New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | AE015451 | 610901 = | NA (NA) | 102 (1.030) | 93/564 | 0.0 | 100% | intergenic (‑56/‑203) | PP_0525/PP_0526 | TonB‑dependent receptor, B12 family/transposase |
? | AE015451 | = 812297 | 0 (0.000) | intergenic (‑46/‑182) | PP_0698/PP_0699 | Transcriptional regulator, LysR family/Transporter, LysE family |
Only 100 of 108 total aligned reads displayed.
TGAATCACCAGTTCATCTTTGGAGGTGTCCACGCCAGCTTCGATTGGGATTGCGGACATTGCCATGAATAGCTGCTCCTTGTAGCGTAGTGTGACTTGAAGGGCACACCCTGGCGCAGGCTTGCTTCTATTGTCGCTTGCTCGCGAGGCATTCCTTATCGGCGCTTGGGTGTTGAAAGGAGGAGGGGTGATTTCTCCTACGGTCTGTACTGCGCGAACAGTCAGAAGCGAGTTATGGCCCTCCTCCTCCCTTCAAGTCCTACCATACAagcgggtttacccgcgaa‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < AE015451/611168‑610901 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑AGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGCTGAACAGGGATATCATGAAACTGCCGCCACTCAACGCCTTCCGCTACTTCGACATTGCCGCCCAGACCGAGAGCTTCGTGCGCGCCGCCGAGCACTTGCACGTCACTCACGGCGCGGTCAGCCGCCAAATACGCCTGCTGGAAGAAAGCCTTGGCGTGGAACTGTTCGAACGCCG‑CAACCGGGCCATTTTCCTCACCCCCGCCGGTCGTGCCCTGCAAGGCACCACCCAGGCGATCTTCGAACAGCTCGAAGGCGCCGTGCAGCGCCTGCAGCAACAAGCTCGCGA < AE015451/812297‑811980 TGAATCACCAGTTCATCTTTGGAGGTGTCCACGCCAGCTTCGATTGGGATTGCGGACATTGCCATGAATAGCTGCTCCTTGTAGCGTAGTGTGACTTGAAGGGCACACCCTGGCGCAGGCTTGCTTCTATTGTCGCTTGCTCGCGAGGCATTCCTTATCGGCGCTTGGGTGTTGAAAGGAGGAGGGGTGATTTCTCCTACGGTCTGTACTGCGCGAACAGTCAGAAGCGAGTTATGGCCCTCCTCCTCCCTTCAAGTCCTACCATACAAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGCT > 4:278040/1‑301 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aAAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGCTGAACAGGGATATCATGAAACTGCCGCCACTCAACGCCTTCCGCTACTTCGACATTGCCGCCCAGACCGAGAGCTTCGTGCGCGCCGCCGAGCACTTGCACGTCACTCACGGCGCGGTCAGCCGCCAAATACGCCTGCTGGAAGAAAGCCTTGGCGTGGAACTGTTCGAACGCCG‑CAACCGGGCCATTTTCCTCACCCCCGCCGGTCGTGCCCTGCAAGGCACCACCCAGGCGATCTTCGAACAGCTCGAAGGCGCCGTGCAGCGCC < 3:642150/300‑1 AGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGCTGAACAGGGATATCATGAAACTGCCGCCACTCAACGCCTTCCGCTACTTCGACATTGCCGCCCAGACCGAGAGCTTCGTGCGCGCCGCCGAGCACTTGCACGTCACTCACGGCGCGGTCAGCCGCCAAATACGCCTGCTGGAAGAAAGCCTTGGCGTGGAACTGTTCGAACGCCG‑CAACCGGGCCATTTTCCTCACCCCCGCCGGTCGTGCCCTGCAAGGCACCACCCAGGCGATCTTCGAACAGCTCGAAGGCGCCGTGCAGCGCCTG < 3:249913/301‑1 GCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGCTGAACAGGGATATCATGAAACTGCCGCCACTCAACGCCTTCCGCTACTTCGACATTGCCGCCCAGACCGAGAGCTTCGTGCGCGCCGCCGAGCACTTGCACGTCACTCACGGCGCGGTCAGCCGCCAAATACGCCTGCTGGAAGAAAGCCTTGGCGTGGAACTGTTCGAACGCCG‑CAACCGGGCCATTTTCCTCACCCCCGCCGGTCGTGCCCTGCAAGGCACCACCCAGGCGATCTTCGAACAGCTCGAAGGCGCCGTGCAGCGCCTGC > 1:118389/1‑301 GTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGCTGAACAGGGATATCATGAAACTGCCGCCACTCAACGCCTTCCGCTACTTCGACATTGCCGCCCAGACCGAGAGCTTCGTGCGCGCCGCCGAGCACTTGCACGTCACTCACGGCGCGGTCAGCCGCCAAATACGCCTGCTGGAAGAAAGCCTTGGCGTGGAACTGTTCGAACGCCG‑CAACCGGGCCATTTTCCTCACCCCCGCCGGTCGTGCCCTGCAAGGCACCACCCAGGCGATCTTCGAACAGCTCGAAGGCGCCGTGCAGCGCCTGCAGCA < 4:414124/301‑1 cCGAAGAGGCCGGCACAGCTGAACAGGGATATCATGAAACTGCCGCCACTCAACGCCTTCCGCTACTTCGACATTGCCGCCCAGACCGAGAGCTTCGTGCGCGCCGCCGAGCACTTGCACGTCACTCACGGCGCGGTCAGCCGCCAAATACGCCTGCTGGAAGAAAGCCTTGGCGTGGAACTGTTCGAACGCCG‑CAACCGGGCCATTTTCCTCACCCCCGCCGGTCGTGCCCTGCAAGGCACCACCCAGGCGATCTTCGAACAGCTCGAAGGCGCCGTGCAGCGCCTGCAGCAACAAGCTC < 3:230197/300‑1 AGAGGCCGGCACAGCTGAACAGGGATATCATGAAACTGCCGCCACTCAACGCCTTCCGCTACTTCGACATTGCCGCCCAGACCGAGAGCTTCGTGCGCGCCGCCGAGCACTTGCACGTCACTCACGGCGCGGTCAGCCGCCAAATACGCCTGCTGGAAGAAAGCCTTGGCGTGGAACTGTTCGAACGCCG‑CAACCGGGCCATTTTCCTCACCCCCGCCGGTCGTGCCCTGCAAGGCACCACCCAGGCGATCTTCGAACAGCTCGAAGTCGCCGTGCAGCGCCTGCAGCAACAAGCTCGCGc > 4:207262/1‑300 TGAATCACCAGTTCATCTTTGGAGGTGTCCACGCCAGCTTCGATTGGGATTGCGGACATTGCCATGAATAGCTGCTCCTTGTAGCGTAGTGTGACTTGAAGGGCACACCCTGGCGCAGGCTTGCTTCTATTGTCGCTTGCTCGCGAGGCATTCCTTATCGGCGCTTGGGTGTTGAAAGGAGGAGGGGTGATTTCTCCTACGGTCTGTACTGCGCGAACAGTCAGAAGCGAGTTATGGCCCTCCTCCTCCCTTCAAGTCCTACCATACAagcgggtttacccgcgaa‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < AE015451/611168‑610901 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑AGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGCTGAACAGGGATATCATGAAACTGCCGCCACTCAACGCCTTCCGCTACTTCGACATTGCCGCCCAGACCGAGAGCTTCGTGCGCGCCGCCGAGCACTTGCACGTCACTCACGGCGCGGTCAGCCGCCAAATACGCCTGCTGGAAGAAAGCCTTGGCGTGGAACTGTTCGAACGCCG‑CAACCGGGCCATTTTCCTCACCCCCGCCGGTCGTGCCCTGCAAGGCACCACCCAGGCGATCTTCGAACAGCTCGAAGGCGCCGTGCAGCGCCTGCAGCAACAAGCTCGCGA < AE015451/812297‑811980 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |