Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
JC | AE015451 | 5,681,415 | +CGGG | intergenic (‑133/+71) | PP_4986 ← / ← PP_4987 | Channel protein, hemolysin III family/putative Chemotaxis protein |
New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | AE015451 | = 5681415 | 0 (0.000) | 102 (0.980) +CGGG |
85/592 | 0.1 | 100% | intergenic (‑133/+71) | PP_4986/PP_4987 | Channel protein, hemolysin III family/putative Chemotaxis protein |
? | AE015451 | 5681416 = | 0 (0.000) | intergenic (‑134/+70) | PP_4986/PP_4987 | Channel protein, hemolysin III family/putative Chemotaxis protein |
Only 100 of 104 total aligned reads displayed.
AAATGCTGTACAGCAACAGCAGCGTGCCGCCGTAGATGGAGAAGCTGACGATCTTCCACGGGTCGCCTTGCAGGCCCGCGGCCACGATCAGCCAGATGGCACCAATAGCAGCGAGGACGGCACCGACCAGGTGGGTCCAGGCGTTGAAGCGTTCACCGTAATACATGCAAACACAGACCTCCTGAGGTGGGCTGGGTTCCTGTTGTGATGCTGATGGCTTCGTTCTTTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGGCGCGAAGCGGCCCCAGGCTTTCATTGCCACTGCATGAACCGCGCTGCTGCGCAGCCCTATCGCGACACAAGGCCGCT‑CCCACTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCACGCACCAGCCTTTCCAATGCGACCAGGTCCGGTACCCGCGCCACCTGCTCACCCACCTGCACCGCTGCCAGCTCCAACCTGCCCAGCGCCACATCCACGTAGTTCAGCTGGCTGTCGAGCTTGCACGAGCGCGGAATGTCCTGCAGCAACAGCGCCAGGTAGCGCAAACCGGTATCGCCCAACGCATTGAGCACCACC > AE015451/5681117‑5681714 | gctgtacagcaacagcagcgtgccgccgtagatggagaagctgacgatcttccacgggtcgccttgcaggcccgcggccacgatcagccagatggcaccaatagcagcgaggacggcaccgaccaggtgggtccaggcgttgaagcgttcaccgtaatacatgcaaacacagacctcctgaggtgggctgggttcctgttgtgatgctgatggcttcgttctttgtgggagcggccttgtgtcgcgaaaggggcgcgaagcggccccaggctttcattgcccctgcatgaaccgccggggc > 4:265251‑M2/300‑301 (MQ=255) cagcaacagcagcgtgccgccgtagatggagaagctgacgatcttccacgggtcgccttgcaggcccgcggccacgatcagccagatggcaccaatagcagcgaggacggcaccgaccaggtgggtccaggcgttgaagcgttcaccgtaatacatgcaaacacagacctcctgaggtgggctgggttcctgttgtgatgctgatggcttcgttctttgtgggagcggccttgtgtcgcgaaaggggcgcgaacgcgccccaggctttcattgcccctgcatgaacctccggggctgtctc > 2:11612‑M2/294‑297 (MQ=255) aacagcagcgtgccgccgtagatggagaagctgacgatcttccacgggtcgccttgcaggcccgcggccacgatcagccagatggcaccaatagcagcgaggacggcaccgaccaggtgggtccaggcgttgaagcgttcaccgtaatacatgcaaacacagacctcctgaggtgggctgggttcctgttgtgatgctgatggcttcgttctttgtgggagcggccttgtgtcgcgaaaggggcgcgaagcggccccaggctttcattgccactgcatgaaccgccgggGCTGCTGCGCAg < 1:136352‑M2/12‑1 (MQ=255) cgatcttgccgccgtagatggagaagctgacgatcttccacgggtcgccttgcaggcccgcggccacgatcagccagatggcaccaatagcagcgaggacggcaccgaccaggtgggtccaggcgttgaagcgttcaccgtaatacatgcaaacacagacctcctgaggtgggctgggttcctgttgtgatgctgatggcttcgttctttgtgggagcggccttgtgtcgcgaaaggggcgcgaagcggccccaggctttcattgccactgcatgaaccgccgggGCTGCTGCGCAGCCCt < 1:152703‑M2/16‑1 (MQ=255) 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ctgcatgaaccgccgggGCTGCTGCGCAGCCCTATCGCGACACAAGGCCGCT‑CCCACTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCACGCACCAGCCTTTCCAATGCGACCAGGTCCGGTACCCGCGCCACCTGCTCACCCACCTGCACCGCTGCCAGCTCCAACCTGCCCAGCGCCACATCCACGTAGTTCAGCTGGCTGTCGAGCTTGCACGAGCGCGGAATGTCCTGCAGCAACAGCGCCAGGTAGCGCAAACCGGTATCGCCCAAc < 4:695596‑M2/284‑1 (MQ=255) ctgacgggcccgccgggGCTGCTGCGCAGCCCTATCGCGACACAAGGCCGCT‑CCCACTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCACGCACCAGCCTTTCCAATGCGACCAGGTCCGGTACCCGCGCCACCTGCTCACCCACCTGCACCGCTGCCAGCTCCAACCTGCCCAGCGCCACATCCACGTAGTTCAGCTGGCTGTCGAGCTTGCACGAGCGCGGAATGTCCTGCAGCAACAGCGCCAGGTAGCGCAAACCGGTATCGCCCAAc < 2:228675‑M2/284‑1 (MQ=255) gcatgaaccgccgggGCTGCTGCGCAGCCCTATCGCGACACAAGGCCGCT‑CCCACTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCACGCACCAGCCTTTCCAATGCGACCAGGTCCGGTACCCGCGCCACCTGCTCACCCACCTGCACCGCTGCCAGCTCCAACCTGCCCAGCGCCACATCCACGTAGTTCAGCTGGCTGTCGAGCTTGCACGAGCGCGGAATGTCCTGCAGCAACAGCGCCAGGTAGCGCAAACCGGTATCGcccaagaa > 3:109412‑M2/16‑298 (MQ=255) atgaaccgccgggGCTGCTGCGCAGCCCTATCGCGACACAAGGCCGCT‑CCCACTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCACGCACCAGCCTTTCCAATGCGACCAGGTCCGGTACCCGCGCCACCTGCTCACCCACCTGCACCGCTGCCAGCTCCAACCTGCCCAGCGCCACATCCACGTAGTTCAGCTGGCTGTCGAGCTTGCACGAGCGCGGAATGTCCTGCAGCAACAGCGCCAGGTAGCGCAAACCGGTATCGCCCAACGCAt > 4:467799‑M2/14‑301 (MQ=255) cccgccgggGCTGCTGCGCAGCCCTATCGCGACACAAGGCCGCT‑CCCACTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCACGCACCAGCCTTTCCAATGCGACCAGGTCCGGTACCCGCGCCACCTGCTCACCCACCTGCACCGCTGCCAGCTCCAACCTGCCCAGCGCCACATCCACGTAGTTCAGCTGGCTGTCGAGCTTGCACGAGCGCGGAATGTCCTGCAGCAACAGCGCCAGGTAGCGCAAACCGGTATCGCCCAACGCATTGAg < 3:174694‑M2/292‑1 (MQ=255) cccgccgggGCTGCTGCGCAGCCCTATCGCGACACAAGGCCGCT‑CCCACTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCACGCACCAGCCTTTCCAATGCGACCAGGTCCGGTACCCGCGCCACCTGCTCACCCACCTGCACCGCTGCCAGCTCCAACCTGCCCAGCGCCACATCCACGTAGTTCAGCTGGCTGTCGAGCTTGCACGAGCGCGGAATGTCCTGCAGCAACAGCGCCAGGTAGCGCAAACCGGTATCGCCCAACGCATTGAg < 4:829443‑M2/292‑1 (MQ=255) ccgggGCTGCTGCGCAGCCCTATCGCGACACAAGGCCGCT‑CCCACTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCACGCACCAGCCTTTCCAATGCGACCAGGTCCGGTACCCGCGCCACCTGCTCACCCACCTGCACCGCTGCCAGCTCCAACCTGCCCAGCGCCACATCCACGTAGTTCAGCTGGCTGTCGAGCTTGCACGAGCGCGGAATGTCCTGCAGCAACAGCGCCAGGTAGCGCAAACCGGTATCGCCCAACGCATTGAGcacc < 1:406461‑M2/296‑1 (MQ=255) gggGCTGCTGCGCAGCCCTATCGCGACACAAGGCCGCT‑CCCACTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCACGCACCAGCCTTTCCAATGCGACCAGGTCCGGTACCCGCGCCACCTGCTCACCCACCTGCACCGCTGCCAGCCCCAACCTGCCCAGCGCCACATCCACGTAGTTCAGCTGGCTGTCGAGCTTGCACGAGCGCGGAatgtcctgcagcaacagcgccaggtagcgcaagatcggaagagcgtcgtgtagggaaagagg > 1:223428‑M2/4‑271 (MQ=255) ggGCTGCTGCGCAGCCCTATCGCGACACAAGGCCGCT‑CCCACTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCACGCACCAGCCTTTCCAATGCGACCAGGTCCGGTACCCGCGCCACCTGCTCACCCACCTGCACCGCTGCCAGCTCCAACCTGCCCAGCGCCACATCCACGTAGTTCAGCTGGCTGTCGAGCTTGCACGAGCGCGGAATGTCCTGCAGCAACAGCGCCAGGTAGCGCAAACCGGTATCGCCCAACGCATTGAGcaccacc < 3:210952‑M2/299‑1 (MQ=255) | AAATGCTGTACAGCAACAGCAGCGTGCCGCCGTAGATGGAGAAGCTGACGATCTTCCACGGGTCGCCTTGCAGGCCCGCGGCCACGATCAGCCAGATGGCACCAATAGCAGCGAGGACGGCACCGACCAGGTGGGTCCAGGCGTTGAAGCGTTCACCGTAATACATGCAAACACAGACCTCCTGAGGTGGGCTGGGTTCCTGTTGTGATGCTGATGGCTTCGTTCTTTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGGCGCGAAGCGGCCCCAGGCTTTCATTGCCACTGCATGAACCGCGCTGCTGCGCAGCCCTATCGCGACACAAGGCCGCT‑CCCACTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCACGCACCAGCCTTTCCAATGCGACCAGGTCCGGTACCCGCGCCACCTGCTCACCCACCTGCACCGCTGCCAGCTCCAACCTGCCCAGCGCCACATCCACGTAGTTCAGCTGGCTGTCGAGCTTGCACGAGCGCGGAATGTCCTGCAGCAACAGCGCCAGGTAGCGCAAACCGGTATCGCCCAACGCATTGAGCACCACC > AE015451/5681117‑5681714 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |