Predicted mutation | ||||||
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RA | AE015451 | 5,674,751 | +G | intergenic (+113/+27) | rhlE‑II → / ← yceI | ATP‑dependent RNA helicase/polyisoprene‑binding protein, acidic stress response factor |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | AE015451 | 5,674,750 | 1 | . | G | 98.0% | 369.4 / ‑1.1 | 101 | intergenic (+112/+28) | rhlE‑II/yceI | ATP‑dependent RNA helicase/polyisoprene‑binding protein, acidic stress response factor |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (1/1); new base G (47/52); total (48/53) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.94e-01 |
Only 100 of 104 total aligned reads displayed.
GTCGCCCTGCGCGTGACGATGCTGCCCGGCAAGAGCCGGCCGTGCGCAACCCGCGTCAGCCGGAAAAAC‑AGCCAGTGATCATTCGCAAGGAGTCCAAGCTGGACCGTTTCCCGACGCCTGAGCAACTGGATGACCTGCCAAGCCGCCCACGCGGTGAGCGCCCAGCGCTGCTGACCCGCAAGGGCTGATAGAAGTACCGAGGGGGCTGCTTCGCAGCCCTATCACGACACAAGGCCGCTCCTGCAGAGAATTTCTTGATCTCTACAGGAGCGGCCTTGTGTCGTGATAGGGCCGCAAAG‑C‑GCGCCCTCGGTTTTCAGCTGGCAGAAATTACTTCTGCTTCACACCTTCGACACTGATATCCAGGTCCAGGGTCTGCGAAGTAGCACCCGGGCCTTTGATGCCGAAGTCGTTCAGGTTCAGCGTGGTGGTGGCGTTGAAGCCAGCGCGCTCGCCACCCCATGGGTCCTTGCCTTCACCGTTGAAGGTAGCCTTGAACGTCACCGGCTTGGTGACACCGTGCATGGTCAGGTCGCCAGTCACGTCAGCCGTCTTGTCGCCAGTAGACTTGACGCTGGTGGAGACGA > AE015451/5674451‑5675034 | gTCGCCCTGCGCGTGACGATGCTGCCCGGCAAGAGCCGGCCGTGCGCAACCCGCGTCAGCCGGAAAAAC‑AGCCAGTGATCATTCGCAAGGAGTCCAAGCTGGACCGTTTCCCGACGCCTGAGCAACTGGATGACCTGCCAAGCCGCCCACGCGGTGAGCGCCCAGCGCTGCTGACCCGCAAGGGCTGATAGAAGTACCGAGGGGGCTGCTTCGCAGCCCTATCACGACACAAGGCCGCTCCTGCAGAGAATTTCTTGATCTCTACAGGAGCGGCCTTGTGTCGTGATAGGGCCGCAAAg‑c‑g > 3:500211/1‑301 (MQ=255) gTCGCCCTGCGCGTGACGATGCTGCCCGGCAAGAGCCGGCCGTGCGCAACCCGCGTCAGCCGGAAAAAC‑AGCCAGTGATCATTCGCAAGGAGTCCAAGCTGGACCGTTTCCCGACGCCTGAGCAACTGGATGACCTGCCAAGCCGCCCACGCGGTGAGCGCCCAGCGCTGCTGACCCGCAAGGGCTGATAGAAGTACCGAGGGGGCTGCTTCGCAGCCCTATCACGACACAAGGCCGCTCCTGCAGAGAATTTCTTGATCTCTACAGGAGCGGCCTTGTGTCGTGATAGGGCCGCAAAg‑c‑g < 4:383670/301‑1 (MQ=255) gCCCTGCGCGTGACGATGCTGCCCGGCAAGAGCCGGCCGTGCGCAACCCGCGTCAGCCGGAAAAAC‑AGCCAGTGATCATTCGCAAGGAGTCCAAGCTGGACCGTTTCCCGACGCCTGAGCAACTGGATGACCTGCCAAGCCGCCCACGCGGTGAGCGCCCAGCGCTGCTGACCCGCAAGGGCTGATAGAAGTACCGAGGGGGCTGCTTCGCAGCCCTATCACGACACAAGGCCGCTCCTGCAGAGAATTTCTTGATCTCTACAGGAGCGGCCTTGTGTCGTGATAGGGCCGCAAcg‑c‑ggcc > 3:646173/1‑298 (MQ=255) gcgggACGTTGCTGCCCGGCCAGAGCCGGCCGTGCGCAACCCGCGTCAGCCGGAAAACC‑AGCCAGTGATCATTCGCAAGGAGTCCAAGCTGGACCGTTTCCCGACGCCTGAGCAACTGGATGACCTGCCAAGCCGCCCACGCGGTGAGCGCCCAGCGCTGCTGACCCGCAAGGGCTGATAGAAGTACCGAGGGGGCTGCTTCGCAGCCCTATCACGACACAAGGCCGCTCCTGCAGAGAATTTCTTGATCTCTACAGGAGCGGCCTTGTGTCGTGATAGGGCCGCAAAG‑CGGCCCCCTCgg < 1:646160/297‑1 (MQ=255) ccgggACGATGCGGCCCGGCAAAGGCCGGCCGTGCGCAACCCGCGTCAGCCGGAAAAAC‑AGCCAGTGATCATTCGCAAGGAGTCCAAGCTGGACCGTTTCCCGACGCCTGAGCAACTGGATGACCTGCCAAGCCGCCCACGCGGTGAGCGCCCAGCGCTGCTGACCCGCAAGGGCTGATAGAAGTACCGAGGGGGCTGCTTCGCAGCCCTATCACGACACAAGGCCGCTCCTGCAGAGAATTTCTTGATCTCTACAGGAGCGGCCTTGTGTCGTGATAGGGCCGCAAAG‑CGGCCCCCTCgg < 1:500200/297‑1 (MQ=255) gACGATGCTGCCCGGCAAGAGCCGGCCGTGCGCAACCCGCGTCAGCCGGAAAAAC‑AGCCAGTGATCATTCGCAAGGAGTCCAAGCTGGACCGTTTCCCGACGCCTGAGCAACTGGATGACCTGCCAAGCCGCCCACGCGGTGAGCGCCCAGCGCTGCTGACCCGCAAGGGCTGATAGAAGTACCGAGGGGGCTGCTTCGCAGCCCTATCACGACACAAGGCCGCTCCTGCAGAGAATTTCTTGATCTCTACAGGAGCGGCCTTGTGTCGTGATAGGGCCGCAAAG‑CGGCCCCCTCGGtttt < 4:543653/301‑1 (MQ=255) ggaactggcCCGGCACGAACCGGTCGTCAGCAACACGCGTCAGCCGGAAAAAC‑GGCCAGAGATCATTCGCAGGGAGTCCAGGCTGGACCGTTTCCCGACGCCTGAGCGACTGGATGACCTGACACGCCGCCCACGCGGTGTGCGCCCAGCGCTGCTGACCCGCCAGGGCTGATAGAAGTACCGAGGGGGCTGCTTCGCAGCCCTATCACGACACAAGGCCGCTCCTGCAGAGAATTTCTTGATCTCTACAGGAGCGGCCTTGTGTCGTGATAGGGCCGCAAAG‑CGGCCCCCTCGGTTTTCa < 2:137824/294‑1 (MQ=255) 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aacccgctgcacccgAAAAACAAGCCAGTGATCATTCGCAAGGAGTCCAAGCTGGACCGTTTCCCGACGCCTGAGCAACTGGATGACCTGCCAAGCCGCCCACGCGGTGAGCGCCCAGCGCTGCTGACCCGCAAGGGCTGATAGAAGTACCGAGGGGGCTGCTTCGCAGCCCTATCACGACACAAGGCCGCTCCTGCAGAGAATTTCTTGATCTCTACAGGAGCGGCCTTGTGTCGTGATAGGGCCGCAAAG‑CGGCCCCCTCGGTTTTCAGCTGGCAGAAATTACTTCTGCTTCACACCtt < 2:422911/287‑1 (MQ=255) ccccttccgatctaacc‑AGCCAATGATACTTCGCAAGGAGTCCAAGCCGGACCGTTTCCCGACGCCTGAGCAACTGGATGACCTGCCAAGCCGCCCACGCGGTGAGCGCCCAGCGCTGCTGACCCGCAAGGGCTGATAGAAGTACCGAGGGGGCTGCTTCGCAGCCCTATCACGACACAAGGCCGCTCCTGCAGAGAATTTCTTGATCTCTACAGGAGCGGCCTTGTGTCGTGATAGGGCCGCAAAG‑CGGCCCCCTCGGTTTTCAGCTGGCAGAAATTACTTCTGCTTCACACCTTCGaca < 2:799426/285‑1 (MQ=255) cgTCAGCCGGAAAAAC‑AGCCAGTGATCATTCGCAAGGAGTCCAAGCTGGACCGTTTCCCGACGCCTGAGCAACTGGATGACCTGCCAAGCCGCCCACGCGGTGAGCGCCCAGCGCTGCTGACCCGCAAGGGCTGATAGAAGTACCGAGGGGGCTGCTTCGCAGCCCTATCACGACACAAGGCCGCTCCTGCAGAGAATTTCTTGATCTCTACAGGAGCGGCCTTGTGTCGTGATAGGGCCGCAAAG‑CGGCCCCCTCGGTTTTCAGCTGGCAGAAATTACTTCTGCTTCACACCTTCGaccc > 2:338028/1‑299 (MQ=255) 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tgtgTCGTGATAGGGCCGCAAAG‑CGGCCCCCTCGGTTTTCAGCTGGCAGAAATTACTTCTGCTTCACACCTTCGACACTGATATCCAGGTCCAGGGTCTGCGAAGTAGCACCCGGGCCTTTGATGCCGAAGTCGTTCAGGTTCAGCGTGGTGGTGGCGTTGAAGCCAGCGCGCTCGCCACCCCATGGGTCCTTGCCTTCACCGTTGAAGGTAGCCTTGAACGTCACCGGCTTGGTGACACCGTGCATGGTCAGGTCGCCAGTCACGTCCGCCGTCTTGTCGCCAGTAGACTTGACGCtggg > 2:462237/1‑300 (MQ=255) tgtgTCGTGATAGGGCCGCAAAG‑CGGCCCCCTCGGTTTTCAGCTGGCAGAAATTACTTCTGCTTCACACCTTCGACACTGATATCCAGGTCCAGGGTCTGCGAAGTAGCACCCGGGCCTTTGATGCCGAAGTCGTTCAGGTTCAGCGTGGTGGTGGCGTTGAAGCCAGCGCGCTCGCCACCCCATGGGTCCTTGCCTTCACCGTTGAAGGTAGCCTTGAACGTCACCGGCTTGGTGACACCGTGCATGGTCAGGTCGCCAGTCACGTCAGCCGTCTTGTCGCCATTAGACTTGACGCtggg > 1:93521/1‑300 (MQ=255) tgtCGTGATAGGGCCGCAAAG‑CGGCCCCCTCGGTTTTCAGCTGGCAGAAATTACTTCTGCTTCACACCTTCGACACTGATATCCAGGTCCAGGGTCTGCGAAGTAGCACCCGGGCCTTTGATGCCGAAGTCGTTCAGGTTCAGCGTGGTGGTGGCGTTGAAGCCAGCGCGCTCGCCACCCCATGGGTCCTTGCCTTCACCGTTGAAGGTAGCCTTGAACGTCACCGGCTTGGTGACACCGTGCATGGTCAGGTCGCCAGTCACGTCAGCCGCCTTgccccccgcccacctcacccccgcgg > 2:579753/1‑276 (MQ=255) gtCGTGATAGGGCCGCAAAG‑CGGCCCCCTCGGTTTTCAGCTGGCAGAAATTACTTCTGCTTCACACCTTCGACACTGATATCCAGGTCCAGGGTCTGCGAAGTAGCACCCGGGCCTTTGATGCCGAAGTCGTTCAGGTTCAGCGTGGTGGTGGCGTTGAAGCCAGCGCGCTCGCCACCCCATGGGTCCTTGCCTTCACCGTTGAAGGTAGCCTTGAACGTCACCGGCTTGGTGACACCGTGCATGGTCAGGTCGCCAGTCACGTCAGCCGTCTTGTCGCCAGTAGACTTTACGCtggtggg > 2:483932/1‑300 (MQ=255) ggttggtAGGGCCGAAAAG‑CGGCCCCCTCGGTTTTCAGCTGGCAGAAATTACTTCTGCTTCACACCTTCGACACTGATATCCAGGTCCAGGGTCTGCGAAGTAGCACCCGGGCCTTTGATGCCGAAGTCGTTCAGGTTCAGCGTGGTGGTGGCGTTGAAGCCAGCGCGCTCGCCACCCCATGGGTCCTTGCCTTCACCGTTGAAGGTAGCCTTGAACGTCACCGGCTTGGTGACACCGTGCATGGTCAGGTCGCCAGTCACGTCAGCCGTCTTGTCGCCAGTAGACTTGACGCTGGTGgag < 2:877229/295‑1 (MQ=255) gATAGGGCCGCAAAG‑CGGCCCCCTCGGTTTTCAGCTGGCAGAAATTACTTCTGCTTCACACCTTCGACACTGATATCCAGGTCCAGGGTCTGCGAAGTAGCACCCGGGCCTTTGATGCCGAAGTCGTTCAGGTTCAGCGTGGTGGTGGCGTTGAAGCCAGCGCGCTCGCCACCCCATGGGTCCTTGCCTTCACCGTTGAAGGTAGCCTTGAACGTCACCGGCTTGGTGACACCGTGCATGGTCAGGTCGCCAGTCACGTCAGCCGTCTTGTCGCCAGTAGACTTGACGCTGGTGGAGACgg > 1:63238/1‑300 (MQ=255) | GTCGCCCTGCGCGTGACGATGCTGCCCGGCAAGAGCCGGCCGTGCGCAACCCGCGTCAGCCGGAAAAAC‑AGCCAGTGATCATTCGCAAGGAGTCCAAGCTGGACCGTTTCCCGACGCCTGAGCAACTGGATGACCTGCCAAGCCGCCCACGCGGTGAGCGCCCAGCGCTGCTGACCCGCAAGGGCTGATAGAAGTACCGAGGGGGCTGCTTCGCAGCCCTATCACGACACAAGGCCGCTCCTGCAGAGAATTTCTTGATCTCTACAGGAGCGGCCTTGTGTCGTGATAGGGCCGCAAAG‑C‑GCGCCCTCGGTTTTCAGCTGGCAGAAATTACTTCTGCTTCACACCTTCGACACTGATATCCAGGTCCAGGGTCTGCGAAGTAGCACCCGGGCCTTTGATGCCGAAGTCGTTCAGGTTCAGCGTGGTGGTGGCGTTGAAGCCAGCGCGCTCGCCACCCCATGGGTCCTTGCCTTCACCGTTGAAGGTAGCCTTGAACGTCACCGGCTTGGTGACACCGTGCATGGTCAGGTCGCCAGTCACGTCAGCCGTCTTGTCGCCAGTAGACTTGACGCTGGTGGAGACGA > AE015451/5674451‑5675034 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |