Predicted mutation | ||||||
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Missing coverage evidence... | ||||||||||
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* | * | ÷ | AE015451 | 1164572 | 1165401 | 830 | 214 [0] | [0] 213 | hexR | DNA‑binding transcriptional regulator |
New junction evidence | |||||||||||
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* | ? | AE015451 | = 1164571 | 0 (0.000) | 212 (1.160) +TCA |
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? | AE015451 | 1165402 = | 0 (0.000) | coding (3/864 nt) | hexR | DNA‑binding transcriptional regulator |
Only 100 of 215 total aligned reads displayed.
GCGCTGAAGCTCAAGGGCGGCTGCCAGAAGGTCTACCCCGGTACGCCACGGGTGCAATTGCAGGACCCGGCCTGGCAGCGCGAGCTGTGCATCGATACCGGTGACAGCGACGACACCGTGGTCTGGCACCCTGGCAATCGCCCGCTGATGGGGGTGACCGGCCGCGAGTCGCAGCGTTTTGTCTGCGTCGAGGCGACCAGTGGCAGTGGCGAAGGCCTGAGCCTGGCACCTGGGCAGCGTGCGCACCTGCGTTTGCAGGCGCACCGGCTCAGTTGAGGTCGTCGTCCTCGATCGGGTAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > AE015451/1164273‑1164571 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CAGTTGAGGTCGTCGTCCTCGATCGGGTAATCACACGCGGTCCATGGGTGTGTCCTTGGGTCGGGAAGACAGCCGGCTGTGTGAGCAGCAGGCTTTTTGCACGGTCGTCTATCGTACTGTCGGTGCGGTTGACGTACCACTTGTCTGTAACACTTGTGCGTAATGTTGTGGTTTTTACTACATTATCCCTTGAAAACCGTGTGTGAAAGCGGTATTCCTAGACCAACTTTAGGAAAGAACCAACATCATGCCCGAAATCAGTGTCTAACCTTGCACCTTTGCCCTGTTTGGCGCCCCCGGC > 2:1861089/1‑301 TGAGGTCGTCGTCCTCGATCGGGTAATCACACGCGGTCCATGGGTGTGTCCTTGGGTCGGGAAGACAGCCGGCTGTGTGAGCAGCAGGCTTTTTGCACGGTCGTCTATCGTACTGTCGGTGCGGTTGACGTACCACTTGTCTGTAACACTTGTGTGTAATGTTGTGGTTTTTACTACATTATCCCTTGAAAACCGTGTGTGAAAGCGGTATTCCTAGACCAACTTTAGGAAAGAACCAACATCATGGCCGCAATCAGTGTCGAACCTTGCACCTTTGCCCTGTTTGGCGCCCTCGGCGACC > 1:1255734/1‑301 TGAGGTCGTCGTCCTCGATCGGGTAATCACACGCGGTCCATGGGTGTGTCCTTGGGTCGGGAAGACAGCCGGCTGTGTGAGCAGCAGGCTTTTTGCACGGTCGTCTATCGTACTGTCGGTGCGGTTGACGTACCACTTGTCTGTAACACTTGTGTGTAATGTTGTGGTTTTTACTACATTATCCCTTGAAAACCGTGTGTGAAAGCGGTATTCCTAGACCAACTTTAGGAAAGAACCAACATCATGGCCGCAATCAGTGTCGAACCTTGCACCTTTGCCCTGTTTGGCGCCCTCGGCGACC > 2:545486/1‑301 TGAGGTCGTCGTCCTCGATCGGGTAATCACACGCGGTCCATGGGTGTGTCCTTGGGTCGGGAAGACAGCCGGCTGTGTGAGCAGCAGGCTTTTTGCACGGTCGTCTATCGTACTGTCGGTGCGGTTGACGTACCACTTGTCTGTAACACTCGTGTGTAATGTTGTTGTTTTTACTACATTATCCCTTGAAAACCGTGTGTGAAAGCGGTATTCCTAGACCAACTTTAGGAAAGAACCAACATCATGGCCGCAATCAGTGTCGAACCTTGCAACTTTGCCCTGTTTGGCGCCCTTGGCGAga > 1:1415767/1‑299 ggtTCGTCGTCCTCGATCGGGTAATCACACGCGGTCCATGGGTGTGTCCTTGGGTCGGGAAGACAGCCGGCTGTGTGAGCAGCAGGCTTTTTGCACGGTCGTCTATCGTACTGTCGGTGCGGTTGACGTACCACTTGTCTGTAACACTTGTGTGTAATGTTGTGGTTTTTACTACATTATCCCTTGAAAACCGTGTGTGAAAGCGGTATTCCTAGACCAACTTTAGGAAAGAACCAACATCATGGCCGCAATCAGTGTCGAACCTTGCACCTTTGCCCTGTTTGGCGCCCTCGGCGACCTG < 1:2351698/298‑1 gGGTCGTCGTCCTCGATCGGGTAATCACACGCGGTCCATGGGTGTGTCCTTGGGTCGGGAAGACAGCCGGCTGTGTGAGCAGCAGGCTTTTTGCACGGTCGTCTATCGTACTGTCGGTGCGGTTGACGTACCACTTGTCTGTAACACTTGTGTGTAATGTTGTGGTTTTTACTACATTATCCCTTGAAAACCGTGTGTGAAAGCGGTATTCCTAGACCAACTTTAGGAAAGAACCAACATCATGGCCGCAATCAGTGTCGAACCTTGCACCTTTGCCCTGTTTGGCGCCCTCGGCGACCTG < 2:209734/300‑1 CGTCGTCCTCGCTCGGGTAATCACACGCGGTCCATGGGTGTGTCCTTGTGTCGGGAAGCCAGCCGGCTGTGTGAGCAGCAGGCTTTTTGCACGGTCGTCTATCGTACTGTCGGTGCGGTTGACGTACCACTTGTCTGTAACACTTGTGTGTAATGTTGTGGTTTTTACTACATTATCCCTTGAAAACCGTGTGTGAAAGCGGTATTCCTAGACCAACTTTAGGAAAGAACCAACATCATGGCCGCAATCAGTGTCGAACCTTGCACCTTTGCCCTGTTTGGCGCCCTCGGCGACCTGGCAT < 2:1835930/301‑1 GTCGTCCTCGATCGGGTAATCACACGCGGTCCATGGGTGTGTCCTTGGGTCGGGAAGACAGCCGGCTGTGTGAGCAGCAGGCTTTTTGCACGGTCGTCTATCGTACTGTCGGTGCGGTTGACGTACCACTTGTCTGTAACACTTGTGTGTAATGTTGTGGTTTTTACTACATTATCCCTTGAAAACCGTGTGTGAAAGCGGTATTCCTAGACCAACTTTAGGAAAGAACCAACATCATGGCCGCAATCAGTGTCGAACCTTGCACCTTTGCCCTGTTTGGCGCCCTCGGCGACCTGGCATT > 1:1459567/1‑301 CGTCCTCGATCGGGTAATCACACGCGGTCCATGGGTGTGTCCTTGGGTCGGGAAGACAGCCGGCTGTGTGAGCAGCAGGCTTTTTGCACGGTCGTCTATCGTACTGTCGGTGCGGTTGACGTACCACTTGTCTGTAACACTTGTGTGTAATGTTGTGGTTTTTACTACATTATCCCTTGAAAACCGTGTGTGAAAGCGGTATTCCTAGACCAACTTTAGGAAAGAACCAACATCATGGCCGCAATCAGTGTCGAACCTTGCACCTTTGCCCTGTTTGGCGCCCTCGGCGACCTGGCATTGC < 1:1861847/301‑1 ATCGGGTAATCACACGCGGTCCATTGGTGTGTCCTTGGGTCGGGAAGACAGCCGGCTGTGTGAGCAGCAGGCTTTTTGCACGGTCGTCTATCGTACTGTCGGTGCGGTTGACGTACCACTTGTCTGTAACACTTGTGTGTAATGTTGTGGTTTTTACTACATTATCCCTTGAAAACCGTGTGTGAAAGCGGTATTCCTAGACCAACTTTAGGAAAGAACCAACATCATGGCCGCAATCAGTGTCGAACCTTGCACCTTTGCCCTGTTTGGCGCCCTCGGCGACCTGGCATTGCGCAAGCTG < 1:2034420/301‑1 ATCGGGTAATCACACGCGGTCCATGGGTGTGTCCTTGGGTCGGGAAGACAGCCGGCTGTGTGAGCAGCAGGCTTTTTGCACGGTCGTCTATCGTACTGTCGGTGCGGTTGACGTACCACTTGTCTGTAACACTTGTGTGTAATGTTGTGGTTTTTACTACATTATCCCTTGAAAACCGTGTGTGAAAGCGGTATTCCTAGACCAACTTTAGGAAAGAACCAACATCATGGCCGCAATCAGTGTCGAACCTTGCACCTTTGCCCTGTTTGGCGCCCTCGGCGACCTGGCATTGCGCAAGtgg > 2:1788298/1‑298 GTAATCACACGCGGTCCATGGGTGTGTCCTTGGGTCGGGAAGACAGCCGGCTGTGTGAGCAGCAGGCTTTTTGCACGGTCGTCTATCGTACTGTCGGTGCGGTTGACGTACCACTTGTCTGTAACACTTGTGTGTAATGTTGTGGTTTTTACTACATTATCCCTTGAAAACCGTGTGTGAAAGCGGTATTCCTAGACCAACTTTAGGAAAGAACCAACATCATGGCCGCAATCAGTGTCGAACCTTGCACCTTTGCCCTGTTTGGCGCCCTCGGCGACCTGGCATTGCTCAAGCTGTTTCC > 1:628602/1‑301 ||| GCGCTGAAGCTCAAGGGCGGCTGCCAGAAGGTCTACCCCGGTACGCCACGGGTGCAATTGCAGGACCCGGCCTGGCAGCGCGAGCTGTGCATCGATACCGGTGACAGCGACGACACCGTGGTCTGGCACCCTGGCAATCGCCCGCTGATGGGGGTGACCGGCCGCGAGTCGCAGCGTTTTGTCTGCGTCGAGGCGACCAGTGGCAGTGGCGAAGGCCTGAGCCTGGCACCTGGGCAGCGTGCGCACCTGCGTTTGCAGGCGCACCGGCTCAGTTGAGGTCGTCGTCCTCGATCGGGTAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > AE015451/1164273‑1164571 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CACGCGGTCCATGGGTGTGTCCTTGGGTCGGGAAGACAGCCGGCTGTGTGAGCAGCAGGCTTTTTGCACGGTCGTCTATCGTACTGTCGGTGCGGTTGACGTACCACTTGTCTGTAACACTTGTGTGTAATGTTGTGGTTTTTACTACATTATCCCTTGAAAACCGTGTGTGAAAGCGGTATTCCTAGACCAACTTTAGGAAAGAACCAACATCATGGCCGCAATCAGTGTCGAACCTTGCACCTTTGCCCTGTTTGGCGCCCTCGGCGACCTGGCATTGCGCAAGCTGTTTCCTGCG > AE015451/1165402‑1165699 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |