| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | AE015451 | 1,164,572 | 830 bp→TCA | coding (4‑833/864 nt) | hexR ← | DNA‑binding transcriptional regulator |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | AE015451 | 1164572 | 1165401 | 830 | 88 [0] | [0] 87 | hexR | DNA‑binding transcriptional regulator |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | AE015451 | = 1164571 | 0 (0.000) | 87 (1.140) +TCA |
79/594 | 0.0 | 100% | coding (834/864 nt) | hexR | DNA‑binding transcriptional regulator |
| ? | AE015451 | 1165402 = | 0 (0.000) | coding (3/864 nt) | hexR | DNA‑binding transcriptional regulator | |||||
CGCTGAAGCTCAAGGGCGGCTGCCAGAAGGTCTACCCCGGTACGCCA‑CGGGTGCAATTGCAGGACCCGGCCTGGCAGCGCGAGCTGTGCATCGATACCGGTGACAGCGACGACACCGTGGTCTGGCACCCTGGCAATCGCCCGCTGATGGGGGTGACCGGCCGCGAGTCGCAGCGTTTTGTCTGCGTCGAGGCGACCAGTGGCAGTGGCGAAGGCC‑TGAGCCTGGCACCTGGGCAGCGTGCGCACCTGCGTTTGCAGGCGCACCGGCTCAGTTGAGGTCGTCGTCCTCGATCGGGTAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > AE015451/1164274‑1164571‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CACGCGGTCCA‑TGGGTGTGTCCTTGGGTCGGGAAGACAGCCGGCTGTGTGAGCAGCAGGCTTTTTGCACGGTCGTCTATCGTACTGTCGGTGCGGTTGACGTACCACTTGTCTGTAACACTTGTGTGTAATGTTGTGGTTTTTACTACATTATCCCTTGAAAACCGTGTGTGAAAGCGGTATTCCTAGACCAACTTTAGGAAAGAACCAACATCATGGCCGCAATCAGTGTCGAACCTTGCACCTTTGCCCTGTTTGGCGCCCTCGGCGACCTGGCATTGCGCAAGCTGTTTCC > AE015451/1165402‑1165695 ||| CGCTGAAGCTCAAGGGCGGCTGCCAGAAGGTCTACCCCGGTACGCCA‑CGGGTGCAATTGCAGGACCCGGCCTGGCAGCGCGAGCTGTGCATCGATACCGGTGACAGCGACGACACCGTGGTCTGGCACCCTGGCAATCGCCCGCTGATGGGGGTGACCGGCCGCGAGTCGCAGCGTTTTGTCTGCGTCGAGGCGACCAGTGGCAGTGGCGAAGGCC‑TGAGCCTGGCACCTGGGCAGCGTGCGCACCTGCGTTTGCAGGCGCACCGGCTCAGTTGAGGTCGTCGTCCTCGATCGGGTAATCA > 1:741593/1‑301 cgaAAGGGCGGCTGCCAGAAGGGCTACCCCGGTAGGCCA‑CGGGTGCAATTGCAGGACCCGGCCTGGCAGGGCGAGCTGTGCATCGATACCGGTGACAGCGACGACACCGTGGTCTGGCACCCTGGCAATCGCCCGCTGATGGGGGTGACCGGCCGCGAGTCGCAGCGTTTTGTCTGCGTCGAGGCGACCAGTGGCAGTGGCGAAGGCC‑TGAGCCTGGCACCTGGGCAGCGTGCGCACCTGCGTTTGCAGGCGCACCGGCTCAGTTGAGGTCGTCGTCCTCGATCGGGTAATCACACGCGGT < 2:676507/298‑1 ccagGGGCGGCTGCCAGAAGGCCGACCCCGGT‑CGGCACCGGGTGAAATTTCAGGACGCGGCCTGGCAGCGCGAGCTGTGCATCGATACCGGTGACAGCGACGACACCGTGGTCTGGCACCCTGGCAATCGCCCGCTGATGGGGGTGACCGGCCGCGAGTCGCAGCGTTTTGTCTGCGTCGAGGCGACCAGTGGCAGTGGCGAAGGCC‑TGAGCCTGGCACCTGGGCAGCGTGCGCACCTGCGTTTGCAGGCGCACCGGCTCAGTTGAGGTCGTCGTCCTCGATCGGGTAATCACACGCGGTC < 2:773606/297‑1 TCAAGGGCGGCTGCCAGAAGGTCTACCCCGGTACGCCA‑CGGGTGCAATTGCAGGACCCGGCCTGGCAGCGCGAGCTGTGCATCGATACCGGTGACAGCGACGACACCGTGGTCTGGCACCCTGGCAATCGCCCGCTGATGGGGGTGACCGGCCGCGAGTCGCAGCGTTTTGTCTGCGTCGAGGCGACCAGTGGCAGTGGCGAAGGCC‑TGAGCCTGGCACCTGGGCAGCGTGCGCACCTGCGTTTGCAGGCGCACCGGCGCAGTTGAGGTCGTCGTCCTCGATCGGGTAATCACACGCGGTC > 1:856217/1‑301 CAAGGGCGGCTGCCAGAAGGTCTACCCCGGTACGCCA‑CGGGTGCAATTGCAGGACCCGGCCTGGCAGCGCGAGCTGTGCATCGATACCGGTGACAGCGACGACACCGTGGTCTGGCACCCTGGCAATCGCCCGCTGATGGGGGTGACCGGCCGCGAGTCGCAGCGTTTTGTCTGCGTCGAGGCGACCAGTGGCAGTGGCGAAGGCC‑TGAGCCTGGCACCTGGGCAGCGTGCGCACCTGCGTTTGCAGGCGCACCGGCTCAGTTGAGGTCGTCGTCCTCGATCGGGTAATCACACGCGGTCC > 1:878826/1‑301 AGGGCGGCTGCCAGAAGGTCTACCCCGGTACGCCA‑CGGGTGCAATTGCAGGACCCGGCCTGGCAGCGCGAGCTGTGCATCGATACCGGTGACAGCGACGACACCGTGGTCTGGCACCCTGGCAATCGCCCGCTGATGGGGGTGACCGGCCGCGAGTCGCAGCGTTTTGTCTGCGTCGAGGCGACCAGTGGCAGTGGCGAAGGCC‑TGAGCCTGGCACCTGGGCAGCGTGCGCACCTGCGTTTGCAGGCGCACCGGCTCAGTTGAGGTCGTCGTCCTCTACAGGGTAATCACACGCGGTCCAc > 2:30125/1‑300 CGGCTGCCAGAAGGTCTACCCCGGTACGCCA‑CGGGTGCAATTGCAGGACCCGGCCTGGCAGCGCGAGCTGTGCATCGATACCGGTGACAGCGACGACACCGTGGTCTGGCACCCTGGCAATCGCCCGCTGATGGGGGTGACCGGCCGCGAGTCGCAGCGTTTTGTCTGCGTCGAGGCGACCAGTGGCAGTGGCGAAGGCC‑TGAGCCTGGCACCTGGGCAGCGTGCGCACCTGCGTTTGCAGGCGCACCGGCTCAGTTGAGGTCGTCGTCCTCGATCGGGTAATCACCCGCGGTCCA‑TGGGT > 2:58648/1‑301 tgGCCAGAAGGTCTACCCCGGTACGCCA‑CGGGTGCAATTGCAGGACCCGGCCTGGCAGCGCGAGCTGTGCATCGATACCGGTGACAGCGACGACACCGTGGTCTGGCACCCTGGCAATCGCCCGCTGATGGGGGTGACCGGCCGCGAGTCGCAGCGTTTTGTCTGCGTCGAGGCGACCAGTGGCAGTGGCGAAGGCC‑TGAGCCTGGCACCTGGGCAGCGTGCGCACCTGCGTTTGCAGGCGCACCGGCTCAGTTGAGGTCGTCGTCCTCGATCGGGTAATCACACGCGGTCCA‑TGGGTGTG < 1:716971/299‑1 CTGCCAGAAGGTCTACCCCGGTACGCCA‑CGGGTGCAATTGCAGGACCCGGCCTGGCAGCGCGAGCTGTGCATCGATACCGGTGACAGCGACGACACCGTGGTCTGGCACCCTGGCAATCGCCCGCTGATGGGGGTGACCGGCCGCGAGTCGCAGCGTCTTGTCTGCGTCGAGGCGACCAGTGGCAGTGGCGAAGGCC‑TGAGCCTGGCACCTGGGCAGCGTGCGCACCTGCGTTTGCAGGCGCACCGGCTCAGTTGAGGTCGTCGTCCTCGATCGCGTAATCACACGCGGTCCA‑TGGGTGTG > 2:643214/1‑301 CAGAAGGTCTACCCCGGTACGCCA‑CGGGTGCAATTGCAGGACCCGGCCTGGCAGCTCGAGCTGGGCATCGATACCGGTGACAGCGACGACACCGTGGTCTGGCACCCTGGCAATCGCCCGCTGATGGGGGTGACCGGCCGCGAGTCGCAGCGTTTTGTCTGCGTCGAGGCGACCAGTGGCAGTGGCGAAGGCC‑TGAGCCTGGCACCTGGGCAGCGTGCGCACCTGCGTTTGCAGGCGCACCGGCTCAGTTGAGGTCGTCGTCCTCGATCGGGTAATCACACGCGGTCCA‑TGGGTGTGTCCT < 2:393177/301‑1 AGAAGGTCTACCCCGGTACGCCA‑CGGGTGCAATTGCAGGACCCGGCCTGGCAGCGCGAGCTGTGCATCGATACCGGTGACAGCGACGACACCGTGGTCTGGCACCCTGGCAATCGCCCGCTGATGGGGGTGACCGGCCGCGAGTCGCAGCGTTTTGTCTGCGTCGAGGCGACCAGTGGCAGTGGCGAAGGCC‑TGAGCCTGGCACCTGGGCAGCGTGCGCACCTGCGTTTGCAGGCGCACCGGCTCAGTTGAGGTCGTCGTCCTCGATCGGGTAATCACACGCGGTCCA‑TGGGTGTGTCCTT > 1:89015/1‑301 CTACCCCGGTACGCCA‑CGGGTGCAATTGCAGGACCCGGCCTGGCAGCGCGAGCTGTGCATCGATACCGGTGACAGCGACGACACCGTGGTCTGGCACCCTGGCAATCGCCCGCTGATGGGGGTGACCGGCCGCGAGTCGCAGCGTTTTGTCTGCGTCGAGGCGACCAGTGGCAGTGGCGAAGGCC‑TGAGCCTGGCACCTGGGCAGCGTGCGCACCTGCGTTTGCAGGCGCACCGGCTCAGTTGAGGTCGTCGTCCTCGATCGGGTAATCACACGCGGTCCA‑TGGGTGTGTCCTTGGGTCGG > 1:744722/1‑301 CCCGGTACGCCA‑CGGGTGCAATTGCAGGACCCGGCCTGGCAGCGCGAGCTGTGCATCGATACCGGTGACAGCGACGACACCGTGGTCTGGCACCCTGGCAATCGCCCGCTGATGGGGGTGACCGGCCGCGAGTCGCAGCGTTTTGTCTGCGTCGAGGCGACCAGTGGCAGTGGCGAAGGCC‑TGAGCCTGGCACCTGGGCAGCGTGCGCACCTGCGTTTGCAGGCGCACCGGCTCAGTTGAGGTCGTCGTCCTCGATCGGGTAATCACACGCGGTCCA‑TGGGTGTGTCCTTGGGTCGGGAAG < 1:158534/301‑1 CGGTACGACA‑CGGGTGAAATGGCAGGACCCGGCCTGGCAGTGCGAGCTGTGCATCGATACCGGTGACAGCGACGACACCGTGGTCTGGCACCCTGGCAATCGCCCGCTGATGGGGGTGACCGGCCGCGAGTCGCAGCGTTTTGTCTGCGTCGAGGCGACCAGTGGCAGTGGCGAAGGCC‑TGAGCCTGGCACCTGGGCAGCGTGCGCACCTGCGTTTGCAGGCGCACCGGCTCAGTTGAGGTCGTCGTCCTCGATCGGGTAATCACACGCGGTCCA‑TGGGTGTGTCCTTGGGTCGGGAAGAC < 1:16688/301‑1 gggACGCCA‑CGGGCGCAATTGCAGGAGCCGGGCTGGCAGGGGGAGACGTGCATCGATACCGGTGACAGCGACGACACCGTGGTCTGGCACCCTGGCAATCGCCCGCTGAGGGGGGTGACCGGCCGCGAGTCGCAGCGTTTTGTCTGCGTCGAGGCGACCAGTGGCAGTGGCGAAGGCC‑TGAGCCTGGCACCTGGGCAGCGTGCGCACCTGCGTTTGCAGGCGCACCGGCTCAGTTGAGGTCGTCGTCCTCGATCGGGTAATCACACGCGGTCCA‑TGGGTGTGTCCTTGGGTCGGGAAGACA < 2:561759/298‑1 GTACGCCA‑CGGGTGCAATTGCAGGACCCGGCCTGGCAGCGCGAGCTGTGCATCGATACCGGTGACAGCGACGACACCGTGGTCTGGCACCCTGGCAATCGCCCGCTGATGGGGGTGACCGGCCGCGAGTCGCAGCGTTTTGTCTGCGTCGAGGCGACCAGTGGCAGTGGCGAAGGCC‑TGAGCCTGGCACCTGGGCAGCGTGCGCACCTGCGTTTGCAGGCGCACCGGCTCAGTTGAGGTCGTCGTCCTCGATCGGGTAATCACACGCGGTCCA‑TGGGTGTGTCCTTGGGTCGGGAAGACAG > 1:784534/1‑301 gttcgcaacgggggaAATTGCAGGACCCGGCCTGGCAGCGCGAGCTGTGCATCGATACCGGTGACAGCGACGACACCGTGGTCTGGCACCCTGGCAATCGCCCGCTGATGGGGGTGACCGGCCGCGAGTCGCAGCGTTTTGTCTGCGTCGAGGCGACCAGTGGCAGTGGCGAAGGCC‑TGAGCCTGGCACCTGGGCAGCGTGCGCACCTGCGTTTGCAGGCGCACCGGCTCAGTTGAGGTCGTCGTCCTCGATCGGGTAATCACACGCGGTCCA‑TGGGTGTGTCCTTGGGTCGGGAAGACAG < 2:258762/286‑1 ACGCCA‑CGGGTGCACGTGCAGGACCCGGCCGGGCAGCGCTAGCTGTGCATCGATACCGGTGCCAGCGACGACACCGTGGTCTGGCACCCTGGCAATCGCCCGCTGATGGGGGTGACCGGCCGCGAGTCGCAGCGTTTTGTCTGCGTCGAGGCGACCAGTGGCAGTGGCGAAGGCC‑TGAGCCTGGCACCTGGGCAGCGTGCGCACCTGCGTTTGCAGGCGCACCGGCTCAGTTGAGGTCGTCGTCCTCGATCGGGTAATCACACGCGGTCCA‑TGGGTGTGTCCTTGGGTCGGGAAGACAGCC < 1:323486/301‑1 TGCAGGACCCGGCCTGGCAGCGCGAGCTGTGCATCGATACCGGTGACAGCGACGACACCGTGGTCTGGCCCCCTGGCAATCGCCCGCTGATGGGGGTGACCGGCCGCGAGTCGCAGCGTTTTGTCTGCGTCGAGGCGACCAGTGGCAGTGGCGAAGGCC‑TGAGCCTGGCACCTGGGCAGCGTGCGCACCTGCGTTTGCAGGCGCACCGGCTCAGTTGAGGTCGTCGTCCTCGATCGGGTAATCACACGCGGTCCA‑TGGGTGTGTCCTTGGGTCGGGAAGACAGCCGGCTGTGTGAGCAGCA > 1:540750/1‑301 TGCAGGACCCGGCCTGGCAGCGCGAGCTGTGCATCGATACCGGTGACAGCGACGACACCGTGGTCTGGCACCCTGGCAATCGCCCGCTGATGGGGGTGACCGGCCGCGAGTCGCAGCGTTTTGTCTGCGTCGAGGCGACCAGTGGCAGTGGCGAAGGCC‑TGAGCCTGGCACCTGGGCAGCGTGCGCACCTGCGTTTGCAGGCGCACCGGCTCAGTTGAGGTCGTCGTCCTCGATCGGGTAATCACACGCGGTCCA‑TGGGTGTGTCCTTGGGTCGGGAAGACAGCCGGCTGTGTGAGCAGCA < 1:323164/301‑1 CAGGACCCGGCCTGGCAGCGCGAGCTGTGCATCGATACCGGTGACAGCGACGACACCGTGGTCTGGCACCCTGGCAATCGCCCGCTGATGGGGGTGACCGGCCGCGAGTCGCAGCGTTTTGTCTGCGTCGAGGCGACCAGTGGCAGTGGCGAAGGCC‑TGAGCCTGGCACCTGGGCAGCGTGCGCACCTGCGTTTGCAGGCGCACCGGCTGCGTTGAGCTCGTCGTCCTCGATCGGGTAATCAGACGCGGTCCAGTGGGT‑TGTCCTTGGGGCGGGAAGACACCCGGCTGTGTGAGCAGCAGG > 2:23643/1‑301 GACCGGGCCTGGCAGCGCGAGCTGTGCATCGATACCGGTGACAGCGACGACACCGTGGTCTGGCACCCTGGCAATCGCCCGCTGATGGGGGTGACCGGACGCGAGTCGCAGCGTTTTGTCTGCGTCGAGGCGACCAGTGGCAGTGGCGAAGGCC‑TGAGCCTGGCACCTGGGCAGCGTGCGAACCTGCGTTTGCAGGCGCACCGGCTCAGTTGAGGTCGTCGTCCTCGATCGGGTAATCACACGCGGTCCA‑TGGGTGTGTCCTTGGGTCGGGAAGACAGCCGGCTGTGTGAGCAGCAGGCTT < 1:775247/301‑1 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |