Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | AE015451 | 2,837,071 | Δ6 bp | intergenic (‑23/+155) | sad‑I ← / ← PP_2489 | NAD+‑dependent succinate semialdehyde dehydrogenase/putative Xenobiotic reductase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | AE015451 | 2,837,071 | 0 | G | . | 100.0% | 14.8 / NA | 5 | intergenic (‑23/+160) | sad‑I/PP_2489 | NAD+‑dependent succinate semialdehyde dehydrogenase/putative Xenobiotic reductase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base . (1/4); total (1/4) | |||||||||||
* | AE015451 | 2,837,072 | 0 | G | . | 100.0% | 14.8 / NA | 5 | intergenic (‑24/+159) | sad‑I/PP_2489 | NAD+‑dependent succinate semialdehyde dehydrogenase/putative Xenobiotic reductase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base . (1/4); total (1/4) | |||||||||||
* | AE015451 | 2,837,073 | 0 | T | . | 100.0% | 14.8 / NA | 5 | intergenic (‑25/+158) | sad‑I/PP_2489 | NAD+‑dependent succinate semialdehyde dehydrogenase/putative Xenobiotic reductase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base . (1/4); total (1/4) | |||||||||||
* | AE015451 | 2,837,074 | 0 | G | . | 100.0% | 14.8 / NA | 5 | intergenic (‑26/+157) | sad‑I/PP_2489 | NAD+‑dependent succinate semialdehyde dehydrogenase/putative Xenobiotic reductase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base . (1/4); total (1/4) | |||||||||||
* | AE015451 | 2,837,075 | 0 | G | . | 100.0% | 14.8 / NA | 5 | intergenic (‑27/+156) | sad‑I/PP_2489 | NAD+‑dependent succinate semialdehyde dehydrogenase/putative Xenobiotic reductase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base . (1/4); total (1/4) | |||||||||||
* | AE015451 | 2,837,076 | 0 | C | . | 80.0% | 10.0 / ‑1.9 | 5 | intergenic (‑28/+155) | sad‑I/PP_2489 | NAD+‑dependent succinate semialdehyde dehydrogenase/putative Xenobiotic reductase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/1); new base . (1/3); total (1/4) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
ATTCGCGCTGAAATCTCGACTTCGCCCAAAGCTTCAGCGGTGATCTTGCCCATCTCTAAGGTTAGCAGGTGGGCATAGTCGCTGGCCTGGGCGCGTAGCAGCTCAGCTGCCCGCTGGAGAATGGCACTGCGTTCGGTAAAGCTGCGTTCTTTCCAGTCGAGGAACGCGCTATGTGCGTCGTCCAGCGCCTGATTGACCTGGTCGTCGGTGGTTTCTGGGAAGGTCTTGAGCAATTCCCCGTTATAGGGGTTGATAGTGGCGTAAGCCATGTGATTCTCCTACTCGTGGCATGGTGGCATGGTGGCATGGTGGCATGGTGGCATGGTGGCATGGTGGCATGGTGGCATGGTGGCATGGTGGCATGGTGGCATGGTGGCATGGTGGCATGGTGGAATGGTGGCATGAAAAGCTCCGGTCTTTCCGTACGTGGTGACAGGGGCTGAAACTCGGATTACTCCACCGGCGTATACCGTTCGAGCCAGTGGGCGTAAG > AE015451/2836780‑2837271 |||||| aTTCGCGCTGAAATCTCGACTTCGCCCAAAGCTTCAGCGGTGATCTTGCCCATCTCTAAGGTTAGCAGGTGGGCATAGTCGCTGGCCTGGGCGCGTAGCAGCTCAGCTGCCCGCTGGAGAATGGCACTGCGTTCGGTAAAGCTGCGTTCTTTCCAGTCGAGGAACGCGCTATGTGCGTCGTCCAGCGCCTGATTGACCTGGTCGTCGGTGGTTTCTGGGAAGGTCTTGAGCAATTCCCCGTTATAGGGGTTGATAGTGGCGTAAGCCATGTGATTCTCCTACTCgttgcatggtggctggg > 3:575493/1‑297 (MQ=255) aTTCGCGCTGAAATCTCGACTTCGCCCAAAGCTTCAGCGGTGATCTTGCCCATCTCTAAGGTTAGCAGGTGGGCATAGTCGCTGGCCTGGGCGCGTAGCAGCTCAGCTGCCCGCTGGAGAATGGCACTGCGTTCGGTAAAGCTGCGTTCTTTCCAGTCGAGGAACGCGCTATGTGCGTCGTCCAGCGCCTGATTGACCTGGTCGTCGGTGGTTTCTGGGAAGGTCTTGAGCAATTCCCCGTTATAGGGGTTGATAGTGGCGTAAGCCATGTGATTCTCCTACTCgtggcatggtggcatgg > 3:124596/1‑301 (MQ=255) gcgcTGAAATCTCGACTTCGCCCAAAGCTTCAGCGGTGATCTTGCCCATCTCTAAGGTTAGCAGGTGGGCATAGTCGCTGGCCTGGGCGCGTAGCAGCTCAGCTGCCCGCTGGAGAATGGCACTGCGTTCGGTAAAGCTGCGTTCTTTCCAGTCGAGGAACGCGCTATGTGCGTCGTCCAGCGCCTGATTGACCTGGTCGTCGGTGGTTTCTGGGAAGGTCTTGAGCAATTCCCCGTTATAGGGGTTGATAGTGGCGTAAGCCATGTGATTCTCCTACTCgtggcatggtggcatggtggg > 1:56328/1‑300 (MQ=255) cTGAAATCTCGACTTCGCCCAAAGCTTCAGCGGTGATCTTGCCCATCTCTAAGGTTAGCAGGTGGGCATAGTCGCTGGCCTGGGCGCGTAGCAGCTCAGCTGCCCGCTGGAGAATGGCACTGCGTTCGGTAAAGCTGCGTTCTTTCCAGTCGAGGAACGCGCTATGTGCGTCGTCCAGCGCCTGATTGACCTGGTCGTCGGTGGTTTCTGGGAAGGTCTTGAGCAATTCCCCGTTATAGGGGTTGATAGTGTCGTAAGCCAGGTGAGTCTCCTACCCgtggcatggtgggatggtggcatg > 2:358696/1‑301 (MQ=255) aaaaTCTCGACTTCGCCCAAAGCTTCAGCGGTGATCTTGCCCATCTCTAAGGTTAGCAGGTGGGCATAGTCGCTGGCCTGGGCGCGTAGCAGCTCAGCTGCCCGCTGGAGAATGGCACTGCGTTCGGTAAAGCTGCGTTCTTTCCAGTCGAGGAACGCGCTATGTGCGTCGTCCAGCGCCTGATTGACCTGGTCGTCGGTGGTTTCTGGGAAGGTCTTGAGCAATTCCCCGTTATAGGGGTTGATAGTGGCGTAAGCCATGTGATTCTCCTACTCgtggcatggtggcatggtggcatggt < 1:579080/300‑1 (MQ=255) aTCTCGACTTCGCCCAAAGCTTCAGCGGTGATCTTGCCCATCTCTAAGGTTAGCAGGTGGGCATAGTCGCTGGCCTGGGCGCGTAGCAGCTCAGCTGCCCGCTGGAGAATGGCACTGCGTTCGGTAAAGCTGCGTTCTTTCCAGTCGAGGAACGCGCTATGTGCGTCGTCCAGCGCCTGATTGACCTGGTCGTCGGTGGTTTCTGGGAAGGTCTTGAGCAATTCCCCGTTATAGGGGTTGATAGTGGCGTAAGCCATGTGATTCTCCTACTCgtggcatggtggcatggtggcatggtggg > 1:579211/1‑300 (MQ=255) aTCTCGACTTCGCCCAAAGCTTCAGCGGTGATCTTGCCCATCTCTAAGGTTAGCAGGTGGGCATAGTCGCTGGCCTGGGCGCGTAGCAGCTCAGCTGCCCGCTGGAGAATGGCACTGCGTTCGGTAAAGCTGCGTTCTTTCCAGTCGAGGAACGCGCTATGTGCGTCGTCCAGCGCCTGATTGACCTGGTCGTCGGTGGTTTCTGGGAAGGTCTTGAGCAATTCCCCGTTATAGGGGTTGATAGTGGCGTAAGCCATGTGATTCTCCTACTCgtggcatggtgacatggtgggagggtggg > 1:640623/1‑300 (MQ=255) gACTTCGCCCAAAGCTTCAGCGGTGATCTTGCCCATCTCTAAGGTTAGCAGGTGGGCATAGTCGCTGGCCTGGGCGCGTAGCAGCTCAGCTGCCCGCTGGAGAATGGCACTGCGTTCGGTAAAGCTGCGTTCTTTCCAGTCGAGGAACGCGCTATGTGCGTCGTCCAGCGCCTGATTGACCTGGTCGTCGGTGGTTTCTGGGAAGGTCTTGAGCAATTCCCCGTTATAGGGGTTGATAGTGGCGTAAGCCATGTGATTCTCCTACTCgtggcatggtggcatggtggcatggtggcatggt < 4:224804/301‑1 (MQ=255) ccAAAGCTTCAGCGGTGATCTTGCCCATCTCTAAGGTTAGCAGGTGGGCATAGTCGCTGGCCTGGGCGCGTAGCAGCTCAGCTGCCCGCTGGAGAATGGCACTGCGTTCGGTAAAGCTGCGTTCTTTCCAGTCGAGGAACGCGCTATGTGCGTCGTCCAGCGCCTGATTGACCTGGTCGTCGGTGGTTTCTGGGAAGGTCTTGAGCAATTCCCCGTTATAGGGGTTGATAGTGGCGTAAGCCATGTGATTCTCCTACTCgtggcatggtggcatggtggcatggtggcatggtggcatggg > 1:101177/1‑300 (MQ=255) ttctttCAGCGGTGATCTTGCCCATCTCTAAGGTTAGCAGGTGGGCATAGTCGCTGGCCTGGGCGCGTAGCAGCTCAGCTGCCCGCTGGAGAATGGCACTGCGTTCGGTAAAGCTGCGTTCTTTCCAGTCGAGGAACGCGCTATGTGCGTCGTCCAGCGCCTGATTGACCTGGTCGTCGGTGGTTTCTGGGAAGGTCTTGAGCAATTCCCCGTTATAGGGGTTGATAGTGGCGTAAGCCATGTGATTCTCCTACTCgtggcatggtggcatggtggcatggtggcatggtggcatggtggc < 3:114737/297‑1 (MQ=255) aGCTTCAGCGGTGATCTTGCCCATCTCTAAGGTTAGCAGGTGGGCATAGTCGCTGGCCTGGGCGCGTAGCAGCTCAGCTGCCCGCTGGAGAATGGCACTGCGTTCGGTAAAGCTGCGTTCTTTCCAGTCGAGGAACGCGCTATGTGCGTCGTCCAGCGCCTGATTGACCTGGTCGTCGGTGGTTTCTGGGAAGGTCTTGAGCAATTCCCCGTTATAGGGGTTGATAGTGGCGTAAGCCATGTGATTCTCCTACTCgtggcatgtgggcatggggcaatgtgggcttggggtactgtggctg > 2:503053/1‑272 (MQ=255) ccTTCAGCGGTGATCTTGCCCATCTCTAAGGTTAGCAGGTGGGCATAGTCGCTGGCCTGGGCGCGTAGCAGCTCAGCTGCCCGCTGGAGAATGGCACTGCGTTCGGTAAAGCTGCGTTCTTTCCAGTCGAGGAACGCGCTATGTGCGTCGTCCAGCGCCTGATTGACCTGGTCGTCGGTGGTTTCTGGGAAGGTCTTGAGCAATTCCCCGTTATAGGGGTTGATAGTGGCGTAAGCCATGTGATTCTCCTACTCgtggcatggtggcatggtggcatggtggcatggtggcatggtggcat < 1:183626/300‑1 (MQ=255) ttCAGCGGTGATCTTGCCCATCTCTAAGGTTAGCAGGTGGGCATAGTCGCTGGCCTGGGCGCGTAGCAGCTCAGCTGCCCGCTGGAGAATGGCACTGCGTTCGGTAAAGCTGCGTTCTTTCCAGTCGAGGAACGCGCTATGTGCGTCGTCCAGCGCCTGATTGACCTGGTCGTCGGTGGTTTCTGGGAAGGTCTTGAGCAATTCCCCGTTATAGGGGTTGATAGTGGCGTAAGCCATGTGATTCTCCTACTCgtggcatggtggcatggtggcatggtggcatggtggcatggtggcatgg > 3:56303/1‑301 (MQ=255) ttCAGCGGTGATCTTGCCCATCTCTAAGGTTAGCAGGTGGGCATAGTCGCTGGCCTGGGCGCGTAGCAGCTCAGCTGCCCGCTGGAGAATGGCACTGCGTTCGGTAAAGCTGCGTTCTTTCCAGTCGAGGAACGCGCTATGTGCGTCGTCCAGCGCCTGATTGACCTGGTCGTCGGTGGTTTCTGGGAAGGTCTTGAGCAATTCCCCGTTATAGGGGTTGATAGTGGCGTAAGCCATGTGATTCTCCTACTCgtggcatggtggcatggtggcatggtggcatggtggcatggtggcagat > 1:114734/1‑298 (MQ=255) tGCCCATCTCTAAGGTTAGCAGGTGGGCATAGTCGCTGGCCTGGGCGCGTAGCAGCTCAGCTGCCCGCTGGAGAATGGCACTGCGTTCGGTAAAGCTGCGTTCTTTCCAGTCGAGGAACGCGCTATGTGCGTCGTCCAGCGCCTGATTGACCTGGTCGTCGGTGGTTTCTGGGAAGGTCTTGAGCAATTCCCCGTTATAGGGGTTGATAGTGGCGTAAGCCATGTGATTCTCCTACTCgtggcatggtggcatggtggcatggtggcatggtggcatggtggcatggtggcatggtggcat > 3:636535/1‑301 (MQ=255) gCCCATCTCTAAGGTTAGCAGGTGGGCATAGTCGCTGGCCTGGGCGCGTAGCAGCTCAGCTGCCCGCTGGAGAATGGCACTGCGTTCGGTAAAGCTGCGTTCTTTCCAGTCGAGGAACGCGCTATGTGCGTCGTCCAGCGCCTGATTGACCTGGTCGTCGGTGGTTTCTGGGAAGGTCTTGAGCAATTCCCCGTTATAGGGGTTGATAGTGGCGTAAGCCATGTGATTCTCCTACTCgtggcatggtggcatggtggcatggtggcatggtggcatggtggcatggtggcatggtggcatg < 4:719887/301‑1 (MQ=255) cATCTCTAAGGTTAGCAGGTGGGCATAGTCGCTGGCCTGGGCGCGTAGCAGCTCAGCTGCCCGCTGGAGAATGGCACTGCGTTCGGTAAAGCTGCGTTCTTTCCAGTCGAGGAACGCGCTATGTGCGTCGTCCAGCGCCTGATTGACCTGGTCGTCGGTGGTTTCTGGGAAGGTCTTGAGCAATTCCCCGTTATAGGGGTTGATAGTGGCGTAAGCCATGTGATTCTCCTACTCgtggcatggtggcatggtggcatggtggcatggtggcatggtggcatggttgcatggtggcatggtg > 3:208324/1‑301 (MQ=255) tctAATGTTTGCAGCTGGGCAGAGTGTCTGGCCTGGTGGCGTAGCAGCTGAGCTGCCCGCTGGAGAATGGCACTGCGTTCGGTAAAGCTGCGTTGTTTCCAGTCGAGGAACGCGCTATGTGCGTCGTCCAGCGCCTGATTGACCTGGTCGTCGGTGGTTTCTGGGAAGGTCTTGAGCAATTCCCCGTTATAGGGGTTGATAGTGGCGTAAGCCATGTGATTCTCCTACTCgtggcatggtggcatggtggcatggtggcatggtggcatggtggcatggtggcatggtggcatggtggcat < 1:56302/301‑1 (MQ=255) ttccgatctgTGGGCATAGTCGCTGGCCTGGGCGTGTAGCAGCTCAGCTGCCCGCTGGAGAATGGCACTGCGTTCGGTAAAGCTGCGTTCTTTCCAGTCGAGGAACGCGCTATGTGCGTCGTCCAGCGCCTGATTGACCTGGTCGTCGGTGGTTTCTGGGAAGGTCTTGAGCAATTCCCCGTTATAGGGGTTGATAGTGGCGTAAGCCATGTGATTCTCCTACTCgtggcatggtggcatggtggcatggtggcatggtggcatggtggcatggtggcatggtggcatggtggcatggtgg < 4:335130/292‑1 (MQ=255) gTTAGCAGGTGGGCATAGTCGCTGGCCTGGGCGCGTAGCAGCTCAGCTGCCCGCTGGAGAATGGCACTGCGTTCGGTAAAGCTGCGTTCTTTCCAGTCGAGGAACGCGCTATGTGCGTCGTCCAGCGCCTGATTGACCTGGTCGTCGGTGGTTTCTGGGAAGGTCTTGAGCAATTCCCCGTTATAGGGGTTGATAGTGGCGTAAGCCATGTGATTCTCCTACTCgtggcatggtggcatggtggcatggtggcatggtggcatggtggcatggtggcatggtggcatggtggcatggtggc < 3:101179/301‑1 (MQ=255) gTGGGCATAGTCGCTGGCCTGGGCGTGTAGCAGCTCAGCTGCCCGCTGGAGAATGGCACTGCGTTCGGTAAAGCTGCGTTCTTTCCAGTCGAGGAACGCGCTATGTGCGTCGTCCAGCGCCTGATTGACCTGGTCGTCGGTGGTTTCTGGGAAGGTCTTGAGCAATTCCCCGTTATAGGGGTTGATAGTGGCGTAAGCCATGTGATTCTCCTACTCgtggcatggtggcatggtggcatggtggcatggtggcctggtggcaaggtggcagggtggcatggtggcatggtggagaggggag > 2:335066/1‑292 (MQ=255) atagtccttGGCCTGGGCGTGTAGCAGCTCAGCTGCCCGCTGGCGAATAGCACTGCCTTCGGTAAGGCTGCGTTCTTTCCAGTCGAGGAACGCGCTGTGTGCGTCGTCCAGCGCGTGATTGACCTGGTGGTCGGTGGTTTCTGGGAAGGTCTTGAGCAATTCCCCGTTATAGGGGTTGATAGTGGCGTAAGCCATGTGATTCTCCTACTCgtggcatggtggcatggtggcatggtggaatggtggcatggtggcatggtggcatggtggcatggtggcatggtggcatggtggcatggtg < 3:640637/293‑1 (MQ=255) tGGGCGCGTAGCAGCTCAGCTGCCCGCTGCAGAATGGCACTGCGTTCGGTAAAGCTGCGTGCTTTCCAGTCGAGGAACGCGCTATGTGCGTCGTCCAGCGGCTGATTGGCCTGGTCGTCGGTGGTTTCTGGGAAGGTCTTGAGCAATTCCCCGTTATAGGGGTTGATAGTGGCGTAAGCCATGTGATTCTCCTACTCgtggcatgatggcatggtggcatggtggcatggtggcatggtggcatggtggcatggtggcatggtggcatggtggcatggtggcatggtggaatggtggcatg < 4:525179/301‑1 (MQ=255) tcagctGCCCGCTGGAGAATGGCACTGCGTTCGGTAAAGCTGCGTTCTTTCCAGTCGAGGAACGCGCTATGTGCGTCGTCCAGCGCCTGATTGACCTGGTCGTCGGTGGTTTCTGGGAAGGTCTTGAGCAATTCCCCGTTATAGGGGTTGATAGTGGCGTAAGCCATGTGATTCTCCTACTCgtggcatggtggcatggtggcatggtggcatggtggcatggtggcatggtggcatggtgccgtggtagcatggtggcatgttggcatggttgaatggtggcatgagatcggaagagcac > 3:75490/1‑286 (MQ=255) cgctGCCCGCTGGAGAATGGCACTGCGTTCGGTAAAGCTGCGTTCTTTCCAGTCGAGGAACGCGCTATGTGCGTCGTCCAGCGCCTGATTGACCTGGTCGTCGGTGGTTTCTGGGAAGGTCTTGAGCAATTCCCCGTTATAGGGGTTGATAGTGGCGTAAGCCATGTGATTCTCCTACTCgtggcatggtggcatggtggcatggtggcatggtggcatggtggcatggtggcatggtggcatggtggcatggtggcatggtggcatggtggaatggtggcatgaaaagctccggtctttc < 3:56329/300‑18 (MQ=255) cGTTCTTTCCAGTCGAGGAACGCGCTATGTGCGTCGTCCAGCGCCTGATTGACCTGGTCGTCGGTGGTTTCTGGGAAGGTCTTGAGCAATTCCCCGTTATAGGGGTTGATAGTGGCGTAAGCCATGTGATTCTCCTACTC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GTGGCATGGTGGCATGGTGGCATGGTGGCATGGTGGCATGGTGGCATGGTGGCATGGTGGCATGGTGGCATGGTGGCATGGTGGCATGGTGGAATGGTGGCATGAAAAGCTCCGGTCTTTCCGTACGTGGTGACAGGGGCTGAAACTCGGATTACTCCAcc < 4:516511/301‑1 (MQ=255) gTTCTTTCCAGTCGAGGAACGCGCTATGTGCGTCGTCCAGCGCCTGATTGACCTGGTCGTCGGTGGTTTCTGGGAAGGTCTTGAGCAATTCCCCGTTATAGGGGTTGATAGTGGCGTAAGCCATGTGATTCTCCTACTC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GTGGCATGGTGGCATGGTGGCATGGTGGCATGGTGGCATGGTGGCATGGTGGCATGGTGGCATGGTGGCATGGTGGCATGGTGGCATGGTGGAATGGTGGCATGAAAAGCTCCGGTCTTTCCGTACGTGGTGACAGGGGCTGAAACTCGGGTTACTCCACCg > 4:466698/1‑301 (MQ=255) cAGTCGAGGAGCTCGGTATGTGCGTCGTCGAGCGCCTTATGGGCCTGGTCGTCGGTGGTTTCTGGGAAGGGCTTGAGCAATTGCCCGTTCTAGGGGTTGATAGTGGCGTAAGCCATGTGATTCTCC‑‑‑‑‑‑‑‑G‑AT‑‑‑‑‑‑‑TCGTGGCATGGTGGCATGGTGGCATGGTGGCATGGTGGCATGGTGGCATGGTGGCATGGTGGCATGGTGGCATGGTGGCATGGTGGCATGGTGGAATGGTGGCATGAAAAGCTCCGGTCTTTCCGTACGTGGTGACAGGGGCTGAAACTCGGATTACTCCACCGGCGTATAc < 4:336208/301‑1 (MQ=255) aGTCGAGGAACGCTCTATGTGCGGCTTCCAACGTCCGATTGGCCTGGTCGGCGGTGGTTTCTGGGAAGGTCTTGAGCAATTCCCCGTTATCGGGGTTGATAGTGGCGTAAGCCATGTGATGCTCCTATTC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GTGGCATGGTGGCATGGTGGCATGGTGGCATGGTGGCATGGTGGCATGGTGGCATGGTGGCATGGTGGCATGGTGGCATGGTGGCATGGTGGAATGGTGGCATGAAAAGCTCCGGTCTTTCCGTACGTGGTGACAGGGGCTGAAACTCGGATTACTCCACCGGCGTATAcc < 3:579226/301‑1 (MQ=255) cggcggccAGCGGCTGAGTGACCTGGACGTCTGTGGTTTCTGGAAAGGTATTGCGCAATTGCCCGTTATAGGGGTTGATAGTTGCGTAAGCCATTGGATTCTCCTACT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CA‑‑‑TGGCATGGTGGCATGGTGGCATGGTGGCATGGTGGCATGGTGGCATGGTGGCATGGTGGCATGTTGGCATGGTGGCATGGTGGCATGGTGGAATGGTGGCATGAAAAGCTCCGGTCTTTCCGTACGTGGTGACAGGGGCTGAAACTCGGATTACTCCACCGGCGTATACCGTTCGAGCCAGTGGGCGTAAg < 4:358769/295‑1 (MQ=21) |||||| ATTCGCGCTGAAATCTCGACTTCGCCCAAAGCTTCAGCGGTGATCTTGCCCATCTCTAAGGTTAGCAGGTGGGCATAGTCGCTGGCCTGGGCGCGTAGCAGCTCAGCTGCCCGCTGGAGAATGGCACTGCGTTCGGTAAAGCTGCGTTCTTTCCAGTCGAGGAACGCGCTATGTGCGTCGTCCAGCGCCTGATTGACCTGGTCGTCGGTGGTTTCTGGGAAGGTCTTGAGCAATTCCCCGTTATAGGGGTTGATAGTGGCGTAAGCCATGTGATTCTCCTACTCGTGGCATGGTGGCATGGTGGCATGGTGGCATGGTGGCATGGTGGCATGGTGGCATGGTGGCATGGTGGCATGGTGGCATGGTGGCATGGTGGCATGGTGGCATGGTGGAATGGTGGCATGAAAAGCTCCGGTCTTTCCGTACGTGGTGACAGGGGCTGAAACTCGGATTACTCCACCGGCGTATACCGTTCGAGCCAGTGGGCGTAAG > AE015451/2836780‑2837271 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |