| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | AE015451 | 1,164,572 | 830 bp→TCA | coding (4‑833/864 nt) | hexR ← | DNA‑binding transcriptional regulator |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | AE015451 | 1164572 | 1165401 | 830 | 99 [0] | [0] 99 | hexR | DNA‑binding transcriptional regulator |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | AE015451 | = 1164571 | 0 (0.000) | 99 (0.900) +TCA |
83/594 | 0.2 | 100% | coding (834/864 nt) | hexR | DNA‑binding transcriptional regulator |
| ? | AE015451 | 1165402 = | 0 (0.000) | coding (3/864 nt) | hexR | DNA‑binding transcriptional regulator | |||||
GGCGAAGATCTTCTGGGTGTAGGCGGCCGGGTCATCGTCGGCCTCTACCGCGCGGCTGACATAGGCGGCACCACTGGCCAGGCTCTGCGCCAGTTGCAGCTTGAGTTCGGGGTAGCCGCTGACGCCGAACGAGCGGCAGAAGCGGTTGACGGTCGGTTCGCTGACCTTGGCCGCCTGGGCCAGCGCAGCGATGCTGAAACGGGTGGCTTGTTGCGGGTTGAGCAGGATGACTTCGGCGACTTTGCGTTCGGCCTTGTTCAGCTCGTCGAGGCGGCCCTGGATCTGTTCCAGGAGGTTTCGCACGCGGTCCATGGGTGTGTCCTTGGGTCGGGAAGACAGCCGGCTGTGTGAGCAGCAGGCTTTTTGCACGG‑TCGTCTATCGTACTGTCGGTGCGGTTGACGTACCACTTGTCTGTAACACTTGTGTGTAATGTTGTGGTTTTTACTACATTATCCCTTGAAAACCGTGTGTGAAAGCGGTATTCCTAGACCAACTTTAGGAAAGAACCAACATCATGGCCGCAATCAGTGTCGAACCTTGCACCTTTGCCCTGTTTGGCGCCCTCGGCGACCTGGCATTGCGCAAGCTGTTTCCTG > AE015451/1165102‑1165697 | gctgaagctcaagggcggctgccagaaggtctaccccggtacgccacgggtgcaattgcaggacccggcctggcagcgcgagctgtgcatcgataccggtgacagcgacgacaccgtggtctggcaccctggcaatcgcccgctgatgggggtgaccggccgcgagtcgcagcgttttgtctgcgtcgaggcgaccagtggcagtggcgaaggcctgagcctggcacctgggcagcgtgcgcacctgcgtttgcaggcgcaccggctcagttgaggtcgtcgtcctcgatcgggtaatcac > 3:55334‑M2/301‑301 (MQ=255) 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(MQ=255) tgcgcacctgcgtttgcaggcgcaccggctcagttgaggtcgtcgtcctcgatcgggtaatcaCACGCGGTCCATGGGTGTGTCCTTGGGTCGGGAAGACAGCCGGCTGTGTGAGCAGCAGGCTTTTTGCACGG‑TCGTCTATCGTACTGTCGGTGCGGTTGACGTACCACTTGTCTGTAACACTTGTGTGTAATGTTGTGGTTTTTACTACATTATCCCTTGAAAACCGTGTGTGAAAGCGGtattcctagaccaactttaggaaagaaccagatcggaagagcacacgtctgaactccag > 3:365317‑M2/64‑272 (MQ=255) gggcacctgcgtttgcaggggcaccggtcaagttgaggtcgtcgtcctcgatcgggtaatcaCACGCGGTCCATGGGTGTGTCCTTGGGTCGGGAAGACAGCCGGCTGTGTGAGCAGCAGGCTTTTTGCACGG‑TCGTCTATCGTACTGTCGGTGCGGTTGACGTACCACTTGTCTGTAACACTTGTGTGTAATGTTGTGGTTTTTACTACATTATCCCTTGAAAACCGTGTGTGAAAGCGGTATTCCTAGACCAACTTTAGGAAAGAACCAACATCATGGCCGCAATCAGTGTCGAACCtt < 2:70848‑M2/239‑1 (MQ=255) cgcacctgcgtttgcaggcgcaccggctcagttgaggtcgtcgtcctcgatcgggtaatcaCACGCGGTCCATGGGTGTGTCCTTGGGTCGGGAAGACAGCCGGCTGTGTGAGCAGCAGGCTTTTTGCACGG‑TCGTCTATCGTACTGTCGGTGCGGTTGACGTACCACTTGTCTGTAACACTTGTGTGTAATGTTGTGGTTTTTACTACATTATCCCTTGAAAACCGTGTGTGAAAGCGGTATTCCTAGACCAACTTTAGGAAAGAACCAACATCATGGCCGCAATCAGTGTCGAACCTTg < 4:612929‑M2/240‑1 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GGCGAAGATCTTCTGGGTGTAGGCGGCCGGGTCATCGTCGGCCTCTACCGCGCGGCTGACATAGGCGGCACCACTGGCCAGGCTCTGCGCCAGTTGCAGCTTGAGTTCGGGGTAGCCGCTGACGCCGAACGAGCGGCAGAAGCGGTTGACGGTCGGTTCGCTGACCTTGGCCGCCTGGGCCAGCGCAGCGATGCTGAAACGGGTGGCTTGTTGCGGGTTGAGCAGGATGACTTCGGCGACTTTGCGTTCGGCCTTGTTCAGCTCGTCGAGGCGGCCCTGGATCTGTTCCAGGAGGTTTCGCACGCGGTCCATGGGTGTGTCCTTGGGTCGGGAAGACAGCCGGCTGTGTGAGCAGCAGGCTTTTTGCACGG‑TCGTCTATCGTACTGTCGGTGCGGTTGACGTACCACTTGTCTGTAACACTTGTGTGTAATGTTGTGGTTTTTACTACATTATCCCTTGAAAACCGTGTGTGAAAGCGGTATTCCTAGACCAACTTTAGGAAAGAACCAACATCATGGCCGCAATCAGTGTCGAACCTTGCACCTTTGCCCTGTTTGGCGCCCTCGGCGACCTGGCATTGCGCAAGCTGTTTCCTG > AE015451/1165102‑1165697 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |