New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | AE015451 | = 5513318 | 0 (0.000) | 115 (1.110) | 94/586 | 0.0 | 100% | intergenic (+96/‑58) | urtD/urtE | putative Urea ABC transporter, ATP‑binding protein/putative Urea ABC transporter, ATP‑binding protein |
? | AE015451 | = 5758121 | NA (NA) | intergenic (+145/+373) | PP_5050/PP_5051 | transposase/conserved protein of unknown function |
Only 100 of 216 total aligned reads displayed.
CGATGCCGAGACCGAATTTACCGCCGAGCTGTTCAAGGGCCTGGCTGGCAAGCATTCGCTGATGGTGGTGGAGCATGACATGGGCTTCGTCGGCAGCATTGCCGACCATGTGACCGTGCTGCACCAGGGGAGTGTGCTGGCGGAAGGCTCGCTGGAGCAGGTGCAGGCAGATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAACCCCGTTCCTACAGTGGGCGTAATGCCATGGGGCGGTTCCCGTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCACAGCATCCCTTTCAGGAACTCTCACATGCTCAAGATCGACACCCTGCACCAGTACTACGGCGGCAGCCACATCCTGCGCGGCCTGTCCTTCGAAGCCAAGATCGGCGAAGTGACCTGCCTGCTGGGCCGCAACGGCGTGGGCAAGACCACCTTGCTGCGCTGCCTGATGGGCCTGGTGCCCGCCCGCGACGGCAGCATCGAATGGGAAGGCAAGCCGATCACCGCGCTCAAACCGCAGCAACGGGTGCAGGCCGGCATCGCCTAC > AE015451/5513018‑5513615 | cGATGCCGAGACCGAATTTACCGCCGAGCTGTTCAAGGGCCTGGCTGGCAAGCATTCGCTGATGGTGGTGGAGCATGACATGGGCTTCGTCGGCAGCATTGCCGACCATGTGACCGTGCTGCACCAGGGGAGTGTGCTGGCGGAAGGCTCGCTGGAGCAGGTGCAGGCAGATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAACCCCGTTCCTACAGTGGGCGTAATGCCATGGGGCGGTTCCCGTCGTAAGAG > 1:461678‑M1/1‑301 (MQ=255) ggcCGGGACCGAATTTACCGCCGAGCGGTTCAAGGGCCTGGCTGGCAAGCATTCGCTGATGGTGGTGGAGCATGACATGGGCTTCGTCGGCAGCATTGCCGACCATGTGACCGTGCTGCACCAGGGGAGTGTGCTGGCGGAAGGCTCGCTGGAGCAGGTGCAGGCAGATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAACCCCGTTCCTACAGTGGGCGTAATGCCATGGGGCGGTTCCCGTCGTAGGAGatt < 2:54399‑M1/300‑4 (MQ=255) ccGAGACCGAATTTACCGCCGAGCTGTTCAAGGGCCTGGCTGGCAAGCATTCGCTGATGGTGGTGGAGCATGACATGGGCTTCGTCGGCAGCATTGCCGACCATGTGACCGTGCTGCACCAGGGGAGTGTGCTGGCGGAAGGCTCGCTGGAGCAGGTGCAGGCAGATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAACCCCGTTCCTACAGTGGGCGTAATGCCATTGGGCGGTTCCCGTCGTAGGGGattct > 2:480124‑M1/1‑296 (MQ=255) gaCCGAATTTACCGCCGAGCTGTTCAAGGGCCTGGCTGGCAAGCATTCGCTGATGGTGGTGGAGCATGACATGGGCTTCGTCGGCAGCATTGCCGACCATGTGACCGTGCTGCACCAGGGGAGTGTGCTGGCGGAAGGCTCGCTGGAGCAGGTGCAGGCAGATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAACCCCGTTCCTACAGTGGGCGTAATGCCATGGGGCGGTTCCCGTCGTAGGAGattctatgg < 1:624910‑M1/301‑10 (MQ=255) gaCCGAATTTACCGCCGAGCTGTTCAAGGGCCTGGCTGGCAAGCATTCGCTGATGGTGGTGGAGCATGACATGGGCTTCGTCGGCAGCATTGCCGACCATGTGACCGTGCTGCACCAGGGGAGTGTGCTGGCGGAAGGCTCGCTGGAGCAGGTGCAGGCAGATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAACCCCGTTCCTACAGTGGGCGTAATGCCATGGGGAGGTTCCCGTCGTAGGAGattctaaag > 1:570826‑M1/1‑292 (MQ=255) aaTTTACCGCCGAGCTGTTCAAGGGCCTGGCTGGCAAGCATTCGCTGATGGTGGTGGAGCATGACATGGGCTTCGTCGGCAGCATTGCCGACCATGTGACCGTGCTGCACCAGGGGAGTGTGCTGGCGGAAGGCTCGCTGGAGCAGGTGCAGGCAGATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAACCCCGTTCCTACAGTGGGCGTAATGCCATGGGGCGGTTCCCGTCGTAGGAGattctatggccgga < 4:531454‑M1/301‑15 (MQ=255) gtttaCCGCCGAGCTGTTCAAGGGCCTGGCTGGCAAGCATTCGCTGATGGTGGTGGAGCATGACATGGGCTTCGTCGGCAGCATTGCCGACCATGTGACCGTGCTGCACCAGGGGAGTGTGCTGGCGGAAGGCTCGCTGGAGCAGGTGCAGGCAGATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAACCCCGTTCCTACAGTGGGCGTAATGCCATGGGGCGGTTCCCGTCGTAGGAGattctatggccggag < 2:242035‑M1/300‑16 (MQ=255) cgccgAGCTGTTCAAGGGCCTGGCTGGCAAGCATTCGCTGATGGTGGTGGAGCATGACATGGGCTTCGTCGGCAGCATTGCCGACCATGTGACCGTGCTGCACCAGGGGAGTGTGCTGGCGGAAGGCTCGCTGGAGCAGGTGCAGGCAGATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAACCCCGTTCCTACAGTGGGCGTAATGCCATGGGGCGGTTCCCGTCGTAGGAGattctatggccggaggcaaat < 3:304924‑M1/301‑22 (MQ=255) ccgAGCTGTTCAAGGGCCTGGCTGGCAAGCATTCGCTGATGGTGGTGGAGCATGACATGGGCTTCGTCGGCAGCATTGCCGACCATGTGACCGTGCTGCACCAGGGGAGTGTGCTGGCGGAAGGCTCGCTGGAGCAGGTGCAGGCAGATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAACCCCGTTCCTACAGTGGGCGTAATGCCATGGGGCGGTTCCCGTCGTAGGAGattctatggccggaggcaaattt > 3:593424‑M1/1‑278 (MQ=255) aatcaccagttcatctttggaggtgtccacgccagcttcgattgggattgcggacattgccatgaatagctgctccttgtagcgtagtgtgacttgaagggcacaccctggcgcaggcttgcttctattgtcgcttgctcgcgaggcattccttatcggcgcttgggtgttgaaaggaggaggggtgatttctcctacggtctgtactgcgcgaacagtcagaagcgagttatggccctcctcctcccttcaagtcctaccatacaAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCggcacaggcac > 1:5968‑M1/267‑301 (MQ=255) aGGGCCTGGCTGGCAAGCATTCGCTGATGGTGGTGGAGCATGACATGGGCTTCGTCGGCAGCATTGCCGACCATGTGACCGTGCTGCACCAGGGGAGTGTGCTGGCGGAAGGCTCGCTGGAGCAGGTGCAGGCAGATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAACCCCGTTCCTACAGTGGGCGTAATGCCATGGGGCGGTTCCCGTCGTAGGAGattctatggccggaggcaaattttcagtaaaaacg < 4:379289‑M1/301‑36 (MQ=255) gggCCTGGCTGGCAAGCATTCGCGGATGGTGGTGGAGCATGACATGGGCTTCGTCGGCAGCATTGCCGACCATGTGACCGTGCTGCACCAGGGGAGTGTGCTGGCGGAAGGCTCGCTGGAGCAGGTGCAGGCAGATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAACCCCGTTCCTACAGTGGGCGTAATGCCATGGGGCGGTTCCCGTCGTAGGAGattctatggccggaggcaaattttcagtaaaaacgc < 2:308118‑M1/301‑37 (MQ=255) tggctggcAAGCATTCGCTGATGGTGGTGGAGCATGACATGGGCTTCGTCGGCAGCATTGCCGACCATGTGACCGTGCTGCACCAGGGGAGTGTGCTGGCGGAAGGCTCGCTGGAGCAGGTGCAGGCAGATGCGCGGGTGGTCGGGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCCGGTAACCCCGTTCCCACAGTGGGCGTCATGCCCTGGGTCGGTTCCCGTCGTAGGAGattctatggcgggagcctacttttcagtacaaacccccacc > 2:111748‑M1/1‑260 (MQ=255) tggcAAGCATTCGCTGATGGTGGTGGAGCATGACATGGGCTTCGTCGGCAGCATTGCCGACCATGTGACCGTGCTGCACCAGGGGAGTGTGCTGGCGGAAGGCTCGCTGGAGCAGGTGCAGGCAGATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAACCCCGTTCCTACAGTGGGCGTAATGCCATGGGGCGGTTCCCGTCGTAGGAGattctatggccggaggcaaattttcagtaaaaacgccatcggccc > 2:799237‑M1/1‑256 (MQ=255) ctttggaggtgtccacgccagcttcgattgggattgcggacattgccatgaatagctgctccttgtagcgtagtgtgacttgaagggcacaccctggcgcaggcttgcttctattgtcgcttgctcgcgaggcattccttatcggcgcttgggtgttgaaaggaggaggggtgatttctcctacggtctgtactgcgcgaacagtcagaagcgagttatggccctcctcctcccttcaagtcctaccatacaAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCACAGCATCCCTTTCAg > 4:274368‑M1/253‑301 (MQ=255) ggagttcagacgtgtgctcttccgatctttgcggacattgccatgaatagctgctccttgtagcgtagtgtgacttgaagggcacaccctggcgcaggcttgcttctattgtcgcttgctcgcgaggcattccttatcggcgcttgggtgttgaaaggaggaggggtgatttctcctacggtctgtactgcgcgaacagtcagaagcgagttatggccctcctcctcccttcaagtcctaccatacaAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCACAGCATCCCTTTCAGGAAct > 4:65197‑M1/248‑301 (MQ=255) cATTCGCTGATGGTGGTGGAGCATGACATGGGCTTCGTCGGCAGCATTGCCGACCATGTGACCGTGCTGCACCAGGGGAGTGTGCTGGCGGAAGGCTCGCTGGAGCAGGTGCAGGCAGATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAACCCCGTTCCTACAGTGGGCGTAATGCCATGGGGCGGTTCCCGTCGTAGGAGattctatggccggaggcaaattttcagtaaaaacgccatcggcctctctcag < 1:185763‑M1/301‑53 (MQ=255) cATTCGCTGATGGTGGTGGAGCATGACATGGGCTTCGTCGGCAGCATTGCCGACCATGTGACCGTGCTGCACCAGGGGAGTGTGCTGGCGGAAGGCTCGCTGGAGCAGGTGCAGGCAGATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAACCCCGTTCCTACAGTGGGCGTAATGCCATGGGGCGGTTCCCGTCGTAGGAGattctatggccggaggcaaattttcagtaaaaacgccatcggcctctctcag < 3:582754‑M1/301‑53 (MQ=255) tttcGCTGATGGTGGTGGAGCATGACATGGGCTTCGTCGGCAGCATTGCCGACCATGTGACCGTGCTGCACCAGGGGAGTGTGCTGGCGGAAGGCTCGCTGGAGCAGGTGCAGGCAGATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAACCCCGTTCCTACAGTGGGCGTAATGCCATGGGGCGGTTCCCGTCGTAGGAGattctatggccggaggcaaattttcagtaaaaacgccatcggcctctctcagc < 3:461689‑M1/300‑54 (MQ=255) 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tcctcccttcaagtcctaccatacaAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCACAGCATCCCTTTCAGGAACTCTCACATGCTCAAGATCGACACCCTGCACCAGTACTACGGCGGCAGCCACATCCTGCGCGGCCTGTCCTTCGAAGCCAAGATCGGCGAAGTGACCTGCCTGCTGGGCCGCAACGGCGTGGGCAAGACCACCTTGCTGCGCTGCCTGATGGGCCTGGTGCACGCCCGCGACGGCAGCATCGAATGGGAAGGCAAGCCGATCACCGCGCTCAAACCGCAGCAAc < 1:713680‑M1/276‑1 (MQ=255) cctcccttcaagtcctaccctacaAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCACAGCATCCCTTTCAGGAACTCTCACATGCTCAAGATCGACACCCTGAACCAGTACTACGGCGGCAGCCACATCCTGCGCGGCCTGTCCTTCGAAGCCAAGATCGGCGAAGTGACCTGCCTGCTGGGCCGCAACGGCGTGGGCAAGACCACCTTGCTGCGCTGCCTGATGGGCCTGGTGCCCGCCCGCGACGGCAGCATCGAATGGGAAGGCAAGCCGATCACCGCGCTCAAACCGCAGCAACg > 2:436785‑M1/25‑301 (MQ=255) cctcccttcaagtcctaccatacaAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCACAGCATCCCTTTCAGGAACTCTCACATGCTCAAGATCGACACCCTGCACCAGTACTACGGCGGCAGCCACATCCTGCGCGGCCTGTCCTTCGAAGCCAAGATCGGCGAAGTGACCTGCCTGCTGGGCCGCAACGGCGTGGGCAAGACCACCTTGCTGCGCTGCCTGATGGGCCTGGTGCCCGCCCGCGACGGCAGCATCGAATGGGAAGGCAAGCCGATCACCGCGCTCAAACCGCAGCAaca < 4:766636‑M1/277‑2 (MQ=255) 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gTTCCCGTCGTAGGAGattctatggccggaggcaaattttcagtaaaaacgccatcggcctctctcagcaacctcgaggtacgagtcagcgtgccagagaatttctccccagcattggatactgcccgtcagtttgggcgggctgcgttgcagccccagcctcagctggccggcttggcacctccggtatatatctcgggcttccagtcggcctgatgcctcatcaggccgaaggccagccgagccaagcgacgtgcaaggatcaccaaggcttgagtggttttcttcccccgggcttggt > 3:345448‑M1/1‑16 (MQ=255) ttCCCGTCGTAGGAGattctatggccggaggcaaattttcagtaaaaacgccatcggcctctctcagcaacctcgaggtacgagtcagcgtgccagagaatttctccccagcattggatactgcccgtcagtttgggcgggctgcgttgcagccccagcctcagctggccggcttggcacctccggtatatatctcgggcttccagtcggcctgatgcctcatcaggccgaaggccagccgagccaagcgacgtgcaaggatcaccaaggcttgagtggttttcttcccccgggcttggtg < 4:43804‑M1/301‑287 (MQ=255) catacaAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCACAGCATCCCTTTCAGGAACTCTCACATGCTCAAGATCGACACCCTGCACCAGTACTACGGCGGCAGCCACATCCTGCGCGGCCTGTCCTTCGAAGCCAAGATCGGCGAAGTGACCTGCCTGCTGGGCCGCAACGGCGTGGGCAAGACCACCTTGCTGCGCTGCCTGATGGGCCTGGTGCCCGCCCGCGACGGCAGCATCGAATGGGAAGGCAAGCCGATCACCGCGCTCAAACCGCAGCAACGGGTGCAGGCCGGCATCGc < 3:567342‑M1/295‑1 (MQ=255) | CGATGCCGAGACCGAATTTACCGCCGAGCTGTTCAAGGGCCTGGCTGGCAAGCATTCGCTGATGGTGGTGGAGCATGACATGGGCTTCGTCGGCAGCATTGCCGACCATGTGACCGTGCTGCACCAGGGGAGTGTGCTGGCGGAAGGCTCGCTGGAGCAGGTGCAGGCAGATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAACCCCGTTCCTACAGTGGGCGTAATGCCATGGGGCGGTTCCCGTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCACAGCATCCCTTTCAGGAACTCTCACATGCTCAAGATCGACACCCTGCACCAGTACTACGGCGGCAGCCACATCCTGCGCGGCCTGTCCTTCGAAGCCAAGATCGGCGAAGTGACCTGCCTGCTGGGCCGCAACGGCGTGGGCAAGACCACCTTGCTGCGCTGCCTGATGGGCCTGGTGCCCGCCCGCGACGGCAGCATCGAATGGGAAGGCAAGCCGATCACCGCGCTCAAACCGCAGCAACGGGTGCAGGCCGGCATCGCCTAC > AE015451/5513018‑5513615 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |