| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | AE015451 | 5,342,745 | 1681 bp→GCGGCCGC | [pgi‑II] | [pgi‑II] | |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | AE015451 | 5342745 | 5344425 | 1681 | 50 [0] | [0] 50 | [pgi‑II] | [pgi‑II] |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | AE015451 | = 5342744 | 0 (0.000) | 49 (0.610) +GCGGCCGC |
47/584 | 0.6 | 100% | intergenic (+190/‑17) | panC/pgi‑II | pantothenate synthetase/glucose‑6‑phosphate isomerase |
| ? | AE015451 | 5344426 = | 0 (0.000) | intergenic (+1/‑177) | pgi‑II/acsA‑II | glucose‑6‑phosphate isomerase/acetyl‑CoA synthetase | |||||
CGAAAAGCTGGCCCCGCACAAGGTGATCCCGGGTAACCGCCCGAGCAACACGTTGGTGGTCGAGCGCATCAGCCCGCGCCGGCTGGGTGCGCTGGTGGCCATGTACGAGCACAAGGTGTTCGTACAGAGCGTTATCTGGGGTATCAACGCCTTCGATCAGTGGGGCGTCGAGCTGGGCAAGGAGCTGGGCAAGGGCGTTTACCAGCGCTTGGTCGGTAGCCTGGAAGACAGCGCCGAAGACGGTTCCACCCAAGGCCTGATCAACTACTTCCGCGGCCGTCACCGCGGTTGATCCGAGCTTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCCTACCAGGCAACGCGTTACCTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTTGAACACCGCTCCCAGCTACACTGTCTTATCGAATAGCCGTTGCAGTCCATCGCCCCTTACAAGAGCAGGACCACCCGCCATGTTCGATATCCGCAAATACCCCCAGGCCCTGGCCGTCAGCCAGTCCGCCGCCCTCACCCCCGAAGACTACCGCCGCCTCTACCGCCAGTCGGTCGAAGACCCAGACACCTTCTGG > AE015451/5344134‑5344719 | tgatcgagacctggtggtgcttcgggcggcttatcggggtagacagcggttgatcgacaacctttacctgcatttggaggcgaagaccgcagaacggtcttgcggtgccttgcagccgattcgcgggcaagcccgctcctgcacgtttacctgtaggtgcgggcttgcttgcaatgcgcccaaaatccccctgccatacccattcccagcacgtcgcctttgcctataacggtgccagcctgaacccggcaacgaccgccgtgtccaagccctcaccacgcaccgcggccgcTCCGAGCtt < 2:373684‑M2/9‑1 (MQ=255) gatcgagacctggtggtgattgcggcggcttacctgggtaacacgcggttgatcgacaacctctacctgcatttggaagagaagaccgcataacggtcttgggctgccttgcagcccattcgcgggcaagcccgctcctgcacgtttacctgtaggggcgggcttgcttgcaatgcccccaaaatccccctgccatacccattcccagcacgtggcctttgcctataatggtgccagcctgaacccggcaacgactgccgtgtccaagccctccccccgccccgcggccgcCCCGAGcttt > 2:39371‑M2/292‑300 (MQ=255) atcgagacctggtggtgattgtggcggcttacctgggtaacacgcggttgatcgacaacctctacctgcatttggaagagaagaccgcataacggtcttgggctgccttgcagcccattcgcgggcaagcccgctcctgcacgtttacctgtaggggcgggcttgcttgcaatgcccccaaaatccccctgccatacccattcccagcacgtggcctttgcctataatggtgccagcctgaacccggcaacgactgccgtgtccaagccctcaccacgcaccgcggccgcTCCGAGCTtgt < 1:25091‑M2/11‑1 (MQ=255) atcgagacctggtggtgattgcggcggcttacctgggtaacacgcggttgatcgacaacctctacctgcatttggaagagaagaccgcataacggtcttgggctgccttgcagcccattcgcgggcaagcccgctcctgcacgtttacctgtaggggcgggcttgcttgcaatgcccccaaaatccccctgccatacccattcccagcacgtggcctttgcctataatggtgccagcctgaacccggcaacgactgccgtgtccaagccctcaccacgcaccgcggccgcTCCGAGCTtgt < 1:156448‑M2/11‑1 (MQ=255) ggggtactggtggtgattgcggctgcttacctgggtaccagccgcttgctcgacaacctctacctgcatttggaagggaagaccgcataacggtcttgggctgccttgcagcccattcgcgggcaagcccgctcctgcacgtttacctgtaggggcgggcttgcttgcaatgcccccaaaatccccctgccatacccattcccagcacgtggcctttgcctataatggtgccagcctgaacccggcaacgactgccgtgtccaagccctcaccacgcaccgcggccgcTCCGAGCTTGTGc < 2:670095‑M2/13‑1 (MQ=255) ggtggtgattgcggcggcttacctgggtaacacgcggttgatcgacaacctctacctgcatttggaagagaagaccgcataacggtcttgggctgccttgcagcccattcgcgggcaagcccgctcctgcacgtttacctgtaggggcgggcttgcttgcaatgcccccaaaatccccctgccatacccattcccagcacgtggcctttgcctataatggtgccagcctgaacccggcaacgactgccgtgtccaagccctcaccacgcaccgcggccgcTCCGAGCTTGTGCCGGCctct < 1:39373‑M2/21‑1 (MQ=255) ggttcttacctgggtaacacgcggttgatcgacaacctctacctgcatttggaagagaagaccgcataacggtcttgggctgccttgcagcccattcgcgggcaagcccgctcctgcacgtttacctgtaggggcgggcttgcttgcaatgcccccaaaatccccctgccatacccattcccagcacgtggcctttgcctataatggtgccagcctgaacccggcaacgactgccgtgtccaagccctcaccacgcaccgcggccgcTCCGAGCTTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAAcc < 2:492729‑M2/34‑1 (MQ=255) 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gccatacccattcccagcacgtggcctttgcctataatggtgccagcctgaacccggcaacgactgccgtgtccaagccctcaccacgcaccgcggccgcTCCGAGCTTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCCTACCAGGCAACGCGTTACCTCGTAGGAGCGGGTTGACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTTGCACAGCGCCCCCAGCTACACTCTCTTATCGAATGGCCGTTGCAGGCCATCGCCCCTTACAAGAGCAGAACAACCCGCAATGTTCGATATCCGAAAATAcccc > 2:736622‑M2/101‑301 (MQ=255) ccccatacccaaaaagtggcctttgcctataatggggcaagcctgaacccggaaacgacagccgtgtccaagccctcaccacgcaccgcggccgcTCCGAGCTTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCCTACCAGGCAACGCGTTACCTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTTGAACACCGCTCCCAGCTACACTGTCTTATCGAATAGCCGTTGCAGTCCATCGCCCCTTACAAGAGCAGGACCACCCGCCATGTTCGATATCCGCAAATACCCCCAGGc < 1:902862‑M2/206‑1 (MQ=255) attcccagcacgtggcctttgcctataatggtgccagcctgaacccggcaacgactgccgtgtccaagccctcaccacgcaccgcggccgcTCCGAGCTTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCCTACCAGGCAACGCGTTACCTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTTGAACACCGCTCCCAGCTACACTGTCTTATCGAATAGCCGTTGCAGTCCATCGCCCCTTACAAGAGCAGGACCACCCGCCATGTTCGATCTCCGCAAATACCCCCCGCCCCTg > 2:181532‑M2/92‑301 (MQ=255) gtggcctttgcctataatggtgccagcctgaacccggcaacgactgccgtgtccaagccctcaccacgcaccgcggccgcTCCGAGCTTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCCTACCAGGCAACGCGTTACCTCGCAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTTGAACACCGCTCCCAGCTACACTGTCTTAACGAATACCCGTTGCAGTCCATCGCCCCTCACAAGAGCAGGACCCCCCTCCCACTTCGATCCCCGCAAACACCCCACGTCcctggccgccccacc > 2:247679‑M2/81‑294 (MQ=255) ctgaacccggcaacgactgccgtgtccaagccctcaccacgcaccgcggccgcTCCGAGCTTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCCTACCAGGCAACGCGTTACCTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTTGAACACCGCTCCCAGCTACACTGTCTTATCGAATAGCCGTTGCAGTCCATCGCCCCTTACAAGAGCAGGACCACCCGCCATGTTCGATATCCGCAAATACCCCCAGGCCCTGGCCGTCAGCCAGTCCGCCGCCCCCACCCCCGAAgacca > 1:859090‑M2/54‑299 (MQ=255) aaacccggcaacgactgccgtgtccaagccctcaccacgcaccgcggccgcTCCGAGCTTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCCTACCAGGCAACGCGTTACCTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTTGAACACCGCTCCCAGCTACACTGTCTTATCGAATAGCCGTTGCAGTCCATCGCCCCTTACAAGAGCAGGACCACCCGCCATGTTCGATATCCGCAAATACCCCCAGGCCCTGGCCGTCAGCCAGTCCGCCGCCCTCACCCCCGAAGACTAcc < 1:181536‑M2/250‑1 (MQ=255) cggccgcTCCGAGCTTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCCTACCAGGCAACGCGTTACCTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTTGAACACCGCTCCCAGCTACACTGTCTTATCGAATAGCCGTTGCAGTCCATCGCCCCTTACAAGAGCAGGACCACCCGCCATGTTCGATATCCGCAAATACCCCCAGGCCCTGGCCGTCAGCCAGTCCGCCGCCCTCACCCCCGAAGACTACCGCCGCCTCTACCGCCAGTCGGTCGAAGACCCAGACACCTTCTgg > 1:667243‑M2/8‑301 (MQ=255) | CGAAAAGCTGGCCCCGCACAAGGTGATCCCGGGTAACCGCCCGAGCAACACGTTGGTGGTCGAGCGCATCAGCCCGCGCCGGCTGGGTGCGCTGGTGGCCATGTACGAGCACAAGGTGTTCGTACAGAGCGTTATCTGGGGTATCAACGCCTTCGATCAGTGGGGCGTCGAGCTGGGCAAGGAGCTGGGCAAGGGCGTTTACCAGCGCTTGGTCGGTAGCCTGGAAGACAGCGCCGAAGACGGTTCCACCCAAGGCCTGATCAACTACTTCCGCGGCCGTCACCGCGGTTGATCCGAGCTTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCCTACCAGGCAACGCGTTACCTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTTGAACACCGCTCCCAGCTACACTGTCTTATCGAATAGCCGTTGCAGTCCATCGCCCCTTACAAGAGCAGGACCACCCGCCATGTTCGATATCCGCAAATACCCCCAGGCCCTGGCCGTCAGCCAGTCCGCCGCCCTCACCCCCGAAGACTACCGCCGCCTCTACCGCCAGTCGGTCGAAGACCCAGACACCTTCTGG > AE015451/5344134‑5344719 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 7 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |