Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
JC | AE015451 | 5,681,415 | +CGGG | intergenic (‑133/+71) | PP_4986 ← / ← PP_4987 | Channel protein, hemolysin III family/putative Chemotaxis protein |
New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | AE015451 | = 5681415 | 1 (0.020) | 53 (0.850) +CGGG |
43/592 | 0.3 | 98.2% | intergenic (‑133/+71) | PP_4986/PP_4987 | Channel protein, hemolysin III family/putative Chemotaxis protein |
? | AE015451 | 5681416 = | 1 (0.020) | intergenic (‑134/+70) | PP_4986/PP_4987 | Channel protein, hemolysin III family/putative Chemotaxis protein |
AACAGCAGCGTGCCGCCGTAGATGGAGAAGCTGACGATCTTCCACGGGTCGCCTTGCAGGCCCGCGGCCACGATCAGCCAGATGGCACCAATAGCAGCGAGGACGGCACCGACCAGGTGGGTCCAGGCGTTGAAGCGTTCACCGTAATACATGCAAACACAGACCTCC‑TGAGGTGGGC‑TGGGTTCCTGTTGTGATGCTGATGGCTTCGTTCTTTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGGCGCGAAGCGGCCCCAGGCTTTCATTGCCACTGCATGAACCGC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > AE015451/5681131‑5681415 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GCTGCTGCGCAGCCCTATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCACGCACCAGCCTTTCCAATGCGACCAGGTCCGGTACCCGCGCCACCTGCTCACCCACCTGCA‑CCGCTGCCAGCTCCA‑ACCTGCCCAGCGCCACATCCACGTAGTTCAGCTGGCTGTCGAGCTTGCACGAGCGCGGAATGTCCTGCAGCAACAGCGCCAGGTAGCGCAAACCGGTATCGCCCAACGCATTGAG > AE015451/5681416‑5681707 |||| AACAGCAGCGTGCCGCCGTAGATGGAGAAGCTGACGATCTTCCACGGGTCGCCTTGCAGGCCCGCGGCCACGATCAGCCAGATGGCACCAATAGCAGCGAGGACGGCACCGACCAGGTGGGTCCAGGCGTTGAAGCGTTCACCGTAATACATGCAAACACAGACCTCC‑TGAGGTGGGC‑TGGGTTCCTGTTGTGATGCTGATGGCTTCGTTCTTTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGGCGCGAAGCGGCCCCAGGCTTTCATTGACACTGGATGAAACGCCGGGGCTGCggagcgg > 1:142265/1‑294 CCGTAGATGGAGAAGCTGACGATCTTCCACGGGTCGCCTTGCAGGCCCGCGGCCACGATCAGCCAGATGGCACCAATAGCAGCGAGGACGGCACCGACCAGGTGGGTCCAGGCGTTGAAGCGTTCACCGTAATACATGCAAACACAGACCTCC‑TGAGGTGGGC‑TGGGTTCCTGTTGTGATGCTGATGGCTTCGTTCTTTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGGCGCGAAGCGGCCCCAGGCTTTCATTGCCACTGCATGAACCGCCGGGGCTGCTGCGCAGCCCTATCGCGCCACc > 1:370191/1‑300 CCGTAGATGGAGAAGCGGACGATCTTCCACGGGTCGCCTTGCAGGCCCGCGGCCACGATCAGCCAGATGGCACCAATAGCAGCGAGGACGGCACCGACCAGGTGGGTCCAGGCGTTGAAGCGTTCACCGTAATACATGCAAACACAGACCTCC‑TGAGGTGGGC‑TGGGTTCCTGTTGTGATGCTGATGGCTTCGTTCTTTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGGCGCGAAGCGGCCCCAGGCTTTCATTGCCACTGCATGAACCGCCGGGGCTGCTGCGCAGCCCTATCGCGACACA < 2:370043/301‑1 AGATGGAGAAGCTGACGATCTTCCACGGGTCGCCTTGCAGGCCCGCGGCCACGATCAGCCAGATGGCACCAATAGCAGCGAGGACGGCACCGACCAGGTGGGTCCAGGCGTTGAAGCGTTCACCGTAATACATGCAAACACAGACCTCC‑TGAGGTGGGC‑TGGGTTCCTGTTGTGATGCTGATGGCTTCGTTCTTTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGGCGCGAAGCGGCCCCAGGCTTTCATTGCCACTGCATGAACCGCCGGGGCTGCTGCGCCGCCCTATCCCGACACAAGGC > 1:328586/1‑301 gaagggtgaggTGACGATCGGCCAAGGGTCGGCTTGCGAGCCCGCGGCGAGGAGCAGCCAGATGGCACCAATAGCAGCGAGGACGGCACCGACCAGGTGGGTCCAGGCGTTGAAGCGTTGACCGTAATACATGCAAACACAGACCTCC‑TGAGGTGGGC‑TGGGTTCCTGTTGTGATGCTGATGGCTTCGTTCTGTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGGCGCGAAGCGGCCCCAGGCTTTCAGTGCCACTGCATGAACCGCCGGGGCTGCTGCGCAGCCCTATCGCGACACAAGGCC < 2:14583/290‑1 gTGGAGAAGCTGACGATCTTCCACGGGGCGCCTTGCAGGCCCGCGGCCAAGATCAGCCAGATGGCAGCAATAGCAGCGAGGACGGCACCGACCAGGTGGGTCCAGGCGTTGAAGCGTTCACCGTAATACATGCAAACACAGACCTCC‑TGAGGTGGGC‑TGGGTTCCTGTTGTGATGCTGATGGCTTCGTTCTTTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGGCGCGAAGCGGCCCCAGGCTTTCATTGCCACTGCATGAACCGCCGGGGCTGCTGCGCAGCCCTATCGCGACACAAGGCCG < 2:608537/300‑1 ATGGAGAAGCTGACGATCTGCCACGGGTCGCCTTGCAGGCCCGCGGCCACGATCAGCCAGATGGCACCAATAGCAGCGAGGACGGCACCGACCAGGTGAGTCCAGGCGTTGAAGCGTTCACCGTAATACATGCAAACACAGACCTCC‑TGAGGTGGGC‑TGGGTTCCTGTTGTGATGCTGATGGCTTCGTTCTTTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGGCGCGAAGCGGCCCCAGGCTTTCATTGCCACTGCATGAACCGCCGGGGCTGCTGCGCAGCCCTATCGCGACACAAGGCCG < 1:296439/301‑1 TTCCCCGGTTCGCCTTGCAGGCCCCCGGCCACGATCAGCCAGATGGCACCAATAGCAGCGAGGACGGCACCGACCAGGTGGGTCCAGGCGTTGAAGCGTTCACCGTAATACATGCAAACACAGACCTCC‑TGAGGTGGGC‑TGGGTTCCTGTTGTGATGCTGATGGCTTCGTTCTTTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGGCGCGAAGCGGCCCCAGGCTTTCATTGCCACTGCATGAACCGCCGGGGCTGCTGCGCAGCCCTATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACTCCAGACCACC < 1:218329/301‑1 tcacctgGCAGGCCCGCGGCCGCGGTCAGCCATGTGGCAGCACTCGCAGCGAGGACGGCACCGACCAGGTGGGTCCAGGCGTTGAAGCGTTCACCGTAATACATTCAAACACAGGCCTCC‑TGAGGTGGGC‑TGGGTTCCTGTTGTGATGCTGATGGCTTCTTTCTTTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGGCGCGAAGCGGCCCCAGGCTTTCATTGCCACTGCATGAACCGCCGGGGCTGCTGCGCAGCCCTATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACTCCAGACCACCAGGCCCTGC < 1:737157/294‑1 GCCTTGCAGGCCCGCGGCCACGATCAGCCAGATGGCACCAATAGCAGCGAGGACGGCACCGACCAGGTGGGTCCAGGCGTTGAAGCGTTCACCGTAATACATGCAAACACAGACCTCC‑TGAGGTGGGC‑TGGGTTCCTGTTGTGATGCTGATGGCTTCGTTCTTTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGACAGGTGCGCGAAGCGGCCCCAGGCTTTCCTGCCCACTGACTGCACCGGCGGGGCTGCTGCGCAGCCCTATCGCCACACAAGGCCGCTGCCAGTCCAGACCACCAGGCCCTGCcc > 1:702245/1‑299 CTTGCAGGCCCGCGGCCACGATCAGCCAGATGGCACCAATAGCAGCGAGGACGGCACCGACCAGGTGGGTCCAGGCGTTGAAGCGTTCACCGTAATACATGCAAACACAGACCTCC‑TGAGGTGGGC‑TGGGTTCCTGTTGTGATGCTGATGGCTTCGTTCTTTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGGCGCGCAGCGGCCCCAGGCTTTCATTGCCACTGCATGAACCGCCGGGGCTGCTGCGCAGCCCTATCGCGACACCAGTCAGCTCCCACTCCAGACAACCAGCCACTGCGCCc > 1:125701/1‑300 cCGGCCACGATCAGCCAGATGACACCAATCGCAGCGAGGACGGCACCGCCCAGGTGGGTCCAGGCGTTGAAGCGTTCACCGTAATACATGCAAACACAGACCTCC‑TGAGGTGGGC‑TGGGTTCCTGTTGTGATGCTGATGGCTTCGTTCTTTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGGCGCGAAGCGGCCCCAGGCTTTCATTGCCACTGCATGAACCGCCGGGGCTGCTGCGCAGCCCTATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAAC < 1:53196/300‑1 TCAGCCAGATGGCACCAATAGCAGCGAGGACGGCACCGACCAGGTGGGTCCAGGCGTTGAAGCGTTCACCGTAATACATGCAAACACAGACCTCC‑TGAGGTGGGC‑TGGGTTCCTGTTGTGATGCTGATGGCTTCGTTCTTTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGGCGCGAAGCGGCCCCAGGCTTTCATTGACACTGCATGAACCGCCGGGGCTGCTGCGCAGCCCTATCGCGACACCAGGCCGCCCCCACCCCAGACCCCCACGCCCcgccccccccctcccaacccaggcccgg > 2:378621/1‑273 ACCAATAGCAGCGAGGACGGCACCGACCAGGTGGGTCCAGGCGTTGAAGCGTTCACCGTAATACATGCAAACACAGACCTCC‑TGAGGTGGGC‑TGGGTTCCTGTTGTGATGCTGATGGCTTCGTTCTTTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGGCGCGAAGCGGCCCCAGGCTTTCCTTGCCCCTGCATGAACCTCCGGGTCTGCTGCGCCCCCCTCTCGCTACACAAGGCCGCTCCCACTCCAGACCACCAGTCCCTGCCCCTCACATCCGCACCAATGTCAGttcgcacattcccc > 1:522515/1‑287 atagacGCGAGGAAGGCAACGACCAGGTGGGTCCGGGCGTTGAAGCGTTCACCGTAATACATGCAAACACAGACCTCC‑TGAGGTGGGC‑TGGGTTCCTGTTGTGATGCTGATGGCTTCGTTCTTTGGGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGGCGCGAAGCGGCCCCAGGCTTTCATTGCCACTGCATGAACCGCCGGGGCTGCTGCGCAGCCCTATCGCTACACAAGGCCGCTCCCACTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCAC < 2:269467/295‑1 gagGGACGGCACCGACCAGGTGGGTCCAGGCGTTGAAGCGTTCACCGTAATACATGCAAACACAGACCTCC‑TGAGGTGGGC‑TGGGTTCCTGTTGTGATGCTGATGGCTTCGTTCTTTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGGCGCGAAGCGGCCCCAGGCTTTCATTGCCACTGCATGAACCGCCGGGGCTGCTGCGCAGCCCTATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCACGCACCAG < 2:328459/298‑1 GACGGCACCGACCAGGTGGGTCCAGGCGTTGAAGCGTTCACCGTCATACATGCAAACACAGACCTCC‑TGAGGTGGGC‑TGGGTTCCTGTTGTGATGCTGATGGCTTCGTTCTTTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGGCGCGAAGCGGCCCCAGGCTTTCATTGCCACTGCATGAACCGCCGGGGCTGCTGCGCAGCCCTATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCACGCACCAGCCTT < 1:378769/301‑1 ttgccctacccgccgctcttccgttctTTGAAGCGTTAACCGTAATACATGCAAACACAGACCTCCGTG‑GGTGGGC‑TGGGTTCCTTTTGTGATGCTGATGGCTTCGTTCTTTGTGGGAGCGGCCTTGTGTAGCGAAAGGGGCGCGAAGCGGCCCCAGGCTTTCATTGCCACTGCATGAACCGCCGGGGCTGCTGCGCAGCCCTATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCACGCACCAGCCTTT < 2:512796/274‑1 tacacgacgctcttccgatctCAGGCGTTGAAGCGTTCACCGTAATACATGCAAACACAGAGCTCC‑TGAGGTGGGC‑TGGGTTCCTGTTGTGATGCTGATGGCTTCGTTCTTTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGGCGCGAAGCGGCCCCAGGCTTTCATTGCCACTGCATGAACCGCCGGGGCTGCTGCGCAGCCCTATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCACGCACCAGCCTTT < 2:625448/280‑1 gcgtgACCGCCCAGGTGGGTCCAGGCTGTGACGCGTTCACCGTAATACATGCAAACAGAGACCTCC‑TGAGGTGGGC‑TGGGTTCCTGTTGTGTTGCTGATGGCTTCGTTCTTTGTGGGAGCGTCCTTGTGTCGCGAAAGGGGCGCGAAGCGGCCCCAGGCTTTCAGTGCCACTGCATGAACCGCCGGGGCTGCTGCGCAGCCCTATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGCTCCGCGTCACGCACCAGCCTTT < 2:202865/296‑1 CAGGCGTTGAAGCGTTCACCGTAATACATGCAAACACAGACCTCC‑TGAGGTGGGC‑TGGGTTCCTGTTGTGATGCTGATGGCTTCGTTCTTTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGGCGCGAAGCGGCCCCAGGCTTTCATTGCCACTGCATGAACCGCCGGGGCTGCTGCGCAGCCCTATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCACGCACCAGCCTTTagatcggaagagcaccagtct > 1:625715/1‑280 CAGGCGTTGAAGCGTTCACCGTAATACATGCAAACACAGACCTCC‑TGAGGTGGGC‑AGGGTTCCTGTTGTGATGCTGATGGCTTCGTTCTTTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGGCGCGAAGCGGCCCCAGGCTTTCATTGCCACTGCATGAACCGCCGGGGCTGCTGCGCAGCCCTATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCACGCACCAGCCTTTCCAATGCGACCAGGTCCGGTA > 1:593720/1‑301 ggggGTTGAACCGTTCACCGTAATACATGCCAGCACATGCCTCC‑TGAGGTGGTC‑TGGGTTCCTGTTGTGATGCTGATGGCTTCGTTCTTGGTGGGAGCTGCCTGATGTCGCGAAAGGGGCGCGAAGCGGCCCCAGGCTTTCATTGCCACTTCATGAACCGCCGGGGCTGCTGCGCAGCCCTATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACTCCAGACCACCAGTCCCCGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGTTTGCAGATCCGCGTCACGCACCAGCCTTTCCAATGCGACCAGGTCCGGTAC < 2:142196/297‑1 TTGAAGCGTTCACCGTAATACATGCAAACACAGACCTCC‑TGAGGTGGGC‑TGGGTTCCTGTTGTGATGCTGATGGCTTCGTTCTTTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGGCGCGAAGCGGCCCCAGGCTTTCATTGCCACTGCATGAACCGCCGGGGCTGCTGCGCAGCCCTATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCACGCACCAGCCTTTagatcggaagagcacacgtctgaactc > 1:513004/1‑274 TGAAGCGTTCACCGTAATACATGCAAACACAGACCTCC‑TGAGGTGGGC‑TGGGTTCCTGTTGTGATGCTGATGGCTTCGTTCTTTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGGCGCGCAGCGGCCCCAGGCTTTCATTGCCACTGCATGACCCGCCGGGGCTGCTCCGCAGCCCTCTCGCGCCACAACGCCGCCCCCACTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACCACCTAACCAAGGCCAGGTTGCAGTCCCGCTTCCCGCACCATCCTGTCCAAcgcacccgggtccgcgaccccagc > 2:41750/1‑277 GAAGCGTTCACCGTAATACATGCAAACACAGACCTCC‑TGAGGTGGGC‑TGGGTTCCTGTTGTGATGCTGATGGCTTCGTTCTTTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGGCGCGAAGCGGCCCCAGGCTTTCATTGCCACTGCATGAACCGCCGGGGCTGCTGCGCAGCCCTATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCACTCACCAGCCTTTCCAATTCGACACGGTCCGGTACCCGCGCC > 2:715693/1‑301 CGTTCACCGTAATACATGCAAACACAGACCTCC‑TGAGGTGGGC‑TGGGTTCCTGTTGTGATGCTGATGGCTTCGTTCTTTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGGCGCGAAGCGGCCCCAGGCTTTCATTGCCACTGCATGAACCGCCGGGGCTGCTGCGCAGCCCTATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCACGCACCAGCCTTTCCAATGCGACCAGGTCCGGTACCCGCGCCACCc > 1:146471/1‑300 GTTCACCGTAATACATGCAAACACAGACCTCC‑TGAGGTGGGC‑TGGGTTCCTGTTGTGATGCTGATGGCTTCGTTCTTTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGGCGCGAAGCGGCCCCAGGCTTTCATTGCCACTGCATGAACCGCCGGGGCTGCTGCGCAGCCCTATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCACGCACCAGCCTTTCCAAgataggaagagaacacgtatgaactcgaat > 1:271757/1‑271 CCGTAATACATGCAAACACAGACCTCC‑TGAGG‑GGGCATGGGTTCCTGTTGTGATGCTGATGGCTTCGTTCTTTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGGCGCGAAGCGGCCCCAGGCTTTCATTGCCACTGCACGAACCGCCGGGGCTGCTGCGCAGCCCTATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCACGCACCAGCCTTTCCAATGCGACCAGGTCCGGTACCCGCGCCACCTGCTCAC < 1:30509/301‑1 cgaAATACATGCAAACACAGACCTCC‑TGAGGTGGGC‑TGGGTTCCTGTTGTGATGCTGATGGCTTCGTTCTTTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGGCGCGAAGCGGCCCCAGGCTTTCATTGCCACTGCATGAACCGCCGGGGCTGCTGCGCAGCCCTATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCACGCACCAGCCTTTCCAATGCGACCAGGTCCGGTACCCGCGCCACCTGCTCACC < 1:323849/298‑1 ACATGCAAACACAGACCTCC‑TGAGGTGGGC‑TGGGTTCCTGTTGTGATGCTGATGGCTTCGTTCTTTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGGCGCGAAGCGGCCCCAGGCTTTCATTGCCACTGCATGAACCGCCGGGGCTGCTGCGCAGCCCTATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCACGCACCAGCCTTTCCACTGCGACCAGTTCCGGTACCCGCGCCACCTGCTCACCCACCTc > 1:405881/1‑300 GAGGTGGGC‑TGGGTTCCTGTTGTGATGCTGATGGCTTCGTTCTTTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGGCGCGAAGCGGCCCCAGGCTTTCATTGCCACTGCATGAACCGCCGGGGCTGCTGCGCAGCCCTATCGCGACACAAGGCCGCTCCCCCTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCACGCCCCAGCCTTTCCAATTCGACCAGGTCCGGTACCCGCGCCACCTTCTCACCCACCTGCccccccccccgccccaaccc > 1:287082/1‑281 TGGGC‑TGGGTTCCTGTTGTGATGCTGATGGCTTCGTTCTTTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGGCGCGAAGCGGCCCCAGGCTTTCATTGCCACTGCATGAACCGCCGGGGCTGCTGCGCAGCCCTATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCCCGCCCCAGCCTTTCCAATCCGACCAGGTCCGGTACCCGCGCCACCTGCTCACCCACCTGCA‑CCGCTGCCAGCTCCA‑ACCTGCCC > 1:210606/1‑301 TGGGC‑TGGGTTCCTGTTGTGATGCTGATGGCTTCGTTCTTTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGGCGCGAAGCGGCCCCAGGCTTTCATTGCCACTGCATGAACCGCCGGGGCTGCTGCGCAGCCCTATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCACGCACCAGCCTTTCCAATGCGACCAGGTCCGGTACCCGCGCCACCTGCTCACCCACCTGCA‑CCGCTGCCAGCTCCA‑ACCTGCCC > 1:511811/1‑301 GGGC‑TGGGTTCCTGTTGTGATGCTGATGGCTTCGTTCTTTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGGCGCGAAGCGGCCCCAGGCTTTCATTGCCACTGCATGAACCGCCGGGGCTGCTGCGCAGCCCTATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCCCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCACGCCACGCACCAGCCTTTCCAATCCGACCAGGTCCGGTACCCGCGCCACCTCCCCACCCACCTTCC‑CCGCTTCCCGCTCCA‑ACCTGCCCc > 1:729068/1‑300 TGGGTTCCTGTTGTGATGCTGATGGCTTCGTTCTTTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGGCGCGAAGCGGCCCCAGGCTTTCATTGCCACTGCATGAACCGCCGGGGCTGCTGCGCAGCCCTATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCACGCACCAGCCTTTCCAATGCGACCAGGTCCGGTACCCGCGCCACCTGCTCACCCACCT‑CACCCGCTGCCACCCCCA‑ACCTGCCCAGCGC > 1:372246/1‑301 GTTGTGATGCTGATGGCTTCGTTCTTTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGGCGCGAAGCGGCCCCAGGCTTTCATTGCCACTGCATGAACCGCCGGGGCTGCTGCGCAGCCCTATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCACGCACCCGCCTCTCCAATTCGACCAGGTCCGGTACCCGCGCCACCTGCCCACCCACCTCCC‑CCGCCGCCCGC‑CCACACCTGCCCCGCGCCACAgcccc > 2:205556/1‑296 GTTCTTTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGGCGCGAAGCGGCCCCAGGCTTTCATTGCCACTGCATGAACCGCCGGGGCTGCTGCGCAGCCCTATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCACGCACCAGCCTTTCCAATGCGACCAGGTCCGGTACCCGCGCCACCTGCTCACCCACCTGCA‑CCGCTGCCAGCTCCA‑ACCTGCCCAGCGCCACATCCCCGTAGTTCCGCTGGCTGTCGA > 1:418658/1‑301 CGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGGCGCGAAGCGGCCCCAGGCTTTCATTGCCACTGCATGAACCGCCGGGGCTGCTGCGCAGCCCTATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCACGCACCAGCCTTTCCAATGCGACCAGGTCCGGTACCCGCGCCACCTGCTCACCCACCTGCA‑CCTCTGCCAGCTCCA‑ACCTGCCCAGCGCCACATCCACGTAGTTCAGCTGGCTGTCGAGCTTGCACGAGCGC > 1:354574/1‑301 GCCTTGTGTCGCGAAAGGGGCGCGAAGCGGCCCCAGGCTTTCATTGCCACTGCATGAACCGCCGGGGCTGCTGCGCAGCCCTATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCACGCACCAGCCTTTCCAATGCGACCAGGTCCGGTACCCGCGCCACCTGCTCACCCACCTGCA‑CCGCTGCCAGCTCCA‑ACCTGCCCAGCGCCACATCCACGTAGTTCAGCTGGCTGTCGAGCTTGCACGAGCGCGG > 1:155783/1‑301 GCCTTGTGGCGCGAAAGGGGCGCGAAGCGGCCCCAGGCTTTCATTGCCACTGCATGAACCGCCGGGGCTGCTGCGCAGCCCTATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCACGCACCAGCCTTTCCAATGCGACCAGGTCCGGTACCCGCGCCACCTGCTCACCCACCTGCA‑CCGCTGCCAGCTCCA‑ACCTGCCCAGCGCCACATCCACGTAGTTCAGCTGGCTGTCGAGCTTGCACGAGCGCGG < 2:593470/301‑1 TGTGTCGCGAAAGGGGCGCGAAGCGGCCCCAGGCTTTCATTGCCACTGCATGAACCGCCGGGGCTGCTGCGCAGCCCTATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCACGCACCAGCCTTTCCAATGCGACCAGGTCCGGTACCCGCGCCACCTGCTCACCCACCTGCA‑CCGCTGCCAGCTCCA‑ACCTGCCCAGCGCCACATCCACGTAGTTCAGCTGGCTGCCGAGCTTGCACGAGCGCGGAATG > 2:486615/1‑301 ccggAAGGGGCGCGAAGCGGCCCCCGGCTTTCGTTGCCACTGCATGAACCGCCGGGGCTGCTCCGGAGCCCTATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCACGCACCAGCCTTTCCAATGCGACCAGGTCCGGTACCCGCGCCACCTGCTCACCCACCTGCA‑CCGCTGCCAGCTCCA‑ACCTGCCCAGCGCCACATCCACGTAGTTCAGCTGGCTGTCGAGCTTGCACGAGCGCGGAATGTCCTGC < 2:210522/297‑1 GAAAGGGGCGCGAAGCGGCCCCAGGCTTTCATTGCCACTGCATGAACCGCCGGGGCTGCTGCGCAGCCCTATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCACGCACCAGCCTTTCCAATGCGACCAGGTCCGGTACCCGCGCCACCTGCTCACCCACCTGCA‑CCGCTGCCAGCTCCA‑ACCTGCCCAGCGCCACATCCACGTAGTTCAGCTGGCTGTCGAGCTTGCACGAGCGCGGAATGTCCTGCAG > 2:228631/1‑301 AAGGGGCGCGAAGCGGCCCCAGGCTTTCATTGCCACTGCATGAACCGCCGGGGCTGCTGCGCAGCCCTATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCACGCACCAGCCTTTCCAATGCGACCAGGTCCGGTACCCGCGCCACCTGCTCACCCACCTGCA‑CCGCTGCCAGCTCCA‑ACCTGCCCAGCGCCACATCCACGTAGTTCAGCTGGCTGTCGAGCTTGCACGAGCGCGGAATGTCCTACAGCA > 1:426692/1‑301 gccttgcaggggCACTGCACGAACCGCCGGGGCTGCTGCGAAGCCCTATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCACGCACCAGCCTTTCCAATGCGACCAGGTCCGGTACCCGCGCCACCTGCTCACCCACCTGCA‑CCGCTGCCAGCTCCA‑ACCTGCCCAGCGCCACATCCACGTAGTTCAGCTGGCTGTCGAGCTTGCACGAGCGCGGAATGTCCTGCAGCAACAGCGCCAGGTAGCGCAAAC < 2:146402/289‑1 TTCATTGCCACTGCATGAACCGCCGGGGCTGCTGCGCAGCCCTATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCACGCACCAGCCTTTCCAATGCGACCAGGTCCGGTACCCGCGCCACCTGCTCACCCACCTGCA‑CCGCTGCCAGCTCCA‑ACCTGCCCAGCGCCACATCCACGTAGTTCAGCTGGCTGTCGAGCTTGCACGAGCGCGGAATGTCCTGCAGCAACAGCGCCAGGTAGCGCAAACCGGT < 1:228721/301‑1 tTTGCCACGGCATGTACCGCCGGGGCTTCTGCGCAGCCCTATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCACGCACCAGCCTTTCCAATGCGACCAGGTCCGGTACCCGCGCCACCTGCTCACCCACCTGCA‑CCGCTGCCAGCTCCA‑ACCTGCCCAGCGCCACATCCACGTAGTTCAGCTGGCTGTCGAGCTTGCACGAGCGCGGAATGTCCTGCAGCAACAGCGCCAGGTAGCGCAAACCGGTATC < 2:511603/300‑1 ctcGCCACTGCAGGAACGGCCGTGTGTGGTGCGCAGCCCACTCGCGACACAAGGACGCTCCCACTCCAGCCCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCACGCACCAGCCTTTCCAATGCGACCAGGTCCGGTACCCGCGCCACCTGCTCACCCACCTGCA‑CCGCTGCCAGCTCCA‑ACCTGCCCAGCGCCACATCCACGTAGTTCAGCTGGCTGTCGAGCTTGCACGAGCGCGGAATGTCCTGCAGCAACAGCGCCAGGTAGCGCAAACCGGTATC < 2:6468/298‑1 aatagCACTGCATGAACCGCCGGGGGTGATGCGCAGCCCTATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACTCCAGACCACCAGGCCATGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCACGCACCAGCCTTTCCAATGCGACCAGGTCCGGTACCCGCGCCACCTGCTCACCCACCTGCA‑CCGCTGCCAGCTCCA‑ACCTGCCCAGCGCCACATCCACGTAGTTCAGCTGGCTGTCGAGCTTGCACGAGCGCGGAATGTCCTGCAGCAACAGCGCCAGGTAGCGCAAACCGGTATC < 1:646236/296‑1 GCCACTGCATGAACCGCCGGGGCTGCTGCGCAGCCCTATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCACGCACCAGCCTTTCCAATGCGACCAGGTCCGGTACCCGCGCCACCTGCTCACCCACCTGCA‑CCGCTGCCAGCTCCA‑ACCTGCCCAGCGCCACATCCACGTAGTTCAGCTGGCTGTCGAGCTTGCACGAGCGCGGACTGTCCTGCAGCAACAGCGCCAGGTAGCGCAAACCGGTATCGCC > 2:628787/1‑301 TGAACCGCCCGGGCTGCTGCGCAGCCCTATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTCACCAAGGTTAGGTTGCAGATCCGCGTCACGCACCAGCCTTTCCAATGCGACCAGGTCCGGTACCCGCGCCACCTGCTCACCCACCTGCA‑CCGCTGCCAGCCCCA‑ACCTGCCCAGCGCCACATCCACGTAGTTCAGCTGGCTGTCGAGCTTGCACGAGCGCGTAATGATCTGCTGCAACAGCGCCAGTTAGTCCAACCCGGTACCGCCCAACGTATT > 2:45507/1‑301 ACCGCCGGGGCTGCTGCGCAGCCCTATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCACGCACCAGCCTTTCCAATGCGACCAGGTCCGGTACCCGCGCCACCTGCTCACCCACCTGCA‑CCGCTGCCAGCTCCA‑ACCTGCCCAGCGCCACATCCACGTAGTTCAGCTGGCTGTCGAGCTTGCACGAGCGCGGAATGTCCTGCAGCAACAGCGCCAGGTAGCGCAAACCGGTATCGCCCAACGCATTGAG > 1:253432/1‑301 |||| AACAGCAGCGTGCCGCCGTAGATGGAGAAGCTGACGATCTTCCACGGGTCGCCTTGCAGGCCCGCGGCCACGATCAGCCAGATGGCACCAATAGCAGCGAGGACGGCACCGACCAGGTGGGTCCAGGCGTTGAAGCGTTCACCGTAATACATGCAAACACAGACCTCC‑TGAGGTGGGC‑TGGGTTCCTGTTGTGATGCTGATGGCTTCGTTCTTTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGGCGCGAAGCGGCCCCAGGCTTTCATTGCCACTGCATGAACCGC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > AE015451/5681131‑5681415 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GCTGCTGCGCAGCCCTATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCACGCACCAGCCTTTCCAATGCGACCAGGTCCGGTACCCGCGCCACCTGCTCACCCACCTGCA‑CCGCTGCCAGCTCCA‑ACCTGCCCAGCGCCACATCCACGTAGTTCAGCTGGCTGTCGAGCTTGCACGAGCGCGGAATGTCCTGCAGCAACAGCGCCAGGTAGCGCAAACCGGTATCGCCCAACGCATTGAG > AE015451/5681416‑5681707 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 7 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |