New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | AE015451 | 2457220 = | 88 (0.830) | 4 (0.040) | 4/582 | 8.2 | 2.5% | coding (291/999 nt) | PP_2150 | putative Thiamine biosynthesis lipoprotein |
? | AE015451 | = 5978413 | 224 (2.180) | coding (704/993 nt) | PP_5241 | DNA‑binding response regulator, LuxR family | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
AAACCCTACTGTGCGCACAGCCCTACTGTTCATTCTGCTGCTACTCACCGCCTGCAACCAAGGCCCCAC‑CCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCTGGTGGCCCGCTGCCGGCCCAGGTGCAGATGGCGGTGGAAACCATCCTGCACGACATCGACCACCACTACTCGACCTACCGCGGCGATTCCATCGTAAGCCAGTTCAACCGCTTGCCTGCGGGCCAGTGCCTGGCTCTGCCGCCTGACATGCTCGCGTTGGTCAGCCTGGGTCAGCACCTTGCCGAGCAGAGCGATGGCGCTTTCGATCTCACCGTAGAGCCATTGCTCGACTTGTGGGGCTTCGGCCCTCAGGCCCGTCACGAGCAAGTGCCCGAACCACAGGCACTGGCCCAGGTGCGCCAGCGTGTGGGTTACCAGCACTTGCGCGTCAAAGGTCGAGCCCTGTGCAAGGATGCCCCGGTGCAGCTCGACTTCAACAGCATCGTCGCCGGTCATGCTGTCGACTTGATCGCTGCGCGCCTGCAGGCCATGGGTGTCAGCAGTTTTGTCGCCGAGGCCACTGGCGA > AE015451/2456920‑2457519 | aaaCCCTACTGTGCGCACAGCCCTACTGTTCATTCTGCTGCTACTCACCGCCTGCAACCAAGGCCCCAC‑CCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCTGGTGGCCCGCTGCCGGCCCAGGTGCAGATGGCGGTGGAAACCATCCTGCACGACATCGACCACCACTACTCGACCTACCGCGGCGATTCCATCGTAAGCCAGTTCAACCGCTTGCCTGCGGGCCAGTGCCTGGCTCTGCCGCCTGACATGCTCGCGTTGGTCAGCCTg > 4:645357/1‑301 (MQ=255) cTACTGTGCGCACAGCCCTACTGTTCATTCTGCTGCTACTCACCGCCTGCAACCAAGGCCCCAC‑CCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCTGGTGGCCCGCTGCCGGCCCAGGTGCAGATGGCGGTGGAAACCATCCTGCACGACATCGACCACCACTACTCGACCTACCGCGGCGATTCCATCGTAAGCCAGTTCAACCGCTTGCCTGCGGGCCAGTGCCTGGCTCTGCCGCCTGACCTGCTCGCGTTGGTCAGCCTGGGTcc > 2:303895/1‑300 (MQ=255) tgtgCGCACAGCCCTACTGTTCATTCTGCTGCTACTCACCGCCTGCAACCAAGGCCCCAC‑CCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCTGGTGGCCCGCTGCCGGCCCAGGTGCAGATGGCGGTGGAAACCATCCTGCACGACATCGACCACCACTACTCGACCTACCGCGGCGATTCCATCGTAAGCCAGTTCAACCGCTTGCCTGCGGGCCAGTGCCTGGCTCTGCCGCCTGACATGCTCGCGTTGGTCAGCCTGGGTCAGCAc > 4:668265/1‑301 (MQ=255) ccccaGCCCTACTGTTCATCCTGCTGGTACTCACCGCCTGCAACCAAGG‑CCCACACCGGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCAGCCAGTACGTCCGCGAGCCTGGTGGCCCGCTGCCGGCCCAGGTGCAGATGGCGGTGGAAACCATCCTGCACGACATCGACCACCACTACTCGACCTACCGCGGCGATTCCATCGTAAGCCAGTTCAACCGCTTGCCTGCGGGCCAGTGCCTGGCTCTGCCGCCTGACATGCTCGCGTTGGTCAGCCTGGGTCAGCACCTTGc < 2:645145/298‑1 (MQ=255) cccTACTGTTCATTCTGCTGCTACTCACCGCCTGCAACCAAGGCCCCAC‑CCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCTGGTGGCCCGCTGCCGGCCCAGGTGCAGATGGCGGTGGAAACCATCCTGCACGACATCGACCACCACTACTCGACCTACCGCGGCGATTCCATCGTAAGCCAGTTCAACCGCTTGCCTGCGGGCCAGTGCCTGGCTCTGCCCCCTGACATTCCCGCGTGTGTCAGCCTGCGTTACCACCttccccgccc > 2:351570/1‑293 (MQ=255) cTACTGTTCATTCTGCTGCTACTCACCGCCTGCAACCAAGGCCCCAC‑CCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCTGGTGGCCCGCTGCCGGCCCAGGTGCAGATGGCGGTGGAAACCATCCTGCACGACATCGACCACCACTACTCGACCTACCGCGGCGATTCCATCGTAAGCCAGTTCAACCGCTTGCCTGCGGGCCAGTGCCTGGCTCTGCCGCCTGACATGCTCGCGTTGGTCAGCCTGGGTCAGCACCTTGCCGAGCagg > 4:411887/1‑300 (MQ=255) cTACTGTTCATTCTGCTGCTACTCACCGCCTGCAACCAAGGCCCCAC‑CCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCTGGTGGCCCGCTGCCGGCCCAGGTGCAGATGGCGGTGGAAACCATCCTGCACGACATCGACCACCACTACTCGACCTACCGCGGCGATTCCATCGTAAGCCAGTTCAACCGCTTGCCTGCGGGCCAGTGCCTGGCTCTGCCGCCTGACATGCTCGCGTTGGTCAGCCTGGGTCAGCACCTTGCCGAGCaga > 3:556443/1‑301 (MQ=255) caCTGTTCATTCTGCTGCTACTCACCGCCTGCAACCACGGCCCCAC‑CCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCTGGTGGCCCGCTGCCGGCCCAGGTGCAGATGGCGGTGGAAACCATCCTGCACGACATCGACCACCACTACTCGACCTACCGCGGCGATTCCATCGTAAGCCAGTTCAACCGCTTGCCTGCGGGCCAGTGCCTGGCTCTGCCGCCTGACATGCTCGCGTTGGTCAGCCTGGGTCAGCACCTTGCCGAGCagag < 2:668044/300‑1 (MQ=255) cTGTTCATTCTGCTGCTACTCACCGCCTGCAACCAAGGCCCCAC‑CCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCTGGTGGCCCGCTGCCGGCCCAGGTGCAGATGGCGGTGGAAACCATCCTGCACGACATCGACCACCACTACTCGACCTACCGCGGCGATTCCATCGTAAGCCAGTTCAACCGCTTGCCTGCGGGCCAGTGCCTGGCTCTGCCGCCTGCCATGCTCGCGTTGGTCAGCCTGGGTCAGCACCTTGCCGAGCAGAGCg > 1:613949/1‑301 (MQ=255) tCTGCTGCTACTCACCGCCTGCAACCAAGGCCCCAC‑CCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCTGGTGGCCCGCTGCCGGCCCAGGTGCAGATGGCGGTGGAAACCATCCTGCACGACATCGACCACCACTACTCGACCTACCGCGGCGATTCCATCGTAAGCCAGTTCAACCGCTTGCCTGCGGGCCAGTGCCTGGCTCTGCCGCCTGACATGCTCGCGTTGGTCAGCCTGGGTCAGCACCTTGCCGAGCAGAGCGATGGCGCt < 4:303976/301‑1 (MQ=255) tgctgcTACTCACCGCCTGCAACCAAGGCCCCAC‑CCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCTGGTGGCCCGCTGCCGGCCCAGGTGCAGATGGCGGTGGAAACCATCCTGCACGACATCGACCACCACTACTCGACCTACCGCGGCGATTCCATCGTAAGCCAGTTCAACCGCTTGCCTGCGGGCCAGTGCCTGGCTCTGCCGCCTGACATGCTCGCGTTGGTCAGCCTGGGTCAGCACCTTGCCGAGCAGAGCGATGGCGCttt < 3:613961/301‑1 (MQ=255) cctgctACGCACCGCCTGCAACCACGGCCCCAC‑CCTTGAGCGCCTGGGTTGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCTGGTGGCCCGCTGCCGGCCCAGGTGCAGATGGCGGTGGAAACCATCCTGCACGACATCGACCACCACTACTCGACCTACCGCGGCGATTCCATCGTAAGCCAGTTCAACCGCTTGCCTGCGGGCCAGTGCCTGGCTCTGCCGCCTGACATGCTCGCGTTGGTCAGCCTGGGTCAGCACCTTGCCGAGCAGAGCGATGGCGCTTTc < 2:411765/300‑1 (MQ=255) ctgctACTCACCGCCTGCAACCAAGGCCCCAC‑CCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCTGGTGGCCCGCTGCCGGCCCAGGTGCAGATGGCGGTGGAAACCATCCTGCACGACATCGACCACCACTACTCGACCTACCGCGGCGATTCCATCGTAAGCCAGTTCAACCGCTTGCCTGCGGGCCAGTGCCTGGCTCTGCCGCCTGACATGCTCGCGTTGGTCAGCCTGGGTCAGCACCTTGCCGAGCAGAGCGATGGCGCTTTCg > 3:464237/1‑301 (MQ=255) ctgctACTCACCGCCTGCAACCAAGGCCCCAC‑CCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCTGGTGGCCCGCTGCCGGCCCAGGTGCAGATGGCGGTGGAAACCATCCTGCACGACATCGACCACCACTACTCGACCTACCGCGGCGATTCCATCGTAAGCCAGTTCAACCGCTTGCCTGCGGGCCAGTGCCTGGCTCTGCCGCCTGACATGCTCGCGTTGGTCAGCCTGGGTCAGCACCTTGCCGAGCAGAGCGATGGCGCTTTCg > 1:558577/1‑301 (MQ=255) cctACTCACCGCCTGCAACCAAGGCCCCAC‑CCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCTGGTGGCCCGCTGCCGGCCCAGGTGCAGATGGCGGTGGAAACCATCCTGCACGACATCGACCACCACTACTCGACCTACCGCGGCGATTCCATCGTAAGCCAGTTCAACCGCTTGCCTGCGGGCCAGTGCCTGGCTCTGCCGCCTGACATGCTCGCGTTGGTCAGCCTGGGTCAGCACCTTGCCGAGCAGAGCGATGGCGCTTTCGAt < 3:640497/300‑1 (MQ=255) cTCACCGCCTGCAACCAAGGCCCCAC‑CCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCTGGTGGCCCGCTGCCGGCCCAGGTGCAGATGGCGGTGGAAACCATCCTGCACGACATCGACCACCACTACTCGACCTACCGCGGCGATTCCATCGTAAGCCAGTTCAACCGCTTGCCTGCGGGCCAGTGCCTGGCTCTGCCGCCTGACATGCTCGCGTTGGTCAGCCTGGGTCAGCACCTTGCCGAGCAGAGCGATGGCGCTTTCGATCTCa < 4:248626/301‑1 (MQ=255) ccACCGCCTGCAACCAAGGCCCCAC‑CCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCTGGTGGCCCGCTGCCGGCCCAGGTGCAGATGGCGGTGGAAACCATCCTGCACGACATCGACCACCACTACTCGACCTACCGCGGCGATTCCATCGTAAGCCAGTTCAACCGCTTGCCTGCGGGCCAGTGCCTGGCTCTGCCGCCTGACATGCTCGCGTTGGTCAGCCTGGGTCAGCACCTTGCCGAGCAGAGCGATGGCGCTTTCGATCTCAc < 2:571284/300‑1 (MQ=255) cACCGCCTGCAACCAAGGCCCCAC‑CCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCTGGTGGCCCGCTGCCGGCCCAGGTGCAGATGGCGGTGGAAACCATCCTGCACGACATCGACCACCACTACTCGACCTACCGCGGCGATTCCATCGTAAGCCAGTTCAACCGCTTGCCTGCGGGCCAGTGCCTGGCTCTGCCGCCTGACATGCTCGCGTTGGTCAGCCTGGGTCAGCACCTTGCCGAGCAGAGCGATGGCGCTTTCGATCTCAca > 4:571463/1‑300 (MQ=255) ccGCCTGCAACCAAGGCCCCAC‑CCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCTGGTGGCCCGCTGCCGGCCCAGGTGCAGATGGCGGTGGAAACCATCCTGCACGACATCGACCACCACTACTCGACCTACCGCGGCGATTCCATCGTAAGCCAGTTCAACCGCTTGCCTGCGGGCCAGTGCCTGGCTCTGCCGCCTGACATGCTCGCGTTGGTCAGCCTGGGTCAGCACCTTGCCGAGCAGAGCGATGGCGCTTTCGATCTCACCGt < 3:344369/301‑1 (MQ=255) cGCCTGCAACCAAGGCCCCAC‑CCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCTGGTGGCCCGCTGCCGGCCCAGGTGCAGATGGCGGTGGAAACCATCCTGCACGACATCGACCACCACTACTCGACCTACCGCGGCGATTCCATCGTAAGCCAGTTCAACCGCTTGCCTGCGGGCCAGTGCCTGGCTCTGCCGCCTGACATGCTCGCGTTGGTCAGCCTGGGTCAGCACCTTGCCGAGCAGAGCGATGGCGCTTTCGATCTCACCGtt > 1:344359/1‑300 (MQ=255) tgtgctcttccgatctaC‑CCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCTGGTGGCCCGCTGCCGGCCCAGGTGCAGATGGCGGTGGAAACCATCCTGCACGACATCGACCACCACTACTCGACCTACCGCGGCGATTCCATCGTAAGCCAGTTCAACCGCTTGCCTGCGGGCCAGTGCCTGGCTCTGCCGCCTGACATGCTCGCGTTGGTCAGCCTGGGTCAGCACCTTGCCGAGCAGAGCGATGGCGCTTTCGATCTCACCGTagag < 4:574344/285‑1 (MQ=255) aaCCAAGGCCCCAC‑CCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCTGGTGGCCCGCTGCCGGCCCAGGTGCAGATGGCGGTGGAAACCATCCTGCACGACATCGACCACCACTACTCGACCTACCGCGGCGATTCCATCGTAAGCCAGTTCAACCGCTTGCCTGCGGGCCAGTGCCTGGCTCTGCCGCCTGACATGCTCGCGTTGGTTAGCCTGGGTCAGCACCTTGCCGAGCAGAGCGATGGCGCTTTCGATCTCACCGTAGAGCCAt > 3:537357/1‑301 (MQ=255) cAAGGCCCCAC‑CCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCTGGTGGCCCGCTGCCGGCCCAGGTGCAGATGGCGGTGGAAACCATCCTGCACGACATCGACCACCACTACTCGACCTACCGCGGCGATTCCATCGTAAGCCAGTTCAACCGCTTGCCTGCGGGCCAGTGCCTGGCTCTGCCGCCTGACATGCTCGCGTTGGTCAGCCTGGGTCAGCACCTTGCCGAGCAGAGCGATGGCGCTTTCGATCTCACCGTAGAGCCATTGc > 4:72154/1‑301 (MQ=255) ccAC‑CCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCTGGTGGCCCGCTGCCGGCCCAGGTGCAGATGGCGGTGGAAACCATCCTGCACGACATCGACCACCACTACTCGACCTACCGCGGCGATTCCATCGTAAGCCAGTTCAACCGCTTGCCTGCGGGCCAGTGCCTGGCTCTGCCGCCTGACATGCTCGCGTTGGTTAGCCTGGGTCAGCACCTTGCCGAGCAGAGCGATGGCGCTTTCGATCTCACCGTAGAGCCATTGCTCGACtt < 1:537344/301‑1 (MQ=255) aC‑CCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCTGGTGGCCCGCTGCCGGCCCAGGTGCAGATGGCGGTGGAAACCATCCTGCACGACATCGACCACCACTACTCGACCTACCGCGGCGATTCCATCGTAAGCCAGTTCAACCGCTTGCCTGCGGGCCAGTGCCTGGCTCTGCCGCCTGACATGCTCGCGTTGGTCAGCCTGGGTCAGCCCCTTGCCGAGCAGAGCGATGGCGCTTTCGATCTCACCGTagcgcgatcggaagagcgtc > 2:574165/1‑283 (MQ=255) aC‑CCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCTGGTGGCCCGCTGCCGGCCCAGGTGCAGATGGCGGTGGAAACCATCCTGCACGACATCGACCACCACTACTCGACCTACCGCGGCGATTCCATCGTAAGCCAGTTCAACCGCTTGCCTGCGGGCCAGTGCCTGGCTCTGCCGCCTGACATGCTCGCGTTGGTCAGCCTGGGTCAGCACCTTGCCGAGCCGAGCGATGGCGCGTTCCATCCCACCGTAGAGCCATTGCCCGGCTtgt > 2:582849/1‑301 (MQ=255) ccTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCTGGTGGCCCGCTGCCGGCCCAGGTGCAGATGGCGGTGGAAACCATCCTGCACGACATCGACCACCACTACTCGACCTACCGCGGCGATTCCATCGTAAGCCAGTTCAACCGCTTGCCTGCGGGCCAGTGCCTGGCTCTGCCGCCTGACATGCTCGCGTTGGTCAGCCTGGGTCAGCACCTTGCCGAGCAGAGCGATGGCGCTTTCGATCTCACCGTAGAGCCATTGCTCGACTTGTgg < 3:558589/301‑1 (MQ=255) tGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCTGGTGGCCCGCTGCCGGCCCAGGTGCAGATGGCGGTGGAAACCATCCTGCACGACATCGACCACCACTACTCGACCTACCGCGGCGATTCCATCGTAAGCCAGTTCAACCGCTTGCCTGCGGGCCAGTGCCTGGCTCTGCCGCCTGACATGCTCGCGTTGGTCAGCCTGGGTCAGCACCTTGCCGAGCAGAGCGATGGCGCTTTCGATCTCACCGTAGAGCCATTGCTCGACTTGTgggg < 4:186257/301‑1 (MQ=255) ggtggtCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCTGGTGGCCCGCTGCCGGCCCAGGTGCAGATGGCGGTGGAAACCATCCTGCACGACATCGACCACCACTACTCGACCTACCGCGGCGATTCCATCGTAAGCCAGTTCAACCGCTTGCCTGCGGGCCAGTGCCTGGCTCTGCCGCCTGACATGCTCGCGTTGGTCAGCCTGGGTCAGCACCTTGCCGAGCAGAGCGATGGCGCTTTCGATCTCACCGTAGAGCCATTGCTCGACTTGTGGGGCTTCGGCCCTc < 4:371955/301‑1 (MQ=255) gtggtCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCTGGTGGCCCGCTGCCGGCCCAGGTGCAGATGGCGGTGGAAACCATCCTGCACGACATCGACCACCACTACTCGACCTACCGCGGCGATTCCATCGTAAGCCAGTTCAACCGCTTGCCTGCGGGCCAGTGCCTGGCTCTGCCGCCTGACATGCTCGCGTTGGTCAGCCTGGGTCAGCACCTTGCCGAGCAGAGCGATGGCGCTTTCGATCTCACCGTAGAGCCATTGCTCGCCTTGTGGGGCTTCGGCCCTcg > 4:48822/1‑300 (MQ=255) tggtCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCTGGTGGCCCGCTGCCGGCCCAGGTGCAGATGGCGGTGGAAACCATCCTGCACGACATCGACCACCACTACTCGACCTACCGCGGCGATTCCATCGTAAGCCAGTTCAACCGCTTGCCTGCGGGCCAGTGCCTGGCTCTGCCGCCTGACATGCTCGCGTTGGTCAGCCTGGGTCAGCACCTTGCCGAGCAGAGCGATGGCGCTGTCGATCTCACCGGAGAGCCATCGCTCGACTTGTGGGGCTGCGGcacccag > 2:320865/1‑295 (MQ=255) ggtCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCTGGTGGCCCGCTGCCGGCCCAGGTGCAGATGGCGGTGGAAACCATCCTGCACGACATCGACCACCACTACTCGACCTACCGCGGCGATTCCATCGTAAGCCAGTTCAACCGCTTGCCTGCGGGCCAGTGCCTGGCTCTGCCGCCTGACATGCTCGCGTTGGTCAGCCTGGGTCAGCACCTTGCCGAGCAGAGCGATGGCGCTTTCGATCTCACCGTAGAGCCATTGCTCGACTTGTGGGGCTTCGGCCCTCAgg > 1:623476/1‑301 (MQ=255) gtCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCTGGTGGCCCGCTGCCGGCCCAGGTGCAGATGGCGGTGGAAACCATCCTGCACGACATCGACCACCACTACTCGACCTACCGCGGCGATTCCATCGTAAGCCAGTTCAACCGCTTGCCTGCGGGCCAGTGCCTGGCTCTGCCGCCTGACATGCTCGCGTTGGTCAGCCTGGGTCAGCACCTTGCCGAGCAGAGCGATGGCGCTTTCGATCTCACCGTAGAGCCATTGCTCGACTTGTGGGGCTTCGGCCCTCAGGc > 3:40462/1‑301 (MQ=255) gtCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCTGGTGGCCCGCTGCCGGCCCAGGTGCAGATGGCGGTGGAAACCATCCTGCACGACATCGACCACCACTACTCGACCTACCGCGGCGATTCCATCGTAAGCCAGTTCAACCGCTTGCCTGCGGGCCAGTGCCTGGCTCTGCCGCCTGACATGCTCGCGTTGGTCAGCCTGGGTCAGCACCTTGCCGAGCAGAGCGATGGCGCTTTCGATCTCACCGTAGAGCCATAGCTCGACTTGTGGGGCTTCGGCCCTCAGGc < 4:320953/301‑1 (MQ=255) cccATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCTGGTGGCCCGCTGCCGGCCCAGGTGCAGATGGCGGTGGAAACCATCCTGCACGACATCGACCACCACTACTCGACCTACCGCGGCGATTCCATCGTAAGCCAGTTCAACCGCTTGCCTGCGGGCCAGTGCCTGGCTCTGCCGCCTGACATGCTCGCGTTGGTCAGCCTGGGTCAGCACCTTGCCGAGCAGAGCGATGGCGCTTTCGATCTCACCGTAGAGCCATTGCTCGACTTGTGGGGCTTCGGCCCTCAGGCCCGTc < 4:857305/300‑1 (MQ=255) cagcTACAGCACCCAGTACGTCCGCGAGCCTGGTGGCCCGCTGCCGGCCCAGGTGCAGATGGCGGTGGAAACCATCCTGCACGACATCGACCACCACTACTCGACCTACCGCGGCGATTCCATCGTAAGCCAGTTCAACCGCTTGCCTGCGGGCCAGTGCCTGGCTCTGCCGCCTGACATGCTCGCGTTGGTCAGCCTGGGTCAGCACCTTGCCGAGCAGAGCGATGGCGCTTTCGATCTCACCGTAGAGCCATTGCTCGACTTGTGGGGCTTCGGCCCTCAGGCCCGTCACGAGCAAGTg < 1:464226/301‑1 (MQ=255) gtctacggaatcccggccGTCCGCGGTCCTGGTGGCCCGCTGCCTGCCCAGGTGCATATGGCGGTGGAAACCATCCTGCACGACATCTACCACCACTACTCGACCTACCGCGGCTATTCCATCGTAAGCCAGTTCAACCGCTTGCCTGCGGGCCAGTGCCTGGCTCTGCCGCCTGACATGCTCGCGTTGGTCAGCCTGGGTCAGCACCTTGCCGAGCAGAGCGATGGCGCTTTCGATCTCACCGTAGAGCCATTGCTCGACTTGTGGGGCTTCGGCCCTCAGGCCCGTCACGAGCAAGTGc < 2:48804/284‑1 (MQ=255) 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aGTACGTCCGCGAGCCTGGTGGCCCGCTGCCGGCCCAGGTGCAGATGGCGGTGGAAACCATCCTGCACGACATCGACCACCACTACTCGACCTACCGCGGCGATTCCATCGTAAGCCAGTTCAACCGCTTGCCTGCGGGCCAGTGCCTGGCTCTGCCGCCTGACATGCTCGCGTTGGTCAGCCTGGGTCAGCACCTTGCCGAGCAGAGCGATGGCGCTTTCGATCTCACCGTAGAGCCATTGCTCGACTTGTGGGGCTTCGGCCCTCAGGCCCGTCCCGAGCAAGTGCCCGAACcaccggg > 1:195910/1‑297 (MQ=255) tCCGCGAGCCTGGTGGCCCGCTGCCGGCCCAGGTGCAGATGGCGGTGGAAACCATCCTGCACGACATCGACCACCACTACTCGACCTACCGCGGCGATTCCATCGTAAGCCAGTTCAACCGCTTGCCTGCGGGCCAGTGCCTGGCTCTGCCGCCTGACATGCTCGCGTTGGTCAGCCTGGGTCAGCACCTTGCCGAGCAGAGCGATGGCGCTTTCGATCTCACCGTAGAGCCATTGCTCGACTTGTGGGGCTTCGGCCCTCAGGCCCGTCACGAGCAAGTGCCCGAACCACAGGCACTGGc < 4:583039/301‑1 (MQ=255) cgAGCCTGGTGGCCCGCTGCCGGCCCAGGTGCAGATGGCGGTGGAAACCATCCTGCACGACATCGACCACCACTACTCGACCTACCGCGGCGATTCCATCGTAAGCCAGTTCAACCGCTTGCCTGCGGGCCAGTGCCTGGCTCTGCCGCCTGACATGCTCGCGTTGGTCAGCCTGGGTCAGCACCTTGCCGAGCAGAGCGATGGCGCTTTCGATCTCACCGTAGAGCCATTGCTCGACTTGTGGGGCTTCGGCCCTCAGGCCCGTCACGAGCAAGTGCCCGAACCACAGGCACTGGCCCAg < 1:556431/301‑1 (MQ=255) 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AAACCCTACTGTGCGCACAGCCCTACTGTTCATTCTGCTGCTACTCACCGCCTGCAACCAAGGCCCCAC‑CCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCTGGTGGCCCGCTGCCGGCCCAGGTGCAGATGGCGGTGGAAACCATCCTGCACGACATCGACCACCACTACTCGACCTACCGCGGCGATTCCATCGTAAGCCAGTTCAACCGCTTGCCTGCGGGCCAGTGCCTGGCTCTGCCGCCTGACATGCTCGCGTTGGTCAGCCTGGGTCAGCACCTTGCCGAGCAGAGCGATGGCGCTTTCGATCTCACCGTAGAGCCATTGCTCGACTTGTGGGGCTTCGGCCCTCAGGCCCGTCACGAGCAAGTGCCCGAACCACAGGCACTGGCCCAGGTGCGCCAGCGTGTGGGTTACCAGCACTTGCGCGTCAAAGGTCGAGCCCTGTGCAAGGATGCCCCGGTGCAGCTCGACTTCAACAGCATCGTCGCCGGTCATGCTGTCGACTTGATCGCTGCGCGCCTGCAGGCCATGGGTGTCAGCAGTTTTGTCGCCGAGGCCACTGGCGA > AE015451/2456920‑2457519 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |