| Predicted mutation | ||||||
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| MC JC | AE015451 | 5,342,745 | 1681 bp→GCGGCCGC | [pgi‑II] | [pgi‑II] | |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
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| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | AE015451 | = 5342744 | 0 (0.000) | 100 (0.830) +GCGGCCGC |
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| ? | AE015451 | 5344426 = | 0 (0.000) | intergenic (+1/‑177) | pgi‑II/acsA‑II | glucose‑6‑phosphate isomerase/acetyl‑CoA synthetase | |||||
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CAGACATCGAAAAGCTGGCCCCGCACAAGGTGATCCCGGGTAACCGCCCGAGCAACACGTTGGTGGTCGAGCGCATCAGCCCGCGCCGGCTGGGTGCGCTGGTGGCCATGTACGAGCACAAGGTGTTCGTACAGAGCGTTATCTGGGGTATCAACGCCTTCGATCAGTGGGGCGTCGAGCTGGGCAAGGAGCTGGGCAAGGGCGTTTACCAGCGCTTGGTCGGTAGCCTGGAAGACAGCGCCGAAGACGGTTCCACCCAAGGCCTGATCAACTACTTCCGCGGCCGTCACCGCGGTTGATCCGAGCTTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCCTACCAGGCAACGCGTTACCTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTTGAACACCGCTCCCAGCTACA‑CTGTCTTATCGAATAGCCGTTGCAGTCCATCGCCCCTTACAAGAGCAGGACCACCCGCCATGTTCGATATCCGCAAATACCCCCAGGCCCTGGCCGTCAGCCAGT‑CCGCCGCCCTCACCCCCGAAGACTACCGCCGCCTCTACCGCCAGTCGGTCGAAGACCCAGACACCTTCTGGGCCGA > AE015451/5344127‑5344724 | tgatcaatgatcgagacctggtggtgattgcggcggcttacctgggtaacacgcggttgatcgacaacctctacctgcatttggaagagaagaccgcataacggtcttgggctgccttgcagcccattcgcgggcaagcccgctcctgcacgtttacctgtaggggcgggcttgcttgcaatgcccccaaaatccccctgccatacccattcccagcacgtggcctttgcctataatggtgccagcctgaacccggcaacgactgccgtgtccaagccctcaccacgcaccgcggccgcTc < 3:394067‑M2/2‑1 (MQ=255)tgatcaatgatcgagacctggtggtgattgcggcggcttacctgggtaacacgcggttgatcgacaacctctacctgcatttggaagagaagaccgcataacggtcttgggctgccttgcagcccattcgcgggcaagcccgctcctgcacgtttacctgtaggggcgggcttgcttgcaatgcccccaaaatccccctgccatacccattcccagcacgtggcctttgcctataatggtgccagcctgaacccggcaacgactgccgtgtccaagccctcaccacgcaccgcggccgcTc > 3:606303‑M2/300‑301 (MQ=255) ggtcaatgatcgagacctggtggtgattgcggcggcttacctgggtaacacgcggttgatcgacaacctctacctgcatttggaagagaagaccgcataacggtcttgggctgccttgcagcccattcgcgggcaagcccgctcctgcacgtttacctgtaggggcgggcttgcttgcaatgcccccaaaatccccctgccatacccattcccagcacgtggcctttgcctataatggtgccagcctgaacccggcaacgactgccgtgtccaagccctcaccacgcaccgcggccgcTcc < 2:757191‑M2/3‑1 (MQ=255) aaatgatcgagacctggtggtgattgcggcggcttacctgggtaacacgcggttgatcgacaacctctacctgcatttggaagagaagaccgcataacggtcttgggctgccttgcagcccattcgcgggcaagcccgctcctgcacgtttacctgtaggggcgggcttgcttgcaatgcccccaaaatccccctgccatacccattcccagcacgtggcctttgcctataatggtgccagcctgaacccggcaacgactgccgtgtccaagccctcaccacgcaccgcggccgcTCCGAg < 1:639356‑M2/6‑1 (MQ=255) 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1:254451‑M2/270‑1 (MQ=255) ccaagccctcaccacgcaccgcggccgcTCCGAGCTTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCCTACCAGGCAACGCGTTACCTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTTGAACACCGCTCCCAGCTACA‑CTGTCTTATCGAATAGCCGTTGCAGTCCATCGCCCCTTACACGAGCAGGACCACCCGCCATGTTCGATATCCGCAAATACCCCCAGGCCCTGGCCGTCCGCCAGT‑CCCCCGCCCTCACCCCCGAAGACTACCCCCCCCTCtaccgccacctcgtc > 2:95678‑M2/29‑294 (MQ=255) caagccctcaccacgcaccgcggccgcTCCGAGCTTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCCTACCAGGCAACGCGTTACCTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTTGAACACCGCTCCCAGCTACA‑CTGTCTTATCGAATAGCCGTTGCAGTCCATCGCCCCTTACAAGAGCAGGACCACCCGCCATGTTCGATATCCGCAAATACCCCCAGGCCCTGGCCGTCAGCCAGT‑CCGCCGCCCTCACCCCCGAAGACTACCGCCGCCTCTACCGccagtcgggcg > 1:252535‑M2/28‑298 (MQ=255) caagccctcaccacgcaccgcggccgcTCCGAGCTTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCCTACCAGGCAACGCGTTACCTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTTGAACACCGCTCCCAGCTACA‑CTGTCTTATCGAATAGCCGTTGCAGTCCATCGCCCCTTACAAGAGCAGGACCACCCGCCATGTTCGATATCCGCAAATACCCCCAGGCCCTGGCCGTCAGCCAGT‑CCGCCGCCCTCACCCCCGAAGACTACCGCCGCCTCTACCGCCAgtcggtcg < 4:594539‑M2/274‑1 (MQ=255) aagccctcaccacgcaccgcggccgcTCCGAGCTTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCCTACCAGGCAACGCGTTACCTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTTGAACACCGCTCCCAGCTACA‑CTGTCTTATCGAATAGCCGTTGCAGTCCATCGCCCCTTACAAGAGCAGGACCACCCGCCATGTTCGATATCCGCAAATACCCCCAGGCCCTGGCCGTCAGCCAGT‑CCGCCGCCCTCACCCCCGAAGACTACCGCCGCCTCTACCGCCAGTCGGTCGa > 4:733455‑M2/27‑301 (MQ=255) gccctcaccacgcaccgcggccgcCCCGAGCTTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCCTACCAGGCAACGCGTTACCTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTTGAACACCGCTCCCAGCTACA‑CTGTCTTATCGAATAGCCGTTGCAGTCCATCGCCCCTTACAAGAGCAGGATCACCCGCCATGTTCGATATCCGCAAATACCCCCAGGCCCTGGCCGTCAGCCAGT‑CCGCCGCCCTCACCCCCGAAGACTACCGCCGCCTCTACCGCCAGTCGGTCGAAg < 4:379373‑M2/277‑1 (MQ=255) cacgcaccgcggccgcTCCGAGCTTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCCTACCAGGCAACGCGTTACCTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTTGAACACCGCTCCCAGCTACA‑CTGTCTTATCGAATAGCCGTTGCAGTCCATCGCCCCTTACAAGAGCAGGACCACCCGCCATGTTCGATATCCGCAAATACCCCCAGGCCCTGGCCGTCAGCCAGT‑CCGCCGCCCTCACCCCCGAAGACTACCGCCGCCTCTACCGCCAGTCGGTCGAAGACCCAGac < 3:204636‑M2/285‑1 (MQ=255) cacgcaccgcggccgcTCCGAGCTTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCCTACCAGGCAACGCGTTACCTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTTGAACACCGCTCCCAGCTACA‑CTGTCTTATCGAATAGCCGTTGCAGTCCATCGCCCCTTACAAGAGCAGGACCACCCGCCATGTTCGATATCCGCAAATACCCCCAGGCCCTGGCCGTCAGCCAGT‑CAGCCGCCCTCACCCCTGAAGACTACCGCCGCCTCTACCGCCAGTCGGGCGAAGACCCAGac > 1:548463‑M2/17‑301 (MQ=255) ccaccgcggccgcTCCGAGCTTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCCTACCAGGCAACGCGTTACCTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTTGAACACCGCTCCCAGCTACA‑CTGTCTTATCGAATAGCCGTTGCAGTCCATCGCCCCTTACAAGAGCAGGACCACCCGCCATGTTCGATATCCGCAAATACCCCCAGGCCCTGGCCGTCAGCCAGT‑CCGCCGCCCTCACCCCCGAAGACTACCGCCGCCTCTACCGCCAGTCGGTCGAAGACCCAGACAcc < 4:168597‑M2/288‑1 (MQ=255) ggccgcTCCGAGCTTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCCTACCAGGCAACGCGTTACCTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTTGAACACCGCTCCCAGCTACA‑CTGTCTTATCGAATAGCCGTTGCAGTCCATCGCCCCTTACAAGAGCAGGACCACCCGCCATGTTCGATATCCGCAAATACCCCCAGGCCCTGGCCGTCAGCCAGT‑CCGCCGCCCTCACCCCCGAAGACTACCGCCGCCTCTACCGCCAGTCGGTCGAAGACCCAGACACCTTCTggg < 3:238873‑M2/295‑1 (MQ=255) ggccgcTCCGAGCTTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCCTACCAGGCAACGCGTTACCTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTTGAACACCGCTCCCAGCTACA‑CTGTCTTATCGAATAGCCGTTGCAGTCCATCGCCCCTTACAAGAGCAGGACCACCCGCCATGTTCGATATCCGCAAATACCCCCAGGCCCTGGCCGTCAGCCAGT‑CCGCCGCCCTCACCCCCGAAGACTACCGCCGCCTCTACCGCCAGTCGGTCGAAGACCCAGACACCTTCCggg < 3:238879‑M2/295‑1 (MQ=255) cgcTCCGAGCTTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCCTACCAGGCAACGCGTTACCTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTTGAACACCGCTCCCAGCTACA‑CTGTCTTATCGAATAGCCGTTGCAGTCCATCGCCCCTTACAAGAGCAGGACCACCCGCCATGTTCGATATCCGCAAATACCCCCAGGCCCTGGCCGTCAGCCAGT‑CCGCCGCCCTCACCCCCGAAGACTACCGCCGCCTCTACCGCCAGTCGGTCGAAGACCCAGACACCTTCTGGGCCg < 4:682502‑M2/298‑1 (MQ=255) gcTCCGAGCTTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCCTACCAGGCAACGCGTTACCTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTTGAACACCGCTCCCAGCTACA‑CTGTCTTATCGAATAGCCGTTGCAGTCCATCGCCCCTTACAAGAGCAGGACCACCCGCCATGTTCGATATCCGCAAATACCCCCAGGCCCTGGCCGTCAGCCAGT‑CCGCCGCCCTCACCCCCGAAGACTACCGCCGCCTCTACCGCCAGTCGGTCGAAGACCCAGACACCTTCTGGGCCGa > 3:654828‑M2/3‑301 (MQ=255) | CAGACATCGAAAAGCTGGCCCCGCACAAGGTGATCCCGGGTAACCGCCCGAGCAACACGTTGGTGGTCGAGCGCATCAGCCCGCGCCGGCTGGGTGCGCTGGTGGCCATGTACGAGCACAAGGTGTTCGTACAGAGCGTTATCTGGGGTATCAACGCCTTCGATCAGTGGGGCGTCGAGCTGGGCAAGGAGCTGGGCAAGGGCGTTTACCAGCGCTTGGTCGGTAGCCTGGAAGACAGCGCCGAAGACGGTTCCACCCAAGGCCTGATCAACTACTTCCGCGGCCGTCACCGCGGTTGATCCGAGCTTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCCTACCAGGCAACGCGTTACCTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTTGAACACCGCTCCCAGCTACA‑CTGTCTTATCGAATAGCCGTTGCAGTCCATCGCCCCTTACAAGAGCAGGACCACCCGCCATGTTCGATATCCGCAAATACCCCCAGGCCCTGGCCGTCAGCCAGT‑CCGCCGCCCTCACCCCCGAAGACTACCGCCGCCTCTACCGCCAGTCGGTCGAAGACCCAGACACCTTCTGGGCCGA > AE015451/5344127‑5344724 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |