Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | AE015451 | 4,586,057 | +C | intergenic (+140/+75) | PP_4061 → / ← PP_4063 | conserved protein of unknown function/putative Long‑chain‑fatty‑acid‑CoA ligase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | AE015451 | 4,586,056 | 1 | . | C | 97.1% | 229.2 / ‑1.6 | 68 | intergenic (+139/+76) | PP_4061/PP_4063 | conserved protein of unknown function/putative Long‑chain‑fatty‑acid‑CoA ligase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (1/1); new base C (31/35); total (32/36) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.78e-01 |
ACATTCCCATTCCACCGGAGACACCCGATCCCAATATCGACGACCCGAGCTTGCCGCCACCCGTACCGGAAGAAGACCCGGACGAGCTGCCGATCAAGCCGACCGTGCCGCCGACAGTGGGCGACCCGCCGAGCCAGGAGCCACCGGTGAAGGCTTAAGGGTAGACCACGGCACCGGCGTGAACAGCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGC‑ATTGATCGGGCCGGCCTC‑TCTGC‑G‑G‑T‑AAACCCGCTCCTACCAGG‑G‑A‑CGTGCCGGCCTTGAATGCGGCGC‑TGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGATCTCACGCATGCGGAACTTCTGCACCTTGCCGGTCACGGTCATCGGGTACTCGTCGACAAAACGTATATACCGCGGCACCTTGAAGTGTGCGATGCGTGCCTTGCACCAGCCCTGCAGCTCCTCGACCGTGGCGCTGTGCCCCGGGTGCAGCTTGATCCAGGCGACGATCTCTTCGCCATAG > AE015451/4585760‑4586351 | aCATTCCCATTCCACCGGAGACACCCGATCCCAATATCGACGACCCGAGCTTGCCGCCACCCGTACCGGAAGAAGACCCGGACGAGCTGCCGATCAAGCCGACCGTGCCGCCGACAGTGGGCGACCCGCCGAGCCAGGAGCCACCGGTGAAGGCTTAAGGGTAGACCACGGCACCGGCGTGAACAGCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGC‑ATTGATCGGGCCGGCCTC‑TTCGCGG‑G‑T‑AAACCCGCTCCTACCAGG‑G‑A‑ccg < 1:680146/301‑3 (MQ=255) cttccgatctcACCGGAGACACCCGATCCCAATATCGACGACCCGAGCTTGCCGCCACCCGTACCGGAAGAAGACCCGGACGAGCTGCCGATCAAGCCGACCGTGCCGCCGACAGTGGGCGACCCGCCGAGCCAGGAGCCACCGGTGAAGGCTTAAGGGTAGACCACGGCACCGGCGTGAACAGCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGC‑ATTGATCGGGCCGGCCTC‑TTCGCGG‑G‑T‑AAACCCGCTCCTACCAGG‑G‑A‑ccgtg < 1:1789760/291‑5 (MQ=255) agacgtgtggtcttccgatctaaTATCGACGACCCGAGCTTGCCGCCACCCGTACCGGAAGAAGACCCGGACGAGCTGCCGATCAAGCCGACCGTGCCGCCGACAGTGGGCGACCCGCCGAGCCACGAGCCACCGGTGAAGGCTTAAGGGTAGACCACGGCACCGGCGTGAACAGCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGC‑ATTGATCGGGCCGGCCTC‑TTCGCGG‑G‑T‑AAACCCGCTCCTACCAGG‑G‑ACCGTGCCGGCCTTg < 1:2083936/280‑1 (MQ=255) cACCGGAGACACCCGATCCCAATATCGACGACCCGAGCTTGCCGCCACCCGTACCGGAAGAAGACCCGGACGAGCTGCCGATCAAGCCGACCGTGCCGCCGACAGTGGGCGACCCGCCGAGCCAGGAGCCACCGGTGAAGGCTTAAGGGTAGACCACGGCACCGGCGTGAACAGCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGC‑ATTGATCGGGCCGGCCCC‑TTCGCGG‑G‑T‑AAACCCGCTCCCACCAGG‑G‑A‑ccgtgcgatcggaag > 2:1789060/1‑287 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ccAATATCGACGACCCGAGCTTGCCGCCCCCCGGACCGGAAGAAGACCCGGACGAGCGGCCGATCAAGCCGACCGGGCCGCCGACAGTGGGCGACCCGCCGAGCCAGGAGCCACCGGTGAAGGCTTAAGGGTAGACCACGGCACCGGCGTGAACAGCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGC‑ATTGATCGGGCCGGCCTC‑TTCGCGG‑G‑T‑AAACCCGCTCCTACCAGG‑G‑ACCGTGCCGGCCTTGAATGCGGCGC‑TGCCCCTgg < 2:862240/301‑1 (MQ=255) aaTATCGACGACCCGAGCTTGCCGCCACCCGTACCGGAAGAAGACCCGGACGAGCTGCCGATCAAGCCGACCGTGCCGCCGACAGTGGGCGACGCGCCGAGCCAGGAGCCACCGGTGAAGGCTTAAGGGTAGACCACGGCACCGGCGTGAACAGCTGACCTGCGCTTCCCCAGTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGCAGATCTTGC‑CTTGATCGGGCCTGCCTC‑TTCGC‑G‑GCT‑AAACGCGCTCCTACCAGG‑G‑ACCGTGCCGGCCTTgcgatcggaagtgacacgtgtg > 2:2083096/1‑280 (MQ=255) ctagagaagcgccgtgcctGCCGCCACCCGGACCGGAAGAGGACCCGGAGGGGCTGCCGCTCAAGCCGACCGTGCCGCCGGCAGTGGGCGAGCCGCCGAGCCAGGAGCCACCGGTGAAGGCTTAAGGGTAGACCACGGCACCGGCGTGAACAGCTGATCTGCGCTGGTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGC‑ATTGATCGGGCCGGCCTC‑TTCGCGG‑G‑T‑AAACCCGCTCCTACCAGG‑G‑ACCGTGCCGGCCTTGAATGCGGCGC‑TGCCCCTGGTAg < 1:1101916/283‑1 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1:1301972/301‑1 (MQ=255) aacccgacgctctcccgacatccGTACCGGAAGAAGACCCGGACGAGCTGCCGATCAAGCCGACCGTGCCGCCGACAGTGGGCGACCCGCCGAGCCAGGAGCCACCGGTGAAGGCTTAAGGGTAGACCACGGCACCGGCGTGAACAGCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGC‑ATTGATCGGGCCGGCCTC‑TTCGCGG‑G‑T‑AAACCCGCTCCTACCAGG‑G‑ACCGTGCCGGCCTTGAATGCGGCGC‑TGCCCCTGGTAGGAGCgg < 2:1259432/280‑1 (MQ=255) gccccGAGCTTGCCGCCACCCGTACCGGAAGAAGACCCGGACGAGCTGCCGATGAAGACGACCGTGCCGCCGACAGTGGGCGACCCGCCGAGCCAGGAGCCACCGGTGAAGGCTTAAGGGTAGACCACGGCACCGGCGTGAACAGCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGC‑ATTGATCGGGCCGGCCTC‑TTCGCGG‑G‑T‑AAACCCGCTCCTACCAGG‑G‑ACCGTGCCGGCCTTGAATGCGGCGC‑TGCCCCTGGTAGGAGCGGGt < 1:65644/299‑1 (MQ=255) 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(MQ=255) cgAGCCAGGAGCCACCGGTGAAGGCTTAAGGGTAGACCACGGCACCGGCGTGAACAGCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGC‑ATTGATCGGGCCGGCCTC‑TTCGCGG‑G‑T‑AAACCCGCTCCTACCAGG‑G‑ACCGTGCCGGCCTTGAATGCGGCGC‑TGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGATCTCACACCTGCGGAACt > 1:161399/1‑301 (MQ=255) gggaggaaCCGGTAAAGGGTTAAGGGTAGACCACGGCACCGACGTGAACAGCTATTCTGCGCTGCTCCATTGAAGGGTTGAGGATGACCGGGTGCTAGGCAAGGTTAAGATCTTGC‑ATTGATCGGGCCGGCCTC‑TTCGCGG‑G‑T‑AAACCCGCTCCTACCAGG‑G‑ACCGTGCCGGCCTTGAATGCGGCCC‑TGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGATCTCACGCATGCGGAACTTCTGCa < 2:831532/294‑1 (MQ=255) ccGGTGAAGGCTTAAGGGTAGACCACGGCACCGGCGTGAACAGCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGAGCTTGC‑ATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGGG‑G‑G‑T‑AAACCCGCTCCTACCAGG‑G‑ACCGTGCCGGCCTTGAATGCGGCGC‑GGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGATCTCACGCATGCGGAACTTCTGCACCTTGCcg < 2:621137/301‑1 (MQ=255) tGAAGGCTTAAGGGTAGACCACGGCACCGGCGTGAACAGCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGC‑ATTGATCGGGCCGGCCTC‑TTCGCGG‑G‑T‑AAACCCGCTCCTACCAGG‑G‑ACCGTGCCGGCCTTGAATGCGGCGC‑TGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGATCTCACGCATGCGGAACTTCTGCACCTTGCccgtcc > 1:470616/1‑300 (MQ=255) aGACCACGGCACCGGCGTGAACAGCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGC‑ATTGATCGGGCCGGCCTC‑TTCGC‑G‑G‑G‑TAACCCGCTCCTACCAGG‑G‑ACCGTGCCGGCCTTGAATGCGGCGC‑TGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTATCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGATCTCACGCATGCGGAACTTCTGCTCCTTGCCGGTCACGGTCATCGGGTACtc > 1:606149/1‑301 (MQ=255) 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2:1007246/1‑285 (MQ=255) aaCAGCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGC‑ATTGATCGGGCCGGCCTC‑TTCGCGG‑G‑T‑AAACCCGCTCCTACCAGG‑G‑ACCGTGCCGGCCTTGAATGCGGCGC‑TGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGATCTCACGCATGCGGAACTTCTGCACCTTGCCGGTCCCGGGTATCGGGTACTCGTCGCCAAAACGtatata > 1:1124647/1‑301 (MQ=255) acacttGATCTGCGCTTCTCCATTGAAAGTTTGACCATGCCCGGGTGCTTGGCCCGGTGCAGATCTTGC‑ATTGATCGGGCCGTCCTC‑TTCGC‑GTG‑T‑AAACCCGCTCCTACCAGG‑G‑ACCGTGCCGGCCTTGTATGCGGCGC‑TGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGATCTCACGCATGCGGAACTTCTGCACCTTGCCGGTCACGGTCATCGGGTACTCGTCGACAAAACGTATATAc < 1:62173/296‑1 (MQ=255) 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(MQ=255) gtGAGGAGGACCGGTTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGC‑ATTGATCGGGCCGGCCTC‑TTCGCGG‑G‑T‑AAACCCGGTCCTACCAGG‑G‑ACCGTGCCGGCCTTGAATGCGGCGC‑TGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGATCTCACGCATGCGGAACTTCTGCACCTTGCCGGTCACGGTCATCGGGTACTCGTCGACAAAACGTATATACCGCGGCACCTTGAAGTGTGCGATGCGTGcc < 2:1761173/300‑1 (MQ=255) gACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGC‑ATTGATCGGGCCGGCCTC‑TTCGCGG‑G‑T‑AAACCCGCTCCTACCAGG‑G‑ACCGTGCCGGCCTTGAATGCGGCGC‑TGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCCCCGCCACACTGATCTCACGCATGCGGAACTTCTCCACCGTGCCGGCCACGGTCCTCGGGTCCTCTGCGACAAAACGTATATACCGCGGCCCCTCTCAGTGTGCGCTTCGTGCCTTGCAccc > 2:2088354/1‑300 (MQ=255) cTTGGCAAGGTGAAGATCTTGC‑ATTGATCGGGCCGGCCTC‑TTCGCGG‑G‑T‑AAACCCGCTCCTACCAGG‑G‑ACCGTGCCGGCCTTGAATGCGGCGC‑TGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGATCTCACGCATGCGGAACTTCTGCAACTTGCCGGTCACGGTCATCGTGTACTTGTCGACAAAACGTATCTACCGTCGCACCTTGAAGTGCGCCAAGCGTGCCTTGCACCAGCCCTGCac > 1:1838534/1‑300 (MQ=255) gCAAGGTGAAGTTC‑TGCAATTGTCCGGGCCGGCCTCTTCT‑C‑G‑G‑TCAAACCCGCTCCTACCAGGAG‑C‑CGTGCGGGCCTTGATTGCGGCGC‑TGCCCCTGGTAGGGGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGATCTCACGCATGCGGAACTTCTGCACCTTGCCGGTCACGGTCATCGGGTACTCGTCGACAAAACGTATATACCGCGGCACCTTGAAGTGTGCGATGCGTGCCTTGCACCAGCCCTGCAGctcc < 1:1544209/301‑1 (MQ=255) aGATCTTGC‑ATTGATCGGGCCGGCCTC‑TTCGCGG‑G‑T‑AAACCCGCTCCTACCAGG‑G‑ACCGTGCCGGCCTTGAATGCGGCGC‑TGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGATCTCACGCATGCGGAACTTCTGCACCTTGCCGGTCACGGTCATCGGGTACTCGTCGACAAAACGTATATACCGCGGCACCTTGAAGTGTGCGATGCGTGCCTTGCACCAGCCCTGCAGCTCCTCGAccctg > 1:2246145/1‑298 (MQ=255) gggCCGGCCTC‑TTCGCGG‑G‑T‑AAACCCGCTCCTGCCAGG‑G‑ACCGTGCCGGCCTGGAATGCGGCGC‑TGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGATCTCACGCATGCGGAACTTCTGCACCTTGCCGGTCACGGTCATCGGGTACTCGTCGACAAAACGTATATACCGCGGCACCTTGAAGTGTGCGATGCGTGCCTTGCACCAGCCCTGCAGCTCCTCGACCGTGGCGCTGTGCCCCGGGt < 2:470434/301‑1 (MQ=255) cccctttcgcgg‑g‑T‑AAACCCGCTCCTACCAGG‑G‑ACCGTGCCGGCCTTGAATGCGGCGC‑TGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGATCTCACGCATGCGGAACTTCTGCACCTTGCCGGTCACGGTCATCGGGTACTCGTCGACAAAACGTATATACCGCGGCACCTTGAAGTGTGCGATGCGTGCCTTGCACCAGCCCTGCAGCTCCTCGACCGTGGCGCTGTGCCCCGGGTGCAGCt < 1:1768401/290‑1 (MQ=255) cctcttcgcgg‑g‑T‑AAACCCGCTCCTACCAGG‑G‑ACCGTGCCGGCCTTGAATGCGGCGC‑TGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGATCTCACGCATGCGGAACTTCTGCACCTTGCCGGTCACGGTCATCGGGTACTCGTCGACCAAACGTATATACCGCGGCACCTTGAAGTGTGCGATGCGTGCCTTGCACCAGCCCTGCAGCTCCTCGACCGTGGCGCTGTGCCCCGGTGGCAGCtt > 2:2191077/11‑301 (MQ=255) tcttcgcgg‑g‑T‑AAACCCGCTCCTACCAGG‑G‑ACCGTGCCGGCCTTGAATGCGGCGC‑TGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGATCTCACGCATGCGGAACTTCTGCACCTTGCCGGTCACGGTCATCGGGTACTCGTCGACAAAACGTATATACCGCGGCACCTTGAAGTGTGCGATGCGTGCCTTGCACCAGCCCTGCAGCTCCTCGACCGTGGCGCTGTGCCCCGGGTGCAGCTTgg > 1:1133875/9‑300 (MQ=255) cttcgcgg‑g‑T‑AAACCCGCTCCTACCAGG‑G‑ACCGTGCCGGCCTTGAATGCGGCGC‑TGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGATCTCACGCATGCGGAACTTCTGCACCTTTCCGGTCACGGTCATCGGGTACTCGTCGACAAAACGTATATACCGCTGCACCTTGACGTGTGCGATGCGTCCCTTGCACCAGCCCTGCAGCTCCCCTACCGTGTCCCTTTGCCCCCGGTTCCGCTTGAt > 2:1815900/8‑301 (MQ=255) gg‑g‑T‑AAACCCGCTCCTACCAGG‑G‑ACCGTGCCGGCCTTGAATGCGGCGC‑TGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGATCTCACGCATGCGGAACTTCTGCACCTTGCCGGTCACGGTCATCGGGTAGTAGTCGACAAAACGTATATACCGCGGCACCTTGAAGTGTTCGATGCGTGACTTGCACCAGCCCCGCAGCTTCTCGACCGTCGCGCTATGCACCGGGGTCAGCTTGATCCAGGc > 1:1672806/2‑301 (MQ=255) g‑T‑AAACCCGCTCCTACCAGG‑G‑ACCGTGCCGGCCTTGAATGCGGCGC‑TGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGATCTCCCGCCTGCGGAACTTCTGCACCTTGCCGGTCACGGTCATCGGGTACTCGTCGACAAGACGTCTATACCGCTGCACCTTGAAGTGTGAGATGCGTGCCTTGCACCCTGCCTGCAGCTCCTCGACCGGGGCTCTGTTCCCCGGGCGCAGCTTGCTCCAGGcgc > 1:36603/1‑300 (MQ=255) aaaCCCGCTCCTACCAGG‑G‑ACCGTGCCTGCCTTGAATGCGGCCC‑GGCCCCTGGTATGAGCGGGTTTACCCCCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGATCTCACGCATGCGGAACTTCTGCACCTTGCCGGTCACGGTCATCGGGTACTCGTCGACAAAACGTATATACCGCGGCACCTTGAAGTGTGCGATGCGTGCCTTGCACCAGCCCTGCAGCTCCTCGACCGTGGCGCTGTGCCCCGGGTGCAGCTTGATCCAGGcgacg < 2:1124222/301‑1 (MQ=255) ccGCTCCTACCAGG‑G‑ACCGTGACGGCCCTGAATGCGGAGC‑TGCCCCTGGTAGGAACGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGATCTCACGCATGCGGAACTTCTGCACCTTGCCGGTCACGGTCATCGGGTACTCGTCGACAAAACGTATATACCGCGGCACCTTGAAGTGTGCGATGCGTGCCTTGCACCAGCCCTGCAGCTCCTCGACCGTGGCGCTGTGCCCCGGGTGCAGCTTGATCCAGGCGACGAtct < 1:2089194/301‑1 (MQ=255) ccTACCAGG‑G‑ACCGTGCCGGCCTTGAATGCGGCGC‑TGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGATCTCACGCATGCGGAACTTCTGCACCTTGCCGGTCACGGTCATCGGGTACTCGTCGACAAAACGTATATACCGCGGCACCTTGAAGTGTGCGATGCGTGCCTTGCACCAGCCCTGCAGCTCCTCGACCGTGGCGCTGTGCCCCGGGTGCAGCTTGATCCAGGCGACGATCTCTTcc > 1:1418038/1‑300 (MQ=255) tACCAGG‑G‑ACCGTGCCGGCCTTGAATGCGGCGC‑TGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGATCTCACGCATGCGGAACTTCTGCACCTTGCCGGTCACGGTCATCGGGTACTCGTCGACAAAACGTATATACCGCGGCACCTTGAAGTGTCCGATGCGTGCCTTGCACCAGCCCTGCAGCCCCTCGACCGTTGCGCTGTTCCCCGGGGTCAGCTTGGTCCCTGCCGCGATCTCTTcccc > 2:1737822/1‑298 (MQ=255) aGG‑G‑ACCGTGCCGGCCTTGAATGCGGCGC‑TGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGATCTCACGCATGCGGAACTTCTGCACCTTGCCGGTCACGGTCATCGGGTACTCGTCGACAAAACGTATATACCGCGGCACCTTGAAGTGTGCGATGCGTGCCTTGCACCAGCCCTGCAGCTCCTCGACCGTGGCGCTGTGCCCCGGGTGCAGCTTGATCCAGGCGACGATCTCTTCGCCATAg > 1:1145409/1‑301 (MQ=255) | ACATTCCCATTCCACCGGAGACACCCGATCCCAATATCGACGACCCGAGCTTGCCGCCACCCGTACCGGAAGAAGACCCGGACGAGCTGCCGATCAAGCCGACCGTGCCGCCGACAGTGGGCGACCCGCCGAGCCAGGAGCCACCGGTGAAGGCTTAAGGGTAGACCACGGCACCGGCGTGAACAGCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGC‑ATTGATCGGGCCGGCCTC‑TCTGC‑G‑G‑T‑AAACCCGCTCCTACCAGG‑G‑A‑CGTGCCGGCCTTGAATGCGGCGC‑TGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGATCTCACGCATGCGGAACTTCTGCACCTTGCCGGTCACGGTCATCGGGTACTCGTCGACAAAACGTATATACCGCGGCACCTTGAAGTGTGCGATGCGTGCCTTGCACCAGCCCTGCAGCTCCTCGACCGTGGCGCTGTGCCCCGGGTGCAGCTTGATCCAGGCGACGATCTCTTCGCCATAG > AE015451/4585760‑4586351 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 7 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |