| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | AE015451 | 5,674,751 | +G | intergenic (+113/+27) | rhlE‑II → / ← yceI | ATP‑dependent RNA helicase/polyisoprene‑binding protein, acidic stress response factor |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | AE015451 | 5,674,750 | 1 | . | G | 99.0% | 358.0 / ‑4.6 | 98 | intergenic (+112/+28) | rhlE‑II/yceI | ATP‑dependent RNA helicase/polyisoprene‑binding protein, acidic stress response factor |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (1/0); major base G (49/47); minor base T (1/0); total (51/47) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.40e-01 | |||||||||||
CGCCCTGCGCGTGACGATGCTGCCCGGCAAGAGCCGGCCGTGCGCAACCCGCGTCAGCCGGAAAAACAGCCAGTGATCATTCGCAAGGAGTCCAAGCTGGACCGTTTCCCGACGCCTGAGCAACTGGATGACCTGCCAAGCCGCCCACGCGGTGAGCGCCCAGCGCTGCTGACCCGCAAGGGCTGATAGAAGTACCGAGGGGGCTGCTTCGCAGCCCTATCACGACACAAGGCCGCTCCTGCAGAGAATTTCTTGATCTCTACAGGAGCGGCCTTGTGTCGTGATAGGGCCGCAAAGC‑GCGCCCT‑‑CGGTTTTCAGCTGGCAGAAATTACTTCTGCTTCACACCTTCGACACTGATATCCAGGTCCAGGGTCTGCGAAGTAGCACCCGGGCCTTTGATGCCGAAGTCGTTCAGGTTCAGCGTGGTGGTGGCGTTGAAGCCAGCGCGCTCGCCACCCCATGGGTCCTTGCCTTCACCGTTGAAGGTAGCCTTGAACGTCACCGGCTTGGTGACACCGTGCATGGTCAGGTCGCCAGTCACGTCAGCCGTCTTGTCGCCAGTAGACTTGACGCTGGTGGAGACGAATTTGGCG > AE015451/5674453‑5675042 | cGCCCTGCGCGTGACGATGCTGCCCGGCAAGAGCCGGCCGTGCGCAACCCGCGTCAGCCGGAAAAACAGCCAGTGATCATTCGCAAGGAGTCCAAGCTGGACCGTTTCCCGACGCCTGAGCAACTGGATGACCTGCCAAGCCGCCCACGCGGTGAGCGCCCAGCGCTGCTGACCCGCAAGGGCTGATAGAAGTACCGAGGGGGCTGCTTCGCAGCCCTATCACGACACAAGGCCGCTCCTGCAGAGAATTTCTTGATCTCTACAGGAGCGGCCTTGTGTCGTGATAGGGCCGCAAAgc‑ggc > 4:213588/1‑299 (MQ=255) ccccTGCGCGGGACGATGCTGCCCGGCAAGGGCCGGCCGTGCGCAACCCGCGTCAGCCGGAAAAACAGCCAGTGATCATTCGCAAGGAGTCCAAGCTGGACCGTTTCCCGACGCCTGAGCAACTGGATGACCTGCCAAGCCGCCCACGCGGTGAGCGCCCAGCGCTGCTGACCCGCAAGGGCTGATAGAAGTACCGAGGGGGCTGCTTCGCAGCCCTATCACGACACAAGGCCGCTCCTGCAGAGAATTTCTTGATCTCTACAGGAGCGGCCTTGTGTCGTGATAGGGCCGCAAAgc‑ggcc < 3:266015/300‑4 (MQ=255) gACGATGCTGCCCGGCAAGAGCCGGCCGTGCGCAACCCGCGTCAGCCGGAAAAACAGCCAGTGATCATTCGCAAGGAGTCCAAGCTGGACCGTTTCCCGACGCCTGAGCAACTGGATGACCTGCCAAGCCGCCCACGCGGTGAGCGCCCAGCGCTGCTGACCCGCAAGGGCTGATAGAAGTACCGAGGGGGCTGCTTCGCAGCCCTATCACGACACAAGGCCGCTCCTGCAGAGAATTTCTTGATCTCTACAGGAGCGGCCTTGTGTCGTGATAGGGCCGCAAAGCGGCCCCCT‑‑CGGtttt < 1:3988/301‑1 (MQ=255) cGATGCTGCCCGGCAAGAGCCGGCCGTGCGCAACCCGCGTCAGCCGGAAAAACAGCCAGTGATCATTCGCAAGGAGTCCAAGCTGGACCGTTTCCCGACGCCTGAGCAACTGGATGACCTGCCAAGCCGCCCACGCGGTGAGCGCCCAGCGCTGCTGACCCGCAAGGGCTGATAGAAGTACCGAGGGGGCTGCTTCGCAGCCCTATCACGACACAAGGCCGCTCCTGCAGAGAATTTCTTGATCTCTACAGGAGCGGCCTTGTGTCGTGATAGGGCCGCAAAGCGGCCCCCT‑‑CGGTTTTCa > 3:136389/1‑301 (MQ=255) cGATGCTGCCCGGCAAGAGCCGGCCGTGCGCAACCCGCGTCAGCCGGAAAAACAGCCAGTGATCATTCGCAAGGAGTCCAAGCTGGACCGTTTCCCGACGCCTGAGCAACTGGATGACCTGCCAAGCCGCCCACGCGGTGAGCGCCCAGCGCTGCTGACCCGCAAGGGCTGATAGAAGTACCGAGGGGGCTGCTTCGCAGCCCTATCACGACACAAGGCCGCTCCTGCAGAGAATTTCTTGATCTCTACAGGAGCGGCCTGGTGTCGTTATAGGGCCGCCAAGCGGCCCCCT‑‑CGGTTTTcc > 2:233225/1‑300 (MQ=255) gATGCTGCCCGGCAAGAGCCGGCCGTGCGCAACCCGCGTCAGCCGGAAAAACAGCCAGTGATCATTCGCAAGGAGTCCAAGCTGGACCGTTTCCCGACGCCTGAGCAACTGGATGACCTGCCAAGCCGCCCACGCGGTGAGCGCCCAGCGCTGCTGACCCGCAAGGGCTGATAGAAGTACCGAGGGGGCTGCTTCGCAGCCCTATCACGACACAAGGCCGCTCCTGCAGAGAATTTCTTGATCTCTACAGGAGCGGCCTTGTGTCGTGATAGGGCCGCAAAGCGGCCCCCT‑‑CGGTTTTccc > 2:95648/1‑299 (MQ=255) cGGCAAGAGCCGGCCGTGCGCAACCCGCGTCAGCCGGAAAAACAGCCAGTGATCATTCGCAAGGAGTCCAAGCTGGACCGTTTCCCGACGCCTGAGCAACTGGATGACCTGCCAAGCCGCCCACGCGGTGAGCGCCCAGCGCTGCTGACCCGCAAGGGCTGATAGAAGTACCGAGGGGGCTGCTTCGCAGCCCTATCACGACACAAGGCCGCTCCTGCAGAGAATTTCTTGATCTCTACAGGAGCGGCCTTGTGTCGTGATAGGGCCGCAAAGCGGCCCCCT‑‑CGGTTTTCAGCTGGCCGaa > 1:520197/1‑301 (MQ=255) ggCAAGAGCCGGCCGTGCGCAACCCGCGTCAGCCGGAAAAACAGCCAGTGATCATTCGCAAGGAGTCCAAGCTGGACCGTTTCCCGACGCCTGAGCAACTGGATGACCTGCCAAGCCGCCCACGCGGTGAGCGCCCAGCGCTGCTGACCCGCAAGGGCTGATAGAAGTACCGAGGGGGCTGCTTCGCAGCCCTATCACGACACAAGGCCGCTCCTGCAGAGAATTTCTTGATCTCTACAGGAGCGGCCTTGTGTCGTGATAGGGCCGCAAAGCGGCCCCCT‑‑CGGTTTTCAGCTGGCAGaaa > 4:4544/1‑301 (MQ=255) cAAGAGCCGGCCGTGCGCAACCCGCGTCAGCCGGAAAAACAGCCAGTGATCATTCGCAAGGAGTCCAAGCTGGACCGTTTCCCGACGCCTGAGCAACTGGATGACCTGCCAAGCCGCCCACGCGGTGAGCGCCCAGCGCTGCTGACCCGCAAGGGCTGATAGAAGTACCGAGGGGGCTGCTTCGCAGCCCTATCACGACACAAGGCCGCTCCTGCAGAGAATTTCTTGATCTCTACAGGAGCGGCCTTGTGTCGTGATAGGGCCGCAAAGCGGCCCCCT‑‑CGGTTTTCAGCTGGCAGAAAtt > 3:166123/1‑301 (MQ=255) agCCGGCCGTGCGCAACCCGCGTCAGCCGGAAAAACAGCCAGTGATCATTCGCAAGGAGTCCAAGCTGGACCGTTTCCCGACGCCTGAGCAACTGGATGACCTGCCAAGCCGCCCACGCGGTGAGCGCCCAGCGCTGCTGACCCGCAAGGGCTGATAGAAGTACCGAGGGGGCTGCTTCGCAGCCCTATCACGACACAAGGCCGCTCCTGCAGAGAATTTCTTGATCTCTACAGGAGCGGCCTTGTGTCGTGATAGGGCCGCAAAGCGGCCCCCT‑‑CGGTTTTCAGCTGGCAGAAATTACtt > 4:401025/1‑301 (MQ=255) 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ccgTGCGCAACCCGGGTCAGCCGGCAAAACAGCCAGTGATCATTCGCAAGGAGTCCAAGCTGGACCGTTTCCCGACGCCTGAGCAACTGGATGACCTGCCAAGCCGCCCACGCGGTGAGCGCCCAGCGCTGCTGACCCGCAAGGGCTGATAGAAGTACCGAGGGGGCTGCTTCGCAGCCCTATCACGACACAAGGCCGCTCCTGCAGAGAATTTCTTGATCTCTACAGGAGCGGCCTTGTGTCGTGATAGGGCCGCAAAGCGGCCCCCT‑‑CGGTTTTCAGCTGGCAGAAATTACTTCTGCtt < 4:387/301‑1 (MQ=255) cAACCCGCGTCAGCCGGAAAACCAGCAAGGGATCATGCGCAAGGAGTCCAAGCTGGACCGTTTCCCGACGCCTGAGCAACTGGATGACCTGCCAAGCCGCCCACGCGGTGAGCGCCCAGCGCTGCTGACCCGCAAGGGCTGATAGAAGTACCGAGGGGGCTGCTTCGCAGCCCTATCACGACACAAGGCCGCTCCTGCAGAGAATTTCTTGATCTCTACAGGAGCGGCCTTGTGTCGTGATAGGGCCGCAAAGCGGCCCCCT‑‑CGGTTTTCAGCTGGCAGAAATTACTTCTGCTTCACACCt < 2:4544/301‑1 (MQ=255) gcgTCAGCCGGAAAAACAGCCAGTGATCATTCGCAAGGAGTCCAAGCTGGACCGTTTCCCGACGCCTGAGCAACTGGATGACCTGCCAAGCCGCCCACGCGGTGAGCGCCCAGCGCTGCTGACCCGCAAGGGCTGATAGAAGTACCGAGGGGGCTGCTTCGCAGCCCTATCACGACACAAGGCCGCTCCTGCAGAGAATTTCTTGATCTCTACAGGAGCGGCCTTGTGTCGTGATAGGGCCGCAAAGCGGCCCCCT‑‑CGGTTTTCAGCTGGCCGAAATTACTTCTGCTTCACACCTTCGacc > 1:212906/1‑300 (MQ=255) aGCCGGAAAAACAGCCAGTGATCATTCGCAAGGAGTCCAAGCTGGACCGTTTCCCGACGCCTGAGCAACTGGATGACCTGCCAAGCCGCCCACGCGGTGAGCGCCCAGCGCTGCTGACCCGCAAGGGCTGATAGAAGTACCGAGGGGGCTGCTTCGCAGCCCTATCACGACACAAGGCCGCTCCTGCAGAGAATTTCTTGATCTCTACAGGAGCGGCCTTGTGTCGTTATAGGGCCGCCAAGCGGCCCCAC‑‑CGGTTTGCAGCTGGCCGGAATTACTTCTGTCTGACACCTTCGACACCGat > 2:747597/1‑301 (MQ=255) cGGAAAAACAGCCAGTGATCATTAGCAAGGAGTCCAAGCTGGACCGTTTCCCGACGCCTGAGCAACTGGATGACCTGCCAAGCCGCCCACGCGGTGAGCGCCCAGCGCTGCTGACCCGCAAGGGATGATAGAAGTACCGAGGGGGCTGCTTCGCAGCCCTATCACGACACAAGGCCGCTCCTGCAGAGAATTTCTTGATCTCTACAGGAGCGGCCTTGTGTCGTGATAGGGCCGCAAAGCGGCCCCCT‑‑CGGTTTTCAGCTGGCAGAAATTACTTCTGCTTCACACCTTCGACACTGATAtc < 3:438296/301‑1 (MQ=255) gatctaaCAGCAAGTGATCATTCGCAAGGAGTCCAAGCTGGACCGTTTCCCGACGCCTGAGCAACTGGATGACCTGCCAAGCCGCCCACGCGGTGAGCGCCCAGCGCTGCTGACCCGCAAGGGCTGATAGAAGTACCGAGGGGGCTGCTTCGCAGCCCTATCACGACACAAGGCCGCTCCTGCAGAGAATTTCTTGATCTCTACAGGAGCGGCCTTGTGTCGTGATAGGGCCGCAAAGCGGCCCCCT‑‑CGGTTTTCAGCTGGCAGAAATTACTTCTGCTTCACACCTTCGACACTGATAtcc < 1:623830/296‑1 (MQ=255) 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aaCAGCCAGTGATCATTCGCAAGGAGTCCAAGCTGGACCGTTTCCCGACGCCTGAGCAACTGGATGACCTGCCAAGCCGCCCACGCGGTGAGCGCCCAGCGCTGCTGACCCGCAAGGGCTGATAGAAGTACCGAGGGGGCTGCTTCGCAGCCCTATCACGACACAAGGCCGCTCCTGCAGAGAATTTCTTGATCTCTACAGGAGCGGCCTTGTGTCGTGATAGGGCCGCAAAGCGGCCCCCT‑‑CGGTTTTCAGCTGGCAGAAATTACTTCTGCTTCACACCTTCGACACTGATAtccagatc > 3:623845/1‑298 (MQ=255) aCAGCCAGTGATCATTCGCAAGGAGTCCAAGCTGGACCGTTTCCCGACGCCTGAGCAACTGGATGACCTGCCAAGCCGCCCACGCGGTGAGCGCCCAGCGCTGCTGACCCGCAAGGGCTGATAGAAGTACCGAGGGGGCTGCTTCGCAGCCCTATCACGACACAAGGCCGCTCCTGCAGAGAATTTCTTGATCTCTACAGGAGCGGCCTTGTGTCGTGATAGGGCCGCAAAGCGGCCCCCT‑‑CGGTTTTCAGCTGGCAGAAATTACTTCTGCTTCACACCTTCGACACTGATAtccaggtcc < 4:118995/301‑1 (MQ=255) aCAGCCAGTAATCATTCGCAAGGAGTCCAAGCTGGACCGTTCCCCGACGCCTGAGCAACTGGATGACCTGCCAAGCCGCCCACGCGGTGAGCGCCCAGCGCTGCTGACCCGCAAGGGCTGATAGAAGTACCGAGGGGGCTGCTTCGCAGCCCTATCACGACACAAGGCCGCTCCTGCAGAGAGTTTCTTGATCTCTACAGGAGCGGCCTTGTGTCGTGATAGGGCCGCAAAGCGGCCCCCT‑‑CGGTTTTCAGCTGGCAGAAATTACTTCTGCTTCACACCTTCGACACTGATAtccaggtcc < 4:6862/301‑1 (MQ=255) cgCCAGTGATCATTCGCAAGGAGTCCAAGCTGGACCGTTTCCCGACGCCTGAGCAACTGGATGACCTGCCAAGCCGCCCACGCGGTGAGCGCCCAGCGCTGCTGACCCGCAAGGGCTGATAGAAGTACCGAGGGGGCTGCTTCGCAGCCCTATCACGACACAAGGCCGCTCCTGCAGAGAATTTCTTGATCTCTACAGGAGCGGCCTTGTGTCGTGATAGGGCCGCAAAGCGGCCCCCT‑‑CGGTTTTCAGCTGGCAGAAATTACTTCTGCTTCACACCTTCGACACTGATAtccaggtccag < 1:283696/300‑1 (MQ=255) aGCCAGTGATCATTCGCAAGGAGTCCAAGCTGGACCGTTTCCCGACGCCTGAGCAACTGGATGACCTGCCAAGCCGCCCACGCGGTGAGCGCCCAGCGCTGCTGACCCACAAGGGCTGATAGAAGTACCGAGGGGGCTGCTTCGCAGCCCTATCACGACACAAGGCCGCTCCTGCAGAGAATTTCTTGATCTCTACAGGAGCGGCCTTGTGTCGTGATAGGGCCGCAAAGCGGCCCCCT‑‑CGGTTTTCCGCTGGCAGAAATTACTTCTGCTTCACACCTTCCACCCTTATAtccaggtccag > 2:36165/1‑301 (MQ=255) cAGTGATCATTCGCAAGGAGTCCAAGCTGGACCGTTTCCCGACGCCTGAGCAACTGGATGACCTGCCAAGCCGCCCACGCGGTGAGCGCCCAGCGCTGCTGACCCGCAAGGGCTGATAGAAGTACCGAGGGGGCTGCTTCGCAGCCCTATCACGACACAAGGCCGCTCCTGCAGAGAATTTCTTGATCTCTACAGGAGCGGCCTTGTGTCGTGATAGGGCCGCAAAGCGGCCCCCT‑‑CGGTTTTCAGCTGGCAGAAATTACTTCTGCTTCACACCTTCGACACTGATATCCAGGTCCAGGGt > 4:384338/1‑301 (MQ=255) tCATTCGCAAGGAGTCCAAGCTGGACCGTTTCCCGACGCCTGAGCAACTGGATGACCTGCCAAGCCGCCCACGCGGTGAGCGCCCAGCGCTGCTGACCCGCAAGGGCTGATAGAAGTACCGAGGGGGCTGCTTCGCAGCCCTATCACGACACAAGGCCGCTCCTGCAGAGAATTTCTTGATCTCTACAGGAGCGGCCTTGTGTCGTGATAGGGCCGCAAAGCGGCCCCCT‑‑CGGTTTTCAGCTGGCAGCACTTACTTCTGCTTCACCCCTTCGACACTGCTATCCAGGTCCAGGGTCTGCgg > 2:29575/1‑300 (MQ=255) cATTCGCAAGGAGTCCAAGCTGGACCGTTTCCCGACGCCTGAGCAACTGGATGACCTGCCAAGCCGCCCACGCGGTGAGCGCCCAGCGCTGCTGACCCGCAAGGGCTGATAGAAGTACCGAGGGGGCTGCTTCGCAGCCCTATCACGACACAAGGCCGCTCCTGCAGAGAATTTCTTGATCTCTACAGGAGCGGCCTTGTGTCGTGATAGGGCCGCAAAGCGGCCCCCT‑‑CGGTTTTCAGCTGGCAGAAATTACTTCTGCTTCACACCTTCGACACTGATATCCAGGTCCCGGGTCTGCGaa > 1:277337/1‑301 (MQ=255) aTTCGCAAGGAGTCCAAGCTGGACCGTTTCCCGACGCCTGAGCAACTGGATGACCTGCCAAGCCGCCCACGCGGTGAGCGCCCAGCGCTGCTGACCCGCAAGGGCTGATAGAAGTACCGAGGGGGCTGCTTCGCAGCCCTATCACGACACAAGGCCGCTCCTGCAGAGAATTTCTTGATCTCTACAGGAGCGGCCTTGTGTCGTGATAGGGCCGCAAAGCGGCCCCCT‑‑CGGTTTTCAGCTGGCAGAAATTACTTCTGCTTCACACCTTCGACACTGATATCCAGGTCCAGGGTCTGCGAAg > 3:30453/1‑301 (MQ=255) 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aaGGAGTCCAAGCTGGACCGTTTCCCGACGCCTGAGCAACTGGATGACCTGCCAAGCCGCCCACGCGGTGAGCGCCCAGCGCTGCTGACCCGCAAGGGCTGATAGAAGTACCGAGGGGGCTGCTTCGCAGCCCTATCACGACACAAGGCCGCTCCTGCAGAGAATTTCTTGATCTCTACAGGAGCGGCTTTGTGTCGTGATAGGGCCGCAAAGCGGCCCCCT‑‑CGGTTTTCAGCTGGCAGAAATTACTTCTGCTTCACACCTTCGACACTGATATCCAGGTCCAGGGTCTGCGAAGTAGCAc < 3:407734/301‑1 (MQ=255) tgctcttccgatctaCCGTTTCCCGACGCCTGAGCAACTGGATGACCTGCCAAGCCGCCCACGCGGTGAGCGCCCAGCGCTGCTGACCCGCAAGGGCTGATAGAAGTACCGAGGGGGCTGCTTCGCAGCCCTATCACGACACAAGGCCGCTCCTGCAGAGAATTTCTTGATCTCTACAGGAGCGGCCTTGTGTCGTGATAGGGCCGCAAAGCGGCCCCCT‑‑CGGTTTTCAGCTGGCAGAAATTACTTCTGCTTCACACCTTCGACACTGATATCCAGGTCCAGGGTCTGCGAAGTAGCAccc < 3:23775/287‑1 (MQ=255) ggAGTCCAAGCTGGACCGTTTCCCGACGCCTGAGCAACTGGATGACCTGCCAAGCCGCCCACGCGGTGAGCGCCCAGCGCTGCTGACCCGCAAGGGCTGATAGAAGTACCGAGGGGGCTGCTTCGCAGCCCTATCACGACACAAGGCCGCTCCTGCAGAGAATTTCTTGATCTCTACAGGAGCGGCCTTGTGTCGTGATAGGGCCGCAAAGCGGCCCCCT‑‑CGGTTTTCAGCTGGCAGAAATTACTTCTGCTTCACACCTTCGACACTGATATCCAGGTCCAGGGTCTGCGAAGTAGCAccc > 4:557448/1‑301 (MQ=255) cgcggccacGTTTCCCGCTGACTGACCAACTGGATGACCGGCCCCGACGCCCGCGCGGTGAGCGCCCAGCACTGCTGACGCGCAAGGGCTGATAGAAGTACCGACGGGGCTGCTTCGCAGCCCTATCACGACACAAGGCCGCTCCTGCAGAGAATTTCTTGATCTCTACAGGGGCGGCCTTGTGTCGTGATAGGGCCGCAAAGCGGCCCCCT‑‑CGGTTTTCAGCTGGCAGAAATTACTTCTGCTTCACGCCTTCGACACTGATATCCAGGTCCAGGGTCTGCGAAGTAGCACCCGGGCCttt < 1:370041/293‑1 (MQ=255) ccgacgcccggccgagctgCCTGGGCAACTGGATGACCTGCCAAGCCGCCCACGCGGTGAGCGCCCAGCGCTGCTGACCCGCAAGGGCTGATAGAAGTACCGAGGGGGCTGCTTCGCAGCCCTATCACGACACAAGGCCGCTCCTGCAGAGAATTTCTTGATCTCTACAGGAGCGGCCTTGTGTCGTGATAGGGCCGCAAAGCGGCCCCCT‑‑CGGTTTTCAGCTGGCAGAAATTACTTCTGCTTCACACCTTCGACACTGATATCCAGGTCCAGGGTCTGCGAAGTAGCACCCGGGCCTTTg < 2:135381/283‑1 (MQ=255) cTGGACCGTTTCCCGACGCCTGAGCAACTGGATGACCTGCCAAGCCGCCCACGCGGTGAGCGCCCAGCGCTGCTGACCCGCAAGGGCTGATAGAAGTACCGAGGGGGCTGCTTCGCAGCCCTATCACGACACAAGGCCGCTCCTGCAGAGAATTTCTTGATCTCTACAGGAGCGGCCTTGTGTCGTGATAGGGCCGCAAAGCGGCCCCCT‑‑CGGTTTTCAGCTGGCAGAAATTACTTCTGCTTCACACCTTCGACACTGATATCCAGGTCCAGGGTCTGCGAAGTAGCACCCGGGCCTTTgg > 1:242716/1‑300 (MQ=255) 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gATAGGGCCGCAAAGCGGCCCCCT‑‑CGGTTTTCAGCTGGCAGAAATTACTTCTGCTTCACACCTTCGACACTGATATCCAGGTCCAGGGTCTGCGAAGTAGCACCCGGGCCTTTGATGCCGAAGTCGTTCAGGTTCAGCGTGGTGGTGGCGTTGAAGCCAGCGCGCTCGCCACCCCATGGGTCCTTGCCTTCACCGTTGAAGGTAGCCTTGAACGTCACCGGCTTGGTGACACCGTGCATGGTCAGGTCGCCAGTCACGTCAGCCGTCTTGTCGCCAGTAGCCTTGACGCTGGTGGAGACgg > 1:536772/1‑300 (MQ=255) ggggCCGCAAAGCGGCCCCCT‑‑CGGTTTTCAGCTGGCAGAAATTACTTCTGCTTCACACCTTCGACACTGATATCCAGGTCCAGGGTCTGCGAAGTAGCACCCGGGCCTTTGATGCCGAAGTCGTTCAGGTTCAGCGTGGTGGTGGCGTTGAAGCCAGCGCGCTCGCCACCCCATGGGTCCTTGCCTTCACCGTTGAAGGTAGCCTTGAACGTCACCGGCTTGGTGACACCGTGCATGGTCAGGTCGCCAGTCACGTCAGCCGTCTTGTCGCCAGTAGACTTGACGCTGGTGGAGACGAAtt < 1:274846/300‑1 (MQ=255) aGGGCCGCAAAGCGGCCCCCT‑‑CGGTTTTCAGCTGGCAGAAATTACTTCTGCTTCACACCTTCGACACTGATATCCAGGTCCAGGGTCTGCGAAGTAGCACCCGGGCCTTTGATGCCGAAGTCGTTCAGGTTCAGCGTGGTGGTGGCGTTGAAGCCAGCGCGCTCGCCACCCCATGGGTCCTTGCCTTCACCGTTGAAGGTAGCCTTGAACGTCACCGGCTTGGTGACACCGTGCATGGTCAGGTCGCCAGTCACGTCAGCCGTCTTGTCGCCAGTAGACTTGACGCTGGTGGAGACGAAtt < 4:466157/301‑1 (MQ=255) gggCCGCAAAGCGGCCCCCT‑‑CGGTTTTCAGCTGGCAGAAATTACTTCTGCTTCACACCTTCGACACTGATATCCAGGTCCAGGGTCTGCGAAGTAGCACCCGGGCCTTTGATGCCGAAGTCGTTCAGGTTCAGCGTGGTGGTGGCGTTGAAGCCAGCGCGCTCGCCACCCCATGGGTCCTTGCCTTCACCGTTGAAGGTAGCCTTTAACGTCACCGGCTTGGTGACACCGTGCATGGTCAGGTCGCCAGTCACGTCAGCCGTCTTGTCGCCAGTAGACTTGACGCTGGGGCTGACGAAttt > 2:363118/1‑301 (MQ=255) gggCCGCAAAGCGGCCCCCT‑‑CGGTTTTCAGCTGGCAGAAATTACTTCTGCTTCACACCTTCGACACTGATATCCAGGTCCAGGGTCTGCGAAGTAGCACCCGGGCCTTTGATGCCGAAGTCGTTCAGGTTCAGCGTGGTGGTGGCGTTGAAGCCAGCGCGCTCGCCACCCCATGGGTCCTTGCCTTCACCGTTGAAGGTAGCCTTGAACGTCACCGGCTTGGTGACACCGTGCATGGTCAGGTCGCCAGTCACGTCAGCCGTCTTGTCGCCAGTAGACTTGACGCtgtgggagcccgttcg > 2:708681/1‑287 (MQ=255) cGCAAAGCGGCCCCCT‑‑CGGTTTTCAGCTGGCAGAAATTACTTCTGCTTCACACCTTCGACACTGATATCCAGGTCCAGGGTCTGCGAAGTAGCACCCGGGCCTTTGATGCCGAAGTCGTTCAGGTTCAGCGTGGTGGTGGCGTTGAAGCCAGCGCGCTCGCCACCCCATGGGTCCTTGCCTTCACCGTTGAAGGTAGCCTTGAACGTCACCGGCTTGGTGACACCGTGCATGGTCAGGTCGCCAGTCACGTCAGCCGTCTTGTCGCCAGTAGACTTGACGCTGGTGGAGACGAATTTGGCg > 1:194763/1‑301 (MQ=255) | CGCCCTGCGCGTGACGATGCTGCCCGGCAAGAGCCGGCCGTGCGCAACCCGCGTCAGCCGGAAAAACAGCCAGTGATCATTCGCAAGGAGTCCAAGCTGGACCGTTTCCCGACGCCTGAGCAACTGGATGACCTGCCAAGCCGCCCACGCGGTGAGCGCCCAGCGCTGCTGACCCGCAAGGGCTGATAGAAGTACCGAGGGGGCTGCTTCGCAGCCCTATCACGACACAAGGCCGCTCCTGCAGAGAATTTCTTGATCTCTACAGGAGCGGCCTTGTGTCGTGATAGGGCCGCAAAGC‑GCGCCCT‑‑CGGTTTTCAGCTGGCAGAAATTACTTCTGCTTCACACCTTCGACACTGATATCCAGGTCCAGGGTCTGCGAAGTAGCACCCGGGCCTTTGATGCCGAAGTCGTTCAGGTTCAGCGTGGTGGTGGCGTTGAAGCCAGCGCGCTCGCCACCCCATGGGTCCTTGCCTTCACCGTTGAAGGTAGCCTTGAACGTCACCGGCTTGGTGACACCGTGCATGGTCAGGTCGCCAGTCACGTCAGCCGTCTTGTCGCCAGTAGACTTGACGCTGGTGGAGACGAATTTGGCG > AE015451/5674453‑5675042 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |