| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | AE015451 | 533510 = | NA (NA) | 4 (0.040) | 4/574 | 8.2 | 4.4% | coding (775/1194 nt) | tufA | Elongation factor Tu‑A |
| ? | AE015451 | = 533506 | 90 (0.850) | coding (771/1194 nt) | tufA | Elongation factor Tu‑A | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
GCTGTCCACCTACGACTTCCCAGGCGACGACACTCCGATCATCATCGGTTCCGCTCGTATGGCGCTGGAAGGCAAAGACGACAACGAAATGGGCACTACCGCTGTTAAGAAGCTGGTAGAAACTCTGGACAGCTACATTCCTGAGCCAGTTCGTGCTATCGACCAGCCGTTCCTGATGCCGATCGAAGACGTGTTCTCGATCTCGGGTCGTGGTACCGTTGTTACCGGTCGTATCGAGCGTGGCATCGTCCGCGTTCAGGATCCGCTGGAAATCGTTGGTCTGCGTGACACCACCACCACCACCTGCACCGGTGTTGAGATGTTCCGCAAGCTGCTGGACGAAGGTCGTGCTGGCGAGAACTGCGGCGTTCTGCTGCGTGGTACCAAGCGTGACGACGTTGAGCGTGGCCAGGTTCTGGTCAAGCCAGGTTCGGTCAAGCCGCACACCAAGTTCACCGCAGAAGTCTACGTCCTGTCGAAGGAAGAAGGCGGCCGTCACACTCCGTTCTTCAAAGGCTACCGTCCACAGTTCTACTTCCGTACCACTGAC > AE015451/533206‑533755 | cctgTCCACCTACGACTTCCCAGGCGACGACAATCCGATCATCATCGGTTCCGCTCGTATGGCGCTGGAAGGCAAAGACGACAACGAAATGGGCACTACCGCTGTTAAGAAGCTGGTAGAAACTCTGGACAGCTACATTCCTGAGCCAGTTCGTGCTATCGACCAGCCGTTCCTGATGCCGATCGAAGACGTGTTCTCGATCTCGGGTCGTGGTACCGTTGTTACCGGTCGTATCGAGCGTGGCATCGTCCGCGTTCAGGATCCGCTGGAAATCGTTGGTCTGCGTGAcaccaccaccacc < 2:283776/300‑1 (MQ=255)cctcttccgatctgACTTCCCAGGCGACGAAACTCCGATCATCATCGGTTCCGCTCGTATGGCGCTGGAAGGCAAAGACGACAACGAAATGGGCACTACCGCTGTTAAGAAGCTGGTAGAAACTCTGGACAGCTACATTCCTGAGCCAGTTCGTGCTATCGACCAGCCGTTCCTGATGCCGATCGAAGACGTGTTCTCGATCTCGGGTCGTGGTACCGTTGTTACCGGTCGTATCGAGCGTGACATCGTCCGCGTTCAGGATCCGCTGGAAATCGTTGGTCTGCGTGAcaccaccaccacc < 2:527310/288‑1 (MQ=255) gatctaCCTACGACTTCCCAGGCGACGACACTCCGATCATCATCGGTTCCGCTCGTATGGCGCTGGAAGGCAAAGACGACAACGAAATGGGCACTACCGCTGTTAAGAAGCTGGTAGAAACTCTGGACAGCTACATTCCTGAGCCAGTTCGTGCTATCGACCAGCCGTTCCTGATGCCGATCGAAGACGTGTTCTCGATCTCGGGTCGTGGTACCGTTGTTACCGGTCGTATCGAGCGTGGCATCGTCCGCGTTCAGGATCCGCTGGAAATCGTTGGTCTGCGTGAcaccaccaccaccac < 4:148360/296‑1 (MQ=255) cccACCTACGACTTCCCAGGCGACGACACTCCGATCATCATCGGTTCCGCTCGTATGGCGCTGGAAGGCAAAGACGACAACGAAATGGGCACTACCGCTGTTAAGAAGCTGGTAGAAACTCTGGACAGCTACATTCCTGAGCCAGTTCGTGCTATCGACCAGCCGTTCCTGATGCCGATCGAAGACGTGTTCTCGATCTCGGGTCGTGGTACCGTTGTTACCGGTCGTATCGAGCGTGGCATCGTCCGCGTTCAGGATCCGCTGGAAATCGTTGGTCTGCGTGACACCACCACCACCACCt < 1:301642/300‑1 (MQ=255) aCCTACGACTTCCCAGGCGACGACACTCCGATCATCATCGGTTCCGCTCGTATGGCGCTGGAAGGCAAAGACGACAACGAAATGGGCACTACCGCTGTTAAGAAGCTGGTAGAAACTCTGGACAGCTACATTCCTGAGCCAGTTCGTGCTATCGACCAGCCGTTCCTGATGCCGATCGAAGACGTGTTCTCGATCTCGGGTCGTGGTACCGTTGTTACCGGTCGTATCGAGCGTGGCATCGTCCGCGTTCAGGATCCGCTGGAAATCGTTGGTCTGCGTGAcaccaccaccaccacagatc > 2:148321/1‑296 (MQ=255) ccTACGACTTCCCAGGCGACGACACTCCGATCATCATCGGTTCCGCTCGTATGGCGCTGGAAGGCAAAGACGACAACGAAATGGGCACTACCGCTGTTAAGAAGCTGGTAGAAACTCTGGACAGCTACATTCCTGAGCCAGTTCGTGCTATCGACCAGCCGTTCCTGATGCCGATCGAAGACGTGTTCTCGATCTCGGGTCGTGGTACCGTTGTTACCGGTCGTATCGAGCGTGGCATCGTCCGCGTTCAGGATCCGCTGGAAATCGTTGGTCTGCGTGACACCACCACCACCACCTGCAc > 3:281809/1‑301 (MQ=255) cTACGACTTCCCAGGCGACGACACTCCGATCATCATCGGTTCCGCTCGTATGGCGCTGGAAGGCAAAGACGACAACGAAATGGGCACTACCGCTGTTAAGAAGCTGGTAGAAACTCTGGACAGCTACATTCCTGAGCCAGTTCGTGCTATCGACCAGCCGTTCCTGATGCCGATCGAAGACGTGTTCTCGATCTCGGGTCGTGGTACCGTTGTTACCGGTCGTATCGAGCGTGGCATCGTCCGCGTTCAGGATCCGCTGGAAATCGTTGGTCTGCGTGACACCACCACCACCACCTGCAcc < 4:176777/301‑1 (MQ=255) gACTTCCCAGGCGACGACACTCCGATCATCATCGGTTCCGCTCGTATGGCGCTGGAAGGCAAAGACGACAACGAAATGGGCACTACCGCTGTTAAGAAGCTGGTAGAAACTCTGGACAGCTACATTCCTGAGCCAGTTCGTGCTATCGACCAGCCGTTCCTGATGCCGATCGAAGACGTGTTCTCGATCTCGGGTCGTGGTACCGTTGTTACCGGTCGTATCGAGCGTGACATCGTCCGCGTTCAGGATCCGCTGGAAATCGTTGGTCTGCGTGAcaccaccaccaccagatcggaagagc > 4:527472/1‑289 (MQ=255) tCCCAGGCGACGACACTCCGATCATCATCGGTTCCGCTCGTATGGCGCTGGAAGGCAAAGACGACAACGAAATGGGCACTACCGCTGTTAAGAAGCTGGTAGAAACTCTGGACAGCTACATTCCTGAGCCAGTTCGTGCTATCGACCAGCCGTTCCTGATGCCGATCGAAGACGTGTTCTCGATCTCGGGTCGTGGTACCGTTGTTACCGGTCGTATCGAGCGTGGCATCGTCCGCGTTCAGGATCCGCTGGAAATCGTTGGTCTGCGTGACACCACCACCACCACCTGCACCGGTGTTga > 4:250065/1‑301 (MQ=255) tCCCAAGCGACGACACTCCGATCATCATCGGTTCCGCTCGTATGGCGCTGGAAGGCAAAGACGACAACGAAATGGGCACTACCGCTGTTAAGAAGCTGGTAGAAACTCTGGACAGCTACATTCCTGAGCCAGTTCGTGCTATCGACCAGCCGTTCCTGATGCCGATCGAAGACGTGTTCTCGATCTCGGGTCGTGGTACCGTTGTTACCGGTCGTATCGAGCGTGGCATCGTCCGCGTTCAGGATCCGCTGGAAATCGTTGGTCTGCGTGACACCACCACCACCACCTGCACCGGTGTTga < 4:708942/301‑1 (MQ=255) 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acacTCCGATCATCATCGGTTCCGCTCGTATGGCGCTGGAAGGCAAAGACGACAACGAAATGGGCACTACCGCTGTTAAGAAGCTGGTAGAAACTCTGGACAGCTACATTCCTGAGCCAGTTCGTGCTATCGACCAGCCGTTCCTGATGCCGATCGAAGACGTGTTCTCGATCTCGGGTCGTGGTACCGTTGTTACCGGTCGTATCGAGCGTGGCATCGTCCGCGTTCAGGATCCGCTGGAAATCGTTGGTCTGCGTGACACCACCACCACCACCTGCACCGGTGTTGAGATGTTCCGCaa > 2:258675/1‑301 (MQ=255) acTCCGATCATCATCGGTTCCGCTCGTATGGCGCTGGAAGGCAAAGACGACAACGAAATGGGCACTACCGCTGTTAAGAAGCTGGTAGAAACTCTGGACAGCTACATTCCTGAGCCAGTTCGTGCTATCGACCAGCCGTTCCTGATGCCGATCGAAGACGTGTTCTCGATCTCGGGTCGTGGTACCGTTGTTACCGGTCGTATCGAGCGTGGCATCGTCCGCGTTCAGGCTCCGCTGGAAATCGTTGTTCTGCGGTACACCACCCCCCCCACCTGCACCGGTGTTGAGATGTTCCGCAAgc > 2:746717/1‑301 (MQ=255) gggagttcagacgtgtgctcttccgatcttGGAAGGCAAAGACGACAACGAAATGGGCACTACCGCTGTTAAGAAGCTGGTAGAAACTCTGGACAGCTACATTCCTGAGCCAGTTCGTGCTATCGACCAGCCGTTCCTGATGCCGATCGAAGACGTGTTCTCGATCTCGGGTCGTGGTACCGTTGTTACCGGTCGTATCGAGCGTGGCATCGTCCGCGTTCAGGATCCGCTGGAAATCGTTGGTCTGCGTGACACCACCACCACCACCTGCACCGGTGTTGAGATGTTCCGCAAGctgctg < 4:125514/272‑1 (MQ=255) ccatcatcGGTTCCGCTCGGATGGCGCTGGAAGGCAAAGACGACAACGAAATGGGCACTACCGCTGTGAAGAAGCTGGTAGAAACTCTGGACAGCTACATTCCTGAGCCAGGTCGTGCTATCGACCAGCCGTTCCTGATGCCGATCGAAGACGTGTTCTCGATCTCGGGTCGTGGTACCGTTGTTACCGGTCGTATCGAGCGTGGCATCGTCCGCGTTCAGGATCCGCTGGAAATCGTTGGTCTGCGTGACACCACCACCACCACCTGCACCGGTGTTGAGATGTTCCGCAAGCTGCTGGa < 1:178741/300‑1 (MQ=255) ccgccgctcttCCGATCTTATGGCGCTGGAAGGCAAAGACGACAACGAAATGGGCACTACCGCTGTTAAGAAGCTGGTAGAAACTCTGGACAGCTACATTCCTGAGCCAGTTCGTGCTATCGACCAGCCGTTCCTGATGCCGATCGAAGACGTGTTCTCGATCTCGGGTCGTGGTACCGTTGTTACCGGTCGTATCGAGCGTGGCATCGTCCGCGTTCAGGATCCGCTGGAAATCGTTGGTCTGCGTGACACCACCACCACCACCTGCACCGGTGTTGAGATGTTCCGCAAGCTGCTGGAc < 2:803751/292‑1 (MQ=255) atcatcGGTTCCGCTCGTATGGCGCTGGAAGGCAAAGACGACAACGAAATGGGCACTACCGCTGTTAAGAAGCTGGTAGAAACTCTGGACAGCTACATTCCTGAGCCAGTTCGTGCTATCGACCAGCCGTTCCTGATGCCGATCGAAGACGTGTTCTCGATCTCGGGTCGTGGTACCGTTGTTACCGGTCGTATCGAGCGTGGCATCGTCCGCGTTCAGGATCCGCTGGAAATCGTTGGTCTGCGTGACACCACCACCACCACCTGCACCGGTGTTGAGATGTTCCGCAAGCTGCTGGACg > 1:461705/1‑301 (MQ=255) catcGGTTCCGCTCGTATGGCGCTGGAAGGCAAAGACGACAACGAAATGGGCACTACCGCTGTTAAGAAGCTGGTAGAAACTCTGGACAGCTACATTCCTGAGCCAGTTCGTGCTATCGACCAGCCGTTCCTGATGCCGATCGAAGACGTGTTCTCGATCTCGGGTCGTGGTACCGTTGTTACCGGTCGTATCGAGCGTGGCATCGTCCGCGTTCAGGATCCGCTGGAAATCGTTGGTCTGCGTGACACCACCACCACCACCTGCACCGGTGGTGAGATTTTCCGCAAGCTGCTggcctac > 2:680322/1‑296 (MQ=255) gCTCGTATGGCGCTGGAAGGCAAAGACGACAACGAAATGGGCACTACCGCTGTTAAGAAGCTGGTAGAAACTCTGGACAGCTACATTCCTGAGCCAGTTCGTGCTATCGACCAGCCGTTCCTGATGCCGATCGAAGACGTGTTCTCGATCTCGGGTCGTGGTACCGTTGTTACCGGTCGTATCGAGCGTGGCATCGTCCGCGTTCAGGATCCGCTGGAAATCGTTGGTCTGCGTGACACCACCACCACCACCTGCACCGGTGTTGAGATGTTCCGCAAGCTGCTGGACGAAGGTCGTGCTg > 3:691536/1‑301 (MQ=255) tATGGCGCTGGAAGGCAAAGACGACAACGAAATGGGCACTACCGCTGTTAAGAAGCTGGTAGAAACTCTGGACAGCTACATTCCTGAGCCAGTTCGTGCTATCGACCAGCCGTTCCTGATGCCGATCGAAGACGTGTTCTCGATCTCGGGTCGTGGTACCGTTGTTACCGGTCGTATCGAGCGTGGCATCGTCCGCGTTCAGGATCCGCTGGAAATCGTTGGTCTGCGTGACACCACCACCACCACCTGCACCGGTGTTGAGATGTTCCGCAAGCTGCTGGAcagatcggaagagcacacg > 4:804021/1‑283 (MQ=255) tATGGCGCTGGAAGGCAAAGACGACAACGAAATGGGCACTACCGCTGTTAAGAAGCTGGTAGAAACTCTGGACAGCTACATTCCTGAGCCAGTTCGTGCTATCGACCAGCCGTTCCTGATGCCGATCGAAGACGTGTTCTCGATCTCGGGTCGTGGTACCGTTGTTACCGGTCGTATCGAGCGTGGCATCGTCCGCGTTCAGGATCCGCTGGAAATCGTTGGTCTGCGTGACACCACCACCACCACCTGCACCGGTGTTGAGATGTTCCGCAAGCTGCTGGACGAAGGTCGTGCTGGCgag > 1:46077/1‑301 (MQ=255) cgcTGGAAGGCAAAGACGACAACGAAATGGGCACTACCGCTGTTAAGAAGCTGGTAGAAACTCTGGACAGCTACATTCCTGAGCCAGTTCGTGCTATCGACCAGCCGTTCCTGATGCCGATCGAAGACGTGTTCTCGATCTCGGGTCGTGGTACCGTTGTTACCGGTCGTATCGAGCGTGGCATCGTCCGCGTTCAGGATCCGCTGGAAATCGTTGGTCTGCGTGACACCACCACCACCACCTGCACCGGTGTTGAGATGTTCCGCAAGCTGCTGGACGAAGGTCGTGCTGGCGAGAACTg < 4:450670/301‑1 (MQ=40) cgcTGGAAGGCAAAGACGACAACGAAATGGGCACTACCGCTGTTAAGAAGCTGGTAGAAACTCTGGACAGCTACATTCCTGAGCCAGTTCGTGCTATCGACCAGCCGTTCCTGATGCCGATCGAAGACGTGTTCTCGATCTCGGGTCGTGGTACCGTTGTTACCGGTCGTATCGAGCGTGGCATCGTCCGCGTTCAGGATCCGCTGGAAATCGTTGGTCTGCGTGACACCACCACCACCACCTGCACCGGTGTTGAGATGTTCCGCAAGCTGCTGGACGAAGGTCGTGCTGGCGAGAACTg < 4:258744/301‑1 (MQ=40) 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| Alignment Legend |
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Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |