| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | AE015451 | 1,164,572 | 830 bp→TCA | coding (4‑833/864 nt) | hexR ← | DNA‑binding transcriptional regulator |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | AE015451 | 1164572 | 1165401 | 830 | 99 [0] | [0] 99 | hexR | DNA‑binding transcriptional regulator |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | AE015451 | = 1164571 | 0 (0.000) | 99 (0.900) +TCA |
83/594 | 0.2 | 100% | coding (834/864 nt) | hexR | DNA‑binding transcriptional regulator |
| ? | AE015451 | 1165402 = | 0 (0.000) | coding (3/864 nt) | hexR | DNA‑binding transcriptional regulator | |||||
GCTGAAGCTCAAGGGCGGCTGCCAGAAGGTCTACCCCGGTACGCCACGGGTGCAATTGCAGGACCCGGCCTGGCAGCGCGAGCTGTGCATCGATACCGGTGACAGCGACGACACCGTGGTCTGGCACCCTGGCAATCGCCCGCTGATGGGGGTGACCGGCCGCGAGTCGCAGCGTTTTGTCTGCGTCGAGGCGACCAGTGGCAGTGGCGAAGGCCTGAGCCTGGCACCTGGGCAGCGTGCGCACCTGCGTTTGCAGGCGCACCGGCTC‑AGTTGAGGTCGTCGTCCTCGATCGGGTAACGGCTGGCGTTGAGGCTTTCCTTGATCTTGCGCAGGTGAGGCTGGAAGTCCACGCCGCGGCGCAGGGTCATGCCGGTGGCCAGTACATCGAGCACGGTCAGCTGGATGATCCGCGAGGTCATTGGCATGTAGATGTCGGTATCTTCCGGCAGCGGAATGTGCAGGCTCAGGCTGCAGGCATTGGCCAGTGGCGAGCCTGCGGCGGTGAGGCCCAGCACCGAAGCGCCGTTTTCACGTGCCAGGCGCGCCACTTCGACCAGTTCGCGGGTGCGCCCGGTGTAGGAAATGATCACGAACAG > AE015451/1164275‑1164870 | gcTGAAGCTCAAGGGCGGCTGCCAGAAGGTCTACCCCGGTACGCCACGGGTGCAATTGCAGGACCCGGCCTGGCAGCGCGAGCTGTGCATCGATACCGGTGACAGCGACGACACCGTGGTCTGGCACCCTGGCAATCGCCCGCTGATGGGGGTGACCGGCCGCGAGTCGCAGCGTTTTGTCTGCGTCGAGGCGACCAGTGGCAGTGGCGAAGGCCTGAGCCTGGCACCTGGGCAGCGTGCGCACCTGCGTTTGCAGGCGCACCGGCTC‑AGTTGAGGTCGTCGTCCTCGATCGGGTAAtcac > 3:55334‑M1/1‑297 (MQ=255) gAAGCTCAAGGGCGGCTGCCAGAAGGTCTACCCCGGTACGCCACGGGTGCAATTGCAGGACCCGGCCTGGCAGCGCGAGCTGTGCATCGATACCGGTGACAGCGACGACACCGTGGTCTGGCACCCTGGCAATCGCCCGCTGATGGGGGTGACCGGCCGCGAGTCGCAGCGTTTTGTCTGCGTCGAGGCGACCAGTGGCAGTGGCGAAGGCCTGAGCCTGGCACCTGGGCAGCGTGCGCACCTGCGTTTGCAGGCGCACCGGCTC‑AGTTGAGGTCGTCGTCCTCGATCGGGTAAtcacacc > 3:615274‑M1/1‑294 (MQ=255) gccaaggggcggcggCCAGAAGGGCTACCCCGGTACGCCACGGGTGCAATTGCAGGACCCGGCCTGGCAGCGCGAGCTGTGCATCGATACCGGTGACAGCGACGACACCGTGGTCTGGCACCCTGGCAATCGCCCGCTGATGGGGGTGACCGGCCGCGAGTCGCAGCGTTTTGTCTGCGTCGAGGCGACCAGTGGCAGTGGCGAAGGCCTGAGCCTGGCACCTGGGCAGCGTGCGCACCTGCGTTTGCAGGCGCACCGGCTC‑AGTTGAGGTCGTCGTCCTCGATCGGGTAAtcacacgcgg < 2:71670‑M1/295‑11 (MQ=255) gctaagggCGGCTGCCAGAAGGTCGACCCCGGTACGGCACGGGTGCAATTGCAGGACCCAGCCTGGCAGCGCGAGCTGTGCATCGATACCGGTGACAGCGACGACACCGTGGGCTGGCACCCTGGCAATCGCCCGCTGATGGGGGTGACCGGCCGCGAGTCGCAGCGTTTTGTCTGCGTCGAGGCGACCAGTGGCAGTGGCGAAGGCCTGAGCCTGGCACCTGGGCAGCGTGCGCACCTGCGTTTGCAGGCGCACCGGCTC‑AGTTGAGGTCGTCGTCCTCGATCGGGTAAtcacacgcggt < 2:166790‑M1/298‑12 (MQ=255) aaGGGCGGCTGCCAGAAGGTCTACCCCGGTACGCCACGGGTGCAATTGCAGGACCCGGCCTGGCAGCGCGAGCTGTGCATCGATACCGGTGACAGCGACGACACCGTGGTCTGGCACCCTGGCAATCGCCCGCTGATGGGGGTGACCGGCCGCGAGTCGCAGCGTTTTGTCTGCGTCGAGGCGACCAGTGGCAGTGGCAAAGGCCTGAGCCTGGCACCTGGGCAGCGTGCGCACCTGCGTTTGCAGGCGCACCGGCTC‑AGTTGAGGTCGTCGTCCTCGATCGGGTAAtcacacgcggtccc > 3:534249‑M1/1‑287 (MQ=255) gggagttcagacgtgtgctcttccgatctgggtgcaattgcaggacccggcctggcagcgcGAGCTGTGCATCGATACCGGTGACAGCGACGACACCGTGGTCTGGCACCCTGGCAATCGCCCGCTGATGGGGGTGACCGGCCGCGAGTCGCAGCGTTTTGTCTGCGTCGAGGCGACCAGTGGCAGTGGCGAAGGCCTGAGCCTGGCACCTGGGCAGCGTGCGCACCTGCGTTTGCAGGCGCACCGGCTC‑AGTTGAGGTCGTCGTCCTCGATCGGGTAAtcacacgcggtccatgggtgtg < 3:485287‑M1/272‑23 (MQ=255) tGCCAGAAGGTCTACCCCGGTACGCCACGGGTGCAATTGCAGGACCCGGCCTGGCAGCGCGAGCTGTGCATCGATACCGGTGACAGCGACGACACCGTGGTCTGGCACCCTGGCAATCGCCCGCTGATGGGGGTGACCGGCCGCGAGTCGCAGCGTTTTGTCTGCGTCGAGGCGACCAGTGGCAGTGGCGAAGGCCTGAGCCTGGCACCTGGGCAGCGTGCGCACCTGCGTTTGCAGGCGCACCGGCTC‑AGTTGAGGTCGTCGTCCTCGATCGGGTAAtcacacgcggtccatgggtgtgt > 4:48554‑M1/1‑278 (MQ=255) gCCAGAAGGTCTACCCCGGTACGCCACGGGTGCAATTGCAGGACCCGGCCTGGCAGCGCGAGCTGTGCATCGATACCGGTGACAGCGACGACACCGTGGTCTGGCACCCTGGCAATCGCCCGCTGATGGGGGTGACCGGCCGCGAGTCGCAGCGTTTTGTCTGCGTCGAGGCGACCAGTGGCAGTGGCGAAGGCCTGAGCCTGGCACCTGGGCAGCGTGCGCACCTGCGTTTGCAGGCGCACCGGCTC‑AGTTGAGGTCGTCGTCCTCGATCGGGTAAtcccacgcggtccatggggttgtt > 2:483400‑M1/1‑277 (MQ=255) gCCAGAAGGTCTACCCCGGTACGCCACGGGTGCAATTGCAGGACCCGGCCTGGCAGCGCGAGCTGTGCATCGATACCGGTGACAGCGACGACACCGTGGTCTGGCACCCTGGCAATCGCCCGCTGATGGGGGTGACCGGCCGCGAGTCGCAGCGTTTTGTCTGCGTCGAGGCGACCAGTGGCAGTGGCGAAGGCCTGAGCCTGGCACCTGGGCAGCGTGCGCACCTGCGTTTGCAGGCGCACCGGCTC‑AGTTGAGGTCGTCGTCCTCGATCGGGTAAtcacacgcggtccatgggtgtgtc > 4:324423‑M1/1‑277 (MQ=255) cAGAAGGTCTACCCCGGTACGCCACGGGTGCAATTGCAGGACCCGGCCTGGCAGCGCGAGCTGTGCATCGATACCGGTGACAGCGACGACACCGTGGTCTGGCACCCTGGCAATCGCCCGCTGATGGGGGTGACCGGCCGCGAGTCGCAGCGTTTTGTCTGCGTCGAGGCGACCAGTGGCAGTGGCGAAGGCCTGAGCCTGGCACCTGGGCAGCGTGCGCACCTGCGTTTGCAGGCGCACCGGCTC‑AGTTGAGGTCGTCGTCCTCGATCGGGTAAtcacacgcggtccatgggtgtgtcct > 4:511779‑M1/1‑275 (MQ=255) 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gCCACGGGTGCAATTGCAGGACCCGGCCTGGCAGCGCGAGCTGTGCATCGATACCGGTGACAGCGACGACACCGTGGTCTGGCACCCTGGCAATCGCCCGCTGATGGGGGTGACCGGCCGCGAGTCGCAGCGTTTTGTCTGCGTCGAGGCGACCAGTGGCAGTGGCGAAGGCCTGAGCCTGGCACCTGGGCAGCGTGCGCACCTGCGTTTGCAGGCGCACCGGCTC‑AGTTGAGGTCGTCGTCCTCGATCGGGTAAtcatccgtggtccatgggtgtggccttgggtcgggaaggccaccgg > 2:547833‑M1/1‑255 (MQ=255) gggTGCAATTGCAGGACCCGGCCTGGCAGCGCGAGCTGTGCATCGATACCGGTGACAGCGACGACACCGTGGTCTGGCACCCTGGCAATCGCCCGCTGATGGGGGTGACCGGCCGCGAGTCGCAGCGTTTTGTCTGCGTCGAGGCGACCAGTGGCAGTGGCGAAGGCCTGAGCCTGGCACCTGGGCAGCGTGCGCACCTGCGTTTGCAGGCGCACCGGCTC‑AGTTGAGGTCGTCGTCCTCGATCGGGTAAtcacacgcggtccatgggtgtgagatcggaagagcgtcgtgtagggaaagg > 1:485273‑M1/1‑250 (MQ=255) gggTGCAATTGCAGGACCCGGCCTGGAAGCGCGAGCTGTGCATCGATACCGGTGACAGCGACGACACCGTGGTCTGGCACCCTGGCAATCGCCCGCTGATGGGGGTGACCGGCCGCGAGTCGCAGCGTTTTGTCTGCGTCGAGGCGACCAGTGGCAGTGGCGAAGGCCTGAGCCTGGCACCTGGGCAGCGTGCGCACCTGCGTTTGCAGGCGCACCGGCTC‑AGTTGAGGTCGTCGTCCTCGATCGGGTAAtcacacgcggtccatgggtgtgtccttgggtcgggaagacagccggctgtg > 1:351381‑M1/1‑250 (MQ=255) 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ccGGGCTGGGAGCGGGGGCTGGGCATAGATACCGGTGACAGCGCCGACACCGTGGTCTGGCACCCTGGCAATCGCCCGCTGATGGGGGTGACCGGCCGCGAGTCGCAGCGTTTTGTCTGCGTCGAGGCGACCAGTGGCAGTGGCGAAGGCCTGAGCCTGGCACCTGGGCAGCGTGCGCACCTGCGTTTGCAGGCGCACCGGCTC‑AGTTGAGGTCGTCGTCCTCGATCGGGTAAtcacacgcggtccatgggtgtgtccttgggtcgtgaagacagccggctgtgtgagcagcaggcttttt < 2:242491‑M1/301‑69 (MQ=255) ggCAGCGCGAGCTGTGCATCGATACCGGTGACAGCGACGACACCGTGGTCTGGCACCCTGGCAATCGCCCGCTGATGGGGGTGACCGGCCGCGAGTCGCAGCGTTTTGTCTGCGTCGAGGCGACCAGTGGCAGTGGCGAAGGCCTGAGCCTGGCACCTGGGCAGCGTGCGCACCTGCGTTTGCAGGCGCACCGGCTC‑AGTTGAGGTCGTCGTCCTCGATCGGGTAAtcacacgcggtccatgggtgtgtccttgggtcgggacgccagccggctgtgtgagcagcaggctttttgcccggg > 2:172184‑M1/1‑226 (MQ=255) ggCAGCGCGAGCTGCGCATCGATACCGGTGACAGCGACGACACCGTGGTCTGGCACCCTGGCAATCGCCCGCTGATGGGGGTGACCGGCCGCGAGTCGCAGCGTTTTGTCTGCGTCGAGGCGACCAGTGGCAGTGGCGAAGGCCTGAGCCTGGCACCTGGGCAGCGTGCGCACCTGCGTTTGCAGGCGCACCGGCTC‑AGTCGAGGTCGTCGTCCTCGACCGGGTAAtcacacgcggtccacgggtctgtccttgggtcgggcagacagccggctgtgttcgcatgaggctctttgcccggt > 2:166646‑M1/1‑226 (MQ=255) gCAGCGCGAGCTGTGCATCGATACCGGTGACAGCGACGACACCGTGGTCTGGCACCCTGGCAATCGCCCGCTGATGGGGGTGACCGGCCGCGAGTCGCAGCGTTTTGTCTGCGTCGAGGCGACCAGTGGCAGTGGCGAAGGCCTGAGCCTGGCACCTGGGCAGCGTGCGCACCTGCGTTTGCAGGCGCACCGGCTC‑AGTTGAGGTCGTCGTCCTCGATCGGGTAAtcacacgcggtccatgggtgtgtccttgggtcgggaagacagccggctgtgtgagcagcaggctttttgcacggtc < 4:166677‑M1/301‑77 (MQ=255) ggcTGTGCATCGATACCGGTGACAGCGACGACACCGTGGTCTGGCACCCTGGCAATCGCCCGCTGATGGGGGTGACCGGCCGCGAGTCGCAGCGTTTTGTCTGCGTCGAGGCGACCAGTGGCAGTGGCGAAGGCCTGAGCCTGGCACCTGGGCAGCGTGCGCACCTGCGTTTGCAGGCGCACCGGCTC‑AGTTGAGGTCGTCGTCCTCGATCGGGTAAtcacacgcggtccatgggtgtgtccttgggtcgggaagacagccggctgtgtgagcagcaggctttttgcacggtcgtctatcg < 4:310664‑M1/300‑85 (MQ=255) aGCTGTGCATCGATACCGGTGACAGCGACGACACCGTGGTCTGGCACCCTGGCAATCGCCCGCTGATGGGGGTGACCGGCCGCGAGTCGCAGCGTTTTGTCTGCGTCGAGGCGACCAGTGGCAGTGGCGAAGGCCTGAGCCTGGCACCTGGGCAGCGTGCGCACCTGCGTTTGCAGGCGCACCGGCTC‑AGTTGAGGTCGTCGTCCTCGATCGGGTAAtcacacgcggtccatgggtgtgtccttgggtcgggaagacagccggctgtgtgagcagcaggctttttgcacggtcgtctatcg < 4:461469‑M1/301‑85 (MQ=255) 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(MQ=255) cGTTTGCAGGCGCACCGGCTC‑AGTTGAGGTCGTCGTCCTCGATCGGGTAAtcacacgcggtccatgggtgtgtccttgggtcgggaagacagccggctgtgtgagcagcaggctttttgcacggtcgtctatcgtactgtcggtgcggttgacgtaccacttgtctgtaacacttgtgtgtaatgttgtggtttttactacattatcccttgaaaaccgtgtgtgaaagcggtattcctagaccaactttaggaaagaaccaacatcatggccgcaatcagtgtcgaaccttgcacctttt > 1:444602‑M1/1‑50 (MQ=255) cGTTTGCAGGCGCACCGGCTC‑AGTTGAGGTCGTCGTCCTCGATCGGGTAAtcacacgcggtccatgggtgtgtccttgggtcgggaagacagccggctgtgtgagcagcaggctttttgcacggtcgtctatcgtactgtcggtgcggttgacgtaccacttgtctgtaacacttgtgtgtaatgttgtggtttttactacattatcccttgaaaaccgtgtgtgaaagcggtattcctagaccaactttaggaaagaaccaacatcatggccgcaatcagtgtcgaaccttgcacctttg < 3:522239‑M1/301‑252 (MQ=255) cGTTTGCAGGCGCACCGGCTC‑AGTTGAGGTCGTCGTCCTCGATCGGGTAAtcacacgcggtccatgggtgtgtccttgggtcgggaagacagccggctgtgtgagcagcaggctttttgcacggtcgtctatcgtactgtcggtgcggttgacgtaccacttgtctgtaacacttgtgtgtaatgttgtggtttttactacattatcccttgaaaaccgtgtgtgaaagcggtattcctagaccaactttaggaaagaaccaacatcatggccgcaatcagtgtcgaaccttgcacctttg < 4:328004‑M1/301‑252 (MQ=255) gcgcACCGGCTC‑AGTTGAGGTCGTCGTCCTCGATCGGGTAAtcacacgcggtccatgggtgtgtccttgggtcgggaagacagccggctgtgtgagcagcaggctttttgcacggtcgtctatcgtactgtcggtgcggttgacgtaccacttgtctgtaacacttgtgtgtaatgttgtggtttttactacattatcccttgaaaaccgtgtgtgaaagcggtattcctagaccaactttaggaaagaaccaacatcatggccgcaatcagtgtcgaaccttgcacctttgccctgtttg < 4:233298‑M1/301‑261 (MQ=255) ggcaCCGGCTC‑AGTTGAGGTCGTCGTCCTCGATCGGGTAAtcacacgcggtccatgggtgtgtccttgggtcgggaagacagccggctgtgtgagcagcaggctttttgcacggtcgtctatcgtactgtcggtgcggttgacgtaccacttgtctgtaacacttgtgtgtaatgttgtggtttttactacattatcccttgaaaaccgtgtgtgaaagcggtattcctagaccaactttaggaaagaaccaacatcatggccgcaatcagtgtcgaaccttgcacctttgccctgtttgg < 1:275791‑M1/300‑262 (MQ=255) gtcCTCGATCGGGTAAtcacacgcggtccatgggtgtgtccttgggtcgggaagacagccggctgtgtgagcagcaggctttttgcacggtcgtctatcgtactgtcggtgcggttgacgtaccacttgtctgtaacacttgtgtgtaatgttgtggtttttactacattatcccttgaaaaccgtgtgtgaaagcggtattcctagaccaactttaggaaagaaccaacatcatggccgcaatcagtgtcgaaccttgcacctttgccctgtttggcgccctcggcgacctggctttgcc > 2:235110‑M1/1‑16 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GCTGAAGCTCAAGGGCGGCTGCCAGAAGGTCTACCCCGGTACGCCACGGGTGCAATTGCAGGACCCGGCCTGGCAGCGCGAGCTGTGCATCGATACCGGTGACAGCGACGACACCGTGGTCTGGCACCCTGGCAATCGCCCGCTGATGGGGGTGACCGGCCGCGAGTCGCAGCGTTTTGTCTGCGTCGAGGCGACCAGTGGCAGTGGCGAAGGCCTGAGCCTGGCACCTGGGCAGCGTGCGCACCTGCGTTTGCAGGCGCACCGGCTC‑AGTTGAGGTCGTCGTCCTCGATCGGGTAACGGCTGGCGTTGAGGCTTTCCTTGATCTTGCGCAGGTGAGGCTGGAAGTCCACGCCGCGGCGCAGGGTCATGCCGGTGGCCAGTACATCGAGCACGGTCAGCTGGATGATCCGCGAGGTCATTGGCATGTAGATGTCGGTATCTTCCGGCAGCGGAATGTGCAGGCTCAGGCTGCAGGCATTGGCCAGTGGCGAGCCTGCGGCGGTGAGGCCCAGCACCGAAGCGCCGTTTTCACGTGCCAGGCGCGCCACTTCGACCAGTTCGCGGGTGCGCCCGGTGTAGGAAATGATCACGAACAG > AE015451/1164275‑1164870 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |