| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | AE015451 | = 215584 | 0 (0.000) | 48 (0.560) | 47/548 | 1.7 | 52.8% | coding (21090/26049 nt) | PP_0168 | putative surface adhesion protein |
| ? | AE015451 | 2177703 = | 86 (1.000) | intergenic (+104/‑62) | PP_5485/PP_1931 | putative N‑acetyltransferase, GNAT domain/conserved protein of unknown function | |||||
Only 100 of 141 total aligned reads displayed.
GCTGACCACAACAGCACCCGACTTCTTCGCGGCTCGGGGATATGAGCAGAGAGACCGATCCCAAGCCCCAAAGGCAATTTCCAGTTCGGAGGAGTTCAAAAGCCTCTGCCCGACGTCTGCGGTTTACATGGTGAAGGAGCTTGGCGACATAAACTCGGTGTCACCACAGGTAACTCGCCTCCACGGACGTCAGTGAGTTCGTTCTCAGGTGTCCCAGGAACGAGTCCTGCGCCCCCCGAAAGATGTCGAACTGAATCGACCTCGTTTTCGTAGACACCTCGAACGGCTGCAAAGGGTCCAGACTGTGTGAAAACGCCCGCGGTTGTCTAACCTTCTGGTCGTCGTGACCGTGGGGACAATCATGAAGCGATTCATCGAAGGTGAGGCTCGAACGCAGGTTACATTGCTGCCGGAGTGCCTGGACGACTACGTCACCGATGAAAACCCAGTGCGTGTGGTCGATGTCTTCGTCGATGAACTCGACCTGGGCGCGCTCGATTTCGCAGGTGTCGATCCGGCAGCAACAGGTCGCCCGGCCTACCATCCAGCGGTCTTGCTGAAGATCTACATCTACGGCTACCTAAACCGCATTCAGTCC > AE015451/2177404‑2178001 | gctgACCACAACAGCACCCGACTTCTTCGCGGCTCGGGGATATGAGCAGAGAGACCGATCCCAAGCCCCAAAGGCAATTTCCAGTTCGGAGGAGTTCAAAAGCCTCTGCCCGACGTCTGCGGTTTACATGGTGAAGGAGCTTGGCGACATAAACTCGGTGTCACCACAGGTAACTCGCCTCCACGGACGTCAGTGAGTTCGTTCTCAGGTGTCCCAGGAACGAGTCCTGCGCCCCCCGAAAGATGTCGAACTGAATCGACCTCGTTTTCGTAGACACCTCGAACGGCTGCAAAGGGTCCa < 2:446940/300‑1 (MQ=255) gACCACAACGGCACCCGACTTCTTCGCGGCTCGGGGATATGAGCAGAGAGACCGATCCCAAGCCCCCAAGGCAATTTCCAGTTCGGAGGAGTTCAAAAGCCTCTGCCCGACGTCTGCGGTTTACATGGTGAAGGAGCTTGGCGACATAAACTCGGTGTCACCACAGGTAACTCGCCTCCACGGACGTCAGTGAGTTCGTTCTCAGGTGTCCCAGGAACGAGTCCTGCGCCCCCCGAAAGATGTCGAACTGAATCGACCTCGTTTTCGTAGACACCTCGAACGGCTGCAAAGGGTCCAGAc < 1:838928/300‑1 (MQ=255) tcaccgtgcacgtcaaccagccgctggcccacgacctggtcgtgaccctgagcaacaacgcccaggtcaccatcaaggccggcgaaaccagcgcgccatacacccacgctgcgcaaggcgatgacgtctacaacgacgctggccagatcagcctgggcatcacgtccgctgtggatgtagacggtcgcaccttcgaaaacctgcaactgggcggtgcggctaccgttcaagtgaccgataccaccgacgaagtagtggccaagctgaccgcgaccccttcggtcaccAGACTGTGTGaa < 1:960442‑M2/12‑1 (MQ=255) cgcgGCTCGGGGATATGAGCAGAGAGACCGATCCCAAGCCCCAAAGGCAATTTCCAGTTCGGAGGAGTTCAAAAGCCTCTGCCCGACGTCTGCGGTTTACATGGTGAAGGAGCTTGGCGACATAAACTCGGTGTCACCACAGGTAACTCGCCTCCACGGACGTCAGTGAGTTCGTTCTCAGGTGTCCCAGGAACGAGTCCTGCGCCCCCCGAAAGATGTCGAACTGAATCGACCTCGTTTTCGTAGACACCTCGAACGGCTGCAAAGGGTCCAGACTGTGTGAAAACGCCCGCGGTTg > 2:631967/1‑298 (MQ=255) gggATATGAGCAGAGAGACCGATCCCAAGCCCCAAAGGCAATTTCCAGTTCGGAGGAGTTCAAAAGCCTCTGCCCGACGTCTGCGGTTTACATGGTGAAGGAGCTTGGCGACATAAACTCGGTGTCACCACAGGTAACTCGCCTCCACGGACGTCAGTGAGTTCGTTCTCAGGTGTCCCAGGAACGAGTCCTGCGCCCCCCGAAAGATGTCGAACTGAATCGACCTCGTTTTCGTAGACACCTCGAACGGCTGCAAAGGGTCCAGACTGTGTGAAAACGCCCGCGGTTGTCTAACCTTc > 1:574035/1‑299 (MQ=255) ggATATGAGCAGAGAGACCGATCCCAAGCCCCAAAGGCAATTTCCAGTTCGGAGGAGTTCAAAAGCCTCTGCCCGACGTCTGCGGTTTACATGGTGAAGGAGCTTGGCGACATAAACTCGGTGTCACCACAGGTAACTCGCCTCCACGGACGTCAGTGAGTTCGTTCTCAGGTGTCCCAGGAACGAGTCCTGCGCCCCACGAAAGATGTCGAACTGAATCGACCTCGTTTTCGTAGACACCTCGAACGGCTGCAAAGGGTCCAGACTGTGTGAAAACGCCCGGGGTTGTCTa > 1:456372/1‑292 (MQ=255) ctggtcgtgaccctgagcaacaacgcccaggtcaccatcaaggccggcgaaaccagcgcgccatacacccacgctgcgcaaggcgatgacgtctacaacgacgctggccagatcagcctgggcatcacgtccgctgtggatgtagacggtcgcaccttcgaaaacctgcaactgggcggtgcggctaccgttcaagtgaccgataccaccgacgaagtagtggccaagctgaccgcgaccccttcggtcaccAGACTGTGTGAACACGCCCGCGGTTGTCTAACCTTCTGgtc > 2:338067‑M2/253‑293 (MQ=255) 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gATCCCAAGCCCCAAAGGCAATTTCCAGTTCGGAGGAGTTCAAAAGCCTCTGCCCGACGTCTGCGGTTTACATGGTGAAGGAGCTTGGCGACATAAACTCGGTGTCACCACAGGTAACTCGCCTCCACGGACGTCAGTGAGTTCGTTCTCAGGTGTCCCAGGAACGAGTCCTGCGCCCCCCGAAAGATGTCGAACTGAATCGACCTCGTTTTCGTAGACACCTCGAACGGCTGCAAAGGGTCAAGACTGTGTGAAAACGCCCGCGGTTGTCTAACCTTCTGGTCGTCGTGACCGTgggg > 1:778560/1‑299 (MQ=255) gagcaacaacgcccaggtcaccatcaaggccggcgaaaccagcgcgccatacacccacgctgcgcaaggcgatgacgtctacaacgacgctggccagatcagcctgggcatcacgtccgctgtggatgtagacggtcgcaccttcgaaaacctgcaactgggcggtgcggctaccgttcaagtgaccgataccaccgacgaagtagtggccaagctgaccgcgaccccttcggtcaccAGACTGTGTGAAAACGCCCGCGGTTGTCTAACCTTCTGGTCGTCGTGACCGTGGGGACAATc < 2:884297‑M2/62‑1 (MQ=255) aaGCCCCAAAGGCAATTTCCAGTTCGTAGGAGTTCAAAAGCCTCTGCCCGACGTCTGCGGTTTACATGGTGAAGGAGCTTGGCGACATAAACTCGGTGTAACCACAGGTAACTCGCCTCCACGGACGTCAGTGAGTTCGTTCTCAGGTGTCCCAGGAACGAGTCCTGCGCCCCCCGAAAGATGTCGAACTGAATCGACCTCGTTTTCGTAGACACCTCGAACGGCTGCAAAGGGTCCAGACTGTGTGAAAACGCCCGCGGTTGTCTAACCTTCTGGTCGTCGTGACCGTGGGGACAATCa < 2:778534/300‑1 (MQ=255) 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agTTCAAAAGCCTCTGCCCGACGTCTGCGGTTTACATGGTGAAGGAGCTTGGCGACATAAACTCGGTGTCACCACAGGTAACTCGCCTCCACGGACGCCAGTGAGTTCGTTCTCAGGTGTCCCAGGAACGAGTCCTGCGCCCCCCGAAAGATGTCGAACTGAATCGACCTCGTTTTCGTAGACACCTCGAACGGCTGCAAAGGGTCCAGACTGTGTGAAAACGCCCGCGGTTGTCTAACCTTCTGGTCGTCGTGACCGTGGGGACAATCATGAAGCGATTCATCGAAGGTGAGGCtagac > 2:256353/1‑296 (MQ=255) accagcgcgccatacacccacgctgcgcaaggcgatgacgtctacaacgacgctggccagatcagcctgggcatcacgtccgctgtggatgtagacggtcgcaccttcgaaaacctgcaactgggcggtgcggctaccgttcaagtgaccgataccaccgacgaagtagtggccaagctgaccgcgaccccttcggtcaccAGACTGTGTGAAAACGCCCGCGGTTGTCTAACCTTCTGGTCGTCGTGACCGTGGGGACAATCATGAAGCGATTCATCGAAGGTGAGGCTCGAACg > 2:542917‑M2/202‑296 (MQ=255) gCCCGACGTCTGCGGTTTACAAGGTGAATGAGCTTGGCGACATAAACTCGGTGTCACCACAGGTAACTCGCCTCCACGGACGCCAGTGAGTTCGTTCTCAGGTGTCCCAGGAACGAGTCCTGCGCCCCCCGAAAGATGTCGAACTGAATCGACCTCGTTTTCGTAGACACCTCGAACGGCTGCAAAGGGTCCAGACTGTGTGAAAACGCCCGCGGTTGTCTAACCTTCTGGTCGTCGTGACCGTGGGGACAATCATGAAGCGATTCATCGAAGGTGAGGCTCGAAc < 1:256359/286‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |