| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | AE015451 | 6,013,885 | T→C | intergenic (+90/+20) | xpt → / ← PP_5266 | Xanthine phosphoribosyltransferase/putative acetyl‑CoA hydrolase family protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | AE015451 | 6,013,885 | 0 | T | C | 97.0% | 107.2 / ‑6.4 | 34 | intergenic (+90/+20) | xpt/PP_5266 | Xanthine phosphoribosyltransferase/putative acetyl‑CoA hydrolase family protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/1); new base C (14/18); total (14/20) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.98e-01 | |||||||||||
CGATGACTTCCTGGCCAACGGCAAAGCCTCCCAAGCGCTGATCTCGATCATCAAGCAGGCAGGTGCCACCGTGGCGGGCCTGGGTATCGTGATCGAGAAGTCGTTCCAGGGCGGCCGTG‑CCGAACTGGACAGCCAGGGTTACCGCGTTGAATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCTGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATCCGCCCCAGGTGGCTTTCATACCCCTCCGGCCCCGGTGCATCCAACGCTGCCTTGCCCAGCTCCAGCACCTCGCTCAGCTTGAACTTGCTCTTCAACCAGTTCAGCGCCCGCAACAGATCCCGCTCCTCGGCCGTAAAGTCCGTGCCCATCGGATACTCCGGGAACAGCCGCGCATGCTGTGCCCTGATCGCCT > AE015451/6013591‑6014179 | ggatcaCTTCCCGGCCAAAGGCAAAGCCTCCCAAGCGCTGATCTCGATCATCAAGCAGGCAGGTGCCACCGTGGCGGGCCTGGGTATCGTGATCGAGAAGTCGTTCCAGGGCGGCCGTG‑CCGAACTGGACAGCCAGGGTTACCGCGTTGAATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTATGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAt < 1:728334/296‑1 (MQ=255) ggCCAACGGCAAAGCCTCCCAAGCGCTGATCTCGATCATCAAGCAGGCAGGTGCCACCGTGGCGGGCCTGGGTATCGTGATCGAGAAGTCGTTCCAGGGCGGCCGTG‑CCGAACTGGACAGCCAGGGTTACCGCGTTGAATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGCGCAGCACAGGTCTCGACCGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGCATGGCCGCAACCCt > 1:692013/1‑301 (MQ=255) cccaGCGCTGATCTCGGTCATCAAGCAGCCAGGTGCCACCGTGGCGGGCCTGGGTATCGTGATCGAGAAGTCGTTCCAGGGCGGCCGTG‑CCGAACTGGACAGCCAGGGGTACCGCGTTGAATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCa < 2:655808/298‑1 (MQ=255) cgcTGATCTCGATCATCAAGCAGGCAGGTGCCACCGTGGCGGGCCTGGGTATCGTGATCGAGAAGTCGTTCCAGGGCGGCCGTG‑CCGAACTGGACAGCCAGGGTTACCGCGTTGAATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGCATGGCCGCAACCCTTTTACCTGGTTGCCGCCAGcccc > 2:25837/1‑301 (MQ=255) 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ggTTACCGCGTTGAATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTCCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATCCGCCCCAGGTGGCTTTCATACCCCTCCGTCCCCGGTGCATc > 1:460673/1‑301 (MQ=255) gTTACCGCGTTGAATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATCCGCCCCAGGTGGCTTTCATACCCCTCCGGCCCCGGTCCATcc > 1:663057/1‑301 (MQ=255) ggCCCGAGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGGGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATCCGCCCCAGGTGGCTTTCATACCCCTCCGGCCCCGGTGCATCCAACGCTGCCTTGCCCAGCt < 1:114642/301‑1 (MQ=255) 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gACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGATGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAGGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCACCTGCATCCGCCCCAGGTGCCTTTCATCCCCCTCCGGCCCCGGTGCATCCACCGCTCCCTTGCCCAGCCCCAGCCCCTCGCTCAGCTTGAACTTGCCCTTTAACCAGCTCACCGCCCCCAAc > 2:426428/1‑301 (MQ=255) gggCAAGCCAGCTCGCACCGGGGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCAGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATCCGCCCCAGGTGGCTTTCATACCCCTCCGGCCCCGGTGCATCCAACGCTGCCTTGCCCAGCTCCAGCACCTCGCTCAGCTTGAACTTGCTCTTCAACCAGTTCAGCGCCCGCAACAGATCCCGctcctc < 1:124429/301‑1 (MQ=255) cGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATCCGCCCCAGGTGGCTTTCATACCCCTCCGGCCCCGGTGCATCCAACGCTGCCTTGCCCAGCTCCAGCACCTCGCTCAGCTTGAACTTGCTCTTCAACCAGTTCAGCGCCCGCAACAGATCCCGCTCCTCGGCCg < 1:64678/301‑1 (MQ=255) 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CGATGACTTCCTGGCCAACGGCAAAGCCTCCCAAGCGCTGATCTCGATCATCAAGCAGGCAGGTGCCACCGTGGCGGGCCTGGGTATCGTGATCGAGAAGTCGTTCCAGGGCGGCCGTG‑CCGAACTGGACAGCCAGGGTTACCGCGTTGAATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCTGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATCCGCCCCAGGTGGCTTTCATACCCCTCCGGCCCCGGTGCATCCAACGCTGCCTTGCCCAGCTCCAGCACCTCGCTCAGCTTGAACTTGCTCTTCAACCAGTTCAGCGCCCGCAACAGATCCCGCTCCTCGGCCGTAAAGTCCGTGCCCATCGGATACTCCGGGAACAGCCGCGCATGCTGTGCCCTGATCGCCT > AE015451/6013591‑6014179 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 7 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |