| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | AE015451 | 550100 = | NA (NA) | 5 (0.050) | 5/574 | 7.7 | 4.5% | coding (775/1194 nt) | tufB | Elongation factor Tu‑B |
| ? | AE015451 | = 550096 | 112 (1.060) | coding (771/1194 nt) | tufB | Elongation factor Tu‑B | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 116 total aligned reads displayed.
GCTGTCCACCTACGACTTCCCAGGCGACGACACTCCGATCATCATCGGTTCCGCTCGTATGGCCCTGGAAGGCAAAGACGACAACGAAATGGGCACTACCGCTGTCAAGAAGCTGGTAGAAACTCTGGATGCCTACATCCCTGAGCCAGTTCGTGCCATCGACCAGCCGTTCCTGATGCCGATCGAAGACGTGTTCTCGATCT‑CGGGTCGTGGTACCGTTGTTACCGGTCGTATCGAGCGTGGCATCGTTCGCGTTCAGGATCCGCTGGAAATCGTTGGTCTGCGTGACACCACCACCACCACCTGCACCGGTGTTGAGATGTTCCGCAAGCTGCTGGACGAAGGTCGTGCT‑GGCGAGAACTGCGGCGTTCTGCTGCGTGGTACCAAGCGTGACGACGTTGAGCGTGGCCAGGTTCTGGTCAAGCCAGGTTCGGTCAAGCCGCACACCAAGTTCACCGCAGAAGTCTACGTCCTGTCGAAGGAAGAAGGCGGCCGTCACACTCCGTTCTTCAAAGGCTACCGTCCACAGTTCTACTTCCGTACCAC > AE015451/549796‑550341 | gctgTCCACCTACGACTTCCCAGGCGACGACACTCCGATCATCATCGGTTCCGCTCGTATGGCCCTGGAAGGCAAAGACGACAACGAAATGGGCACTACCGCTGTCAAGAAGCTGGTAGAAACTCTGGATGCCTACATCCCTGAGCCAGTTCGTGCCATCGACCAGCCGTTCCTGATGCCGATCGAAGACGTGTTCTCGATCT‑CGGGTCGTGGTACCGTTGTTACCGGTCGTATCGAGCGTGGCATCGTTCGCGTTCAGGATCCGCTGGAAATCGTTGGTCTGCGTGAcaccaccaccacc > 4:204985/1‑301 (MQ=255) cTACGACTTCCCAGGCGACGACACTCCGATCATCATCGGTTCCGCTCGTATGGCCCTGGAAGGCAAAGACGACAACGAAATGGGCACTACCGCTGTCAAGAAGCTGGTAGAAACTCTGGATGCCTACATCCCTGAGCCAGTTCGTGCCATCGACCAGCCGTTCCTGATGCCGATCGAAGACGTGTTCTCGATCT‑CGGGTCGTGGTACCGTTGTTACCGGTCGTATCGAGCGTGGCATCGTTCGCGTTCAGGATCCGCTGGAAATCGTTGGTCTGCGTGACACCACCACCACCACCTGCAcc > 1:391072/1‑301 (MQ=255) ccgatctcAGGCGACGACACTCCGATCATCATCGGTTCCGCTCGTATGGCCCTGGAAGGCAAAGACGACAACGAAATGGGCACTACCGCTGTCAAGAAGCTGGTAGAAACTCTGGATGCCTACATCCCTGAGCCAGTTCGTGCCATCGACCAGCCGTTCCTGATGCCGATCGAAGACGTGTTCTCGATCT‑CGGGTCGTGGTACCGTTGTTACCGGTCGTATCGAGCGTGGCATCGTTCGCGTTCAGGATCCGCTGGAAATCGTTGGTCTGCGTGACACCACCACCACCACCTGCACCGgtg < 4:501536/294‑1 (MQ=255) ccccgggaccgaacatCCGATCATCATCGGTTCCGCTCGTATTGCCCTGGAAGGCAAAGACGACAACGAAATGGGCACTACCGCTGTCAAGAAGCTGGTAGAAACTCTGGATGCCTACATCCCTGAGCCAGTTCGTGCCATCGACCAGCCGTTCCTGATGCCGATCGAAGACGTGTTCTCGATCT‑CGGGTCGTGGTACCGTTGTTACCGGTCGTATCGAGCGTGGCATCGTTCGCGTTCAGGATCCGCTGGAAATCGTTGGTCTGCGTGACACCACCACCACCACCTGCACCGGTGTTgag < 2:204934/286‑1 (MQ=255) cccAGGCGACGACACTCCGATCATCATCGGTTCCGCTCGTATGGCCCTGGAAGGCAAAGACGACAACGAAATGGGCACTACCGCTGTCAAGAAGCTGGTAGAAACTCTGGATGCCTACATCCCTGAGCCAGTTCGTGCCATCGACCAGCCGTTCCTGATGCCGATCGAAGACGTGTTCTCGATCT‑CGGGTCGTGGTACCGTTGTTACCGGTCGTATCGAGCGTGGCATCGTTCGCGTTCAGGATCCGCTGGAAATCGTTGGTCTGCGTGTGCCCCCCACCACCACCTGCACCGGAGTTgcg > 2:321654/1‑299 (MQ=255) cccAGGCGACGACACTCCGATCATCATCGGTTCCGCTCGTATGGCCCTGGAAGGCAAAGACGACAACGAAATGGGCACTACCGCTGTCAAGAAGCTGGTAGAAACTCTGGATGCCTACATCCCTGAGCCAGTTCGTGCCATCGACCAGCCGTTCCTGATGCCGATCGAAGACGTGTTCTCGATCT‑CGGGTCGTGGTACCGTTGTTACCGGTCGTATCGAGCGTGGCATCGTTCGCGTTCAGGATCCGCTGGAAATCGTTGGTCTGCGTGACACCACCACCACCACCTGCACCGGTGTTgag < 1:543139/301‑1 (MQ=255) cAGGCGACGACACTCCGATCATCATCGGTTCCGCTCGTATGGCCCTGGAAGGCAAAGACGACAACGAAATGGGCACTACCGCTGTCAAGAAGCTGGTAGAAACTCTGGATGCCTACATCCCTGAGCCAGTTCGTGCCATCGACCAGCCGTTCCTGATGCCGATCGAAGACGTGTTCTCGATCT‑CGGGTCGTGGTACCGTTGTTACCGGTCGTATCGAGCGTGGCATCGTTCGCGTTCAGGATCCGCTGGAAATCGTTGGTCTGCGTGACACCCCCACCACCACCTGCCCCGgtgcgatcgg > 2:501386/1‑294 (MQ=255) cAGGCGACGACACTCCGATCATCATCGGTTCCGCTCGTATGGCCCTGGAAGGCAAAGACGACAACGAAATGGGCACTACCGCTGTCAAGAAGCTGGTAGAAACTCTGGATGCCTACATCCCTGAGCCAGTTCGTGCCATCGACCAGCCGTTCCTGATGCCGATCGAAGACGTGTTCTCGATCT‑CGGGTCGTGGTACCGTTGTTACCGGTCGTATCGAGCGTGGCATCGTTCGCGTTCAGGATCCGCTGGAAATCGTTGGTCTGCGTGACACCACCACCACCACCTGCACCGGTGTTGAGAt < 3:391082/301‑1 (MQ=255) aGGCGACGACACTCCGATCATCATCGGTTCCGCTCGTATGGCCCTGGAAGGCAAAGACGACAACGAAATGGGCACTACCGCTGTCAAGAAGCTGGTAGAAACTCTGGATGCCTACATCCCTGAGCCAGTTCGTGCCATCGACCAGCCGTTCCTGATGCCGATCGAAGACGTGTTCTCGATCT‑CGGGTCGTGGTACCGTTGTTACCGGTCGTATCGAGCGTGGCATCGTTCGCGTTCAGGATCCGCTGGAAATCGTTGGTCTGCGTGACACCACCACCACCACCTGCACCGGTGTTGAGATg > 1:62613/1‑301 (MQ=255) gacgacACTCCGATCATCATCGGTTCCGCTCGTATGGCCCTGGAAGGCAAAGACGACAACGAAATGGGCACTACCGCTGTCAAGAAGCTGGTAGAAACTCTGGATGCCTACATCCCTGAGCCAGTTCGTGCCATCGACCAGCCGTTCCTGATGCCGATCGAAGACGTGTTCTCGATCT‑CGGGTCGTGGTACCGTTGTTACCGGTCGTATCGAGCGTGGCATCGTTCGCGTTCAGGATCCGCTGGAAATCGTTGGTCTGCGTGACACCACCACCACCACCTGCACCGGTGTTGAGATGTTcc > 4:90937/1‑301 (MQ=255) cGATCATCATCGGTTCCGCTCGTATGGCCCTGGAAGGCAAAGACGACAACGAAATGGGCACTACCGCTGTCAAGAAGCTGGTAGAAACTCTGGATGCCTACATCCCTGAGCCAGTTCGTGCCATCGACCAGCCGTTCCTGATGCCGATCGAAGACGTGCTCTCGATCT‑CGGGTCGTGGTACCGTTGTTACCGGTCGTATCGAGCGTGGCATCGTTCGCGTTCAGGATCCGCTGGAAATCGTTGGTCTGCGTGACACCACAACCACCACCTGCACCGGTGTTGAGATGTTCAGCAAgctgcc > 1:45099/1‑300 (MQ=255) ctacacgacgctcttccgatctATGGCCCTGGAAGGCAAAGACGACAACGAAATGGGCACTACCGCTGTCAAGAAGCTGGTAGAAACTCTGGATGCCTACATCCCTGAGCCAGTTCGTGCCATCGACCAGCCGTTCCTGATGCCGATCGAAGACGTGTTCTCGATCT‑CGGGTCGTGGTACCGTTGTTACCGGTCGTATCGAGCGTGGCATCGTTCGCGTTCAGGATCCGCTGGAAATCGTTGGTCTGCGTGACACCACCACCACCACCTGCACCGGTGTTGAGATGTTCCGCAAGctgctg < 1:313705/280‑1 (MQ=255) tcatcatcGGTTCCGCTCGTATGGCCCTGGAAGGCAAAGACGACAACGAAATGGGCACTACCGCTGTCAAGAAGCTGGTAGAAACTCTGGATGCCTACATCCCTGAGCCAGTTCGTGCCATCGACCAGCCGTTCCTGATGCCGATCGAAGACGTGTTCTCGATCT‑CGGGTCGTGGTACCGTTGTTACCGGTCGTATCGAGCGTGGCATCGTTCGCGTTCAGGATCCGCTGGAAATCGTTGGTCTGCGTGACACCACCACCACCACCTGCACCGGTGTTGAGATGTTCCGCAAGCTGCTGGa > 1:378003/1‑301 (MQ=255) ccatcatcGGGGCCGCTCGTATGGCCCTGAAAGGCAAAGACGACAACGAAATGGGCACTACCGCTGTCAAGAAGCTGGTAGAAACTATGGATGCCTACATCCCTGAGCCAGTTCGTGCCATCGACCAGCCGTTCCTGATGCCGATCGAAGACGTGTTCTCGATCT‑CGGGTCGTGGTACCGTTGTTACCGGTCGTATCGAGCGTGGCATCGTTCGCGTTCAGGATCCGCTGGAAATCGTTGGTCTGCGTGACACCACCACCACCACCTGCACCGGTGTTGAGATGTTCCGCAAGCTGCTGGa < 2:614151/300‑1 (MQ=255) catcatcGGTTCCGCTCGTATGGCCCTGGAAGGCAAAGACGACAACGAAATGGGCACTACCGCTGTCAAGAAGCTGGTAGAAACTCTGGATGCCTACATCCCTGAGCCAGTTCGTGCCATCGACCAGCCGTTCCTGATGCCGATCGAAGACGTGTTCTCGATCT‑CGGGTCGTGGTACCGTTGTTACCGGTCGTATCGAGCGTGGCATCGTTCGCGTTCAGGATCCGCTGGAAATCGTTGGTCTGCGTGACACCACCACCACCACCTGCACCGGTGTTGAGATGTTCCGCAAGCTGCTGGAc > 4:743203/1‑301 (MQ=255) tcatcGGTTCCGCTCGTATGGCCCTGGAAGGCAAAGACGACAACGAAATGGGCACTACCGCTGTCAAGAAGCTGGTAGAAACTCTGGATGCCTACATCCCTGAGCCAGTTCGTGCCATCGACCAGCCGTTCCTGATGCCGATCGAAGACGTGTTCTCGATCT‑CGGGTCGTGGTACCGTTGTTACCGGTCGTATCGAGCGTGGCATCGTTCGCGTTCAGGATCCGCTGGAAATCGTTGGTCTGCGTGACACCACCACAACCACCTGCAACGGTGTTTAGATGTTCCGCAAGCTGCTGGActg > 2:395108/1‑299 (MQ=255) atcGGTTCCGCTCGTATGGCCCTGGAAGGCAAAGACGACAACGAAATGGGCACTACCGCTGTCAAGAAGCTGGTAGAAACTCTGGATGCCTACATCCCTGAGCCAGTTCGTGCCATCGACCAGCCGTTCCTGATGCCGATCGAAGACGTGTTCTCGATCT‑CGGGTCGTGGTACCGTTGTTACCGGTCGTATCGAGCGTGGCATCGTTCGCGTTCAGGATCCGCTGGAAATCGTTGGTCTGCGTGACACCACCACCACCACCTGCACCGGTGTTGAGATGTTCCGCAAGCTGCTGGACGAAg > 4:445253/1‑301 (MQ=255) gacgtgtgctcttccgatcttGGAAGGCAAAGACGACAACGAAATGGGCACTACCGCTGTCAAGAAGCTGGTAGAAACTCTGGATGCCTACATCCCTGAGCCAGTTCGTGCCATCGACCAGCCGTTCCTGATGCCGATCGAAGACGTGTTCTCGATCT‑CGGGTCGTGGTACCGTTGTTACCGGTCGTATCGAGCGTGGCATCGTTCGCGTTCAGGATCCGCTGGAAATCGTTGGTCTGCGTGACACCACCACCACCACCTGCACCGGTGTTGAGATGTTCCGCAAGCTGCTGGACGAAGGt < 4:385074/281‑1 (MQ=255) cccGCTCGGATGGCCCTGGAAGGCAAAGACGACAACGAAAGGGGCACTACCGCTGTCAAGAAGCTGGTAGACACTCTGGATGCCTACATCCCTGGGCCAGTTCGTGCCATCGACCGGCCGTTCCTGATGCCAGTCGAAGACGTGTTCTCGATCT‑CCGGTCGTGGTACCGTTGTTACCGGTCGTATCGAGCGTGGCATCGTTCGCGTTCAGGATCCGCTGGAAATCGTTGGTCTGCGTGACACCACCACCACCACCTGCACCGGTGTTGAGATGTTCCGCAAGCTGCTGGACGAAGGTCGTg < 1:61247/300‑1 (MQ=14) gTATGGCCCTGGAAGGCAAAGACGACAACGAAATGGGCACTACCGCTGTCAAGAAGCTGGTAGAAACTCTGGATGCCTACATCCCTGAGCCAGTTCGTGCCATCGACCAGCCGTTCCTGATGCCGATCGAAGACGTGTTCTCGATCT‑CGGGTCGTGGTACCGTTGTTACCGGTCGTATCGAGCGTGGCATCGTTCGCGTTCAGGATCCGCTGGAAATCGTTGGTCTGCGTGACACCACCACCACCACCTGCACCGGTGTTGAGATGTTCCGCAAGCTGCTGGACGAAGGTCGTTCT‑GGCga > 1:459361/1‑301 (MQ=255) aTGGCCCTGGAAGGCAAAGACGACAACGAAATGGGCACTACCGCTGTCAAGAAGCTGGTAGAAACTCTGGATGCCTACATCCCTGAGCCAGTTCGTGCCATCGACCAGCCGTTCCTGATGCCGATCGAAGACGTGTTCTCGATCT‑CGGGTCGTGGTACCGTTGTTACCGGTCGTATCGAGCGTGGCATCGTTCGCGTTCAGGATCCGCTGGAAATCGTTGGTCTGCGTGACACCACCACCACCACCTGCACCGGTGTTGAGATGTTCCGCAAGctgctgagatcggaagagcacacgtctg > 3:313711/1‑279 (MQ=255) cgCCCTAGAAGGCAAAGACCACAACGAAATGGGCACTACCGCCGTCAAGAAGCTGGTAGAAACTCTGGATGCCTACATCCCTGAGCCAGTTCGTGCCATCGACCAGCCGTTCCTGATGCCGATCGAAGACGTGTTCTCGATCT‑CGGGTCGTGGTACCGTTGTTACCGGTCGTATCGAGCGTGGCATCGTTCGCGTTCAGGATCCGCTGGAAATCGTTGGTCTGCGTGACACCACCACCACCACCTGCACCGGTGTTGAGATGTTCCGCAAGCTGCTGGACGAAGGTCGTGCT‑GGCGAGAAc < 2:742946/300‑1 (MQ=255) cccTGGAAGGCAAAGACGACAACGAAATGGGCACTACCGCTGTCAAGAAGCTGGTAGAAACTCTGGATGCCTACATCCCTGAGCCAGTTCGTGCCATCGACCAGCCGTTCCTGATGCCGATCGAAGACGTGTTCTCGATCT‑CGGGTCGTGGTACCGTTGTTACCGGTCGTATCGAGCGTGGCATCGTTCGCGTTCAGGATCCGCTGGAAATCGTTGGTCTGCGTGACACCCCCACCACCACCTGCACCGGTGTTGAGATGTTCCGCAAGCTGTTGGACGAAGGTCGT‑CTCGGCGAGAACTg > 2:553419/1‑301 (MQ=255) gAAGGCAAAGACGACAACGAAATGGGCACTACCGCTGTCAAGAAGCTGGTAGAAACTCTGGATGCCTACATCCCTGAGCCAGTTCGTGCCATCGACCAGCCGTTCCTGATGCCGATCGAAGACGTGTTCTCGATCT‑CGGGTCGTGGTACCGTTGTTACCGGTCGTATCGAGCGTGGCATCGTTCGCGTTCAGGATCCGCTGGAAATCGTTGGTCTGCGTGACACCACCACCACCACCTGCACCGGTGTTGAGATGTTCCGCAAGCTGCTGGACGAAGGTCGTGCT‑GGCGAGAACTgcggcg > 2:330797/1‑301 (MQ=40) aaGGCAAAGACGACAACGAAATGGGCACTACCGCTGTCAAGAAGCTGGTAGAAACTCTGGATGCCTACATCCCTGAGCCAGTTCGTGCCATCGACCAGCCGTTCCTGATGCCGATCGAAGACGTGTTCTCGATCT‑CGGGTCGTGGTACCGTTGTTACCGGTCGTATCGAGCGTGGCATCGTTCGCGTTCAGGATCCGCTGGAAATCGTTGGTCTGCGTGACGCCACCACCACCACCTGCACCGGTGTTGAGATGTTCCGCAAGCTGCTGGACGAAGGTCGTGCT‑GGCGAGAACTGCGGCGt > 1:243522/1‑301 (MQ=255) 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aaaCGAAATGGGCACTACCGCTGTCAAGAAGCTGGTAGAAACTCTGGATGCCTACATCCCTGAGCCAGTTCGTGCCATCGACCAGCCGTTCCTGATGCCGATCGAAGACGTGTTCTCGATCT‑CGGGTCGTGGTACCGTTGTTACCGGTCGTATCGAGCGTGGCATCGTTCGCGTTCAGGATCCGCTGGAAATCGTTGGTCTGCGTGACACCACCACCACCACCTGCACCGGTGTTGAGATGTTCCGCAAGCTGCTGGACGAAGGTCGTGCT‑GGCGAGAACTGCGGCGTTCTGCTGCGTGGt < 1:497312/300‑1 (MQ=40) cGAAATGGGCACTACCGCTGTCAAGAAGCTGGTAGAAACTCTGGATGCCTACATCCCTGAGCCAGTTCGTGCCATCGACCAGCCGTTCCTGATGCCGATCGAAGACGTGTTCTCGATCT‑CGGGTCGTGGTACCGTTGTTACCGGTCGTATCGAGCGTGGCATCGTTCGCGTTCAGGATCCGCTGGAAATCGTTGGTCTGCGTGACACCACCACCACCACCTGCACCGGTGTTGAGATGTTCCGCAAGCTGCTGGACTACTGTCGTCCT‑GGCGAGACCTGCGGGGtttctcgtgctggatcc > 2:600118/1‑286 (MQ=14) aaTGGGCACTACCGCTGTCAAGAAGCTGGTAGAAACTCTGGATGCCTACATCCCTGAGCCAGTTCGTGCCATCGACCAGCCGTTCCTGATGCCGATCGAAGACGTGTTCTCGATCT‑CGGGTCGTGGTACCGTTGTTACCGGTCGTATCGAGCGTGGCATCGTTCGCGTTCAGGATCCGCTGGAAATCGTTGGTCTGCGTGACACCACCACCACCACCTGCACCGGTGTTGAGATGTTCCGCAAGCTGCTGGACGAAGGTCGTGCT‑GGCGAGAACTGCGGCGTTCTGCTGCGTGGTACCAAg < 3:190772/301‑1 (MQ=40) 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ggTCGTATCGAGCGTGGCATCGTTCGCGTTCAGGATCCGCTGGAAATCGTTGGTCTGCGTGACACCACCACCACCACCTGCACCGGTGTTGAGATGTTCCGCAAGCTGCTGGACGAAGGTCGTGCT‑GGCGAGAACTGCGGCGTTCTGCTGCGTGGTACCAAGCGTGACGACGTTGAGCGTGGCCAGGTTCTGGTCAAGCCAGGTTCGGTCAAGCCGCACACCAAGTTCACCGCAGAAGTCTACGTCCTGTCGAAGGAAGAAGGCGGCCGTCACACTCCGTTCTTCaagatcggaagagcac > 3:640097/1‑287 (MQ=14) tCGTATCGAGCGTGGCATCGTTCGCGTTCAGGATCCGCTGGAAATCATTGGTCTGCGTGACACCACCACCACCACCTGCACCGGTGTTGAGATGTTCCGCAAGCTGCTGGACGAAGGTCGTGCT‑GGCGAGAACTGCGGCGTTCTGCTGCGTGGTACCAAGCGTGACGACGTTGAGCGTGGCCAGGTTCTGGTCAAGCCAGGTTCGGTCAAGCCGCACACCAAGTTCACCGCAGAAGTCTACGTCCTGTCGAAGGAAGAAGGCGGCCGTCACACTCCGTTCTTCAAAGGCTACCGTCCACAg < 3:638307/301‑1 (MQ=14) ggtagggAGCGTGGGAGCGGTCGCGTTCAGGATGCTCTGGAAATCGTTGGTCTGCGTGACACCACCACCACCACCCGCACCGGTGTTGAGATGTTCCGCAAGCTGCTGGACGAAGGTCGTGCT‑GGCGAGAACTGCGGCGTTCTGCTGCGTGGTACCAAGCGTGACGACGTTGAGCGTGGCCAGGTTCTGGTCAAGCCAGGTTCGGTCAAGCCGCACACCAAGTTCACCGCAGAAGTCTACGTCCTGTCGAAGGAAGAAGGCGGCCGTCACACTCCGTTCTTCAAAGGCTACCGTCCACAGt < 2:445126/295‑1 (MQ=255) gAGCGTGGCATCGTTCGCGTTCAGGATCCGCTGGAAATCGTTGGTCTGCGTGACACCACCACCACCACCTGCACCGGTGTTGAGATGTTCCGCAAGCTGCTGGACGAAGGTCGTGCT‑GGCGAGAACTGCGGCGTTCTGCTGCGTGGTACCAAGCGTGACGACGTTGAGCGTGGCCAGGTTCTGGTCAAGCCAGGTTCGGTCAAGCCGCACACCAAGTTCACCGCAGAAGTCTACGTCCTGTCGAAGGAAGAAGGCGGCCGTCACACTCCGTTCTTCAAAGGCTACCGTCCACAGTTCTACt > 1:445651/1‑301 (MQ=31) gTGGCATCGTTCGCGTTCAGGATCCGCTGGAAATCGTTGGTCTGCGTGACACCACCACCACCACCTGCACCGGTGTTGAGATGTTCCGCAAGCTGCTGGACGAAGGTCGTGCT‑GGCGAGAACTGCGGCGTTCTGCTGCGTGGTACCAAGCGTGACGACGTTGAGCGTGGCCAGGTTCTGGTCAAGCCAGGTTCGGTCAAGCCGCACACCAAGTTCACCGCAGAAGTCTACGTCCTGTCGAAGGAAGAAGGCGGCCGTCACACTCCGTTCTTCAAAGGCTACCGTCCACAGTTATACTTCCg > 4:238456/1‑301 (MQ=14) cATCGTTCGCGTTCAGGATCCGCTGGAAATCGTTGGTCTGCGTGACACCACCACCACCACCTGCACCGGTGTTGAGATGTTCCGCAAGCTGCTGGACGAAGGTCGTGCT‑GGCGAGAACTGCGGCGTTCTGCTGCGTGGTACCAAGCGTGACGACGTTGAGCGTGGCCAGGTTCTGGTCAAGCCAGGTTCGGTCAAGCCGCACACCAAGTTCACCGCAGAAGTCTACGTCCTGTCGAAGGAAGAAGGCGGCCGTCACACTCCGTTCTTCAAAGGCTACCGTCCACAGTTCTACTTCCGTAcc < 4:546424/301‑1 (MQ=31) | GCTGTCCACCTACGACTTCCCAGGCGACGACACTCCGATCATCATCGGTTCCGCTCGTATGGCCCTGGAAGGCAAAGACGACAACGAAATGGGCACTACCGCTGTCAAGAAGCTGGTAGAAACTCTGGATGCCTACATCCCTGAGCCAGTTCGTGCCATCGACCAGCCGTTCCTGATGCCGATCGAAGACGTGTTCTCGATCT‑CGGGTCGTGGTACCGTTGTTACCGGTCGTATCGAGCGTGGCATCGTTCGCGTTCAGGATCCGCTGGAAATCGTTGGTCTGCGTGACACCACCACCACCACCTGCACCGGTGTTGAGATGTTCCGCAAGCTGCTGGACGAAGGTCGTGCT‑GGCGAGAACTGCGGCGTTCTGCTGCGTGGTACCAAGCGTGACGACGTTGAGCGTGGCCAGGTTCTGGTCAAGCCAGGTTCGGTCAAGCCGCACACCAAGTTCACCGCAGAAGTCTACGTCCTGTCGAAGGAAGAAGGCGGCCGTCACACTCCGTTCTTCAAAGGCTACCGTCCACAGTTCTACTTCCGTACCAC > AE015451/549796‑550341 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |