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Only 100 of 159 total aligned reads displayed.
ATCACCAGCTCTGCCGGCTGCTCCACCTCGCGCCCCTGGGCATCGATGTAGGTCACGCCGGTGGCCCTGCGCTTGCTGTCGTCCAGGTTCACCCGCAGCACATGGGCATTGGGCCGCAACTCGAAGTTGGGCACCTGGCGCAGCGCCGGCAGGATATTCACGTTGGGCGAGGCCTTGGAGTACATGTAACA‑CACGTAGCCGCTGCAGAAACCGCAGAAGTTGCAAGGCCCCATCTGCGCCCCGTAGGGGTTGGTG‑TATGGCCCCGACGTGTTGGCCGACGGCAGGTTGTAGGGTTTGTAGCCCAGGCTGGTGGCAGCCTTTTCGAACAGCCTTGCCGATACAACGTTCTTCTGCGCGGGCAGCGGGAACGGGTTGGAACGGTCCGGCGCATAGGGGTTGCCGCCCTTCCCTTCACCGACCACCTGGCCTTTGACGGTCCAGGCCTGGCCTGAAGTGCCAAAGACCTTTTCGGCAAAGTCGAAATAGGGCTCCAGCTCTTCGTAACTGACGCCGAAGTCCTGGATAGTCATGCCTTCGGGAATGAACGTGCGCCCGTAGCGCTCTTCATAGTGGCTGCGCAGGCGC > AE015451/3830442‑3831026 | aTCACCAGCTCTGCCGGCTGCTCCACCTCGCGCCCCTGGGCATCTATGTAGGTCACGCCGGTGGCCCTGCGCTTGCTGTCGTCCAGGTTCACCCGCAGCACATGGGCATTGGGCCGCAACTCGAAGTTGGGCACCTGGCGCAGCGCCGGCAGGATATTCACGTTGGGCGAGGCCTTGGAGTACATGTAACA‑CACGTAGCCGCTGCAGAAACCGCAGAAGTTGCAAGGCCCCATCTGCGCCCCGTAGGGGTTGGTG‑TATGGCCCCGACGTGTTGGCCGACGGCAGGTTGTAGGGTTTATAGc < 1:2298596/301‑1 (MQ=255) catctaGCTCTGCCGGCTGCTCCACCTCGCGCCCCTGGGCATCGATGTAGGTCACGCCGGTGGCCCTGCGCTTGCTGTCGTCCAGGTTCACCCGCAGCACATGGGCATTGGGCCGCAACTCGAAGTTGGGCACCTGGCGCAGCGCCGGCAGGATATTCACGTTGGGCGAGGCCTTGGAGTACATGTAACA‑CACGTAGCCGCTGCAGAAACCGCAGAAGTTGCAAGGCCCCATCTGCGCCCCGTAGGGGTTGGTG‑TATGGCCCCGACGTGTTGGCCGACGGCAGGTTGTAGGGTTTATAGcc < 2:2345106/296‑1 (MQ=255) aGCTCTGCCGGCTGCTCCACCTCGCGCCCCTGGGCATCGATGTAGGTCACGCCGGTGGCCCTGCGCTTGCTGTCGTCCAGGTTCACCCGCAGCACATGGGCATTGGGCCGCAACTCGAAGTTGGGCACCTGGCGCAGCGCCGGCAGGATATTCACGTTGGGCGAGGCCTTGGAGTACATGTAACA‑CACGTAGCCGCTGCAGAAACCGCAGAAGTTGCAAGGCCCCATCTGCGCCCCGTAGGGGTTGGTG‑TATGGCCCCGACGTGTTGGCCGACGGCAGGTTGTAGGGTTTATAGccagatc > 1:2346040/1‑296 (MQ=255) gCTCTGCCGGCTGCTCCACCTCGCGCCCCTGGGCATCGATGTAGGTCACGCCGGTGGCCCTGCGCTTGCTGTCGTCCAGGTTCACCCGCAGCACATGGGCATTGGGCCGCAACTCGAAGTTGGGCACCTGGCGCAGCGCCGGCAGGATATTCACGTTGGGCGAGGCCTTGGAGTACATGTAACA‑CACGTAGCCGCTGCAGAAACCGCAGAAGTTGCAAGGCCCCATCTGCGCCCCGTAGGGGTTGGTG‑TATGGCCCCGACGTGTTGGCCGACGGCAGGTTGGAGGGTTTATAGCCCAGGcg > 2:384455/1‑300 (MQ=255) 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ATCACCAGCTCTGCCGGCTGCTCCACCTCGCGCCCCTGGGCATCGATGTAGGTCACGCCGGTGGCCCTGCGCTTGCTGTCGTCCAGGTTCACCCGCAGCACATGGGCATTGGGCCGCAACTCGAAGTTGGGCACCTGGCGCAGCGCCGGCAGGATATTCACGTTGGGCGAGGCCTTGGAGTACATGTAACA‑CACGTAGCCGCTGCAGAAACCGCAGAAGTTGCAAGGCCCCATCTGCGCCCCGTAGGGGTTGGTG‑TATGGCCCCGACGTGTTGGCCGACGGCAGGTTGTAGGGTTTGTAGCCCAGGCTGGTGGCAGCCTTTTCGAACAGCCTTGCCGATACAACGTTCTTCTGCGCGGGCAGCGGGAACGGGTTGGAACGGTCCGGCGCATAGGGGTTGCCGCCCTTCCCTTCACCGACCACCTGGCCTTTGACGGTCCAGGCCTGGCCTGAAGTGCCAAAGACCTTTTCGGCAAAGTCGAAATAGGGCTCCAGCTCTTCGTAACTGACGCCGAAGTCCTGGATAGTCATGCCTTCGGGAATGAACGTGCGCCCGTAGCGCTCTTCATAGTGGCTGCGCAGGCGC > AE015451/3830442‑3831026 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |