| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | AE015451 | 6,013,885 | T→C | intergenic (+90/+20) | xpt → / ← PP_5266 | Xanthine phosphoribosyltransferase/putative acetyl‑CoA hydrolase family protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | AE015451 | 6,013,885 | 0 | T | C | 97.9% | 330.5 / NA | 98 | intergenic (+90/+20) | xpt/PP_5266 | Xanthine phosphoribosyltransferase/putative acetyl‑CoA hydrolase family protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base C (52/43); minor base G (0/2); total (53/45) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.13e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
GATGACTTCCTGGCCAACGGCAAAGCCTCCCAAGCGCTGATCTCGATCATCAAGCAGGCAGGTGCCACCGTGGCGGGCCTGGGTATCGTGATCGAGAAGTCGTTCCAGGGCGGCCGTGCCGAACTGGACAGCCAGGGTTACCGCGTTGAATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCTGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACA‑AGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATCCGCCCCAGGTGGCTTTCATACCCCTCCGGCCCCGGTGCATCCAACGCTGCCTTGCCCAGCTC‑CAGCACCTCGCTCAGCTTGAACTTGCTCTTCAACCAGTTCAGCGCCCGCAACAGATCCCGCTCCTCGGCCGTAAAGTCCGTGCCCATCGGATACTCCGGGAACAGCCGCGCATGCTGTGCCCTGATCGCCTC > AE015451/6013592‑6014180 | gcggACTTCCTGTCCAACGGCAAGGCGTCCCAAGCGCTGATCTCGATCATCAAGCAGGCAGGTGCCAGCGTGGCGGGCCTGGGTATCGTGATCGAGAAGTCGTTCCAGGGCGGCCGTGCCGAACTGGACAGGCAGGGATACCGCGTTGAATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATg < 2:2320113/298‑1 (MQ=255) aaCGGCAAAGCCTCCCAAGCGCTGCTCTCAATCATCAAGCAGGCTGTTGCAACCGTGGCGGGCCTGGGTATCGTGATCGAGAAGTCGTTCCAGGGCGGCCGTGCCGAACTGGACAGCCAGGGTTACCGCGTTGAATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTa < 1:1479767/301‑1 (MQ=255) gCAAAGCCTCCCAAGCGCTGATCTCGATCATCAAGCAGGCAGGTGCCACCGTGGCGGGCCTGGGTATCGTGATCGAGAAGTCGTTCCAGGGCGGCCGTGCCGAACTGGACAGCCAGGGTTACCGCGTTGAATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTTGCAGCGGCCGTTCCCCGGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTg > 2:1998044/1‑301 (MQ=255) aaaaGCCGCCCAAGCGCTTACCTCAATCATCAAGCAGGCAGGTGCCACCGTGGCGGGCCTGGGTATCGTGATCGAGAAGTCGTTCCAGGGCGGCCGTGCCGAACTGGACAGCCAGGGTTACCGCGTTGAATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTgg < 1:1804839/300‑1 (MQ=255) 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cTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACA‑AGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATCCGCCCCAGGTGGCTTTCATACCCCTCCGGCCCCGGTGCATCCAACGCTGCCTTGCCCAGCTC‑CAGCACCTCGCTCAGCTTGAACTTGCTCTTCAACCAGTTCAGCGCCCGCAACAGATCCCGCTCCTCGGCCGTAAAGTCCGTGCCCATCGGATACTCCGGGACCAGCCGCGCATGCtgt > 2:416920/1‑301 (MQ=255) cTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACA‑AGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATCCGCCCCAGGTGGCTTTCATACCCCTCCGGCCCCGGTGCATCCAACGCTACCTTGCCCAGCTC‑CAGCACCTCGCTCAGCTTGAACTTGCTCTTCAACCAGTTCAGCGCCCGCAACAGATCCCGCTCCTCGGCCGTAAAGTCCGTGCCCATCGGATACTCCGGGAACAGCCGCGCATGCtgt < 1:849195/301‑1 (MQ=255) tgtgGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACA‑AGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATCCGCCCCAGGTGGCTTTCATACCCCTCCGGCCCCGGTGCATCCAACGCTGCCTTGCCCAGCTC‑CAGCACCTCGCTCAGCTTGAACTTGCTCTTCAACCAGTTCAGCGCCCGCAACAGATCCCGCTCCTCGGCCGTAAAGTCCGTGCCCATCGGATACTCCgagatcggaagagcgtcgtgtt > 2:993305/1‑280 (MQ=255) ggAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACA‑AGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATCCGCCCCAGGTGGCTTTCATACCCCTCCGGCCCCGGTGCATCCAACGCTGCCTTGCCCAGCTC‑CAGCACCTCGCTCAGCTTGAACTTGCTCTTCAACCAGTTCAGCGCCCGCAACAGATCCCGCTCCTCGGCCGTAAAGTCCGTGCCCATCGGATACTCCGGGAACAGCCGCGCATGCTGTGCCCt > 1:423277/1‑301 (MQ=255) gCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACA‑AGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATCCGCCCCAGGTGGCTTTCATACCCCTCCGGCCCCGGTGCATCCAACGCTGCCTTGCCCAGCTC‑CAGCACCTCGCTCAGCTTGAACTTGCTCTTCAACCAGTTCAGCGCCCGCAACAGATCCCGCTCCTCGGCCGTAAAGTCCGTGCCCATCGGATACTCCGGGAACAGCCGCGCATGCTGTGCCCTGAt < 2:702802/301‑1 (MQ=255) gTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACA‑AGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATCCGCCCCAGGTGGCTTTCATACCCCTCCGGCCCCGGTGCATCCAACGCTGCCTTGCCCAGCTC‑CAGCACCTCGCTCAGCTTGAACTTGCTCTTCAACCAGTTCAGCGCCCGCAACAGATCCCGCTCCTCGGCCGTAAAGTCCGTGCCCATCGGATACTCCGGGAACAGCCGCGCATgagatcggaagagcacacg > 1:1805907/1‑283 (MQ=255) gTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACA‑AGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATCCGCCCCAGGTGGCTTTCATACCCCTCCGGCCCCGGTGCATCCAACGCTGCCTTGCCCAGCTC‑CAGCACCTCGCTCAGCTTGAACTTGCTCTTCAACCAGTTCAGCGCCCGCAACAGATCCCGCTCCTCGGCCGTAAAGTCCGTGCCCATCGGATACTCCGGGAACAGCCGCGCATGCTGTGCCCTGATCGCCTc > 1:1198/1‑301 (MQ=255) | GATGACTTCCTGGCCAACGGCAAAGCCTCCCAAGCGCTGATCTCGATCATCAAGCAGGCAGGTGCCACCGTGGCGGGCCTGGGTATCGTGATCGAGAAGTCGTTCCAGGGCGGCCGTGCCGAACTGGACAGCCAGGGTTACCGCGTTGAATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCTGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACA‑AGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATCCGCCCCAGGTGGCTTTCATACCCCTCCGGCCCCGGTGCATCCAACGCTGCCTTGCCCAGCTC‑CAGCACCTCGCTCAGCTTGAACTTGCTCTTCAACCAGTTCAGCGCCCGCAACAGATCCCGCTCCTCGGCCGTAAAGTCCGTGCCCATCGGATACTCCGGGAACAGCCGCGCATGCTGTGCCCTGATCGCCTC > AE015451/6013592‑6014180 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |