| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | AE015451 | 4,586,057 | +C | intergenic (+140/+75) | PP_4061 → / ← PP_4063 | conserved protein of unknown function/putative Long‑chain‑fatty‑acid‑CoA ligase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | AE015451 | 4,586,056 | 1 | . | C | 100.0% | 86.7 / NA | 25 | intergenic (+139/+76) | PP_4061/PP_4063 | conserved protein of unknown function/putative Long‑chain‑fatty‑acid‑CoA ligase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (0/0); new base C (11/14); total (11/14) | |||||||||||
ACATTCCCATTCCACCGGAGACACCCGATCCCAATATCGACGACCCGAGCTTGCCGCCACCCGTACCGGAAGAAGACCCGGACGAGCTGCCGATCAAGCCGACCGTGCCGCCGACAGTGGGCGACCCGCCGAGCCAGGAGCCACCGGTGAAGGCTTAAGGGTAGACCACGGCACCGGCGTGAACAGCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTCTGC‑GGTAAACCCGCTCCTACCAGGGA‑CGTGCCGGCCTTGAATGCGGCGCTGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGATCTCACGCATGCGGAACTTCTGCACCTTGCCGGTCACGGTCATCGGGTACTCGTCGACAAAACGTATATACCGCGGCACCTTGAAGTGTGCGATGCGTGCCTTGCACCAGCCCTGCAGCTCCTCGACCGTGGCGCTGTGCCCCGGGTGCAGCTTGATCCAGGCGACGATCTCTTCGCC > AE015451/4585760‑4586347 | aCATTCCCATTCCACCGGAGACACCCGATCCCAATATCGACGACCCGAGCTTGCCGCCACCCGTACCGGAAGAAGACCCGGACGAGCTGCCGATCAAGCCGACCGTGCCGCCGACAGTGGGCGACCCGCCGAGCCAGGAGCCACCGGTGAAGGCTTAAGGGTAGACCACGGCACCGGCGTGAACAGCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGA‑cc < 1:136217/300‑2 (MQ=255) ccACCGGAGACACCCGATCCCAATATCGACGACCCGAGCTTGCCGCCACCCGTACCGGAAGAAGACCCGGACGAGCTGCCGATCAAGCCGACCGTGCCGCCGACAGTGGGCGACCCGCCGAGCCAGGAGCCACCGGTGAAGGCTTAAGGGTAGACCACGGCACCGGCGTGAACAGCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTg < 2:399197/301‑1 (MQ=255) cGGAGACACCCGATCCCAATATCGACGACCCGAGCTTGCCGCCACCCGTACCGGAAGAAGACCCGGACGAGCTGCCGATCAAGCCGACCGTGCCGCCGACAGTGGGCGACCCGCCGAGCCAGGAGCCACCGGTGAAGGCTTAAGGGTAGACCACGGCACCGGCGTGAACAGCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCtt > 2:757311/1‑296 (MQ=255) ggAGACACCCGATCCCAATATCGACGACCCGAGCTTGCCGCCACCCGTACCGGAAGAAGACCCGGACGAGCTGCCGATCAAGCCGACCGTGCCGCCGACAGTGGGCGACCCGCCGAGCCAGGAGCCACCGGTGAAGGCTTAAGGGTAGACCACGGCACCGGCGTGAACAGCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATgc < 1:393000/301‑1 (MQ=255) cccGATCCCAATATCGACGACCCGAGCTTGCCGCCACCCGTACCGGAAGAAGACCCGGACGAGCTGCCGATCAAGCCGACCGTGCCGCCGACAGTGGGCGACCCGCCGAGCCAGGAGCCACCGGTGAAGGCTTAAGGGTAGACCACGGCACCGGCGTGAACAGCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATg < 1:255660/293‑1 (MQ=255) ccGATCCCAATATCGACGACCCGAGCTTGCCGCCACCCGTACCGGAAGAAGACCCGGACGAGCTGCCGATCAAGCCGACCGTGCCGCCGACAGTGGGCGACCCGCCGAGCCAGGAGCCACCGGTGAAGGCTTAAGGGTAGACCACGGCACCGGCGTGAACAGCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATgcggcg < 1:757337/297‑1 (MQ=255) cccAATATCGACGACCCGAGCTTGCCGCCACCCGTACCGGAAGAAGACCCGGACGAGCTGCCGATCAAGCCGACCGTGCCGCCGACAGTGGGCGACCCGCCGAGCCAGGAGCCACCGGTGAAGGCTTAAGGGTAGACCACGGCACCGGCGTGAACAGCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAAt > 1:259490/1‑286 (MQ=255) gacCCGAGCTTGCCGCCACCCGTACCGGAAGAAGACCCGGACGAGCTGCCGATCAAGCCGACCGTGCCGCCGACAGTGGGCGACCCGCCGAGCCAGGAGCCACCGGTGAAGGCTTAAGGGTAGACCACGGCACCGGCGTGAACAGCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAAt < 2:259484/274‑1 (MQ=255) cgccACCCGTACCGGAAGAAGACCCGGACGAGCTGCCGATCAAGCCGACCGTGCCGCCGACAGTGGGCGACCCGCCGAGCCAGGAGCCACCGGTGAAGGCTTAAGGGTAGACCACGGCACCGGCGTGAACAGCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATGCGGCGCTGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAaga < 2:671659/301‑1 (MQ=255) gAGCTGCCGATCAAGCCGACCGTGCCGCCGACAGTGGGCGACCCGCCGAGCCAGGAGCCACCGGTGAAGGCTTAAGGGTAGACCACGGCACCGGCGTGAACAGCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGA‑ccgt > 1:39717/1‑216 (MQ=255) gAGCTGCCGATCAAGCCGACCGTGCCGCCGACAGTGGGCGACCCGCCGAGCCAGGAGCCACCGGTGAAGGCTTAAGGGTAGACCACGGCACCGGCGTGAACAGCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGA‑ccgt < 2:39715/219‑4 (MQ=255) ggCGACCGGCCGAGCCAGGAGCCACCGGTGAAGGCTTAAGGGTAGACCACGGCACCGGCGTGAACAGCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATGCGGCGCTGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAg < 1:274859/272‑1 (MQ=255) ggCGACCCGCCGAGCCAGGGGCCACCGGTGAAGGCTTAAGGGTAGACCACGGCACCGCCGTGAGCAGCTGATCTGCGCTGCTCAATTGAAAGGTTGAGGATGACCTGGTGCTTGGCAATGTGAAGATCTGGCGTTGATCGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATGCGGCGCTGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCa < 2:77512/258‑1 (MQ=255) aCCCGCCGAGCCAGGAGCCACCGGTGAAGGCTTAAGGGTAGACCACGGCACCGGCGTGAACAGCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATGCGGCGCTGCCCCTGGt < 1:487882/209‑1 (MQ=255) gAAGGCTTAAGGGTAGACCACGGCACCGGCGTGAACAGCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATGCGGCGCTGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAAccc < 1:777204/233‑1 (MQ=255) aCAGCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATGCGGCGCTGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGATCTCACGCATGCGGAACTTCTGCACCTTGCCGGTCACGGTCCTCGGGTACTCGTCGACAAAACGtatat > 2:660039/1‑299 (MQ=255) gAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTGGCATTGATCGGGCCGGCCGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATGCGGCGCTGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGATCTCACGCATGCGGAACTTCTGCACCtt < 2:365815/234‑1 (MQ=255) aaGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATGCGGCGCTGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGATCTCACGCATGCGGAACTTCTGCACCTTGCCGGTCACGGTCATCGGGTACTCGTCGACAAAACGTATATACCGCGGCACCTTGa > 1:521460/1‑288 (MQ=255) gACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGGTCGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAGCCCCGGTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAGTGCGGCGCTGCCCCTGGTAGGGGCGGGTTTACCCGCAAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCa < 2:446638/170‑1 (MQ=255) cTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAATGCGCTCCTCCCCGGGACCGTTCCGGCCTTTGATGCCGCGCTGCCCCTGGTAGGAGCTGGATTCACCGCGCAGCGGCCGGCCGCCCCAGTCCATCAACCCGCAAATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGATCTCACGCATGCGGAACTTCTGCACCTTGCCGGTCACGGTCATc > 1:753459/1‑227 (MQ=255) cgcgggTAAACCCGCTCCTACCGGGGACCGTGCCGGCCTTGAATGCGGCGCTGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGATCTCACGCATGCGGAACTTCTGCACCTTGCCGGTCACGGTCATCGGGTACTCGTCGACAAAACGTATATACCGCGGCACCTTGAAGTGTGCGAt < 1:639643/231‑1 (MQ=255) cgcgggTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATGCGGCGCTGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGATCTCACGCATGCGGAACTTCTGCACCTTGCCGGTCACGGTCATCGGGTACTCGTCGACCAAACGTATATACCGCGGCACCTTGAAGTGTGCg > 2:639618/5‑233 (MQ=255) gcgggTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATGCGGCGCTGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGATCTCACGCATGCGGAACTTCTGCACCTTGCCGGTCACGGTCATCGGGTACTCGTCGACAAAACGTATATACCGCGGCACCTTGAAGTGTGCGATGCGTGCCTTGCACCAGCCCTGCAGCTCCTCGACCGTGGCGCTGTGCCCCGGGTGCAGCTTGATcc > 1:8934/4‑299 (MQ=255) cgggTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATGCGGCGCTGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGATCTCACGCATGCGGAACTTCTGCACCTTGCCGGTCACGGTCATCGGGTACTCGTCGACAAAACGTATATACCGCGGCACCTTGAAGTGTGCGATGCGTGCCTTGCACCAGCCCTGCAGCTCCTCGACCGTGGCGCtgtt > 2:512129/3‑277 (MQ=255) cgggTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATGCGGCGCTGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGATCTCACGCATGCGGAACTTCTGCACCTTGCCGGTCACGGTCATCGGGTACTCGTCGACAAAACGTATATACCGCGGCACCTTGAAGTGTGCGATGCGTGCCTTGCACCAGCCCTGCAGCTCCTCGACCGTGGCGCtgtg < 1:512150/276‑1 (MQ=255) cTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATGCGGCGCTGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGATCTCACGCATGCGGAACTTCTGCACCTTGCCGGTCACGGTCATCGGGTACTCGTCGACAAAACGTATATACCGCGGCACCTTGAAGTGTGCGATGCGTGCCTTGCACCAGCCCTGCAGCTCCTCGACCGTGGCGCTGTGCCCCGGGTGCAGCTTGATCCAGGCGACGATCTCtt > 2:65975/1‑301 (MQ=255) tACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATGCGGCGCTGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGATCTCACGCATGCGGAACTTCTGCACCTTGCCGGTCACGGTCATCGGGTACTCGTCGACAAAACGTATATACCGCGGCACCTTGAAGTGTGCGATGCGTGCCTTGCACCAGCCCTGCAGCTCCTCGACCGTGGCGCTGTGCCCCGGGTTCAGCTTGATCCAGGCGACGATCTCGTCGcc > 2:605929/1‑301 (MQ=255) aCCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATGCGGCGCTGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGATCTCACGCATGCGGAACTTCTGCACCTTGCCGGTCACGGTCATCGGGTACTCGTCGACAAAACGTATATACCGCGGCACCTTGAAGTGTGCGATGCGTGCCTTGCACCAGCCCTGCAGCTCCTCGACCGTGGCGCTGTGCCACGGGTGCAGCTTGATCCAGGCGACGATCTCTTc > 2:167878/1‑297 (MQ=255) | ACATTCCCATTCCACCGGAGACACCCGATCCCAATATCGACGACCCGAGCTTGCCGCCACCCGTACCGGAAGAAGACCCGGACGAGCTGCCGATCAAGCCGACCGTGCCGCCGACAGTGGGCGACCCGCCGAGCCAGGAGCCACCGGTGAAGGCTTAAGGGTAGACCACGGCACCGGCGTGAACAGCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTCTGC‑GGTAAACCCGCTCCTACCAGGGA‑CGTGCCGGCCTTGAATGCGGCGCTGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGATCTCACGCATGCGGAACTTCTGCACCTTGCCGGTCACGGTCATCGGGTACTCGTCGACAAAACGTATATACCGCGGCACCTTGAAGTGTGCGATGCGTGCCTTGCACCAGCCCTGCAGCTCCTCGACCGTGGCGCTGTGCCCCGGGTGCAGCTTGATCCAGGCGACGATCTCTTCGCC > AE015451/4585760‑4586347 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |