         843   ...-......................-....-...........-..........C-....  789
88        838   .N.TN....N.G............NNG....N..G......N.N..........CT....  779

Query_66  2287  -TGTCTGA-CACTGGAAGCTACATT-GGGAGATTACGCCAA-CAGCTGGCACATCTGGGT  2342
0         786   -.......-................-...............-..................  731
5         786   -.......-................-.......-.......-..................  732
14        787   -.......-................-...............-..................  732
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3         788   -.......-................-...............A..................  732
88        778   N.N.....N........N.......T...............-..................  720

Query_66  2343  ATATCCTGCTGCGGTACA-GAAAGTAGCTGATGAA-GCACAATTGCTGATGACCGACCGT  2400
0         730   ..................-................-........................  673
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3         731   ..................-................-........................  674
88        719   ..N..T............N................A........................  660
137       171                                           ...G.............     155
134       866                                           ...G.............     850
131       564                                           ...G.............     548
126       863                                           ...G.............     847
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21        289                                           ...G.............     305
19        292                                           ...G.............     308

Query_66  2401  CTGGATGCAAAA-GCTTTGCAACGTCTTCAGGAAGGTGGCAACGTACTGCTTTCTTTACG  2459
0         672   ............-...............................................  614
5         673   ............-...............................................  615
14        673   ............-...............................................  615
12        676   ............-...............................................  618
3         673   ............-...............................................  615
88        659   ............A.......................N.......................  600

Query_66  2460  GAAAGGCTCCTTGCCTGCCGAAGCGGGAGGCGAAGTAGTGATAGGTTTCTCTAGCATCTT  2519
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Query_66  2520  CTGGAACACGGCCTGGACGCTGGGACAAGCACCGCACACACTGGGTATCCTGTGTAACCC  2579
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Query_66  2580  CGCTCATCCGGCACTTTCAGAGTTCCCTACAGAGTATTACAGTGATTATCAGTGGTGGGA  2639
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Query_66  2640  TGCCATGAGCCATTCCGGTGCCATCGAAGTGGTCAAGATTGATAAAAACTTGCAGCCGAT  2699
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Query_66  2700  TGTACGAGTTATCGACGACTGGTTTACGAACCGTCCGCTGGCTTTGTTGTTCGAAGTGAA  2759
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Query_66  2760  GGTGGGTAAGGGTAAATTGCTTGTGTCAGGAATTGATTTCTGGCAGGATATGGACAAGCG  2819
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Query_66  2820  TACGGAAGCCCGTCAGTTACTCTACAGCTTGAAGAAATATATGTGCGGTAATCGCTTCAA  2879
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Query_66  2880  TCCCTCTTCTGAAGTCGATGCGAAAGATTTAAGTATTTTGTTTTCCATTAAAAATCAAAA  2939
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26        136                                                             ..  135
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42        133                                                              .  133
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24        136                                                             ..  135
22        135                                                             ..  134
8         136                                                              .  136
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87        122                                                            ...  120
79        65                                                               .  65
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77        65                                                               .  65

Query_66  2940  ATAACATTGGAAGTGGATAACGGATCCGAATTCGAGCTCCGTCGA-CAAGCTT-GCGGCC  2997
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18        65     ....................--.....                                  41

Query_66  2998  G-CACT-CGAGcaccaccaccaccacca-cT-G-AGA-T-CCGGCTGCTAACAAAG-CCC  3049
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18        45                                        .-.-................C...  24

Query_66  3050  --G--AAAGGAAGC-TGAGTTGGC-TG-CTGCCACCGCTGAGCAATAAC-TAG-CA-TAA  3099
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5         23    --.--...A...                                                  16
14        24    --.--...                                                      21
12        26    --.--...N...                                                  19
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88        9     --.--....                                                     5
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85        21    --.--....                                                     17
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116       19    --.--....A.N..                                                10
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30        22    --.--...                                                      19
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87        10    --A--..                                                       8
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51        8     --.--....                                                     4
58        9     --.--..                                                       7
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Query_66  3100  C-C-CCTT-GGGGCCTCTAAACGGGTCTT--GAGG-GG--TTTTTTGCTGAAA  3144
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111       1003  .-.-....G....N..TNN..........--.NN.-..GT...........    1048
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Gapped
Lambda      K        H
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Effective search space used: 478468354


Query= CMR200137.122

Length=3144
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Query_67  1     TCTCG-ATCCCGCGAAATTAATAC-GACTC-ACTATAGGGG--AATT-GTGAG-CGGA-T  52
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Query_67  53    AAC-AA-TT-CCCC--T-C-TAGAAA-TAA-TTTT-GTTTAAC--TTTAAGAA-GGA-GA  98
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Query_67  99    TATAC-ATATG--CACCAT-CATCATCAT-CATTCTT-CT-GG-TGTAGAT-CTGTGGTC  149
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Query_67  150   TCAT-CC--G-CAGTTCG-AAAAGGGTA-CCGAGAA-CCTGTACTT-CCAAT-CCAATGC  200
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Query_67  201   CCAGACTGATAAGATTGACCTGGCCGGCTCGTGGACATTTTCTACGGACAGCATGGACTG  260
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96        160   .                                                             160
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Query_67  261   GAGCCGGGTGATTGAACTGCCGGGTTCAATGGCTTCCAATGGTTTTGGGGAAGATATTGC  320
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Query_67  321   CGTGGGTACTGATTGGACGGGCGGTATTGTGGATTCTTCTTATTTCTTTAAACCTTCGTA  380
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Query_67  381   TGCCAAATACCGTGAGGCAGGAAATATCAAGGTACCTTTCTGGCTTCAGCCGGTAAAATA  440
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Query_67  441   TTACAAGGGTAAGGCGTGGTATCAGAAAGAGGTGGTGATTCCGGACAGTTGGGAAGGAAA  500
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Query_67  501   GGACATTTCTCTCTTTTTGGAACGATGCCATTGGGAGAGCCGTTTGTATATAGACGGAAA  560
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Query_67  561   GGAAATCGGCATGCAAAATGCTTTGGGGGCGCCCCATCGTTATGACCTGACAGGCAAGCT  620
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50        899                                                        .......  893

Query_67  621   TTCAG-CAGGGAAACATGTG-TTGATGCTGTGTGTAGACAA-TCGGGTGAAAAACATTGA  677
61        558   .....-..............-....................-..................  614
59        564   .....-..............T....................-..................  621
52        902   N....A.N....T....-..-C....A....C..-..G.T.-.GN.AG..T....G.A.C  847
50        892   N..NA-....A.T...AT..-.N...N..NCN-.....GGNG.........N.-...A..  837

Query_67  678   TCCGGGGGAGAACTCACATAGTATTTC-CGACCATACACAAGGAAACTGGAACGGGGTG-  735
61        615   ...........................-...............................-  672
59        622   ...........................-...............................-  679
52        846   AAT..TN.N......T....T...C..-N.T...N..........T..CNTN.....G.A  788
48        822                       ....C..-N.T........N..A..T..N.TC.A.N.G.-  785
50        836   .A.T..N.T.NC.....N.N....C..GN.T...G..........T.NNNTC.A...GA-  778

Query_67  736   GTAGGC-GATATGTTCCTGGAAGTAAAGCC-GG-AAGTGAATGTGTC-TTCCGTCAAGAT  791
61        673   ......-.......................-..-.............T............  729
59        680   ......-.......................-..-.............-............  735
52        787   ......T....AA.-.N...NTTAC.....T..-.......N.....-...G........  731
48        784   .C..CT-....A.N.NNN.A.NT.......-T.CN...C.CC.....-...G........  728
50        777   .C..CT-N.G.NAA.GNGNC....CC....-.C-.............-.-.G....G...  723

Query_67  792   TATGCCGGAGCGTCTGGCTAAG-AAAGTCAGTGTGTCGGC-TT-CCTTGATGAACC-GTT  847
61        730   ......................-.................T..-............-...  786
59        736   ......................-.................-..Y.Y..........-...  792
52        730   A.AT.A..T...CAA.CNC...-.......CN......TT-N.-AGAN..G...GN-...  675
48        727   A..-.AA.T.N...AA..GC..T....G..CN.......N-.C-.GAN.....N.GT...  671
50        722   ...CNN......G.AA......T.......CN......AT-.C-.GNA....CGGT-...  666
119       140                                                       ....-...  134
32        266                                                       ....-...  272

Query_67  848   ATGAAAAAGA--TGCCAATGTGGTAC-TGGAGATGACGGTAGGTAATGAAAAAGTACAG-  903
61        787   ..........--.....N........T................N...............-  843
59        793   ...-......--..............-................................-  847
52        674   ..TC......GA..T-.NCC..T.T.-..-..CN..N....T....GC..TC.AGC...-  619
48        670   ...C......--....T..CNTT.TT-C.T.CCA.....C.T....CA.TC....N..AA  614
50        665   N.TC.G....--N...T.G.N...TT-.....CA.........G.GC-..........A-  611
119       133   .....TCG..--......                                            118
32        273   .....TCG..--......                                            288

Query_67  904   --CAACAATG-TACGTTGAAGCCGGGC-GAAAATCAAGTGATGATGTCGCTGGCCATGAA  959
61        844   --.....T..T......TG........-....................K...........  900
59        848   --........-................-.............................N..  903
52        618   --........-...........AAAT.A.....A...C...N....GNATCC...GAA.T  562
48        613   GC....CC..-CC.----......AT.-AG.C.A.......A.....NATCC...GN..T  560
50        610   --AGC.....-...........AAAT.-...C.....CA..N.....AATCCN..--...  557

Query_67  960   G--GGAGACA-TTAAGTGCTGGGATG-AGTTTTCTCCATCCTTATA-TGA-TTTGAAGCT  1013
61        901   .--.......T...............N.......N...........T...T.........  958
59        904   ---.......-...............-.....N....T.......N-...-.........  956
52        561   .--....N..-....AA..A......-..A...N......                      526
48        559   .--T.N.G..-.GC.AA..A......-.....GNC..T..AAC.C.-...-.N..C.AT.  506
50        556   .TG..T.G..-....AA..A......-.....GNC..TA.AAC.C.-N.N-CN..C..T.  501

Query_67  1014  GAGTG-TGAAGGATGC-GG-ATAGCGGTGAAACG-GATGTC-TATG-CGGAACGTTTTGG  1067
61        959   N....T..........-..A..............T......T....N.......N.....  1017
59        957   ..T..                                                         961
48        505   .TCC.--....CCA..A..-.AG...TC...CAA-A.....-...N-...TT.TC...CA  452
50        500   .....-G...C...CA-..-.A....TC....A.-..G...-C...-...----....CA  451

Query_67  1068  -TT---TCCGTGAT-GTG-AAGGTGAAAGAC-GGCAAA-CTCACCATCAAC-GACCGCCG  1118
61        1018  T..---....NN..N...A...NN....N..-.                             1046
52        441                    .-..T......ATT-......-.........CC.-.T...TA-  404
48        451   -G.---..TC-..G-.N.-.....C....TT-.....GG.G..T..C.C-.-.T....N-  403
50        450   -.CCAG..NT...G-.A--..T......A.TT......-..G--.....C.C........  398
105       717               ..-...-.........                                  730
103       719               ..-...-.........                                  732
102       717               ..-...-.........                                  730
104       720               ..-...-.........                                  733

Query_67  1119  TTTG---TTCCTG--CGTGGTACGCTGG--AT-TGTGC--CGTATTTCCGAAGACCG-GT  1167
52        403   ....---GC.A.TTC....--.A.T...--GA-.A...ACN.C..........T...-..  353
48        402   -...---NC.A.TTC....--.A.T...GA.A-.NCA.--N.C..........N...T..  352
50        397   .G.CCAT.....-----..--.A.T...G-..A..CN.--N.C..............-..  349

Query_67  1168  TTCCCGCCCACGGATGTAGAATCCTGGAAAAAGATTTATACCACCTGTCGGCAGCACGGA  1227
52        352   ..T.NC..TNG...G..G.....N...G...-.....G.C..                    312
48        351   .....-.ATCG...N..G.....N.....TGTA......C.....ATAG......CG..G  293
50        348   ..T..C.ATNG...G..G.....G.....TGT.......-...GTCA........-...G  291

Query_67  1228  CTGAACCATGT------GCGCTTCCATTCCTGGTGTCCGCCCGAAGCTGCTTTTGCAGCT  1281
48        292   AG.....G...                                                   282
50        290   GA.CN......TGATAAT.AT..T.GCA...--.......----..GC........----  241

Query_67  1282  GCCGA-TGGGATGGGT----ATGTACCTGGAGATAGAATGTTCTTCCT-GGGCTAACCAG  1335
50        240   .AG..T...A...AN.CGAG.A..--.G..........AT.GG.C.A.CN...--.....  185

Query_67  1336  TCGACTACCATTGGCGATGGAGGCGATCTGGACCGCTTTATCTGGGAGGAAAGTGAACGC  1395
52        2                  ....-..........................................  47
48        2                  ....-..........................................  47
50        5                        .........................................  45
50        184   .NC.A...............T..........N...G..                        147

Query_67  1396  ATCGTCCGTGAGTTTGGTAACCATCCTTCTTTCTGCATGATGATGTACGGTAACGAACCG  1455
52        48    ....................................T.............G......G..  107
48        48    ....................G..........G....T.............G....CTG..  107
50        46    ....................................T......G......G...C.GG..  105

Query_67  1456  GCTGGTGAGGGAAGTAATGCCTATCTGACTAATTTTGTTACTACCTGGAAAGAGCGCGAT  1515
52        108   ............................T.........A..A...G.N.....T.....C  167
48        108   .................A............C..............G..............  167
50        106   .A............A..A..........T.CC......AN.A...G.NCC...T...C.C  165

Query_67  1516  GCCCGCCGTTTATATTGTTCGGGTGCCGGATGGCCCAATTTGCCGGTTAACGACTTCTTG  1575
52        168   .......AA.GG.....NA.T............A.......CTATC....G.........  227
48        168   ........-.GG.....NA.T....................CTATC.CC.G...C..AC.  226
50        166   CAT....AA.GG.....NA.T......N.....A.......-.TATC.CC........C.  224

Query_67  1576  AGCGATTCCAATCCTCGTATTCAGGCGTGGGGACAAGGTGTGAAGAGTATTATCAACGCA  1635
52        228   .NTC.....N....CT.C....NC..C.TC......ACACC...A.TG.........NTG  287
48        227   CAT....T.N....CT.C.AA.GN.....C....G.....C...A.TG.........A.G  286
50        225   .NTC.............C.AAAGC..C..C..........C...A.TG........--..  282

Query_67  1636  CAG-GCTCCGCG--TACCGACTATGACTGGTCAGAATACATCGGACGTTTCCAGCAGCCG  1692
52        288   ...-.....C..--G.TGC........G..A..-...CTT..CC.N.A.....C.TC..N  343
48        287   GTT-C....C..GC.G..--.....GTG..AT.A.T.....TCC.N.A.....CNTC...  343
50        283   TG.N.....C..---G.T.C.G........AT.A.TC....TCC...A.....C.TC..N  339

Query_67  1693  ATGGTGAGCCACGAAATCGGGCAGTGGTGTGTATATCCCAACTTCAAGGAAATGGCCAAA  1752
52        344   .G..N..AAAC..G.C.TC..A.A..CN...C..............C.............  403
48        344   ....G..AA....GNC.TC..A.A..CN...N..T...........C........N...N  403
50        340   ....G..AAAC..GTC.TC..A.A..CN.N.C.......................A..    397

Query_67  1753  TAC-GACGGGG-TGATGCGCCCGCGTAATTTTGAGATATTCCAGGCTACACTGGCTGAAA  1810
52        404   ...G.......A..G..A.TTT..-C......C.C..TC...TC..........N...NN  462
48        404   GCG-.......-.........TTGCC..C.....CC.TCN..TC.AG.-....AAA..G.  460

Query_67  1811  ACGGTATGGCACATTTGGCT-GACAGCTTCCTGCTGGCTTCCGGAAAATTGCAGG-CGTT  1868
5         1229                                                 ........G....  1217
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48        461   ..C.N..A.-......T.T.C...GC...................C.......NA-TCA.  518

Query_67  1869  GTGTTATA-AGGCCGATATCGAAGCTGCTTTGCGTAC---AAAAGACTT-CGGTGG-ATT  1922
0         1183                           ...N.N....TA---C........T....T.-...  1153
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48        519   .....GA.-G..N.A.AC..ATCC.........A.G.---CNC.C.TCN-...C..-..N  572

Query_67  1923  CCA--GTTACTGGGCTTGTCTGATTTCCCGGGGC-AGGGTACGG-CTTTG-G-TA-GGAG  1975
0         1152  N..--..N.....-..A........N......-.-.A......--...G.-T-A.-....  1103
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48        573   A..TCT.C...T.--.........CGG.TT....-.....-T..-.....-NACT-T..T  625

Query_67  1976  -TGC-TCGAT-GCG-T-TCTGGGAAG--AAAAA-GGCTA-CA-T-CCGTCC-GGAAGAAT  2023
0         1102  -...-NN...-N..A.-...T....AGA.....-.....-..-.T......C........  1050
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Query_67  2024  A-CCGTCGTTTCTGT-AATAGTACGGTACCATTACTGCGC-TTGCCGAAG-TTGATTTAT  2079
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Query_67  2080  ACC-AACCAGG-AAACGGTGAAA-GGAAGTCTGGAA-GTGGCACATTTCGGAGCTGCT-C  2134
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Query_67  2135  CGCTGGAGG-TG-ACTTCT-ACTGTCTGGACCC-TG-AAAAC--AAAAG--AA-GGAAAG  2184
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88        924                             .......C..N.....--....NGA..-......  894

Query_67  2185  -ACAATTGCTT-CGGG-CACGCTGGCACA-CCAG-CC-GG-TAGGTAT-CGGCAATTGT-  2235
0         888   -....N.....-....-............-....-..-..-.......-..........-  838
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Query_67  2236  ATTCCGTTGGGGCAGCTGGAGA-TTCC-ATTGGATAAGG-TGGACGTCCC--TTCA-TGT  2289
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88        834   N....N.G............NNG....N..G......N.N..........CT....N.N.  775

Query_67  2290  CTGA-CACTGGAAGCTACATT-GGGAGATTACGCCAA-CAGCTGGCACATCTGGGTATAT  2346
0         783   ....-................-...............-......................  727
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12        787   ....-................-...............-......................  731
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88        774   ....N........N.......T...............-....................N.  716

Query_67  2347  CCTGCTGCGGTACA-GAAAGTAGCTGATGAA-GCACAATTGCTGATGACCGACCGTCTGG  2404
0         726   ..............-................-............................  669
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14        727   ..............-................-............................  670
12        730   ..............-................-............................  673
3         727   ..............-................-............................  670
88        715   .T............N................A............................  656
137       171                                       ...G.............         155
134       866                                       ...G.............         850
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120       865                                       ...G.............         849
21        289                                       ...G.............         305
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Query_67  2405  ATGCAAAA-GCTTTGCAACGTCTTCAGGAAGGTGGCAACGTACTGCTTTCTTTACGGAAA  2463
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3         669   ........-...................................................  611
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Query_67  2464  GGCTCCTTGCCTGCCGAAGCGGGAGGCGAAGTAGTGATAGGTTTCTCTAGCATCTTCTGG  2523
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3         610   ............................................................  551
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Query_67  2524  AACACGGCCTGGACGCTGGGACAAGCACCGCACACACTGGGTATCCTGTGTAACCCCGCT  2583
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Query_67  2584  CATCCGGCACTTTCAGAGTTCCCTACAGAGTATTACAGTGATTATCAGTGGTGGGATGCC  2643
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3         490   ............................................................  431
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Query_67  2644  ATGAGCCATTCCGGTGCCATCGAAGTGGTCAAGATTGATAAAAACTTGCAGCCGATTGTA  2703
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Query_67  2704  CGAGTTATCGACGACTGGTTTACGAACCGTCCGCTGGCTTTGTTGTTCGAAGTGAAGGTG  2763
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Query_67  2764  GGTAAGGGTAAATTGCTTGTGTCAGGAATTGATTTCTGGCAGGATATGGACAAGCGTACG  2823
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Query_67  2824  GAAGCCCGTCAGTTACTCTACAGCTTGAAGAAATATATGTGCGGTAATCGCTTCAATCCC  2883
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Query_67  2884  TCTTCTGAAGTCGATGCGAAAGATTTAAGTATTTTGTTTTCCATTAAAAATCAAAAATAA  2943
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23        842                                                            ...  844
111       837                                                        .......  843
112       833                                                        .......  839
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115       135                                                            ...  133
42        133                                                          .....  129
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28        136                                                         ......  131
30        131                                                            ...  129
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31        134                                                            ...  132
34        135                                                            ...  133
62        136                                                            ...  134
22        135                                                         ......  130
8         136                                                          .....  132
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73        130                                                            ...  128
68        129                                                            ...  127
51        119                                                           ....  116
58        116                                                           ....  113
71        127                                                            ...  125
54        121                                                           ....  118
69        128                                                            ...  126
66        127                                                            ...  125
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20        65                                                             ...  63
18        65                                                             ...  63

Query_67  2944  CATTGGAAGTGGATAACGGATCCGAATTCGAGCTCCGTCGA-CAAGCTT-GCGGCCG-CA  3000
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18        62    .................--.....                                      41

Query_67  3001  CT-CGAGcaccaccaccaccacca-cT-G-AGA-T-CCGGCTGCTAACAAAG-CCC--G-  3050
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Query_67  3051  -AAAGGAAGC-TGAGTTGGC-TG-CTGCCACCGCTGAGCAATAAC-TAG-CA-TAAC-C-  3101
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Query_67  3102  CCTT-GGGGCCTCTAAACGGGTCTT--GAGG-GG--TTTTTTGCTGAAA  3144
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Query= CMR200137.123

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Query_68  53    AAC-AA-TT-CCCC--T-C-TAGAAA-TAA-TTTT-GTTTAAC--TTTAAGAA-GGA-GA  98
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Query_68  99    TATAC-ATATG--CACCAT-CATCATCAT-CATTCTT-CT-GG-TGTAGAT-CTGTGGTC  149
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Query_68  150   TCAT-CC--G-CAGTTCG-AAAAGGGTA-CCGAGAA-CCTGTACTT-CCAAT-CCAATGC  200
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Query_68  201   CCAGACTGATAAGATTGACCTGGCCGGCTCGTGGACATTTTCTACGGACAGCATGGACTG  260
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84        149   ...                                                           151
111       152   .                                                             152
90        149   ...                                                           151
112       156   .                                                             156
82        150   ...                                                           152
100       151   ...                                                           153
95        161   .                                                             161
94        163   .                                                             163
102       160   .                                                             160
80        152   ..                                                            153
29        148   .A..T..                                                       154
72        151   ........                                                      158
97        162   .                                                             162
104       163   .                                                             163
74        146   ........                                                      153
76        150   ..                                                            151
78        148   ..                                                            149
99        144   ...                                                           146
91        145   ...                                                           147
114       168   ........                                                      175
87        799   .                                                             799
122       905   .A...G..                                                      898
101       157   ...                                                           159
137       915   ...                                                           913

Query_68  261   GAGCCGGGTGATTGAACTGCCGGGTTCAATGGCTTCCAATGGTTTTGGGGAAGATATTGC  320
61        198   ............................................................  257
59        204   ............................................................  263

Query_68  321   CGTGGGTACTGATTGGACGGGCGGTATTGTGGATTCTTCTTATTTCTTTAAACCTTCGTA  380
61        258   ............................................................  317
59        264   ............................................................  323

Query_68  381   TGCCAAATACCGTGAGGCAGGAAATATCAAGGTACCTTTCTGGCTTCAGCCGGTAAAATA  440
61        318   ............................................................  377
59        324   ............................................................  383
96        834                 ..............                                  847

Query_68  441   TTACAAGGGTAAGGCGTGGTATCAGAAAGAGGTGGTGATTCCGGACAGTTGGGAAGGAAA  500
61        378   ..........................................................C.  437
59        384   ..........................................................C.  443

Query_68  501   GGACATTTCTCTCTTTTTGGAACGATGCCATTGGGAGAGCCGTTTGTATATAGACGGAAA  560
61        438   ............................................................  497
59        444   ............................................................  503

Query_68  561   GGAAATCGGCATGCAAAATGCTTTGGGGGCGCCCCATCGTTATGACCTGACAGGCAAGCT  620
61        498   ............................................................  557
59        504   ............................................................  563
52        909                                                        ...GN..  903
50        899                                                        .......  893

Query_68  621   TTCAG-CAGGGAAACATGTG-TTGATGCTGTGTGTAGACAA-TCGGGTGAAAAACATTGA  677
61        558   .....-..............-....................-..................  614
59        564   .....-..............T....................-..................  621
52        902   N....A.N....T....-..-C....A....C..-..G.T.-.GN.AG..T....G.A.C  847
50        892   N..NA-....A.T...AT..-.N...N..NCN-.....GGNG.........N.-...A..  837

Query_68  678   TCCGGGGGAGAACTCACATAGTATTTC-CGACCATACACAAGGAAACTGGAACGGGGTG-  735
61        615   ...........................-...............................-  672
59        622   ...........................-...............................-  679
52        846   AAT..TN.N......T....T...C..-N.T...N..........T..CNTN.....G.A  788
48        822                       ....C..-N.T........N..A..T..N.TC.A.N.G.-  785
50        836   .A.T..N.T.NC.....N.N....C..GN.T...G..........T.NNNTC.A...GA-  778

Query_68  736   GTAGGC-GATATGTTCCTGGAAGTAAAGCC-GG-AAGTGAATGTGTC-TTCCGTCAAGAT  791
61        673   ......-.......................-..-.............T............  729
59        680   ......-.......................-..-.............-............  735
52        787   ......T....AA.-.N...NTTAC.....T..-.......N.....-...G........  731
48        784   .C..CT-....A.N.NNN.A.NT.......-T.CN...C.CC.....-...G........  728
50        777   .C..CT-N.G.NAA.GNGNC....CC....-.C-.............-.-.G....G...  723

Query_68  792   TATGCCGGAGCGTCTGGCTAAG-AAAGTCAGTGTGTCGGC-TT-CCTTGATGAACC-GTT  847
61        730   ......................-.................T..-............-...  786
59        736   ......................-.................-..Y.Y..........-...  792
52        730   A.AT.A..T...CAA.CNC...-.......CN......TT-N.-AGAN..G...GN-...  675
48        727   A..-.AA.T.N...AA..GC..T....G..CN.......N-.C-.GAN.....N.GT...  671
50        722   ...CNN......G.AA......T.......CN......AT-.C-.GNA....CGGT-...  666
119       140                                                       ....-...  134
32        266                                                       ....-...  272

Query_68  848   ATGAAAAAGA--TGCCAATGTGGTAC-TGGAGATGACGGTAGGTAATGAAAAAGTACAG-  903
61        787   ..........--.....N........T................N...............-  843
59        793   ...-......--..............-................................-  847
52        674   ..TC......GA..T-.NCC..T.T.-..-..CN..N....T....GC..TC.AGC...-  619
48        670   ...C......--....T..CNTT.TT-C.T.CCA.....C.T....CA.TC....N..AA  614
50        665   N.TC.G....--N...T.G.N...TT-.....CA.........G.GC-..........A-  611
119       133   .....TCG..--......                                            118
32        273   .....TCG..--......                                            288

Query_68  904   --CAACAATG-TACGTTGAAGCCGGGC-GAAAATCAAGTGATGATGTCGCTGGCCATGAA  959
61        844   --.....T..T......TG........-....................K...........  900
59        848   --........-................-.............................N..  903
52        618   --........-...........AAAT.A.....A...C...N....GNATCC...GAA.T  562
48        613   GC....CC..-CC.----......AT.-AG.C.A.......A.....NATCC...GN..T  560
50        610   --AGC.....-...........AAAT.-...C.....CA..N.....AATCCN..--...  557

Query_68  960   G--GGAGACA-TTAAGTGCTGGGATG-AGTTTTCTCCATCCTTATA-TGA-TTTGAAGCT  1013
61        901   .--.......T...............N.......N...........T...T.........  958
59        904   ---.......-...............-.....N....T.......N-...-.........  956
52        561   .--....N..-....AA..A......-..A...N......                      526
48        559   .--T.N.G..-.GC.AA..A......-.....GNC..T..AAC.C.-...-.N..C.AT.  506
50        556   .TG..T.G..-....AA..A......-.....GNC..TA.AAC.C.-N.N-CN..C..T.  501

Query_68  1014  GAGTG-TGAAGGATGC-GG-ATAGCGGTGAAACG-GATGTC-TATG-CGGAACGTTTTGG  1067
61        959   N....T..........-..A..............T......T....N.......N.....  1017
59        957   ..T..                                                         961
48        505   .TCC.--....CCA..A..-.AG...TC...CAA-A.....-...N-...TT.TC...CA  452
50        500   .....-G...C...CA-..-.A....TC....A.-..G...-C...-...----....CA  451

Query_68  1068  -TT---TCCGTGAT-GTG-AAGGTGAAAGAC-GGCAAA-CTCACCATCAAC-GACCGCCG  1118
61        1018  T..---....NN..N...A...NN....N..-.                             1046
52        441                    .-..T......ATT-......-.........CC.-.T...TA-  404
48        451   -G.---..TC-..G-.N.-.....C....TT-.....GG.G..T..C.C-.-.T....N-  403
50        450   -.CCAG..NT...G-.A--..T......A.TT......-..G--.....C.C........  398
105       717               ..-...-.........                                  730
103       719               ..-...-.........                                  732
102       717               ..-...-.........                                  730
104       720               ..-...-.........                                  733

Query_68  1119  TTTG---TTCCTG--CGTGGTACGCTGG--AT-TGTGC--CGTATTTCCGAAGACCG-GT  1167
52        403   ....---GC.A.TTC....--.A.T...--GA-.A...ACN.C..........T...-..  353
48        402   -...---NC.A.TTC....--.A.T...GA.A-.NCA.--N.C..........N...T..  352
50        397   .G.CCAT.....-----..--.A.T...G-..A..CN.--N.C..............-..  349

Query_68  1168  TTCCCGCCCACGGATGTAGAATCCTGGAAAAAGATTTATACCACCTGTCGGCAGCACGGA  1227
52        352   ..T.NC..TNG...G..G.....N...G...-.....G.C..                    312
48        351   .....-.ATCG...N..G.....N.....TGTA......C.....ATAG......CG..G  293
50        348   ..T..C.ATNG...G..G.....G.....TGT.......-...GTCA........-...G  291

Query_68  1228  CTGAACCATGT------GCGCTTCCATTCCTGGTGTCCGCCCGAAGCTGCTTTTGCAGCT  1281
48        292   AG.....G...                                                   282
50        290   GA.CN......TGATAAT.AT..T.GCA...--.......----..GC........----  241

Query_68  1282  GCCGA-TGGGATGGGT----ATGTACCTGGAGATAGAATGTTCTTCCT-GGGCTAACCAG  1335
50        240   .AG..T...A...AN.CGAG.A..--.G..........AT.GG.C.A.CN...--.....  185

Query_68  1336  TCGACTACCATTGGCGATGGAGGCGATCTGGACCGCTTTATCTGGGAGGAAAGTGAACGC  1395
52        2                  ....-..........................................  47
48        2                  ....-..........................................  47
50        5                        .........................................  45
50        184   .NC.A...............T..........N...G..                        147

Query_68  1396  ATCGTCCGTGAGTTTGGTAACCATCCTTCTTTCTGCATGATGATGTACGGTAACGAACCG  1455
52        48    ....................................T.............G......G..  107
48        48    ....................G..........G....T.............G....CTG..  107
50        46    ....................................T......G......G...C.GG..  105

Query_68  1456  GCTGGTGAGGGAAGTAATGCCTATCTGACTAATTTTGTTACTACCTGGAAAGAGCGCGAT  1515
52        108   ............................T.........A..A...G.N.....T.....C  167
48        108   .................A............C..............G..............  167
50        106   .A............A..A..........T.CC......AN.A...G.NCC...T...C.C  165

Query_68  1516  GCCCGCCGTTTATATTGTTCGGGTGCCGGATGGCCCAATTTGCCGGTTAACGACTTCTTG  1575
52        168   .......AA.GG.....NA.T............A.......CTATC....G.........  227
48        168   ........-.GG.....NA.T....................CTATC.CC.G...C..AC.  226
50        166   CAT....AA.GG.....NA.T......N.....A.......-.TATC.CC........C.  224

Query_68  1576  AGCGATTCCAATCCTCGTATTCAGGCGTGGGGACAAGGTGTGAAGAGTATTATCAACGCA  1635
52        228   .NTC.....N....CT.C....NC..C.TC......ACACC...A.TG.........NTG  287
48        227   CAT....T.N....CT.C.AA.GN.....C....G.....C...A.TG.........A.G  286
50        225   .NTC.............C.AAAGC..C..C..........C...A.TG........--..  282

Query_68  1636  CAG-GCTCCGCG--TACCGACTTTGACTGGTCAGAATACATCGGACGTTTCCAGCAGCCG  1692
52        288   ...-.....C..--G.TGC...A....G..A..-...CTT..CC.N.A.....C.TC..N  343
48        287   GTT-C....C..GC.G..--..A..GTG..AT.A.T.....TCC.N.A.....CNTC...  343
50        283   TG.N.....C..GC.G....---.......AT.A.TC....TCC...A.....C.TC..N  339

Query_68  1693  ATGGTGAGCCACGAAATCGGGCAGTGGTGTGTATATCCCAACTTCAAGGAAATGGCCAAA  1752
52        344   .G..N..AAAC..G.C.TC..A.A..CN...C..............C.............  403
48        344   ....G..AA....GNC.TC..A.A..CN...N..T...........C........N...N  403
50        340   ....G..AAAC..GTC.TC..A.A..CN.N.C.......................----.  395

Query_68  1753  TAC-GACG---GGG-TGATGC-GCCCGCGTAATTTTGAGATATTCCAGGAAACACTGGCT  1806
52        404   ...G....---...A..G..A-.TTT..-C......C.C..TC...TC.CT.......N.  458
48        404   GCG-....---...-......-...TTGCC..C.....CC.TCN..TC..G.-....AAA  456
50        396   C..-.G..GTC...-......A.TTT..CA.T....C.C..-....-TC..NG.....A.  451

Query_68  1807  GAAAACGGTATGGCACATTTGGCT-GACAGCTTCCTGCTGGCTTCCGGAAAATTGCAGG-  1864
5         1229                                                     ........G  1221
52        459   ..NNT.C.N....AC.T....TT.-...NNT.........CT.C..A..C.......N.-  516
48        457   ..G...C.N..A.-......T.T.C...GC...................C.......NA-  514
50        452   ......C.C....                                                 464

Query_68  1865  CGTTGTGTTATA-AGGCCGATATCGAAGCTGCTTTGCGTAC---AAAAGACTT-CGGTGG  1919
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5         1220  ........-...TNNNN...AN.N...NN.N.C...N....---...NNNNN.-......  1166
14        1195                   ...AN........N...N......---...N.NN.--......  1158
3         1196                       .............G.....TNCA.........-.....A  1159
52        517   TCN......                                                     525
48        515   TCA......GA.-G..N.A.AC..ATCC.........A.G.---CNC.C.TCN-...C..  569

Query_68  1920  -ATTCCA--GTTACTGGGCTTGTCTGATTTCCCGGGGC-AGGGTACGG-CTTTG-G-TA-  1971
0         1155  -...N..--..N.....-..A........N......-.-.A......--...G.-T-A.-  1107
5         1165  G......--.....NTNN..GN.NN..........A..N..N.....A-N....A.-..A  1110
14        1157  -.N.NA.--..-...NNNNN......N..C.....NNA-...-.....-NC...-.-.T-  1108
12        1147       ..--.......NNTN.-..-.......N.A..N-.A.......-NN...-.-..-  1102
3         1158  -.NNN-.--.N-..NN.-..N..TNN.A.NN...N.NN-N.N--....G.N.G.-.-..-  1111
48        570   -..NA..TCT.C...T.--.........CGG.TT....-.....-T..-.....-NACT-  621

Query_68  1972  GGAG-TGC-TCGAT-GCG-T-TCTGGGAAG--AAAAA-GGCTA-CA-T-CCGTCC-GGAA  2019
0         1106  ....-...-NN...-N..A.-...T....AGA.....-.....-..-.T......C....  1054
5         1109  ....N...C.....-...-.N.........N-.....-.....-..-.T......-.-..  1058
14        1107  A...ANN.-.NNNNN...-G-.........--.....-.....A..N.-.G....-....  1056
12        1101  ....-...-.....-...-.--..T.....--.....A.....-.N-.-T.....-N...  1054
3         1110  A.NA-GN.-.....-...-A-........AGA.....-.....-..-.-......-....  1061
48        622   T..T-..T-.AC..-..C-G-.....T.C.--.....-N.A..                   656

Query_68  2020  GAATA-CCGTCGTTTCTGT-AATAGTACGGTACCATTACTGCGC-TTGCCGAAG-TTGAT  2075
0         1053  .....-.............N..........N.....-.......C.........-.....  997
5         1057  ...NN-......G...NN.-........................-.........-.....  1002
14        1055  .....-..........NN.-.......................G-N........-.-...  1001
12        1053  ...AN-AN......-....-.........-.N............-....NN.-.-....N  1001
3         1060  .....A.....CG......-...........N............-.-.......G.....  1004
48        695                             ..N..G..T.........-...A.NC.C-.....  726

Query_68  2076  TTATACC-AACCAGG-AAACGGTGAAA-GGAAGTCTGGAA-GTGGCACATTTCGGAGCTG  2131
0         996   .......-.......-...........-A...........-...-......CG.A.....  942
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12        1000  .-.....-.-....--...........-......N.....-...................  948
3         1003  ....C..-....CA.-G..........A.........N..-.....N....-........  948
48        727   .                                                             727

Query_68  2132  CT-CCGCTGGAGG-TG-ACTTCT-ACTGTCTGGACCC-TG-AAAAC--AAAAG--AA-GG  2180
0         941   ..-..........-..-......-.............-..-.....--.....--..-..  893
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3         947   ..-..........-..-......-........N....-..-....ACA.....--..A..  896
88        924                                 .......C..N.....--....NGA..-..  898

Query_68  2181  AAAG-ACAATTGCTT-CGGG-CACGCTGGCACA-CCAG-CC-GG-TAGGTAT-CGGCAAT  2232
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88        897   ....G......NA..T....A..N.........N....A..-..N..N..T.T......N  839

Query_68  2233  TGT-ATTCCGTTGGGGCAGCTGGAGA-TTCC-ATTGGATAAGG-TGGACGTCCC--TTCA  2286
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3         843   ...-......................-....-...........-..........C-....  789
88        838   .N.TN....N.G............NNG....N..G......N.N..........CT....  779

Query_68  2287  -TGTCTGA-CACTGGAAGCTACATT-GGGAGATTACGCCAA-CAGCTGGCACATCTGGGT  2342
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88        778   N.N.....N........N.......T...............-..................  720

Query_68  2343  ATATCCTGCTGCGGTACA-GAAAGTAGCTGATGAA-GCACAATTGCTGATGACCGACCGT  2400
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Query_68  2401  CTGGATGCAAAA-GCTTTGCAACGTCTTCAGGAAGGTGGCAACGTACTGCTTTCTTTACG  2459
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3         673   ............-...............................................  615
88        659   ............A.......................N.......................  600

Query_68  2460  GAAAGGCTCCTTGCCTGCCGAAGCGGGAGGCGAAGTAGTGATAGGTTTCTCTAGCATCTT  2519
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3         614   ............................................................  555
88        599   ............................................................  540

Query_68  2520  CTGGAACACGGCCTGGACGCTGGGACAAGCACCGCACACACTGGGTATCCTGTGTAACCC  2579
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3         554   ............................................................  495
88        539   ............................................................  480

Query_68  2580  CGCTCATCCGGCACTTTCAGAGTTCCCTACAGAGTATTACAGTGATTATCAGTGGTGGGA  2639
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3         494   ............................................................  435
88        479   ............................................................  420

Query_68  2640  TGCCATGAGCCATTCCGGTGCCATCGAAGTGGTCAAGATTGATAAAAACTTGCAGCCGAT  2699
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3         434   ............................................................  375
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Query_68  2700  TGTACGAGTTATCGACGACTGGTTTACGAACCGTCCGCTGGCTTTGTTGTTCGAAGTGAA  2759
0         373   ............................................................  314
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3         374   ............................................................  315
88        359   ............................................................  300

Query_68  2760  GGTGGGTAAGGGTAAATTGCTTGTGTCAGGAATTGATTTCTGGCAGGATATGGACAAGCG  2819
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3         314   ............................................................  255
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Query_68  2820  TACGGAAGCCCGTCAGTTACTCTACAGCTTGAAGAAATATATGTGCGGTAATCGCTTCAA  2879
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3         254   ............................................................  195
88        239   ............................................................  180

Query_68  2880  TCCCTCTTCTGAAGTCGATGCGAAAGATTTAAGTATTTTGTTTTCCATTAAAAATCAAAA  2939
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3         194   ............................................................  135
88        179   ............................................................  120
83        131                                                            ...  129
85        134                                                            ...  132
110       836                                                            ...  838
39        814                                                              .  814
111       837                                                            ...  839
112       833                                                            ...  835
49        136                                                            ...  134
26        136                                                             ..  135
40        133                                                              .  133
44        136                                                            ...  134
42        133                                                              .  133
38        133                                                              .  133
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46        138                                                            ...  136
28        136                                                             ..  135
24        136                                                             ..  135
22        135                                                             ..  134
8         136                                                              .  136
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87        122                                                            ...  120
79        65                                                               .  65
75        67                                                               .  67
81        65                                                               .  65
77        65                                                               .  65

Query_68  2940  ATAACATTGGAAGTGGATAACGGATCCGAATTCGAGCTCCGTCGA-CAAGCTT-GCGGCC  2997
0         133   .............................................-.......-..N...  76
5         134   .............................................-......N-......  77
14        134   .............................................-.......-......  77
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Query_68  2998  G-CACT-CGAGcaccaccaccaccacca-cT-G-AGA-T-CCGGCTGCTAACAAAG-CCC  3049
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Query_68  3050  --G--AAAGGAAGC-TGAGTTGGC-TG-CTGCCACCGCTGAGCAATAAC-TAG-CA-TAA  3099
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Query_68  3100  C-C-CCTT-GGGGCCTCTAAACGGGTCTT--GAGG-GG--TTTTTTGCTGAAA  3144
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Gapped
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Effective search space used: 478468354


Query= CMR200148.116

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29        147   ..-...------TC.--C.GCA.---..C.....T.....C...GA..CAT.....AAG.  194
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85        813   ..-..                                                         810
83        813   ..                                                            812
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105       159   ..-.                                                          161
103       161   ..-.                                                          163
96        159   ..                                                            160
9         154   ..                                                            155
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70        151   ..-C..                                                        155
112       155   ..                                                            156
102       159   ..-.                                                          161
95        160   ..                                                            161
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82        149   ..                                                            150
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80        151   ..                                                            152
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104       162   ..-.                                                          164
72        150   ..-C..                                                        154
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Query_69  245   GGATGACCTTGCAGGAAAAGTTA--GGACAGTTGAATCT-GCCG-GCT-GGGA---ATGA  296
117       599   A.......G..G.A..G..AA.C--.....A.....C..AC...-T.A-C..G---.-..  548
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137       867   A......TG.AG.......AGA.TC..T...C....C..-N..C-.T.-TCCG---GC..  814

Query_69  297   CCTGGTGTCGGGAGCAGTGA-AGAA-CAGCAAGATGGCAGAAGCTATCCGAGCTGGTGAG  354
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137       813   GA.C..CA.C..-....GC.C.A..-....G.TG.....A..AAAGATT..A.AA.G.CT  756

Query_69  355   -GTCGGCGGCTTT-TTCAATGTGAAGGGAGTGGATAAGATTTACCAGATG--CAGCGTA-  409
117       489   -..G.....AC.C-.....CC.A..A..T..A..CCGT...CTTG.AG..--..AAAGC-  435
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137       755   C..G.....AC.C-C....CC....A..G.....G.....--..GC....--T.CAAA.A  701

Query_69  410   -TGGCGGTGGAGGAAACTCGTCTGGGAATTCCTTT---GATAGTGGGTGCCGATGTGATT  465
55        142                                                 ..............  129
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137       700   C....CA.A...A.GT.A..C.....C..C..CC.---....T.C..CATG..C..AG.G  644

Query_69  466   CACGGGTACGAAACAATCTTCCCGATTCCGTTGGCCCTGTCTTGTAGCTGGG----ATAC  521
117       378   ..T..C........C........C.....A....GAT....C..C.C.....----...T  323
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137       643   ..T..T........C..T.....T.....A..A.G...C..C...TC.....----...T  588

Query_69  522   GGCGGCGGT-GA-C-ACGTATGGCACGTATTTCTGCCACGGAAGCCAGTGCCGATGGAAT  578
117       322   ......TA.C..-G-.AA.-CC..C......G.A....TC.....A...........C..  266
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Query_69  579   CAGCTGGACCTTCAGTCCGATGGTAGACATCTGTCGGGATGCCC-GCTGGGGACGTATTG  637
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Query_69  638   CAG-AAGGAAGTGGAGAGGACCCGTACCTCGG-GGCGTT-GATGGCTGGAGCCTAT-G-T  692
117       206   GC.-.G..CTCG.....A..T....TT..G..T..A.C.--..C..-AC..G.A..G.-.  152
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9         550   .C.-....GT....T..A..TA.......                                 577
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Query_69  693   GCGCGGTTATCAGGGT---G----ACGGCA---------TGA-AGC----------AG-A  724
117       151   ATA...A..C......---.CCAAT.T...AGACCAAT-..C-.C.----------GC-.  108
17        644   ATCG............ATC.----..CT..ACAACCAAC...-...----------GC-.  687
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126       1073                                         ...-...----------GC-.  1065

Query_69  725   ACAATGAAATCATGGCCTG-TGTGAAGCACTTTGCGC---TGTATGGAGCTTCGGA-ATC  779
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Query_69  780   GGGACGTGACTACAATTCGGTG-GATATGAGTCG-AAACCTGATGTATAATGTGTACCTG  837
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Query_69  838   GCTCC-TTATAAAGGGGCGGTGGAAGCCGGAGTGGGTTCGGTGATGAGCTC-GTTCAATA  895
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134       951   TA...-C..-CC..CT..-..A..T..A..T..A..CAGC..A...-..GT-C.....CG  897

Query_69  896   CCATCAACGGGGTACCTGCTACAGCTGACA-AATGGC-TGCTGACGGATTTGCTCCGCAA  953
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Query_69  954   TGAGTGGGGGTTC-ACGGGGTTTGTGGTGACCGACTACAATTCGATTGGTGAGATGA-AG  1011
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134       838   GC.A.....C...G..--..C..........A....                          805

Query_69  1012  ACTCATGGGGTGGCCGACTTGAAGGAGGCTTC--TGCACGGGCGTTGAATGCAGGAACGG  1069
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Query_69  1070  ACATGGATATGGTGGCACATGGTT-TCTTGCA--TACGCT-G--GAAGCTTCATTGAAGG  1123
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Query_69  1124  AG---AAGGCCGTG-ACGCAGGAGCGG--ATTGACGA-GGCTTGTCGTCG-GGTATTGGA  1175
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Query_69  1176  AGCCAAGTATAAGTTAGGATTGTTTGAAAATCCTTATAAGTATTGTGATACGCTTCGGGG  1235
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Query_69  1236  ACGCAAGGAATTGTTTACGGAGGCGAATCGTAAAGCGGCACGTGAGATTGCGGCTGAAAC  1295
55        512   .......C.........N.....T............C........C.A............  453
4         365   CAAA.C...TA.C.AC..T..T.AAC....G.GTATT.....CCG...CT.T.......G  424

Query_69  1296  GTTTGTGCTGTTGAAGAACGAGGGTAAGTTGTTGCCTTTGCAGAAAAAAGGACGCATTGC  1355
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Query_69  1356  ATTGATTGGGCCGATGGCTGATGC-GCAGAAC--AATA-TGTGCGGCACGTGGAACA-TG  1410
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4         485   TG.AG........T....GA..A.-.-..TT.T-....-..CC...A.......        534

Query_69  1411  GA-TTGTC-AGACAGACCGTCA-TGTGACGA-TGTACGAAGCTTTCCGTC-GTGCGGT-A  1464
8         1146  ..A.....N.....NG......A...NNN..A........AGC.......C.......N.  1087
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Query_69  1465  GGTGATAAGG-CTACGG--TTTCTTATGCC-AAGGGAA-GTAATG-TGT-ATTATA-GTG  1516
8         1086  ..........G....C.GT........N..C.......A......N...T......A...  1027
55        283   ..........-......--...NC...N..-.......-..C.N.-.C.-N.....-...  232

Query_69  1517  AGCATATTGAGAAA-GGGGCGG-TCGAA-CCTCGTCCGCTGACACGTGGCGATGACCGTC  1573
8         1026  .....NN.......A.......G.....A.........N.....................  967
55        231   ..............-.......-.....-....A..........................  175

Query_69  1574  AGTTGCGGGCTGAGGCTTTGCGCGTGGCGGCTTCTGCC-GATGTGATTGTGGCCGCATTA  1632
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Query_69  1633  GGTGAGAGTGCTGAGATGAGCGGAGCTT-CTTCTTCTCGTACAGATATTCAGATT-CCGG  1690
8         906   ............................T..........................-....  848
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4         777   .....ATC.T....A.....T..T.AA.-.GAG.AG...A......T.GA.T...-..T.  834

Query_69  1691  ATGCGCAGAAAGATTTGTTGAAGGCATTGATAGCTACCGGAAAGCCGGTGGTACTGGCTT  1750
8         847   ............................................................  788
55        59    ...A.........-.CC.........-.....CAGG..................        8
27        167                                      ..T........T..T......A.GC  191
23        169                                      ..T........T..T......A.GC  193
115       811                                      ..G..T..A..C..A.....AA.CC  787
116       799                                           ...N..T..T......A.GC  780
33        381   ..A....ACGT.TAC.T...C...A....T.GAAA.....C..A.........T...TG.  440
121       69    ..A....ACGT.TAC.T...C...A....T.GAAA.....C..A.........T...     13
4         835   ...TT..-...ACN..A...G.A.A...AG.GAAA..A..N..-..T..C..T....TA.  892
2         456                                      ..G..T..A..C..A.....AA.CC  480
25        467                                      ..T........T..T......A.GC  491

Query_69  1751  TGTTTACCGG-TCGTCCGCTG--GATTTATGCTGGGAGTCTGAGCATGT-TCCGGCTATC  1806
8         787   ..........-..........--..........................-..........  732
27        192   .C.....A..-...C..A..A--ACG..GACT.....ACAG........-G..C..C...  247
23        194   .C.....A..-...C..A..A--ACG..GACT.....ACAG........-G..C..C...  249
115       786   .C........G...G...T..--ACGC.GAA......ACAG........-A..T..C...  730
116       779   .C..N..A..-...C..A..A--ACG..GACT.....ACAG........-G..C..C...  724
33        441   ..........-.......T.A--.TA..GAAT......CAG..AA....-A..T.....T  496
4         893   .A..C..T..-G......T..ACCC..G.CNTG..A..A.--.AA....A..TT.....T  949
2         481   .C........-...G...T..--ACGC.GAA......ACAG........-A..T..C...  536
25        492   .C.....A..-...C..A..A--ACG..GACT.....ACAG........-G..C..C...  547

Query_69  1807  CTGAAC-GTGTGGTTTGCCGGCAGTGAAGCGGGTGATGCCATTGCCGATGTGATGTTTGG  1865
8         731   ......-.....................................................  673
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115       729   T....T-..A.....C.GA.............C.T.........G......TC....C..  671
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33        497   .....T-..........GT..T........T.C.CT........GT.....AC.......  555
4         950   .....T-..T.......GA..T.NC...A.C.C.T....TN.A.NA.....-C.N..C..  1007
2         537   T....T-..A.....C.GA.............C.T.........G......TC....C..  595
25        548   .....T-..A.....C.GT..A.....G..A.CAT.C.......G......AT....C..  606

Query_69  1866  AGAAGTATCTCCTTCGGGTAAGCTGACTACGA-GTTTCCCACGTGCGGTGGGACAGTTGC  1924
8         672   ................................-...........................  614
27        307   C..T...                                                       313
23        309   C..T...                                                       315
115       670   T..C..CAA...GAGT..A..A..A..C.T..-C......                      632
116       663   C..T...AA...                                                  652
33        556   .A.T...AA...GAGT..C..A..T.....T.CT.....G.A.A.-T..A......A.T.  614
4         1008  .A.T...AT....GGA......                                        1029
2         596   T..C..CAA...GAGT..A..A..A..C.T..-C......                      634
25        607   C..T...AA...CAGC..C..A..A..G.T..-CA.....CAAAAAC..A..C..AA.A.  665

Query_69  1925  CGCTTTATTATAATCACCTGAATACGGGTCGTCC---GGAT-AC--GGATGACACTACTT  1978
8         613   ..................................---....-..--..............  560
33        615   .TT.G.TC.....C..TAA......T........TTT.CC.C.A--..--.G.-..GG..  669
25        666   .TT.G.T...C.....TAAA.....C........---TT-.-..TT.A.A.G..AATGG.  720

Query_69  1979  TCAATCGTTATGGCAGCAATTACATCGA-CC-AGAGTAATGAACCGCTTTATCCTTTTGG  2036
8         559   ............................-..-............................  502
115       523                                       ...Y........G.....C..C..  500
33        670   C..GAA...-CC.T........TC.G..TGT-...-...C..............G.....  726
2         744                                       ...N........G.....C..C.N  767
25        721   ..G.AAAA.TCC.T..T......C.G..-TGT...C-..C..T..AT.G.....A..C..  778

Query_69  2037  CTATGGTTTGAGTTATACC-ACTTTCCGTTACGGT-AATTTGCAGTTGAGTGCGGAGCGT  2094
8         501   ...................-...............-........................  444
115       499   T.....A...TCG......-.......AG...A..G.CA.....-.....            452
33        727   A.....C.....C.....T-......                                    751
2         768   T.....A...TCG......-.....                                     791
25        779   ..........TCG......A......                                    804

Query_69  2095  ATGGCCAAGGGTGGGCAGTTGAAGGTAACCGTGCCTGTAACCAATTCCGGCGAGTGTGAC  2154
8         443   ............................................................  384

Query_69  2155  GGAGTAGAGATTGTGCAGTTGTATCTTCACGATGTGTATGCAGAAATCTCCCGTCCGGTG  2214
8         383   ............................................................  324
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Query_69  2215  AAGGAGCTGAAA-GCTTTCCGCCGTGTGGCCCTTAAAAAGGGAGAGACACAGAATGTAGA  2273
8         323   ............-...............................................  265
6         923   ..A..A......C....                                             939

Query_69  2274  GTTTGTACTCGATGAGGATGATTTGAAGTATTATAATTCTCGTCTGGAATATGGATATGA  2333
8         264   ............................................................  205
115       204                                                             ..  203
116       197                                                             ..  196
37        675                                                  .............  687

Query_69  2334  ACCGGGAGAGTTTGAAGTGATGGTGGGTCCGGACAGCCGGAATGTGCAGCACGCGACTTT  2393
8         204   ............................................................  145
115       202   ......T..C.....CA.C...A.C...GGAA......A.GC....A..ACG....AG..  143
116       195   .........C..C..CA.A...A.C..GGG.A......--..A...T.AA.A-.....CA  139
37        688   ..                                                            689

Query_69  2394  TGTGGCTGAATAACATTGGAAGTGGATAACGGATCCGAATTCGAGCTCCGTCGA-CAAGC  2452
8         144   ......................................................-.....  86
85        132           ..............................................-.....  82
83        129           ..............................................-.....  79
110       838           ..............................................A.....  889
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27        841             ............................................-.....  889
23        842             ..........................N.....C...........-.....  890
111       839           ..................................N...........-.N...  889
112       835           ..............................N.-.............-.....  884
40        133           ..............................................-.....  83
26        135           ..............................................-.....  85
64        139      ......G............................................-.....  84
60        141      ......G............................................-.....  86
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115       142   ---.A.ACTT............................................-.....  87
44        134           ..............................................-.....  84
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116       138   .C..AG.TTG............................................-.....  80
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14        135           ..............................................-.....  85
0         134           ..............................................-.....  84
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12        138           ..............................................-.....  88
3         135           ..............................................-.....  85
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5         135           ..............................................-.....  85
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79        66           .......................--.....                         39
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18        65              ....................--.....                         41

Query_69  2453  TT-GCGGCCG-CACT-CGAGcaccaccaccaccacca-cT-G-AGA-T-CCGGCTGCTAA  2504
8         85    .N-.N.....-....-.....................-..-.-...-.-...........  34
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75        45                                                 .-.-...........  33
81        43                                                 .-.-...........  31
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Query_69  2505  CAAAG-CCC--G--AAAGGAAGC-TGAGTTGGC-TG-CTGCCACCGCTGAGCAATAAC-T  2555
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    Posted date:  Oct 24, 2017  11:00 AM
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