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(MQ=255) aTGCGGAGGTATAGCCACCATCGCATTCGCGGG‑T‑A‑A‑ACCC‑GCTCCTAC‑ACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGGCGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACACCAGGTTGCGGTCGCCGAACACGTTGTCGACCCGGCCGACCGGCGGCCAGTACTTGCCTTCCACCAGGCTCGCCAGGGGGTATACCGCCTGCTCGCGGCTGTAGCCATGGGTCCATTCGCCAACCAGCTCAGCCGCAG‑GTGGC‑GGTGCGTTTTTTAGCggggtggcggtcttg > 1:122521/1‑289 (MQ=255) ggAGGTATAGCCACCATCGCATTCGCGGG‑T‑A‑A‑ACCC‑GCTCCTAC‑ACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGGCGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACACCAGGTTGCGGTCGCCGAACACGTTGTCGACCCGGCCGACCGGCGGCCAGTACTTGCCTTCCACCAGGCTCGCCAGGGGGTATACCGCCTGCTCGCGGCTGTAGCCATGGGTCCATTCGCCAACCAGCTCAGCCGCAGTGT‑GC‑GGTGCGTTTTTCAGCGGGTTGTCGTCCTTGTccc > 1:759844/1‑300 (MQ=255) ggAGGTATAGCCACCATCGCATTCGCGGG‑T‑A‑A‑ACCC‑GCTCCTAC‑ACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGGCGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACACCAGGTTGCGGTCGCCGAACACGTTGTCGACCCGGCCGACCGGCGGCCAGTACTTGCCTTCCACCAAGCCCGCCAGGGGGGATACCGCCTGCCCGCGGCTGTAGCCATGGGTCCATTCGCCAACCAGCCCAGCCGCAGTGG‑GCGGGTG‑GTGTTTTAGCGGGTTGTCGTCCtttttcc > 2:1728518/1‑296 (MQ=255) aGCCACCATCGCATTCGCGGG‑T‑A‑AGC‑CC‑GCTCCTAC‑ACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGGCGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACACCAGGTTGCGGTCGCCGAACACGTTGTCGACCCGGCCGACCGGCGGCCAGTACTTGCCTTCCACCAGGCTCGCCAGGGGGTATACCGCCTGCTCGCGGCTGTAGCCATGGGTCCATTCGCCAACCAGCTCAGCCGCAGTGT‑GC‑GGTGCGTTTTTCAGCGGGTTGTCGTCCTTGTCCAGGCTACCg < 1:988214/301‑1 (MQ=255) aGCCACCATCGCATTCGCGGG‑T‑A‑A‑ACCC‑GCTCCTAC‑ACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGGCGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACACCAGGTTGCGGTCGCCGAACACGTTGTCGACCCGGCCGACCGGCGGCCAGTACTTGCCTTCCACCAGGCTCGCCAGGGGGTATACCGCCTGCTCGCGGCTGTAGCCATGGGTCCATTCGCCAACCAGCTCAGCCGCAGGGT‑GC‑GGTGCGTTTTTCAGCGGGTTTTCCTCCTTGTCCAGGCTAccc > 2:1530657/1‑300 (MQ=255) aGCCACCATCGCATTCGCGGG‑T‑A‑A‑ACCC‑GCTCCTAC‑ACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGGCGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACACCAGGTTGCGGTCGCCGAACACGTTGTCGACCCGGCCGACCGGCGGCCAGTACTTGCCTTCCACCAGGCTCGCCAGGGGGTATACCGCCTGCTCGCGGCTGTAGCCATGGGTCCATTCGCCAACCAGCCCAGCCGCCGTGT‑GC‑GGTGCGTTTTTCAGCGGGTTGTCGTCCtagatcggaggggcg > 2:525935/1‑287 (MQ=255) gCCACCATCGCATTCGCGGG‑T‑A‑A‑ACCC‑GCTCCTAC‑ACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGGCGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACACCAGGTTGCGGTCGCCGAACACGTTGTCGACCCGGCCGACCGGCGGCCAGTACTTGCCCTCCACCAGGCTCGCCAGGGGGTATACCGCCTGCCCGCGGCTGTAGGCATGCGTCCATTCGCCAACCACCTCCGCCGCAGTGT‑GC‑CGTGCGGTTTTCATCGGGTTTTCGTCCTTCTTCTGGCTACCgc > 2:716870/1‑300 (MQ=255) caccaTCGAATTCGCGGG‑T‑A‑A‑ACCC‑GCTCCTAC‑ACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGGCGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACACCAGGTTGCGGTCGCCGAACACGTTGTCGACCCGGCCGACCGGCGGCCAGTACTTGCCTTCCACCAGGCTCGCCAGGGGGTATACCGCCTGCTCGCGGCTGTAGCCATGGGTCCATTCGCCAACCAGCTCAGCCGCAGTGT‑GC‑GGTGCGTTTTTCAGCGGGTTGTCGTCCTTGTCCAGGCTACCGtcc < 2:1497344/301‑1 (MQ=255) cccgatcccgcgGG‑T‑A‑A‑ACCC‑GCTCCTAC‑ACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGGCGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACACCAGGTTGCGGTCGCCGAACACGTTGTCGACCCGGCCGACCGGCGGCCAGTACTTGCCTTCCACCAGGCTCGCCAGGGGGTATACCGCCTGCTCGCGGCTGTAGCCATGGGTCCATTCGCCAACCAGCTCAGCCGCAGTGT‑GC‑GGTGCGTTTTTCAGCGGGTTGTCGTCCTTGTCCAGGCTACCGTCCTCCa < 1:1548722/293‑1 (MQ=255) atggCATTCGCGGG‑T‑A‑A‑ACCC‑GTGACGAC‑ACAGAGCCAGCCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGGCGTCCTGAGAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACACCAGGTTGCGGTCGCCGAACACGTTGTCGACCCGGCCGACCGGCGGCCAGTACTTGCCTTCCACCAGGCTCGCCAGGGGGTATACCGCCTGATCGCGGCTGTAGCCATGGGTCCATTCGCCAACCAGCTCAGCCGCAGTGT‑GC‑GGTGCGTTTTTCAGCGGGTTGTCGTCCTTGTCCAGGCTACCGTCCTCCa < 2:258908/298‑1 (MQ=255) acgccATTCGCGGG‑T‑A‑A‑ACCC‑GCTCCTAC‑ACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGGCGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACACCAGGTTGCGGTCGCCGAACACGTTGTCGACCCGGCCGACCGGCGGCCAGTACTTGCCTTCCACCAGGCTCGCCAGGGGGTATACCGCCTGCTCGCGGCTGTAGCCATGGGTCCATTCGCCAACCAGCTCAGCCGCAGTGT‑GC‑GGTGCGTTTTTCAGCGGGTTGTCGTCCTTGTCCAGGCTACCGTCCTCCa < 2:683778/297‑1 (MQ=255) aTCGCATTCGCGGG‑T‑A‑A‑A‑CCAGCTCCTAC‑ACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGGCGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACACCAGGTTGCGGTCGCCGAACACGTTGTCGACCCGGCCGACCGGCGGCCAGTACTTGCCTTCCACCAGGCTCGCCAGGGGGTATACCGCCTGCTCGCGGCTGTAGCCATGGGTCCATTCGCCAACCAGCTCAGCCGGAGGGT‑GC‑GGTGCGTTTTTCAGCGGGTTGTCGTCCTTGTACAGGCTACCGtcctcaa > 1:474903/1‑299 (MQ=255) gg‑T‑A‑A‑ACCC‑GCTCCTAC‑ACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGGCGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACACCAGGTTGCGGTCGCCGAACACGTTGTCGACCCGGCCGACCGGCGGCCAGTACTTGCCTTCCACCAGGCTCGCCAGGGGGTATACCGCCTGCTCGCGGCTGTAGCCATGGGTCCATTCGCCAACCAGCTCAGCCGCAGTGT‑GC‑GGTGCGTTTTTCAGCGGGTTGTCGTCCTTGTCCAGGCTACCGTCCTCCACCGCGCGGAttt > 1:649939/1‑301 (MQ=255) | CTTTGTCACTGCCGTGGCCTTTGCCTGTGGCGCCCAGTGAGCCATACAGCTCGGCTTTGACGCTGGCGGTGCGGGCCAGCAGGCCGTCACGGCGCAGCCCTTCGGCAAACCGCGCAGCGGCGCGCATCGGGCCGACCGTGTGGGAGCTGGAGGGGCCGATGCCGATCTTGAACAGGTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATCGCATTCGCGGG‑T‑A‑A‑A‑CC‑GCTCCTAC‑ACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGGCGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACACCAGGTTGCGGTCGCCGAACACGTTGTCGACCCGGCCGACCGGCGGCCAGTACTTGCCTTCCACCAGGCTCGCCAGGGGGTATACCGCCTGCTCGCGGCTGTAGCCATGGGTCCATTCGCCAACCAGCTCAGCCGCAGTGT‑GC‑GGTGCGTTTTTCAGCGGGTTGTCGTCCTTGTCCAGGCTACCGTCCTCCACCGCGCGGATTT > AE015451/1126351‑1126939 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |