| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | AE015451 | 2,032,505 | 1680 bp→GCGGCCGC | [pgi‑I] | [pgi‑I] | |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | AE015451 | 2032505 | 2034184 | 1680 | 114 [0] | [0] 114 | [pgi‑I] | [pgi‑I] |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | AE015451 | = 2032504 | 0 (0.000) | 112 (1.090) +GCGGCCGC |
100/584 | 0.0 | 100% | intergenic (‑260/‑16) | kdsA‑II/pgi‑I | 2‑dehydro‑3‑deoxyphosphooctonate aldolase/glucose‑6‑phosphate isomerase |
| ? | AE015451 | 2034185 = | 0 (0.000) | intergenic (+1/+1440) | pgi‑I/PP_5477 | glucose‑6‑phosphate isomerase/conserved protein of unknown function | |||||
Only 100 of 114 total aligned reads displayed.
GACATCGAAAAGCTGGCCCCGCACAAGGTGATCCCGGGTAACCGCCCGAGCAACACATTGGTGGTCGAGCGCATCAGCCCGCGCCGGCTGGGTGCGCTGGTGGCCATGTACGAGCACAAGGTGTTCGTACAGAGCGTTATCTGGGGTATCAACGCCTTCGATCAGTGGGGCGTCGAGCTGGGCAAGGAACTGGGCAAGAGCGTTTACCAGCGCTTGGTCGGTAGCCTGGAAGACAGCGCCGAAGACGGTTCCACCCAAGGCCTGATCAATTACTTTCGTGGTAAACACCGTGGCTGACCCTGCTTGATACTGGCCCGGCGGGAGGAGCGTCCGAGCGGAGCTGGTGGTCGCCGGAAACACTAGCGCATCATGGCGGTGAATAGCAGGCCGCATTTCGACGCAGAGGTGGTACAGTCAACAGGGTAGGTAATTCGCAGATTTTGTCATCCATCCAAGTGCTAATGCTCTTGGATGGGGCTCAGTCCCAGTTGTGACTAGAGGATCTGAATGTACAATGCACTTCTGCTAATCGCTGCAATTGCCCTTACCGGATGCGCTGCGTCCTCGGAAATGAAGACGGTGAGAGGTAAGACAGGC > AE015451/2033888‑2034484 | cattcgattgtggagttgatcttgatcattttttactcgataggtccttagggggcaacccgcaggacatggcaaagggataatagtcagcgcgcccttgctaaccgtggttgtgccgattctacaatttttctgctgcctttcgagcatggcgaggctgccaggcgtttgtgagcggtattttgcgcgcatgaatgcggcttttccctttcttgcgcatgggcattgcctataatgtcgcagacgtggaacctgactacgattgataggttctggatttacccttatcgcggccgccccc > 2:483804‑M2/298‑300 (MQ=255) tcgattgtggagttgatcttgatcattttttactcgataggtccttagggggcaacccgcaggacatggcaaagggataatagtcagcgcgcccttgctaaccgtggttgtgccgattctacaatttttctgctgcctttcgagcatggcgaggctgccaggcgtttgtgagcggtattttgcgcgcatgaatgcggcttttccctttcttgcgcatgggcattgcctataatgtagccgacgtggaacctgacaacgattgataggttctggctttacccgtatcgcggccgcCCCTGCt > 1:93939‑M2/295‑301 (MQ=255) cgtgtgctttccgatctttgatcattttttactcgataggtccttagggggcaacccgcaggacatggcaaagggataatagtcagcgcgcccttgctaaccgtggttgtgccgattctacaatttttctgctgcctttcgagcatggcgaggctgccaggcgtttgtgagcggtattttgcgcgcatgaatgcggcttttccctttcttgcgcatgggcattgcctataatgtcgccgacgtggaacctgacaacgattgataggttctggctttacccgtatcgcggccgcCCCTGCtt < 3:403922‑M2/8‑1 (MQ=255) tgtggagttgatcttgatcattttttactcgataggtccttagggggcaacccgcaggacatggcaaagggataatagtcagcgcgcccttgctaaccgtggttgtgccgattctacaatttttctgctgcctttcgagcatggcgaggctgccaggcgtttgtgagcggtattttgcgcgcatgaatgcggcttttccctttcttgcgcatgggcattgcctataatgtcgccgacgtggaacctgacaacgattgataggttctggctttacccgtatcgcggccgcCCCTGCTTGATa > 1:321336‑M2/290‑301 (MQ=255) ttggagttgatcttgatcattttttactcgataggtccttagggggcaacccgcaggacatggcaaagggataatagtcagcgcgcccttgctaaccgtggttgtgccgattctacaatttttctgctgcctttcgagcatggcgaggctgccaggcgtttgtgagcggtattttgcgcgcatgaatgcggcttttccctttcttgcgcatgggcattgcctataatgtcgccgacgtggaacctgacaacgattgataggttctggctttacccgtatcgcggccgcCCCTGCTTGATAc < 4:463798‑M2/13‑1 (MQ=255) ttgatcattttttactcgataggtccttagggggcaacccgcaggacatggcaaagggataatagtcagcgcgcccttgctaaccgtggttgtgccgattctacaatttttctgctgcctttcgagcatggcgaggctgccaggcgtttgtgagcggtattttgcgcgcatgaatgcggcttttccctttcttgcgcatgggcattgcctataatgtcgccgacgtggaacctgacaacgattgataggttctggctttacccgtatcgcggccgcccctgcttagatcggaagagcgtcg > 1:403911‑M2/277‑284 (MQ=255) tgatcattttttactcgataggtccttagggggcaacccgcaggacatggcaaagggataatagtcagcgcgcccttgctaaccgtggttgtgccgattctacaatttttctgctgcctttcgagcatggcgaggctgccaggcgtttgtgagcggtagtttgcgcgcatgaatgcggcttttccctttcttgcgcatgggcattgcctataatgtcgccgatgtggaacctgacaacgtttgagaggttctggctttacccgtatcggggcccaCCCTGCTTGTAACGGGCCcggggggg > 2:450756‑M2/276‑300 (MQ=255) tattttttactcggtaggtccttagggggaaacccgcaggacatggcaaagggataatagtcagcgcgcccttgctaaccgtggttgtgccgattctacaatttttctgctgcctttcgagcatggcgaggctgccaggcgtttgtgagcggtattttgcgcgcatgaatgcggcttttccctttcttgcgcatgggcattgcctataatgtcgccgacgtggaacctgacaacgattgataggttctggctttacccgtatcgcggccgcCCCTGCTTGATACTGGCCCGGCGGgaggag < 2:282031‑M2/30‑1 (MQ=255) ataggtccttagggggcaacccgcaggacatggcaaagggataatagtcagcgcgcccttgctaaccgtggttgtgccgattctacaatttttctgctgcctttcgagcatggcgaggctgccaggcgtttgtgagcggtattttgcgcgcatgaatgcggcttttccctttcttgcgcatgggcattgcctataatgtcgccgacgtggaacctgacaacgattgataggttctggctttacccgtatcgcggccgcCCCTGCTTGATACTGGCCCGGCGGGAGGAGCGTCCGAGCGGAg > 1:445130‑M2/259‑301 (MQ=255) gtccttagggggcaacccgcaggacatggcaaagggataatagtcagcgcgcccttgctaaccgtggttgtgccgattctacaatttttctgctgcctttcgagcatggcgaggctgccaggcgtttgtgagcggtattttgcgcgcatgaatgcggcttttccctttcttgcgcatgggcattgcctataatgtcgccgacgtggaacctgacaacgattgataggttctggctttacccgtatcgcggccgcCCCTGCTTGATACTGGCCCGGCGGGAGGAGCGTCCGAGCGGAGCtgg > 3:258851‑M2/255‑301 (MQ=255) tccttagggggcaacccgcaggacatggcaaagggataatagtcagcgcgcccttgctaaccgtggttgtgccgattctacaatttttctgctgcctttcgagcatggcgaggctgccaggcgtttgtgagcggtattttgcgcgcatgaatgcggcttttccctttcttgcgcatgggcattgcctataatgtcgccgacgtggaacctgacaccgattgataggttctggctttacccgtatcgcggccgcCCCTGCTTGATACTGGCCCGGCGggaggagcgtccgcgccgacctggg > 2:205424‑M2/254‑289 (MQ=255) tagggggcaacccgcaggacatggcaaagggataatagtcagcgcgcccttgctaaccgtggttgtgccgattctacaatttttctgctgcctttcgagcatggcgaggctgccaggcgtttgtgagcggtattttgcgcgcatgaatgcggcttttccctttcttgcgcatgggcattgcctataatgtcgccgacgtggaacctgacaacgattgataggttctggctttacccgtatcgcggccgcCCCTGCTTGATACTGGCCCGGCGGGAGGAGCGTCCGAGCGGAGCtggtggtg > 2:843780‑M2/250‑300 (MQ=255) tagggggcaacccgcaggacatggcaaagggataatagtcagcgcgcccttgctaaccgtggttgtgccgattctacaatttttctgctgcctttcgagcatggcgaggctgccaggcgtttgtgagcggtattttgcgcgcatgaatgcggcttttccctttcttgcgcatgggcattgcctataatgtcgccgacgtgaaacctgacaacgattgataggttctggctttacccgtatcgcggccgcCCCTGCTTGATACTGGCCCGGCGGGAGGAGCGTCCGAGCGGAGCTGGTGGTc < 4:40187‑M2/52‑1 (MQ=255) 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aggacatggcaaagggataatagtcagcgcgcccttgctaaccgtggttgtgccgattctacaatttttctgctgcctttcgagcatggcgaggctgccaggcgtttgtgagcggtattttgcgcgcatgaatgcggcttttccctttcttgcgcatgggcattgcctataatgtcgccgacgtggaacctgacaacgattgataggttctggctttacccgtatcgcggccgcCCCTGCTTGATACTGGCCCGGCGGGAGGAGCGTCCGAGCGGAGCTGGTGGTCGCCGGAAACACTAgc < 3:321342‑M2/67‑1 (MQ=255) catggcaaagggataatagtcagcgcgcccttgctaaccgtggttgtgccgattctacaatttttctgctgcctttcgagcatggcgaggctgccaggcgtttgtgagcggtattttgcgcgcatgaatgcggcttttccctttcttgcgcatgcgcattgcctataatgtcgccgacgtggaacctgacaacgattgataggttctggctttacccgtatcgcggccgcCCCTGCTTGATACTGGCCCGGCGGGAGGAGCGTCCGAGCGGAGCTGGTGGTCGCCGGAAACACTAGCGcat < 1:551406‑M2/71‑1 (MQ=255) ggataatagtcagcgcgcccttgctaaccgtggttgtgccgattctacaatttttctgctgcctttcgagcatggcgaggctgccaggcgtttgtgagcggtattttgcgcgcatgaatgcggcttttccctttcttgcgcatgggcattgcctataatgtcgccgacgtggaacctgacaacgattgataggttctggctttacccgtatcgcggccgcCCCTGCTTGATACTGGCCCGGCGGGAGGAGCGTCCGAGCGGAGCTGGTGGTCGCCGGAAACACTAGCGCATCATGGCGGTg < 4:450883‑M2/81‑1 (MQ=255) 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tgacaacgattgataggttctggctttacccgtatcgcggccgcCCCTGCTTGATACTGGCCCGGCGGGAGGAGCGTCCGAGCGGAGCTGGTGGTCGCCGGAAACACTAGCGCATCATGGCGGTGAATAGCAGGCCGCATTTCGACGCAGAGGTGGTACAGTCAACAGGGTAGGTAATTCGCAGATTTTGTCATCCATCCAAGTGCTAATGCTCTTGGATGGGGCTCAGTCCCAGTTGTGACTAGAGGATCTGAATGTACAATGCACTTCTGCTAATCGCTGCAATTGCCCTTACCGGATg < 1:258846‑M2/257‑1 (MQ=255) aacgattgataggttctggctttacccgtatcgcggccgcCCCTGCTTGATACTGGCCCGGCGGGAGGAGCGTCCGAGCGGAGCTGGTGGTCGCCGGAAACACTAGCGCATCATGGCGGTGAATAGCAGGCCGCATTTCGACGCAGAGGTGGTACAGTCAACAGGGTAGGTAATTCGCAGATTTTGTCATCCATCCAAGTGCTAATGCTCTTGGATGGGGCTCAGTCCCAGTTGTGACTAGAGGATCTGAATGTACAATGCACTTCTGCTAATCGCTGCAATTGCCCTTACCGGATGCGCt > 4:813018‑M2/41‑301 (MQ=255) gattgataggttctggctttacccgtatcgcggccgcCCCTGCTTGATACTGGCCCGGCGGGAGGAGCGTCCGAGCGGAGCTGGTGGTCGCCGGAAACACTAGCGCATCATGGCGGTGAATAGCAGGCCGCATTTCGACGCAGAGGTGGTACAGTCAACAGGGTAGGTAATTCGCAGATTTTGTCATCCATCCAAGTGCTAATGCTCTTGGATGGGGCTCAGTCCCAGTTGTGACTAGAGGATCTGAATGTACAATGCACTTCTGCTAATCGCTGCAATTGCCCTTACCGGATGCGCTGCg > 1:88354‑M2/38‑301 (MQ=255) cgccggtctgcgcccgcCCCGGCTTGTAACGGGCCCGGCGGGAGGAGCGTCCGGGCGGAGGTGGTGGTAGCCGGAAACACTAGCGCATCATGGCGGTGAATAGCAGGCCGCATTTCGACGCAGAGGTGGTACAGTCAACAGGGTAGGTAATTCGCAGATTTTGTCATCCATCCAAGTGCTAATGCTCTTGGATGGGGCTCAGTCCCAGTTGTGACTAGAGGATCTGAATGTACAATGCACTTCTGCTAATCGCTGCAATTGCCCTTACCGGATGCGCTGCGTCCTCGGAAATGAAGACGGt < 2:432272‑M2/284‑1 (MQ=255) ccgtatcgcggccgcCCCTGCTTGATACTGGCCCGGCGGGAGGAGCGTCCGAGCGGAGCTGGTGGTCGCCGGAAACACTAGCGCATCATGGCGGTGAATAGCAGGCCGCATTTCGACGCAGAGGTGGTACAGTCAACAGGGTAGGTAATTCGCAGATTTTGTCATCCATCCAAGTGCTAATGCTCTTGGATGGGGCTCAGTCCCAGTTGTGACTAGAGGATCTGAATGTACAATGCACTTCTGCTAATCGCTGCAATTGCCCTTACCGGATGCGCTGCGTCCTCGGAAATGAAGACggtcg > 4:432395‑M2/16‑299 (MQ=255) cgtatcgcggccgcCCCTGCTTGATACTGGCCCGGCGGGAGGAGCGTCCGAGCGGAGCTGGTGGTCGCCGGAAACACTAGCGCATCATGGCGGTGAATAGCAGGCCGCATTTCGACGCAGAGGTGGTACAGTCAACAGGGTAGGTAATTCGCAGATTTTGTCATCCATCCAAGTGCTAATGCTCTTGGATGGGGCTCAGTCCCAGTTGTGACTAGAGGATCTGAATGTACAATGCACTTCTGCTAATCGCTGCAATTGCCCTTACCGGATGCGCTGCGTCCTCGGAAATGAAGACGGTgag > 4:400408‑M2/15‑301 (MQ=255) gtatcgcggccgcCCCTGCTTGATACTGGCCCGGCGGGAGGAGCGTCCGAGCGGAGCTGGTGGTCGCCGGAAACACTAGCGCATCATGGCGGTGAATAGCAGGCCGCATTTCGACGCAGAGGTGGTACAGTCAACAGGGTAGGTAATTCGCAGATTTTGTCATCCATCCAAGTGCTAATGCTCTTGGATGGGGCTCAGTCCCAGTTGTGACTAGAGGATCTGAATGTACAATGCACTTCTGCTAATCGCTGCAATTGCCCTTACCGGATGCGCTGCGTCCTCGGAAATGAAGACGGTgaga < 3:599347‑M2/288‑1 (MQ=255) cgcggccgcCCCTGCTTGATACTGGCCCGGCGGGAGGAGCGTCCGAGCGGAGCTGGTGGTCGCCGGAAACACTAGCGCATCATGGCGGTGAATAGCAGGCCGCATTTCGACGCAGAGGTGGTACAGTCAACAGGGTAGGTAATTCGCAGATTTTGTCATCCATCCAAGTGCTAATGCTCTTGGATGGGGCTCAGTCCCAGTTGTGACTAGAGGATCTGAATGTACAATGCACTTCTGCTAATCGCTGCAATTGCCCTTACCGGATGCGCTGCGTCCTCGGAAATGAAGACGGTGAGAGGTa > 4:740460‑M2/10‑301 (MQ=255) cCCCTGCTTGATACTGGCCCGGCGGGAGGAGCGTCCGAGCGGAGCTGGTGGTCGCCGGAAACACTAGCGCATCATGGCGGTGAATAGCAGGCCGCATTTCGACGCAGAGGTGGTACAGTCAACAGGGTAGGTAATTCGCAGATTTTGTCATCCATCCAAGTGCTAATGCTCTTGGATGGGGCTCAGTCCCAGTTGTGACTAGAGGATCTGAATGTACAATGCACTTCTGCTAATCGCTGCAATTGCCCTTACCGGATGCGCTGCGTCCTCGGAAATGAAGACGGTGAGAGGTAAGACAGGc < 1:53873‑M2/300‑1 (MQ=255) | GACATCGAAAAGCTGGCCCCGCACAAGGTGATCCCGGGTAACCGCCCGAGCAACACATTGGTGGTCGAGCGCATCAGCCCGCGCCGGCTGGGTGCGCTGGTGGCCATGTACGAGCACAAGGTGTTCGTACAGAGCGTTATCTGGGGTATCAACGCCTTCGATCAGTGGGGCGTCGAGCTGGGCAAGGAACTGGGCAAGAGCGTTTACCAGCGCTTGGTCGGTAGCCTGGAAGACAGCGCCGAAGACGGTTCCACCCAAGGCCTGATCAATTACTTTCGTGGTAAACACCGTGGCTGACCCTGCTTGATACTGGCCCGGCGGGAGGAGCGTCCGAGCGGAGCTGGTGGTCGCCGGAAACACTAGCGCATCATGGCGGTGAATAGCAGGCCGCATTTCGACGCAGAGGTGGTACAGTCAACAGGGTAGGTAATTCGCAGATTTTGTCATCCATCCAAGTGCTAATGCTCTTGGATGGGGCTCAGTCCCAGTTGTGACTAGAGGATCTGAATGTACAATGCACTTCTGCTAATCGCTGCAATTGCCCTTACCGGATGCGCTGCGTCCTCGGAAATGAAGACGGTGAGAGGTAAGACAGGC > AE015451/2033888‑2034484 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |