| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | AE015451 | 610901 = | NA (NA) | 203 (1.170) | 162/564 | 0.0 | 100% | intergenic (‑56/‑203) | PP_0525/PP_0526 | TonB‑dependent receptor, B12 family/transposase |
| ? | AE015451 | = 812297 | 0 (0.000) | intergenic (‑46/‑182) | PP_0698/PP_0699 | Transcriptional regulator, LysR family/Transporter, LysE family | |||||
Only 100 of 214 total aligned reads displayed.
TGGCGAAGGATTTGGTATTCGGAGCGGCTTGAATCACCAGTTCATCTTTGGAGGTGTCCACGCCAGCTTCGATTGGGATTGCGGACATTGCCATGAATAGCTGCTCCTTGTAGCGTAGTGTGACTTGAAGGGCACACCCTGGCGCAGGCTTGCTTCTATTGTCGCTTGCTCGCGAGGCATTCCTTATCGGCGCTTGGGTGTTGAAAGGAGGAGGGGTGATTTCTCCTACGGTCTGTACTGCGCGAACAGTCAGAAGCGAGTTATGGCCCTCCTCCTCCCTTCAAGTCCTACCATACAagcgggtttacccgcgaa‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < AE015451/611197‑610901‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑AGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGCTGAACAGGGATATCATGAAACTGCCGCCACTCAACGCCTTCCGCTACTTCGACATTGCCGCCCAGACCGAGAGCTTCGTGCGCGCCGCCGAGCACTTGCACGTCACTCACGGCGCGGTCAGCCGCCAAATACGCCTGCTGGAAGAAAGCCTTGGCGTGGAACTGTTCGAACGCCGCAACCGGGCCATTTTCCTCACCCCCGCCGGTCGTGCCCTGCAAGGCACCACCCAGGCGATCTTCGAACAGCTCGAAGGCGCCGTGCAGCGCCTGCAGCAACAAGCTCGCG < AE015451/812297‑811981 TGGCGAAGGATTTGGTATTCGGAGCGGCTTGAATCACCAGTTCATCTTTGGAGGTGTCCACGCCAGCTTCGATTGGGATTGCGGACATTGCCATGAATAGCTGCTCCTTGTAGCGTAGTGTGACTTGAAGGGCACACCCTGGCGCAGGCTTGCTTCTATTGTCGCTTGCTCGCGAGGCATTCCTTATCGGCGCTTGGGTGTTGAAAGGAGGAGGGGTGATTTCTCCTACGGTCTGTACTGCGCGAACAGTCAGAAGCGAGTTATGGCCCTCCTCCTCCCTTCAAGTCCTACCATACACGCG > 2:106017/1‑301 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CTCCTCCTCCCTTCAAGTCCTACCATACAAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGCTGAACAGGGATATCATGAAACTGCCGCCACTCAACGCCTTCCGCTACTTCGACATTGCCGCCCAGACCGAGAGCTTCGTGCGCGCCGCCGAGCACTTGCACGTCACTCACGGCGCGGTCAGCCGCCAAATACGCCTGCTGGAAGAAAGCCTTGGCGTGGAACTGTTCGAACGCCGCAACCGGGCCATTTTCCTCACCCCCGCCGGTCGTGCCCTGCAAGGCACCACCCAGGCGATCTTCG < 1:2162791/301‑1 ccctacacgacgctcttccgatctGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGCTGAACAGGGATATCATGAAACTGCCGCCACTCAACGCCTTCCGCTACTTCGACATTGCCGCCCAGACCGAGAGCTTCGTGCGCGCCGCCGAGCACTTGCACGTCACTCACGGCGCGGTCAGCCGCCAAATACGCCTGCTGGAAGAAAGCCTTGGCGTGGAACTGTTCGAACGCCGCAACCGGGCCATTTTCCTCACCCCCGCCGGTCGTGCCCTGCAAGGCACCACCCAGGCGATCTTCGAACAGCTC < 2:504335/277‑1 CCCTTCAAGTCCTACCATACAAGCGGGTTTACCCGCGAAGACGCCGGCACAGCTGAACAGGGATATCATGAAACTGCCGCCACTCAACGCCTTCCGCTACTTCGACATTGCCGCCCAGACCGAGAGCTTCGTGCGCGCCGCCGAGCACTTGCACGTCACTCACGGCGCGGTCAGCCGCCAAATACGCCTGCTGGAAGAAAGCCTTGGCGTGGAACTGTTCGAACGCCGCAACCGGGCCATTTTCCTCACCCCCGCCGGTCGTGCCCTGCAAGGCACCACCCAGGCGATCTTCGAACAGCTC < 1:1324861/301‑1 CTACCATACAAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGCTGAACAGGGATATCATGAAACTGCCGCCACTCAACGCCTTCCGCTACTTCGACATTGCCGCCCAGACCGAGAGCTTCGTGCGCGCCGCCGAGCACTTGCACGTCACTCACGGCGCGGTCAGCCGCCAAATACGCCTGCTGGAAGAAAGCCTTGGCGTGGAACTGTTCGAACGCCGCAACCGGGCCATTTTCCTCACCCCCGCCGGTCGTGCCCTGCAAGGCACCACCCAGGCGATCTTCGAACAGCTCGAAGGCGCCGT < 1:900856/301‑1 agaagtggggttgatccggGAAGACGCCGGCACCGCGGAAAAGGGATATCATCAACCTGCCGCCACTCGACGCCTCCCGCTACTTCGACCTTGCCGCCCAGACCGAGAGCTTCGTGCGCGCCGCCGAGCACTTGCACGTCACTCACGGCGCGGTCAGCCGCCAAATACGCCTGCTGGAAGAAAGCCTTGGCGTGGAACTGTTCGAACGCCGCAACCGGGCCATTTTCCTCACCCCCGCCGGTCGTGCCCTGCAAGGCACCACCCAGGCGATCTTCGAACAGCTCGAAGGCGCCGTGCAGCG < 2:1984052/282‑1 CAAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGCTGAACAGGGATATCATGAAACTGCCGCCACTCAACGCCTTCCGCTACTTCGACATTGCCGCCCAGACCGAGAGCTTCGTGCGCGCCGCCGAGCACTTGCACGTCACTCACGGCGCGGTCAGCCGCCAAATACGCCTGCTGGAAGAAAGCCTTGGCGTGGAACTGTTCGAACGCCGCAACCGGGCCATTTTCCTCACCCCCGCCGGTCGTGCCCTGCAAGGCACCACCCAGGCGATCTTCGAACAGCTCGAAGGCGCCGTGCAGCGCC < 1:2187119/301‑1 AAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGCTGAACAGGGATATCATGAAACTGCCGCCACTCAACGCCTTCCGCTACTTCGACATTGCCGCCCAGACCGAGAGCTTCGTGCGCGCCGCCGAGCACTTGCACGTCACTCACGGCGCGGTCAGCCGCCAAATACGCCTGCTGGAAGAAAGCCTTGGCGTGGAACTGTTCGAACGCCGCAACCGGGCCATTTTCCTCACCCCCGCCGGTCGTGCCCTGCAAGGCACCACCCAGGCGATCTTCGAACAGCTCGAAGGCGCCGTGCAGCGCCc > 1:2209570/1‑300 GGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGCTGAACAGGGATATCATGAAACTGCCGCCACTCAACGCCTTCCGCTACTTCGACATTGCCGCCCAGACCGAGAGCTTCGTGCGCGCCGCCGAGCACTTGCACGTCACTCACGGCGCGGTCAGCCGCCAAATACGCCTGCTGGAAGAAAGCCTTGGCGTGGAACTGTTCGAACGCCGCAACCGGGCCATTTTCCTCACCCCCGCCGGTCGTGCCCTGCAAGGCACCACCCAGGCGATCTTCAAACAGCCCCAAGGCGCCGTGCAGCCCCTGCAGC > 2:1787187/1‑301 TACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGCTGAACAGGGATATCATGAAACTGCCGCCACTCAACGCCTTCCGCTACTTCGACATTGCCGCCCAGACCGAGAGCTTCGTGCGCGCCGCCGAGCACTTGCACGTCACTCACGGCGCGGTCAGCCGCCAAATACGCCTGCTGGAAGAAAGCCTTGGCGTGGAACTGTTCGAACGCCGCAACCGGGCCATTTTCCTCACCCCCGCCGGTCGTGCCCTGCAAGGCACCACCCAGGCGATCTTCGAACAGCTCGAAGGCGCCGTGCAGCGCCTGCAGCAACA > 1:647930/1‑301 CGAAGAGGCCGGCACAGCTGAACAGGGATATCATGAAACTGCCGCCACTCAACGCCTTCCGCTACTTCGACATTGCCGCCCAGACCGAGAGCTTCGTGCGCGCCGCCGAGCACTTGCACGTCACTCACGGCGCGGTCAGCCGCCAAATACGCCTGCTGGAAGAAAGCCTTGGCGTGGAACTGTTCGAACGCCGCAACCGGGCCATTTTCCTCACCCCCGCCGGTCGTGCCCTGCAAGGCACCACCCAGGCGATCTTCGAACAGCTCGAAGGCGCCGTGCAGCGCCTGCAGCAACAAGCTCG > 1:1035177/1‑301 GAAGAGGCCGGCACAGCTGAACAGGGATATCATGAAACTGCCGCCACTCAACGCCTTCCGCTACTTCGACATTGCCGCCCAGACCGAGAGCTTCGTGCGCGCCGCCGAGCACTTGCACGTCACTCACGGCGCGGTCAGCCGCCAAATACGCCTGCTGGAAGAAAGCCTTGGCGTGGAACTGTTCGAACGCCGCAACCGGGCCATTTTCCTCACCCCCGCCGGTCGTGCCCTGCAAGGCACCACCCAGGCGATCTTCGAACAGCTCGAAGGCGCCGTGCAGCGCCTGCAGCAACAAGCTCGC > 1:223778/1‑301 AAGAGGCCGGCACAGCTGAACAGGGATATCATGAAACTGCCGCCACTCAACGCCTTCCGCTACTTCGACATTGCCGCCCAGACCGAGAGCTTCGTGCGTGCCGCCGAGCACTTGCACGTCACTCACGGCGCGGTCAGCCGCCAAATACGCCTGCTGGAAGAAAGCCTTGGCGTGGAACTGTTCGAACGCCGCAACCGGGCCATTTTCCTCACCCCCGCCGGTCGTGCCCTGCAAGGCACCACCCAGGCGATCTTCGAACAGCTCGAAGGCGCCGTGCAGCGCCTGCAGCAACAAGCTCGCG > 1:1609654/1‑301 TGGCGAAGGATTTGGTATTCGGAGCGGCTTGAATCACCAGTTCATCTTTGGAGGTGTCCACGCCAGCTTCGATTGGGATTGCGGACATTGCCATGAATAGCTGCTCCTTGTAGCGTAGTGTGACTTGAAGGGCACACCCTGGCGCAGGCTTGCTTCTATTGTCGCTTGCTCGCGAGGCATTCCTTATCGGCGCTTGGGTGTTGAAAGGAGGAGGGGTGATTTCTCCTACGGTCTGTACTGCGCGAACAGTCAGAAGCGAGTTATGGCCCTCCTCCTCCCTTCAAGTCCTACCATACAagcgggtttacccgcgaa‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < AE015451/611197‑610901‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑AGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGCTGAACAGGGATATCATGAAACTGCCGCCACTCAACGCCTTCCGCTACTTCGACATTGCCGCCCAGACCGAGAGCTTCGTGCGCGCCGCCGAGCACTTGCACGTCACTCACGGCGCGGTCAGCCGCCAAATACGCCTGCTGGAAGAAAGCCTTGGCGTGGAACTGTTCGAACGCCGCAACCGGGCCATTTTCCTCACCCCCGCCGGTCGTGCCCTGCAAGGCACCACCCAGGCGATCTTCGAACAGCTCGAAGGCGCCGTGCAGCGCCTGCAGCAACAAGCTCGCG < AE015451/812297‑811981 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |