| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | AE015451 | = 4769220 | 81 (0.770) | 4 (0.040) | 4/578 | 8.2 | 2.5% | coding (10047/10413 nt) | pvdD | non‑ribosomal peptide synthetase |
| ? | AE015451 | 5772390 = | 231 (2.270) | coding (573/2004 nt) | betT‑I | Choline transporter | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
AGGGTGGCCTCATGCGGCACCTGGAAGTGCCCACAGGCCAGCAGCCGCGCAGTGTCCAGGGCCTGGCCAAGCTGCGCGGCCAAGGCTTCGCGCTCATCGTCACGGCCCGCTACCCACCAACTGTGCGGTACCACCTGCACGGGCTGGCACGTGTGCAGCTCACGCGACAGGCGCTTGAGGCTGCGCGCAGTGATGAACACCTGGGTCAGTTCATCGACGCCCAACCC‑CGTCGCCCCCTGCCTGTTGCCCAGTGCCTGCGTGATCAGCGCCCGCGCACTCCCCTCGCCTTCCGGCAGCGCCACATCACGCTTCACGGGCTGCGC‑CGAGGGTACGGTGGCCTGCAACAGCTCGTTCAAATCGTCCAGCCAATGATCGACTTGCAGGTGGGTTTGCGTGCTGGGCACGAAGCTGTCCAGCAGCGCGAGCAACTCCACGCGCTCACCCTGCCCTTCCAGCACCGCCGCCATCAGTGACGCCAAGGTGCCGCCGAGCGACCAGCCCAGCAAGCGGTACGGGCCATGCGGCTGCTGTTCACGCAGGCAGGCAACGTAGTCGCTGGCCATGCTCTGCAGCGACGCTTCCTGCCAGGCACCGTC > AE015451/4768921‑4769516 | aGGGTGGCCTCATGCGGCACCTGGAAGTGCCCACAGGCCAGCAGCCGCGCAGTGTCCAGGGCCTGGCCAAGCTGCGCGGCCAAGGCTTCGCGCTCATCGTCACGGCCCGCTACCCACCAACTGTGCGGTACCACCTGCACGGGCTGGCACGTGTGCAGCTCACGCGACAGGCGCTTGAGGCTGCGCGCAGTGATGAACACCTGGGTCAGTTCATCGACGCCCAACCC‑CGTCGCCCCCTGCCTGTTGCCCAGTGCCTGCGTGATCAGCGCCCGCGCACTCCCCTCTCCTTCCGGCACCGccc > 2:825084/1‑300 (MQ=255) gTGGCCTCATGCGGCACCTGGAAGTGCCCACAGGCCAGCAGCCGCGCAGTGTCCAGGGCCTGGCCAAGCTGCGCGGCCAAGGCTTCGCGCTCATCGTCACGGCCCGCTACCCACCAACTGTGCGGTACCACCTGCACGGGCTGGCACGTGTGCAGCTCACGCGACAGGCGCTTGAGGCTGCGCGCAGTGATGAACACCTGGGTCAGTTCATCGACGCCCAACCC‑CGTCGCCCCCTGCCTGTTGCCCAGTGCCTGCGTGATCAGCGCCCGCGCACTCCCCTCGCCTTCCGGCAGCGCCACAt < 1:551388/301‑1 (MQ=255) ggaaCCTGGAAGTGCCCACAGGCCAGCAGCCGCGCAGTGTCCAGGGCCTGGCCAAGCTGCGCGGCCAAGGCTTCGCGCTCATCGTCACGGCCCGCTACCCACCAACTGTGCGGTACCACCTGCACGGGCTGGCACGTGTGCAGCTCACGCGACAGGCGCTTGAGGCTGCGCGCAGTGATGAACACCTGGGTCAGTTCATCGACGCCCAACCC‑CGTCGCCCCCTGCCTGTTGCCCAGTGCCTGCGTGATCAGCGCCCGCGCACTCCCCTCGCCTTCCGGCAGCGCCACATCACGCTTCACgg < 3:287266/298‑1 (MQ=255) atcTGGAAGTGCCCACAGGCCAGCAGCCGCGCAGTGTCCAGGGCCTGGCCAAGCTGCGCGGCCAAGGCTTCGCGCTCATCGTCACGGCCCGCTACCCACCAACTGTGCGGTACCACCTGCACGGGCTGGCACGTGTGCAGCTCACGCGACAGGCGCTTGAGGCTGCGCGCAGTGATGAACACCTGGGTCAGTTCATCGACGCCCAACCC‑CGTCGCCCCCTGCCTGTTGCCCAGTGCCTGCGTGATCAGCGCCCGCGCACTCCCCTCGCCTTCCGGCAGCGCCACATCACGCTTCACGGGCt < 4:200752/299‑1 (MQ=255) ggAAGTGCCCACAGGCCAGCAGCCGCGCAGTGTCCAGGGCCTGGCCAAGCTGCGCGGCCAAGGCTTCGCGCTCATCGTCACGGCCCGCTACCCACCAACTGTGCGGTACCACCTGCACGGGCTGGCACGTGTGCAGCTCACGCGACAGGCGCTTGAGGCTGCGCGCAGTGATGAACACCTGGGTCAGTTCATCGACGCCCAACCC‑CGTCGCCCCCTGCCTGTTGCCCAGTGCCTGCGTGATCAGCGCCCGCGCACTCCCCCCGCCTTCCGGCAGCGCCCCCTCCCGCTTccccggccagtc > 2:200701/1‑290 (MQ=255) gAAGTGCCCACAGGCCAGCAGCCGCGCAGTGTCCAGGGCCTGGCCAAGCTGCGCGGCCAAGGCTTCGCGCTCATCGTCACGGCCCGCTACCCACCAACTGTGCGGTACCACCTGCACGGGCTGGCACGTGTGCAGCTCACGCGACAGGCGCTTGAGGCTGCGCGCAGTGATGAACACCTGGGTCAGTTCATCGACGCCCAACCC‑CGTCGCCCCCTGCCTGTTGCCCAGTGCCTGCGTGATCAGCGCCCGCGCACTCCCCTCGCCTTCCGGCAGCGCCACATCACGCTTCACGGGCTGCGc‑c > 3:135277/1‑301 (MQ=255) gCCCACAGGCCAGCAGCCGCGCAGTGTCCAGGGCCTGGCCAAGCTGCGCGGCCAAGGCTTCGCGCTCATCGTCACGGCCCGCTACCCACCAACTGTGCGGTACCACCTGCACGGGCTGGCACGTGTGCAGCTCACGCGACAGGCGCTTGAGGCTGCGCGCAGTGATGAACACCTGGGTCAGTTCATCGACGCCCAACCC‑CGTCGCCCCCTGCCTGTTGCCCAGTGCCTGCGTGATCAGCGCCCGCGCACTCCCCTCGCCTTCCGGCAGCGCCACATCACGCTTCACGGGCTGCGC‑CGAggg > 1:563186/1‑301 (MQ=255) cccACAGCCCAGCAGCCGCGCCGTGTCCAGGGCCTGGCAAAGCTGCGCGGCCAAGGCTTCGCGCTCATCGTCACGGCCCGCTACCAACCAACTGTGCGGTACCACCTGCACGGGCTGGCACGTGTGCAGCTCACGCGACAGGCGCTTGAGGCTGCGCGCAGTGATGAACACCTGGGTCAGTTCATCGACGCCCAACCC‑CGTCGCCCCCTGCCTGTTGCCCAGTGCCTGCGTGATCAGCGCCCGCGCACTCCCCTCGCCTTCCGGCAGCGCCACATCACGCTTCACGGGCTGCGC‑CGAGGGt < 2:11896/301‑1 (MQ=255) caGGCCAGCAGCCGCGCAGTGTCCAGGGCCTGGCCAAGCTGCGCGGCCAAGGCTTCGCGCTCATCGTCACGGCCCGCTACCCACCAACTGTGCGGTACCACCTGCACGGGCTGGCACGTGTGCAGCTCACGCGACAGGCGCTTGAGGCTGCGCGCAGTGATGAACACCTGGGTCAGTTCATCGACGCCCAACCC‑CGTCGCCCCCTGCCTGTTGCCCAGTGCCTGCGTGATCAGCGCCCGCGCACTCCCCTCACCTTCCGGCAGCGCCACATCACGCTTCACGGGCTGCGC‑CGAGGGTACgg > 4:298205/1‑301 (MQ=255) ggCCAGCAGCCGCGCAGTGTCCAGGGCCTGGCCAAGCTGCGCGGCCAAGGCTTCGCGCTCATCGTCACGGCCCGCTACCCACCAACTGTGCGGTACCACCTGCACGGGCTGGCACGTGTGCAGCTCACGCGACAGGCGCTTGAGGCTGCGCGCAGTGATGAACACCTGGGTCAGTTCATCGACGCCCAACCC‑CGTCGCCCCCTGCCTGTTGCCCAGTGCCTGCGTGATCAGCGCCCGCGCACTCCCCTCGCCTTCCGGCAGCGCCACATCCCGCTTCACGGGCTTCGC‑CGAGGGTACGGTg > 1:559039/1‑301 (MQ=255) ccccttccgatctggggccAGGGCCTGGCCAAGCTGCGCGGCCAAGGCTTCGCGCTCATCGTCACGGCCCGCTACCCACCAACTGTGCGGTACCACCTGCACGGGCTGGCACGTGTGCAGCTCACGCGACAGGCGCTTGAGGCTGCGCGCAGTGATGAACACCTGGGTCAGTTCATCGACGCCCAACCC‑CGTCGCCCCCTGCCTGTTGCCCAGTGCCTGCGTGATCAGCGCCCGCGCACTCCCCTCGCCTTCCGGCAGCGCCACATCACGCTTCACGGGCTGCGC‑CGAGGGTACGGTGGcc < 2:404630/284‑1 (MQ=255) atctagcCGCGCAGTGTCCAGGGCCTGGCCAAGCTGCGCGGCCAAGGCTTCGCGCTCATCGTCACGGCCCGCTACCCACCAACTGTGCGGTACCACCTGCACGGGCTGGCACGTGTGCAGCTCACGCGACAGGCGCTTGAGGCTGCGCGCAGTGATGAACACCTGGGTCAGTTCATCGACGCCCAACCC‑CGTCGCCCCCTGCCTGTTGCCCAGTGCCTGCGTGATCAGCGCCCGCGCACTCCCCTCGCCTTCCGGCAGCGCCACATCACGCTTCACGGGCTGCGC‑CGAGGGTACGGTGGcc < 4:616787/297‑1 (MQ=255) agcCGCGCAGTGTCCAGGGCCTGGCCAAGCTGCGCGGCCAAGGCTTCGCGCTCATCGTCACGGCCCGCTACCCACCAACTGTGCGGTACCACCTGCACGGGCTGGCACGTGTGCAGCTCACGCGACAGGCGCTTGAGGCTGCGCGCAGTGATGAACACCTGGGTCAGTTCATCGACGCCCAACCC‑CGTCGCCCCCTGCCTGTTGCCCAGTGCCTGCGTGATCAGCGCCCGCGCAACCCCCTCGCCTTCCGGCAGCGCCACATCCCGCTTCCCGGGCTG‑GCGCGGGGGTACGGTGGccaggc > 2:812873/1‑297 (MQ=255) agcCGCGCAGTGTCCAGGGCCTGGCCAAGCTGCGCGGCCAAGGCTTCGCGCTCATCGTCACGGCCCGCTACCCACCAACTGTGCGGTACCACCTGCACGGGCTGGCACGTGTGCAGCTCACGCGACAGGCGCCTGAGGCTGCGCGCAGTGATGAACACCTGGGTCAGTTCATCGACGCCCAACCC‑CGTCGCCCCCTGCCTGTTGCCCAGTGCCTGCGTGATCAGCGCCCGCGCACTCCCCTCGCCTTCCGGCAGCGCCACATCACGCTGCACGGGCTGCGC‑CGAGGGTACGGTGGccagag > 2:616588/1‑297 (MQ=255) gcCGCGCAGTGTCCAGGGCCTGGCCAAGCTGCGCGGCCAAGGCTTCGCGCTCATCGTCACGGCCCGCTACCCACCAACTGTGCGGTACCACCTGCACGGGCTGGCACGTGTGCAGCTCACGCGACAGGCGCTTGAGGCTGCGCGCAGTGATGAACACCTGGGTCAGTTCATCGACGCCCAACCC‑CGTCGCCCCCTGCCTGTTGCCCAGTGCCTGCGTGATCAGCGCCCGCGCACTCCCCTCGCCTTCCGGCAGCGCCACATCACGCTTCACGGGCTGCGC‑CGAGGGTACGGTGGCCTGCaa > 3:99832/1‑301 (MQ=255) cgcgcgGTGTCCAGGGCCGGGCCAAGCTGCGCGGCCAAGGCTTCGCGCTCATCGTCACGGCCCGCTACCCACCAACTGTGCGGTACCACCTGCACGGGCTGGCACGTGTGCAGCTCACGCGACAGGCGCTTGAGGCTGCGCGCAGTGATGAACACCTGGGTCAGTTCATCGACGCCCAACCC‑CGTCGCCCCCTGCCTGTTGCCCAGTGCCTGCGTGATCAGCGCCCGCGCACTCCCCTCGCCTTCCGGCAGCGCCACATCACGCTTCACGGGCTGCGC‑CGAGGGTACGGTGGCCTGCAACa < 2:310029/301‑1 (MQ=255) gtgtCCAGGGCCTGGCCAAGCTGCGCGGCCAAGGCTTCGCGCTCATCGTCACGGCCCGCTACCCACCAACTGTGCGGTACCACCTGCACGGGCTGGCACGTGTGCAGCTCACGCGACAGGCGCTTGAGGCTGCGCGCAGTGATGAACACCTGGGTCAGTTCATCGACGCCCAACCC‑CGTCGCCCCCTGCCTGTTGCCCAGTGCCTGCGTGATCAGCGCCCGCGCACTCCCCTCGCCTTCCGGCAGCGCCACATCACGCTTCACGGGCTGCGC‑CGAGGGTACGGTGGccagatcggaagagc > 4:404743/1‑288 (MQ=255) gtgtCCAGGGCCTGGCCAAGCTGCGCGGCCAAGGCTTCGCGCTCATCGTCACGGCCCGCTACCCACCAACTGTGCGGTACCACCTGCACGGGCTGGCACGTGTGCAGCTCACGCGACAGGCGCTTGAGGCTGCGCGCAGTGATGAACACCTGGGTCAGTTCATCGACGCCCAACCC‑CGTCGCCCCCTGCCTGTTGCCCAGTGCCTGCGTGATCAGCGCCCGCGCACTCCCCTCGCCTTCCGGCAGCGCCACATCACGCTTCACGGGCTGCGC‑CGAGGGTACGGTGGCCTGCAACAGCTCGt < 1:135275/301‑1 (MQ=255) ccAGGGCCTGGCCAAGCTGCGCGGCAAAGGCTTCGCGCTCATAGTCACGGCCCGCTACCCACCAACTGTGCGGTACCACCTGCACGGGCTGGCACGTGTGCAGCTCACGCGACAGGCGCTTGAGGCTGCGCGCAGTGATGAACACCTGGGTCAGTTCATCGACGCCCAACCC‑CGTCGCCCCCTGCCTGTTGCCCAGTGCCTGCGTGAACAGCGCCCGCGCACTCCCCTCGCCTTCCGGCAGCGCCACATCACGCTTCACGGGCTGCGC‑CGAGGGTACGGTGGCCTGCAACAGCTCGTTCaa < 1:3394/301‑1 (MQ=255) ggCCAAGCTGCGCGGCCAAGGCTTCGCGCTCATCGTCACGGCCCGCTACCCACCAACTGTGCGGTACCACCTGCACGGGCTGGCACGTGTGCAGCTCACGCGACAGGCGCTTGAGGCTGCGCGCAGTGATGAACACCTGGGTCAGTTCATCGACGCCCAACCC‑CGTCGCCCCCTGCCTGTTGCCCAGTGCCTGCGTGATCAGCGCCCGCGCACTCCCCTCGCCTTCCGGCAGCGCCACATCACGCTTCACGGGCTGCGC‑CGAGGGTACGGTGGCCTGCAACAGCTCGTTCAAATCGTCCAg < 4:813144/301‑1 (MQ=255) gCCAAGCTGCGCGGCCAAGGCTTCGCGCTCATCGTCACGGCCCGCTACCCACCAACTGTGCGGTACCACCTGCACGGGCTGGCACGTGTGCAGCTCACGCGACAGGCGCTTGAGGCTGCGCGCAGTGATGAACACCTGGGTCAGTTCATCGACGCCCAACCC‑CGTCGCCCCCTGCCTGTTGCCCAGTGCCTGCGTGATCAGCGCCCGCGCACTCCCCTCGCCTTCCGGCAGCGCCACATCACGCTTCACGGGCTGCGC‑CGAGGGTACGGTGGCCTGCATCAGCTCGTTCAAATCGTCCAGc > 3:278007/1‑301 (MQ=255) ggcgcGGCCAAGGCTTCGCGCTCATCGTCACGGCCCGCTACCCACCAACTGTGCGGTACCACCTGCACGGGCTGGCACGTGTGCAGCTCACGCGACAGGCGCTTGAGGCTGCGCGCAGTGATGAACACCTGGGTCAGTTCATCGACGCCCAACCC‑CGTCGCCCCCTGCCTGTTGCCCAGTGCCTGCGTGATCAGCGCCCGCGCACTCCCCTCGCCTTCCGGCAGCGCCACATCACGCTTCACGGGCTGCGC‑CGAGGGTACGGTGGCCTGCAACAGCTCGTTCAAATCGTCCAGCCAATGAt < 3:563198/300‑1 (MQ=255) cggggCCAAGGCTTCGCGCTCATCGTCACGGCCCGCTACCCACCAACTGTGCGGTACCACCTGCACGGGCTGGCACGTGTGCAGCTCACGCGACAGGCGCTTGAGGCTGCGCGCAGTGATGAACACCTGGGTCAGTTCATCGACGCCCAACCC‑CGTCGCCCCCTGCCTGTTGCCCAGTGCCTGCGTGATCAGCGCCCGCGCACTCCCCTCGCCTTCCGGCAGCGCCACATCACGCTTCACGGGCTGCGC‑CGAGGGTACGGTGGCCTGCAACAGCTCGTTCAAATCGTCCAGCCAATGATCg < 1:99829/298‑1 (MQ=255) cAAGGCTTCGCGCTCATCGTCACGGCCCGCTACCCACCAACTGTGCGGTACCACCTGCACGGGCTGGCACGTGTGCAGCTCACGCGACAGGCGCTTGAGGCTGCGCGCAGTGATGAACACCTGGGTCAGTTCATCGACGCCCAACCC‑CGTCGCCCCCTGCCTGTTGCCCAGTGCCTGCGTGATCAGCGCCCGCGCACTCCCCTCGCCTGCCGGCAGCGCCACATCACGCTTCACGGGCTGCCC‑CGAGGGTACGGTCGCCTGCAACATCCCGTTCAAAtgggaccgccaattgacgactttc > 2:685040/1‑278 (MQ=255) aaGGCTTCGCGCTCATCGTCACGGCCCGCTACCCACCAACTGTGCGGTACCACCTGCACGGGCTGGCACGTGTGCAGCTCACGCGACAGGCGCTTGAGGCTGCGCGCAGTGATGAACACCTGGGTCAGTTCATCGACGCCCAACCC‑CGTCGCCCCCTGCCTGTTGCCCAGTGCCTGCGTGATCAGCGCCCGCGCACTCCCCTCGCCTTCCGGCAGCGCCACATCACGCTTCACGGGCTGCGC‑CGAGGGTACGGTGGCCTGCAACAGCTCGTTCAAATCGTCCAGCCAATGATCGACTTGCa < 3:559051/301‑1 (MQ=255) ctcTCATCGTCACGGCCCGCTACCCACCAACTGTGCGGTACCACCTGCACGGGCTGGCACGTGTGCAGCTCACGCGACAGGCGCTTGAGGCTGCGCGCAGTGATGAACACCTGGGTCAGTTCATCGACGCCCAACCC‑CGTCGCCCCCTGCCTGTTGCCCAGTGCCTGCGTGATCAGCGCCCGCGCACTCCCCTCGCCTTCCGGCAGCGCCACATCACGCTTCACGGGCTGCGC‑CGAGGGTACGGTGGCCTGCAACAGCTCGTTCAAATCGTCCAGCCAATGATCGACTTGCAGGTGGGttt < 2:627380/299‑1 (MQ=255) ccgatctCGTCACGGCCCGCTACCCACCAACTGTGCGGTACCACCTGCACGGGCTGGCACGTGTGCAGCTCACGCGACAGGCGCTTGAGGCTGCGCGCAGTGATGAACACCTGGGTCAGTTCATCGACGCCCAACCC‑CGTCGCCCCCTGCCTGTTGCCCAGTGCCTGCGTGATCAGCGCCCGCGCACTCCCCTCGCCTTCCGGCAGCGCCACATCACGCTTCACGGGCTGCGC‑CGAGGGTACGGTGGCCTGCAACAGCTCGTTCAAATCGTCCAGCCAATGATCGACTTGCAGGTGGGttt < 4:31840/295‑1 (MQ=255) tCATCGTCACGGCCCGCTACCCACCAACTGTGCGGTACCACCTGCACGGGCTGGCACGTGTGCAGCTCACGCGACAGGCGCTTGAGGCTGCGCGCAGTGATGAACACCTGGGTCAGTTCATCGACGCCCAACCC‑CGTCGCCCCCTGCCTGTTGCCCAGTGCCTGCGTGATCAGCGCCCGCGCACTCCCCTCGCCTTCCGGCAGCGCCACATCACGCTTCACGGGCTGCGC‑CGAGGGTACGGTGGCCTGCAACAGCTCGTTCAAATCGTCCAGCCAATGATCGACTTGCAGGTGGGTTTGCg > 4:689821/1‑301 (MQ=255) cATCGTCACGGCCCGCTACCCACCAACTGTGCGGTACCACCTGCACGGGCTGGCACGTGTGCAGCTCACGCGACAGGCGCTTGAGGCTGCGCGCAGTGATGAACACCTGGGTCAGTTCATCGACGCCCAACCC‑CGTCGCCCCCTGCCTGTTGCCCAGTGCCTGCGTGATCAGCGCCCGCGCACTCCCCTCGCCTTCCGGCAGCGCCACATCACGCTTCACGGGCTGCGC‑CGAGGGTACGGTGGCCTGCAACAGCTCGTTCAAATCGTCCAGCCAATGATCGACTTGCAGGTGGGtttagat > 4:627591/1‑297 (MQ=255) cGTCACGGCCCGCTACCCACCAACTGTGCGGTACCACCTGCACGGGCTGGCACGTGTGCAGCTCACGCGACAGGCGCTTGAGGCTGCGCGCAGTGATGAACACCTGGGTCAGTTCATCGACGCCCAACCC‑CGTCGCCCCCTGCCTGTTGCCCAGTGCCTGCGTGATCAGCGCCCGCGCACTCCCCTCGCCTTCCGGCAGCGCCACATCACGCTTCACGGGCTGCGC‑CGAGGGTACGGTGGCCTGCAACAGCTCGTTCAAATCGTCCAGCCAATGAACGACTTGCAGGTGGGtttaagtcgg > 2:31826/1‑294 (MQ=255) gTCACGGCCCGCTACCCACCAACTGTGCGGTACCACCTGCACGGGCTGGCACGTGTGCAGCTCACGCGACAGGCGCTTGAGGCTGCGCGCAGTGATGAACACCTGGGTCAGTTCATCGACGCCCAACCC‑CGTCGCCCCCTGCCTGTTGCCCAGTGCCTGCGTGATCAGCGCCCGCGCACTCCCCTCGCCTTCCGGCAGCGCCACATCACGCTTCACGGGCTGCGC‑CGAGGGTACGGTGGCCTGCAACCGCTCGTTCAACTCTTCCAGCCAATGATCGACTTGCAGGTGGGTTTCCGttccg > 2:783563/1‑297 (MQ=255) cTACCCACCAACTGTGCGGTACCACCTGCACGGGCTGGCACGTGTGCAGCTCACGCGACAGGCGCTTGAGGCTGCGCGCAGTGATGAACACCTGGGTCAGTTCATCGACGCCCAACCC‑CGTCGCCCCCTGCCTGTTGCCCAGTGCCTGCGTGATCAGCGCCCGCGCACTCCCCTCGCCTTCCGGCAGCGCCACATCACGCTTCACGGGCTGCGC‑CGAGGGTACGGTGGCCTGCAACAGCTCGTTCAAATCGTCCAGCCAATGATCGACTTGCAGGTGGGtttagatcggaagagcacacgt > 4:537929/1‑282 (MQ=255) ccaACTGTGCGGTACCACCTGCACGGGCTGGCACGTGTGCAGCTCACGCGACAGGCGCTTGAGGCTGCGCGCAGTGATGAACACCTGGGTCAGTTCATCGACGCCCAACCC‑CGTCGCCCCCTGCCTGTTGCCCAGTGCCTGCGTGATCAGCGCCCGCGCACTCCCCTCGCCTTCCGGCAGCGCCACATCACGCTTCACGGGCTGCGC‑CGAGGGTACGGTGGCCTGCAACAGCTCGTTCAAATCGTCCAGCCAATGATCGACTTGCAGGTGGGTTTGCGTGCTGGGCACGAAGCTGTCcagc < 4:444014/301‑1 (MQ=255) cgatcttgCGGTACCACCTGCACGGGCTGGCACGTGTGCAGCTCACGCGACAGGCGCTTGAGGCTGCGCGCAGTGATGAACACCTGGGTCAGTTCATCGACGCCCAACCC‑CGTCGCCCCCTGCCTGTTGCCCAGTGCCTGCGTGATCAGCGCCCGCGCACTCCCCTCGCCTTCCGGCAGCGCCACATCACGCTTCACGGGCTGCGC‑CGAGGGTACGGTGGCCTGCAACAGCTCGTTCAAATCGTCCAGCCAATGATCGACTTGCAGGTGGGTTTGCGTGCTGGGCACGAAGCTGTCcagca < 4:101343/295‑1 (MQ=255) caACTGTGCGGTACCACCTGCACGGGCTGGCACGTGTGCAGCTCACGCGACAGGCGCTTGAGGCTGCGCGCAGTGATGAACACCTGGGTCAGTTCATCGACGCCCAACCC‑CGTCGCCCCCTGCCTGTTGCCCAGTGCCTGCGTGATCAGCGCCCGCGCACTCCCCTCGCCTTCCGGCAGCGCCACATCACGCTTCACGGGCTGCGC‑CGAGGGTACGGTGGCCTGCAACAGCTCGTTCAAATCGTCCAGCCAATGATCGACTTGCAGGTGGGTTTGCGTGCTGGGCACGAAGCTGTCcagca > 3:487512/1‑301 (MQ=255) cTGTGCGGTACCACCTGCACGGGCTGGCACGTGTGCAGCTCACGCGACAGGCGCTTGAGGCTGCGCGCAGTGATGAACACCTGGGTCAGTTCATCGACGCCCAACCC‑CGTCGCCCCCTGCCTGTTGCCCAGTGCCTGCGTGATCAGCGCCCGCGCACTCCCCTCGCCTTCCGGCAGCGCCACATCACGCTTCACGGGCTGCGC‑CGAGGGTACGGTGGCCTGCAACAGCTCGTTCAAATCGTCCAGCCAATGATCGACTTGCAGGTGGGTTTGCGTGCTGGGCACGAAGCTGTCCAGCAgcg > 4:713520/1‑301 (MQ=255) gtgCGGTACCACCTGCACGGGCTGGCACGTGTGCAGCTCACGCGACAGGCGCTTGAGGCTGCGCGCAGTGATGAACACCTGGGTCAGTTCATCGACGCCCAACCC‑CGTCGCCCCCTGCCTGTTGCCCAGTGCCTGCGTGATCAGCGCCCGCGCACTCCCCTCGCCTTCCGGCAGCGCCACATCACGCTTCACGGGCTGCGC‑CGAGGGTACGGTGGCCTGCAACAGCTCGTTCAAATCGTCCAGCCAATGATCGACTTGCAGGTGGGTTTGCGTGCTGGGCACGAACCTGTCCAGCAGcgcg > 4:788855/1‑301 (MQ=255) tgCGGTACCACCTGCACGGGCTGGCACGTGTGCAGCTCACGCGACAGGCGCTTGAGGCTGCGCGCAGTGATGAACACCTGGGTCAGTTCATCGACGCCCAACCC‑CGTCGCCCCCTGCCTGTTGCCCAGTGCCTGCGTGATCAGCGCCCGCGCACTCCCCTCGCCTTCCGGCAGCGCCACATCACGCTTCACGGGCTGCGC‑CGAGGGTACGGTGGCCTGCAACAGCTCGTTCAAATCGTCCAGCCAATGATCGACTTGCAGGTGGGTTTGCGTGCTGGGACCGAAGCTGTCcagcaagtacg > 2:101313/1‑295 (MQ=255) gTACCACCTGCACGGGCTGGCACGTGTGCAGCTCACGCGACAGGCGCTTGAGGCTGCGCGCAGTGATGAACACCTGGGTCAGTTCATCGACGCCCAACCC‑CGTCGCCCCCTGCCTGTTGCCCAGTGCCTGCGTGATCAGCGCCCGCGCACTCCCCTCGCCTTCCGGCAGCGCCACATCACGCTTCACGGGCTGCGC‑CGAGGGTACGGTGGCCTGCAACAGCTCGTTCAAATCGTCCAGCCAATGATCGACTTGCAGGTGGGTTTGCGTGCTGGGCACGAAGCTGTCCAGCAGCGCGAGCaa > 1:26015/1‑301 (MQ=255) gtccgatgtggctggcacggtggcatgtCACGCGACAGGCGCTTGAGGCTGCGCGCAGTGATGAACACCTGGGTCAGTTCATCGACGCCCAACCC‑CGTCGCCCCCTGCCTGTTGCCCAGTGCCTGCGTGATCAGCGCCCGCGCACTCCCCTCGCCTTCCGGCAGCGCCACATCACGCTTCACGGGCTGCGC‑CGAGGGTACGGTGGCCTGCAACAGCTCGTTCAAATCGTCCAGCCAATGATCGACTTGCAGGTGGGTTTGCGTGCTGGGCACGAAGCTGTCCAGCAGCGCGAGCAACTCCa < 2:607381/274‑1 (MQ=255) 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ccAGTGCCTGCGTGATCAGCGCCCGCGCACTCCCCTCGCCTTCCGGCAGCGCCACATCACGCTTCACGGGCTGCGC‑CGAGGGTACGGTGGCCTGCAACAGCTCGTTCAAATCGTCCAGCCAATGATCGACTTGCAGGTGGGTTTGCGTGCTGGGCACGAAGCTGTCCAGCAGCGCGAGCAACTCCACGCGCTCACCCTGCCCTTCCAGCACCGCCGCCATCAGTGACGCCAAGGTGCCGCCGAGCGACCAGCCCAGCAAGCCGTACGGGCCATGCGGCTGCTGTTCCCgccagggctcgaa > 2:383789/1‑290 (MQ=255) acgtgcttccgatctgcCCGCGCACTCCCCTCGCCTTCCGGCAGCGCCACATCACGCTTCACGGGCTGCGC‑CGAGGGTACGGTGGCCTGCAACAGCTCGTTCAAATCGTCCAGCCAATGATCGACTTGCAGGTGGGTTTGCGTGCTGGGCACGAAGCTGTCCAGCAGCGCGAGCAACTCCACGCGCTCACCCTGCCCTTCCAGCACCGCCGCCATCAGTGACGCCAAGGTGCCGCCGAGCGACCAGCCCAGCAAGCGGTACGGGCCATGCGGCTGCTGTTCACGCAGGCAGGCAACGTAGt < 4:422088/286‑1 (MQ=255) tGATCAGCGCCCGAGCACTCCCCTCGCCTTCCGGCAGCGCCACATCACGCTTCACGGGCTGCGC‑CGAGGGTACGGTGGCCTGCAACAGCTCGTTCAAATCGTCCAGCCAATGATCGACTTGCAGGTGGGTTTGCGTGCTGGGCACGAAGCTGTCCAGCAGCGCGAGCAACTCCACGCGCTCACCCTGCCCTTCCAGCACCGCCGCCATCAGTGACGCCAAGGTGCCGCCGAGCGACCAGCCCAGCAAGCGGTACGGGCCATGCGGCTGCTGTTCACGCAGGCAGGCAACGTAGTCGCTGGc < 4:685275/301‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |