| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | AE015451 | 2,837,065 | Δ3 bp | intergenic (‑17/+164) | sad‑I ← / ← PP_2489 | NAD+‑dependent succinate semialdehyde dehydrogenase/putative Xenobiotic reductase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | AE015451 | 2,837,064 | 0 | G | . | 100.0% | 12.9 / NA | 5 | intergenic (‑16/+167) | sad‑I/PP_2489 | NAD+‑dependent succinate semialdehyde dehydrogenase/putative Xenobiotic reductase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base . (1/4); total (1/4) | |||||||||||
| * | AE015451 | 2,837,065 | 0 | T | . | 100.0% | 12.9 / NA | 5 | intergenic (‑17/+166) | sad‑I/PP_2489 | NAD+‑dependent succinate semialdehyde dehydrogenase/putative Xenobiotic reductase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base . (1/4); total (1/4) | |||||||||||
| * | AE015451 | 2,837,066 | 0 | G | . | 100.0% | 12.9 / NA | 5 | intergenic (‑18/+165) | sad‑I/PP_2489 | NAD+‑dependent succinate semialdehyde dehydrogenase/putative Xenobiotic reductase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base . (1/4); total (1/4) | |||||||||||
AGCGTAATACTCTAAAATTCGCGCTGAAATCTCGACTTCGCCCAAAGCTTCAGCGGTGATCTTGCCCATCTCTAAGGTTAGCAGGTGGGCATAGTCGCTGGCCTGGGCGCGTAGCAGCTCAGCTGCCCGCTGGAGAATGGCACTGCGTTCGGTAAAGCTGCGTTCTTTCCAGTCGAGGAACGCGCTATGTGCGTCGTCCAGCGCCTGATTGACCTGGTCGTCGGTGGTTTCTGGGAAGGTCTTGAGCAATTCCCCGTTATAGGGGTTGATAGTGGCGTAAGCCATGTGATTCTCCTACTCGTGGCATGGTGGCATGGTGGCATGGTGGCATGGTGGCATGGTGGCATGGTGGCATGGTGGCATGGTGGCATGGTGGCATGGTGGCATGGTGGCATGGTGGCATGGTGGAATGGTGGCATGAAAAGCTCCGGTCTTTCCGTACGTGGTGACAGGGGCTGAAACTCGGATTACTCCACCGGCGTATACCGTTCGAGCCAGTGGGCGTAAG > AE015451/2836764‑2837271 ||| aGCGTAATACTCTAAAATTCGCGCTGAAATCTCGACTTCGCCCAAAGCTTCAGCGGTGATCTTGCCCATCTCTAAGGTTAGCAGGTGGGCATAGTCGCTGGCCTGGGCGCGTAGCAGCTCAGCTGCCCGCTGGAGAATGGCACTGCGTTCGGTAAAGCTGCGTTCTTTCCAGTCGAGGAACGCGCTATGTGCGTCGTCCAGCGCCTGATTGACCTGGTCGTCGGTGGTTTCTGGGAAGGTCTTGAGCAATTCCCCGTTATAGGGGTTGATAGTGGCGTAAGCCATGTGATTCTCCTACTCg < 1:489753/301‑1 (MQ=255) 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tcagctGCCCGCTGGAGAATGGCACTGCGTTCGGTAAAGCTGCGTTCTTTCCAGTCGAGGAACGCGCTATGTGCGTCGTCCAGCGCCTGATTGACCTGGTCGTCGGTGGTTTCTGGGAAGGTCTTGAGCAATTCCCCGTTATAGGGGTTGATAGTGGCGTAAGCCATGTGATTCTCCTACTCgtggcatggtggcatggtggcatggtggcatggtggcatggtggcatggtggcatggtgccgtggtagcatggtggcatgttggcatggttgaatggtggcatgagatcggaagagcac > 3:75490/1‑286 (MQ=255) cgctGCCCGCTGGAGAATGGCACTGCGTTCGGTAAAGCTGCGTTCTTTCCAGTCGAGGAACGCGCTATGTGCGTCGTCCAGCGCCTGATTGACCTGGTCGTCGGTGGTTTCTGGGAAGGTCTTGAGCAATTCCCCGTTATAGGGGTTGATAGTGGCGTAAGCCATGTGATTCTCCTACTCgtggcatggtggcatggtggcatggtggcatggtggcatggtggcatggtggcatggtggcatggtggcatggtggcatggtggcatggtggaatggtggcatgaaaagctccggtctttc < 3:56329/300‑18 (MQ=255) cGTTCTTTCCAGTCGAGGAACGCGCTATGTGCGTCGTCCAGCGCCTGATTGACCTGGTCGTCGGTGGTTTCTGGGAAGGTCTTGAGCAATTCCCCGTTATAGGGGTTGATAGTGGCGTAAGCCATGTGATTCTCCTACTC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GTGGCATGGTGGCATGGTGGCATGGTGGCATGGTGGCATGGTGGCATGGTGGCATGGTGGCATGGTGGCATGGTGGCATGGTGGCATGGTGGAATGGTGGCATGAAAAGCTCCGGTCTTTCCGTACGTGGTGACAGGGGCTGAAACTCGGATTACTCCAcc < 4:516511/301‑1 (MQ=255) 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AGCGTAATACTCTAAAATTCGCGCTGAAATCTCGACTTCGCCCAAAGCTTCAGCGGTGATCTTGCCCATCTCTAAGGTTAGCAGGTGGGCATAGTCGCTGGCCTGGGCGCGTAGCAGCTCAGCTGCCCGCTGGAGAATGGCACTGCGTTCGGTAAAGCTGCGTTCTTTCCAGTCGAGGAACGCGCTATGTGCGTCGTCCAGCGCCTGATTGACCTGGTCGTCGGTGGTTTCTGGGAAGGTCTTGAGCAATTCCCCGTTATAGGGGTTGATAGTGGCGTAAGCCATGTGATTCTCCTACTCGTGGCATGGTGGCATGGTGGCATGGTGGCATGGTGGCATGGTGGCATGGTGGCATGGTGGCATGGTGGCATGGTGGCATGGTGGCATGGTGGCATGGTGGCATGGTGGAATGGTGGCATGAAAAGCTCCGGTCTTTCCGTACGTGGTGACAGGGGCTGAAACTCGGATTACTCCACCGGCGTATACCGTTCGAGCCAGTGGGCGTAAG > AE015451/2836764‑2837271 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |