Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ AE015451 4236757 4239342 2586 28 [26] [26] 28 [catA‑I]–catR [catA‑I],catC,catB,catR

TCGATGGTGCGCGGGGTGCCGCCGCCAAGGCCGGCTTCGGCATCCTTGGCATCCTGCAGCAGGTCGAGGAAGTGCTCGATACCCAGGCCAGCAGCCAGCAGGCCTGCCTCGTTACGGCCGCCCAGGCGGTTGAGGTAGTCGACGGCGTGCCAGAACTCGTCCTCGGTAATCTCCAGGTCTTCGATCAGGCGGGCGGTGTCTTGCAGCACGCGCAGAATGATCTGCTTGAAGCGCGGGTTTCCTTCGGCATGGTCCAGGCCAGCTACCCGGTTGAAGAAGGCTTGAATGTCGGCAGTGTGGGAAATTTTCACGGTCATCGTGCTTACCTCGTATTGTTCTTGTCAGGCATACAGGTGCGAATCAGC  >  AE015451/4236456‑4236820
                                                                                                                                                                                                                                                                                                            |                                                                
tCGATGGTGCGCGGGGTGCCACCGCCAAGGCCGGCTTCGGCATCCTTGGCATCCTGCAGCAGGTCGAGGAAGTGCTCGATACCCAGGCCAGCAGCCAGCAGGCCTGCCTCGTTACGGCCGCCCAGGCGGTTGAGGTAGTCGACGGCGTGCCAGAACTCGTCCTCGGTAATCTCCAGGTCTTCGATCAGGCGGGCGGTGTCTTGCAGCACGCGCAGAATGATCTGCTTGAAGCGCGGGTTTCCTTCGGCATGGTCCAGGCCAGCTACCCGGTTGAAGAAGGCTTGAATGTCGGCAGTGTggg                                                                  <  3:496468/301‑1 (MQ=255)
  gATGGTGCGCGGGGTGCCGCCGCCAAGGCCGGCTTCGGCATCCTTGGCATCCTGCAGCAGGTCGAGGAAGTGCTCGATACCCAGGCCAGCAGCCAGCAGGCCTGCCTCGTTACGGCCGCCCAGGCGGTTGAGGTAGTCGACGGCGTGCCAGAACTCGTCCTCGGTAATCTCCAGGTCTTCGATCAGGCGGGCGGTGTCTTGCAGCACGCGCAGAATGATCTGCTTGAAGCGCGGGTTTCCTTCGGCATGGTCCAGGCCAGCTACCCGGTTGAAGAAGGCTTGAATGTCGGCAGTGTGGGaa                                                                >  3:531295/1‑301 (MQ=255)
   aTGGTGCGCGGGGTGCCGCCGCCAAGGCCGGCTTCGGCATCCTTGGCATCCTGCAGCAGGTCGAGGAAGTGCTCGATACCCAGGCCAGCAGCCAGCAGGCCTGCCTCGTTACGGCCGCCCAGGCGGTTGAGGTAGTCGACGGCGTGCCAGAACTCGTCCTCGGTAATCTCCAGGTCTTCGATCAGGCGGGCGGTGTCTTGCAGCACGCGCAGAATGATCTGCTTGAAGCGCGGGTTTCCTTCGGCATGGTCCAGGCCAGCTACCCGGTTGAAGAAGCCTTGCATGTCGGCAGGTgggggaa                                                              >  2:439407/1‑297 (MQ=255)
     ttccggtctggTGCCGCCGCCAAGGCCGGCTTCGGCATCCTTGGCATCCTGCAGCAGGTCGAGGAAGTGCTCGATACCCAGGCCAGCAGCCAGCAGGCCTGCCTCGTTACGGCCGCCCAGGCGGTTGAGGTAGTCGACGGCGTGCCAGAACTCGTCCTCGGTAATCTCCAGGTCTTCGATCAGGCGGGCGATGTCTTGCAGCACGCGCAGAATGATCTGCTTGAAGCGCGGGTTTCCTTCGGCATGGTCCAGGCCAGCTACCCGGTTGAAGAAGGCTTGAATGTCGGCAGTGTGGGAAAtt                                                             <  2:157848/292‑1 (MQ=255)
            ggggTGCCGCCGCCAAGGCCGGCTTCGGCATCCTTGGCATCCTGCAGCAGGTCGAGGAAGTGCTCGATACCCAGGCCAGCAGCCAGCAGGCCTGCCTCGTTACGGCCGCCCAGGCGGTTGAGGTAGTCGACGGCGTGCCAGAACTCGTCCTCGGTAATCTCCAGGTCTTCGATCAGGCGGGCGGTGTCTTGCAGCACGCGCAGAATGATCTGCTTGAAGCGCGGGTTTCCTTCGGCATGGTCCAGGCCAGCTACCCGGTTGAAGAAGGCTTGAATGTCGGCAGTGTGGGAAATTTTCACgg                                                      <  3:503074/301‑1 (MQ=255)
              ggTGCCGCCGCCAAGGCCGGCTTCGGCATCCTTGGCATCCTGCAGCAGGTCGAGGAAGTGCTCGATACCCAGGCCAGCAGCCAGCAGGCCTGCCTCGTTACGGCCGCCCAGGCGGTTGAGGTAGTCGACGGCGTGCCAGAACTCGTCCTCGGTAATCTCCAGGTCTTCGATCAGGCGGGCGATGTCTTGCAGCACGCGCAGAATGATCTGCTTGAAGCGCGGGTTTCCTTCGGCATGGTCCAGGCCAGCTACCCGGTTGAAGAAGGCTTGAATGTCGGCAGTGTGGGAAAttagatcggaa                                                    >  4:157878/1‑292 (MQ=255)
                  ccgatctcAAGGCCGGCTTCGGCATCCTTGGCATCCTGCAGCAGGTCGAGGAAGTGCTCGATACCCAGGCCAGCAGCCAGCAGGCCTGCCTCGTTACGGCCGCCCAGGCGGTTGAGGTAGTCGACGGCGTGCCAGAACTCGTCCTCGGTAATCTCCAGGTCTTCGATCAGGCGGGCGGTGTCTTGCAGCACGCGCAGAATGATCTGCTTGAAGCGCGGGTTTCCTTCGGCATGGTCCAGGCCAGCTACCCGGTTGAAGAAGGCTTGAATGTCGGCAGTGTGGGAAATTTTCACGGTCATCg                                                <  1:545805/294‑1 (MQ=255)
                    gccgccAAGGCCGGCTTCGGCATCCTTGGCATCCTGCAGCAGGTCGAGGAAGTGCTCGATACCCAGGCCAGCAGCCAGCAGGCCTGCCTCGTTACGGCCGCCCAGGCGGTTGAGGTAGTCGACGGCGTGCCAGAACTCGTCCTCGGTAATCTCCAGGTCTTCGATCAGGCGGGCGGTGTCTTGCAGCACGCGCAGAATGATCTGCTTGAAGCGCGGGTTTCCTTCGGCATGGTCCAGGCCAGCTACCCAGTTGAAGAAGGCTTGAATGTCGGCAGTGTGGGAAATTTTCACGGTCATCGTg                                              <  4:3726/301‑1 (MQ=255)
                        ccAAGGCCGGCTTCGGCATCCTTGGCATCCTGCAGCAGGTCGAGGAAGTGCTCGATACCCAGGCCAGCAGCCAGCAGGCCTGCCTCGTTACGGCCGCCCAGGCGGTTGAGGTAGTCGACGGCGTGCCAGAACTCGTCCTCGGTAATCTCCAGGTCTTCGATCAGGCGGGCGGTGTCTTGCAGCACGCGCAGAATGATCTGCTTGAAGCGCGGGTTTCCTTCGGCATGGTCCAGGCCAGCTACCCGGTTGAAGAAGGCTTGAATGTCGGCAGTGTGGGAACTTTTCACGGTCATCGttctgg                                          >  2:47335/1‑296 (MQ=255)
                         cAAGGCCGGCTTCGGCATCCTTGGCATCCTGCAGCAGGTCGAGGAAGTGCTCGATACCCAGGCCAGCAGCCAGCAGGCCTGCCTCGTTACGGCCGCCCAGGCGGTTGAGGTAGTCGACGGCGTGCCAGAACTCGTCCTCGGTAATCTCCAGGTCTTCGATCAGGCGGGCGGTGTCTTGCAGCACGCGCAGAATGATCTGCTTGAAGCGCGGGTTTCCTTCGGCATGGTCCAGGCCAGCTACCCGGTTGAAGAAGGCTTGAATGTCGGCAGTGTGGGAAATTTTCACGGTCATCgagatcgg                                         >  3:545819/1‑294 (MQ=255)
                          aaGGCCGGCTTCGGCATCCTTGGCATCCTGCAGCAGGTCGAGGAAGTGCTCGATACCCAGGCCAGCAGCCAGCAGGCCTGCCTCGTTACGGCCGCCCAGGCGGTTGAGGTAGTCGACGGCGTGCCAGAACTCGTCCTCGGTAATCTCCAGGTCTTCGATCAGGCGGGCGGTGTCTTGCAGCACGCGCAGAATGATCTGCTTGAAGCGCGGGTTTCCTTCGGCATGGTCCAGGCCAGCTACCCGGTTGAAGCAGGCTGGAATGTCGGCAGTGTGGGAAATCTTCACGGGCATCGttcatccc                                        >  2:478706/1‑294 (MQ=255)
                          aaGGCCGGCTTCGGCATCCTTGGCATCCTGCAGCAGGTCGAGGAAGTGCTCGATACCCAGGCCAGCAGCCAGCAGGCCTGCCTCGTTACGGCCGCCCAGGCGGTTGAGGTAGTCGACGGCGTGCCAGAACTCGTCCTCGGTAATCTCCAGGTCTTCGATCAGGCGGGCGGTGTCTTGCAGCACGCGCAGAATGATCTGCTTGAAGCGCGGGTTTCCTTCGGCATGGTCCAGGCCAGCTACCCGGTTGAAGAAGGCTTGAATGTCGGCAGTGTGGGAAATTTTCACGGTCATCGTGCTGAcc                                        >  4:729417/1‑301 (MQ=255)
                                ggCTTCGGCATCCTTGGCATCCTGCAGCAGGTCGAGGAAGTGCTCGATACCCAGGCCAGCAGCCAGCAGGCCTGCCTCGTTACGGCCGCCCAGGCGGTTGAGGTAGTCGACGGCGTGCCAGAACTCGTCCTCGGTAATCTCCAGGTCTTCGATCAGGCGGGCGGTGTCTTGCAGCACGCGCAGAATGATCTGCTTGAAGCGCGGGTTTCCTTCGGCATGGTCCAGGCCAGCTACCCGGTTGAAGAAGGCTTGAATGTCGGCAGTGTGGGAAATTTTCACGGTCATCGTGCTGACCTCGtct                                  >  2:534667/1‑299 (MQ=255)
                                     cGGCATCCTTGGCATCCTGCAGCAGGTCGAGGAAGTGCTCGATACCCAGGCCAGCAGCCAGCAGGCCTGCCTCGTTACGGCCGCCCAGGCGGTTGAGGTAGTCGACGGCGTGCCAGAACTCGTCCTCGGTAATCTCCAGGTCTTCGATCAGGCGGGCGGTGTCTTGCAGCACGCGCAGAATGATCTGCTTGAAGCGCGGGTTTCCTTCGGCATGGTCCAGGCCAGCTACCCGGTTGAAGAAGGCTTGAATGTCGGCAGTGTGGGAAATTTTCACGGTCATCGTGCTGACCTCGTATTGtgt                             >  3:102127/1‑299 (MQ=255)
                                      ggCATCCTTGGCATCCTGCAGCAGGTCGAGGAAGTGCTCGATACCCAGGCCAGCAGCCAGCAGGCCTGCCTCGTTACGGCCGCCCAGGCGGTTGAGGTAGTCGACGGCGTGCCAGAACTCGTCCTCGGTAATCTCCAGGTCTTCGATCAGGCGGGCGGTGTCTTGCAGCACGCGCAGAATGATCTGCTTGAAGCGCGGGTTTCCTTCGGCATGGTCCAGGCCAGCTACCCGGTTGAAGAAGGCTTGAATGTCGGCAGTGTGGGAAATTTTCACGGTCATCGTGCTGACCTCGTAttttgtt                            >  2:188263/1‑296 (MQ=255)
                                        cATCCTTGGCATCCTGCAGCAGGTCGAGGAAGTGCTCGATACCCAGGCCAGCAGCCAGCAGGCCTGCCTCGTTACGGCCGCCCAGGCGGTTGAGGTAGTCGACGGCGTGCCAGAACTCGTCCTCGGTAATCTCCAGGTCTTCGATCAGGCGGGCGGTGTCTTGCAGCACGCGCAGAATGATCTGCTTGAAGCGCGGGTTTCCTTCGGCATGGTCCAGGCCAGCTACCCGGTTGAAGAAGGCTTGAATGTCGGCAGTGTGGGAAATTTTCACGGTCATCGTGCTGACCTCGTATTGtgtgaa                          >  3:273798/1‑296 (MQ=255)
                                           ccTTGGCATCCGGCAGCAGGTCGAGGAAGTGCTCGATACCCAGGCCAGCAGCCAGCAGGCCTGCCTCGTTACGGCCGCCCAGGCGGTTGAGGTAGTCGACGGCGTGCCAGAACTCGTCCTCGGTAATCTCCAGGTCTTCGATCAGGCGGGCGGTGTCTTGCAGCACGCGCAGAATGATCTGCTTGAAGCGCGGGTTTCCTTCGGCATGGTCCAGGCCAGCTACCCGGTTGAAGAAGGCTTGAATGTCGGCAGTGTGGGAAATTTTCACGGTCATCGTGCTGACCTCGTATTGtgtgaaatt                       <  1:531281/301‑9 (MQ=255)
                                                gcgtCCTGCAGCGGGTCGAGTAGATGCTCGAGACCCAGGACAGCAGCCAGCAGGCCTGCCTCGTTACGGCCGCCCAGGCGGTTGAGGTAGTCGACGGCGTGCCAGAACTCGTCCTCGGTAATCTCCAGGTCTTCGATCAGGCGGGCGGTGTCTTGCAGCACGCGCAGAATGATCTGCTTGAAGCGCGGGTTTCCTTCGGCATGGTCCAGGCCAGCTACCCGGTTGAAGAAGGCTTGAATGTCGGCAGTGTGGGAAATTTTCACGGTCATCGTGCTGACCTCGTATTGtgtgaaattgttat                  <  2:208441/298‑14 (MQ=255)
                                                gCATCCTGCAGCAGGTCGAGGAAGTGCTCGATACCCCGGCCAGCAGCCAGCAGGCCTGCCTCGTTACGGCCGCCCAGGCGGTTGAGGTAGTCGACGGCGTGCCAGAACTCGTCCTCGGTAATCTCCAGGTCTTCGATCAGGCGGGCGGTGTCTTGCAGCACGCGCAGAATGATCTGCTTGAAGCGCGGGTTTCCTTCGGCATGGTCCAGGCCAGCTACCCGGTTGAAGAAGGCTTGAATGTCGGCAGTGTGGGAAATTTTCACGGTCATCGTGCTGACCTCGTATTGtgtgaaattgttat                  <  2:729204/301‑14 (MQ=255)
                                                   tCCTGCAGCAGGTCGAGGAAGTGCTCGATACCCAGGCCAGCAGCCAGCAGGCCTGCCTCGTTACGGCCGCCCAGGCGGTTGAGGTAGTCGACGGCGTGCCAGAACTCGTCCTCGGTAATCTCCAGGTCTTCGATCAGGCGGGCGGTGTCTTGCAGCACGCGCAGAATGATCTGCTTGAAGCGCGGGTTTCCTTCGGCATGGTCCAGGCCAGCTACCCGGTTGAAGAAGGCTTGAATGTCGGCAGTGTGGGAAATTTTCACGGTCATCGTGCTGACTTCGTATTGtgtgaaattgttatctg               >  4:41664/1‑285 (MQ=255)
                                                        cagcagGTCGAGGAAGTGCTCGATACCCAGGCCAGCAGCCAGCAGGCCTGCCTCGTTACGGCCGCCCAGGCGGTTGAGGTAGTCGACGGCGTGCCAGAACTCGTCCTCGGTAATCTCCAGGTCTTCGATCAGGCGGGCGGTGTCTTGCAGCACGCGCAGAATGATCTGCTTGAAGCGCGGGTTTCCTTCGGCATGGTCCAGGCCAGCTACCCGGTTGAAGAAGGCTTGAATGTCGGCAGTGTGGGAAATTTTCACGGTCATCGTGCTGACCTCGTATTGtgtgaaattgttatccgctcac          <  4:47347/301‑22 (MQ=255)
                                                         agcagGTCGAGGAAGTGCTCGATACCCAGGCCAGCAGCCAGCAGGCCTGCCTCGTTACGGCCGCCCAGGCGGTTGAGGTAGTCGACGGCGTGCCAGAACTCGTCCTCGGTAATCTCCAGGTCTTCGATCAGGCGGGCGGTGTCTTGCAGCACGCGCAGAATGATCTGCTTGAAGCGCGGGTTTCCTTCGGCATGGTCCAGGCCAGCTACCCGGTTGAAGAAGGCTTGAATGTCGGCAGTGTGGGAAATTTTCACGGTCATCGTGCTGACCTCGTATTGtgtgaaattgttatccgctcaca         >  4:14908/1‑279 (MQ=255)
                                                            agGTCGAGGAAGTGCTCGATACCCAGGCCAGCAGCCAGCAGGCCTGCCTCGTTACGGCCGCCCAGGCGGTTGAGGTAGTCGACGGCGTGCCAGAACTCGTCCTCGGTAATCTCCAGGTCTTCGATCAGGCGGGCGGTGTCTTGCAGCACGCGCAGAATGATCTGCTTGAAGCGCGGGTTTCCTTCGGCATGGTCCAGGCCAGCTACCCGGTTGAAGAAGGCTTGAATGTCGGCAGTGTGGGAAATTTTCACGGTCATCGTGCTGACCTCGTATTGtgtgaaattgttatccgctcacaatt      >  3:171325/1‑276 (MQ=255)
                                                            agGTCGAGGAAGTGCTCGATACCCAGGCCAGCAGCCAGCAGGCCTGCCTCGTTACGGCCGCCCAGGCGGTTGAGGTAGTCGACGGCGTGCCAGAACTCGTCCTCGGTAATCTCCAGGTCTTCGATCAGGCGGGCGGTGTCTTGCAGCACGCGCAGAATGATCTGCTTGAAGCGCGGGTTTCCTTCGGCATGGTCCAGGCCAGCTACCCGGTTGAAGAAGGCTTGAATGTCGGCAGTGTGGGAAATTTTCACGGTCATCGTGCTGACCTCGTATTGtgtgaaattgttatccgctcacaatt      >  2:91495/1‑276 (MQ=255)
                                                             ggTCGAGGAAGTGCTCGATACCCAGGCCAGCAGCCAGCAGGCCTGCCTCGTTACGGCCGCCCAGGCGGTTGAGGTAGTCGACGGCGTGCCAGAACTCGTCCTCGGTAATCTCCAGGTCTTCGATCAGGCGGGCGGTGTCTTGCAGCACGCGCAGAATGATCTGCTTGAAGCGCGGGTTTCCTTCGGCATGGTCCAGGCCAGCTACCCGGTTGAAGAAGGCTTGAATGTCGGCAGTGTGGGAAATTTTCACGGTCATCGTGCTGACCTCGTATTGtgtgaaattgttatccgctcacaattc     <  1:102125/301‑27 (MQ=255)
                                                             cctCGAGGAAGTGCTCGATACCCAGGCCAGCAGCCAGCAGGCCTGCCTCGTTACGGCCGCCCAGGCGGGTGAGGTAGTCGACGGCGTGCCAGAACTCGTCCTCGGTAATCTCCAGGTCTTCGATCAGGCGGGCGGTGTCTTGCAGCACGCGCAGAATGATCTGCTTGAAGCGCGGGTTTCCTTCGGCATGGTCCAGGCCAGCTACCCGGTTGAAGAAGGCTTGAATGTCGGCAGTGTGGGAAATTTTCACGGTCATCGTGCTGACCTCGTATTGtgtgaaattgttatccgctcacaattc     <  3:329681/299‑27 (MQ=255)
                                                                cGAGGAAGTGCTCGATACCCAGGCCAGCAGCCAGCAGGCCTGCCTCGTTACGGCCGCCCAGGCGGTTGAGGTAGTCGACGGCGTGCCAGAACTCGTCCTCGGTAATCTCCAGGTCTTCGATCAGGCGGGCGGTGTCTTGCAGCACGCGCAGAATGATCTGCTTGAAGCGCGGGTTTCCTTCGGCATGGTCCAGGCCAGCTACCCGGTTGAAGAAGGCTTGCATGTCGGCAGTGTGGGAAATTTTCACGGTCATCGTGCTGACCTCGTATTGtgtgaacttgttctccgctcacaattcagc  >  1:329673/1‑272 (MQ=255)
                                                                cGAGGAAGTGCTCGATACCCAGGCCAGCAGCCAGCAGGCCTGCCTCGTTACGGCCGCCCAGGCGGTTGAGGTAGTCGACGGCGTGCCAGAACTCGTCCTCGGTAATCTCCAGGTCTTCGATCAGGCGGGCGGTGTCTTGCAGCACGCGCAGAATGATCTGCTTGAAGCGCGGGTTTCCTTCGGCATGGTCCAGGCCAGCTACCCGGTTGAAGAAGGCTTGAATGTCGGCAGTGTGGGAAATTTTCACGGTCATCGTGCTGACCTCGTATTGtgtgaaattgttatccgctcacaattccac  >  1:122303/1‑272 (MQ=255)
                                                                                                                                                                                                                                                                                                            |                                                                
TCGATGGTGCGCGGGGTGCCGCCGCCAAGGCCGGCTTCGGCATCCTTGGCATCCTGCAGCAGGTCGAGGAAGTGCTCGATACCCAGGCCAGCAGCCAGCAGGCCTGCCTCGTTACGGCCGCCCAGGCGGTTGAGGTAGTCGACGGCGTGCCAGAACTCGTCCTCGGTAATCTCCAGGTCTTCGATCAGGCGGGCGGTGTCTTGCAGCACGCGCAGAATGATCTGCTTGAAGCGCGGGTTTCCTTCGGCATGGTCCAGGCCAGCTACCCGGTTGAAGAAGGCTTGAATGTCGGCAGTGTGGGAAATTTTCACGGTCATCGTGCTTACCTCGTATTGTTCTTGTCAGGCATACAGGTGCGAATCAGC  >  AE015451/4236456‑4236820

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: