| Predicted mutation | ||||||
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| MC JC | AE015451 | 5,342,745 | 1681 bp→GCGGCCGC | [pgi‑II] | [pgi‑II] | |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
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| * | * | ÷ | AE015451 | 5342745 | 5344425 | 1681 | 101 [0] | [0] 104 | [pgi‑II] | [pgi‑II] |
| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | AE015451 | = 5342744 | 0 (0.000) | 100 (0.830) +GCGGCCGC |
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| ? | AE015451 | 5344426 = | 0 (0.000) | intergenic (+1/‑177) | pgi‑II/acsA‑II | glucose‑6‑phosphate isomerase/acetyl‑CoA synthetase | |||||
Only 100 of 101 total aligned reads displayed.
GCAGTGATCAATGATCGAGACCTGGTGGTGATTGCGGCGGCTTACCTGGGTAACACGCGGTTGATCGACAACCTCTACCTGCATTTGGAA‑GAGAAGACCGCATAACGGTCTTGGGCTGCCTTGCAGCCCATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTGCACGTTTACCTGTAGGGGCGGGCTTGCTTGCAATGCCCCCAAAATCCCCCTGCCATACCCATTCCCAGCACGTGGCCTTTGCCTATAATGGTGCCAGCCTGAACCCGGCAACGACTGCCGTGTCCAAGCCCTCACCACGCACCAAGGGAACCCCGCGCAATGGCGTATTACCGTACACCCCACGATGTGACGGCCCTGCCCGCCTGGCAGGCGCTTCAGAAACACCGCGACGCCATGCAAAGCTTCAGCATGCGCGAAGCCTTCGCCGCCGATGCCAAGCGCTTCGACCAGTTTTCCCTCAGCGCTTGCGGCCTGTTCCTCGACTACTCGAAAAACCTGATCACCGAGCAAAGCCGCGATCTGCTGGTCAATCTGGCCAATGAAGTGGGCCTGCAGGACGCCATCAAGTCGATGTTCAGCGGTGAGATCATCAACGCCT > AE015451/5342450‑5343040 | ggagtGATCAATGATCGATAACTGGTAGTGATTGCGGCGGCTTACCTGGGTAACACGCGGTTGATCGACAACCTCTACCTGCATTTGGAA‑GAGAAGACCGCATAACGGTCTTGGGCTGCCTTGCAGCCCATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTGCACGTTTACCTGTAGGGGCGGGCTTGCTTGCAATGCCCCCAAAATCCCCCTGCCATACCCATTCCCAGCACGTGGCCTTTGCCTATAATGGTGCCAGCCTGAACCCGGCAACGACTGCCGTGTCCAAGCCCTCACCACGCACCgcggcc < 2:558630‑M1/299‑7 (MQ=255) 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aaatGATCGAGACCTGGTGGTGATTGCGGCGGCTTACCTGGGTAACACGCGGTTGATCGACAACCTCTACCTGCATTTGGAA‑GAGAAGACCGCATAACGGTCTTGGGCTGCCTTGCAGCCCATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTGCACGTTTACCTGTAGGGGCGGGCTTGCTTGCAATGCCCCCAAAATCCCCCTGCCATACCCATTCCCAGCACGTGGCCTTTGCCTATAATGGTGCCAGCCTGAACCCGGCAACGACTGCCGTGTCCAAGCCCTCACCACGCACCgcggccgctccgag < 1:639356‑M1/300‑15 (MQ=255) ggtgcgagaCCTGGTGGTGATTGCGGCGGCTTACCTGGGTAACACGCGGTTGATCGACAACCTCTACCTGCATTTGGAA‑GAGAAGACCGCATAACGGTCTTGGGCTGCCTTGCAGCCCATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTGCACGTTTACCTGTAGGGGCGGGCTTGCTTGCAATGCCCCCAAAATCCCCCTGCCATACCCATTCCCAGCACGTGGCCTTTGCCTATAATGGTGCCAGCCTGAACCCGGCAACGACTGCCGTGTCCAAGCCCTCACCACGCACCgcggccgctccgagctt < 2:635405‑M1/297‑18 (MQ=255) agaTCGATACCTGGTGGTGATTGCGGCGGCTTACCTGGGTAACACGCGGTTGATCGACAACCTCTACCTGCATTTGGAA‑GAGAAGACCGCATAACGGTCTTGGGCTGCCTTGCAGCCCATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTGCACGTTTACCTGTAGGGGCGGGCTTGCTTGCAATGCCCCCAAAATCCCCCTGCCATACCCATTCCCAGCACGTGGCCTTTGCCTATAATGGTGCCAGCCTGAACCCGGCAACGACTGCCGTGTCCAAGCCCTCACCACGCACCgcggccgctccgagctt < 4:664888‑M1/300‑18 (MQ=255) 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tggtgATTGCGGCGGCTTACCTGGGTAACACGCGGTTGATCGACAACCTCTACCTGCATTTGGAA‑GAGAAGACCGCATAACGGTCTTGGGCTGCCTTGCAGCCCATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTGCACGTTTACCTGTAGGGGCGGGCTTGCTTGCAATGCCCCCAAAATCCCCCTGCCATACCCATTCCCAGCACGTGGCCTTTGCCTATAATGGTGCCAGCCTGAACCCGGCAACGACTGCCGTGTCCAAGCCCTCACCACGCACCgcggccgctccgagcttgtgccggcctcttc > 1:243237‑M1/1‑270 (MQ=255) tttgCGGCGGCTTACCTGGGTAACACGCGGTTGATCGACAACCTCTACCTGCATTTGGAA‑GAGAAGACCGCATAACGGTCTTGGGCTGCCTTGCAGCCCATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTGCACGTTTACCTGTAGGGGCGGGCTTGCTTGCAATGCCCCCAAAATCCCCCTGCCATACCCATTCCCAGCACGTGGCCTTTGCCTATAATGGTGCCAGCCTGAACCCGGCAACGACTGCCGTGTCCAAGCCCTCACCACGCACCgcggccgctccgagcttgtgccggcctcttcgcggg < 3:291228‑M1/300‑37 (MQ=255) gccgccttactagggtaacacggggttGAGCGACAACCTCTACCTGAATTTGGAA‑GGGAAGACCGAATACCGGTCTTGGGCTGCCTTGAAGCCCATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTGCACGTTTACCTGTAGGGGCGGGCTTGCTTGCAATGCCCCCAAAATCCCCCTGCCATACCCATTCCCAGCACGTGGCCTTTGCCTATAATGGTGCCAGCCTGAACCCGGCAACGACTGCCGTGTCCAAGCCCTCACCACGCACCgcggccgctccgagcttgtgccggcctcttcgcgggtaaac < 2:59375‑M1/289‑42 (MQ=255) 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GCAGTGATCAATGATCGAGACCTGGTGGTGATTGCGGCGGCTTACCTGGGTAACACGCGGTTGATCGACAACCTCTACCTGCATTTGGAA‑GAGAAGACCGCATAACGGTCTTGGGCTGCCTTGCAGCCCATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTGCACGTTTACCTGTAGGGGCGGGCTTGCTTGCAATGCCCCCAAAATCCCCCTGCCATACCCATTCCCAGCACGTGGCCTTTGCCTATAATGGTGCCAGCCTGAACCCGGCAACGACTGCCGTGTCCAAGCCCTCACCACGCACCAAGGGAACCCCGCGCAATGGCGTATTACCGTACACCCCACGATGTGACGGCCCTGCCCGCCTGGCAGGCGCTTCAGAAACACCGCGACGCCATGCAAAGCTTCAGCATGCGCGAAGCCTTCGCCGCCGATGCCAAGCGCTTCGACCAGTTTTCCCTCAGCGCTTGCGGCCTGTTCCTCGACTACTCGAAAAACCTGATCACCGAGCAAAGCCGCGATCTGCTGGTCAATCTGGCCAATGAAGTGGGCCTGCAGGACGCCATCAAGTCGATGTTCAGCGGTGAGATCATCAACGCCT > AE015451/5342450‑5343040 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |