| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | AE015451 | 1,164,572 | 830 bp→TCA | coding (4‑833/864 nt) | hexR ← | DNA‑binding transcriptional regulator |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | AE015451 | 1164572 | 1165401 | 830 | 74 [0] | [0] 71 | hexR | DNA‑binding transcriptional regulator |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | AE015451 | = 1164571 | 0 (0.000) | 71 (0.830) +TCA |
66/546 | 0.5 | 100% | coding (834/864 nt) | hexR | DNA‑binding transcriptional regulator |
| ? | AE015451 | 1165402 = | 0 (0.000) | coding (3/864 nt) | hexR | DNA‑binding transcriptional regulator | |||||
GAAGATCTTCTGGGTGTAGGCGGCCGGGTCATCGTCGGCCTCTACCGCGCGGCTGACATAGGCGGCACCACTGGCCAGGCTCTGCGCCAGTTGCAGCTTGAGTTCGGGGTAGCCGCTGACGCCGAACGAGCGGCAGAAGCGGTTGACGGTCGGTTCGCTGACCTTGGCCGCCTGGGCCAGCGCAGCGATGCTGAAACGGGTGGCTTGTTGCGGGTTGAGCAGGATGACTTCGGCGACTTTGCGTTCGGCCTTGTTCAGCTCGTCGAGGCGGCCCTGGATCTGTTCCAGGAGGTTTCGCACGCGGTCCATGGGTGTGTCCTTGGGTCGGGAAGACAGCCGGCTGTGTGAGCAGCAGGCTTTTTGCACGGTCGTCTATCGTACTGTCGGTGCGGTTGACGTACCACTTGTCTGTAACACTTGTGTGTAATGTTGTGGTTTTTACTACATTATCCCTTGAAAACCGTGTGTGAAAGCGGTATTCCTAGACCAACTTTAGGAAAGAACCAACATCATGGCCGCAATCAGTGTCGAACCTTGCACCTTTGCCCTGTTTGGCGCCCTCGGCGACCTGGCATTGCGCAAGCTGTTTCC > AE015451/1165105‑1165695 | gaagctaaagggcggctgccagaaggtctaccccggtacgccacgggtgcaattgcaggacccggcctggcagcgcgagctgtgcatcgataccggtgacagcgacgacaccgtggtctggcaccctggcaatcgcccgctgatgggggtgaccggccgcgagtcgcagcgttttgtctgcgtcgaggcgaccagtggcagtggcgaaggcctgagcctggcacctgggcagcgtgcgcacctgcgtttgcaggcgcaccggctcagttgaggtcgtcgtcctcgatcgggtaatcacac < 2:726278‑M2/3‑1 (MQ=255) gggcggctgccagaaggtctaccccggtacgccacgggtgcaattgcaggacccggcctggcagcgcgagctgtgcatcgataccggtgacagcgacgacaccgtggtctggcaccctggcaatcgcccgctgatgggggtgaccggccgcgagtcgcagcgttttgtctgcgtcgaggcgaccagtggcagtggcgaaggcctgagcctggcacctgggcagcgtgcgcacctgcgtttgcaggcgcaccggctcagttgaggtcgtcgtcctcgatcgggtaatccCACGCGGTcc > 2:407733‑M2/289‑298 (MQ=255) ggctgccagaaggtctaccccggtacgccacgggtgcaattgcaggacccggcctggcagcgcgagctgtgcatcgataccggtgacagcgacgacaccgtggtctggcaccctggcaatcgcccgctgatgggggtgaccggccgcgagtcgcagcgttttgtctgcgtcgaggcgaccagtggcagtggcgaaggcctgagcctggcacctgggcagcgtgcgcacctgcgtttgcaggcgcaccggctcagttgaggtcgtcgtcctcgatcgggtaatcaCACGCGGTCCATGGgt > 1:424773‑M2/285‑300 (MQ=255) gccagaaggtctaccccggtacgccacgggtgcaattgcaggacccggcctggcagcgcgagctgtgcatcgataccggtgacagcgacgacaccgtggtctggcaccctggcaatcgcccgctgatgggggtgaccggccgcgagtcgcagcgttttgtctgcgtcgaggcgaccagtggcagtggcgaaggcctgagcctggcacctgggcagcgtgcgctcctgcgtttgcaggcgcaccggctcagttgaggtcgtcgtcctcgatcgggtaatcaCACGCGGTcc < 1:411700‑M2/10‑1 (MQ=255) gtctaccccggtacgccacgggtgcaattgcaggacccggcctggcagcgcgagctgtgcatcgataccggtgacagcgacgacaccgtggtctggcaccctggcaatcgcccgctgatgggggtgaccggccgcgagtcgcagcgttttgtctgcgtcgaggcgaccagtggcagtggcgaaggcctgagcctggcacctgggcagcgtgcgcacctgcgtttgcaggcgcaccggctcagttgaggtcgtcgtcctcgatcgggtaatcaCACGCGGTCCATGGGTGTGTCCTTgg > 1:341300‑M2/273‑298 (MQ=255) gccacgggtgcaattgcaggacccggcctggcagcgcgagctgtgcatcgataccggtgacagcgacgacaccgtggtctggcaccctggcaatcgcccgctgatgggggtgaccggccgcgagtcgcagcgttttgtctgcgtcgaggcgaccagtggcagtggcgaaggcctgagcctggcacctgggcagcgtgcgcacctgcgtttgcaggcgcaccggctcagttgaggtcgtcgtcctcgatcgggtaatcaCACGCGGTCCATGGGTGTGTCCTTGGGTCGGGAAGACAGCCgg > 1:848885‑M2/259‑301 (MQ=255) gggtgcaattgcaggacccggcctggcagcgcgagctgtgcatcgataccggtgacagcgacgacaccgtggtctggcaccctggcaatcgcccgctgatgggggtgaccggccgcgagtcgcagcgttttgtctgcgtcgaggcgaccagtggcagtggcgaaggcctgagcctggcacctgggcagcgtgcgcacctgcgtttgcaggcgcaccggctcagttgaggtcgtcgtcctcgatcgggtaatcaCACGCGGTCCATGGGTGTGTCCTTGGGTCGGGAAGACAGCCGGCt > 1:83194‑M2/254‑298 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |