| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | AE015451 | 1,164,572 | 830 bp→TCA | coding (4‑833/864 nt) | hexR ← | DNA‑binding transcriptional regulator |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | AE015451 | 1164572 | 1165401 | 830 | 74 [0] | [0] 71 | hexR | DNA‑binding transcriptional regulator |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | AE015451 | = 1164571 | 0 (0.000) | 71 (0.830) +TCA |
66/546 | 0.5 | 100% | coding (834/864 nt) | hexR | DNA‑binding transcriptional regulator |
| ? | AE015451 | 1165402 = | 0 (0.000) | coding (3/864 nt) | hexR | DNA‑binding transcriptional regulator | |||||
GCGCTGAAGCTCAAGGGCGGCTGCCAGAAGGTCTACCCCGGTACGCCACGGGTGCAATTGCAGGACCCGGCCTGGCAGCGCGAGCTGTGCATCGATACCGGTGACAGCGACGACACCGTGGTCTGGCACCCTGGCAATCGCCCGCTGATGGGGGTGACCGGCCGCGAGTCGCAGCGTTTTGTCTGCGTCGAGGCGACCAGTGGCAGTGGCGAAGGCCTGAGCCTGGCACCTGGGCAGCGTGCGCACCTGCGTTTGCAGGCGCACCGGCTCAGTTGAGGTCGTCGTCCTCGATCGGGTAACGGCTGGCGTTGAGGCTTTCCTTGATCTTGCGCAGGTGAGGCTGGAAGTCCACGCCGCGGCGCAGGGTCATGCCGGTGGCCAGTACATCGAGCACGGTCAGCTGGATGATCCGCGAGGTCATTGGCATGTAGATGTCGGTATCTTCCGGCAGCGGAATGTGCAGGCTCAGGCTGCAGGCATTGGCCAGTGGCGAGCCTGCGGCGGTGAGGCCCAGCACCGAAGCGCCGTTTTCACGTGCCAGGCGCGCCACTTCGACCAGTTCGCGGGTGCGCCCGGTGTAGGAAATGATCACGAAC > AE015451/1164273‑1164868 | gcgcTGAAGCTCAAGGGCGGCTGCCAGAAGGTCTACCCCGGTACGCCACGGGTGCAATTGCAGGACCCGGCCTGGCAGCGCGAGCTGTGCATCGATACCGGTGACAGCGACGACACCGTGGTCTGGCACCCTGGCAATCGCCCGCTGATGGGGGTGACCGGCCGCGAGTCGCAGCGTTTTGTCTGCGTCGAGGCGACCAGTGGCAGTGGCGAAGGCCTGAGCCTGGCACCTGGGCAGCGTGCGCACCTGCGTTTGCAGGCGCACCGGCTCAGTTGAGGTCGTCGTCCTCGATCGGGTAAt > 2:88555‑M1/1‑299 (MQ=255) gAAGCTAAAGGGCGGCTGCCAGAAGGTCTACCCCGGTACGCCACGGGTGCAATTGCAGGACCCGGCCTGGCAGCGCGAGCTGTGCATCGATACCGGTGACAGCGACGACACCGTGGTCTGGCACCCTGGCAATCGCCCGCTGATGGGGGTGACCGGCCGCGAGTCGCAGCGTTTTGTCTGCGTCGAGGCGACCAGTGGCAGTGGCGAAGGCCTGAGCCTGGCACCTGGGCAGCGTGCGCACCTGCGTTTGCAGGCGCACCGGCTCAGTTGAGGTCGTCGTCCTCGATCGGGTAAtcacac < 2:726278‑M1/300‑7 (MQ=255) gggCGGCTGCCAGAAGGTCTACCCCGGTACGCCACGGGTGCAATTGCAGGACCCGGCCTGGCAGCGCGAGCTGTGCATCGATACCGGTGACAGCGACGACACCGTGGTCTGGCACCCTGGCAATCGCCCGCTGATGGGGGTGACCGGCCGCGAGTCGCAGCGTTTTGTCTGCGTCGAGGCGACCAGTGGCAGTGGCGAAGGCCTGAGCCTGGCACCTGGGCAGCGTGCGCACCTGCGTTTGCAGGCGCACCGGCTCAGTTGAGGTCGTCGTCCTCGATCGGGTAAtcccacgcggtcc > 2:407733‑M1/1‑285 (MQ=255) ggcTGCCAGAAGGTCTACCCCGGTACGCCACGGGTGCAATTGCAGGACCCGGCCTGGCAGCGCGAGCTGTGCATCGATACCGGTGACAGCGACGACACCGTGGTCTGGCACCCTGGCAATCGCCCGCTGATGGGGGTGACCGGCCGCGAGTCGCAGCGTTTTGTCTGCGTCGAGGCGACCAGTGGCAGTGGCGAAGGCCTGAGCCTGGCACCTGGGCAGCGTGCGCACCTGCGTTTGCAGGCGCACCGGCTCAGTTGAGGTCGTCGTCCTCGATCGGGTAAtcacacgcggtccatgggt > 1:424773‑M1/1‑281 (MQ=255) gCCAGAAGGTCTACCCCGGTACGCCACGGGTGCAATTGCAGGACCCGGCCTGGCAGCGCGAGCTGTGCATCGATACCGGTGACAGCGACGACACCGTGGTCTGGCACCCTGGCAATCGCCCGCTGATGGGGGTGACCGGCCGCGAGTCGCAGCGTTTTGTCTGCGTCGAGGCGACCAGTGGCAGTGGCGAAGGCCTGAGCCTGGCACCTGGGCAGCGTGCGCTCCTGCGTTTGCAGGCGCACCGGCTCAGTTGAGGTCGTCGTCCTCGATCGGGTAAtcacacgcggtcc < 1:411700‑M1/290‑14 (MQ=255) aGAAGGTCTACCCCGGTACGCCACGGGTGCAATTGCAGGACCCGGCCTGGCAGCGCGAGTTGTGCATCGATACCGGTGACAGCGACGACACCGTGGTCTGGCACCCTGGCAATCGCCCGCTGATGGGGGTGACCGGCCGCGAGTCGCAGCGTTTTGTCTGCGTCGAGGCGACCAGTGGCAGTGGCTAAGGCCTGAGCCTGGCACCTGGGCAGCGTTCGCACCTGCGTTTGCAGGCGCACCGGCTCAGTTGAGGTCGTCGTCCTCGATCGGGTAAtc > 2:182252‑M1/1‑274 (MQ=255) aGAAGGTCTACCCCGGTACGCCACGGGTGCAATTGCAGGACCCGGCCTGGCAGCGCGAGTTGTGCATCGATACCGGTGACAGCGACGACACCGTGGTCTGGCACCCTGGCAATCGCCCGCTGATGGGGGTGACCGGCCGCGAGTCGCAGCGTTTTGTCTGCGTCGAGGCGACCAGTGGCAGTGGCGAAGGCCTGAGCCTGGCACCTGGGCAGCGTGCGCACCTGCGTTTGCAGGCGCACCGGCTCAGTTGAGGTCGTCGTCCTCGATCGGGTAAtc < 1:182256‑M1/276‑3 (MQ=255) 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tGCAATTGCAGGACCCGGCCTGGCAGCGCGAGCTGTGCATCGATACCGGTGACAGCGACGACACCGTGGTCTGGCACCCTGGCAATCGCCCGCTGATGGGGGTGACCGGCCGCGAGTCGCAGCGTTTTGTCTGCGTCGAGGCGACCAGTGGCAGTGGCGAAGGCCTGAGCCTGGCACCTGGGCAGCGTGCGCACCTGCGTTTGCAGGCGCACCGGCTCAGTTGAGGTCGTCGTCCTCGATCGGGTAAtcacacgcggtccatgggtgtgtccttgggtcgggaagacagccggctgtgtg > 1:735507‑M1/1‑247 (MQ=255) gCAATTGCAGGACCCGGCCTGGCGGCGCGAGCTGTGCATCGATACCGGTGACAGCGACGACACCGTGGTCTGGCACCCTGGCAATCGCCCGCTGATGGGGGTGACCGGCCGCGAGTCGCAGCGTTTTGTCTGCGTCGAGGCGACCAGTGGCAGTGGCGAAGGCCTGAGCCTGGCACCTGGGCAGCGTGCGCACCTGCGTTTGCAGGCGCACCGGCTCAGTTGAGGTAGTCGTCCTCGATCGGGTAAtcac > 2:410488‑M1/1‑246 (MQ=255) aatggcaggACCCGGCCTGGCAGCGCGAGCTGTGCATCGATACCGGTGACAGCTACGACACCGTGGTCTGGCACCCTGGCAATCGCCCGCTGATGGGGGTGACCGGCCGCGAGTCGCAGCGTTTTGTCTGCGTCGAGGCGACCAGTGGCAGTGGCGAAGGCCTGAGCCTGGCACCTGGGCAGCGTGCGCACCTGCGTTTGCAGGCGCACCGGCTCAGTTGAGGTCGTCGTCCTCGATCGGGTAAtcacacgcggtccatgggtgtgtccttgggtcgggaagacagccggctgtgtgagc < 2:245891‑M1/296‑57 (MQ=255) cAGGACCCGGCCTGGCAGCGCGAGCTGTGCATCGATACCGGTGACAGCGACGACACCGTGGTCTGGCACCCTGGCAATCGCCCGCTGATGGGGGTGACCGGCCGCGAGTCGCAGCGTTTTGTCTGCGTCGAGGCGACCAGTGGCAGTGGCGAAGGCCTGAGCCTGGCACCTGGGCAGCGTGCGCACCTGCGTTTGCAGGCGCACCGGCTCAGTTGAGGTCGTCGTCCTCGATCGGGTAAtcacacgcggtccatgggtgtgtccttgggtcgggaagacagccggctgtgtgagc > 2:586380‑M1/1‑239 (MQ=255) aGGACCCGGCCTGGCAGCGCGAGCTGTGCATCGATACCGGTGACAGCGACGACACCGTGGTCTGGCACCCTGGCAATCGCCCGCTGATGGGGGTGACCGGCCGCGAGTCGCAGCGTTTTGTCTGCGTCGAGGCGACCAGTGGCAGTGGCGAAGGCCTGAGCCTGGCACCTGGGCAGCGTGCGCACCTGCGTTTGCAGGCGCACCGGCTCAGTTGAGGTCGTCGTCCTCGATCGGGTAAtcacacgcggtccatgggtgtgtccttgggt > 1:386536‑M1/1‑238 (MQ=255) gCCTGGCAGCGCGAGCTGTGCATCGATACCGGTGACAGCGACGACACCGTGGTCTGGCACCCTGGCAATCGCCCGCTGATGGGGGTGACCGGCCGCGAGTCACAGCGTTTTGTCTGCGTCGAGGCGACCAGTGGCAGTGGCGAAGGCCTGAGCCTGGCACCTGGGCAGCGTGCGCACCTGCGTTTGCAGGCGCACCGGCTCAGTTGAGGTCGTCGTCCTCGATCGGGTAAtcacacgcggtccatgggtgtgtccttgggtcgggaagacagccggctgtgtgagcagcaggctttttgc < 1:439766‑M1/300‑71 (MQ=255) cTGGCAGCGCGAGCTGTGCATCGATACCGGTGACAGCGACGACACCGTGGTCTGGCACCCTGGCAATCGCCCGCTGATGGGGGTGACCGGCCGCGAGTCGCAGCGTTTTGTCTGCGTCGAGGCGACCAGTGGCAGTGGCGAAGGCCTGAGCCTGGCACCTGGGCAGCGTGCGCACCTGCGTTTGCAGGCGCACCGGCTCAGTTGAGGTCGTCGTCCTCGATCGGGTAAtcacacgcggtccatgggtgtgtccttgggtcgggaagacagccggctgtgtgagcagcaggctttttgcac > 1:326718‑M1/1‑228 (MQ=255) cgAGCTGTGCATCGATACCGGTGACAGCGACGACACCGTGGTCTGGCACCCTGGCAATCGCCCGCTGATGGGGGTGACCGGCCGCGAGTCGCAGCGTTTTGTCTGCGTCGAGGCGACCAGTGGCAGTGGCGAAGGCCTGAGCCTGGCACCTGGGCAGCGTGCGCACCTGCGTTTGCAGGCGCACCGGCTCAGTTGAGGTCGTCGTCCTCGATCGGGTAAtcacacgcggtccatgggtgtgtccttgggtcgggaagacagccggctgtgtgagcagcaggctttttgcacggtcg > 2:517259‑M1/1‑219 (MQ=255) gAGCTGTGCATCGATACCGGTGACAGCGACGACACCGTGGTCTGGCACCCTGGCAATCGCCCGCTGATGGGGGTGACCGGCCGCGAGTCGCAGCGTTTTGTCTGCGTCGAGGCGACCAGTGGCAGTGGCGAAGGCCTGAGCCTGGCACCTGGGCAGCGTGCGCACCTGCGTTTGCAGGCGCACCGGCTCAGTTGAGGTCGTCGTCCTCGATCGGGTAAtcacacgcggtccatgggtgtgtccttgggtcgggaagacagccggctgtgtgagcagcaggctttttgcacg > 1:706377‑M1/1‑218 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |