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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | AE015451 | 2,935,792 | 0 | G | A | 98.6% | 488.1 / NA | 142 | intergenic (+87/‑175) | PP_2568/PP_2569 | Ring‑cleaving dioxygenase/Metabolite MFS transporter, MHS family |
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Only 100 of 142 total aligned reads displayed.
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gtcCAGGCCGCCCTCT‑CGTGCAGGACCCGGCGGGTGGATATCCAGCCAATCCCGATTATGCTTCATGAACCTTGCTGCGATCCGAGGCGGCCCGCCTCGTCGTGCTTCGCGCAACCAAAGCAAGCGCCAGGGCCTGGGTGCGACGGTGAAGTGGTTGTGAGGTGCTCCGGCCTGTATGACAACATGACGGAGGCAACCCATGGCGGTTCTCGACAGCACATCCACGGGCAGCGCGCCCCAACGCGGTATCACCAAGGAG‑GAGCGCAAGGTCATCTTCGCCTCGTCCCTGGGCACGGTATTc > 1:2277454/1‑301 (MQ=255) ggCCGCCC‑CTCCGTGCAGGACCCGGCGGGTGGATATCCAGCCAATCCCGATTATGCTTCATGAACCTTGCTGCGATCCGAGGCGGCCCGCCTCGTCGTGCTTCGCGCAACCAAAGCAAGCGCCAGGGCCTGGGTGCGACGGTGAAGTGGTTGTGAGGTGCTCCGGCCTGTATGACAACATGACGGAGGCAACCCATGGCGGTTCTCGACAGCACATCCACGGGCAGCGCGCCCCAACGCGGTATCACCAAGGAG‑GAGCGCAAGGTCATCTTCGCCTCGTCCCTGGGCACGGTATTCGAGTg < 2:873002/301‑1 (MQ=255) gccCTCT‑CGTGCAGGACCCGGCGGGTGGATATCCAGCCAATCCCGATTATGCTTCATGAACCTTGCTGCGATCCGAGGCGGCCCGCCTCGTCGTGCTTCGCGCAACCAAAGCAAGCGCCAGGGCCTGGGTGCGACGGTGAAGTGGTTGTGAGGTGCTCCGGCCTGTATGACAACATGACGGAGGCAACCCATGGCGGTTCTCGACAGCACATCCACGGGCAGCGCGCCCCAACGCGGTATCACCAAGGAG‑GAGCGCAAGGTCATCTTCGCCCCGTCCCTGGGCACGGTATTCGAGTGGTAc > 2:401525/1‑301 (MQ=255) ccccTCT‑CGTTCAGGACCCGGCGGGTGGATATCCCGCCAATCCCGTTTATGCTTCATGCACCTTGCTGCGATCCGAGGCGGCCCGCCTCGTCGTGCTTCGCGCAACCAAAGCAAGCGCCAGGGCCTGGGTGCGACGGTGAAGTGGTTGTGAGGTGCTCCGGCCTGTATGACAACATGACGGAGGCAACCCATGGCGGTTCTCGACAGCACATCCACGGGCAGCGCGCCCCAACGCGGTATCACCAAGGAG‑GAGCGCAAGGTCATCTTCGCCTCGTCCCTGGGCACGGTATTCGAGTGGTAc < 1:918659/300‑1 (MQ=255) cgactcacGTGCAGAACCCGGCGGGTGGATATCCGGCCAATCCCGATTATGCTTCAGGAACCTGGCTGCGATCCGAGGCGGCCGTCCTCGTCGTGCTTCGCGCAACCAAAGCAAGCGCCAGGGCCTGGGTGCGACGGTGAAGTGGTTGTGAGGTGCTCCGGCCTGTATGACAACATGACGGAGGCAACCCATGGCGGTTCTCGACAGCACATCCACGGGCAGCGCGCCCCAACGCGGTATCACCAAGGAG‑GAGCGCAAGGTCATCTTCGCCTCGTCCCTGGGCACGGTATTCGAGTGGTAc < 2:614614/294‑1 (MQ=255) ccTCT‑CGTGCAGGACCCGGCGGGTGGATATCCAGCCAATCCCGATTATGCTTCATGAACCTTGCTGCGATCCGAGGCGGCCCGCCTCGTCGTGCTTCGCGCAACCAAAGCAAGCGCCAGGGCCTGGGTGCGACGGTGAAGTGGTTGTGAGGTGCTCCGGCCTGTATGACAACATGACGGAGGCAACCCATGGCGGTTCTCGACAGCACATCCACGGGCAGCGCGCCCCAACGCGGTATCACCAAGGAG‑GAGCGCAAGGTCATCTTCGCCTCGTCCCTGGGCACGGTATTCGAGTGGTACgg > 1:2026142/1‑300 (MQ=255) tct‑cGTGCAGGACCCGGCGGGTGGATATCCAGCCAATCCCGATTATGCTTCATGAACCTTGCTGCGATCCGAGGCGGCCCGCCTCGTCGTGCTTCGCGCAACCAAAGCAAGCGCCAGGGCCTGGGTGCGACGGTGAAGTGGTTGTGAGGTGCTCCGGCCTGTATGACAACATGACGGAGGCAACCCATGGCGGTTCTCGACAGCACATCCACGGGCAGCGCGCCCCAACGCGGTATCACCAAGGAG‑GAGCGCAAGGTCATCTTCGCCTCGTCCCTGGGCACGGTATTCGAGTGGTactact > 1:941154/1‑301 (MQ=255) tGCAGGACCCGGCGGGTGGATATCCAGCCAATCCCGATTATGCTTCATGAACCTTGCTGCGATCCGAGGCGGCCCGCCTCGTCGTGCTTCGCGCAACCAAAGCAAGCGCCAGGGCCTGGGTGCGACGGTGAAGTGGTTGTGAGGTGCTCCGGCCTGTATGACAACATGACGGAGGCAACCCATGGCGGTTCTCGACAGCACATCCACGGGCAGCGCGCCCCAACGCGGTATCACCAAGGAG‑GAGCGCAAGGTCATCTTCGCCTCGTCCCTGGGCACGGTATTCGCGTGGTACGACTTCttc > 1:1195749/1‑299 (MQ=255) cAGGCCCCGGCGGGTGGATATCCAGCCAATCCCGATTATGCTTCATGAACCTTGCTGCGATCCGAGGCGGCCCGCCTCGTCGTGCTTCGCGCAACCAAAGCAAGCGCCAGGGCCTGGGTGCGACGGTGAAGTGGCTGTGAGGTGCTCCGGCCTGTATGACAACATGACGGAGGCAACCCATGGCGGTTCTCGACAGCACATCCACGGGCAGCGCGCCCCAACGCGGTATCACCAAGGAG‑GAGCGCAAGGTCATCTTCGCCTCGTCCCTGGGCACGGTATTCGAGTGGTACGACTTCTACCt < 1:1282967/301‑1 (MQ=255) | GGGCGTGGAAGGGCGCAACCTGCACCATTTCTGCCTGCGCATCGAGCCGTTCGACGAGGCCGCGTTGACGGCCTATCTGGAAGCCGCCGGGGTAAAGGTGGAGCCTGCCGAGAAGCGTTATGGTGCCGAAGGGGAGGGGCTTTCGCTGTACTGCTACGACCCGGATGGTAATCAGGTCGAGTTGAAGGGGCCGGTAGTGCCTGGCGGGTGAAACCGCCCCCGCCAAAATCGTCAGCCAACCCGC‑TATCGCCCGGCACCCCGGTGCTGCGTGTCGTCCAGGCCGCCCTCT‑CGTGCAGGGCCCGGCGGGTGGATATCCAGCCAATCCCGATTATGCTTCATGAACCTTGCTGCGATCCGAGGCGGCCCGCCTCGTCGTGCTTCGCGCAACCAAAGCAAGCGCCAGGGCCTGGGTGCGACGGTGAAGTGGTTGTGAGGTGCTCCGGCCTGTATGACAACATGACGGAGGCAACCCATGGCGGTTCTCGACAGCACATCCACGGGCAGCGCGCCCCAACGCGGTATCACCAAGGAG‑GAGCGCAAGGTCATCTTCGCCTCGTCCCTGGGCACGGTATTCGAGTGGTACGACTTCTACCT > AE015451/2935495‑2936088 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 7 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |