New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | AE015451 | = 5880817 | 240 (2.270) | 4 (0.040) | 4/600 | 8.4 | 1.4% | coding (422/1368 nt) | PP_5154 | putative Oxidoreductase, FAD‑binding |
? | AE015451 | = 5908358 | 311 (2.940) | coding (863/1098 nt) | spuD | spermidine/putrescine ABC transporter ‑ periplasmic subunit | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 243 total aligned reads displayed.
AACTCGAAAGCGGTCAGGTCCAGCTTGCCCTGGAAGGCGTGCAGCACCGGCATGATCGAGTCGAAGTCCGGTGTGCCCAGCACCATGGCGGTGAGGTTGCGCGGTGCGCGGTCCAGGCGCATGGTGGCCTCGACCACGAAGCCCAGCGTACCCTCGGCACCAATGAACAGCTGGCGCAGGTCGTAGCCGGTGGCGTTCTTGATCAGGTCTTTGTTCAGCTCCAGCAACTCGCCCTTGCCGGTGACCACTTTCAGCCCGGCCACCCAGTTGCGGGTCATACCGTAACGAATCACCTTGATCCCGCCGGCGTTGGTGCCGATATTGCCGCCAATCTGGCTGGAACCGCTGGAAGCGAAGTCCACCGGGTAATAAAGGCCTTGCTCTTCGGCGTAGGTTTGCAGCTGGCGGGTGACGACCCCTGGCTGGCAAACCACAGTACGGTCGAAAGCATTGAAGCCAAGGATCTGGTTCATGTAGTCGAAGGCGACGACAACCTCGCCATTGGCCGCCACGGCGCCGGCAGAAAGCCCGGTGCGCCCGCCAGAGGGCACCAGCGCCACCTTGTGCGCATTGGCCCAGTGCACAATGGCTTGCACCTGTT > AE015451/5880517‑5881117 | aCTCGAAAGCGGTCAGGTCCAGCTTGCCCTGGAAGGCGTGCAGCACCGGCATGATCGAGTCGAAGTCCGGTGTGCCCAGCACCATGGCGGTGAGGTTGCGCGGTGCGCGGTCCAGGCGCATGGTGGCCTCGACCACGAAGCCCAGCGTACCCTCGGCACCAATGAACAGCTGGCGCAGGTCGTAGCCGGTGGCGTTCTTGATCAGGTCTTTGTTCAGCTCCAGCAACTCGCCCTTGCCGGTGACCACTTTCAGCCCGGCCACCCAGTTGCGGGTCATACCGTAACGAATCACCTTGATccc > 2:204850/1‑301 (MQ=255) cTCGAGAGCGGTTCGGGCCAGCTTGCCCTGGAAGGCGGGCAGCACCGGCATGAGTGAGTGGAAGTCCGGTGTGCCCAGGTCCATGGCGGTGAGGTTGCGCGGTGCGCGGTCCAGGCGCATGGTGGGCTCGAGCACGAAGCCCAGCGTACCCTCGGCACCAATGAACAGCTGGCGCAGGTCGTAGCCGGTGGCGTTCTTGATCAGGTCTTTGTTCAGCTCCAGCAACTCGCCCTTGCCGGTGACCACTTTCAGCCCGGCCACCCAGTTGCGGGTCATACCGTAACGAATCACCTTGATCccg < 2:843832/301‑1 (MQ=255) aaGCGGTCAGGTCCAGCTTGCCCTGGAAGGCGTGCAGCACCGGCATGATCGAGTCGAAGTCCGGTGTGCCCAGCACCATGGCGGTGAGGTTGCGCGGTGCGCGGTCCAGGCGCATGGTGGCCTCGACCACGAAGCCCAGCGTACCCTCGGCACCAATGAACAGCTGGCGCAGGTCGTAGCCGGTGGCGTTCTTGATCAGGTCTTTGTTCAGCTCCAGCAACTCGCCCTTGCCGGTGACCACTTTCAGCCCGGCCACCCAGTTGCGGGTCATACCGTAACGAATCACCTTGATCCCGCCGGc < 4:513135/301‑1 (MQ=255) aGGTCCAGCTTGCCCTGGAAGGCGTGCAGCACCGGCATGATCGAGTCGAAGTCCGGTGTGCCCAGCACCATGGCGGTGAGGTTGCGCGGTGCGCGGTCCAGGCGCATGGTGGCCTCGACCACGAAGCCCAGCGTACCCTCGGCACCAATGAACAGCTGGCGCAGGTCGTAGCCGGTGGCGTTCTTGATCAGGTCTTTGTTCAGCTCCAGCAACTCGCCCTTGCCGGTGACCACTTTCAGCCCGGCCACCCAGTTGCGGGTCATACCGTAACGAATCACCTTGATCCCGCCGGCGTTGGTGc > 3:546661/1‑301 (MQ=255) tGCCCTGGAAGGCGTGCAGCACCGGCATGATCGAGTCGAAGTCCGGTGTGCCCAGCACCATGGCGGTGAGGTTGCGCGGTGCGCGGTCCAGGCGCATGGTGGCCTCGACCACGAAGCCCAGCGTACCCTCGGCACCAATGAACAGCTGGCGCAGGTCGTAGCCGGTGGCGTTCTTGATCAGGTCTTTGTTCAGCTCCAGCAACTCGCCCTTGCCGGTGACCACTTTCAGCCCGGCCACCCAGTTGCGGGTCATACCGTAACGAATCACCTTGATCCCGCCGGCGTTGGTGCCGATATTgcc < 4:204901/301‑1 (MQ=255) gctcttccgatctgTGCAGCACCGGCATGATCGAGTCGAAGTCCGGTGTGCCCAGCACCATGGCGGTGAGGTTGCGCGGTGCGCGGTCCAGGCGCATGGTGGCCTCGACCACGAAGCCCAGCGTACCCTCGGCACCAATGAACAGCTGGCGCAGGTCGTAGCCGGTGGCGTTCTTGATCAGGTCTTTGTTCAGCTCCAGCAACTCGCCCTTGCCGGTGACCACTTTCAGCCCGGCCACCCAGTTGCGGGTCATACCGTAACGAATCACCTTGATCCCGCCGGCGTTGGTGCCGATATTgcc < 4:730985/288‑1 (MQ=255) cccTGGAAGGCGGGCAGCACCGGCATGATCGAGTCGAAGTCCGGTCGGCCCAGAACCATGGCGGTGAGGTTGCGCGGTGCGCGGTCCAGGCGCATGGTGGCCTCGACCACGAAGCCCAGCGTACCCTCGGCACCAATGAACAGCTGGCGCAGGTCGTAGCCGGTGGCGTTCTTGATCAGGTCTTTGTTCAGCTCCAGCAACTCGCCCTTGCCGGTGACCACTTTCAGCCCGGCCACCCAGTTGCGGGTCATACCGTAACGAATCACCTTGATCCCGCCGGCGTTGGTGCCGATATTgccgc < 2:406304/301‑1 (MQ=255) tctgAAGGCGTGCAGCACCGGCATGATCGAGTCGAAGTCCGGTGTGCCCAGCACCATGGCGGTGAGGTTGCGCGGTGCGCGGTCCAGGCGCATGGTGGCCTCGACCACGAAGCCCAGCGTACCCTCGGCACCAATGAACAGCTGGCGCAGGTCGTAGCCGGTGGCGTTCTTGATCAGGTCTTTGTTCAGCTCCAGCAACTCGCCCTTGCCGGTGACCACTTTCAGCCCGGCCACCCAGTTGCGGGTCATACCGTAACGAATCACCTTGATCCCGCCGGCGTTGGTGCCGATATTGCCGCCa < 1:300194/298‑1 (MQ=255) gatctgCGTGCAGCACCGGCATGATCGAGTCGAAGTCCGGTGTGCCCAGCACCATGGCGGTGAGGTTGCGCGGTGCGCGGTCCAGGCGCATGGTGGCCTCGACCACGAAGCCCAGCGTACCCTCGGCACCAATGAACAGCTGGCGCAGGTCGTAGCCGGTGGCGTTCTTGATCAGGTCTTTGTTCAGCTCCAGCAACTCGCCCTTGCCGGTGACCACTTTCAGCCCGGCCACCCAGTTGCGGGTCATACCGTAACGAATCACCTTGATCCCGCCGGCGTTGGTGCCGATATTGCCGCCAAt < 1:551936/296‑1 (MQ=255) gTGCAGCACCGGCATGATCGAGTCGAAGTCCGGTGTGCCCAGCACCATGGCGGTGAGGTTGCGCGGTGCGCGGTCCAGGCGCATGGTGGCCTCGACCACGAAGCCCAGCGTACCCTCGGCACCAATGAACAGCTGGCGCAGGTCGTAGCCGGTGGCGTTCTTGATCAGGTCTTTGTTCAGCTCCAGCAACTCGCCCTTGCCGGTGACCACTTTCAGCCCGGCCACCCAGTTGCGGGTCATACCGTAACGAATCACCTTGATCCCGCCGGCGTTGGTGCCGATATTGCCGCCAATctggctg > 3:366928/1‑301 (MQ=255) agcaCCGGCATGATCGAGTCGAAGTCCGGTGTGCCCAGCACCATGGCGGTGAGGTTGCGCGGTGCGCGGTCCAGGCGCATGGTGGCCTCGACCACGAAGCCCAGCGTACCCTCGGCACCAATGAACAGCTGGCGCAGGTCGTAGCCGGTGGCGTTCTTGATCAGGTCTTTGTTCAGCTCCAGCAACTCGCCCTTGCCGGTGACCACTTTCAGCCCGGCCACCCAGTTGCGGGTCATACCGTAACGAATCACCTTGATCCCGCCGGCGTTGGTGCCGATATTGCCGCCAATCTGGCTGGAAc > 1:308752/1‑301 (MQ=255) cttccgctcttCGAAGGCCCGTGTGCCCAGCACCATGGCGGTGAGGTTGCGCGGTGCGCGGTCCAGGCGCATGGTGGCCTCGACCACGAAGCCCAGCGTACCCTCGGCACCAATGAACAGCTGGCGCAGGTCGTAGCCGGTGGCGTTCTTGATCAGGTCTTTGTTCAGCTCCAGCAACTCGCCCTTGCCGGTGACCACTTTCAGCCCGGCCACCCAGTTGCGGGTCATACCGTAACGAATCACCTTGATCCCGCCGGCGTTGGTGCCGATATTGCCGCCAATCTGGCTGGAACCGCTGGaa < 1:715923/291‑1 (MQ=255) tGATCGAGTCGAAGTCCGGTGTGCCCAGCACCATGGCGGTGAGGTTGCGCGGTGCGCGGTCCAGGCGCATGGTGGCCTCGACCACGAAGCCCAGCGTACCCTCGGCACCAATGAACAGCTGGCGCAGGTCGTAGCCGGTGGCGTTCTTGATCAGGTCTTTGTTCAGCTCCAGCAACTCGCCCTTGCCGGTGACCACTTTCAGCCCGGCCACCCAGTTGCGGGTCATACCGTAACGAATCACCTTGATCCTGCCGGCGCTGGTGCGGATATTGCCGCCAATCTGGCTGGACCCgttgaaagg > 1:656083/1‑293 (MQ=255) gATCGAGTCGAAGTCCGGTGTGCCCAGCACCATGGCGGTGAGGTTGCGCGGTGCGCGGTCCAGGCGCATGGTGGCCTCGACCACGAAGCCCAGCGTACCCTCGGCACCAATGAACAGCTGGCGCAGGTCGTAGCCGGTTGCGTTCTTGATCAGGTCTTTGTTCAGCTCCAGCAACTCGCCCTTGCCGGTGACCACTTTCAGCCCGGCCACCCAGTTGCGGGTCATACCGTAACGAATCACCTTGATCCCGCCGGCGTTGGTGCCGATATTGCCGCCAATCTGGCTGGAACCGCTGGAAGCg < 1:391377/301‑1 (MQ=255) tggAAGTCCGGGGTGCCCAGAACCATGGCGGTGAGGTGGCGCGGTGCGCGGTCCAGGCGCATGGTGGCCTCGACCACGAAGCCCAGCGTACCCTCGGCACCAATGAACAGCTGGCGCAGGTCGTAGCCGGTGGCGTTCTTGATCAGGTCTTTGTTCAGCTCCAGCAACTCGCCCTTGCCGGTGACCACTTTCAGCCCGGCCACCCAGTTGCGGGTCATACCGTAACGAATCACCTTGATCCCGCCGGCGTTGGTGCCGATATTGCCGCCAATCTGGCTGGAACCGCTGGAAGCGAAGTCCa < 3:656096/299‑1 (MQ=255) tCGAAGTCCGGTGTGCCCAGCACCATGGCGGTGAGGTTGCGCGGTGCGCGGTCCAGGCGCATGGTGGCCTCGACCACGAAGCCCAGCGTACCCTCGGCACCAATGAACAGCTGGCGCAGGTCGTAGCCGGTGGCGTTCTTGATCAGGTCTTTGTTCAGCTCCAGCAACTCGCCCTTGCCGGTGACCACTTTCAGCCCGGCCACCCAGTTGCGGGTCATACCGTAACGAATCACCTTGATCCCGCCGGCGTTGGTGCCGATATTGCCGCCAATCTGGCTGGAACCGCTGGAAGCGAAGTCCa < 4:487170/301‑1 (MQ=255) gAAGTCCGGTGTGCCCAGCACCATGGCGGTGAGGTTGCGCGGTGCGCGGTCCAGGCGCATGGTGGCCTCGACCACGAAGCCCAGCGTACCCTCGGCACCAATGAACAGCTGGCGCAGGTCGTAGCCGGTGGCGTTCTTGATCAGGTCTTTGTTCAGCTCCAGCAACTCGCCCTTGCCGGTGACCACTTTCAGCCCGGCCACCCAGTTGCGGGTCATACCGTAACGAATCACCTTGATCCCGCCGGCGTTGGTGCCGATATTGCCGCCAATCTGGCTGGAACCGCTGGAAGCGAAGTCCaga > 4:372226/1‑299 (MQ=255) cccgatcttgtgCCCAGCACCATGGCGGTGAGGTTGCGCGGTGCGCGGTCCAGGCGCATGGTGGCCTCGACCACGAAGCCCAGCGTACCCTCGGCACCAATGAACAGCTGGCGCAGGTCGTAGCCGGTGGCGTTCTTGATCAGGTCTTTGTTCAGCTCCAGCAACTCGCCCTTGCCGGTGACCACTTTCAGCCCGGCCACCCAGTTGCGGGTCATACCGTAACGAATCACCTTGATCCCGCCGGCGTTGGTGCCGATATTGCCGCCAATCTGGCTGGAACCGCTGGAAGCGAAGTCCACCg < 1:15471/293‑1 (MQ=255) aaGTCCGGTGTGCCCAGCACCATGGCGGTGAGGTTGCGCGGTGCGCGGTCCAGGCGCATGGTGGCCTCGACCACGAAGCCCAGCGTACCCTCGGCACCAATGAACAGCTGGCGCAGGTCGTAGCCGGTGGCGTTCTTGATCAGGTCTTTGTTCAGCTCCAGCAACTCGCCCTTGCCGGTGACCACTTTCAGCCCGGCCACCCAGTTGCGGGTCATACCGTAACGAATCACCTTGATCCCGCCGGCGTTGGTGCCGATATTGCCGCCAATCTGGCTGGAACCGCTGGAAGCGAAGTCCACCg > 3:447964/1‑301 (MQ=255) aaGTCCGGTGTGCCCAGCACCATGGCGGTGAGGTTGCGCGGTGCGCGGTCCAGGCGCATGGTGGCCTCGACCACGAAGCCCAGCGTACCCTCGGCACCAATGAACAGCTGGCGCAGGTCGTAGCCGGTGGCGTTCTTGATCAGGTCTTTGTTCAGCTCCAGCAACTCGCCCTTGCCGGTGACCACTTTCAGCCCGGCCACCCAGTTGCGGGTCATACCGTAACGAATCACCTTGATCCCGCCGGCGTTGGTGCCGATATTGCCGCCAATCTGGCTGGAACCGCTGGAAGCGAAGTCCACCg < 4:620590/301‑1 (MQ=255) ccGGTGTGCCCAGCACCATGGCGGTGAGGTTGCGCGGTGCGCGGTCCAGGCGCATGGTGGCCTCGACCACGAAGCCCAGCGTACCCTCGGCACCAATGAACAGCTGGCGCAGGTCGTAGCCGGTGGCGTTCTTGATCAGGTCTTTGTTCAGCTCCAGCAACTCGCCCTTGCCGGTGACCACTTTCAGCCCGGCCACCCAGTTGCGGGTCATACCGTAACGAATCACCTTGATCCCGCCGGCGTTGGTGCCGATATTGCCGCCAATCTGGCTGGAACCGCTGGAATCGAAGTccccctggtt > 2:730045/1‑293 (MQ=255) gCCCAGCACCATGGCGGTGAGGTTGCGCGGTGCGCGGTCCAGGCGCATGGTGGCCTCGACCACGAAGCCCAGCGTACCCTCGGCACCAATGAACAGCTGGCGCAGGTCGTAGCCGGTGGCGTTCTTGATCAGGTCTTTGTTCAGCTCCAGCAACTCGCCCTTGCCGGTGACCACTTTCAGCCCGGCCACCCAGTTGCGGGTCATACCGTAACGAATCACCTTGATCCCGCCGGCGTTGGTGCCGATATTGCCGCCAATCTGGCTGGAACCGCTGGAAGCGAAGTCCACCGGGTAATAAAgg < 3:194650/301‑1 (MQ=255) ccgctcttccgatctaGGTTGCGCGGTGCGCGGTCCAGGCGCATGGTGGCCTCGACCACGAAGCCCAGCGTACCCTCGGCACCAATGAACAGCTGGCGCAGGTCGTAGCCGGTGGCGTTCTTGATCAGGTCTTTGTTCAGCTCCAGCAACTCGCCCTTGCCGGTGACCACTTTCAGCCCGGCCACCCAGTTGCGGGTCATACCGTAACGAATCACCTTGATCCCGCCGGCGTTGGTGCCGATATTGCCGCCAATCTGGCTGGAACCGCTGGAAGCGAAGTCCACCGGGTAATAAAGGCCtt < 1:326142/286‑1 (MQ=255) aGCACCATGGCGGTGAGGTTGCGCGGTGCGCGGTCCAGGCGCATGGTGGCCTCGACCACGAAGCCCAGCGTACCCTCGGCACCAATGAACAGCTGGCGCAGGTCGTAGCCGGTGGCGTTCTTGATCAGGTCTTTGTTCAGCTCCAGCAACTCGCCCTTGCCGGTGACCACTTTCAGCCCGGCCACCCAGTTGCGGGTCATACCGTAACGAATCACCTTGATCCCGCCGGCGTTGGTGCCGATATTGCCGCCAATCTGGCTGGAACCGCTGGAAGCGAAGTCCACCGGGTAATAAAGGCCtt > 3:151771/1‑301 (MQ=255) cACCATGGCGGTGAGGTTGCGCGGTGCGCGGTCCAGGCGCATGGTGGCCTCGACCACGAAGCCCAGCGTACCCTCGGCACCAATGAACAGCTGGCGCAGGTCGTAGCCGGTGGCGTTCTTGATCAGGTCTTTGTTCAGCTCCAGCAACTCGCCCTTGCCGGTGACCACTTTCAGCCCGGCCATCCAGTTGCGGGTCATACCGTAACGAATCACCTTGATCCCGCCGGCGTTGGTGCCGATATTGCCGCCAATCTGGCTGGAACCGCTGGAAGCGAAGTCCACCGGGTAATAAAGGCCTTGc > 2:65975/1‑301 (MQ=255) cACCATGGCGGTGAGGTTGCGCGGTGCGCGGTCCAGGCGCATGGTGGCCTCGACCACGAAGCCCAGCGTACCCTCGGCACCAATGAACAGCTGGCGCAGGTCGTAGCCGGTGGCGTTCTTGATCAGGTCTTTGTTCAGCTCCAGCAACTCGCCCTTGCCGGTGACCACTTTCAGCCCGGCCACCCAGTTGCGGGTCATACCGTAACGAATCACCTTGATCCCGCCGGCGTTGGTGCCGATATTGCCGCCAATCTGGCTGGAACCGCTGGAAGCGAAGTCCACCGGGTAATAAAGGCCTTGc > 4:546216/1‑301 (MQ=255) aTGGCGGTGAGGTTGCGCGGTGCGCGGTCCAGGCGCATGGTGGCCTCGACCACGAAGCCCAGCGTACCCTCGGCACCAATGAACAGCTGGCGCAGGTCGTAGCCGGTGGCGTTCTTGATCAGGTCTTTGTTCAGCTCCAGCAACTCGCCCTTGCCGGTGACCACTTTCAGCCCGGCCACCCAGTTGCGGGTCATACCGTAACGAATCACCTTGATCCCGCCGGCGTTGGTGCCGATATTGCCGCCAATCTGGCTGGAACCGCTGGAAGCGAAGTCCACCGGGTAATAAAGGCCTTGCTCtt > 4:168378/1‑301 (MQ=255) ggggttggggggggcgcggtCCAGGCGCATGGGTGCCTCGACCACGAAGCCCAGCGTACCCTCGGCACAAATGAACAGCTGGCGCAGGTCGTAGCCGGTGGCGTTCTTGATCAGGTCTTTGTTCAGCTCCAGCAACTCGCCCTTGCCGGTGACCACTTTCAGCCCGGCCACCCAGTTGCGGGTCATACCGTAACGAATCACCTTGATCCCGCCGGCGTTGGTGCCGATATTGCCGCCAATCTGGCTGGAACCGCTGGAAGCGAAGTCCACCGGGTAATAAAGGCCTTGCTCTTCGGCGTAg < 2:627655/288‑1 (MQ=255) aGGTTGCGCGGTGCGCGGTCCAGGCGCATGGTGGCCTCGACCACGAAGCCCAGCGTACCCTCGGCACCAATGAACAGCTGGCGCAGGTCGTAGCCGGTGGCGTTCTTGATCAGGTCTTTGTTCAGCTCCAGCAACTCGCCCTTGCCGGTGACCACTTTCAGCCCGGCCACCCAGTTGCGGGTCATACCGTAACGAATCACCTTGATCCCGCCGGCGTTGGTGCCGATATTGCCGCCAATCTGGCTGGAACCGCTGGAAGCGAAGTCCACCGGGTAATAAAGGCCttagatcggaagagcac > 3:326149/1‑286 (MQ=255) gggtgcgcggtgcgcggTCCAGGCGCATGGGGGCCTCGACCAGCAAGCCCAGCGTACCCTCGGCACCAAGGAACAGCTGGCGCAGGTCGTAGCCGGTGGCGTTCTTGATCAGGTCTTTGTTCAGCTCCAGCAACTCGCCCTTGCCGGTGACCACTTTCAGCCCGGCCACCCAGTTGCGGGTCATACCGTAACGAATCACCTTGATCCCGCCGGCGTTGGTGCCGATATTGCCGCCAATCTGGCTGGAACCGCTGGAAGCGAAGTCCACCGGGTAATAAAGGCCTTGCTCTTCGGCGTAGGt < 2:175149/298‑1 (MQ=255) tttGCGCGGTGCGCGGTCCAGGCGCATGGTGGCCTCGACCACGAAGCCCAGCGTACCCTCGGCACCAATGAACAGCTGGCGCAGGTCGTAGCCGGTGGCGTTCTTGATCAGGTCTTTGTTCAGCTCCAGCAACTCGCCCTTGCCGGTGACCACTTTCAGCCCGGCCACCCAGTTGCGGGTCATACCGTAACGAATCACCTTGATCCCGCCGGCGTTGGTGCCGATATTGCCGCCAATCTGGCTGGAACCGCTGGAAGCGAAGTCCACCGGGTAATAAAGGCCTTGCTCTTCGGCGTAGGtt < 1:218455/300‑1 (MQ=255) ttGCGCGGTGCGCGGTCCAGGCGCATGGTGGCCTCGACCACGAAGCCCAGCGTACCCTCGGCACCAATGAACAGCTGGCGCAGGTCGTAGCCGGTGGCGTTCTTGATCAGGTCTTTGTTCAGCTCCAGCAACTCGCCCTTGCCGGTGACCACTTTCAGCCCGGCCACCCAGTTGCGGGTCATACCGTAACGAATCACCTTGATCCCGCCGGCGTTGGTGCCGATATTGCCGCCAATCTGGCTGGAACCGCTGGAAGCGAAGTCCACCGGGTAATAAAGGCCTTGCTCTTCGGCGTAGGttt < 1:416920/301‑1 (MQ=255) gggcgcggtacccgggCCAGGCTGATGGTGGCCTCGACCACGAAGCCCAGCGTACCCTCGGCACCAATGAACAGCTGGCGCAGATCGTAGCCGGTGGCGTTCTTGATCAGGTCTTTGTTCAGCTCCAGCAACTCGCCCTTGCCGGTGACCACTTTCAGCCCGGCCACCCAGTTGCGGGTCATACCGTAACGAATCACCTTGATCCCGCCGGCGTTGGTGCCGATATTGCCGCCAATCTGGCTGGAACCGCTGGAAGCGAAGTCCACCGGGTAATAAAGGCCTTGCTCTTCGGCGTAGGttt < 2:531216/299‑1 (MQ=255) cgtgtgctcttccgatctaTGGTGGCCTCGACCACGAAGCCCAGCGTACCCTCGGCACCAATGAACAGCTGGCGCAGGTCGTAGCCGGTGGCGTTCTTGATCAGGTCTTTGTTCAGCTCCAGCAACTCGCCCTTGCCGGTGACCACTTTCAGCCCGGCCACCCAGTTGCGGGTCATACCGTAACGAATCACCTTGATCCCGCCGGCGTTGGTGCCGATATTGCCGCCAATCTGGCTGGAACCGCTGGAAGCGAAGTCCACCGGGTAATAAAGGCCTTGCTCTTCGGCGTAGGTTTGCAGCt < 3:726121/283‑1 (MQ=255) gggccggtCCAGGGGCAGGGTGGCCTCAACCACGAAGCCCAGCTTACCCTCGGAACCAATGAACAGCTGGCGAAGGTCGTAGCCGGTGGGGTTCTTGATCAGGTCTTGGTTCAGCTCCAGCAACTCGCCC‑TGCCGGTGACCACTTTCAGCCCGGCCACCCAGTTGCGGGTCATACCGTAACGAATCACCTTGATCCCGCCGGCGTTGGTGCCGATATTGCCGCCAATCTGGCTGGAACCGCTGGAAGCGAAGTCCACCGGGTAATAAAGGCCTTGCTCTTCGGCGTAGGTTTGCAGCTGGc < 1:564061/297‑1 (MQ=255) cgctcttccgatctgcATGGTGGCCTCGACCACGAAGCCCAGCGTACCCTCGGCACCAATGAACAGCTGGCGCAGGTCGTAGCCGGTGGCGTTCTTGATCAGGTCTTTGTTCAGCTCCAGCAACTCGCCCTTGCCGGTGACCACTTTCAGCCCGGCCACCCAGTTGCGGGTCATACCGTAACGAATCACCTTGATCCCGCCGGCGTTGGTGCCGATATTGCCGCCAATCTGGCTGGAACCGCTGGAAGCGAAGTCCACCGGGTAATAAAGGCCTTGCTCTTCGGCGTAGGTTTGCAGCTgg < 2:799698/287‑1 (MQ=255) ccAGGCGCATGGTGGCCTCGACCACGAAGCCCAGCGTACCCTCGGCACCAATGAACAGCTGGCGCAGGTCGTAGCCGGTGGCGTTCTTGATCAGGTCTTTGTTCAGCTCCAGCAACTCGCCCTTGCCGGTGACCACTTTCAGCCCGGCCACCCAGTTGCGGGTCATACCGTAACGAATCACCTTGATCCCGCCGGCGTTGGTGCCGATATTGCCGCCAATCTGGCTGGAACCGCTGGAAGCGAAGTCCACCGGGTAATAAAGGCCTTGCTCTTCGGCGTAGGTTTGCAGCTGGCGGGTgac > 3:516434/1‑301 (MQ=255) ggCGCATGGTGGCCTCGACCACGAAGCCCAGCGTACCCTCGGCACCAATGAACAGCTGGCGCAGGTCGTAGCCGGTGGCGTTCTTGATCAGGTCTTTGTTCAGCTCCAGCAACTCGCCCTTGCCGGTGACCACTTTCAGCCCGGCCACCCAGTTGCGGGTCATACCGTAACGAATCACCTTGATCCCGCCGGCGTTGGTGCCGATATTGCCGCCAATCTGGCTGGAACCGCTGGAAGCGAAGTCCACCGGGTAATAAAGGCCTTGCTCTTCGGCGTAGGTTTGCAGCTGGCGGGTgacgac > 1:103878/1‑301 (MQ=255) gcATGGTGGCCTCGACCACGAAGCCCAGCGTACCCTCGGCACCAATGAACAGCTGGCGCAGGTCGTAGCCGGTGGCGTTCTTGATCAGGTCTTTGTTCAGCTCCAGCAACTCGCCCTTGCCGGTGACCACTTTCAGCCCGGCCACCCAGTTGCGGGTCATACCGTAACGAATCACCTTGATCCCGCCGGCGTTGGTGCCGATATTGCCGCCAATCTGGCTGGAACCGCTGGAAGCGAAGTCCACCGGGTAATAAAGGCCTTGCTCTTCGGCGTAGGTTTGCAGCTggagatcggaagagca > 4:799968/1‑287 (MQ=255) aTGGTGGCCTCGACCACGAAGCCCAGCGTACCCTCGGCACCAATGAACAGCTGGCGCAGGTCGTAGCCGGTGGCGTTCTTGATCAGGTCTTTGTTCAGCTCCAGCAACTCGCCCTTGCCGGTGACCACTTTCAGCCCGGCCACCCAGTTGCGGGTCATACCGTAACGAATCACCTTGATCCCGCCGGCGTTGGTGCCGATATTGCCGCCAATCTGGCTGGAACCGCTGGAAGCGAAGTCCACCGGGTAATAAAGGCCTTGCTCTTCGGCGTAGGTTTGCAGCtagatcggaagagcgtcgg > 1:726105/1‑283 (MQ=255) 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ccGTAACGAATCACCTTGATCCCGCCGGCGTTGGTGCCGATATTGCCGCCAATCTGGCTGGAACCGCTGGAAGCGAAGTCCACCGGGTAATAAAGGCCTTGCTCTTCGGCGTAGGTTTGCAGCTGGCGGGTGACGACCCCTGGCTGGCAAACCACAGTACGGTCGAAAGCATTGAAGCCAAGGATCTGGTTCATGTAGTCGAAGGCGACGACAACCTCGCCATTGGCCGCCACGGCGCCGGCAGAAAGCCCGGTGCGCCCGCCAGAGGGCACCAGCGCCACCTTGTGCGCATTGGCCCAGt < 3:497069/301‑1 (MQ=255) ccGAATCACCTTGATCCCGCCGGCGTTGGTGCCGATATTGCCGCCAATCTGGCTGGAACCGCTGGAAGCGAAGTCCACCGGGTAATAAAGGCCTTGCTCTTCGGCGTAGGTTTGCAGCTGGCGGGTGACGACCCCTGGCTGGCAAACCACAGTACGGTCGAAAGCATTGAAGCCAAGGATCTGGTTCATGTAGTCGAAGGCGACGACAACCTCGCCATTGGCCGCCACGGCGCCGGCAGAAAGCCCGGTGCGCCCGCCAGAGGGCACCAGCGCCACCTTGTGCGCATTGGCCCAGTGcaca < 1:183411/300‑1 (MQ=255) cGAATCACCTTGATCCCGCCGGCGTTGGTGCCGATATTGCCGCCAATCTGGCTGGAACCGCTGGAAGCGAAGTCCACCGGGTAATAAAGGCCTTGCTCTTCGGCGTAGGTTTGCAGCTGGCGGGTGACGACCCCTGGCTGGCAAACCACAGTACGGTCGAAAGCATTGAAGCCAAGGATCTGGTTCATGTAGTCGAAGGCGACGACAACCTCGCCATTGGCCGCCACGGCGCCGGCAGAAAGCCCGGTGCGCCCGCCAGAGGGCACCAGCGCCACCTTGTGCGCATTGGCCCAGTGCACaa > 3:183416/1‑301 (MQ=255) cACCTTGATCCCGCCGGCGTTGGTGCCGATATTGCCGCCAATCTGGCTGGAACCGCTGGAAGCGAAGTCCACCGGGTAATAAAGGCCTTGCTCTTCGGCGTAGGTTTGCAGCTGGCGGGTGACGACCCCTGGCTGGCAAACCACAGTACGGTCGAAAGCATTGAAGCCAAGGATCTGGTTCATGTAGTCGAAGGCGACGACAACCTCGCCATTGGCCGCCACGGCGCCGGCAGAAAGCCCGGTGCGCCCGCCAGAGGGCACCAGCGCCACCTTGTGCGCATTGGCCCAGtagatcggaagg > 4:648818/1‑290 (MQ=255) cccTTGATCCCGCCGGCGTTGGTGCCGATATTGCCGCCAATCTGGCTGGAACCGCTGGAAGCGAAGTCCACCGGGTAATAAAGGCCTTGCTCTTCGGCGTAGGTTTGCAGCTGGCGGGTGACGACCCCTGGCTGGCAAACCACAGTACGGTCGAAAGCATTGAAGCCAAGGATCTGGTTCATGTAGTCGAAGGCGACGACAACCTCGCCATTGGCCGCCACGGCGCCGGCAGAAAGCCCGGTGCGCCCGCCAGAGGGCACCAGCGCCACCTTGTGCGCATTGGCCCAGTGCACAATGGCtt < 2:603932/300‑1 (MQ=255) cccTTGATCCCGCCGGCGTTGGTGCCGATATGGCCGCCAATCTGGCTGGAACCGCTGGAAGCGAAGTCCACCGGGTAATAAAGGCCTTGCTCTTCGGCGTAGGTTTGCAGCTGGCGGGTGACGACCCCTGGCTGGCAAACCACAGTACGGTCGAAAGCATTGAAGCCAAGGATCTGGTTCATGTAGTCGAAGGCGACGACAACCTCGCCATTGGCCGCCACGGCGCCGGCAGAAAGCCCGGTGCGCCCGCCAGAGGGCACCAGCGCCACCTTGTGCGCATTGGCCCAGTGCACAATGGCtt < 2:159725/300‑1 (MQ=255) aTCCCGCCGGCGTTGGTGCCGATATTGCCGCCAATCTGGCTGGAACCGCTGGAAGCGAAGTCCACCGGGTAATAAAGGCCTTGCTCTTCGGCGTAGGTTTGCAGCTGGCGGGTGACGACCCCTGGCTGGCAAACCACAGTACGGTCGAAAGCATTGAAGCCAAGGATCTGGTTCATGTAGTCGAAGGCGACGACAACCTCGCCATTGGCCGCCACGGCGCCGGCAGAAAGCCCGGTGCGCCCGCCAGAGGGCACCAGCGCCACCTTGTGCGCATTGGCCCAGTGCACAATgagatcggaag > 4:180501/1‑291 (MQ=255) aTCCCGCCGGCGTTGGTGCCGATATTGCCGCCAATCTGGCTGGAACCGCTGGAAGCGAAGTCCACCGGGTAATAAAGGCCTTGCTCTTCGGCGTAGGTTTGCAGCTGGCGGGTGACGACCCCTGGCTGGCAAACCACAGTACGGTCGAAAGCATTGAAGCCAAGGATCTGGTTCATGTAGTCGAAGGCGACGACAACCTCGCCATTGGCCGCCACGGCGCCGGCAGAAAGCCCGGTGCGCCCGCCAGAGGGCACCAGCGCCACCTTGTGCGCATTGGCCCAGTGCACAATGGCTTGCAccc > 1:424317/1‑300 (MQ=255) ccccGCCGGCGTAGGTGCCGATATTGACGCCAATCTGGCTGGAACCGCTGGAAGCGAAGTCCACCGGGTAATAAAGGCCTTGCTCTTCGGCGTAGGTTTGCAGCTGGCGGGTGACGACCCCTGGCTGGCAAACCACAGTACGGTCGAAAGCATTGAAGCCAAGGATCTGGTTCATGTAGTCGAAGGCGACGACAACCTCGCCATTGGCCGCCACGGCGCCGGCAGAAAGCCCGGTGCGCCCGCCAGAGGGCACCAGCGCCACCTTGTGCGCATTGGCCCAGTGCACAATGGCTTGCACCTg < 2:30716/300‑1 (MQ=255) | AACTCGAAAGCGGTCAGGTCCAGCTTGCCCTGGAAGGCGTGCAGCACCGGCATGATCGAGTCGAAGTCCGGTGTGCCCAGCACCATGGCGGTGAGGTTGCGCGGTGCGCGGTCCAGGCGCATGGTGGCCTCGACCACGAAGCCCAGCGTACCCTCGGCACCAATGAACAGCTGGCGCAGGTCGTAGCCGGTGGCGTTCTTGATCAGGTCTTTGTTCAGCTCCAGCAACTCGCCCTTGCCGGTGACCACTTTCAGCCCGGCCACCCAGTTGCGGGTCATACCGTAACGAATCACCTTGATCCCGCCGGCGTTGGTGCCGATATTGCCGCCAATCTGGCTGGAACCGCTGGAAGCGAAGTCCACCGGGTAATAAAGGCCTTGCTCTTCGGCGTAGGTTTGCAGCTGGCGGGTGACGACCCCTGGCTGGCAAACCACAGTACGGTCGAAAGCATTGAAGCCAAGGATCTGGTTCATGTAGTCGAAGGCGACGACAACCTCGCCATTGGCCGCCACGGCGCCGGCAGAAAGCCCGGTGCGCCCGCCAGAGGGCACCAGCGCCACCTTGTGCGCATTGGCCCAGTGCACAATGGCTTGCACCTGTT > AE015451/5880517‑5881117 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |