New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | AE015451 | 550100 = | NA (NA) | 5 (0.050) | 5/574 | 7.7 | 4.5% | coding (775/1194 nt) | tufB | Elongation factor Tu‑B |
? | AE015451 | = 550096 | 112 (1.060) | coding (771/1194 nt) | tufB | Elongation factor Tu‑B | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 115 total aligned reads displayed.
CTACGACTTCCCAGGCGACGACACTCCGATCATCATCGGTTCCGCTCGTATGGCCCTGGAAGGCAAAGACGACAACGAAATGGGCACTACCGCTGTCAAGAAGCTGGTAGAAACTCTGGATGCCTACATCCCTGAGCCAGTTCGTGCCATCGACCAGCCGTTCCTGATGCCGATCGAAGACGTGTTCTCGATCT‑CGGGTCGTGGTACCGTTGTTACCGGTCGTATCGAGCGTGGCATCGTTCGCGTTCAGGATCCGCTGGAAATCGTTGGTCTGCGTGACACCACCACCACCACCTGCACCGGTGTTGAGATGTTCCGCAAGCTGCTGGACGAAGGTCGTGCTGGCGAGAACTGCGGCGTTCTGCTGCGTGGTACCAAGCGTGACGACGTTGAGCGTGGCCAGGTTCTGGTCAAGCCAGGTTCGGTCAAGCCGCACACCAAGTTCACCGCAGAAGTCTACGTCCTGTCGAAGGAAGAAGGCGGCCGTCACACTCCGTTCTTCAAAGGCTACCGTCCACAGTTCTACTTCCGTACCAC > AE015451/549805‑550341 | cTACGACTTCCCAGGCGACGACACTCCGATCATCATCGGTTCCGCTCGTATGGCCCTGGAAGGCAAAGACGACAACGAAATGGGCACTACCGCTGTCAAGAAGCTGGTAGAAACTCTGGATGCCTACATCCCTGAGCCAGTTCGTGCCATCGACCAGCCGTTCCTGATGCCGATCGAAGACGTGTTCTCGATCT‑CGGGTCGTGGTACCGTTGTTACCGGTCGTATCGAGCGTGGCATCGTTCGCGTTCAGGATCCGCTGGAAATCGTTGGTCTGCGTGACACCACCACCACCACCTGCAcc > 1:391072/1‑301 (MQ=255) ccgatctcAGGCGACGACACTCCGATCATCATCGGTTCCGCTCGTATGGCCCTGGAAGGCAAAGACGACAACGAAATGGGCACTACCGCTGTCAAGAAGCTGGTAGAAACTCTGGATGCCTACATCCCTGAGCCAGTTCGTGCCATCGACCAGCCGTTCCTGATGCCGATCGAAGACGTGTTCTCGATCT‑CGGGTCGTGGTACCGTTGTTACCGGTCGTATCGAGCGTGGCATCGTTCGCGTTCAGGATCCGCTGGAAATCGTTGGTCTGCGTGACACCACCACCACCACCTGCACCGgtg < 4:501536/294‑1 (MQ=255) cccAGGCGACGACACTCCGATCATCATCGGTTCCGCTCGTATGGCCCTGGAAGGCAAAGACGACAACGAAATGGGCACTACCGCTGTCAAGAAGCTGGTAGAAACTCTGGATGCCTACATCCCTGAGCCAGTTCGTGCCATCGACCAGCCGTTCCTGATGCCGATCGAAGACGTGTTCTCGATCT‑CGGGTCGTGGTACCGTTGTTACCGGTCGTATCGAGCGTGGCATCGTTCGCGTTCAGGATCCGCTGGAAATCGTTGGTCTGCGTGTGCCCCCCACCACCACCTGCACCGGAGTTgcg > 2:321654/1‑299 (MQ=255) cccAGGCGACGACACTCCGATCATCATCGGTTCCGCTCGTATGGCCCTGGAAGGCAAAGACGACAACGAAATGGGCACTACCGCTGTCAAGAAGCTGGTAGAAACTCTGGATGCCTACATCCCTGAGCCAGTTCGTGCCATCGACCAGCCGTTCCTGATGCCGATCGAAGACGTGTTCTCGATCT‑CGGGTCGTGGTACCGTTGTTACCGGTCGTATCGAGCGTGGCATCGTTCGCGTTCAGGATCCGCTGGAAATCGTTGGTCTGCGTGACACCACCACCACCACCTGCACCGGTGTTgag < 1:543139/301‑1 (MQ=255) cAGGCGACGACACTCCGATCATCATCGGTTCCGCTCGTATGGCCCTGGAAGGCAAAGACGACAACGAAATGGGCACTACCGCTGTCAAGAAGCTGGTAGAAACTCTGGATGCCTACATCCCTGAGCCAGTTCGTGCCATCGACCAGCCGTTCCTGATGCCGATCGAAGACGTGTTCTCGATCT‑CGGGTCGTGGTACCGTTGTTACCGGTCGTATCGAGCGTGGCATCGTTCGCGTTCAGGATCCGCTGGAAATCGTTGGTCTGCGTGACACCCCCACCACCACCTGCCCCGgtgcgatcgg > 2:501386/1‑294 (MQ=255) cAGGCGACGACACTCCGATCATCATCGGTTCCGCTCGTATGGCCCTGGAAGGCAAAGACGACAACGAAATGGGCACTACCGCTGTCAAGAAGCTGGTAGAAACTCTGGATGCCTACATCCCTGAGCCAGTTCGTGCCATCGACCAGCCGTTCCTGATGCCGATCGAAGACGTGTTCTCGATCT‑CGGGTCGTGGTACCGTTGTTACCGGTCGTATCGAGCGTGGCATCGTTCGCGTTCAGGATCCGCTGGAAATCGTTGGTCTGCGTGACACCACCACCACCACCTGCACCGGTGTTGAGAt < 3:391082/301‑1 (MQ=255) aGGCGACGACACTCCGATCATCATCGGTTCCGCTCGTATGGCCCTGGAAGGCAAAGACGACAACGAAATGGGCACTACCGCTGTCAAGAAGCTGGTAGAAACTCTGGATGCCTACATCCCTGAGCCAGTTCGTGCCATCGACCAGCCGTTCCTGATGCCGATCGAAGACGTGTTCTCGATCT‑CGGGTCGTGGTACCGTTGTTACCGGTCGTATCGAGCGTGGCATCGTTCGCGTTCAGGATCCGCTGGAAATCGTTGGTCTGCGTGACACCACCACCACCACCTGCACCGGTGTTGAGATg > 1:62613/1‑301 (MQ=255) gacgacACTCCGATCATCATCGGTTCCGCTCGTATGGCCCTGGAAGGCAAAGACGACAACGAAATGGGCACTACCGCTGTCAAGAAGCTGGTAGAAACTCTGGATGCCTACATCCCTGAGCCAGTTCGTGCCATCGACCAGCCGTTCCTGATGCCGATCGAAGACGTGTTCTCGATCT‑CGGGTCGTGGTACCGTTGTTACCGGTCGTATCGAGCGTGGCATCGTTCGCGTTCAGGATCCGCTGGAAATCGTTGGTCTGCGTGACACCACCACCACCACCTGCACCGGTGTTGAGATGTTcc > 4:90937/1‑301 (MQ=255) acgacACTCCGATCATCATCGGTTCCGCTCGTATGGCCCTGGAAGGCAAAGACGACAACGAAATGGGCACTACCGCTGTCAAGAAGCTGGTAGAAACTCTGGATGCCTACATCCCTGAGCCAGTTCGTGCCATCGACCAGCCGTTCCTGATGCCGATCGAAGACGTGTTCTCGATCT‑CGGGTCGTGGTACCGTTGTTACCGGTCGTATCGAGCGTGGCATCGTTCGCGTTCAGGATCCGCTGGAAATCGTTGGTCTGCGTGACACCACCACCACCACCTGCACCGGTGTTGAGATGTTCCg < 4:527870/301‑1 (MQ=255) cGATCATCATCGGTTCCGCTCGTATGGCCCTGGAAGGCAAAGACGACAACGAAATGGGCACTACCGCTGTCAAGAAGCTGGTAGAAACTCTGGATGCCTACATCCCTGAGCCAGTTCGTGCCATCGACCAGCCGTTCCTGATGCCGATCGAAGACGTGCTCTCGATCT‑CGGGTCGTGGTACCGTTGTTACCGGTCGTATCGAGCGTGGCATCGTTCGCGTTCAGGATCCGCTGGAAATCGTTGGTCTGCGTGACACCACAACCACCACCTGCACCGGTGTTGAGATGTTCAGCAAgctgcc > 1:45099/1‑300 (MQ=255) 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catcatcGGTTCCGCTCGTATGGCCCTGGAAGGCAAAGACGACAACGAAATGGGCACTACCGCTGTCAAGAAGCTGGTAGAAACTCTGGATGCCTACATCCCTGAGCCAGTTCGTGCCATCGACCAGCCGTTCCTGATGCCGATCGAAGACGTGTTCTCGATCT‑CGGGTCGTGGTACCGTTGTTACCGGTCGTATCGAGCGTGGCATCGTTCGCGTTCAGGATCCGCTGGAAATCGTTGGTCTGCGTGACACCACCACCACCACCTGCACCGGTGTTGAGATGTTCCGCAAGCTGCTGGAc > 4:743203/1‑301 (MQ=255) tcatcGGTTCCGCTCGTATGGCCCTGGAAGGCAAAGACGACAACGAAATGGGCACTACCGCTGTCAAGAAGCTGGTAGAAACTCTGGATGCCTACATCCCTGAGCCAGTTCGTGCCATCGACCAGCCGTTCCTGATGCCGATCGAAGACGTGTTCTCGATCT‑CGGGTCGTGGTACCGTTGTTACCGGTCGTATCGAGCGTGGCATCGTTCGCGTTCAGGATCCGCTGGAAATCGTTGGTCTGCGTGACACCACCACAACCACCTGCAACGGTGTTTAGATGTTCCGCAAGCTGCTGGActg > 2:395108/1‑299 (MQ=255) atcGGTTCCGCTCGTATGGCCCTGGAAGGCAAAGACGACAACGAAATGGGCACTACCGCTGTCAAGAAGCTGGTAGAAACTCTGGATGCCTACATCCCTGAGCCAGTTCGTGCCATCGACCAGCCGTTCCTGATGCCGATCGAAGACGTGTTCTCGATCT‑CGGGTCGTGGTACCGTTGTTACCGGTCGTATCGAGCGTGGCATCGTTCGCGTTCAGGATCCGCTGGAAATCGTTGGTCTGCGTGACACCACCACCACCACCTGCACCGGTGTTGAGATGTTCCGCAAGCTGCTGGACGAAg > 4:445253/1‑301 (MQ=255) gTATGGCCCTGGAAGGCAAAGACGACAACGAAATGGGCACTACCGCTGTCAAGAAGCTGGTAGAAACTCTGGATGCCTACATCCCTGAGCCAGTTCGTGCCATCGACCAGCCGTTCCTGATGCCGATCGAAGACGTGTTCTCGATCT‑CGGGTCGTGGTACCGTTGTTACCGGTCGTATCGAGCGTGGCATCGTTCGCGTTCAGGATCCGCTGGAAATCGTTGGTCTGCGTGACACCACCACCACCACCTGCACCGGTGTTGAGATGTTCCGCAAGCTGCTGGACGAAGGTCGTTCTGGCga > 1:459361/1‑301 (MQ=255) aTGGCCCTGGAAGGCAAAGACGACAACGAAATGGGCACTACCGCTGTCAAGAAGCTGGTAGAAACTCTGGATGCCTACATCCCTGAGCCAGTTCGTGCCATCGACCAGCCGTTCCTGATGCCGATCGAAGACGTGTTCTCGATCT‑CGGGTCGTGGTACCGTTGTTACCGGTCGTATCGAGCGTGGCATCGTTCGCGTTCAGGATCCGCTGGAAATCGTTGGTCTGCGTGACACCACCACCACCACCTGCACCGGTGTTGAGATGTTCCGCAAGctgctgagatcggaagagcacacgtctg > 3:313711/1‑279 (MQ=255) cgCCCTAGAAGGCAAAGACCACAACGAAATGGGCACTACCGCCGTCAAGAAGCTGGTAGAAACTCTGGATGCCTACATCCCTGAGCCAGTTCGTGCCATCGACCAGCCGTTCCTGATGCCGATCGAAGACGTGTTCTCGATCT‑CGGGTCGTGGTACCGTTGTTACCGGTCGTATCGAGCGTGGCATCGTTCGCGTTCAGGATCCGCTGGAAATCGTTGGTCTGCGTGACACCACCACCACCACCTGCACCGGTGTTGAGATGTTCCGCAAGCTGCTGGACGAAGGTCGTGCTGGCGAGAAc < 2:742946/300‑1 (MQ=255) 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cACTACCGCTGTCAAGAAGCTGGTAGAAACTCTGGATGCCTACATCCCTGAGCCAGTTCGTGCCATCGACCAGCCGTTCCTGATGCCGATCGAAGACGTGTTCTCGATCT‑CGGGTCGTGGTACCGTTGTTACCGGTCGTATCGAGCGTGGCATCGTTCGCGTTCAGGATCCGCTGGAAATCGTTGGTCTGCGTGACACCACCACCACCACCTGCACCGGTGTTGAGATGTTCCGCAAGCTGCTGGACGAAGGTCGTGCTGGCGAGAACTGCGGCGTTCTGCTGCGTGGTACCAAGCgggag > 1:719173/1‑297 (MQ=255) cACTACCGCTGTCAAGAAGCTGGTAGAAACTCTGGATGCCTACATCCCTGAGCCAGTTCGTGCCATCGACCAGCCGTTCCTGATGCCGATCGAAGACGTGTTCTCGATCT‑CGGGTCGTGGTACCGTTGTTACCGGTCGTATCGAGCGTGGCATCGTTCGCGTTCAGGATCCGCTGGAAATCGTTGGTCTGCGTGACACCACCACCACCACCTGCACCGGTGTTGAGATGTTCCGCAAGCTGCTGGACGAAGGTCGTGCTGGCGAGAACTGCGGCGTTCTGCTGCGTGGTACCAAGCGTgac > 1:550291/1‑301 (MQ=40) tACCGCTGTCAAGAAGCTGGTAGAAACTCTGGATGCCTACATCCCTGAGCCAGTTCGTGCCATCGACCAGCCGTTCCTGATGCCGATCGAAGACGTGTTCTCGATCT‑CGGGTCGTGGTACCGTTGTTACCGGTCGTATCGAGCGTGGCATCGTTCGCGTTCAGGATCCGCTGGAAATCGTTGGTCTGCGTGACACCACCACCACCACCTGCACCGGTGTTGAGATGTTCCGCAAGCTGCTGGACGAAGGTCGTGCTGGCGAGAACTGCGGCGTTCTGCTGCGTGGTACCAAGCGTgacgac < 4:553589/301‑1 (MQ=40) caCCGCTGTCAAGAAGCTGGTAGAAACTCTGGATGCCTACATCCCTGAGCCAGTTCGTGCCATCGACCAGCCGTTCCTGATGCCGATCGAAGACGTGTTCTCGATCT‑CGGGTCGTGGTACCGTTGTTACCGGTCGTATCGAGCGTGGCATCGTTCGCGTTCAGGATCCGCTGGAAATCGTTGGTCTGCGTGACACCACCACCACCACCTGCACCGGTGTTGAGATGTTCCGCAAGCTGCTGGACGAAGGTCGTGCTGGCGAGAACTGCGGCGTTCTGCTGCGTGGTACCAAGCGTgacgac < 2:90911/300‑1 (MQ=40) cGCTGTCAAGAAGCTGGTAGAAACTCTGGATGCCTACATCCCTGAGCCAGTTCGTGCCATCGACCAGCCGTTCCTGATGCCGATCGAAGACGTGTTCTCGATCT‑CGGGTCGTGGTACCGTTGTTACCGGTCGTATCGAGCGTGGCATCGTTCGCGTTCAGGATCCGCTGGAAATCGTTGGTCTGCGTGACACCACCACCACCACCTGCACCGGTGTTGAGATGTTCCGCAAGCTGCTGGACGAAGGTCGTGCTGGCGAGAACTGCGGCGTTCTGCTGCGTGGTACCAATCGTGACGACGtt > 4:657913/1‑301 (MQ=255) gTCAAGAAGCTGGTAGAAACTCTGGATGCCTACATCCCTGAGCCAGTTCGTGCCATCGACCAGCCGTTCCTGATGCCGATCGAAGACGTGTTCTCGATCT‑CGGGTCGTGGTACCGTTGTTACCGGTCGTATCGAGCGTGGCATCGTTCGCGTTCAGGATCCGCTGGAAATCGTTGGTCTGCGTGACACCACCACCACCACCTGCACCGGTGTTGAGATGTTCCGCAAGCTGCTGGACGAAGGTCGTGCTGGCGAGAACTGCGGCGTTCTGCTGCGTGGTACCAAGCGTGACGACGTTGAGc > 4:327729/1‑301 (MQ=40) 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ggtagggAGCGTGGGAGCGGTCGCGTTCAGGATGCTCTGGAAATCGTTGGTCTGCGTGACACCACCACCACCACCCGCACCGGTGTTGAGATGTTCCGCAAGCTGCTGGACGAAGGTCGTGCTGGCGAGAACTGCGGCGTTCTGCTGCGTGGTACCAAGCGTGACGACGTTGAGCGTGGCCAGGTTCTGGTCAAGCCAGGTTCGGTCAAGCCGCACACCAAGTTCACCGCAGAAGTCTACGTCCTGTCGAAGGAAGAAGGCGGCCGTCACACTCCGTTCTTCAAAGGCTACCGTCCACAGt < 2:445126/295‑1 (MQ=255) tATCGAGCGTGGCATCGTTCGCGTTCAGGATCCGCTGGAAATCGTTGGTCTGCGTGACACCACCACCACCACCTGCACCGGTGTTGAGATGTTCCGCAAGCTGCTGGACGAAGGTCGTGCTGGCGAGAACTGCGGCGTTCTGCTGCGTGGTACCAAGCGTGACGACGTTGAGCGTGGCCAGGTTCTGGTCAAGCCAGGTTCGGTCAAGCCGCACACCAAGTTCACCGCAGAAGTCTACGTCCTGTCGAAGGAAGAAGGCGGCCGTCACACTCCGTTCTTCAAAGGCTACCGTCCACAGTTc < 3:379259/301‑1 (MQ=31) gcGAGCGTGGCATCGTTCGCGTTCAGGATCCGCTGGAAATCGTTGGTCTGCGTGACACCACAACCACCACCTGCACCGGTGTTGAGATGTTCCGCAAGCTGCTGGACGAAGGTCGTGCTGGCGAGAACTGCGGCGTTCTGCTGCGTGGTACCAAGCGTGACGACGTTGAGCGTGGCCAGGTTCTGGTCAAGCCAGGTTCGGTCAAGCCGCACACCAAGTTCACCGCAGAAGTCTACGTCCTGTCGAAGGAAGAAGGCGGCCGTCACACTCCGTTCTTCAAAGGCTACCGTCCACAGTTCTa < 2:520334/300‑1 (MQ=14) gAGCGTGGCATCGTTCGCGTTCAGGATCCGCTGGAAATCGTTGGTCTGCGTGACACCACCACCACCACCTGCACCGGTGTTGAGATGTTCCGCAAGCTGCTGGACGAAGGTCGTGCTGGCGAGAACTGCGGCGTTCTGCTGCGTGGTACCAAGCGTGACGACGTTGAGCGTGGCCAGGTTCTGGTCAAGCCAGGTTCGGTCAAGCCGCACACCAAGTTCACCGCAGAAGTCTACGTCCTGTCGAAGGAAGAAGGCGGCCGTCACACTCCGTTCTTCAAAGGCTACCGTCCACAGTTCTACt > 1:445651/1‑301 (MQ=31) gTGGCATCGTTCGCGTTCAGGATCCGCTGGAAATCGTTGGTCTGCGTGACACCACCACCACCACCTGCACCGGTGTTGAGATGTTCCGCAAGCTGCTGGACGAAGGTCGTGCTGGCGAGAACTGCGGCGTTCTGCTGCGTGGTACCAAGCGTGACGACGTTGAGCGTGGCCAGGTTCTGGTCAAGCCAGGTTCGGTCAAGCCGCACACCAAGTTCACCGCAGAAGTCTACGTCCTGTCGAAGGAAGAAGGCGGCCGTCACACTCCGTTCTTCAAAGGCTACCGTCCACAGTTATACTTCCg > 4:238456/1‑301 (MQ=14) cATCGTTCGCGTTCAGGATCCGCTGGAAATCGTTGGTCTGCGTGACACCACCACCACCACCTGCACCGGTGTTGAGATGTTCCGCAAGCTGCTGGACGAAGGTCGTGCTGGCGAGAACTGCGGCGTTCTGCTGCGTGGTACCAAGCGTGACGACGTTGAGCGTGGCCAGGTTCTGGTCAAGCCAGGTTCGGTCAAGCCGCACACCAAGTTCACCGCAGAAGTCTACGTCCTGTCGAAGGAAGAAGGCGGCCGTCACACTCCGTTCTTCAAAGGCTACCGTCCACAGTTCTACTTCCGTAcc < 4:546424/301‑1 (MQ=31) | CTACGACTTCCCAGGCGACGACACTCCGATCATCATCGGTTCCGCTCGTATGGCCCTGGAAGGCAAAGACGACAACGAAATGGGCACTACCGCTGTCAAGAAGCTGGTAGAAACTCTGGATGCCTACATCCCTGAGCCAGTTCGTGCCATCGACCAGCCGTTCCTGATGCCGATCGAAGACGTGTTCTCGATCT‑CGGGTCGTGGTACCGTTGTTACCGGTCGTATCGAGCGTGGCATCGTTCGCGTTCAGGATCCGCTGGAAATCGTTGGTCTGCGTGACACCACCACCACCACCTGCACCGGTGTTGAGATGTTCCGCAAGCTGCTGGACGAAGGTCGTGCTGGCGAGAACTGCGGCGTTCTGCTGCGTGGTACCAAGCGTGACGACGTTGAGCGTGGCCAGGTTCTGGTCAAGCCAGGTTCGGTCAAGCCGCACACCAAGTTCACCGCAGAAGTCTACGTCCTGTCGAAGGAAGAAGGCGGCCGTCACACTCCGTTCTTCAAAGGCTACCGTCCACAGTTCTACTTCCGTACCAC > AE015451/549805‑550341 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |