Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
MC JC | AE015451 | 2,032,505 | 1680 bp→GCGGCCGC | [pgi‑I] | [pgi‑I] |
Missing coverage evidence... | ||||||||||
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seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
* | * | ÷ | AE015451 | 2032505 | 2034184 | 1680 | 71 [0] | [0] 75 | [pgi‑I] | [pgi‑I] |
New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | AE015451 | = 2032504 | 0 (0.000) | 71 (0.850) +GCGGCCGC |
66/536 | 0.5 | 100% | intergenic (‑260/‑16) | kdsA‑II/pgi‑I | 2‑dehydro‑3‑deoxyphosphooctonate aldolase/glucose‑6‑phosphate isomerase |
? | AE015451 | 2034185 = | 0 (0.000) | intergenic (+1/+1440) | pgi‑I/PP_5477 | glucose‑6‑phosphate isomerase/conserved protein of unknown function |
GTGGAGTTGATCTTGATCATTTTTTACTCGATAGGTCCTTAGGGGGCAACCCGCAGGACATGGCAAAGGGATAATAGTCAGCGCGCCCTTGCTAACCGTGGTTGTGCCGATTCTACAATTTTTCTGCTGCCTTTCGAGCATGGCGAGGCTGCCAGGCGTTTGTGAGCGGTATTTTGCGCGCATGAATGCGGCTTTTCCCTTTCTTGCGCATGGGCATTGCCTATAATGTCGCCGACGTGGAACCTGACAACGATTGATAGGTTCTGGCTTTACCCGTATCAAGGATCTTTTTGCAATGGCGTTCTACCGTACACCTCACGATGTCACTGCTCTGCCAGCCTGGAAGGCGCTTCAGCAACACCGCGAAGCCATGCGAGGCTTCAGCATGTCCGAAGCCTTTGCCGCCGATGCCAAGCGCTTCGACCAGTTTTCCCTTAGCGCTTGCGGCCTGTTCCTCGACTACTCAAAAAACCTGATCACCGAGCAAAGCCGCGATCTGCTGGTCAACCTGGCCAATGAAGTGGGCCTGCAGGACGCCATCAAGTCGATGTTCAGCGGTGAGATCATCAACGC > AE015451/2032225‑2032797 | gtgGAGTTGATCTTGATCATTGTTTACTCGATAGGTCCTTAGGGGGCAACCCGCAGGACATGGCAAAGGGATAATAGTCAGCGCGCCCTTGCTAACCGTGGTTGTGCCGATTCTACAATTTTTCTGCTGCCTTTCGAGCATGGCGAGGCTACCAGGCGTTTGTGAGCGGTATTTTGCGCGCATGAATGCGGCTTTTCCCTTTCTTGCGCATGGGCATTGCCTATAATGTCGCCGACGTGGAACCTGACAACGATTGATAGGTTCTGGCTTTACCCGTATCgcggccgcccctgcttgata < 2:41974‑M1/300‑21 (MQ=255) gatcttgatcATTTTTTACTCGATAGGTCCTTAGGGGGCAACCCGCAGGACATGGCAAAGGGATAATAGTCAGCGCGCCCTTGCTAACCGTGGTTGTGCCGATTCTACAATTTTTCTGCTGCCTTTCGAGCATGGCGAGGCTGCCAGGCGTTTGTGAGCGGTATTTTGCGCGCATGAATGCGGCTTTTCCCTTTCTTGCGCATGGGCATTGCCTATAATGTCGCCGACGTGGAACCTGACAACGATTGATAGGTTCTGGCTTTACCCGTATCgcggccgcccctgcttgatactggcccg > 1:51826‑M1/1‑272 (MQ=255) tttACTCGATAGGTCCTTAGGGGGCAACCCGCAGGACATGGCAAAGGGATAATAGTCAGCGCGCCCTTGCTAACCGTGGTTGTGCCGATTCTACAATTTTTCTGCTGCCTTTCGAGCATGGCGAGGCTGCCAGGCGTTTGTGAGCGGTATTTTGCGCGCATGAATGCGGCTTTTCCCTTTCTTGCGCATGGGCATTGCCTATAATGTCGCCGACGTGGAACCTGACAACGATTGATAGGTTCTGGCTTTACCCGTATCgcggccgcccctgcttgatactggcccggcgggaggagcgtc < 1:527033‑M1/300‑43 (MQ=255) tACTCGATAGGTCCTTAGGGGGCAACCCGCAGGACATGGCAAAGGGATAATAGTCAGCGCGCCCTTGCTAACCGTGGTTGTGCCGATTCTACAATTTTTCTGCTGCCTTTCGAGCATGGCGAGGCTGCCAGGCGTTTGTGAGCGGTATTTTGCGCGCATGAATGCGGCTTTTCCCTTTCTTGCGCATGGGCATTGCCTATAATGTCGCCGACGTGGAACCTGACAACGATTGATAGGTTCTGGCTTTACCCGTATCgcggccgcccctgcttgatactggcccggcgggaggagcgtcc > 2:737566‑M1/1‑256 (MQ=255) aTGGCAAAGGGATAATAGTCAGCGCGCCCTTGCTAACCGTGGTTGTGCCGATTCTACAATTTTTCTGCTGCCTTTCGAGCATGGCGAGGCTGCCAGGCGTTTGTGAGCGGTATTTTGCGCGCATGAATGCGGCTTTTCCCTTTCTTGCGCATGGGCATTGCCTATAATGTCGCCGACGTGGAACCTGACAACGATTGATAGGTTCTGGCTTTACCCGTATCgcggccgcccctgcttgatactggcccggcgggaggagcgtccgagcggagctggtggtcgccggaaacactagcg < 2:51824‑M1/297‑77 (MQ=255) ggCAAAGGGATAATAGTCAGCGCGCCCTTGCTAACCGTGGTTGTGCCGATTCTACAATTTTTCTGCTGCCTTTCGAGCATGGCGAGGCTGCCAGGCGTTTGTGAGCGGTATTTTGCGCGCATGAATGCGGCTTTTCCCTTTCTTGCGCATGGGCATTGCCTATAATGTCGCCGACGTGGAACCTGACAACGATTGATAGGTTCTGGCTTTACCCGTATCgcggccgcccctgcttgatactggcccgg > 2:726047‑M1/1‑219 (MQ=255) aaGGGATAATAGTCAGCGCGCCCTTGCTAACCGTGGTTGTGCCGATTCTACAATTTTTCTGCTGCCTTTCGAGCATGGCGAGGCTGCCAGGCGTTTGTGAGCGGTATTTTGCGCGCATGAATGCGGCTTTTCCCTTTCTTGCGCATGGGCATTGCCTATAATGTCGCCGACGTGGAACCTGACAACGATTGATAGGTTCTGGCTTTACCCGTATCgcggccgcccctgcttgatactggcccggcgggaggagcgtccgagcggagctggtggtcgccggaaacactagcgcatcatggcg < 2:607112‑M1/301‑87 (MQ=255) aaGGGATAATAGTCAGCGCGCCCTTGCTAACCGTGGTTGTGCCGATTCTACAATTTTTCTGCTGCCTTTCGAGCATGGCGAGGCTGCCAGGCGTTTGTGAGCGGTATTTTGCGCGCATGAATGCGGCTTTTCCCTTTCTTGCGCATGGGCATTGCCTATAATGTCGCCGACGTGGAACCTGACAACGATTGATAGGTTCTGGCTTTACCCGTATCgcggccgcccctgcttgatactggcccggcgggaggagcgtccgagcggagctggtggtcgccggaaacactagcccatcatggc > 2:180134‑M1/1‑215 (MQ=255) gggATAATAGTCAGCGCGCCCTTGCTAACCGTGGTTGTGCCGATTCTACAATTTTTCTGCTGCCTTTCGAGCATGGCGAGGCTGCCAGGCGTTTGTGAGCGGTATTTTGCGCGCATGAATGCGGCTTTTCCCTTTCTTGCGCATGGGCATTGCCTATAATGTCGCCGACGTGGAACCTGACAACGATTGATAGGTTCTGGCTTTACCCGTATCgcggccgcccctgcttgatactggcccggcgggaggagcgtccgagcggagctggtggtcgccggaaacactagcgcatcatggcgg > 1:862477‑M1/1‑213 (MQ=255) gATAATAGTCAGCGCGCCCTTGCTAACCGTGGTTGTGCCGATTCTACAATTTTTCTGCTGCCTTTCGAGCATGGCGAGGCTGCCAGGCGTTTGTGAGCGGTATTTTGCGCGCATGAATGCGGCTTTTCCCTTTCTTGCGCATGGGCATTGCCTATAATGTCGCCGACGTGGAACCTGACAACGATTGATAGGTTCTGGCTTTACCCGTATCgcggccgcccctgcttgatactggcccggcggg > 1:337904‑M1/1‑211 (MQ=255) 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ccTTGCTAACCGTGGTTGTGCCGATTCTACAATTTTTCTGCTGCCTTTCGAGCATGGCGAGGCTGCCAGGCGTTTGTGAGCGGTATTTTGCGCGCATGAATGCGGCTTTTCCCTTTCTTGCGCATGGGCATTGCCTATAATGTCGCCGACGTGGAACCTGACAACGATTGATAGGTTCTGGCTTTACCCGTATCacggccgcccctgcttgatactggcccggcgggaggagcgtccgagcggagctggtggtcgccggaaacactagcgcatcatggcggtgaataggaggccgcattt > 2:890718‑M1/1‑194 (MQ=255) gTGGTTGTGCCGATTCTACAATTTTTCTGCTGCCTTTCGAGCATGGCGAGGCTGCCAGGCGTTTGTGAGCGGTATTTTGCGCGGATGAATGCGGCTTTTCCCTTTCTTGCGCATGGGCATTGCCTATAATGTCGCCGACGTGGAACCTGACAACGATTGATAGGTTCTGGCTTTACCCGTATCgcggccgcccctgcttgatactggcccggcgggaggagcgtccgagcggagctggtggtcgccggaaacactagcgcatcatggcggtgaatagcaggccgcatttcgacgc > 2:961883‑M1/1‑183 (MQ=255) gTTGTGCCGATTCTACAATTTTTCTGCTGCCTTTCGAGCATGGCGAGGCTGCCAGGCGTTTGTGAGCGGTATTTTGCGCGCATGAATGCGGCTTTTCCCTTTCTTGCGCATGGGCATTGCCTATAATGTCGCCGACGTGGAACCTGACAACGATTGATAGGTTCTGGCTTTACCCGTATCgcggccgcccctgcttgatactggcccggcgggaggagcgtccgagcggagctggtggtcgccggaaacactagcgcatcatggcggtgaatagcaggccgcatttcgacgcagaggtgg > 1:362315‑M1/1‑180 (MQ=255) gtgCCGATTCTACAATTTTTCTGCTGCCTTTCGAGCATGGCGAGGCTGCCAGGCGTTTGTGAGCGGTATTTTGCGCGCATGAATGCGGCTTTTCCCTTTCTTGCGCATGGGCATTGCCTATAATGTCGCCGACGTGGAACCTGACAACGATTGATAGGTTCTGGCTTTACCCGTATCgcggccgcccctgcttgatactggcccggcgggaggagcgtccgagcggagctggtggtcgccggaaacactagcgcatcatggcggtgaatagtaggccgcatttcgacgcagaggtggtac < 1:585911‑M1/300‑124 (MQ=255) cGATTCTACAATTTTTCTGCTGCCTTTCGAGCATGGCGAGGCTGCCAGGCGTTTGTGAGCGGTATTTTGCGCGCATGAATGCGGCTTTTCCCTTTCTTGCGCATGGGCATTGCCTATAATGTCGCCGACGTGGAACCTGACAACGATTGATAGGTTCTGGCTTTACCCGTATCgcggccgcccctgcttgatactggcccggcgggaggagcgtccgagcggagctggtggtcgccggaaacactagcgcatcatggc > 1:772001‑M1/1‑173 (MQ=255) tCTACAATTTTTCTGCTGCCTTTCGAGCATGGCGAGGCTGCCAGGCGTTTGTGAGCGGTATTTTGCGCGCATGAATGCGGCTTTTCCCTTTCTTGCGCATGGGCATTGCCTATAATGTCGCCGACGTGGAACCTGACAACGATTGATAGGTTCTGGCTTTACCCGTATCgcggccgcccctgcttgatactggcccggcgggaggagcgtccgagcggagctggtggtcgccggaaacactagcgcatcatggcggtgaatag < 2:862451‑M1/263‑95 (MQ=255) cTACAATTTTTCTGCTGCCTTTCGAGCATGGCGAGGCTGCCAGGCGTTTGTGAGCGGTATTTTGCGCGCATGAATGCGGCTTTTCCCTTTCTTGCGCATGGGCATTGCCTATAATGTCGCCGACGTGGAACCTGACAACGATTGATAGGTTCTGGCTTTACCCGTATCgcggccgcccctgcttgatactggcccggcgggaggagcgtccgagcggagctggtggtcgccggaaacactagcgcatcatggcggtgaatagcaggccgcatttcgacgcagaggtggtacagtcaacagg > 2:21151‑M1/1‑168 (MQ=255) tttCTGCTGCCTTTCGAGCATGGCGAGGCTGCCAGGCGTTTGTGAGCGGTATTTTGCGCGCATGAATGCGGCTTTTCCCTTTCTTGCGCATGGGCATTGCCTATAATGTCGCCGACGTGGAACCTGACAACGATTGATAGGTTCTGGCTTTACCCGTATCgcggccgcccctgcttgatactggcccggcgggaggagcgtccgagcggagctggtggtcgccggaaacactagcgcatcatggcggtgaatagcaggccgcatttcgacgcagaggtggtaca < 2:771975‑M1/284‑125 (MQ=255) tCTGCTGCCTTTCGAGCATGGCGAGGCTGCCAGGCGTTTGTGAGCGGTATTTTGCGCGCATGAATGCGGCTTTTCCCTTTCTTGCGCATGGGCATTGCCTATAATGTCGCCGACGTGGAACCTGACAACGATTGATAGGTTCTGGCTTTACCCGTATCgcggccgcccctgcttgatactggcccggcgggaggagcgtccgagcggagctggtggtcgccggaaacactagcgcatcatggcggtgaatagcaggccgcatttcgacgcagaggtggtaccgtcaaccgggtaggtaatt > 1:248031‑M1/1‑158 (MQ=255) gcCTTTCGAGCATGGCGAGGCTGCCAGGCGTTTGTGAGCGGTATTTTGCGCGCATGAATGCGGCTTTTCCCTTTCATGCGCATGGGCATTGCCTATAATGTCGCCGACGTGGAACCTGACAACGATTGATAGGTTCTGGCTTTACCCGTATCgcggccgcccctgcttgatactggcccggcgggaggagcgtccgagcggagctggtggtcgccggaaacactagcgcatcatggcggtgaatagcaggccgcatttcgacgcagaggtggtacagtcaacagggtaggtaattcgcag < 1:658797‑M1/300‑149 (MQ=255) ttCGAGCATGGCGAGGCTGCCAGGCGTTTGTGAGCGGTATTTTGCGCGGATGAATGCGGCTTTTACCTTTCTTGCGCATGGGCATTGCCTATAATGTCGCCGACGTGGAACCTGACAACGATTGATAGGTTCTGGCTTTACCCGTATCgcggccgcccctgcttgatactggcccggcgggaggagcgtccgagcggagctggtggtcgccggaaacactagcgcatcatggcggtgaatagcaggccgcatttcgacgcagaggtggtacagtcaacagggtaggtaattcgcagat < 1:961909‑M1/298‑151 (MQ=255) gAGCATGGCGAGGCTGCCAGGCGTTTGTGAGCGGTATTTTGCGCGCATGAATGCGGCTTTTCCCTTTCTTGCGCATGGGCATTGCCTATAATGTCGCCGACGTGGAACCTGACAACGATTGATAGGTTCTGGCTTTACCCGTATCgcggccgcccctgcttgatactggcccggcgggaggagcgtccgagcggagctggtggtcgccggaaacactagcgcatcatggcggtgaatagcaggccgcatttcgacgcagaggtggtacagtcaacagggtaggtaattcgcagattt > 1:227958‑M1/1‑145 (MQ=255) gCATGGCGCGGCTGCCAGGCGTTTGTGAGCGGTATTTTGCGCGCATGAATGCGGCTTTTCCCTTTCTTGCGCATGGGCATTGCCTATAATGTCGCCGACGTGGAACCTGACAACGATTGATAGGTTCTGGCTTTACCCGTATCgcggccgcccctgcttgatactggcccggcgggaggagcgtccgagcggagctggtggtcgccggaaacactagcgcatcatggcggtgaata < 2:321447‑M1/236‑94 (MQ=255) aTGGCGAGGCTGCCAGGCGTTTGTGAGCGGTATTTTGCGCGCATGAATGCGGCTTTTCCCTTTCTTGCGCATGGGCATTGCCTATAATGTCGCCGACGTGGAACCTGACAACGATTGATAGGTTCTGGCTTTACCCGTATCgcggccgcccctgcttgatactggcccggcgggaggagcgtccgagcggagctggtggtcgccggaaacactagcgcatcatggcggtgaatagcaggccgcatttcgacgcagaggtggtacagtcaacagggtaggtaattcgcagattttgtcatcc > 1:2375‑M1/1‑141 (MQ=255) aTGGCGAGGCTGCCAGGCGTTTGTGAGCGGTATTTTGCGCGCATGAATGCGGCTTTTCCCTTTCTTGCGCATGGGCATTGCCTATAATGTCGCCGACGTGGAACCTGACAACGATTGATAGGTTCTGGCTTTACCCGTATCgcggccgcccctgcttgatactggcccggcgggaggagcgtccgagcggagctggtggtcgccggaaacactagcgcatcatggcggtgaatagcaggccgcatttcgacgcagaggtggtacagtcaacagggtaggtaattcgcagattt > 1:573158‑M1/1‑141 (MQ=255) aTGGCGAGGCTGCCAGGCGTTTGTGAGCGGTATTTTGCGCGCATGAATGCGGCTTTTCCCTTTCTTGCGCATGGGCATTGCCTATAATGTCGCCGACGTGGAACCTGACAACGATTGATAGGTTCTGGCTTTACCCGTATCgcggccgcccctgcttgatactggcccggcgggaggagcgtccgagcggagctggtggtcgccggaaacactagcgcatcatggcggtgaatagcaggccgcatttcgacgcagaggtggtacagtcaacagggtaggtaattcgcagattt < 2:573136‑M1/293‑153 (MQ=255) aTGGCGAGGCTGCCAGGCGTTTGTGAGCGGTATTTTGCGCGCATGAATGCGGCTTTTCCCTTTCTTGCGCATGGGCATTGCCTATAATGTCGCCGACGTGGAACCTGACAACGATTGATAGGTTCTGGCTTTACCCGTATCgcggccgcccctgcttgatactggcccggcgggaggagcgtccgagcggagctggtggtcgccggaaacactagcgcatcatggcggtgaatagcaggccgcatttcgacgcagaggtggtacagtc > 1:303556‑M1/1‑141 (MQ=255) ggCGAGGCTGCCAGGCGTTTGTGAGCGGTATTTTGCGCGCATGAATGCGGCTTTTCCCTTTCTTGCGCATGGGCATTGCCTATAATGTCGCCGACGTGGAACCTGACAACGATTGATAGGTTCTGGCTTTACCCGTATCgcggccgcccctgcttgatactggcccggcgggaggagcgtccgagcggagctggtggtcgccggaaacactagcgcatcatggcggtgaatagcaggccgcatttcgacgcagaggtggtacagtcaacagggtaggtaattc < 2:248025‑M1/283‑145 (MQ=255) gAGGCTGCCAGGCGTTTGTGAGCGGTATTTTGCGCGCATGAATGCGGCTTTTCCCTTTCTTGCGCATGGGCATTGCCTATAATGTCGCCGACGTGGAACCTGACAACGATTGATAGGTTCTGGCTTTACCCGTATCgcggccgcccctgcttgatactggcccggcgggaggagcgtccgagcggagctggcggtcgccggaaacactagcgcatcatggcggtgaatagcaggc > 1:706166‑M1/1‑136 (MQ=255) aGGCTGCCAGGCGTTTGTGAGCGGTATTTTGCGCGCATGAATGCGGCTTTTCCCTTTCTTGCGCATGGGCATTGCCTATAATGTCGCCGACGTGGAACCTGACAACGATTGATAGGTTCTGGCTTTACCCGTATCgcggccgcccctgcttgatactggcccggcgggaggagcgtccgagcggagctggtggtcgccggaaacactagcgcatcatggcggtgaatagcaggccgcatttcgacgcagaggtggtacagtcaacagggtaggtaatttgcagattttgtcatccatcc > 1:616136‑M1/1‑135 (MQ=255) aGGCTGCCAGGCGTTTGTGAGCGGTATTTTGCGCGCATGAATGCGGCTTTTCCCTTTCTTGCGCATGGGCATTGCCTATAATGTCGCCGACGTGGAACCTGACAACGATTGATAGGTTCTGGCTTTACCCGTATCgcggccgcccctgcttgatactggcccggcgggaggagcgtccgagcggagctggtggtcgccggaaacactagcgcatcatggcggtgaatagcaggccgcatttcgacgcagaggtggtacagtcaacagggtaggtaattcgcagattttgtcatccatcca > 1:190957‑M1/1‑135 (MQ=255) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |