| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | AE015451 | 1,164,572 | 830 bp→TCA | coding (4‑833/864 nt) | hexR ← | DNA‑binding transcriptional regulator |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | AE015451 | 1164572 | 1165401 | 830 | 68 [0] | [0] 65 | hexR | DNA‑binding transcriptional regulator |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | AE015451 | = 1164571 | 0 (0.000) | 65 (0.800) +TCA |
61/594 | 0.2 | 100% | coding (834/864 nt) | hexR | DNA‑binding transcriptional regulator |
| ? | AE015451 | 1165402 = | 0 (0.000) | coding (3/864 nt) | hexR | DNA‑binding transcriptional regulator | |||||
GCGCTGAAGCTCAAGGGCGGCTGCCAGAAGGTCTACCCCGGTACGCCACGGGTGCAATTGCAGGACCCGGCCTGGCAGCGCGAGCTGTGCATCGATACCGGTGACAGCGACGACACCGTGGTCTGGCACCCTGGCAATCGCCCGCTGATGGGGGTGACCGGCCGCGAGT‑CGCAGCGTTTTGTCTGCGTCGAGGCGACCAGTGGCAGTGGCGAAGGCCTGAGCCTGGCACCTGGGCAGCGTGCGCACCTGCGTTTGCAGGCGCACCGGCTCAGTTGAGGTCGTCGTCCTCGATCGGGTAACGGCTGGCGTTGAGGCTTTCCTTGATCTTGCGCAGGTGAGGCTGGAAGTCCACGCCGCGGCGCAGGGTCATGCCGGTGGCCAGTACATCGAGCACGGTCAGCTGGATGATCCGCGAGGTCATTGGCATGTAGATGTCGGTATCTTCCGGCAGCGGAATGTGCAGGCTCAGGCTGCAGGCATTGGCCAGTGGCGAGCCTGCGGCGGTGAGGCCCAGCACCGAAGCGCCGTTTTCACGTGCCAGGCGCGCCACTTCGACCAGTTCGCGGGTGCGCCCGGTGTAGGAAATGATCACGAACA > AE015451/1164273‑1164869 | gttcagacgtgtgctcttccgatctagaaggtctaccccggtacgccacggGTGCAATTGCAGGACCCGGCCTGGCAGCGCGAGTTGTGCATCGATACCGGTGACAGCGACGACACCGTGGTCTGGCACCCTGGCAATCGCCCGCTGATGGGGGTGACCGGCCGCGAGT‑CGCAGCGTTTTGTCTGCGTCGAGGCGACCAGTGGCAGTGGCGAAGGCCTGAGCCTGGCACCTGGGCAGCGTGCGCACCTGCGTTTGCAGGCGCACCGGCTCAGTTGAGGTCGTCGTCCTCGATCGGGTAAtc < 1:183265‑M1/276‑3 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1:758367‑M1/1‑122 (MQ=255) gTCGAGGCGACCAGTGGCAGTGGCGAAGGCCTGAGCCTGGCACCTGGGCAGCGTGCGCACCTGCGTTTGCAGGCGCACCGGCTCAGTTGAGGTCGTCGTCCTCGATCGGGTAAtcacacgcggtccatgggtgtgtccttgggtcgggaagacagccggctgtgtgagcagcaggctttttgcacggtcgtctatcgtactgtcggtgcggttgacgtaccacttgtctgtaacacttgtgtgtaatgttgtggtttttactacattatcccttgaaacccgtgtagatcggaagggcgtg > 2:698780‑M1/1‑113 (MQ=255) cGAGGCGACCAGTGGCAGTGGCGAAGGCCTGAGCCTGGCACCTGGGCAGCGTGCGCACCTGCGTTTGCAGGCGCACCGGCTCAGTTGAGGTCGTCGTCCTCGATCGGGTAAtcacacgcggtccatgggtgtgtccttgggtcgggaagacagccggctgtgtgagcagcaggctttttgcacggtcgtctatcgtactgtcggtgcggttgacgtaccacttgtctgtaacacttgtgtgtaatgttgtggtttttactacattatcccttgaaaaccgtgtgtgaaagcggtattccta > 2:284762‑M1/1‑111 (MQ=255) aaGGCCTGAGCCTGGAACCTGGGAGGCGTGCGCACCTGCGTTTGCAGGCGAACCGGCTCAGTTGAGGTCGTCGTCCTCGATCGGGTAAtcacacgcggtccaggggtgtgtccttgggtcgggaagacagccggctgtgtgagcagcaggctttttgcacggtcgtctatcgtactgtcggtgcggttgacgtaccacttgtctgtaacacttgtgtgtaatgttgtggtttttactacattatcccttgaaaaccgtgtgtgaaagcggtattcctagaccaactttaggaaagaaccaa < 1:284769‑M1/301‑214 (MQ=255) cTGGCACCTGGGCAGCGTGCGCACCTGCGTTTGCAGGCGCACCGGCTCAGTTGAGGTCGTCGTCCTCGATCGGGTAAtcacacgcggtccatgggtgtgtccttgggtcgggaagacagccggctgtgtgagcagcaggctttttgcacggtcgtctatcgtactgtcggtgcggttgacgtaccacttgtctgtaacacttgtgtgtaatgttgtggtttttactacattatcccttgaaaaccgtgtgtgaaagcggtattcctagaccaactttaggaaagaaccaacatcatggccg > 1:753254‑M1/1‑77 (MQ=255) aacCTGGGCAGCTTGCGAACATGCGTTTGCAGGCGCACCGGCTCAGTTGAGGTCGTCGTCCTCGATCGGGTAAtcacacgcggtccatgggtgtgtccttgggtcgggaagacagccggctgtgtgagcagcaggctttttgcacggtcgtctatcgtactgtcggtgcggttgacgtaccacttgtctgtaacacttgtgtgtaatgttgtggtttttactacattatcccttgaaaaccgtgtgtgaaagcggtattcctagaccaactttaggaaagaaccaacatcatggccgcaat < 2:738957‑M1/300‑229 (MQ=255) aCCTGGGCAGCGTGCGCACCTGCGTTTGCAGGCGCACCGGCTCAGTTGAGGTCGTCGTCCTCGATCGGGTAAtcacacgcggtccatgggtgtgtccttgggtcgggaagacagccggctgtgtgagcagcaggctttttgcacggtcgtctatcgtactgtcggtgcggttgacgtaccacttgtctgtaacacttgtgtgtaatgttgtggtttttactacattatcccttgaaaaccgtgtgtgaaagcggtattcctagaccaactttaggaaagaaccaacatcatggccgcaatc > 1:612757‑M1/1‑72 (MQ=255) ggggcAGCGGGCGAACCGGCGTTTGAAGGCGCACCGGCTCAGTTGAGGTCGTCGTCCTCGATCGGGTAAtcacacgcggtccatgggtgtgtccttgggtcgggaagacagccggctgtgtgagcagcaggctttttgcacggtcgtctatcgtactgtcggtgcggttgacgtaccacttgtctgtaacacttgtgtgtaatgttgtggtttttactacattatcccttgaaaaccgtgtgtgaaagcggtattcctagaccaactttaggaaagaaccaacatcatggccgcaatcagt < 2:319808‑M1/300‑233 (MQ=255) gaagggtgggaacttgcgtttgaaggggaACCGGTTCATTTGAGGTCGTCGTCGTCGATCGGGTAAtcacacgcggtccatgggtgtgtccttgggtcgggaagacagccggctgtgtgagcagcaggctttttgcacggtcgtctatcgtactgtcggtgcggttgacgtaccacttgtctgtaacacttgtgtgtaatgttgtggtttttactacattatcccttgaaaaccgtgtgtgaaagcggtattcctagaccaactttaggaaagaaccaacatcatggccgcaatcagtgtc < 2:328372‑M1/287‑236 (MQ=255) gCGTTTGCAGGCGCACCGGCTCAGTTGAGGTCGTCGTCCTCGATCGGGTAAtcacacgcggtccatgggtgtgtccttgggtcgggaagacagccggctgtgtgagcagcaggctttttgcacggtcgtctatcgtactgtcggtgcggttgacgtaccacttgtctgtaacacttgtgtgtaatgttgtggtttttactacattatcccttgaaaaccgtgtgtgaaagcggtattcctagaccaactttaggaaagaaccaacatcatggccgcaatcagtgtccaaccttgcaccttt > 2:236588‑M1/1‑51 (MQ=255) tGCAGGCGCACCGGCTCAGTTGAGGTCGTCGTCCTCGATCGGGTAAtcacacgcggtccatgggtgtgtccttgggtcgggaagacagccggctgtgtgagcagcaggctttttgcacggtcgtctatcgtactgtcggtgcggttgacgtaccacttgtctgtaacacttgtgtgtaatgttgtggtttttactacattatcccttgaaaaccgtgtgtgaaagcggtattcctagaccaactttaggaaagaaccaacatcatggccgcaatcagtgtcgaaccttgcacctttgccct > 1:60085‑M1/1‑46 (MQ=255) gcgcACCGGCTCAGTTGAGGTCGTCGTCCTCGATCGGGTAAtcacccgcggtccatgggtgtgtccttgggtcgggaagacagccggctgtgtgagcagcaggctttttgcacggtcgtctatcgtactgtcggtgcggttgacgtaccacttgtctgtaacacttgtgtgtaatgttgtggtttttactacattatcccttgaaaaccgtgtgtgaaagcggtattcctagaccaactttaggaaagaaccaacatcatggccgcaatcagtgtcgaaccttgcacctttgccctgtttg < 2:612735‑M1/301‑261 (MQ=255) cGGCTCAGTTGAGGTCGTCGTCCTCGATCGGGTAAtcacacgcggtccatgggtgtgtccttgggtcgggaagacagccggctgtgtgagcagcaggctttttgcacggtcgtctatcgtactgtcggtgcggttgacgtaccacttgtctgtaacacttgtgtgtaatgttgtggtttttactacattatcccttgaaaaccgtgtgtgaaagcggtattcctagaccaactttaggaaagaaccaacatcatggccgcaatcagtgtcgaaccttgcacctttgccctgtttggcgccc > 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1:113600‑M1/1‑16 (MQ=255) ccTCGATCGGGTAAtcacacgcggtccatgggtgtgtccttgggtcgggaagacagccggctgtgtgagcagcaggctttttgcacggtcgtctatcgtactgtcggtgcggttgacgtaccacttgtctgtaacacttgtgtgtaatgttgtggtttttactacattatcccttgaaaaccgtgtgtgaaagcggtattcctagaccaactttaggaaagaaccaacatcatggccgcaatcagtgtcgaaccttgcacctttgccctgtttggcgccctcggcgacctggcaagatcgg > 1:169319‑M1/1‑14 (MQ=255) aTCGGGTAAtcacacgcggtccatgggtgtgtccttgggtcgggaagacagccggctgtgtgagcagcaggctttttgcacggtcgtctatcgtactgtcggtgcggttgacgtaccacttgtctgtaacacttgtgtgtaatgttgtggtttttactacattatcccttgaaaaccgtgtgtgaaagcggtattcctagaccaactttaggaaagaaccagcatcatggccgcaatcagtgtcgaaccttgcacctttgccctgtttggcgccctcggcgacctgtcattgcgcaagctt > 2:668409‑M1/1‑9 (MQ=255) tCGGGTAAtcacacgcggtccatgggtgtgtccttgggtcgggaagacagccggctgtgtgagcagcaggctttttgcacggtcgtctatcgtactgtcggtgcggttgacgtaccacttgtctgtaacacttgtgtgtaatgttgtggtttttactacattatcccttgaaaaccgtgtgtgaaagcggtattcctagaccaactttaggaaagaaccaacatcatggccgcaatcagtgtcgaaccttgcacctttgccctgtttggcgctctcggcgacatggcattgcgcaagctgt > 2:696385‑M1/1‑8 (MQ=255) tAAtcacacgcggtccatgggtgtgtccttgggtcgggaagacagccggctgtgtgagcagcaggctttttgcacggtcgtctatcgtactgtcggtgcggttgacgtaccacttgtctgtaacacttgtgtgtaatgttgtggtttttactacattatcccttgaaaaccgtgtgtgaaagcggtattcctagaccaactttaggaaagaaccaacatcatggccgcaatcagtgtcgaaccttgcacctttgccctgtttggcgccctcggcgacctggcattgcgcaagctgtttcct > 1:698625‑M1/1‑3 (MQ=255) | GCGCTGAAGCTCAAGGGCGGCTGCCAGAAGGTCTACCCCGGTACGCCACGGGTGCAATTGCAGGACCCGGCCTGGCAGCGCGAGCTGTGCATCGATACCGGTGACAGCGACGACACCGTGGTCTGGCACCCTGGCAATCGCCCGCTGATGGGGGTGACCGGCCGCGAGT‑CGCAGCGTTTTGTCTGCGTCGAGGCGACCAGTGGCAGTGGCGAAGGCCTGAGCCTGGCACCTGGGCAGCGTGCGCACCTGCGTTTGCAGGCGCACCGGCTCAGTTGAGGTCGTCGTCCTCGATCGGGTAACGGCTGGCGTTGAGGCTTTCCTTGATCTTGCGCAGGTGAGGCTGGAAGTCCACGCCGCGGCGCAGGGTCATGCCGGTGGCCAGTACATCGAGCACGGTCAGCTGGATGATCCGCGAGGTCATTGGCATGTAGATGTCGGTATCTTCCGGCAGCGGAATGTGCAGGCTCAGGCTGCAGGCATTGGCCAGTGGCGAGCCTGCGGCGGTGAGGCCCAGCACCGAAGCGCCGTTTTCACGTGCCAGGCGCGCCACTTCGACCAGTTCGCGGGTGCGCCCGGTGTAGGAAATGATCACGAACA > AE015451/1164273‑1164869 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |